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文檔簡介
1、. . . . 1 / 12 第一章 蛋白質(zhì)1、必需氨基酸(essential amino acid)必需 氨基酸 指的是人體自身不能合成或合成速度不能滿足人體需要,必須從食物中攝取的氨基酸。分別是:賴氨酸 、色氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸 、氨酸、異 亮氨酸 、亮氨酸、 纈氨酸 。2、等電點 (isoelectric point,pi) 在某一 ph的溶液中,氨基酸解離成陽離子和陰離子的趨勢與相等,稱為間性離子,呈電中性,此時溶液的ph稱為該氨基酸的等電點。3、模體( motif )在蛋白質(zhì)分子中,可發(fā)現(xiàn) 2 個或者 3個具有二級結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個特殊的空間構(gòu)象,并具有相應(yīng)的功
2、能,被稱為模體4、結(jié)構(gòu)域( domain)分子量較大的蛋白質(zhì)??烧郫B成多個結(jié)構(gòu)較為緊密的區(qū)域,該區(qū)域具有獨立的構(gòu)象,并各行其功能,稱為結(jié)構(gòu)域5、蛋白質(zhì)的變性(protein denaturation) 在某些物理和化學因素作用下,蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象被破壞,即有序的空間結(jié)構(gòu)變成無序的空間結(jié)構(gòu), 從而導致其理化性質(zhì)的改變和生物活性的喪失,但是一級結(jié)構(gòu)沒有改變稱為蛋白質(zhì)的變性。6、蛋白質(zhì)的復(fù)性(protein renaturation):若蛋白質(zhì)變性程度較輕,去除變性因素后,有些蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)象和功能,稱為復(fù)性7、亞基 (subunit):在蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)中,有二個或二個以上具有
3、獨立的三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈,彼此借次級鍵相連,成為一定的空間結(jié)構(gòu)。具有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈單位,稱為亞基或亞單位,8、別構(gòu)效應(yīng)(變位效應(yīng),allosteric effect):蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的改變伴隨其功能的變化,稱為變構(gòu)效應(yīng)。 具有變構(gòu)效應(yīng)的蛋白質(zhì)稱為變構(gòu)蛋白,常有四級結(jié)構(gòu),例如血紅蛋白。(書上)凡蛋白質(zhì)分子因與某種小分子物質(zhì)相互作用發(fā)生構(gòu)象改變,因而改變了這種蛋白質(zhì)與其它分子進行反應(yīng)的能力,這一現(xiàn)象稱為變構(gòu)作用。(ppt上). . . . 2 / 12 9 分子?。?molecular disease)由于遺傳物質(zhì)(dna )的突變,導致其編碼的蛋白質(zhì)分子的氨基酸序列異常,而引起其功能改變的遺
4、傳性疾病。第二章 核酸1核酸的變性(denaturation)在某些理化因素作用下,dna分子互補堿基對之間氫鍵斷裂,dna雙螺旋打開,變?yōu)閱捂湣?退火( annealing )變性 dna在適當條件下, 兩條互補鏈可重新恢復(fù)天然的雙螺旋結(jié)構(gòu),這一現(xiàn)象稱退火,又稱復(fù)性。3分子雜交(molecular hybridization)不同來源的核酸變性后合并在一起進行復(fù)性。只要這些核酸分子的核苷酸序列中含有可以形成堿基互補配對的序列,彼此之間即可形成局部雙鏈,即所謂的雜化雙鏈(heteroduplex)。這個過程叫雜交或核酸分子雜交。4. 解鏈溫度( melting temperature, tm)
