細(xì)菌的分類及命名

1、一、細(xì)菌分類學(xué)一、細(xì)菌分類學(xué)對(duì)細(xì)菌進(jìn)行對(duì)細(xì)菌進(jìn)行分類，分類，命名與鑒定命名與鑒定的的 一門學(xué)科。一門學(xué)科。任務(wù)：任務(wù)：在全面了解在全面了解細(xì)菌生物學(xué)特征細(xì)菌生物學(xué)特征的基礎(chǔ)上，的基礎(chǔ)上，研究它們的研究它們的種類種類，探索其，探索其起源起源，演化演化以以及與及與其他類群之間的親緣關(guān)系其他類群之間的親緣關(guān)系，進(jìn)而提，進(jìn)而提出能反映出能反映自然發(fā)展的分類系自然發(fā)展的分類系統(tǒng)，并將細(xì)統(tǒng)，并將細(xì)菌加菌加以分門別類以分門別類。細(xì)菌分類學(xué)細(xì)菌分類學(xué)包括分類，命名和鑒定包括分類，命名和鑒定1、細(xì)菌分類：、細(xì)菌分類：根據(jù)細(xì)菌各自的特征，并根據(jù)細(xì)菌各自的特征，并按照按照親緣關(guān)系親緣關(guān)系分類，以不同等級(jí)分類，以不同

2、等級(jí)編排系編排系統(tǒng)統(tǒng)。分類有兩種：。分類有兩種： 細(xì)菌的生理生化分類法細(xì)菌的生理生化分類法，包括有傳，包括有傳統(tǒng)分類法和數(shù)值分類法。統(tǒng)分類法和數(shù)值分類法。 細(xì)菌核酸、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的同源程度細(xì)菌核酸、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的同源程度進(jìn)行分類法進(jìn)行分類法，稱種系分類或自然分類。，稱種系分類或自然分類。2、細(xì)菌命名、細(xì)菌命名：在分類基礎(chǔ)上，給每種：在分類基礎(chǔ)上，給每種細(xì)菌一個(gè)細(xì)菌一個(gè)科學(xué)名稱科學(xué)名稱，便于交流并保證所，便于交流并保證所有的科研工作者給予同樣名稱。有的科研工作者給予同樣名稱。3、細(xì)菌鑒定：、細(xì)菌鑒定：將未知細(xì)菌按分類原則，將未知細(xì)菌按分類原則，確定細(xì)菌的分類地位確定細(xì)菌的分類地位。 古菌古菌細(xì)菌細(xì)菌

3、3、細(xì)菌的分類單元、細(xì)菌的分類單元 細(xì)菌的分類單元與動(dòng)植物一樣，依次為細(xì)菌的分類單元與動(dòng)植物一樣，依次為科及科以上的劃分在細(xì)菌不太完善，且隨科及科以上的劃分在細(xì)菌不太完善，且隨著研究的深入科屬的劃分會(huì)發(fā)生變動(dòng)著研究的深入科屬的劃分會(huì)發(fā)生變動(dòng)Staphylococcus aureusStaphylococcus aureus RosenbachRosenbach 1884 1884屬名葡萄球菌屬名葡萄球菌種名金黃色種名金黃色命名人的姓命名人的姓命名年份命名年份金黃色葡萄球菌的學(xué)名為金黃色葡萄球菌的學(xué)名為Peptostreptococcus foetidusPeptostreptococcus f

4、oetidus （ VeillonVeillon ）SmithSmith屬名消化鏈球菌屬名消化鏈球菌種名惡臭種名惡臭原命名者原命名者改名者惡臭消化鏈球菌的學(xué)名惡臭消化鏈球菌的學(xué)名惡臭消化鏈球菌是由惡臭消化鏈球菌是由 Veillon 首先發(fā)現(xiàn)和定名的首先發(fā)現(xiàn)和定名的，后，后 Smith 重新定為現(xiàn)名。重新定為現(xiàn)名。 這些表型特征對(duì)細(xì)菌的鑒定和分類具有很重要的這些表型特征對(duì)細(xì)菌的鑒定和分類具有很重要的作用，尤其是在臨床微生物學(xué)的實(shí)中，至今仍有作用，尤其是在臨床微生物學(xué)的實(shí)中，至今仍有應(yīng)用價(jià)值。應(yīng)用價(jià)值。形態(tài)形態(tài)染色染色培養(yǎng)培養(yǎng)細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)生理生化生理生化抗原特性抗原特性1）DNA堿基堿基G

