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文檔簡介

1、綠色熒光蛋白基因在大腸桿菌中的表達與檢測一、 背景介紹1綠色熒光蛋白1955年,Davenport和Nicol 在太平洋海里的一種發(fā)光生物維多利亞水母(Aequorea victoria)中發(fā)現(xiàn)并發(fā)表了熒光蛋白的生物發(fā)光現(xiàn)象,但是對生物發(fā)光現(xiàn)象的機理并不了解。1962年,日本科學家下村修在水母中純化鑒定出了一種能催化化學發(fā)光的蛋白質(zhì)分子并將其命名為aequorin,aequorin能將化學能轉(zhuǎn)化為光能,從而產(chǎn)生出波長為470nm的藍色光(lmax=470nm),但是水母發(fā)出的光是獨有的綠色,因此水母發(fā)光的蛋白質(zhì)并非 aequorin。與此同時,發(fā)現(xiàn)和分離了一個受紫外線激發(fā)能發(fā)出綠色熒光的蛋白質(zhì)

2、綠色熒光蛋白(GFP)。1971年,Morin和Hastings提出了GFP這個名稱。1985到1992年間,科學家 Douglas Prasher 測定完成了aequorin 和GFP的基因和蛋白質(zhì)序列,并通過蛋白質(zhì)序列分析和核磁共振分光術(shù)(NMR spectroscopy)確定了GFP發(fā)光位點。1994年,美國科學家錢永健開始改造GFP,目前所用的大多數(shù)是錢永健實驗室改造后的變種,有的熒光更強,有的可激活、變色。1996年,解析得到了GFP的晶體結(jié)構(gòu),它的發(fā)光過程是也在日后的應用中得到了解答??v觀整個過程,從1961年到1974年,下村修的研究遙遙領(lǐng)先,卻很少有人注意。在1974年以后,特

3、別是八十年代后,綠色熒光蛋白的研究得到了廣泛的重視和發(fā)展。綠色熒光蛋白,分子質(zhì)量約為28kDa,由238個氨基酸構(gòu)成,第6567位氨基酸(Ser-Tyr-Gly)形成發(fā)光團,經(jīng)共價鍵連接而成對羥苯甲基咪唑烷酮,它可以被光激發(fā)產(chǎn)生熒光,是主要發(fā)光的位置。綠色熒光蛋白分子的形狀呈圓柱形,就像一個桶,發(fā)光的基團位于桶中央,因此,它可形象地比喻成一個裝有色素的“油漆桶”。其發(fā)光團的形成不具有物種專一性,發(fā)出的熒光穩(wěn)定,且不需要依賴其他基質(zhì)而發(fā)光。GFP的優(yōu)點很多:首先,它本身穩(wěn)定,不需要任何反應底物和輔助因子,且無種屬限制,可在多種生物細胞中表達發(fā)出穩(wěn)定熒光,在450490nm 藍光激發(fā)下,發(fā)光能保持

4、 10min 以上。其次,其分子量小,對目的基因的功能無任何影響,融合蛋白具有與GFP一樣的熒光性質(zhì),對細胞沒有毒性。最后,GFP觀察方便,利用激光掃描共聚焦顯微鏡,甚至普通顯微鏡都可以觀察到活細胞內(nèi)蛋白的變化、活動,用肉眼就可對辨別細胞是否表達及其表達水平。作為一種新型的報告基因, 綠色熒光蛋白在生命科學的各個領(lǐng)域得到廣泛的應用:利用綠色熒光蛋白的特有發(fā)光機制,可將GFP作為蛋白標簽。就是利用 DNA 重組技術(shù),將目的基因與GFP基因構(gòu)成融合基因,轉(zhuǎn)染或轉(zhuǎn)化至合適的細胞進行表達,而后借助熒光顯微鏡觀察細胞內(nèi)活體中標記的蛋白質(zhì)。綠色熒光蛋白也可用于大規(guī)模藥物篩選。另外,由于綠色熒光蛋白獨特的光

