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文檔簡介
1、應(yīng)用ncbi map viewer查找一個基因序列生科1201班 周宇箏 吳家裕 馬子良 余騰 基于人類基因組項目獲得了序列數(shù)據(jù),很多機構(gòu)開始了對基因組序列的各項數(shù)據(jù)進行注釋(annotation),構(gòu)建人類基因組整合圖譜。其中美國的 ucsc (university of california santa cruz) ,ncbi(national center for biotechnology information)和英國的sanger中心收錄的數(shù)據(jù)最為詳盡。 隨著生命科學(xué)迅猛發(fā)展,數(shù)據(jù)庫對于我們科研交流所需要的各項數(shù)據(jù)是十分重要的。真正有意義的不是數(shù)據(jù),而是其背后的生物學(xué)含義。也因此,
2、學(xué)會使用各種數(shù)據(jù)庫對于科研、學(xué)習(xí)和交流是至關(guān)重要的。 以上提及的幾個數(shù)據(jù)庫功能十分強大,本次僅展示在基因圖譜中查找基因這一項用途。 基因圖譜是指,對生物的基因進行鑒定,以此測定它的染色體上的特定位置,然后用圖示的方式把它表示出來。 三大基因組圖譜ucsc genome browser,ncbi map viewer和ensembl genome browser對基因組序列的注釋是目前為止最為豐富的。接下來我們將以ncbi map viewer(/mapview/)為例對基因il6進行分析,查看其各項數(shù)據(jù)。在在sequence format(序列輸出格式)后面是一個下拉式(序列輸出格式)后面是一個下拉式選擇菜單,默認的為選擇菜單,默認的為fasta格式,還有一個是格式,還有一個是genbank格格式。建議大家選擇式。建議大家選擇genbnak格式,因為這個格式提供了很格式,因為這個格式提供了很多該基因的信息,而多該基因的信息,而f
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