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文檔簡(jiǎn)介

1、第一章1、3end and 5end:DNA或RNA單鏈帶有3-羥基或其磷酸酯的一段叫做3端;DNA或RNA單鏈帶有游離5-羥基或其磷酸酯的一段叫做5端。2、A、C、T、G:Adenine,guanine,cytosine,thymine 3、Melting temperature:熔解溫度,指DNA變性過(guò)程中通過(guò)加熱,有一半雙鏈被分解或形成單鏈時(shí)的溫度。4、Spontaneous mutations:在自然條件下發(fā)生的突變叫做自發(fā)突變或自然突變。 5、Transition:轉(zhuǎn)換是基因突變的一種,指一種嘧啶被另一種嘧啶代替、一種嘌呤被另一種嘌呤代替,G-C<=>A-T。 Trans

2、version:顛換是基因突變的一種,指異型堿基的置換,即嘌呤被嘧啶代替或相反,A-T<=>T-A或G-C<=>G-C。 6、Hotspot:突變熱點(diǎn)是突變發(fā)生頻率高的位點(diǎn)或重組頻率高的那些位點(diǎn)。7、Modified bases : 修飾堿基或稀有堿基,指除了那些在 DNA(A、T 、 G、C)、 RNA( A、 U 、G、C) 合成時(shí)的四種通用堿基之外的一些堿基,由核酸合成后修飾產(chǎn)生。9、Hybridization:雜交,指RNA 和 DNA 鏈互補(bǔ)配對(duì)形成 RNA-DNA 雜合鏈的過(guò)程。8、Denaturation:變性,指DNA或RNA加熱從雙鏈轉(zhuǎn)變?yōu)閱捂湹臓顟B(tài)。

3、 10、Renaturation(annealing): 復(fù)性(退火),DNA 雙螺旋分子變性后的互補(bǔ)單鏈再結(jié)合成雙鏈的過(guò)程。11、如何理解結(jié)構(gòu)決定功能(舉例說(shuō)明)? 第二章1、Viroid:類病毒,是沒(méi)有蛋白外殼的環(huán)狀小分子單鏈RNA感染因子,能引起高等植物基因序列的甲基化,從而導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄的失敗。2、PSTV: 土豆紡錘體管狀病毒 (potato spindle tuber virus) ,為比較典型的呈梯狀的類病毒,其RNA是一個(gè)裸露的閉合環(huán)狀單鏈RNA分子。 3、Prion:朊病毒,是一種蛋白質(zhì)樣感染因子,不含核酸但表現(xiàn)出可遺傳的特性,能引起人等哺乳動(dòng)物的中樞神經(jīng)系統(tǒng)病變。 PrP:朊病毒

4、相關(guān)蛋白(prion related protein)。 PrP C :是人等哺乳動(dòng)物的身體中存在的正常存在的細(xì)胞形式(c是細(xì)胞型的縮寫),可被蛋白酶完全水解。 PrP SC:是朊病毒相關(guān)蛋白的致病形式(sc是瘙癢癥的縮寫)。 PrPsc蛋白和PrPc蛋白和是同分異構(gòu)體,一級(jí)結(jié)構(gòu)相同,但PrPsc比PrPc具有更多的折疊,使得其溶解度降低,對(duì)蛋白酶抗性加強(qiáng),從而被蛋白酶水解,從而致使大腦細(xì)胞代謝異常致病。4、 Scrapie :羊瘙癢病,是最早發(fā)現(xiàn)的朊蛋白病。5、allele:等位基因,指位于染色體同一位置分別控制兩種不同性狀的基因。 6、Gain-of-function mutation:功

5、能獲得型突變,表示使蛋白質(zhì)獲得新的活性(或功能),性質(zhì)顯性的。 Null mutation:無(wú)效突變,表示基因的活性完全消失,因?yàn)樵摶蛞驯粍h除。 Loss-of-function mutation:功能喪失型突變,導(dǎo)致丟失原有功能的基因突變。即使得某一基因失活,這種性質(zhì)是隱性的。 Leaky mutants:遺漏突變,突變性狀表現(xiàn)得不完全的突變體,此突變不影響表型,功能并不是必需的。即基因仍存在部分功能,因?yàn)橥蛔兒蟮牡鞍踪|(zhì)存在部分活性(錯(cuò)義突變),或者因?yàn)楫a(chǎn)生了少量的野生型蛋白質(zhì)(無(wú)義突變)。 7、Each allele has a different phenotype, illustra

6、te byexample? 1)通常不同一系列等位基因往往具有表型。 比如果蠅中 white 位點(diǎn)的存在對(duì)紅眼的 形成是必要的。這個(gè)位點(diǎn)是根據(jù)無(wú)義突變命名的,該突變使果蠅在突變雜合子中 具有白色的眼睛。W+相對(duì)其他基因來(lái)說(shuō)是顯性的。一般有很多種不同的等位基 因。盡管一些突變基因并未產(chǎn)生眼睛顏色,但是一些基因產(chǎn)生了顏色。因此,每 一種突變等位基因代表了該基因的不同突變, 這些不同突變不會(huì)完全破壞基因的 功能,而是會(huì)保留一定得活性,由此會(huì)產(chǎn)生特征性的表型。2)位于染色體同一位置的分別控制兩種不同性狀的基因是等位基因,等位基因之間具有多種關(guān)系。比如,果蠅中white位點(diǎn)的存在對(duì)紅眼的形成是必要的。這

7、個(gè)位點(diǎn)是根據(jù)無(wú)義突變命名的,該突變使果蠅在突變雜合子中具有白色的眼睛。表述野生型和突變型基因時(shí),通常在野生型基因后面加上。當(dāng)?shù)任换虼嬖跁r(shí),一個(gè)動(dòng)物可能是攜帶兩種突變基因的雜合子。這種雜合子的表型依賴于每一個(gè)突變所遺留下的活性。從本質(zhì)上講,兩個(gè)突變基因間的關(guān)系與野生型和突變型間沒(méi)有區(qū)別,一個(gè)突變可能都是顯性的,也可能部分是顯性的。在任何一個(gè)遺傳位點(diǎn)上并非一定要有一個(gè)野生型基因。人類學(xué)行系統(tǒng)的比較就提供了一個(gè)例子:缺失功能有空白型表示,即O型;但是功能性的A型和B型是共顯性的,并且對(duì)O型表現(xiàn)出顯性。8、 The specificity determines the blood group for

8、 human (illustrate by example) .基因座會(huì)有一條以上的野生型等位基因,當(dāng)?shù)任换虼嬖跁r(shí),一個(gè)動(dòng)物可能是攜帶兩種突變基因的雜合子。這種雜合子的表型依賴于每一個(gè)突變所遺留下的活性。從本質(zhì)上講,兩個(gè)突變基因間的關(guān)系與野生型和突變型間沒(méi)有區(qū)別:一個(gè)突變可能是顯性的,可能是部分顯性,也可能都是顯性的。在任何一個(gè)遺傳位點(diǎn)上并非一定要有一個(gè)野生型基因。人類血型系統(tǒng)的比較就提供了一個(gè)例子。缺失功能由空白型表示,即O型。但是功能性的A型和B型是共顯性的,并且對(duì)O型表現(xiàn)出顯性。A或B都不能被認(rèn)為是野生型。因?yàn)樗鼈兇砜苫Q的作用,而不是功能的獲得或缺失。即一個(gè)群體中存在多條功能性等位