5、在解鏈過程中,紫外吸光度的變化a260達到最大變化值的一半時所對應(yīng)的溫度稱為tm 第三章 酶1變構(gòu)酶( allosteric enzyme)一些小分子物質(zhì)能夠與酶的活性中心以外的調(diào)節(jié)部位或亞基以非共價鍵形式結(jié)合,使酶發(fā)生變構(gòu)而改變其催化活性,這種酶稱為變構(gòu)酶2同工酶( isozyme )指催化相同的化學反應(yīng),但酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)乃至免疫學性質(zhì)不同的一組酶3酶原( zymogen)有些酶在細胞合成或初分泌,或在其發(fā)揮催化功能前只有酶的無活性前體,必須在一定條件下,這些酶的前體水解開一個或者幾個特定的肽鍵,致使構(gòu)想發(fā)生改變,表現(xiàn)出酶的活性,這種無活性酶的前體稱為酶原。4活性中心(activ
6、e center). . . . 3 / 12 酶分子中的必需基團相對集中,組成具有特定空間結(jié)構(gòu)的區(qū)域,能與底物特異結(jié)合并將底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物。5 米氏常數(shù)( km )km是當酶促反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半時的底物濃度。單位:mol/l 。6 變構(gòu)調(diào)節(jié)( allosteric regulation)一些小分子物質(zhì)能夠與酶的活性中心以外的調(diào)節(jié)部位或亞基以非共價鍵形式結(jié)合,使酶的構(gòu)象發(fā)生改變,使酶的活性改變,這種現(xiàn)象稱為變構(gòu)調(diào)節(jié)7 酶的化學修飾 chemical modification 酶蛋白肽鏈上的一些基團可與某種化學基團發(fā)生可逆的共價結(jié)合,從而改變酶的活性。稱為酶的化學修飾(chemical m
7、odification)或共價修飾 (covalent modification) 8 必需基團( essential group)酶分子中與催化作用直接相關(guān)、不可缺少的化學基團。( 催化基團、結(jié)合基團)9 全酶 holoenzyme :即酶蛋白與輔助因子。酶蛋白和輔助因子單獨存在都不具有酶活性,只有全酶具有酶活性。10 酶( enzyme)是由活細胞產(chǎn)生, 對其底物具有高度催化效能和高度專一性,能在細胞外起同樣催化作用的一類生物催化劑。第四章 糖代1. 糖異生 gluconeogenesis 從非糖物質(zhì)(乳酸、甘油、生糖氨基酸)轉(zhuǎn)變?yōu)槠咸烟腔蛘咛窃倪^程稱為糖異生2. 糖酵解( glycol
8、ysis)與無氧氧化(anaerobic oxidation)在機體缺氧條件下,葡萄糖經(jīng)一系列酶促反應(yīng)生成丙酮酸進而還原生成乳酸的過程,稱為糖降解,亦稱為無氧氧化3. 有氧氧化( aerobic oxidation)葡萄糖或糖原在有氧條件下徹底氧化成h2o和 co2 ,同時釋放出能量的過程,這是糖氧化的主要方式。. . . . 4 / 12 第五章 脂代1. 必需脂肪酸 (essential fatty acid) 人體必需但自身不能合成或合成不足,必須依賴食物供給的脂肪酸,如亞油酸、 亞麻酸和花生四烯酸。2. 酮體 (ketone body) 肝細胞通過脂酸-氧化產(chǎn)生的大量乙酰coa除通過氧
9、化生成atp供能外, 還在線粒體轉(zhuǎn)化為被稱為酮體的化合物,包括乙酰乙酸,- 羥丁酸,丙酮。3脂肪動員 (fat mobilization) 儲存在脂肪細胞中的脂肪,被脂酶逐步水解為游離脂酸與甘油,并釋放入血以供其他組織氧化利用的過程。4. 脂肪酸的- 氧化( -oxidation of fatty acid)脂酰 coa進入線粒體基質(zhì)后,從脂?;?碳原子開始,經(jīng)過脫氫、加水、再脫氫、硫解等 4 步連續(xù)反應(yīng), 脂?;鶖嗔旬a(chǎn)生1 分子乙酰coa和 1 分子比原來少兩個碳原子的脂酰coa 。第六章生物氧化1. 生物氧化( biological oxidation)物質(zhì)在生物體進行氧化稱生物氧化,主