5、信號傳導機制及其在表達后易被周圍化學環(huán)境和蛋白之間的相互作用影響的特性,極適用于成為活細胞體內(nèi)的光學感受器。近年來,由于融合抗體具有發(fā)射熒光和與抗原結(jié)合兩種特性,所以將其用做免疫染色的檢測試劑,直接用于流式細胞儀、免疫熒光的標記、腫瘤的檢測等。目前應用較多的是GFP的突變體增強型綠色熒光蛋白(Enhanced Green Fluorescent Protein,簡稱EGFP)。EGFP將GFP的第64位氨基酸苯丙氨酸突變成為亮氨酸,從而發(fā)射出的熒光強度比GFP大6倍以上。所以,EGFP比GFP更適合作為報告基因來研究基因表達、調(diào)控、細胞分化及蛋白質(zhì)在生物體內(nèi)的定位和轉(zhuǎn)運等EGFP (720bp

6、)的基因片段: ATGGTGAGCAAGGGCGAGGAGCTGTTCACCGGGGTGGTGCCCATCCTGGTCGAGCTGGACGGCGACGTAAACGGCCACAAGTTCAGCGTGTCCGGCGAGGGCGAGGGCGATGCCACCTACGGCAAGCTGACCCTGAAGTTCATCTGCACCACCGGCAAGCTGCCCGTGCCCTGGCCCACCCTCGTGACCACCCTGACCTACGGCGTGCAGTGCTTCAGCCGCTACCCCGACCACATGAAGCAGCACGACTTCTTCAAGTCCGCCATGCCCGAAGGCTACGTCCAGGAGCGCA

7、CCATCTTCTTCAAGGACGACGGCAACTACAAGACCCGCGCCGAGGTGAAGTTCGAGGGCGACACCCTGGTGAACCGCATCGAGCTGAAGGGCATCGACTTCAAGGAGGACGGCAACATCCTGGGGCACAAGCTGGAGTACAACTACAACAGCCACAACGTCTATATCATGGCCGACAAGCAGAAGAACGGCATCAAGGTGAACTTCAAGATCCGCCACAACATCGAGGACGGCAGCGTGCAGCTCGCCGACCACTACCAGCAGAACACCCCCATCGGCGACGGCCCCGTGCTGCTGCCCG

8、ACAACCACTACCTGAGCACCCAGTCCGCCCTGAGCAAAGACCCCAACGAGAAGCGCGATCACATGGTCCTGCTGGAGTTCGTGACCGCCGCCGGGATCACTCTCGGCATGGACGAGCTGTACAAGTAA2.大腸桿菌表達載體及表達系統(tǒng)大腸桿菌質(zhì)粒是一類獨立于染色體外自主復制的雙鏈、閉環(huán)DNA分子,大腸桿菌質(zhì)??煞譃榻Y(jié)合轉(zhuǎn)移型和非結(jié)合轉(zhuǎn)移型兩種,非結(jié)合轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒在通常培養(yǎng)條件下不在宿主間轉(zhuǎn)移,整合到染色體上的頻率也很低,具有遺傳學上的穩(wěn)定性和安全性。又因其大小一般在250kb范圍內(nèi),適合于制備和重組DNA的體外操作,因此幾乎所有的大腸桿菌表達系

9、統(tǒng)都選用非結(jié)合轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒作為運載外源基因的載體,這些表達載體通過對天然質(zhì)粒的改造獲得。理想的大腸桿菌表達載體要求具有以下特征:(1)穩(wěn)定的遺傳復制、傳代能力,在無選擇壓力下能存在于大腸桿菌細胞內(nèi)。(2)具有顯性的轉(zhuǎn)化篩選標記。(3)啟動子的轉(zhuǎn)錄是可以調(diào)控的,抑制時本底轉(zhuǎn)錄水平較低。(4)啟動子的轉(zhuǎn)錄的mRNA能夠在適當?shù)奈恢媒K止,轉(zhuǎn)錄過程不影響表達載體的復制。(5)具備適用于外源基因插入的酶切位點。復制子、篩選標志、啟動子、終止子和核糖體結(jié)合位點是構(gòu)成表達載體的最基本元件。大腸桿菌表達系統(tǒng)是基因表達技術(shù)中發(fā)展最早,目前應用最廣泛的經(jīng)典表達系統(tǒng)。一個完整的大腸桿菌表達系統(tǒng)至少要有表達載體和宿主菌