9、基因被稱為多態(tài)性。ABO血型基因座編碼半乳糖基轉(zhuǎn)移酶,其特異性決定了血型的差別。第三章1、DMD:杜興氏肌營(yíng)養(yǎng)不良癥,是人類常見(jiàn)的X染色體連鎖隱性遺傳的神經(jīng)-肌肉系統(tǒng)疾病,其病因?yàn)榧±w維中抗肌萎縮蛋白( muscular dystrophin)缺失導(dǎo)致肌纖維的破壞,肌肉萎縮 ,失去肌纖維的功能。2、DHFR:二氫葉酸還原酶(dihydrofolate reductase),利用NADPH催化二氫葉酸還原成四氫葉酸的氧化還原酶,受氨基蝶呤和氨甲蝶呤的競(jìng)爭(zhēng)性抑制。哺乳動(dòng)物的DHFR基因具有相似的構(gòu)成,有較短的外顯子和長(zhǎng)度變化廣泛但相對(duì)較長(zhǎng)的內(nèi)含子。3、 Conservation of exons

10、and its application:外顯子的保守性可以做為鑒定編碼區(qū)的基礎(chǔ),即通過(guò)確認(rèn)那些在許多生物體中都存在的序列片段。對(duì)于含有這樣基因的區(qū)域,即在許多生物中這些基因的功能長(zhǎng)期被保留下來(lái),這個(gè)序列所代表的蛋白質(zhì)應(yīng)當(dāng)有兩個(gè)特性:它必須有一個(gè)開(kāi)放閱讀框 (ORF);在其他生物中很可能存在與它相關(guān)的序列。物種雜交(zoo blot )可作為鑒定基因的第一個(gè)標(biāo)準(zhǔn):將來(lái)自一定區(qū)域的短片段(具放射性)作為探針,通過(guò)Southern 雜交(Southern blotting )檢測(cè)來(lái)自不同物種的相關(guān)DNA 。如果我們發(fā)現(xiàn)幾個(gè)物種中的雜交片段與某一探針相關(guān) 探針通常來(lái)自于人類 則這個(gè)探針就可成為一條基因

11、外顯子的候補(bǔ)片段。將這些候補(bǔ)片段進(jìn)行測(cè)序,如果它們有可讀框,則它們就一可被用來(lái)分離周圍的基因組區(qū)域。如果它們是一個(gè)外顯子的一部分,則可以用它們來(lái)鑒定整條基因,分離相應(yīng)的cDNA 和mRNA ,從而最終分離出蛋白質(zhì)。4、 translocation:易位,非同源染色體之間互換片段的一種畸變。5、Chromosome walking and its application:采用一段分離自某一重組體一端的非重復(fù)DNA片段作為探針含有相鄰序列的重組克隆采用一段分離自某一重組DNA克隆體一端的非重復(fù)DNA片段作為探針,一步一步地達(dá)到靶DNA以鑒定含有相鄰序列的重組克隆。 根據(jù)已知的基因或分子標(biāo)記連續(xù)步移

12、,獲取人、動(dòng)物和植物的重要調(diào)控基因,可以用于研究結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)調(diào)控,如分離克隆啟動(dòng)子并對(duì)其功能進(jìn)行研究; 步查獲取新物種中基因的非保守區(qū)域,從而獲得完整的基因序列; 鑒定T-DNA或轉(zhuǎn)座子的插入位點(diǎn),鑒定基因槍轉(zhuǎn)基因法等轉(zhuǎn)基因技術(shù)所導(dǎo)致的外源基因的插入位點(diǎn)等; 用于染色體測(cè)序工作中的空隙填補(bǔ),獲得完整的基因組序列; 用于人工染色體PAC、YAC和BAC的片段搭接。6、 exon trapping and its application:外顯子捕獲技術(shù),即對(duì)基因組片段迅速掃描從而得知外顯子存在的一種技術(shù)。將擬檢測(cè)基因組序列克隆在特異性表達(dá)載體所含兩個(gè)外顯子之間的一個(gè)內(nèi)含子中進(jìn)行表達(dá),如果基因組片

13、段中含有一個(gè)外顯子,那么它的序列可以在細(xì)胞質(zhì)RNA中被發(fā)現(xiàn);但如果基因組片段中只由內(nèi)含子中的序列組成,那么剪接就不會(huì)發(fā)生,且mRNA也不會(huì)運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞質(zhì)中。 外顯子測(cè)序技術(shù)是指利用目標(biāo)序列捕獲技術(shù)將基因組的全部外顯子區(qū)域 DNA 捕獲后進(jìn)行高通量測(cè)序的技術(shù)。利用外顯子測(cè)序技術(shù)可以準(zhǔn)確地找到人類罕見(jiàn)疾病的致病基因。7、UTR:非翻譯區(qū)(Untranslated Regions),是信使RNA分子兩端的非編碼片段。 5'-UTR從mRNA起點(diǎn)的甲基化鳥(niǎo)嘌呤核苷酸帽延伸至AUG起始密碼子,3'-UTR從編碼區(qū)末端的終止密碼子延伸至多聚A尾巴(Poly-A)的前端。8、globin:珠蛋

14、白,血紅蛋白和肌紅蛋白中的蛋白質(zhì)組分。血紅蛋白分子由2對(duì)不同的珠蛋白組成四聚體;肌紅蛋白只有1條珠蛋白多肽鏈。9、Rubisco:1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(Ribulose bisphosphate carboxylase oxygenase),是光合作用C3碳反應(yīng)中重要的羧化酶,也是光呼吸中不可缺少的加氧酶。第四章 1、shot-gun approach:鳥(niǎo)槍法,利用限制性酶將目的DNA切成隨機(jī)性片段(將基因組DNA克隆入DNA載體,轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞,構(gòu)建基因組文庫(kù),再?gòu)幕蚪M文庫(kù)中篩選得所需要的序列或基因克隆,)再將這些片段的序列連接起來(lái)的測(cè)序方法。 2、銜接物:銜接物(Linker

15、),是一種用人工方法合成的DNA短片段,其上具有一個(gè)或數(shù)個(gè)限制酶識(shí)別位點(diǎn),通過(guò)酶切產(chǎn)生粘性末端正常連接。3、末端轉(zhuǎn)移酶:末端轉(zhuǎn)移酶(Terminal transferase, TdT),是一種無(wú)需模板的DNA聚合酶,在二價(jià)陽(yáng)離子存在下,末端轉(zhuǎn)移酶催化 dNTP (脫氧核糖核苷三磷酸)加于 DNA 分子的 3' 羥基端。 帶有凸出、凹陷或平滑末端的單雙鏈DNA分子均可作為TdT的底物。若 dNTP 為T或C,此二價(jià)陽(yáng)離子首選Co2+鈷離子;若 dNTP 為A或 G,首選鎂離子Mg2+。4、 Saccharomyces cerevisiae:釀酒酵母(Saccharomyces cerev

