生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)課件

生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)浙江中醫(yī)藥大學(xué)信息技術(shù)學(xué)院王海舜1文檔之家-/生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)浙江中醫(yī)藥大學(xué)信息技術(shù)學(xué)院1文檔之家-http課程學(xué)習(xí)目的和要求教學(xué)目的:通過(guò)本課程的學(xué)習(xí)，掌握醫(yī)學(xué)信息學(xué)的基本原理，能用醫(yī)學(xué)信息學(xué)的方法和計(jì)算機(jī)技術(shù)開(kāi)展醫(yī)學(xué)研究。課程內(nèi)容:醫(yī)學(xué)信息學(xué)生物信息學(xué)2文檔之家-/課程學(xué)習(xí)目的和要求教學(xué)目的:通過(guò)本課程的學(xué)習(xí)，掌握醫(yī)學(xué)信息學(xué)醫(yī)學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)信息標(biāo)準(zhǔn)化臨床信息系統(tǒng)醫(yī)學(xué)信息有序化醫(yī)學(xué)信息獲取PACS系統(tǒng)及其實(shí)現(xiàn)醫(yī)學(xué)信息的硬件架構(gòu)和信息安全臨床信息系統(tǒng)臨床路徑無(wú)線網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)決策支持生物信息學(xué)概論生物數(shù)據(jù)庫(kù)序列對(duì)比和數(shù)據(jù)庫(kù)搜索課程的內(nèi)容3文檔之家-/課程的內(nèi)容3文檔之家-http://shop63695479課程教學(xué)目的和要求教學(xué)方法:理論課實(shí)驗(yàn)課醫(yī)院信息化建設(shè)見(jiàn)習(xí)、調(diào)研討論課考核辦法綜述、調(diào)研報(bào)告、實(shí)驗(yàn)報(bào)告40％教學(xué)參與情況（討論課、上課參與）10％考試50%4文檔之家-/課程教學(xué)目的和要求教學(xué)方法:4文檔之家-http://sho教材和參考書目教材:王偉.醫(yī)學(xué)信息學(xué).高等教育出版社，2006，2參考書目：(荷蘭)J.H.VanBemmel(美國(guó))M.A.Musen主編包含飛鄭學(xué)侃主譯，醫(yī)學(xué)信息學(xué)，上海科技出版社。傅征等，醫(yī)院信息系統(tǒng)建設(shè)與應(yīng)用，人民軍醫(yī)出版社，2003，3金新政等，醫(yī)院信息系統(tǒng)，科學(xué)出版社，2004.1黃曉鸝主編，醫(yī)學(xué)信息學(xué)教程，中國(guó)科學(xué)技術(shù)出版社5文檔之家-/教材和參考書目教材:王偉.醫(yī)學(xué)信息學(xué).高等教育出版社，200第一章醫(yī)學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ)第一節(jié)醫(yī)學(xué)信息信息的含義信息存在的普遍性信息概念的表述各家學(xué)說(shuō)：歸納為五種主要學(xué)說(shuō)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)（GB/T4894-1985）：是事物變化和特征的反映；是事物間相互聯(lián)系的表征；是事物在特定信息載體上的映射或再現(xiàn)信息的特征語(yǔ)法語(yǔ)義語(yǔ)用6文檔之家-/第一章醫(yī)學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ)第一節(jié)醫(yī)學(xué)信息6文檔之家-http:醫(yī)學(xué)信息學(xué)（MedicalInformatics）概念： 醫(yī)學(xué)信息是指醫(yī)學(xué)、醫(yī)療衛(wèi)生和公共健康或藥學(xué)、藥物為信息內(nèi)容和應(yīng)用領(lǐng)域的各種信息。傳統(tǒng)的醫(yī)學(xué)信息學(xué)－－側(cè)重文獻(xiàn)信息管理、分析研究?，F(xiàn)代醫(yī)學(xué)信息學(xué)－－計(jì)算機(jī)技術(shù)與IT應(yīng)用到醫(yī)藥衛(wèi)生領(lǐng)域。醫(yī)學(xué)信息的要素：語(yǔ)義要素語(yǔ)用要素7文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)（MedicalInformatics）概念：7醫(yī)學(xué)信息的類型根據(jù)存在方式分類人體內(nèi)信息人體外信息根據(jù)來(lái)源分類系統(tǒng)內(nèi)部信息系統(tǒng)外部信息根據(jù)應(yīng)用領(lǐng)域分類醫(yī)學(xué)研究信息臨床研究信息醫(yī)學(xué)市場(chǎng)信息醫(yī)學(xué)管理信息8文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息的類型8文檔之家-http://shop636954第二節(jié)醫(yī)學(xué)信息學(xué)相關(guān)概念信息與數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