10、兩部分構(gòu)成。為了改善表達系統(tǒng)的性能和對各類外源基因的適應能力,表達系統(tǒng)有時還需要有特定功能基因的質(zhì)?;蛉茉椿晒勼w參與。到目前為止已經(jīng)成功發(fā)展了許多表達載體和相應的宿主菌。由于大腸桿菌本身的蛋白質(zhì)翻譯后修飾加工體系相當不完善,因此不能對重組蛋白質(zhì)進行修飾加工,這是大腸桿菌系統(tǒng)與其它表達系統(tǒng)相比存在的一個比較突出的缺陷。大腸桿菌的表達系統(tǒng)包括:Lac和Tac表達系統(tǒng),這是最早建立并得到廣泛應用的表達系統(tǒng),它是以大腸桿菌lac操縱子調(diào)控機理為基礎(chǔ)設(shè)計、構(gòu)建的表達系統(tǒng)。PL和PR表達系統(tǒng),它是以噬箘體早期轉(zhuǎn)錄啟動子PL、PR為核心構(gòu)建的表達系統(tǒng)稱為PL和PR表達系統(tǒng)。T7表達系統(tǒng),大腸桿菌T7噬箘體

11、具有一套專一性非常強的轉(zhuǎn)錄體系,利用這一體系中的元件為基礎(chǔ)構(gòu)建的表達系統(tǒng)稱為T7表達系統(tǒng)。此外還有其他表達系統(tǒng),如營養(yǎng)調(diào)控型、糖原調(diào)控型、pH調(diào)控型等。3SDS-PAGE原理SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳,是在聚丙烯酰胺凝膠系統(tǒng)中引進SDS,SDS能斷裂分子內(nèi)和分子間氫鍵,破壞蛋白質(zhì)的二級和三級結(jié)構(gòu),強還原劑能使半胱氨酸之間的二硫鍵斷裂,蛋白質(zhì)在一定濃度的含有強還原劑的SDS溶液中,與SDS分子按比例結(jié)合,形成帶負電荷的SDS-蛋白質(zhì)復合物,這種復合物由于結(jié)合大量的SDS,使蛋白質(zhì)喪失了原有的電荷狀態(tài)形成僅保持原有分子大小為特征的負離子團塊,從而降低或消除了各種蛋白質(zhì)分子之間天然的電荷差異,由于S

12、DS與蛋白質(zhì)的結(jié)合是按重量成比例的,因此在進行電泳時,蛋白質(zhì)分子的遷移速度取決于分子大小。當分子量在15KD到200KD之間時,蛋白質(zhì)的遷移率和分子量的對數(shù)呈線性關(guān)系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW為分子量,X為遷移率,k、b均為常數(shù),若將已知分子量的標準蛋白質(zhì)的遷移率對分子量對數(shù)作圖,可獲得一條標準曲線,未知蛋白質(zhì)在相同條件下進行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標準曲線上求得分子量。SDS- 聚丙烯酰胺凝膠使用一種不連續(xù)的緩沖系統(tǒng)。在這一系統(tǒng)中,一般凝膠分為低濃度的成層膠(濃縮膠)和較高濃度的分離膠。在電泳時, SDS-多肽復合物向兩膠界面遷移,在分離膠表面形成了一個極薄的層,極大

13、地濃縮了樣品的體積,使樣品在分離之前處于同一起跑線。一般來說,在被分析的蛋白質(zhì)穩(wěn)定的pH范圍,凡是不與SDS發(fā)生相互作用的緩沖液都可以使用,但緩沖液的選擇對蛋白帶的分離和電泳的速度是非常關(guān)鍵的。Tris-甘氨酸系統(tǒng)是目前使用最多的緩沖系統(tǒng)。如果要測定糖蛋白的分子量,最好采用Tris-硼酸鹽緩沖系統(tǒng),對于分子質(zhì)量小于15kDa的蛋白樣品,可以使用SDS-尿素系統(tǒng),也可以采用Tris-tricine緩沖系統(tǒng)。4.蛋白分離與檢測蛋白質(zhì)的分離方法很多,依據(jù)分子大小分離的方法包括:透析和超過濾,透析指利用蛋白質(zhì)分子不能通過半透膜而與小分子分離;超濾是利用壓力或離心力使小分子溶質(zhì)通過半透膜而蛋白質(zhì)被截留在