16、isiae),又稱面包酵母或出芽酵母,是指能將糖類轉(zhuǎn)化為酒精的酵母。釀酒酵母是與人類關(guān)系最廣泛的一種酵母,不僅因?yàn)樗糜谥谱?、饅頭等食品及釀酒,而且作用真核模式生物(原核的模式生物大腸桿菌)。 5、C. elegans:秀麗隱桿線蟲(chóng)(Caenorhabditis elegans,C. elegans),是一種無(wú)毒無(wú)害、可以獨(dú)立生存的線蟲(chóng)。其個(gè)體小,成體僅1.5mm長(zhǎng),為雄性或雌雄同體,有五對(duì)常染色體(autosome)和一對(duì)性染色體(sex chromsome),是一個(gè)染色體數(shù)很少的二倍體。 6、非互補(bǔ)粘性末端DNA分子間的連接方法。 如果要連接的是具有非互補(bǔ)的粘性末端的載體分子和外源DNA片

17、段,可先用Sl核酸酶除去粘性末端,形成平末端的片段,便可按平末端連接法分別給它們加上相同的一段銜接物。如此帶有銜接物的載體分子和外源DNA片段,隨后再用只在銜接物中具有的唯一識(shí)別位點(diǎn)的限制酶切割,結(jié)果就會(huì)產(chǎn)生出能夠彼此互補(bǔ)的粘性末端。這樣就可以按照常規(guī)的辦法,用T4 DNA連接酶將它們連接起來(lái)。 7、 gene amplification:基因的擴(kuò)增,是指帶有外源DNA片段的重組體分子在體外構(gòu)成之后,導(dǎo)入適當(dāng)?shù)募闹骷?xì)胞進(jìn)行繁殖,從而獲得大量的單一的重組體DNA分子的過(guò)程。 8、transformation:轉(zhuǎn)化一詞嚴(yán)格地說(shuō)是指,感受態(tài)的大腸桿菌細(xì)胞捕獲和表達(dá)質(zhì)粒載體DNA分子的生命過(guò)程;而轉(zhuǎn)染

18、(transfection)一詞,則是專指感受態(tài)的大腸桿菌細(xì)胞捕獲和表達(dá)噬菌體DNA分子的生命過(guò)程。但從本質(zhì)上講,兩者并沒(méi)有什么根本的差別。無(wú)論轉(zhuǎn)化還是轉(zhuǎn)染,其關(guān)鍵的因素都是用氯化鈣處理大腸桿菌細(xì)胞,以提高膜的通透性,從而使外源DNA分子能夠容易地進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)部。9、 How to clone gene for genome?基因組DNA克隆與cDNA克隆不同,它的出發(fā)材料是基因組DNA。由于cDNA分子比較小,可以在質(zhì)粒載體上克隆。高等真核生物染色體基因組DNA的基因文庫(kù),通常是用噬菌體或柯斯質(zhì)粒作載體構(gòu)建的。第五章1. Plasmid:質(zhì)粒,是細(xì)菌細(xì)胞內(nèi)獨(dú)立于染色體之外的、能自主復(fù)制的雙鏈環(huán)

19、狀DNA分子。是DNA重組技術(shù)中的重要工具,大多數(shù)是經(jīng)過(guò)人工改造或構(gòu)建的,常含抗生素抗性基因。 Phage:噬菌體,是一種溫和的誘導(dǎo)性噬菌體,其基因組除在5'端有12個(gè)可互補(bǔ)的堿基外均為線性雙鏈DNA,感染時(shí)DNA形成環(huán)狀。噬菌體作為外源基因克隆載體可以攜帶較長(zhǎng)的外源DNA片段。 Cosmid:粘粒(cos site-carrying plasmid),是人工建造的含有cos序列和質(zhì)粒復(fù)制子的攜有噬菌體染色體黏性末端的質(zhì)粒。 4. TdT:末端轉(zhuǎn)移酶(Terminaltransferase,TdT)是一種無(wú)需模板的DNA聚合酶,能夠催化脫氧核苷酸結(jié)合到DNA分子的3'羥基端。

20、5. GATC:同尾酶,一類識(shí)別DNA分子中不同核苷酸序列,但能酶切產(chǎn)生相同黏性末端的限制性內(nèi)切酶7. genome:基因組,指單倍體細(xì)胞中包括編碼序列和非編碼序列在內(nèi)的全部DNA分子。是有機(jī)體內(nèi)一組完整的基因,是一種生物體具有的所有遺傳信息的總和,它最終由DNA 的全序列決定。8. genetic map(linkage map ):遺傳圖譜(genetic map )或連鎖圖譜(linkage map )是根據(jù)重組頻率來(lái)確定突變位點(diǎn)之間的距離。這種方法需要依靠對(duì)表型有影響的突變體的產(chǎn)生,故其應(yīng)用非常有限,而且由于重組頻率并不能準(zhǔn)確反映位點(diǎn)之間的物理距離,所以它不能確切反映遺傳物質(zhì)的物理距離

21、。 9. genetic polymorphism : 遺傳多態(tài)性,指一個(gè)基因座上有多條等位基因的現(xiàn)象。10. SNP:?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性(single nucleotide polymorphism)當(dāng)比較等位基因時(shí),其單個(gè)核苷酸的改變被稱為單核苷酸多態(tài)性,從SNP 的角度來(lái)看,每一個(gè)人的基因組都是獨(dú)一無(wú)二的。12、蛋白組學(xué)研究中所用的方法及原理13. 試說(shuō)明每個(gè)等位基因具有不同的表型 (舉例)。機(jī)體存在著多條等位基因,每一條等位基因都會(huì)對(duì)表型產(chǎn)生不同的影響。我們把一個(gè)基因座上有多條等位基因的現(xiàn)象稱作遺傳多態(tài)性,當(dāng)多條等位基因在一個(gè)種群中穩(wěn)定存在時(shí),這些等位基因所在的位置被認(rèn)為是多態(tài)性的。突變等