)基本單元---符號(hào)信息構(gòu)成的基礎(chǔ)---數(shù)據(jù)信息的外在形式---消息9文檔之家-/第二節(jié)醫(yī)學(xué)信息學(xué)相關(guān)概念信息與數(shù)據(jù)9文檔之家-http:/信息與知識(shí)知識(shí)的定義P9知識(shí)的分類知事類知識(shí)（know-what）知因類知識(shí)（know-why）知能類知識(shí)（know-how）知人類知識(shí)（know-what）10文檔之家-/信息與知識(shí)10文檔之家-http://shop6369547知識(shí)與信息的關(guān)系11文檔之家-/知識(shí)與信息的關(guān)系11文檔之家-http://shop6369信息與文獻(xiàn)文獻(xiàn)的概念：記錄有信息和知識(shí)的一切載體。文獻(xiàn)的等級(jí)結(jié)構(gòu)。p12圖1-6一次文獻(xiàn)二次文獻(xiàn)三次文獻(xiàn)文獻(xiàn)與信息的關(guān)系P13圖1-7信息與知識(shí)性記錄性載體實(shí)體形態(tài)性12文檔之家-/信息與文獻(xiàn)12文檔之家-http://shop636954713文檔之家-/13文檔之家-http://shop63695479.tao第三節(jié)醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究20世紀(jì)70年代末借用法語(yǔ)單詞informatiquemedicale而來(lái)。將先前的醫(yī)學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)、醫(yī)學(xué)信息科學(xué)、計(jì)算機(jī)醫(yī)學(xué)應(yīng)用衛(wèi)生信息學(xué)等統(tǒng)一而成。

1978年國(guó)際醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)（IMIA）成立。是WHO認(rèn)可的非政府組織。1974年起每3年一次會(huì)議。14文檔之家-/第三節(jié)醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究20世紀(jì)70年代末借用法語(yǔ)單詞info醫(yī)學(xué)信息學(xué)的定義醫(yī)學(xué)信息學(xué)是以信息學(xué)、信息管理和信息技術(shù)為依托，研究醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的信息現(xiàn)象和信息規(guī)律，用于醫(yī)學(xué)決策和管理的一門交叉學(xué)科。交叉學(xué)科與IT技術(shù)密切相關(guān)任務(wù)醫(yī)學(xué)信息利用和共享，提高決策15文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)的定義15文檔之家-http://shop6369國(guó)外醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展過(guò)程醫(yī)學(xué)信息學(xué)的初期探索（20世紀(jì)60年代）MEDLARS的建成為標(biāo)志美國(guó)大學(xué)“生命科學(xué)計(jì)算機(jī)資源”醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展時(shí)期（20世紀(jì)70－80年代）

大規(guī)模醫(yī)院信息系統(tǒng)國(guó)際醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)成立（IMIA）16文檔之家-/國(guó)外醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展過(guò)程醫(yī)學(xué)信息學(xué)的初期探索（20世紀(jì)60年醫(yī)學(xué)信息學(xué)的深入研究時(shí)期（20世紀(jì)80年代中期至今）大型研究項(xiàng)目的開(kāi)展從以數(shù)據(jù)處理的階段進(jìn)入知識(shí)處理的新階段，醫(yī)學(xué)人工智能和專家系統(tǒng)的研究為主要標(biāo)志。17文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)的深入研究時(shí)期（20世紀(jì)80年代中期至今）17文檔二、我國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展進(jìn)程1995年“金衛(wèi)工程”建立國(guó)家醫(yī)療信息骨干網(wǎng)建立衛(wèi)生宏觀數(shù)據(jù)庫(kù)建立醫(yī)院HIS發(fā)行“金衛(wèi)卡”軍隊(duì)一、二、三號(hào)工程1987年，中國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)（CMIA）成立。04年11月，中國(guó)衛(wèi)生信息學(xué)會(huì)成立存在的問(wèn)題：缺乏研究的深度和廣度。