14、膜上而分離。密度梯度離心,蛋白質(zhì)顆粒在具有密度梯度的介質(zhì)中離心時,質(zhì)量和密度大的顆粒比質(zhì)量和密度小的顆粒沉降得快,且每種蛋白質(zhì)顆粒沉降到與其自身密度相等的介質(zhì)密度梯度時,即停止不前,最后各種蛋白質(zhì)在離心管中被分離成不同的區(qū)帶。凝膠過濾,即分子排阻層析。凝膠顆粒內(nèi)部為多孔的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。大分子最先流出層析柱。 根據(jù)溶解度分離的方法包括:鹽溶和鹽析,中性鹽在低濃度時可增加蛋白質(zhì)的溶解度,即鹽溶。原因是蛋白質(zhì)分子吸附鹽類離子后,帶電層使蛋白質(zhì)分子彼此排斥,而與水分子相互作用加強;當離子強度增大到足夠高時,此時與蛋白質(zhì)疏水基團接觸的自由水被移去以溶劑化鹽離子,導致蛋白質(zhì)疏水基團暴露,使蛋白質(zhì)因疏

15、水作用凝聚沉淀。 根據(jù)所帶電荷分離的方法包括:電泳(凈電荷、分子大小、形狀),區(qū)帶電泳、聚丙烯酰氨凝膠電泳(PAGE)、毛細管電泳 離子交換層析。其余的方法還有吸附層析、親和層析、高效液相層析(HPLC),快速蛋白液相層析(FPLC)等。蛋白質(zhì)的檢測方法包括:凱氏定氮法,它是樣品與濃硫酸共熱。含氮有機物即分解產(chǎn)生氨(消化),氨又與硫酸作用,變成硫酸氨。經(jīng)強堿堿化使之分解放出氨,借蒸汽將氨蒸至酸液中,根據(jù)此酸液被中和的程度可計算得樣品之氮含量。雙縮尿法,雙縮脲(NH3CONHCONH3)是兩個分子脲經(jīng)180左右加熱,放出一個分子氨后得到的產(chǎn)物。在強堿性溶液中,雙縮脲與CuSO

16、4形成紫色絡(luò)合物,稱為雙縮脲反應。凡具有兩個酰胺基或兩個直接連接的肽鍵,或能過一個中間碳原子相連的肽鍵,這類化合物都有雙縮脲反應。Folin酚試劑法,此法的顯色原理與雙縮脲方法是相同的,只是加入了第二種試劑,即Folin酚試劑,以增加顯色量,從而提高了檢測蛋白質(zhì)的靈敏度。這兩種顯色反應產(chǎn)生深藍色的原因是:在堿性條件下,蛋白質(zhì)中的肽鍵與銅結(jié)合生成復合物。Folin酚試劑中的磷鉬酸鹽磷鎢酸鹽被蛋白質(zhì)中的酪氨酸和苯丙氨酸殘基還原,產(chǎn)生深藍色(鉬蘭和鎢蘭的混合物)。在一定的條件下,藍色深度與蛋白的量成正比。紫外吸收法,蛋白質(zhì)分子中,酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸殘基的苯環(huán)含有共軛雙鍵,使蛋白質(zhì)具有吸收紫外光

17、的性質(zhì)。吸收高峰在280nm處,其吸光度(即光密度值)與蛋白質(zhì)含量成正比。此外,蛋白質(zhì)溶液在238nm的光吸收值與肽鍵含量成正比。利用一定波長下,蛋白質(zhì)溶液的光吸收值與蛋白質(zhì)濃度的正比關(guān)系,可以進行蛋白質(zhì)含量的測定。5. pET28a 質(zhì)粒pET28a 質(zhì)粒作為表達載體, 該質(zhì)粒含有強啟動子T7 啟動子, 可以使目的基因得到高效表達。其N端含有Thrombin蛋白酶切位點。 Pet28a的抗性是kana抗性,通常所用的表達菌株是BL21(DE3),BL21(DE3)Gold等BL21(DE3)系列的宿主菌。pET28a, b, c的差異僅僅存在于多克隆位點處,Pet28a和pET28b,pet

