軟件學習總結(jié)

1、CASTAP學習總結(jié)CASTAP計算是要進行的三個任務中的一個，即單個點的 能量計算，幾何優(yōu)化或分子動力學CASTAP計算是要進 行的三個任務中的一個，即單個點的能量計算，幾何優(yōu)化 或分子動力學.CASTAP幾何優(yōu)化任務允許改善結(jié)構(gòu)的幾何，獲得穩(wěn)定結(jié) 構(gòu)或多品型物.CASTAP動力學任務允許模擬結(jié)構(gòu)中原子在計算力的影 響下將如何移動。CASTAP性質(zhì)任務允許在完成能量，幾何優(yōu)化或動力學運 行之后求出電子和結(jié)構(gòu)性質(zhì)。不是很明白的地方：自洽計算與非自洽計算的定義域意義 所在【好好看看CASTAP計算是要進行的三個任務中的 一個，即單個點的能量計算，幾何優(yōu)化或分子動力學 CASTAP計算是要進行的三

2、個任務中的一個，即單個點的 能量計算，幾何優(yōu)化或分子動力學.CASTAP幾何優(yōu)化任務允許改善結(jié)構(gòu)的幾何，獲得穩(wěn)定結(jié) 構(gòu)或多品型物.CASTAP動力學任務允許模擬結(jié)構(gòu)中原子在計算力的影 響下將如何移動。CASTAP性質(zhì)任務允許在完成能量，幾何優(yōu)化或動力學運 行之后求出電子和結(jié)構(gòu)性質(zhì)。不是很明白的地方：自洽計算與非自洽計算的定義域意義所在【好好看看DFT方面量于計算的知識】如果存在的話，CASTEP使用的則是格子的全部對稱。既 包含有兩個原子的原胞和包含有8個原子的單胞是相對 應的。不論單胞如何定義，電荷密度，鍵長，每一類原子 的總體能量都是一樣的，并且由于使用了較少的原子，使 計算時間得以減少。

3、（這句話沒有理解，是什么意思？）有的不僅要優(yōu)化幾何結(jié)構(gòu)有時還要優(yōu)化品格，在more的 選項中有這個優(yōu)化。AlAs Trajectory.xtd軌線文件，包含每一個優(yōu)化步驟后的結(jié)構(gòu)。（為什么沒有這個文件）用castap可以進行計算態(tài)密度和能帶結(jié)構(gòu)，而且可以分別 表示出來！MS學習總結(jié)LDA適合的體系:（1）密度變換比較緩慢的體系（例如金 屬體系）（2）高密度體系（例如過渡金屬）（3）大多數(shù)結(jié)構(gòu) 優(yōu)化過程LDA不適合的體系:（1）對電子非常少的體系（例如化學 反應中的過渡態(tài)）（2）對于結(jié)合能的絕對值GGA在結(jié)合能（粘附能）方面更具優(yōu)勢CASTEP采用平面波的展開形式來描述電子波函數(shù)。按照原子動能的

4、類型來選擇相關(guān)的平面波。CASTEP使用贗勢來重置真實原子勢能，能夠有效減少平面波的數(shù)量Doml31.請問過渡態(tài)虛頻的物理意義該怎樣理解？答：其實，這個問題是個數(shù)學問題。要搞懂過渡態(tài)虛頻的物理意 義，首先要搞懂到底什么是頻率。其實這一點經(jīng)常有人忽視。中學的時候我們學過簡諧振動，對應的回復力f=-kx,對應 的能量曲線，是一個開口向上的二次函數(shù)E=(k/2)x2.這樣的振 動，對應的x=0的點是能量極小值點(簡單情況下也就是最小值 點)。這時的振動頻率我們也會求3 = (2n )sqrt(k/m)。顯然它是 一個正的頻率，也就是通常意義下的振動頻率。然后，從頻率的概念引出虛頻的概念。一維情況下，

5、如果能量曲線是一個開口向下的二次曲線呢？ 首先，從能量上看，這是個不穩(wěn)定的點，中學的物理書上稱為“不 穩(wěn)平衡”。用現(xiàn)在的觀點看，就是這個點的一階導數(shù)是零(受力為 0)，且是能量極大值。如果套用上面的公式，“回復力”f=-kx (實際上已經(jīng)不是回復，而是讓x越來越遠了)，這里k是個負數(shù)，3 =2n sqrt(k/m)顯然就是一個虛數(shù)了，即所謂的虛頻。 Gaussian里面給出一個負的頻率，就是對應這個虛頻的。實際情況下，分子的能量是一個高維的勢能面，構(gòu)型優(yōu)化的 時候，有時得到了極小值點，這樣這個點的任意方向上，都可以 近似為開口向上的二次函數(shù)，這樣這里對應的振動頻率就都是正 的。對于極大值點，在每個方向都是開口向下的二次函數(shù)，那么 頻率就會都是負的一一當然一般優(yōu)化很少會遇到這樣的情況。對 于頻率有正有負的情況，說明找到的點在某些方向上是極大值， 有些方向上是極小值。如果要得到穩(wěn)定的能量最低構(gòu)型，顯然需 要通過微調(diào)分子的構(gòu)型，消去所有的虛頻。如何微調(diào)？要看虛頻 的振動方向。想象著虛頻對應的就是開口向下的二次函數(shù)，顯然， 把分子坐標按照振動的方向移動一點點，分子應該就可以順著勢 能面找到新的穩(wěn)定點，但是也不能太小。而所謂的過渡態(tài)，則是 連接反應物和產(chǎn)物之間的最低能量路徑上的能量極大值。好比山 谷中的A，B兩點，它們之間的一