18文檔之家-/二、我國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展進(jìn)程1995年“金衛(wèi)工程”18文檔之醫(yī)學(xué)信息學(xué)的研究對(duì)象和研究領(lǐng)域研究對(duì)象對(duì)生命信息現(xiàn)象的研究應(yīng)用控制論P(yáng)15圖1-8對(duì)人類社會(huì)活動(dòng)中醫(yī)學(xué)信息的研究循證醫(yī)學(xué)P16圖1-919文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)的研究對(duì)象和研究領(lǐng)域研究對(duì)象19文檔之家-http診斷－治療循環(huán)1．人類活動(dòng)的三個(gè)階段：觀察、分析、行動(dòng)2．醫(yī)療衛(wèi)生活動(dòng)：觀察、診斷、治療20文檔之家-/診斷－治療循環(huán)1．人類活動(dòng)的三個(gè)階段：觀察、分析、行動(dòng)觀察、分析、行動(dòng)21文檔之家-/觀察、分析、行動(dòng)21文檔之家-http://shop6369診斷－治療循環(huán)22文檔之家-/診斷－治療循環(huán)22文檔之家-http://shop63695生物信息學(xué)（Bioinformatics)概念

美國(guó)人類基因組計(jì)劃實(shí)施五年后的總結(jié)報(bào)告中，對(duì)生物信息學(xué)作了以下定義： 生物信息學(xué)是一門交叉科學(xué)，它包含了生物信息的獲取、處理、存儲(chǔ)、分發(fā)、分析和解釋等在內(nèi)的所有方面，它綜合運(yùn)用數(shù)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和生物學(xué)的各種工具，來(lái)闡明和理解大量數(shù)據(jù)所包含的生物學(xué)意義。23文檔之家-/生物信息學(xué)（Bioinformatics)概念 美國(guó)人類基因生物信息學(xué)核心觀點(diǎn)：生命現(xiàn)象是在信息控制下不同層次上的物質(zhì)、能量與信息的交換。是信息在不同層次的傳遞過(guò)程：核酸、蛋白質(zhì)、細(xì)胞、器官、系統(tǒng)、整體。24文檔之家-/生物信息學(xué)核心觀點(diǎn)：24文檔之家-http://shop63廣義的生物信息學(xué)生物的遺傳信息學(xué)：DNA-RNA-蛋白質(zhì)、遺傳信息-轉(zhuǎn)錄-翻譯生命活動(dòng)的調(diào)控：基因的功能、表達(dá)和調(diào)控蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、功能。生物電磁學(xué)與電磁生物學(xué)：生物電磁學(xué)：人體的電磁輻射：人體信號(hào)的調(diào)制方式；電磁生物學(xué)25文檔之家-/廣義的生物信息學(xué)生物的遺傳信息學(xué)：DNA-RNA-蛋白質(zhì)、遺視覺(jué)系統(tǒng)與光信息處理視網(wǎng)膜神經(jīng)元回路與信息處理、彩色視覺(jué)及彩色圖象的編碼、變換機(jī)制等。腦和神經(jīng)系統(tǒng)與信息：腦感知覺(jué)信息處理原理及其應(yīng)用，學(xué)習(xí)、記憶、思維模型與信息系統(tǒng)新原理研究。生物結(jié)構(gòu)與微光機(jī)電系統(tǒng)：DNA驅(qū)動(dòng)的微細(xì)機(jī)器人生物大分子到細(xì)胞基本結(jié)構(gòu)體系的自組裝、自組織創(chuàng)造新物質(zhì)的分子工程學(xué)研究基因芯片、蛋白質(zhì)芯片26文檔之家-/視覺(jué)系統(tǒng)與光信息處理26文檔之家-http://shop63狹義的生物信息學(xué)基因?qū)哟蔚纳镄畔W(xué)綜合利用生物學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)、信息科學(xué)以及計(jì)算機(jī)科學(xué)的交叉學(xué)科。把基因組DNA序列信息作為信息分析的源頭，獲得蛋白質(zhì)編碼區(qū)的信息之后進(jìn)行蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)模擬和預(yù)測(cè)。核心是基因組信息學(xué)：基因組信息的獲取、處理、存儲(chǔ)、分配和解釋。發(fā)現(xiàn)新基因信息后進(jìn)行蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)擬合預(yù)測(cè)，依據(jù)蛋白質(zhì)的功能進(jìn)行藥物設(shè)計(jì)。27文檔之家-/狹義的生物信息學(xué)基因?qū)哟蔚纳镄畔W(xué)27文檔之家-http:醫(yī)學(xué)信息學(xué)的學(xué)科體系醫(yī)學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ)研究醫(yī)學(xué)信息技術(shù)研究醫(yī)學(xué)信息標(biāo)準(zhǔn)化研究醫(yī)學(xué)信息有序化研究醫(yī)學(xué)信息獲取方法研究醫(yī)學(xué)信息交流研究醫(yī)學(xué)圖象分析與處理技術(shù)研究醫(yī)學(xué)信息系統(tǒng)研究醫(yī)學(xué)決策支持系統(tǒng)研究醫(yī)學(xué)知識(shí)管理研究28文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)的學(xué)科體系