22、位基因多態(tài)性的基礎(chǔ)是它們產(chǎn)生了影響蛋白質(zhì)功能的突變體,因此會(huì)在表型上產(chǎn)生一些變化,比較這些等位基因,它們各自的限制圖譜或者DNA序列是互不相同的。14. 限制性位點(diǎn)能否體現(xiàn)孟德?tīng)栠z傳的特性。限制位點(diǎn)多態(tài)性的遺傳規(guī)律符合孟德?tīng)柖伞O聢D中顯示了一個(gè)祖孫三代的限制性多態(tài)家譜,從圖譜中可以看到在所有可能的配對(duì)重組中,某個(gè)限制標(biāo)記的4 條等位基因都能找到,并且它們?cè)诿恳淮歇?dú)立地分離,表明了DNA分子標(biāo)記片段的孟德?tīng)栠z傳定律。15. RFLP可以作為一種遺傳標(biāo)記。 所謂RFLP,即DNA限制片段長(zhǎng)度多態(tài)性,它是指應(yīng)用特定的核酸內(nèi)切限制酶切割有關(guān)的DNA分子,所產(chǎn)生出來(lái)的DNA片段在長(zhǎng)度上的簡(jiǎn)單變化。由

23、于核酸內(nèi)切限制酶是以一種序列特異的方式切割DNA分子,來(lái)自一個(gè)完整的純合子個(gè)體(所有的基因及DNA序列)的每一種同源的DNA分子,都會(huì)在同樣的位點(diǎn)被準(zhǔn)確地切割。從不同的生態(tài)型(ecotype)或不同的地理隔離群(geographical isolate)植株分離的總DNA中,同源DNA分子通常會(huì)表現(xiàn)出序列的趨異性(divergence),形成RFLP(圖12 )。這些RFLP是由于DNA序列上的特定變化(突變)引起的,因此它們也能夠像其他任何遺傳標(biāo)記一樣進(jìn)行定位,成為一種十分有用的分子標(biāo)記。他檢測(cè)的不是一些特征性表型而是通過(guò)檢測(cè)限制圖譜來(lái)直接揭示基因型。由于限制標(biāo)記不限于那些對(duì)表型有影響的基因

24、組的變化,因此它們成為分子水平上測(cè)定遺傳基因座的有力工具。限制標(biāo)記可以提供檢測(cè)疾病的診斷程序,可以對(duì)基因的分離提供參考16. genetic markers:遺傳標(biāo)記,研究遺傳性狀時(shí)所找的參照物。17. 目前遺傳研究中所使用用的四類遺傳標(biāo)記。(1)Morphological markers(形態(tài)學(xué)標(biāo)記) (Plant height, leave color and shape);(2)Cytological markers (細(xì)胞學(xué)標(biāo)記) (Nuclear type, triplet);(3)Biochemical markers (生化標(biāo)記) (Soluble protein, isozym

25、e);(4)Molecular markers (DNA, RNA, rRNA) (分子標(biāo)記)18. SSR:簡(jiǎn)單重復(fù)順序(Simple Sequence Repeat),即微衛(wèi)星DNA標(biāo)記 RAPD: Randomly Amplified Polymorphic DNA 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA AFLP: Amplified Fragment Length Polymorphism 擴(kuò)增的限制性內(nèi)切酶片段長(zhǎng)度多態(tài)性 Satellite: 衛(wèi)星DNA (重復(fù)單位為幾百-幾千堿基對(duì)) MS: Microsatellite:微衛(wèi)星DNA (重復(fù)單位為2-5堿基對(duì))20. Genomics:基因組學(xué),

26、研究基因組的結(jié)構(gòu)、功能及表達(dá)產(chǎn)物的學(xué)科,包括結(jié)構(gòu)、功能和比較基因組學(xué)等三個(gè)領(lǐng)域。21. Transcriptomics:轉(zhuǎn)錄組學(xué),研究基因組轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的全部轉(zhuǎn)錄物的種類、結(jié)構(gòu)和功能的學(xué)科。22. Proteomics:蛋白組學(xué),研究基因組編碼的全部蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)和功能的學(xué)科。L6 1. PLoS:公共科學(xué)圖書館(Public Library of Science),是一個(gè)由科學(xué)家和醫(yī)生組成的非營(yíng)利機(jī)構(gòu),致力于把世界上科學(xué)和醫(yī)學(xué)的文獻(xiàn)作為免費(fèi)資源向公眾放。 2. Null mutation:無(wú)效突變,由于大片段插入、缺失或重排而導(dǎo)致基因產(chǎn)物完全無(wú)效的突變。3. Redundancy:冗余,在同

27、一條染色體上或在不同染色體上的基因組內(nèi)有兩個(gè)或更多個(gè)基因編碼同一種或十分相似的蛋白質(zhì),這些基因中沒(méi)有一個(gè)基因是必需的。4.biochip:生物芯片,指將大量探針?lè)肿庸潭ㄓ谥С治锷虾笈c帶熒光標(biāo)記的DNA或蛋白等其他樣品分子進(jìn)行雜交,通過(guò)檢測(cè)每個(gè)探針?lè)肿拥碾s交信號(hào)強(qiáng)度進(jìn)而獲取樣品分子的數(shù)量和序列信息。5. SAGE:基因表達(dá)系列分析(基因表達(dá)連續(xù)分析法)是一種新的基因表達(dá)分析方法,它能對(duì)特定細(xì)胞或組織中的大量轉(zhuǎn)錄本同時(shí)進(jìn)行定量分析。6. DD法:即mRNA差別顯示(differential display of RNA by PCR), 是一種新的研究基因差異表達(dá)的有力工具。這個(gè)方法的主要程序是將

28、細(xì)胞內(nèi)的mRNA抽提出來(lái),反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再經(jīng)PCR隨機(jī)擴(kuò)增, 通過(guò)在測(cè)序凝膠上電泳條帶的比較篩選出不同的表達(dá)的基因,并回收這些DNA片段,經(jīng)擴(kuò)增后作為探針,在cDNA或基因組DNA庫(kù)中掃描找到相關(guān)基因。7. EST:(expressed sequence tag,EST)表達(dá)序列標(biāo)簽: 是指短的、單次(測(cè)序)閱讀的cDNA 5 或3 端序列。也包括來(lái)自于差異顯示和RACE實(shí)驗(yàn)的cDNA序列。一般是來(lái)自不同組織來(lái)源的cDNA序列,長(zhǎng)度在300-500bp左右。 8. HDA:high-density oligonucleotide array (高密度寡聚核苷酸陣列)9. RACE

29、: 又稱為cDNA末端的快速擴(kuò)增 (rapid amplification of cDNA ends,RACE) 是一種基于mRNA反轉(zhuǎn)錄和 PCR技術(shù)建立起來(lái)的、以部分的已知序列為起點(diǎn)、擴(kuò)增基因轉(zhuǎn)錄本未知區(qū)域、從而獲得mRNA(cDNA)完整序列的方法。10. mtDNA:線粒體DNA,是獨(dú)立于基因組之外的DNA,環(huán)狀、并位于線粒體之中。ctDNA:葉綠體DNA也是獨(dú)立于基因組之外的 (通常是環(huán)形的) 存在于植物葉綠體之中。13、 人類線粒體基因組與釀酒酵母的線粒體基因組間的異同。 人類線粒體 DNA 有 22 條 tRNA 基因、 條 rRNA 基因和 13 條蛋白質(zhì)編碼基因。 條中的 1