10、要指糖、脂肪、蛋白質(zhì)等在體分解時逐步釋放能量,最終生成co2 和 h2o的過程。2 氧化磷酸化 (oxidative phosphorylation) 氧化磷酸化 (oxidative phosphorylation)是指代物氧化脫氫,經(jīng)線粒體電子呼吸鏈傳遞釋放能量,偶聯(lián)驅(qū)動adp磷酸化生成atp的過程,又稱為偶聯(lián)磷酸化。3 氧化呼吸鏈 (oxidative respiratory chain) 代物脫下的成對氫原子(2h )通過多種酶和輔酶所催化的氧化還原反應(yīng)逐步傳遞,最終與氧結(jié)合生成水,釋放的能量驅(qū)動atp生成 . 這一系列酶和輔酶稱為電子傳遞鏈(electron transfer cha
11、in)。它與細胞攝取氧的呼吸過程相關(guān),故又稱呼吸鏈(respiratory chain) 4. 底物水平磷酸化(substrate-level phosphorylation)物質(zhì)在生物氧化過程中,常生成一些含有高能鍵的化合物,而這些化合物可直接偶聯(lián)atp或 gtp的合成,這種產(chǎn)生atp等高能分子的方式稱為底物水平磷酸化. . . . 5 / 12 第七章氨基酸代1. 一碳單位( one carbon unit)某些氨基酸代中產(chǎn)生的含有一個碳原子的基團。包括:甲基,甲烯基,甲炔基,甲?;?,亞氨甲基等2. 必需氨基酸 ( essential amino) 體不能合成,必需由食物供給的氨基酸,包括
12、:纈、亮、異亮、苯丙、色、蛋、賴3. 腐敗作用 (putrefaction) : 未被吸收的氨基酸與未被消化的蛋白質(zhì)在大腸菌中的代作用。第八章 核酸代1. 從頭合成途徑(de novo synthesis pathway): 利用磷酸核糖、氨基酸、二氧化碳等簡單物質(zhì)為原料,經(jīng)過一系列酶促反應(yīng),合成核苷酸的途徑。2. 補救合成途徑(salvage synthesis pathway): 利用體游離的嘌呤或嘌呤核苷,經(jīng)過簡單的反應(yīng),合成核苷酸的過程,稱為補救合成/ 重新利用途徑。第九章 物質(zhì)代的聯(lián)系和調(diào)節(jié)1. 共價修飾( covalent modification)酶蛋白肽鏈上某些氨基酸殘基在其它
13、酶的催化下發(fā)生共價修飾,從而引起酶活性的改變,稱為酶的化學修飾。修飾形式:乙?;?、甲基化、腺苷化與磷酸化等,磷酸化是最常見的重要修飾形式2. 變構(gòu)調(diào)節(jié)( allosteric regulation)小分子化合物與酶蛋白的調(diào)節(jié)亞基或調(diào)節(jié)部位進行非共價結(jié)合,引起酶構(gòu)象變化,從而改變酶的活性。變構(gòu)調(diào)節(jié)不引起酶的構(gòu)型變化,不涉與共價鍵變化。3. 代調(diào)節(jié) regulation of metabolism 機體根據(jù)外環(huán)境的變化調(diào)節(jié)各種物質(zhì)代通路的強度、方向和速度。4. 動態(tài)平衡 dynamic equilibrium 體物質(zhì)不斷更新、適時補充, 通過一定的調(diào)節(jié)機制保持代的動態(tài)平衡,以防止中間產(chǎn)物的堆積和缺
14、乏。. . . . 6 / 12 5. 化學修飾 chemical modification 酶蛋白肽鏈上某些氨基酸殘基在其它酶的催化下發(fā)生共價修飾,從而引起酶活性的改變,稱為酶的化學修飾。修飾形式:乙酰化、甲基化、腺苷化與磷酸化等,磷酸化是最常見的重要修飾形式6. 關(guān)鍵酶 (key enzyme):代途徑中,催化單向/ 不可逆 / 非平衡反應(yīng)的酶,其活性決定代途徑的方向。關(guān)鍵酶常位于代途徑的第一步驟或分叉點。7. 限速酶 (rate-limiting enzyme):催化代途徑中速度最慢步驟的酶,它的活性決定代途徑的總速度。限速酶常位于代調(diào)節(jié)的樞紐步驟。8. 誘導( induction):使
15、酶的生成增多增快,加速酶合成的化合物稱為誘導劑(inducer )9. 阻遏( repression):使酶的生成減少減慢,減少酶合成的化合物稱為阻遏劑(repressor) 第十章 dna的生物合成1中心法則(the central dogma)是指遺傳信息從dna傳遞給 rna ,再從 rna傳遞給蛋白質(zhì),即完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程。也可以從dna傳遞給 dna ,即完成dna的復(fù)制過程。2半保留復(fù)制(semi-conservative replication)dna復(fù)制時,母鏈dna解開為兩股單鏈,各自作為模板按堿基配對規(guī)律,合成與模板互補的子鏈。子代dna ,一股鏈從親代完整地承
