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1、應(yīng)用ncbi map viewer查找一個(gè)基因序列生科1201班 周宇箏 吳家裕 馬子良 余騰 基于人類(lèi)基因組項(xiàng)目獲得了序列數(shù)據(jù),很多機(jī)構(gòu)開(kāi)始了對(duì)基因組序列的各項(xiàng)數(shù)據(jù)進(jìn)行注釋(annotation),構(gòu)建人類(lèi)基因組整合圖譜。其中美國(guó)的 ucsc (university of california santa cruz) ,ncbi(national center for biotechnology information)和英國(guó)的sanger中心收錄的數(shù)據(jù)最為詳盡。 隨著生命科學(xué)迅猛發(fā)展,數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)于我們科研交流所需要的各項(xiàng)數(shù)據(jù)是十分重要的。真正有意義的不是數(shù)據(jù),而是其背后的生物學(xué)含義。也因此,
2、學(xué)會(huì)使用各種數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)于科研、學(xué)習(xí)和交流是至關(guān)重要的。 以上提及的幾個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)功能十分強(qiáng)大,本次僅展示在基因圖譜中查找基因這一項(xiàng)用途。 基因圖譜是指,對(duì)生物的基因進(jìn)行鑒定,以此測(cè)定它的染色體上的特定位置,然后用圖示的方式把它表示出來(lái)。 三大基因組圖譜ucsc genome browser,ncbi map viewer和ensembl genome browser對(duì)基因組序列的注釋是目前為止最為豐富的。接下來(lái)我們將以ncbi map viewer(/mapview/)為例對(duì)基因il6進(jìn)行分析,查看其各項(xiàng)數(shù)據(jù)。在在sequence format(序列輸出格式)后面是一個(gè)下拉式(序列輸出格式)后面是一個(gè)下拉式選擇菜單,默認(rèn)的為選擇菜單,默認(rèn)的為fasta格式,還有一個(gè)是格式,還有一個(gè)是genbank格格式。建議大家選擇式。建議大家選擇genbnak格式,因?yàn)檫@個(gè)格式提供了很格式,因?yàn)檫@個(gè)格式提供了很多該基因的信息,而多該基因的信息,而f
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