醫(yī)學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ)研究28文檔之家-http醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究進(jìn)展醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)挖掘理論、技術(shù)與方法的研究領(lǐng)域數(shù)據(jù)庫(kù)與跨庫(kù)檢索循證醫(yī)學(xué)信息資源的研究統(tǒng)一的醫(yī)學(xué)信息標(biāo)準(zhǔn)研究基于WEB的電子病歷系統(tǒng)研究整合的醫(yī)療信息系統(tǒng)研究智能化醫(yī)學(xué)專家系統(tǒng)研究小波理論在醫(yī)學(xué)圖象處理中的研究社區(qū)衛(wèi)生和公共衛(wèi)生系統(tǒng)的研究29文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究進(jìn)展醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)挖掘理論、技術(shù)與方法的研究29文檔2、決策支持系統(tǒng)與數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)決策支持系統(tǒng)（DSS）：從數(shù)據(jù)庫(kù)中找出必要的數(shù)據(jù)，并利用數(shù)學(xué)模型的功能，為用戶產(chǎn)生所需的信息。數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)和數(shù)據(jù)挖掘數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)：是一個(gè)面向主題的、集成的、穩(wěn)定的、包含歷史數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)集合。它用于支持經(jīng)營(yíng)管理中的決策制定過(guò)程。數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的概念對(duì)收集不同來(lái)源的數(shù)據(jù)從新的角度提出了一種新的結(jié)構(gòu)方法數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的根本任務(wù)：把信息加以整理歸納并及時(shí)提供給管理決策人員。主要作用：提供報(bào)表和圖表、支持多維分析、數(shù)據(jù)挖掘的基礎(chǔ)。30文檔之家-/2、決策支持系統(tǒng)與數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)決策支持系統(tǒng)（DSS）：從數(shù)據(jù)庫(kù)中數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的主題：是指用戶使用數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)進(jìn)行決策時(shí)所關(guān)心的重點(diǎn)方面。面向主題：數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)內(nèi)的信息是按主題進(jìn)行組織，為按主題進(jìn)行決策的過(guò)程提供信息。集成：指信息是經(jīng)過(guò)系統(tǒng)加工、匯總和整理。穩(wěn)定：數(shù)據(jù)進(jìn)入數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)后，將長(zhǎng)期被保留。包含歷史數(shù)據(jù)：從過(guò)去某一時(shí)點(diǎn)到目前的各個(gè)階段的信息。31文檔之家-/數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的主題：是指用戶使用數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)進(jìn)行決策時(shí)所關(guān)心的重點(diǎn)方數(shù)據(jù)挖掘：所謂數(shù)據(jù)挖掘，就是從數(shù)據(jù)庫(kù)中抽取隱含的、以前未知的、具有潛在應(yīng)用價(jià)值的信息的過(guò)程。數(shù)據(jù)挖掘是KDD最核心的部分。數(shù)據(jù)挖掘與傳統(tǒng)分析工具不同的是數(shù)據(jù)挖掘使用的是基于發(fā)現(xiàn)的方法，運(yùn)用模式匹配和其它算法決定數(shù)據(jù)之間的重要聯(lián)系。32文檔之家-/數(shù)據(jù)挖掘：32文檔之家-http://shop6369547第一步是描述數(shù)據(jù)---計(jì)算統(tǒng)計(jì)變量（比如平均值、均方差等），再用圖表或圖片直觀的表示出來(lái)，進(jìn)而可以看出一些變量之間的相關(guān)性（比如有一些值經(jīng)常同時(shí)出現(xiàn)）。歷史數(shù)據(jù)建立一個(gè)預(yù)言模型，然后再用另外一些數(shù)據(jù)對(duì)這個(gè)模型進(jìn)行測(cè)試。驗(yàn)證你的模型33文檔之家-/第一步是描述數(shù)據(jù)---計(jì)算統(tǒng)計(jì)變量（比如平均值、均方差等數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)系統(tǒng)的四個(gè)層次體系結(jié)構(gòu)：（1）數(shù)據(jù)源：整個(gè)系統(tǒng)的數(shù)據(jù)源泉（2）數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)與管理：不同于傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫(kù)，決定了外部數(shù)據(jù)的表現(xiàn)形式。

