虛擬實驗實驗報告

1、篇一：虛擬實驗報告 第一章文獻綜述1.1丙酮酸脫氫酶概述在原核生物中，丙酮酸脫氫酶復(fù)合體存在于細胞質(zhì)中。在哺乳動物細胞中，丙酮酸脫氫酶復(fù) 合體主要定位在線粒體上，整個復(fù)合體的各個組成酶都是由核基因編碼的，在核糖體上表達， 轉(zhuǎn)運到線粒體中。高等植物細胞有兩種不同的丙酮酸脫氫酶復(fù)合體形式，一種是線粒體丙酮 酸脫氫酶復(fù)合體，另一種是定位在質(zhì)體基質(zhì)中的質(zhì)體丙酮酸脫氫酶復(fù)合體。目前認為，線粒 體丙酮酸脫氫酶復(fù)合體催化反應(yīng)生成的乙酰輔酶a進入三羧酸循環(huán)徹底氧化產(chǎn)生能量，而質(zhì) 體丙酮酸脫氫酶復(fù)合體催化反應(yīng)生成的乙酰輔酶a則進入脂肪酸合成途徑(bhavnani and wallace, 1990)。1.2丙酮

2、酸脫氫酶結(jié)構(gòu)研究原核細胞如大腸桿菌的丙酮酸脫氫酶復(fù)合體由丙酮酸脫氫酶(e1，ec 1.2.4.1)、二氫硫辛酸 乙酰轉(zhuǎn)移酶(e2，ec 2.3.1.12)、二氫硫辛酸脫氫酶(e3，ec 1.8.1.4)組成，這三個組成酶都 結(jié)合了不同的輔助因子，其中e1結(jié)合了輔助因子焦磷酸硫胺素(thiamin diphosphate，tpp) 和mg2+； e2的賴氨酸殘基上共價結(jié)合了硫辛酸(lipoic acid) ； e3緊密結(jié)合了 fad分子。整 個復(fù)合體由24個e2單體構(gòu)成核心框架結(jié)構(gòu)，24個e1單體和6個e3單體結(jié)合在e2核心框 架上(bosma et al., 1982)。真核生物的丙酮酸脫氫酶

3、復(fù)合體除了含有上述的e1、e2、e3外，還有調(diào)節(jié)它活性的丙酮酸脫 氫酶激酶(pyruvate dehydrogenase kinase)、丙酮酸脫氫酶磷酸酶(pyruvate dehydrogenase phosphatase)以及e3結(jié)合蛋白(e3 binding protein)。整個復(fù)合體核心框架結(jié)構(gòu)由60個 e2單體以及12個e3結(jié)合蛋白單體組成，在其周圍結(jié)合有20-30個e1異型四聚體(22)、6 一12個e3同型二聚體、1-2個丙酮酸脫氫酶激酶同型/異型22四聚體的形式存在，和亞單位的分子量分二聚體以及2-3個丙酮酸脫氫酶磷酸酶異型二 聚體(kresze and ronft, 19

4、81)。人丙酮酸脫氫酶復(fù)合體e1是以位點位于和別是41和36 kda。 根據(jù)人e1的x-射線晶體結(jié)構(gòu)，輔助因子焦磷酸硫胺素和mg2+的結(jié)合二個亞基之間的界面處 的深溝內(nèi)。和真核生物不同，大腸桿菌e1是同一單體形成的非對稱二聚體，e1單體由886個氨基酸殘 基組成。焦磷酸硫胺素和mg2+結(jié)合在二個亞基之間的界面處，e1的n-末端結(jié)構(gòu)域(1一55 氨基酸殘基)三維結(jié)構(gòu)無法在x-射線晶體衍射中得到，將e1的n-末端16-25、26 35、 36-45氨基酸殘基分別去除的突變體沒有活性，而去除46-55氨基酸殘基的突變體仍保持 活性；同時，對e1的7-15氨基酸殘基進行的點突變研究也證明e1的n-末端