18、28c的載體的區(qū)別是差了一個核苷酸堿基,目的是便于在進行克隆構(gòu)建的時候調(diào)整氨基酸讀碼框,使得基因都可以克隆到這個系列目的載體中去。pET28a:5' 測序引物及序列:T7: 5'-TAATACGACTCACTATAGGG-3'3' 測序引物序列:  T7t: 5'-GCTAGTTATTGCTCAGCGG-3'二 試驗流程1. 實驗器材及試劑超低溫冰箱、電熱恒溫培養(yǎng)箱、恒溫調(diào)速搖床、PCR 擴增儀、電泳儀、高速冷凍離心機、電子天平、水浴鍋、低溫高速離心機、快速混勻器、EGFP-N3 模板、菌株E. coli DH5、E. col

19、i BL21、質(zhì)粒 pET28a、限制性內(nèi)切酶 EcoR, Hind 、T4 DNA 連接酶、DNA 凝膠回收試劑盒及質(zhì)粒、小提試劑盒、DNA 純化試劑盒及 IPTG、PCR用試劑、卡那霉素、瓊脂糖及 PCR 合成引物等、蛋白胨、酵母浸出粉、瓊脂粉等2. 實驗流程(實驗中樣品用量根據(jù)提取的各種載體、質(zhì)粒的濃度相應的改變)2.1堿裂變法提質(zhì)粒2.1.1細菌的培養(yǎng) 1) 添加適量的抗菌素(Ap: 20 mg/mL母液終濃度50100 ug/mL)(避免雜菌污染,防止質(zhì)粒的丟失) 2) 接種(20 mL+Ap50 mL+Ap)3) 控制菌體的生長狀態(tài)(37過夜培養(yǎng)或轉(zhuǎn)接24菌液至新鮮培養(yǎng)基中, 37

20、繼續(xù)培養(yǎng)至對數(shù)生長中后期)。2.1.2細胞裂解提取質(zhì)粒DNA(4操作,每100mg菌體量,加入)1)稱離心管重W1,加入約1/2離心管的菌液,與另一組同學配平,6000r/min離心5min。2)棄去上清液,再加入5ml溶液,混勻,6000r/min離心5min,棄去上清液,稱離心管重量為W2,計算菌體量W。3)1.0mL溶液,充分渦旋震蕩,用溶液再次配平。4)2.0mL溶液,輕柔顛倒混勻,冰浴3-5min。5)15mL溶液,輕柔顛倒混勻,冰浴5min。6)12000rpm,15min;小心轉(zhuǎn)移上清到新的離心管中,記錄體積V。7)加入2V冰乙醇,顛倒混勻;-20,15min。8)12000rp

21、m,15min,棄上清。9)加入5mL70%乙醇,12000rpm,3min,吸棄上清液。10)重復乙醇洗滌一次,37風干5-10min。11)分次加入1mLTE溶液并轉(zhuǎn)移到Ep管中,得到質(zhì)粒DNA粗提物。12)加入50ulRNase(10mg/ml),終濃度為50ug/ml,37孵育1-2h。2.1.3質(zhì)粒DNA的純化1)1ml粗提物均分于兩個Ep管中,加入等體積Tris飽和酚,混勻,12000rpm離心5min。2)轉(zhuǎn)移上清V1至新管,加入V1的酚/氯仿/異戊醇混合液,混勻,12000rpm離心5min。3) 轉(zhuǎn)移上清V2至新管,加入V2的氯仿/異戊醇溶液,混勻,12000rpm離心5mi

22、n。4)轉(zhuǎn)移上清V3至新管,加入1/10V3的3MNaAc溶液(pH=5.2),再加入2V4(V4=V3+1/10V3)的冰乙醇,混勻,-20保存30min。5)12000rpm離心14min,棄上清。 6)加入500ul70%乙醇洗滌,12000rpm離心2min,棄上清。7)重復洗滌一次,吸棄上清液,37風干5min。8)每管加入25ulTE溶解沉淀,合并,得到50ul純化質(zhì)粒DNA。2.2重組質(zhì)粒的構(gòu)建2.2.1 EGFP和質(zhì)粒DNA的酶切加樣順序為:ddH2O-Buffer(緩沖液)-DNA-限制性內(nèi)切酶 Hind;在不同的1.5ml無菌離心管中,按照表1中、組樣量順序加入各組分(將少

