核酸序列一般分析課件

生物信息學(xué)第六講核酸序列的一般分析生物信息學(xué)1主要內(nèi)容:基因組DNA簡(jiǎn)介、序列格式轉(zhuǎn)化、DNA序列分析四、序列翻譯、ORF查找五、限制性內(nèi)切酶分析六、引物設(shè)計(jì)七、RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)分析主要內(nèi)容:2基因組DNA簡(jiǎn)介·遺傳信息存貯在4種字符組成的核酸序列中天書”—用遺傳語(yǔ)言書寫的人類遺傳藍(lán)本包含的信息量巨大更重要的是目前人類對(duì)它了解甚少天書中只有4個(gè)字符(堿基A、T、G、C)既沒有段落,也沒有標(biāo)點(diǎn)符號(hào)是一個(gè)長(zhǎng)度為3×109的一維序列?；蚪MDNA簡(jiǎn)介3科學(xué)家對(duì)這本天書了解最多的部分就是遺傳密碼或者說(shuō)掌握了DNA對(duì)蛋白質(zhì)編碼的規(guī)律關(guān)于密碼子(1)密碼子的使用是非隨機(jī)的·如果密碼子的第一、第二位堿基是A、U,那么第三位將盡可能使用G、C;反之亦然。如果三位都用G、C,則配對(duì)容易,分解難;位都用A、U,則相反。一般地說(shuō),高表達(dá)的基因,要求翻譯速度快,要求密碼子和反密碼子配對(duì)快、分開也快?？茖W(xué)家對(duì)這本天書了解最多的部分就是遺傳密碼4(2)密碼子的使用有一定的統(tǒng)計(jì)規(guī)律對(duì)同義密碼子的使用存在著偏愛不同種屬偏愛的密碼子不同人類基因組:密碼子第三位取A、U的情況占90%而第三位取G、C僅占10%密碼子的使用偏性與基因功能、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)相關(guān)(2)密碼子的使用有一定的統(tǒng)計(jì)規(guī)律5核酸序列一般分析課件6核酸序列一般分析課件7核酸序列一般分析課件8核酸序列一般分析課件9核酸序列一般分析課件10核酸序列一般分析課件11核酸序列一般分析課件12核酸序列一般分析課件13核酸序列一般分析課件14核酸序列一般分析課件15核酸序列一般分析課件16核酸序列一般分析課件17核酸序列一般分析課件18核酸序列一般分析課件19核酸序列一般分析課件20核酸序列一般分析課件21核酸序列一般分析課件22核酸序列一般分析課件23核酸序列一般分析課件24核酸序列一般分析課件25核酸序列一般分析課件26核酸序列一般分析課件27核酸序列一般分析課件28核酸序列一般分析課件29核酸序列一般分析課件30核酸序列一般分析課件31核酸序列一般分析課件32核酸序列一般分析課件33核酸序列一般分析課件34核酸序列一般分析課件35核酸序列一般分析課件36核酸序列一般分析課件37核酸序列一般分析課件38核酸序列一般分析課件39核酸序列一般分析課件40核酸序列一般分析課件41核酸序列一般分析課件42核酸序列一般分析課件43核酸序列一般分析課件44核酸序列一般分析課件45核酸序列一般分析課件46核酸序列一般分析課件47核酸序列一般分析課件48核酸序列一般分析課件49核酸序列一般分析課件50核酸序列一般分析課件51核酸序列一般分析課件52核酸序列一般分析課件53核酸序列一般分析課件54核酸序列一般分析課件55核酸序列一般分析課件56核酸序列一般分析課件57核酸序列一般分析課件58核酸序列一般分析課件59核酸序列一般分析課件60生物信息學(xué)第六講核酸序列的一般分析生物信息學(xué)61主要內(nèi)容:基因組DNA簡(jiǎn)介、序列格式轉(zhuǎn)化、DNA序列分析四、序列翻譯、ORF查找五、限制性內(nèi)切酶分析六、引物設(shè)計(jì)七、RNA二級(jí)結(jié)構(gòu)分析主要內(nèi)容:62基因組DNA簡(jiǎn)介·遺傳信息存貯在4種字符組成的核酸序列中天書”—用遺傳語(yǔ)言書寫的人類遺傳藍(lán)本包含的信息量巨大更重要的是目前人類對(duì)它了解甚少天書中只有4個(gè)字符(堿基A、T、G、C)既沒有段落,也沒有標(biāo)點(diǎn)符號(hào)是一個(gè)長(zhǎng)度為3×109的一維序列?；蚪MDNA簡(jiǎn)介63科學(xué)家對(duì)這本天書了解最多的部分就是遺傳密碼或者說(shuō)掌握了DNA對(duì)蛋白質(zhì)編碼的規(guī)律關(guān)于密碼子(1)密碼子的使用是非隨機(jī)的·如果密碼子的第一、第二位堿基是A、U,那么第三位將盡可能使用G、C;反之亦然。如果三位都用G、C,則配對(duì)容易,分解難;位都用A、U,則相反。一般地說(shuō),高表達(dá)的基因,要求翻譯速度快,要求密碼子和反密碼子配對(duì)快、分開也快?？茖W(xué)家對(duì)這本天書了解最多的部分就是遺傳密碼64(2)密碼子的使用有一定的統(tǒng)計(jì)規(guī)律對(duì)同義密碼子的使用存在著偏愛不同種屬偏愛的密碼子不同人類基因組:密碼子第三位取A、U的情況占90%而第三位取G、C僅占10%密碼子的使用偏性與基因功能、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)相關(guān)(2)密碼子的使用有一定的統(tǒng)計(jì)規(guī)律65核酸序列一般分析課件66核酸序列一般分析課件67核酸序列一般分析課件68核酸序列一般分析課件69核酸序列一般分析課件70核酸序列一般分析課件71核酸序列一般分析課件72核酸序列一般分析課件73核酸序列一般分析課件74核酸序列一般分析課件75核酸序列一般分析課件76核酸序列一般分析課件77核酸序列一般分析課件78核酸序列一般分析課件79核酸序列一般分析課件80核酸序列一般分析課件81核酸序列一般分析課件82核酸序列一般分析課件83核酸序列一般分析課件84核酸序列一般分析課件85核酸序列一般分析課件86核酸序列一般分析課件87核酸序列一般分析課件88核酸序列一般分析課件89核酸序列一般分析課件90核酸序列一般分析課件91核酸序列一般分析課件92核酸序列一般分析課件93核酸序列一般分析課件94核酸序列一般分析課件95核酸序列一般分析課件96核酸序列一般分析課件97核酸序列一般分析課件98核酸序列一般分析課件99核酸序列一般分析課件100核酸序列一般分析課件101核酸序列一般分析課件102核酸序列一般分析課件103核酸序列一般分析課件104核酸序列一般分析課件105核酸序列一般分析課件106核酸序列一般分析課件107核酸序列一般分析課件108核酸序列一般分析課件109核酸序列一般分析課件110核酸序列一般分析課件111