5、結(jié)構(gòu)域?qū)τ谡?個大腸桿菌丙酮酸脫氫酶復(fù)合體的活性以及e1和e2之間的結(jié)合非常重要。隨后的核磁共振 研究發(fā)現(xiàn)n-末端結(jié)構(gòu)域和e2的亞基結(jié)合結(jié)構(gòu)域而不是硫辛酸結(jié)構(gòu)域結(jié)合。利用三維結(jié)構(gòu)預(yù) 測軟件對這55個氨基酸序列進行預(yù)測，結(jié)果顯示它可能含有2個-螺旋，與e2的亞基結(jié)合結(jié) 構(gòu)域的-螺旋相互結(jié)合(arjunan et al., 2002)。由于人e1的8亞基有輔助因子焦磷酸硫胺素和mg2+的結(jié)合位點，人e1的8亞基的結(jié)構(gòu)就是 我感興趣的。第二章序列的獲得和載體構(gòu)建在設(shè)計之前，要先明確所要使用的表達載體，我想表達的是人丙酮酸脫氫酶的e1的8亞基， 然后通過一系列純化后，進行核磁共振解析其蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)(

6、lessard and perham, 1994)。 我考慮使用pet32a表達載體，進行原核表達，因為該載體上有histag標(biāo)簽，可以用ni離子 親和層析柱純化，該載體還含有amp抗性基因，另外，其nco i之前存在腸激酶切點ek，在 ni柱純化完成后可以進行酶切，將雜蛋白切掉，只保留目的蛋白，然后用分子篩層析進行最 后的分離，純化效果應(yīng)該不錯。選擇酶切位點nco i和xho i,設(shè)計引物時目的蛋白質(zhì)序列在nco i開始插入，在xho i后添 加終止密碼子taa,目的蛋白質(zhì)會從trxtag中的atg開始表達，直到taa結(jié)束。2.1序列獲得和引物設(shè)計（pp5設(shè)計引物）首先，從ncbi上下載了人

7、丙酮酸脫氫酶的el的 P亞基序列，再以fasta格式下載下來pp5中打開文件由于這是人丙酮酸脫氫酶el組成酶的8亞基，因此在實際的基因組中，兩端仍然有序列，為 了擴增出整段基因，在這段基因的兩端加了連續(xù)的a （其他堿基也可以），便于后續(xù)對引物編 輯，如添加酶切位點，加a或t減小gc含量，添加保護堿基等。添加的6個a添加的6個a檢測片段內(nèi)的酶切位點，在enzyme中選擇所需查找的nco i和xho i切點，然后檢測。結(jié)果表明片段內(nèi)沒有所要添加的酶切位點，因此可以在引物上添加。點擊primer圖標(biāo)設(shè)計引物選擇上游引物s，這是還未做任何編輯修改，可能會出現(xiàn)dimer （二聚體）、false prim

8、ing （錯配）或者cross dimer （上下游引物之間二聚體）等情況，另外gc含量可能不太合適。不過，通過edit primers功能可以修改引物，來盡量避免這些情況。這是edit primers界面。篇二：虛擬現(xiàn)實實驗報告實驗一造型定位和旋轉(zhuǎn)、縮放一、實驗內(nèi)容：熟悉vrmlpad編輯器的安裝和使用熟悉cortonaplayer瀏覽器的安裝和使用掌握虛擬造型的基本操作。二、實驗環(huán)境：硬件環(huán)境計算機一臺軟件環(huán)境windowsxp操作系統(tǒng)、vrmlpad編輯器和cortonaplayer瀏覽器三、實驗步驟：完成第四章例4-1代碼：shape appearanceappearance mate

9、rialmaterial diffusecolor 0.9 0.1 0.05geometrysphere radius 0.85shape appearanceappearance materialmaterial diffusecolor 0.8 0.9 0.1geometry cylinder radius 0.3height 2.0bottom false截圖：實驗二三維立體造型的設(shè)計與實現(xiàn)（需交實驗報告）一、實驗內(nèi)容熟悉各種立體造型的設(shè)計學(xué)會利用各種不同的立體造型組合實現(xiàn)復(fù)雜的造型二、實驗環(huán)境硬件環(huán)境計算機一臺軟件環(huán)境windowsxp操作系統(tǒng)、vrmlpad編輯器和cortonapl