34文檔之家-/數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)系統(tǒng)的四個(gè)層次體系結(jié)構(gòu)：

34文檔之家-http:大部分情況下，數(shù)據(jù)挖掘都要先把數(shù)據(jù)從數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)中拿到數(shù)據(jù)挖掘庫(kù)或數(shù)據(jù)集市中。數(shù)據(jù)源數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)各分公司數(shù)據(jù)集市分析數(shù)據(jù)集市數(shù)據(jù)挖掘數(shù)據(jù)集市圖1：數(shù)據(jù)挖掘庫(kù)從數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)中得出35文檔之家-/大部分情況下，數(shù)據(jù)挖掘都要先把數(shù)據(jù)從數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)中拿到數(shù)據(jù)挖掘庫(kù)數(shù)據(jù)挖掘庫(kù)可能是你的數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的一個(gè)邏輯上的子集，而不一定非得是物理上單獨(dú)的數(shù)據(jù)庫(kù)。36文檔之家-/數(shù)據(jù)挖掘庫(kù)可能是你的數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的一個(gè)邏輯上的子集，而不一定非得可以把一個(gè)或幾個(gè)事務(wù)數(shù)據(jù)庫(kù)導(dǎo)到一個(gè)只讀的數(shù)據(jù)庫(kù)中，就把它當(dāng)作數(shù)據(jù)集市，然后在他上面進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘。

數(shù)據(jù)源數(shù)據(jù)挖掘庫(kù)圖2：數(shù)據(jù)挖掘庫(kù)從事務(wù)數(shù)據(jù)庫(kù)中得出

37文檔之家-/可以把一個(gè)或幾個(gè)事務(wù)數(shù)據(jù)庫(kù)導(dǎo)到一個(gè)只讀的數(shù)據(jù)庫(kù)中，就把它當(dāng)作聯(lián)機(jī)分析處理（OLAP）：對(duì)分析需要的數(shù)據(jù)進(jìn)行有效集成，按多維模型進(jìn)行組織，以便進(jìn)行多角度、多層次的分析，并發(fā)現(xiàn)趨勢(shì)。 傳統(tǒng)的查詢和報(bào)表工具是告訴你數(shù)據(jù)庫(kù)中都有什么（whathappened），OLAP則更進(jìn)一步告訴你下一步會(huì)怎么樣（Whatnext）、和如果我采取這樣的措施又會(huì)怎么樣（Whatif）。38文檔之家-/聯(lián)機(jī)分析處理（OLAP）：對(duì)分析需要的數(shù)據(jù)進(jìn)行有效集成，按多（4）前端工具：報(bào)表工具、數(shù)據(jù)分析工具、查詢工具、數(shù)據(jù)挖掘工具。（P183圖9-7)39文檔之家-/（4）前端工具：報(bào)表工具、數(shù)據(jù)分析工具、查詢工具、數(shù)據(jù)挖掘工第四節(jié)醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育一、國(guó)外醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育99年IMIA批準(zhǔn)了召開(kāi)的MEDINFO大會(huì)批準(zhǔn)和公布醫(yī)學(xué)信息教育的指導(dǎo)建議。美國(guó)有60多家大學(xué)授予醫(yī)學(xué)信息學(xué)學(xué)位；荷蘭設(shè)醫(yī)學(xué)信息學(xué)課程和教師職位澳大利亞本世紀(jì)初有24所大學(xué)醫(yī)學(xué)信息學(xué)方面的課程。法國(guó)93年將醫(yī)學(xué)信息學(xué)設(shè)置為專業(yè)。40文檔之家-/第四節(jié)醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育一、國(guó)外醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育40文檔之家-h二、我國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育醫(yī)學(xué)信息專業(yè)教育：專業(yè)目錄歸到“信息管理與信息系統(tǒng)”；03年列為目錄外專業(yè)。