5、+C%比例的測(cè)定比例的測(cè)定u親緣關(guān)系相近的種比也相近，親緣關(guān)系相近的種比也相近，比差別大親緣關(guān)系必然遠(yuǎn)比差別大親緣關(guān)系必然遠(yuǎn)（G+C）%=100% A+T+G+CG+C簡稱簡稱GC比比u種內(nèi)差距種內(nèi)差距2.54.0, 種間種間5%, 屬間屬間差距差距10% 2）核酸分子雜交法）核酸分子雜交法DNA-DNA DNA-rRNA rRNA-rRNA 方法方法: : u待測(cè)菌株待測(cè)菌株dsDNA-ssDNA u參照菌株，同位素標(biāo)記的參照菌株，同位素標(biāo)記的ssDNA檢測(cè)雜合檢測(cè)雜合DNA的放射性強(qiáng)度的放射性強(qiáng)度，參照菌株自，參照菌株自身為身為DNA復(fù)性的放射性強(qiáng)度復(fù)性的放射性強(qiáng)度100% uDNA-DN

6、A雜交同源性性雜交同源性性 60%為同種為同種 70%同一亞種同一亞種 2060%為同一屬為同一屬3）rRNA寡核苷酸編目分析寡核苷酸編目分析urRNA是細(xì)胞中的是細(xì)胞中的“活化石活化石”原核生物：原核生物：23s、16s、5s 真核生物：真核生物：28s、18s、5.8s u16s或或18s用作系統(tǒng)分類用作系統(tǒng)分類：（提出三域：（提出三域?qū)W說）學(xué)說）u生理功能重要又恒定、含量高易提取、生理功能重要又恒定、含量高易提取、核苷酸序列保守、分子質(zhì)量適中、信息核苷酸序列保守、分子質(zhì)量適中、信息量大易于分析量大易于分析球菌球菌桿菌桿菌絲狀或樹枝狀絲狀或樹枝狀葡萄球菌葡萄球菌鏈球菌鏈球菌糞腸球菌糞腸球菌

7、微球菌微球菌MZN染色陰性染色陰性MZN染色陽性染色陽性牛放線菌牛放線菌粘性放線菌粘性放線菌星形奴卡菌星形奴卡菌剛果嗜皮菌剛果嗜皮菌產(chǎn)芽胞產(chǎn)芽胞無芽胞無芽胞抗酸染色陽性抗酸染色陽性抗酸染色陰性抗酸染色陰性梭菌梭菌芽胞桿菌芽胞桿菌炭疽桿菌炭疽桿菌分支桿菌分支桿菌牛分支桿菌和禽分支桿菌牛分支桿菌和禽分支桿菌鼠麻風(fēng)桿菌鼠麻風(fēng)桿菌副結(jié)核分支菌副結(jié)核分支菌棒狀桿菌棒狀桿菌化膿放線菌化膿放線菌馬紅球菌馬紅球菌產(chǎn)單核李氏桿菌產(chǎn)單核李氏桿菌豬丹毒桿菌豬丹毒桿菌球菌球菌/球桿菌球桿菌桿菌桿菌MZN染色陰性染色陰性MZN染色陰性染色陰性弧狀桿菌弧狀桿菌中等大小桿菌中等大小桿菌螺旋狀菌螺旋狀菌絲狀菌絲狀菌彎曲菌彎曲菌弧菌弧菌耐瑟菌耐瑟菌生摩拉菌生摩拉菌不動(dòng)桿菌不動(dòng)桿菌腸桿菌科腸桿菌科