英文數(shù)據(jù)庫(kù)檢索下

1、1,英文醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索下,湘雅醫(yī)學(xué)院信息檢索教研室 周文琦 2010.9.27,一、概述,荷蘭醫(yī)學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(kù)(The Excerpta Medica Database,簡(jiǎn)稱(chēng)EMBASE) 由荷蘭Elsevier Science 出版社編輯出版，收摘70個(gè)國(guó)家的7200多種生物醫(yī)學(xué)期刊，其中歐洲期刊占54%。 多種版本形式： 印刷版Excerpta Medica ：EM(文摘型檢索工具） 1947年創(chuàng)刊，42個(gè)分冊(cè) CD-ROM 光盤(pán)數(shù)據(jù)庫(kù)：1989年各分冊(cè)內(nèi)容建成機(jī)建成機(jī)讀數(shù)據(jù)庫(kù),提供光盤(pán)檢索。 On-line EMBASE.com 、DIALOG、 OVID、STN等檢索系統(tǒng)中。 EMBAS

2、E.com 是Elsevier B.V公司2003年推出的荷蘭醫(yī)學(xué)文摘網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)EMBASE.com（http:/www.EMBASE.com）。,荷蘭醫(yī)學(xué)文摘（EMBASE, EM）,EMBASE覆蓋的學(xué)科領(lǐng)域,3,藥物研究、藥理學(xué)、制藥學(xué)、藥劑學(xué)、不良反應(yīng)與相互作用、毒理學(xué) 人體醫(yī)學(xué)（臨床與實(shí)驗(yàn)） 基礎(chǔ)生物醫(yī)學(xué) 生物工藝學(xué)、生物醫(yī)學(xué)工程、醫(yī)療設(shè)備 衛(wèi)生政策與管理、藥物經(jīng)濟(jì)學(xué) 公共與職業(yè)衛(wèi)生、環(huán)境衛(wèi)生與污染控制 物質(zhì)依賴(lài)與濫用 精神病學(xué)與心理學(xué) 替代與補(bǔ)充醫(yī)學(xué) 法醫(yī)學(xué) EMBASE.com收錄的MEDLINE內(nèi)容有：護(hù)理學(xué)，牙科學(xué)，獸醫(yī)學(xué)等,生物醫(yī)學(xué)與藥理學(xué),EMBASE的特點(diǎn),收錄大量的藥

3、物文獻(xiàn)，數(shù)據(jù)庫(kù)中40%的記錄與藥物有關(guān) ； 提供17個(gè)藥物副主題詞以及47個(gè)給藥方式副主題詞，詳細(xì)揭示數(shù)據(jù)庫(kù)的藥物信息； 設(shè)置了許多與藥物有關(guān)的字段，如藥物敘詞字段（DRM和DRR）、藥物分類(lèi)名字段（EL）、藥物制造商字段（MN）、化學(xué)物質(zhì)登記號(hào)字段（RN）、藥物商品名字段（TN）等。,收錄藥物信息較全，且對(duì)藥物文獻(xiàn)檢索功能較強(qiáng),有自有的主題詞表EMTree, 提供Emtree主題詞表輔助檢索，詞表整合了NLM的MeSH詞表，共計(jì)包括5.5萬(wàn)多個(gè)藥物、生物醫(yī)學(xué)和生物學(xué)術(shù)語(yǔ)，22萬(wàn)多個(gè)同義詞，大約2萬(wàn)個(gè)CAS化學(xué)物質(zhì)登記號(hào)。 現(xiàn)EMBASE數(shù)據(jù)庫(kù)已整合Medline數(shù)據(jù)，可獲取數(shù)據(jù)范圍更廣，更全