目前有30所醫(yī)學(xué)院校開(kāi)設(shè)醫(yī)學(xué)信息學(xué)專業(yè)。醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索課教學(xué)41文檔之家-/二、我國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)教育醫(yī)學(xué)信息專業(yè)教育：專業(yè)目錄歸到“信息管醫(yī)學(xué)信息學(xué)發(fā)展方向研究與應(yīng)用領(lǐng)域不斷擴(kuò)大由疾病分類編碼擴(kuò)大到衛(wèi)生各個(gè)領(lǐng)域重價(jià)值和質(zhì)量管理Ball公式(服務(wù)+質(zhì)量)/消費(fèi)=價(jià)值Ball的實(shí)現(xiàn)方法：強(qiáng)化疾病管理、普及遠(yuǎn)程醫(yī)療、實(shí)現(xiàn)病人安全管理、建立決策支持系統(tǒng)。衛(wèi)生信息系統(tǒng)建設(shè)03年公布《國(guó)家公共衛(wèi)生信息系統(tǒng)建設(shè)方案》加快專業(yè)人才培養(yǎng)建立健全醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究體制加強(qiáng)國(guó)際和國(guó)內(nèi)合作42文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)發(fā)展方向研究與應(yīng)用領(lǐng)域不斷擴(kuò)大42文檔之家-htt生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)浙江中醫(yī)藥大學(xué)信息技術(shù)學(xué)院王海舜43文檔之家-/生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)浙江中醫(yī)藥大學(xué)信息技術(shù)學(xué)院1文檔之家-http課程學(xué)習(xí)目的和要求教學(xué)目的:通過(guò)本課程的學(xué)習(xí)，掌握醫(yī)學(xué)信息學(xué)的基本原理，能用醫(yī)學(xué)信息學(xué)的方法和計(jì)算機(jī)技術(shù)開(kāi)展醫(yī)學(xué)研究。課程內(nèi)容:醫(yī)學(xué)信息學(xué)生物信息學(xué)44文檔之家-/課程學(xué)習(xí)目的和要求教學(xué)目的:通過(guò)本課程的學(xué)習(xí)，掌握醫(yī)學(xué)信息學(xué)醫(yī)學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)信息標(biāo)準(zhǔn)化臨床信息系統(tǒng)醫(yī)學(xué)信息有序化醫(yī)學(xué)信息獲取PACS系統(tǒng)及其實(shí)現(xiàn)醫(yī)學(xué)信息的硬件架構(gòu)和信息安全臨床信息系統(tǒng)臨床路徑無(wú)線網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)決策支持生物信息學(xué)概論生物數(shù)據(jù)庫(kù)序列對(duì)比和數(shù)據(jù)庫(kù)搜索課程的內(nèi)容45文檔之家-/課程的內(nèi)容3文檔之家-http://shop63695479課程教學(xué)目的和要求教學(xué)方法:理論課實(shí)驗(yàn)課醫(yī)院信息化建設(shè)見(jiàn)習(xí)、調(diào)研討論課考核辦法綜述、調(diào)研報(bào)告、實(shí)驗(yàn)報(bào)告40％教學(xué)參與情況（討論課、上課參與）10％考試50%46文檔之家-/課程教學(xué)目的和要求教學(xué)方法:4文檔之家-http://sho教材和參考書目教材:王偉.醫(yī)學(xué)信息學(xué).高等教育出版社，2006，2參考書目：(荷蘭)J.H.VanBemmel(美國(guó))M.A.Musen主編包含飛鄭學(xué)侃主譯，醫(yī)學(xué)信息學(xué)，上?？萍汲霭嫔?。傅征等，醫(yī)院信息系統(tǒng)建設(shè)與應(yīng)用，人民軍醫(yī)出版社，2003，3金新政等，醫(yī)院信息系統(tǒng)，科學(xué)出版社，2004.1黃曉鸝主編，醫(yī)學(xué)信息學(xué)教程，中國(guó)科學(xué)技術(shù)出版社47文檔之家-/教材和參考書目教材:王偉.醫(yī)學(xué)信息學(xué).高等教育出版社，200第一章醫(yī)學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ)第一節(jié)醫(yī)學(xué)信息信息的含義信息存在的普遍性信息概念的表述各家學(xué)說(shuō)：歸納為五種主要學(xué)說(shuō)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)（GB/T4894-1985）：是事物變化和特征的反映；是事物間相互聯(lián)系的表征；是事物在特定信息載體上的映射或再現(xiàn)信息的特征語(yǔ)法語(yǔ)義語(yǔ)用48文檔之家-/第一章醫(yī)學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ)第一節(jié)醫(yī)學(xué)信息6文檔之家-http:醫(yī)學(xué)信息學(xué)（MedicalInformatics）概念： 醫(yī)學(xué)信息是指醫(yī)學(xué)、醫(yī)療衛(wèi)生和公共健康或藥學(xué)、藥物為信息內(nèi)容和應(yīng)用領(lǐng)域的各種信息。