10、ayer瀏覽器三、實驗步驟：制作一個煙囪的立體造型，首先以原點為中心生成一個半徑為1、高度為2的圓柱體，然后以（0，0，1.5）為坐標(biāo)變換節(jié)點的新原點生成一個底面半徑為 2，高度為1的圓錐體。建立一個帶刻度的鐘表造型：首先生成鐘表面box造型，然后在鐘表面上利用球體sphere造型生成各個刻度，利用圓柱體cylinder造型生成時針、分針 等造型。其中利用transform坐標(biāo)變換節(jié)點對各個造型進行平移、縮放以及旋轉(zhuǎn)操作。3.設(shè) 計一個文本造型。4、完成書中第四章的例4-2、4-3和4-4。 1）4-2代碼：transform translation -2 0 0rotation 0 0 1

11、0.5children def leg shape appearance appearance materialmaterial diffusecolor 0.3 0.3 0.3ambientintensity 0.3 specularcolor 0.7 0.7 0.7 shininess 0.1geometry box size 2 0.2 4 transform translation 2 0 0 rotation 0 0 1 -0.5 children use leg transform translation 0 0.52 0 scale 1.5 1 1 children shape

12、appearanceappearance materialmaterial diffusecolor 0.5 0.3 0.2 transparency 0.15 geometrycylinder radius 3 height 0.1 截圖：2)4-3代碼： shape appearanceappearance material material diffusecolor 1.0 0 0 geometry text string happy new year! fontstylefontstyle style bolditalic size 0.8 justify middle transfo

13、rm translation -3 -0.5 0 scale 1.2 1.2 1.2 children inline url 1-1.wrl transform translation 3 -0.5 0 scale 1.2 1.2 1.2 children inline url 1-1.wrl截圖：3） 4-4代碼：shape appearanceappearance materialmaterial diffusecolor 1 0 0geometryindexedfaceset coord coordinate 篇三：電路實驗報告虛擬實驗一、實驗?zāi)康?、初步了解虛擬實驗軟件pspice，并

14、學(xué)會pspice的簡單使用。2、通過虛擬實驗來驗證kvl與kcl。二、實驗儀器與應(yīng)用軟件pc機一臺（windows操作系統(tǒng)），pspice電路仿真軟件。三、實驗原理利用虛擬實驗軟件pspice，對下面電路原理圖進行仿真模擬。設(shè)定r1、r2、r3以及r4四個電阻的阻值，然后給兩個電壓源賦予不同的值，用軟件進行模擬仿真實 驗，分別測出各支路的電壓和電流。算出各回路的電壓之和是否為零，和各節(jié)點的電流之和 是否為零來驗證kvl、kcl的成立。四、實驗步驟：1、在e盤上創(chuàng)建自己的文件夾（命名為自己的姓名，學(xué)號，班級）2、打開pspice軟件，從瀏覽器中的元件庫中取出r、vdc、gnd-earth并在畫圖

15、區(qū)上畫出電 路原理圖。并將文件保存在e盤上自己所創(chuàng)建的文件夾里。3、給r1、r2、r3以及r4四個 電阻分別賦值為：1k歐、2k歐、3k歐以及4k歐4、給電壓源us1、us2賦值為12v。分別 測量此時各節(jié)點的電壓和各支路的電流并記錄下來：ua=10.91v ub=8.727vuc=12.00v ud=0v i1=1.091ma i2=1.091ma i3=2.182ma 5、給電壓 源us1、us2賦值為9v，-12v。分別測量此時各節(jié)點的電壓和各支路的電流并記錄下來ua=5.636v ub=-1.091vuc=-12.00v ud=0v i1=3.364ma i2=-3.364ma i3=-272.7ua 6、給電 壓源us1、us2賦值為10v，6v。分別測量此時各節(jié)點的電壓和各支路的電流并記錄下來 ua=8.606v ub=5.818vuc=6.000v ud=0v i1=1.394ma i2=60.61ua