16、受過來,另一股鏈則完全重新合成。兩個子代dna都和親代dna堿基序列一致。這種復(fù)制方式稱為半保留復(fù)制(semi-conservative replication)。3逆轉(zhuǎn)錄( reverse transcription)以 rna為模板合成dna的過程稱為逆轉(zhuǎn)錄4. 岡崎片段( okazaki fragment)在 dna復(fù)制中存在不連續(xù)的片段,這種不連續(xù)復(fù)制的dna片段稱作岡崎片段(okazaki fragment )5. 引發(fā)體 (primosome) 解旋酶、拓撲異構(gòu)酶、 引物酶和引物以與單鏈結(jié)合蛋白形成的復(fù)合體稱為引發(fā)體(primosome) . . . . 7 / 12 第十一章 r
17、na的生物合成1啟動子( promoter )是位于轉(zhuǎn)錄起始點上游的一段dna序列,是 rna聚合酶的識別和結(jié)合部位。在轉(zhuǎn)錄調(diào)控中起著重要作用。2. 外顯子( exon)在斷裂基因與初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中出現(xiàn),并表達為成熟rna的核酸序列。3. 含子( intron)隔斷基因的線性表達,在剪接過程中被去除的核酸序列。4. rna 編輯( rna editing)遺傳信息在rna水平發(fā)生改變,由一個基因產(chǎn)生不止一種蛋白質(zhì)的加工方式。5. 核酶( ribozyme )具有催化活性的rna 6. 轉(zhuǎn)錄作用( dna-dependent rna synthesis )在 rna聚合酶催化下,以dna為模板,以
18、4 種三磷酸核苷(atp, gtp, ctp, utp ) 為原料進行的 rna聚合反應(yīng)。7. 終止子 (terminator) 在基因單位中,具有停止轉(zhuǎn)錄作用的部位, 包括 gc富集區(qū)和at富集區(qū) , 也稱終止子。8. 轉(zhuǎn)錄因子 transcriptional factor, tf 反式作用因子中, 直接或間接結(jié)合rna聚合酶的, 稱為轉(zhuǎn)錄因子(transcriptional factors, tf)。9. 剪接作用( mrna splicing )剪切 hnrna中含子序列,將各外顯子序列連接為成熟mrna 的過程。10. 不對稱轉(zhuǎn)錄(asymmetric transcription)dn
19、a片段轉(zhuǎn)錄時,雙鏈dna中只有一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板,這種轉(zhuǎn)錄方式稱為不對稱轉(zhuǎn)錄. . . . 8 / 12 11. 模板鏈( template strand)指導 rna合成的 dna鏈12. 編碼鏈( coding strand)與模板鏈互補的另一條dna鏈。無轉(zhuǎn)錄功能,其序列與轉(zhuǎn)錄的rna序列相同。13. 轉(zhuǎn)錄泡 (transcription bubble) 由 dna雙鏈(打開約17bp),rna聚合酶與新合成的rna鏈局部形成的結(jié)構(gòu). 14. 單順反子一條 mrna 模板只含有一個翻譯起始點和一個終止點,因而一個基因編碼一條多肽鏈或rna鏈,每個基因轉(zhuǎn)錄有各自的調(diào)節(jié)元件。15. 多順反
20、子在原核細胞中,通常是幾種不同的mrna 連在一起,相互之間由一段短的不編碼蛋白質(zhì)的間隔序列所隔開,這種mrna 叫做多順反子mrna 。這樣的一條mrna 鏈含有指導合成幾種蛋白質(zhì)的信息。第十二章蛋白質(zhì)的生物合成1. 核糖體循環(huán)(ribosome cycle )蛋白質(zhì)翻譯過程中,核糖體大小亞基聚合完成肽鏈起始、延長與終止過程后解離,它們還可以再聚合成完整的核糖體,開始新的肽鏈合成,循環(huán)往復(fù)。2分子伴侶 (molecular chaperone) 是細胞一類保守蛋白質(zhì),可識別肽鏈的非天然構(gòu)象,促進各功能域和整體蛋白質(zhì)的正確折疊3. 信號肽 (signal peptide) 各種新生分泌型蛋白的