4、面,5,MEDLINE 2,162 種特有期刊,EMBASE 7200多種期刊，其中包括1,803 種特有期刊,Elsevier為同時(shí)檢索EMBASE和 MEDLINE提供的網(wǎng)絡(luò)平臺(tái),時(shí)間范圍： MEDLINE 從1966開(kāi)始收錄，EMBASE 從1974開(kāi)始收錄,二、EMBASE主要字段說(shuō)明,見(jiàn)教材P81-82,三、主題詞和副主題詞,1.主題詞：descriptor, preferred term 醫(yī)學(xué)敘詞與藥學(xué)敘詞4.6萬(wàn)個(gè),另有20萬(wàn)個(gè)同義詞包括各種藥物名稱(chēng)的變化形式和NLM的MeSH主題詞。,例如：stomach bleeding use: stomach hemorrhage,詞表：

5、EMTREE 對(duì)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行主題分析、標(biāo)引和檢索時(shí)使用的權(quán)威性詞表。 主題檢索時(shí)，系統(tǒng)將同時(shí)檢索: Major Medical Descriptors (DEM), Minor Medical Descriptors (DER), Major Drug Descriptors (DRM), and Minor Drug Descriptors (DRR)字段。字段限定為SU。 多級(jí)樹(shù)狀結(jié)構(gòu)，可進(jìn)行擴(kuò)展檢索。,*自然詞語(yǔ)序e.g. acute granulocytic leukemia (急性粒細(xì)胞性白血病 not leukemia, acute granulocytic) *單數(shù)名詞形式

6、e.g. stomach tumor (not gastric tumors) *美式拼法 e.g. fetus (not foetus) *多用全稱(chēng) e.g. nuclear magnetic resonance (“nmr” is a synonym) *希臘字母用羅馬字拼讀e.g. alpha adrenergic receptor,敘詞特點(diǎn),2.副主題詞（link term）,疾?。?4個(gè)） Parkinson disease/surgery 藥物（17個(gè)） losartan / drug combination 給藥方式（47個(gè)）,14個(gè)疾病連接詞,complication(并發(fā)癥)

7、 congenital disorder(先天性疾病) diagnosis(診斷) drug therapy(藥物療法) disease management(疾病處理) drug resistance（耐藥性） epidemiology(流行病學(xué)) etiology(病因?qū)W) prevention(預(yù)防) rehabilitation(康復(fù)) radiotherapy(放射療法) surgery(外科手術(shù)) side effect(不良反應(yīng)) therapy(治療),17個(gè)藥物連接詞,47個(gè)給藥方式連接詞,buccal drug administration(口腔給藥) epidural d

8、rug administration(硬膜外給藥) inhalatinal drug administration(吸入給藥) intraarterial drug administration(動(dòng)脈內(nèi)給藥) intraarticular drug administration(關(guān)節(jié)內(nèi)給藥) ntrabronchial drug administration(支氣管內(nèi)給藥) intrabursal drug administration(囊內(nèi)給藥) intracameral drug administration(房室內(nèi)給藥) ,四、檢索運(yùn)算符與運(yùn)算規(guī)則,布爾邏輯運(yùn)算符：AND、OR和NOT

9、(asthma and pollution) not theophylline 鄰近度算符：NEAR/n和NEXT/n NEAR/n 表示兩個(gè)檢索詞之間可有n個(gè)以?xún)?nèi)的單詞出 現(xiàn)，且兩詞的前后順序可以顛倒，但NEXT/n兩詞的前后 順序固定。 例：acetylation next/6 histones 可檢出,截詞符：*號(hào)和?號(hào) *表示零個(gè)或多個(gè)字符。 如 inflam* inflamed, inflammation, inflammatory ？表示一個(gè)可變字符。 sulf?nyl可檢出sulfonylandsulfinyl 短語(yǔ)檢索：詞組或短語(yǔ)必須加上引號(hào)。但帶連字符“-”的詞組或短語(yǔ)不在此