23、量的樣品加在管壁上,確保加樣準確)。樣品混勻后,4000rpm離心1min,將液體集中于管底。酶切后,可以用電泳檢測一下酶切的效果。表1.限制性內(nèi)切酶反應體系加樣順序加樣序號反應體系成分pUC19(各組)EGFP(商品)體積(l)體積(l)1ddH2O13.070.0210X M buffer2.010.03DNA4.015.04Hind(15U/l)1.05.0共計20.0100.0(50+50)備注各組1份全班1份2.2.2載體與外源片段的連接取無菌1.5mlEP管,加樣順序為:ddH2O-Buffer-pUC19/Hind- EGFP /Hind-T4DNA Ligase(見表二) 表2

24、.T4連接酶反應體系加樣順序加樣序號成分體積(l)1ddH2O3.2210X T4 Ligase Buffer1.03pUC19/Hind1.54EGFP /Hind3.55T4DNA Ligase08共計10.02.3 重組DNA質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化、鑒定與篩選2.3.1 感受態(tài)細胞的制備(注意冰浴、離心)1倒LB平板,劃線活化E.coliDH5,培養(yǎng)一段時間。挑取單菌落接種到5mlLB液體中,37震蕩培養(yǎng)過夜。將過夜培養(yǎng)物按1%轉(zhuǎn)接至新鮮20mlLB液體,37,220rmp震蕩2-2.5h。2取2個干凈的Ep管(編號SG-1-1、SG-1-2),各加入上述菌液1.5ml,4000rmp離心5min,

25、棄上清,再各加入1.5ml菌液,4000rmp離心5min,棄上清。3. 利用殘留液體渦旋細胞,然后加入800l預冷的0.1M CaCl2,冰浴懸浮細胞,隨后4000rmp離心5min,棄上清。4. 加入100l冷0.1M CaCl2,輕輕懸浮細胞,冰浴20min,之后將SG-1-2分裝50l至SG-1-3管中。2.3.2 質(zhì)粒轉(zhuǎn)化 按表3的序號順序加樣、操作。表3.質(zhì)粒轉(zhuǎn)化步驟:171234567實驗設(shè)組感受態(tài)細胞(l/管)DNA(l)冰浴熱擊冰浴復蘇培養(yǎng)基涂布平板實驗組100連接物5.010min90s5minLB:0.9ml/管,0.5-1h麥+Ap50l×2100l×

26、;2150l×2200l×2轉(zhuǎn)化對照50pUC19(自提)1.0麥+Ap50l×1細胞對照50麥+Ap50l×1麥50l×1備注預留一個空白麥+Ap平板; 共計:11(麥+Ap)和1(麥),倒置于37恒溫箱中培養(yǎng)16-20h(本實驗兩天后來觀察結(jié)果)。2.3.3 重組子的篩選與培養(yǎng)1. 觀察幾天前的涂布培養(yǎng)結(jié)果并記錄,著重包括:菌落生長情況、生長的菌落的顏色、菌落數(shù)量的多少,并測量菌落的pH值。2. 從實驗組的2個50ul的平板中挑出4個白色單菌落,在事先預留的空白麥+Ap平板上分區(qū)劃線培養(yǎng)。將接好菌的平板放在恒溫培養(yǎng)箱中。2.4 PCR反應2

27、.4.1試劑盒法提質(zhì)粒1. 觀察上次劃線的平板中的菌落是否為白色。用燒好的鑷子夾著無菌牙簽劃取帶有重組質(zhì)粒的E.coliDH5a(白色的菌落),將帶有質(zhì)粒的E.coli接種于5ml LB/抗生素培養(yǎng)液中,37搖床培養(yǎng)1216個小時。2. 取1.05.0ml的菌液,室溫下10000xg離心1min收集細菌。3. 倒棄培養(yǎng)基,加入250ul Solution/RNase A混合液,漩渦震蕩使細胞完全懸浮。4. 往重懸混合液中加入250ul Solution,輕輕顛倒混勻46次,此操作避免劇烈混勻裂解液且裂解反應不要超過5min。5. 加入350ul Solution,溫和顛倒數(shù)次至形成白色絮狀沉淀