30、4 2 15 條蛋白質(zhì)編碼基因或者 rRNA 編碼基因轉(zhuǎn)錄的方向相同。 條 tRNA 基因是順時(shí)針?lè)较虮磉_(dá)的, 14 8 條是逆時(shí)針?lè)较颉?釀酒酵母的線粒體基因組包含蛋白質(zhì)編碼基因、rRNA 基因和 tRNA 基因(既有連續(xù)的也有斷 裂的) ,轉(zhuǎn)錄方向?yàn)槟鏁r(shí)針。14、動(dòng)物可以從植物中得到營(yíng)養(yǎng)的原因在CO2 /O2 較高時(shí)主要催化羧化反應(yīng),在比率較低時(shí)主要進(jìn)行加氧反應(yīng)。Rubisco中文名是核酮糖二磷酸縮化酶,大量存在于植物細(xì)胞的葉綠體中。除了光合作用以外,植物在自然界中的另一大作用就是碳的固定化。意思就是從二氧化碳的形態(tài)轉(zhuǎn)變成有機(jī)物,比如說(shuō)葡萄糖等的形態(tài)。動(dòng)物不能直接利用大氣中的二氧化碳。在植

31、物中,由于Rubisco這種酶的存在,經(jīng)過(guò)一系列反應(yīng),可以把CO2 轉(zhuǎn)變?yōu)榱姿岣视退岬男问剑缓笤诒黄渌缸兂烧崽堑扔袡C(jī)物,供植物使用。同時(shí),也因此,動(dòng)物可以通過(guò)食用植物而得到有機(jī)物。Rubisco具體作用的過(guò)程大概就是,他把空氣中的CO2連接到植物內(nèi)含有的一個(gè)含有五個(gè)碳的糖上,變成一個(gè)六碳糖,然后再平分成兩個(gè)三個(gè)碳的磷酸甘油酸。然后,有的磷酸甘油酸重新合成五碳糖,以供碳固定循環(huán)繼續(xù)進(jìn)行,而有的磷酸甘油酸就用于合成蔗糖等有機(jī)物。第七章1、gene family: 即基因家族,真核生物的基因組中有許多來(lái)源相同、結(jié)構(gòu)相似、功能相關(guān)的基因,這樣的一組基因稱為基因家族,它的成員可以成簇(cluster

32、 )排列在一起或散布在不同染色體上(或兼而有之)?;蚪M分析顯示很多基因?qū)儆诨蚣易濉;虼兀╣ene cluster )為我們對(duì)基因組中大區(qū)域而不是單條基因的進(jìn)化動(dòng)力的研究提供了機(jī)遇。2、Alu family(人類的中度重復(fù)序列即Alu序列家族) ,Alu族序列成員眾多,大約有300,000個(gè),(平均每6kb DNA就有一個(gè))。每個(gè)長(zhǎng)度約300bp,在其第170位置附近都有AGCT這樣的序列,可被限制性內(nèi)切酶Alu所切割(AGCT),故此得名 。無(wú)論從Alu族序列的長(zhǎng)度還是從其重復(fù)頻率上來(lái)看,Alu族序列都更像高度重復(fù)序列;然而它們不同于高度重復(fù)序列的串聯(lián)集中分布 ,而是廣泛散布在非重復(fù)序列

33、之間。3、Satellite DNA:衛(wèi)星DNA,在高度重復(fù)序列中,常有一些A·T段浮力密度較小,因而在將DNA切斷成數(shù)百個(gè)堿基對(duì)的片斷進(jìn)行超離心時(shí),常會(huì)在主要的DNA帶上有一個(gè)次要的DNA帶相伴隨,這就是所謂衛(wèi)星DNA Microsatellite:微衛(wèi)星序列,其中的重復(fù)序列單位長(zhǎng)度小于10 bp(一般是1-6,最多是6個(gè)) 的序列稱為微衛(wèi)星(microsatellite )序列。 Minisatellite:重復(fù)序列單位長(zhǎng)度在10-100bp 之間的序列,稱之為小衛(wèi)星(minisatellite )序列 VNTR:但Microsatellite和Minisatellite的應(yīng)用并

34、不是嚴(yán)格的,兩種序列也稱為數(shù)目可變的串聯(lián)重復(fù)序列 ( variable number tandem repeat , VNTR )或短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat , STR )4、globin:珠蛋白,是具有攜帶氧能力的蛋白質(zhì)。在脊椎動(dòng)物體內(nèi)有兩種類型:即存在于血液中的血紅蛋白和肌肉中的肌紅蛋白。目前在神經(jīng)系統(tǒng)又發(fā)現(xiàn)了第三種珠蛋白,主要存在于大腦中,因此被稱之為“神經(jīng)珠蛋白”。胞紅蛋白(CGB)是新發(fā)現(xiàn)的第四種攜氧珠蛋白,廣泛分布于多種組織和器官.在不同種類細(xì)胞中其亞細(xì)胞定位并不相同,在結(jié)締組織中主要定位于細(xì)胞質(zhì),而在神經(jīng)組織胞核和胞質(zhì)中均有分布. 5、To illu

35、strate the developmental control via example. (via globin)發(fā)育控制:即隨著連續(xù)的不同基因的開(kāi)關(guān),在不同時(shí)期,不同的基因產(chǎn)物會(huì)執(zhí)行相同的功能。在成體細(xì)胞中,珠蛋白四聚體由兩條相同的 a 鏈和b 鏈構(gòu)成,而胚胎血細(xì)胞包含的珠蛋白四聚體與成體中的形式不同,其每個(gè)四聚體包含兩條相同的類a 和類b 珠蛋白鏈,每一條都與成體中的肽鏈相關(guān),并在稍后被其取代。在個(gè)體發(fā)育的不同階段,血紅蛋白的亞基組成是不同的 ,這些不同的亞基都是由各自的基因編碼的。成人的血紅蛋白中,大約有97%都是22 ,此外還有2%的22以及胎兒階段遺留下來(lái)大約1%的22 ;在胎兒階

36、段 的組成為22 ;在8周前的胎兒階段,血紅蛋白的組成為22、 2 2 、 2 2)。在成體細(xì)胞中,珠蛋白四聚體由兩條相同的 a 鏈和b 鏈構(gòu)成,而胚胎血細(xì)胞包含的珠蛋白四聚體與成體中的形式不同,其每個(gè)四聚體包含兩條相同的類a 和類b 珠蛋白鏈,每一條都與成體中的肽鏈相關(guān),并在稍后被其取代。這就是一個(gè)發(fā)育控制的例子,即隨著連續(xù)的不同基因的開(kāi)關(guān),在不同時(shí)期,不同的基因產(chǎn)物會(huì)執(zhí)行相同的功能。胚胎和成體血紅蛋白的具體關(guān)系因不同的有機(jī)體而不同。人類中這條基因的發(fā)展經(jīng)歷了三個(gè)階段:胚胎、胎兒和成人。胚胎和成體基因的差別在哺乳動(dòng)物類是相同的,但成體前的基因數(shù)目是有變化的。在人類中,兩個(gè)類鏈為 x 和a ,