10、列。 Clinical-trial “Heart attack” Heart attack 另注意由引號(hào)引起的短語(yǔ)中不能出現(xiàn)鄰近度算符和截詞符。,字段限定符：主要包括“：”號(hào)和“/”號(hào) “：”號(hào)可實(shí)現(xiàn)對(duì)所有字段的限定檢索，并可同時(shí)限定多個(gè)字段，字段標(biāo)識(shí)符之間用逗號(hào)分隔。應(yīng)用格式是 檢索詞：檢索字段 如heart failure:ti,ab,de “/”號(hào) 用來(lái)對(duì)de、dd、dm、au、jt、ta、exp、mj這8個(gè)字段進(jìn)行精確限定檢索，也可同進(jìn)進(jìn)行多個(gè)字段的精確限定檢索。還可以連接副主題詞進(jìn)行副主題詞的限定檢索。應(yīng)用格式是 檢索詞/檢索字段 如infections disease/exp/mj

11、 sleep disorder/exp/mj/dm_dt,dm_th 多種運(yùn)算符的聯(lián)用：(symptom* NEAR/5 (headache* OR head ache):TI,AB,17,五、EMBASE.COM的檢索途徑與方法,EMBASE.COM檢索主界面,檢索途徑與方法,4種檢索途徑： 【Search】 【EMTREE Tool】 【Journals】 【Authors】 6種檢索方式（Search Forms） Quick Search 快速檢索 Advanced Search 高級(jí)檢索 Drug Search 藥物檢索 Disease Search 疾病檢索 Article Sea

12、rch 文章檢索,1.快速檢索,20,支持自然語(yǔ)言檢索，可輸入任意的單詞、詞組或檢索表達(dá)式，可進(jìn)行布爾邏輯檢索、鄰近度檢索、截詞檢索和字段限定檢索，檢索詞組時(shí)需加引號(hào)。不區(qū)分大小寫(xiě)。 全字段檢索 Extensive search選項(xiàng)：對(duì)檢索式進(jìn)行擴(kuò)詞檢索，即根據(jù)輸入的檢索詞自動(dòng)在EMTREE詞表中找到相關(guān)的主題詞及其下位詞，并將這些詞在主題詞字段中進(jìn)行檢索，最后將檢索結(jié)果與用戶(hù)輸入檢索詞進(jìn)行全文檢索的檢索結(jié)果進(jìn)行邏輯或運(yùn)算。,檢索舉例：查找阿斯匹林治療心臟疾病的文獻(xiàn),檢索結(jié)果顯示（1）,檢索史區(qū),檢索結(jié)果顯示區(qū),查看主題詞,查看摘要,獲取全文,檢索結(jié)果限定區(qū),檢索結(jié)果顯示（2）查看Detail

13、s,23,檢索結(jié)果顯示（3）檢索結(jié)果限定,檢索結(jié)果顯示（4）記錄詳細(xì)信息顯示,作者鏈接,相關(guān)文獻(xiàn)鏈接,檢索結(jié)果處理之一Clipboard選中需要的記錄，點(diǎn)擊Add to Clipboard。,打開(kāi)Clipboard查看選中的記錄,檢索詞輸入框,勾選，自動(dòng)將檢索詞與主題詞進(jìn)行匹配,勾選，檢索詞作為關(guān)鍵詞進(jìn)行檢索,勾選，檢索詞必須是文獻(xiàn)中的主要討論的對(duì)象,勾選，可進(jìn)行同義詞檢索和優(yōu)先詞擴(kuò)展檢索,擴(kuò)展檢索，檢索主題詞的下位詞和衍生詞,限定項(xiàng),2.高級(jí)檢索,更多記錄限制選項(xiàng)：如循證醫(yī)學(xué)、出版類(lèi)型、重點(diǎn)研究領(lǐng)域、語(yǔ)種、人類(lèi)性別和年齡組、動(dòng)物研究類(lèi)型,檢索舉例：查找嬰兒甲肝乙肝預(yù)防方面的文獻(xiàn)。,檢索結(jié)果,