28、。6. 室溫下,10000xg離心10min。7. 轉(zhuǎn)移上清液至套有2ml收集管的HiBind DNA結(jié)合柱中,室溫下,10000xg離心1min,倒去收集管中的濾液。8. 把柱子重新裝回收集管,加入500ul HB Buffer,按上述條件離心,棄去濾液。9. 把柱子重新裝回收集管,加入700ul DNA Wash Buffer,按上述條件離心,棄去濾液。注意:濃縮的DNA Wash Buffer在使用之前必須按標簽的提示用無水乙醇稀釋。10. 把柱子重新裝回收集管,10000xg離心空柱2min以甩干柱子基質(zhì)。注意:不要忽略次步這對去除柱子中殘留的乙醇至關(guān)重要。11. 把柱子裝在干凈的1.

29、5ml離心管上,加入3050ul Elution Buffer到柱子基質(zhì)中,靜置12分鐘,10000xg離心1min洗脫出DNA。2.4.2 PCR反應在進行PCR反應之前,可以用凝膠電泳檢測重組質(zhì)粒,看一下重組質(zhì)粒的大小,再用PCR擴增目的基因。以EGFP 片段為模板, 設(shè)計上游引物: 5-ATGGTGAGCAAGGGCGAGGAG-3,下游引物: 5- GGCTGATTATGATCTAGAGTC-3。可以先將模板適當稀釋,實驗要設(shè)置對照試驗,可根據(jù)需求自主設(shè)計加入各組分后,分別取模板、上游和下游引物、Taq酶(5u/ul)、dd水、10× Buffer、dNTP作為 PCR反應體

30、系(可參照表4加),輕彈混勻加入的液體,快速離心集液于管底。將制備好的PCR體系放入PCR機器中,PCR的反應程序如表5。表4. PCR體系的建立編號組分加量(ul)1dd水13.2210×Buffer2.03dNTP(2.5mM each)1.64M13F(10uM)15M13R(10uM)16摸板(1-10ng/ul)1.07Taq酶(5u/ul)0.2總體積20.0表5. PCR反應程序項目溫度時間預變性943min變性9430s復性5830s延伸7260s終延伸7210min保存42hr整個 PCR 反應體系共進行 35 個循環(huán)。擴增產(chǎn)物用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳驗證。2.5

31、重組表達載體的構(gòu)建2.5.1 EGFP 基因和 pET28 a 表達載體的限制性酶切處理取上述經(jīng)PCR擴增后的目的片段作為PCR反應的模板, 設(shè)計引入EcoR酶切位點的上游引物( 5GGAG / AATTCATGGTGAGCAAGGGCGAGGAG3)和 引 入Hind 酶切位點的下游引物( 5CCGA / AGCTTGGCTGATTATGATCTAGAGTC3)。PCR 反應體系及反應條件同2.4.2。擴增產(chǎn)物用1% 瓊脂糖凝膠電泳檢驗。PCR后的EGFP片段進行雙酶切, 反應體系如下: 30L添加了酶切位點的 EGFP片段、5ul 10×buffer、1ul EcoR(20 U/L)、1ul Hind ( 20 U/L) ,用無菌水將反應液調(diào)至 50 L 后,于 37下保溫1 h, 然后在 65條件下處理20min 進行熱失活。另一方面, 將pET28a 質(zhì)粒載體按上述方法進行雙酶切。可以用瓊脂糖凝膠電泳對上述兩個酶切產(chǎn)物進行檢測。2.5.2 pET28a-EGFP重組表達載體的構(gòu)建 將上述含酶切位點的EGFP片段與線性pET28a質(zhì)粒按2:1比例、在45下保溫5 min 后, 置于冰浴中冷卻,冷卻后分別加入1ul T4DNA 連接酶、2ul10×T4DNA

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