動物育種學(xué)-第6－個體遺傳評定之選擇指數(shù)法(1)ppt課件

1、遺傳評定概述單性狀育種值估計多性狀綜合遺傳評定第三節(jié) 多性狀綜合遺傳評定v多性狀選擇概述v綜合選擇指數(shù)的估計v選擇指數(shù)運用的本卷須知多性狀選擇概述育種任務(wù)中，不僅希望單個性狀得到改良，更育種任務(wù)中，不僅希望單個性狀得到改良，更追求在多個性狀上同時獲得進(jìn)展追求在多個性狀上同時獲得進(jìn)展畜禽的育種目的涉及多個性狀：畜禽的育種目的涉及多個性狀：奶牛：產(chǎn)奶量、乳脂率、乳蛋白率奶牛：產(chǎn)奶量、乳脂率、乳蛋白率豬：日增重、瘦肉率和產(chǎn)仔數(shù)豬：日增重、瘦肉率和產(chǎn)仔數(shù)蛋雞：產(chǎn)蛋數(shù)和蛋重蛋雞：產(chǎn)蛋數(shù)和蛋重綿羊：剪毛量、毛長和細(xì)度綿羊：剪毛量、毛長和細(xì)度多性狀選擇概述多性狀選擇方法順序選擇法獨立淘汰法綜合選擇法綜合選擇

2、指數(shù)綜合選擇指數(shù)綜合遺傳評定綜合遺傳評定順序選擇法tandem selection指對育種目的中待選擇的幾個性狀逐一進(jìn)展選擇例如奶牛的育種目的：產(chǎn)奶量、乳脂率、乳蛋白率缺陷：花時太長、性狀的選擇顧此失彼，已不運用多性狀選擇概述產(chǎn)奶量產(chǎn)奶量乳脂率乳脂率乳蛋白率乳蛋白率2-3個世代個世代2-3個世代個世代2-3個世代個世代獨立淘汰法independent culling指育種目的中包含的每個性狀都有一個最低選擇規(guī)范，各性狀都超越相應(yīng)規(guī)范的個體留作種畜改良：同時思索多個性狀，優(yōu)于順序淘汰法缺陷：選擇的個體能夠在各性狀上都表現(xiàn)平平多性狀選擇概述綜合選擇法index selection，I 根據(jù)育種目的

3、中各性狀的遺傳根底和經(jīng)濟(jì)重要性，分別給予各性狀一個適當(dāng)?shù)募訖?quán)系數(shù)，綜合到一個指數(shù)中，根據(jù)指數(shù)的大小進(jìn)展選擇選擇效果優(yōu)于獨立淘汰法和順序選擇法多性狀選擇概述獨立淘汰法獨立淘汰法順序選擇法順序選擇法綜合選擇法綜合選擇法綜合選擇指數(shù)的特征反映的個體種用價值較為全面不僅思索性狀的遺傳根底和經(jīng)濟(jì)重要性，而且還思索性狀間的遺傳相關(guān)選擇效率較高，在BLUP之前被廣泛運用綜合選擇指數(shù)v多性狀選擇概述v綜合選擇指數(shù)的估計v選擇指數(shù)運用的本卷須知綜合選擇指數(shù)的根本公式：綜合選擇指數(shù)的估計iniiTAWAII、AT：綜合選擇指數(shù)：綜合選擇指數(shù)Wi：第：第 i 個性狀的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值個性狀的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值A(chǔ)i：第：第 i 個

4、性狀的育種值個性狀的育種值根據(jù)各性狀在育種根據(jù)各性狀在育種和經(jīng)濟(jì)上的重要性，和經(jīng)濟(jì)上的重要性，給予相應(yīng)的經(jīng)濟(jì)加給予相應(yīng)的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值權(quán)值I 的計算公式:綜合選擇指數(shù)的估計)(iiiiniiTppbAWAI 矩陣方式：)p(pbIb: 含遺傳根底和經(jīng)濟(jì)意義的偏回歸系數(shù)向量含遺傳根底和經(jīng)濟(jì)意義的偏回歸系數(shù)向量p : 為不同來源的信息性狀表型值為不同來源的信息性狀表型值p多元回歸方法多元回歸方法：與：與p對應(yīng)的均數(shù)對應(yīng)的均數(shù)綜合選擇指數(shù)的估計綜合選擇指數(shù)計算的關(guān)鍵步驟： 偏回歸系數(shù)b的計算計算偏回歸系數(shù)的正規(guī)方程組求極大值方法DAwVbDAwVb1則： V：信息性狀表型值之間的方差協(xié)方差矩陣：信息性狀