21、n端有保守的氨基酸序列第十三章基因表達調(diào)控1. 基因( gene )負載特定遺傳信息的dna片段,包括:dna編碼序列、非編碼調(diào)節(jié)序列和含子序列。. . . . 9 / 12 2. 管家基因( housekeeping gene)生物體某些基因產(chǎn)物在整個生命過程中都是需要的或必不可少的,這類產(chǎn)物的編碼基因在生物體的幾乎所有細胞中持續(xù)表達3. 誘導( induction)基因表達水平在特定環(huán)境中增高的現(xiàn)象,這類基因叫可誘導基因4. 阻遏( repression)基因?qū)Νh(huán)境信號應(yīng)答表現(xiàn)為表達水平降低,這類基因叫可阻遏基因5. 操縱子( operon )由功能相關(guān)的一組基因在染色體上串聯(lián),共同構(gòu)成的
22、一個轉(zhuǎn)錄單位。一個操縱子只含一個啟動序列與數(shù)個可轉(zhuǎn)錄的編碼基因6. 順式作用元件 (cis-acting element) 可影響自身基因表達活性的dna序列7. 增強子( enhancer )遠離轉(zhuǎn)錄起始位點(130kb) ,決定基因的特異性表達,增強啟動子轉(zhuǎn)錄活性的dna序列。其發(fā)揮作用的方式通常與方向、距離無關(guān)8. 沉默子 silencer 某些基因的負性調(diào)節(jié)元件,當其結(jié)合特異蛋白因子時,對基因轉(zhuǎn)錄起阻遏作用。有些dna序列既可作為正性、又可作為負性調(diào)節(jié)元件發(fā)揮順式調(diào)節(jié)作用9. 反式作用因子 (trans-acting factors) 指能直接或間接地識別或結(jié)合在各類順式作用元件 核心
23、序列上參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。10. 基因 組( genome )指來自一個生物體的一整套遺傳物質(zhì),對原核生物與噬菌體來說,它們的基因組就是單個環(huán)狀染色體所含的全部基因,對于真核生物而言,基因組是指一個生物體的染色體所包含的全部 dna 11. 基因表達( gene expression ). . . . 10 / 12 指細胞 在生命過程中, 把儲存在 dna順序中 遺傳信息 經(jīng)過轉(zhuǎn)錄和翻譯, 轉(zhuǎn)變成具有 生物 活性的蛋白質(zhì)分子。第十三章基因工程與基因重組1.基因工程( genetic engineering)是將外源基因通過體外重組后導入受體細胞,使這個基因能在受體細胞復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、
24、 翻譯表達的操作。1.重組 dna技術(shù)( recombinantdnatechnique)在體外重新組合脫氧核苷酸(dna )分子,并使它們在適當?shù)募毎性鲋车倪z傳操作。1.限制性核酸切酶(restriction endonuclease): 存在于細菌體,能夠識別和切割雙鏈dna部特定核苷酸序列的一類核酸酶。1.聚合酶鏈反應(yīng)(pcr )在反應(yīng)體系中加入模板dna 、 dntp 、 特別設(shè)計的特異引物與耐熱的dna聚合酶(常用 taq 酶) ,經(jīng)多次變性、退火、延伸循環(huán)反應(yīng),使目的dna呈指數(shù)合成的過程1.cdna文庫 (cdna library) 以 mrna 為模板,利用反轉(zhuǎn)錄酶合成與mr
25、na 互補的 dna ,再復(fù)制成雙鏈cdna片段,與適當載體連接后轉(zhuǎn)入受體菌,這些受體菌包含了所有cdna信息,總稱cdna文庫。常用于篩選編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因。1.基因組 dna文庫 (genomic dna library) 利用限制性核酸切酶將組織或細胞染色體dna切割后, 與適當載體連接后轉(zhuǎn)入受體菌,這些受體菌包含了所有基因組dna信息,總稱基因組dna文庫第十五章細胞信息轉(zhuǎn)導1. 第二信使 (secondary messenger) 在細胞傳遞信息的小分子物質(zhì),如:ca2+、dag 、ip3、cer (神經(jīng)酰胺)、camp 、cgmp 、花生四烯酸與其代產(chǎn)物等。2.g 蛋白 (guanylate binding protein 是一類位于細胞膜胞漿面
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