14、3.藥物檢索,要同時(shí)選擇多個(gè)給藥方式連接詞，按住shift或ctrl鍵，用鼠標(biāo)點(diǎn)擊多個(gè)連接詞，并用AND 或OR連接,可使用藥物屬名（generic name），專(zhuān)利商品名（proprietary name），實(shí)驗(yàn)室代號(hào)（laboratory code）和化學(xué)名（chemical name）檢索藥物信息，如claritin、loratadine、sch29851等。,檢索舉例：查阿司匹林(Aspirin)投藥與劑量（drug administration, drug dose）方面的綜述文獻(xiàn)。,4.疾病檢索,35,檢索字段：疾病名稱(chēng)。 自動(dòng)轉(zhuǎn)換到優(yōu)選術(shù)語(yǔ)；藥物可作為關(guān)鍵詞檢索；可選擇擴(kuò)展檢索；

15、專(zhuān)門(mén)檢索以某疾病為研究重點(diǎn)的文獻(xiàn) 提供疾病專(zhuān)題檢索，幫助用戶(hù)更精確地檢索疾病的某一類(lèi)或幾類(lèi)分支的相關(guān)文獻(xiàn)，提高相關(guān)性。 如:（疾?。┗謴?fù)、（疾病）副作用、外科手術(shù)、（疾?。┲委煹?例：查有關(guān)白內(nèi)障手術(shù)的文獻(xiàn) cataract surgery 限制選項(xiàng):同前,5.文章檢索,36,作者檢索：姓在前，名的縮寫(xiě)在后。也可只輸入作者的姓或“姓第一個(gè)名首字母”進(jìn)行檢索。輸入時(shí)姓與名之間空一格，名與名之間用“.”或空格分隔。如檢索作者韓冬季（Han Dongji），可輸入Han D.J.、Han D或Han。 期刊檢索：可輸入刊名全稱(chēng)、縮寫(xiě)、ISSN或CODEN。如檢索British Medical Jou

16、rnal，可輸入“British Medical Journal”、“Br. Med. J.”、“0959-8146”或09598146。,勾選exact,則精確匹配檢索,7.EMTREE Tool,37,瀏覽、查詢(xún)和選擇主題詞進(jìn)行主題詞檢索的輔助工具。 在Find Term檢索框內(nèi)輸入任意一個(gè)單詞或詞組，并點(diǎn)擊“Find”，系統(tǒng)將按字順輪排顯示所有包含該單詞的主題詞和同義詞。 非主題詞（同義詞）后用“use:”指引到主題詞。 如T cell use: T lymphocyte,對(duì)選定的主題詞可直接查看有關(guān)的記錄，或進(jìn)行檢索；顯示主題詞詳細(xì)信息，包括同義詞，樹(shù)狀結(jié)構(gòu)，Dorland氏醫(yī)學(xué)辭典對(duì)

17、該詞的注解。 還可按等級(jí)分類(lèi)瀏覽主題詞，點(diǎn)擊 “Browse by facets” 選項(xiàng)后，顯示出詞典的15個(gè)大類(lèi)，再點(diǎn)擊任意所需瀏覽的術(shù)語(yǔ)，該部分的若干分支的術(shù)語(yǔ)顯現(xiàn)，可層層點(diǎn)擊，最終結(jié)束于最小的不再分的術(shù)語(yǔ)，最多可達(dá)12級(jí)。,按等級(jí)分類(lèi)瀏覽主題詞,EMTREE 15個(gè)大類(lèi)表,Anatomical concepts （解剖學(xué)） Organisms （有機(jī)體） Physical diseases, disorders and abnormalities (身體疾病、紊亂及異常) Chemicals and drugs （化學(xué)制品及藥物） Analytical, diagnostic and t

18、herapeutic techniques, equipment andparameters （分析、診斷及治療技術(shù)、設(shè)備及參數(shù)） Psychological and psychiatric phenomena （心理學(xué)及精神病學(xué)） Biological phenomena and functions （生物學(xué)現(xiàn)象和功能） Chemical, physical and mathematical phenomena (化學(xué)、物理和數(shù)學(xué)現(xiàn)象) Society and environment （社會(huì)和環(huán)境） Types of article or study （論文或研究類(lèi)型） Geographic names （