37、而e、g 、d 、b為類b鏈,這些鏈?zhǔn)窃诓煌陌l(fā)育階段表達(dá)的。6、Unequal crossing-over can result in what results? 基因簇中發(fā)生不等交換可造成量和質(zhì)兩種結(jié)果,(1) 不等交換可以改變基因數(shù)目:如果一條染色體上的基因1與另一條染色體上的基因2 配對(duì),則其他基因拷貝就無(wú)法配對(duì)。錯(cuò)配基因間的重組就產(chǎn)生了一條有單一(重組)基因拷貝的染色體和一條有三份基因拷貝(包括兩條來(lái)自親本的和一條來(lái)自重組的)的染色體(2) 不等交換還會(huì)有質(zhì)的改變:如果交換發(fā)生在基因內(nèi)部而不是基因間,其結(jié)果將決定于發(fā)生交換的基因序列完全相同還是只是相近。如果非等位基因的拷貝1和拷貝2

38、序列相同,怎形成兩條基因序列沒(méi)有改變。但是相鄰基因序列比較相近時(shí),也可以發(fā)生不等交換(只不過(guò)頻率比兩條基因序列完全相同時(shí)低),這時(shí)形成的兩條重組基因與任一條親本基因都不相同。7、Buoyant density: 雙鏈體 DNA 的浮力密度 浮力密度由其 G-C 含量決定,其經(jīng)驗(yàn)公 浮力密度 式為:= 1.660 + 0.00098 ( % G-C) g-cm -3 浮力密度通常用 DNA 氯化艷(Cscl )密度梯度離心法測(cè)定,離心中 DNA 可以在與其密度相對(duì)應(yīng)的位置上形成條帶。當(dāng)序列之間 G-C 含量差異 超過(guò) 5 時(shí),就能夠用密度梯度離心分離出來(lái)。8、cryptic satellite

39、DNA: A cryptic satellite is a satellite DNA sequence not identified as such by a separate peak on a density gradient; that is, it remains present in main-band DNA (隱蔽衛(wèi)星 DNA).9、State DNA fingerprinting and its applications.9、DNA fingerprinting :DNA指紋分析技術(shù),即使用限制性內(nèi)切酶切割每個(gè)個(gè)體的、含有短重復(fù)序列的區(qū)域后所產(chǎn)生的片段, 通過(guò)分析這些片段的異

40、同而得到個(gè)體間的遺傳關(guān)系。因?yàn)檫@些片段對(duì)于每個(gè)個(gè)體都是唯一的,任何兩個(gè)個(gè)體之間所存在的這樣的特殊片段可以用來(lái)定義他們之間的遺傳關(guān)系(如父親-孩子之間的遺傳關(guān)系)。第八章2. The “adapter” is transfer RNA (tRNA),why.mRNA 中的每個(gè)核苷酸三聯(lián)體代表一個(gè)氨基酸。由于核苷酸三聯(lián)體與氨基酸的結(jié)構(gòu)不同,“適配器”使每個(gè)三聯(lián)體密碼子是與特定的氨基酸相對(duì)應(yīng)的。其中的 “適配器” 是tRNA , 它有兩個(gè)關(guān)鍵性質(zhì):1. 它代表唯一的氨基酸,并與其共價(jià)相連2. 它包含了一個(gè)三核苷酸序列,即反密碼子( anticodon ) ,它與代表氨基酸的密碼子是互補(bǔ)的。反密碼子使

41、tRNA 能夠通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則識(shí)別密碼子。3. 比較三種RNA的結(jié)構(gòu)及功能?;虮磉_(dá)普遍需要的三類 RNA 是 mRNA (攜帶編碼序列) 、tRNA (提供 與密碼子相應(yīng)的氨基酸)和 rRNA (為蛋白質(zhì)合成提供環(huán)境的核糖體的重要組 成單元) tRNA 由 74 - 95 個(gè)堿基組成,形成帶有 4 個(gè)恒定臂的三葉草二級(jí)結(jié)構(gòu)(在更 長(zhǎng)的 tRNA 中另有一個(gè)側(cè)臂) 信使 RNA一種中間體,它提供了代表蛋白質(zhì)的 DNA 序列 轉(zhuǎn)運(yùn) RNA 是用來(lái)運(yùn)送氨基酸到對(duì)應(yīng)的 mRNA 密碼子上,是小分子 RNA RNA 是核糖體的組成元件。 核糖體是一個(gè)包括很多蛋白質(zhì)和 RNA 組件的核 糖核蛋白,它

42、提供了一個(gè)把特定氨基酸聚合成肽鏈的裝置。種類結(jié)構(gòu)功能mRNA由氨基酸編碼區(qū)和非編碼區(qū)組成,真核生物mRNA 含有5 末端帽子結(jié)構(gòu)和3末端的多聚A尾結(jié)構(gòu)。原核生物mRNA起始密碼子上游存在SD序列合成蛋白質(zhì)的模板tRNA由74 - 95個(gè)堿基組成,形成帶有4 個(gè)恒定臂的三葉草二級(jí)結(jié)構(gòu)(在更長(zhǎng)的tRNA 中另有一個(gè)側(cè)臂)轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸rRNA主要的rRNA具有廣泛的二級(jí)結(jié)構(gòu)并且和蛋白質(zhì)結(jié)合形成核糖體,長(zhǎng)度介于1500-1900(小rRNA)或者2900-4700(大rRNA)個(gè)堿基之間核糖體的組成部分4、 How to produce the cap and the poly(A) for eukar

43、yotic mRNA. 原核生物加帽和加尾。 課本 135137 頁(yè)。 加 poly( A) 的反應(yīng)由 poly( A) 聚合酶poly( A) polymerase所催化,它在 mRNA 的游離 3 羥基上加上 200 個(gè)腺苷酸。 細(xì)胞核 RNA 和 mRNA 的 poly(A) 序列都與 poly(A)結(jié)合蛋白poly( A) binding protein,PABP相結(jié)合,許多真核生 物內(nèi)部有相關(guān)類型的蛋白質(zhì)。 5、cistron: 單順?lè)醋拥?mRNA 只編碼一種蛋白質(zhì) (單順?lè)醋蛹磫位?。單 順 反 子 (monocistron) :真核基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為單順?lè)醋?,即一個(gè)基因編碼一條多

44、肽 鏈或 RNA 鏈,每個(gè)基因轉(zhuǎn)錄有各自的調(diào)節(jié)元件。 多順?lè)醋拥?mRNA 可編碼一種以上的蛋白質(zhì) (多順?lè)醋蛹炊嗷? 編碼單條多肽鏈的一個(gè)遺傳功能單位,即轉(zhuǎn)錄單位。順?lè)醋樱╟istron) :即結(jié) 構(gòu)基因,為決定一條多肽鏈合成的功能單位,約 1000bp。 6、RNAfMet :在細(xì)菌和真核生物細(xì)胞器中,tRNA 起始子(initiator )攜帶一個(gè)氨基基團(tuán) 被甲?;募琢虬彼?,稱為氨甲酰甲硫氨酰?tRNA 5、Whats its function of poly (A) and how to use it in experiments? mRNA 3 ' 延伸的多聚腺苷酸經(jīng)常被