傳統(tǒng)的醫(yī)學(xué)信息學(xué)－－側(cè)重文獻(xiàn)信息管理、分析研究。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)信息學(xué)－－計(jì)算機(jī)技術(shù)與IT應(yīng)用到醫(yī)藥衛(wèi)生領(lǐng)域。醫(yī)學(xué)信息的要素：語(yǔ)義要素語(yǔ)用要素49文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)（MedicalInformatics）概念：7醫(yī)學(xué)信息的類型根據(jù)存在方式分類人體內(nèi)信息人體外信息根據(jù)來(lái)源分類系統(tǒng)內(nèi)部信息系統(tǒng)外部信息根據(jù)應(yīng)用領(lǐng)域分類醫(yī)學(xué)研究信息臨床研究信息醫(yī)學(xué)市場(chǎng)信息醫(yī)學(xué)管理信息50文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息的類型8文檔之家-http://shop636954第二節(jié)醫(yī)學(xué)信息學(xué)相關(guān)概念信息與數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)基本單元---符號(hào)信息構(gòu)成的基礎(chǔ)---數(shù)據(jù)信息的外在形式---消息51文檔之家-/第二節(jié)醫(yī)學(xué)信息學(xué)相關(guān)概念信息與數(shù)據(jù)9文檔之家-http:/信息與知識(shí)知識(shí)的定義P9知識(shí)的分類知事類知識(shí)（know-what）知因類知識(shí)（know-why）知能類知識(shí)（know-how）知人類知識(shí)（know-what）52文檔之家-/信息與知識(shí)10文檔之家-http://shop6369547知識(shí)與信息的關(guān)系53文檔之家-/知識(shí)與信息的關(guān)系11文檔之家-http://shop6369信息與文獻(xiàn)文獻(xiàn)的概念：記錄有信息和知識(shí)的一切載體。文獻(xiàn)的等級(jí)結(jié)構(gòu)。p12圖1-6一次文獻(xiàn)二次文獻(xiàn)三次文獻(xiàn)文獻(xiàn)與信息的關(guān)系P13圖1-7信息與知識(shí)性記錄性載體實(shí)體形態(tài)性54文檔之家-/信息與文獻(xiàn)12文檔之家-http://shop636954755文檔之家-/13文檔之家-http://shop63695479.tao第三節(jié)醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究20世紀(jì)70年代末借用法語(yǔ)單詞informatiquemedicale而來(lái)。將先前的醫(yī)學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)、醫(yī)學(xué)信息科學(xué)、計(jì)算機(jī)醫(yī)學(xué)應(yīng)用衛(wèi)生信息學(xué)等統(tǒng)一而成。

1978年國(guó)際醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)（IMIA）成立。是WHO認(rèn)可的非政府組織。1974年起每3年一次會(huì)議。56文檔之家-/第三節(jié)醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究20世紀(jì)70年代末借用法語(yǔ)單詞info醫(yī)學(xué)信息學(xué)的定義醫(yī)學(xué)信息學(xué)是以信息學(xué)、信息管理和信息技術(shù)為依托，研究醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的信息現(xiàn)象和信息規(guī)律，用于醫(yī)學(xué)決策和管理的一門交叉學(xué)科。交叉學(xué)科與IT技術(shù)密切相關(guān)任務(wù)醫(yī)學(xué)信息利用和共享，提高決策57文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)的定義15文檔之家-http://shop6369國(guó)外醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展過(guò)程醫(yī)學(xué)信息學(xué)的初期探索（20世紀(jì)60年代）MEDLARS的建成為標(biāo)志美國(guó)大學(xué)“生命科學(xué)計(jì)算機(jī)資源”醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展時(shí)期（20世紀(jì)70－80年代）