5、表型值之間的方差協(xié)方差矩陣D：被估個體與信息來源個體間的親緣系數(shù)對角矩陣：被估個體與信息來源個體間的親緣系數(shù)對角矩陣A：信息性狀與目的性狀間的遺傳方差協(xié)方：信息性狀與目的性狀間的遺傳方差協(xié)方 差矩陣差矩陣w：經(jīng)濟(jì)加權(quán)值向量：經(jīng)濟(jì)加權(quán)值向量6-16目的性狀與信息性狀目的性狀：綜合育種值所包含的性狀，即育種目的中待改良的性狀如：產(chǎn)奶量、乳脂量信息性狀：育種值估計中提供信息資料的性狀 如：產(chǎn)奶量、乳脂率信息性狀與目的性狀普通為一樣性狀，信息性狀與目的性狀普通為一樣性狀，也可以不同，但必需有較高的遺傳相關(guān)也可以不同，但必需有較高的遺傳相關(guān)估計綜合選擇指數(shù)的步驟：估計綜合選擇指數(shù)的步驟：綜合選擇指數(shù)的估

6、計DAwVb1)(ppbIwADVV1、)(例：例： 對某奶牛場的青年公牛進(jìn)展綜合選擇指對某奶牛場的青年公牛進(jìn)展綜合選擇指數(shù)計算，目的性狀為乳脂量和日增重。數(shù)計算，目的性狀為乳脂量和日增重。知一公?，F(xiàn)有如下信息性狀記錄：知一公?，F(xiàn)有如下信息性狀記錄： 母親乳脂量母親乳脂量PD1=170kg, 對應(yīng)均數(shù)為對應(yīng)均數(shù)為140kg 父親日增重父親日增重PS2=1180g, 對應(yīng)均數(shù)為對應(yīng)均數(shù)為1290g 本身日增重本身日增重PE2=0g, 對應(yīng)均數(shù)為對應(yīng)均數(shù)為1300g 綜合選擇指數(shù)的估計綜合選擇指數(shù)的估計性狀性狀wPA乳脂量（乳脂量（1） 25元元25kg12.5kg0.10日增重（日增重（2） 1

7、.3元元80g51g兩性狀的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值和有關(guān)遺傳參數(shù)為：兩性狀的經(jīng)濟(jì)加權(quán)值和有關(guān)遺傳參數(shù)為：2, 1Ar兩性狀間的兩性狀間的遺傳相關(guān)遺傳相關(guān)解：先求矩陣解：先求矩陣 ， 結(jié)果如下：結(jié)果如下： 綜合選擇指數(shù)的估計222222221211),(),(),(PESPEDSDPsymPPCovPPCovPPCovV75.63515 .121 . 0),(212, 121AAArAACov0),(21SDPPCov5 .1300515 . 0),(),(22)(2222222APPAESESEsrAACovPPCov222, 1222, 12, 12)()()(1AAAAACovAACovAACovAw

8、ADV、88.3175.635 . 0),(),(21)(2121AACovrPPCovEDPPAED兩性狀間的遺傳相關(guān)兩性狀間的遺傳相關(guān)信息個體間的親緣相關(guān)信息個體間的親緣相關(guān)綜合選擇指數(shù)的估計于是，于是，222808 .1300808 .318025symV2225175.635175.6375.635 .12A15 . 05 . 0)()()(221IPAIPAIPAESDrrrD3 . 12521www綜合選擇指數(shù)的估計712. 0244. 0115. 33 . 1255175.635175.6375.635 .1215 . 05 . 0808 .1300808 .3180252221

9、222symDAwVb1偏回歸系數(shù)為：綜合選擇指數(shù)的估計綜合選擇指數(shù)為：41.1831300135012901180140170712. 0244. 0115. 3)(yybI評價綜合選擇指數(shù)準(zhǔn)確度的目的：真實育種值與選擇指數(shù)間的相關(guān)系數(shù)rAI綜合選擇指數(shù)的估計GwwDAwbcb2TAAIrGww2TA其中，其中，G：各目的性狀間的遺傳方差：各目的性狀間的遺傳方差協(xié)方差矩陣協(xié)方差矩陣22121221),(),(AAAACovAACovG綜合選擇指數(shù)的估計本例的綜合選擇指數(shù)準(zhǔn)確度為：69.1061953 . 1255175.6375.635 .123 . 125222GwwTA8 .104424

10、97524871995712. 0244. 0115. 3DAwbcb31. 088.32519.102AIrGwwDAwbcb2TAAIrv多性狀選擇概述v綜合選擇指數(shù)的估計v運用選擇指數(shù)法的本卷須知運用選擇指數(shù)法的前提不存在系統(tǒng)環(huán)境效應(yīng)被估個體與表型觀測值來源于同一總體遺傳參數(shù)已估計出來選擇指數(shù)運用的本卷須知滿足上述條件時，估計育種值為最正確線性滿足上述條件時，估計育種值為最正確線性無偏估計。無偏估計。I I 的運用遭到上述條件的制約的運用遭到上述條件的制約制定選擇指數(shù)的本卷須知 1) 目的性狀要突出。一個選擇指數(shù)包括24個最重要的性狀 例如：種公豬包括達(dá)100kg體重日齡和活體背膘 種母豬再添加總產(chǎn)仔數(shù)性狀防止有高的負(fù)遺傳相關(guān)性狀。必需思索時，可合并為一個性狀