45、描述為poly (A)尾部,有這種特征的mRNA稱為poly (A)+).poly (A)序列并非由DNA編碼,在細(xì)胞核內(nèi)它是在轉(zhuǎn)錄之后被加到RNA上的。Poly(A)被特異的蛋白質(zhì)PABP結(jié)合,有助于穩(wěn)定mRNA,防止降解;作為核糖體的識(shí)別信號(hào),使mRNA分子有效翻譯。在試驗(yàn)中的應(yīng)用:具有poly(A)的mRNA在oligo(dT)引物和反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,可合成出雙鏈cDNA。隨后將它與質(zhì)粒載體構(gòu)成重組分子,并轉(zhuǎn)化給大腸桿菌寄主細(xì)胞進(jìn)行擴(kuò)增。應(yīng)用這種方法能夠分離和擴(kuò)增我們所期望研究的基因或DNA片段。 8. 5-FU抗癌機(jī)理胸苷酸合成酶抑制藥,是尿嘧啶5位上的氫被氟取代的衍生物。 5-FU在

46、細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)變?yōu)?-氟尿嘧啶脫氧核苷酸(5F-dUMP),而抑制脫氧胸苷酸合成酶,阻止脫氧尿苷酸(dUMP)甲基化轉(zhuǎn)變?yōu)槊撗跣剀账幔╠TMP),從而影響DNA的合成。此外,5-FU 在體內(nèi)可轉(zhuǎn)化為5-氟尿嘧啶核苷,以偽代謝產(chǎn)物形式摻入RNA中干擾蛋白質(zhì)的合成,故對(duì)其他各期細(xì)胞也有作用。第九章1. PABP: poly(A)結(jié)合蛋白,能夠結(jié)合細(xì)胞核RNA和mRNA的poly(A)序列,許多真核生物內(nèi)部有相關(guān)類型的蛋白質(zhì)。 2.How to start protein synthesize?蛋白質(zhì)合成起始:核糖體有三個(gè)tRNA結(jié)合位點(diǎn)氨酰-tRNA進(jìn)入A位點(diǎn)肽酰-tRNA進(jìn)入P位點(diǎn)去氨酰tRNA通過(guò)E

47、位脫出將肽鏈從P位的肽酰-tRNA上轉(zhuǎn)移到A位的氨酰-tRNA上,這樣,一個(gè)氨基酸就被加到了肽鏈上本題感覺(jué)答案不靠譜建議看課件5.How to demonstrate that inhibiting one step in protein synthesis blocks the next step for kirromycin?黃色霉素(kirromycin )是抑制EF-Tu 作用的抗生素,當(dāng)EF-Tu 被黃色霉素結(jié)合后,它仍可使氨酰-tRNA 結(jié)合到A 位。但EF-Tu * GDP 復(fù)合體不能從核糖體中釋放。該復(fù)合體的持續(xù)存在會(huì)阻止肽酰-tRNA 與氨酸- tRNA 間形成肽鍵。結(jié)果,核

48、糖體停滯在mRNA 上,使蛋白質(zhì)合成終止。黃色霉素的這種效果說(shuō)明抑制蛋白質(zhì)合成的其中一步就會(huì)阻礙后續(xù)步驟。原因是EF-Tu 的持續(xù)存在阻止了氨酰-tRNA 的氨酰末端進(jìn)入50S 亞基的A位。所以,EF-Tu * GDP 的釋放是形成肽鍵所必需的。在蛋白質(zhì)合成的其他階段可以看到同樣的規(guī)律:前一步反應(yīng)必須完成后才能發(fā)生后續(xù)反應(yīng)。6. How to reveal the nature of the transfer reaction via the antibiotic puromycin?該轉(zhuǎn)移反應(yīng)的本質(zhì)是通過(guò)抗生素嘌呤霉素(puromycin )抑制蛋白質(zhì)合成而揭示出來(lái)的。嘌呤霉素的結(jié)構(gòu)類似于腺

49、苷酸末端上結(jié)合了氨基酸的tRNA (氨酰-tRNA )。嘌呤霉素中以N 而不是以O(shè) 將氨基酸與tRNA 結(jié)合。該抗生素可以同氨酰-tRNA 一樣進(jìn)入核糖體,然后肽酰-tRNA 的肽鏈將被轉(zhuǎn)移到嘌呤霉素的氨基基團(tuán)上。因?yàn)猷堰拭顾夭荒芘c核糖體A 位結(jié)合,所以多肽酰嘌呤霉素合成物以多肽酰嘌呤霉素的形式從核糖體上放出。這種蛋白質(zhì)合成在成熟之前的終止正是該抗生素有致死作用的原因。嘌呤霉素有類似于氨酰-tRNA 的結(jié)構(gòu),它將一個(gè)芳香族氨基酸殘基與一個(gè)糖堿基相連。8、RRF ribosome recycling factor 核糖體再循環(huán)因子 它作用于50s大亞基,即能使大小亞基解離,而IF3依舊留下來(lái)以防

50、止兩者的再度結(jié)合。 RF release factor 釋放因子9、 How to form 48s complex?一些起始因子與核糖體小亞基結(jié)合形成43S 復(fù)合體(43S復(fù)合體=40S亞基+因子+tRNA),當(dāng)43S 復(fù)合體與mRNA 結(jié)合,它搜尋起始密碼子,并可以48S 復(fù)合體的形式被分離到。48s復(fù)合體在起始密碼處形成。L 10 趙云 整理1. The stability of peptidyl-tRNA is higher than of aminoacyl-tRNA,why? 16S rRNA 不同位點(diǎn)上的各種堿基被P 位上的tRNA 所保護(hù)。在三維結(jié)構(gòu)上,可能這些堿基是相鄰的。實(shí)

51、際上,16S rRNA 與P 位上的tRNA 比A 位上的tRNA 有更多的接觸,這可能是肽酰-tRNA 比氨酰-tRNA 具有更高穩(wěn)定性的原因。 3.wobble hypothesis:搖擺假說(shuō)解釋了一種能力¾tRNA可以識(shí)別一種以上密碼子的能力,即可同密碼子的第三位以非G·C,非A·T的形式配對(duì)。4. How to process the 3¢ end and the the 5¢ end of a tRNA?tRNA 3¢ 端通過(guò)切割、修整,再加上CCA而成,過(guò)程為:核酸內(nèi)切酶首先引發(fā)前體下游的裂解反應(yīng),幾個(gè)核酸外切酶隨之沿3&

52、#162; 到5¢ 方向降解前體,修剪3¢ 端。在真核生物中,這個(gè)反應(yīng)也是由多個(gè)酶來(lái)完成的。這個(gè)過(guò)程形成了3¢ 端的tRNA ,然后再加上CCA。tRNA 的5¢ 端由核糖核酸酶P ( ribonuclease P )裂解催化而成。 5. U、D、A、I: U:尿嘧啶,RNA中的主要組成堿基之一,經(jīng)過(guò)修飾可變?yōu)槎喾N修飾堿基。 D:二氫尿嘧啶,是由尿嘧啶雙鍵飽和所產(chǎn)生,環(huán)的結(jié)構(gòu)發(fā)生了變化。I:次黃嘌呤核苷酸(inosine , l )常存在于有嘌呤生物合成途徑的細(xì)胞中。然而,它并不是直接摻入RNA ,相反它是依靠RNA 中對(duì)A 的修飾而成的。對(duì)A 的修飾還

53、包括許多復(fù)雜基團(tuán)的加人。次黃嘌呤核苷可以和尿嘧啶、胞嘧啶、腺嘌呤中的任何一種配對(duì)。 6. Inosine can pair with any of U, C, and A,why?當(dāng)反密碼子的堿基被修飾后,可能會(huì)產(chǎn)生除涉及到A 、C 、U 和G 的常規(guī)和擺動(dòng)以外的配對(duì)方式。次黃嘌呤核苷(I)通常出現(xiàn)在反密碼子的第一位。在這一位置上它能同U 、C 和A 中的任何一種堿基配對(duì)。7. suppressor:抑制子是第二次突變,這種突變抵消或改變了第一次(最初)突變的效應(yīng)。10.To illustrate missense suppressors completed with wild-type.錯(cuò)義

54、抑制發(fā)生在tRNA反義密碼子突變后,他識(shí)別錯(cuò)誤的密碼子,因?yàn)橐吧蛅RNA和抑制子tRNA都可以識(shí)別AGA,所以抑制僅僅是部分的抑制。第十一章1. Chaperones:是這樣的一組蛋白質(zhì)即可以同沒(méi)有完全折疊或沒(méi)有完全組裝的蛋白質(zhì)相結(jié)合,以幫助這些蛋白質(zhì)的折疊或阻止它們的聚集。2. Self-assembly:是描述某種蛋白質(zhì)(或某種蛋白質(zhì)復(fù)合物)的一種能力即可以形成這種蛋白質(zhì)的最終結(jié)構(gòu)又沒(méi)有任何額外組份(如分子伴侶)的幫助。這一述語(yǔ)也可指當(dāng)分子接觸并相互結(jié)合時(shí)任何生物結(jié)構(gòu)的自發(fā)形成。4. Why they are named “hsp”?答:這些蛋白質(zhì)之所以稱為熱激蛋白(heat shock

55、 protein , hsp ) ,是因?yàn)樵跍囟壬邥r(shí),它們會(huì)大量產(chǎn)生,以盡量減少熱變性對(duì)蛋白質(zhì)的損害。6. Protein translocation:蛋白質(zhì)易位描述蛋白質(zhì)的跨膜運(yùn)動(dòng),跨膜在真核生物中即指跨過(guò)細(xì)胞器的膜,原核中則指質(zhì)膜。蛋白質(zhì)易位所通過(guò)的膜有一個(gè)具特殊用途的通道。7. SRP:信號(hào)識(shí)別顆粒是核糖核蛋白復(fù)合物,這種復(fù)合物在蛋白質(zhì)易位時(shí)識(shí)別信號(hào)序列并指導(dǎo)核糖體進(jìn)入易位通道。不同生物的SRPs具有不同的組成成份,但所有的SRPs都含有相關(guān)的蛋白質(zhì)和RNAs。8. translocon: 跨膜通道稱為易位子 9. TRAM:能與易位的新生鏈相交聯(lián)的一種主要蛋白質(zhì),可激發(fā)所有蛋白質(zhì)的易

56、位。 10. Sec61s function:Sec61 蛋白能形成通道,同時(shí)也能和核糖體相互作用。Sec61復(fù)合體是易位子的主要成份。11. TOM、TIM、TOC、TIC、SecYEG、Sec61、Pores、NPC、proteasome、 TOM, TIM, TOC, TIC在轉(zhuǎn)運(yùn)穿過(guò)線粒體和葉綠體的每層膜時(shí)都會(huì)使用不同的受體,根據(jù)外膜和內(nèi)膜的不同,在葉綠體中它們分別稱為TOC 和TIC ;在線粒體中它們分別稱為TOM和TIM。SecYEG: Sec61復(fù)合體是易位子的主要成份(包括三種跨膜蛋白即a、b、g)。Pores:核孔是物質(zhì)出入細(xì)胞核的門戶。NPC: nuclear pore c

57、omlex核被膜上溝通核質(zhì)和細(xì)胞質(zhì)的復(fù)雜隧道結(jié)構(gòu),由多種核孔蛋白構(gòu)成。隧道的內(nèi)、外口和中央有由核糖核蛋白組成的顆粒。對(duì)進(jìn)出核的物質(zhì)有控制作用。Proteasome 蛋白酶體是一種大的復(fù)合體,可降解細(xì)胞質(zhì)內(nèi)的蛋白質(zhì),包括一般降解(將蛋白質(zhì)完全轉(zhuǎn)化為小片段)和特殊的加工事件。完全降解的主要底物是錯(cuò)誤折疊的蛋白質(zhì),這是一個(gè)最基本的質(zhì)量控制系統(tǒng);而少部分蛋白質(zhì)的降解是一個(gè)調(diào)控事件,比如,調(diào)節(jié)細(xì)胞周期的進(jìn)行。12. Sec systems function: Sec系統(tǒng)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白質(zhì)進(jìn)入和通過(guò)內(nèi)膜 14. El、E2、E3:泛素循環(huán)涉及三種活動(dòng):El 連接泛素,;E3 結(jié)合底物蛋白質(zhì);E2負(fù)責(zé)將泛素從El

58、轉(zhuǎn)移到底物。進(jìn)一步的循環(huán)將產(chǎn)生多聚泛素。泛素活化酶(ubiquitin-activating enzyme ) El ,利用ATP 將其自身通過(guò)高能硫酯鍵在Cys 殘基與泛素C 端的Gly 相連。泛素被傳遞到泛素聯(lián)合酶(ubiquitin conjugating enzyme ) E2上,泛素連接酶(ubiquitin ligase ) E3 將泛素傳遞到底物上,與底物蛋白質(zhì)Lys 殘基的上e-氨基形成異肽鍵。15.Ubiquitin:泛素:是一種存在于大多數(shù)真核細(xì)胞中的小蛋白,是一個(gè)由76個(gè)氨基酸組成的高度保守的多肽鏈,分子量大約8500道爾頓,它存在于所有真核細(xì)胞和人體內(nèi)的細(xì)胞中,因其廣泛分布于各類細(xì)胞而得名。它在真核生物中具有高度保留性,人類和酵母的泛素有96%的

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