大規(guī)模醫(yī)院信息系統(tǒng)國(guó)際醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)成立（IMIA）58文檔之家-/國(guó)外醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展過(guò)程醫(yī)學(xué)信息學(xué)的初期探索（20世紀(jì)60年醫(yī)學(xué)信息學(xué)的深入研究時(shí)期（20世紀(jì)80年代中期至今）大型研究項(xiàng)目的開(kāi)展從以數(shù)據(jù)處理的階段進(jìn)入知識(shí)處理的新階段，醫(yī)學(xué)人工智能和專家系統(tǒng)的研究為主要標(biāo)志。59文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)的深入研究時(shí)期（20世紀(jì)80年代中期至今）17文檔二、我國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展進(jìn)程1995年“金衛(wèi)工程”建立國(guó)家醫(yī)療信息骨干網(wǎng)建立衛(wèi)生宏觀數(shù)據(jù)庫(kù)建立醫(yī)院HIS發(fā)行“金衛(wèi)卡”軍隊(duì)一、二、三號(hào)工程1987年，中國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)（CMIA）成立。04年11月，中國(guó)衛(wèi)生信息學(xué)會(huì)成立存在的問(wèn)題：缺乏研究的深度和廣度。60文檔之家-/二、我國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)的發(fā)展進(jìn)程1995年“金衛(wèi)工程”18文檔之醫(yī)學(xué)信息學(xué)的研究對(duì)象和研究領(lǐng)域研究對(duì)象對(duì)生命信息現(xiàn)象的研究應(yīng)用控制論P(yáng)15圖1-8對(duì)人類社會(huì)活動(dòng)中醫(yī)學(xué)信息的研究循證醫(yī)學(xué)P16圖1-961文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)的研究對(duì)象和研究領(lǐng)域研究對(duì)象19文檔之家-http診斷－治療循環(huán)1．人類活動(dòng)的三個(gè)階段：觀察、分析、行動(dòng)2．醫(yī)療衛(wèi)生活動(dòng)：觀察、診斷、治療62文檔之家-/診斷－治療循環(huán)1．人類活動(dòng)的三個(gè)階段：觀察、分析、行動(dòng)觀察、分析、行動(dòng)63文檔之家-/觀察、分析、行動(dòng)21文檔之家-http://shop6369診斷－治療循環(huán)64文檔之家-/診斷－治療循環(huán)22文檔之家-http://shop63695生物信息學(xué)（Bioinformatics)概念

美國(guó)人類基因組計(jì)劃實(shí)施五年后的總結(jié)報(bào)告中，對(duì)生物信息學(xué)作了以下定義： 生物信息學(xué)是一門交叉科學(xué)，它包含了生物信息的獲取、處理、存儲(chǔ)、分發(fā)、分析和解釋等在內(nèi)的所有方面，它綜合運(yùn)用數(shù)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)和生物學(xué)的各種工具，來(lái)闡明和理解大量數(shù)據(jù)所包含的生物學(xué)意義。65文檔之家-/生物信息學(xué)（Bioinformatics)概念 美國(guó)人類基因生物信息學(xué)核心觀點(diǎn)：生命現(xiàn)象是在信息控制下不同層次上的物質(zhì)、能量與信息的交換。是信息在不同層次的傳遞過(guò)程：核酸、蛋白質(zhì)、細(xì)胞、器官、系統(tǒng)、整體。66文檔之家-/生物信息學(xué)核心觀點(diǎn)：24文檔之家-http://shop63廣義的生物信息學(xué)生物的遺傳信息學(xué)：DNA-RNA-蛋白質(zhì)、遺傳信息-轉(zhuǎn)錄-翻譯生命活動(dòng)的調(diào)控：基因的功能、表達(dá)和調(diào)控蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、功能。生物電磁學(xué)與電磁生物學(xué)：生物電磁學(xué)：人體的電磁輻射：人體信號(hào)的調(diào)制方式；電磁生物學(xué)67文檔之家-/廣義的生物信息學(xué)生物的遺傳信息學(xué)：DNA-RNA-蛋白質(zhì)、遺視覺(jué)系統(tǒng)與光信息處理視網(wǎng)膜神經(jīng)元回路與信息處理、彩色視覺(jué)及彩色圖象的編碼、變換機(jī)制等。腦和神經(jīng)系統(tǒng)與信息：腦感知覺(jué)信息處理原理及其應(yīng)用，學(xué)習(xí)、記憶、思維模型與信息系統(tǒng)新原理研究。生物結(jié)構(gòu)與微光機(jī)電系統(tǒng)：DNA驅(qū)動(dòng)的微細(xì)機(jī)器人生物大分子到細(xì)胞基本結(jié)構(gòu)體系的自組裝、自組織創(chuàng)造新物質(zhì)的分子工程學(xué)研究基因芯片、蛋白質(zhì)芯片68文檔之家-/視覺(jué)系統(tǒng)與光信息處理26文檔之家-http://shop63狹義的生物信息學(xué)基因?qū)哟蔚纳镄畔W(xué)綜合利用生物學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)、信息科學(xué)以及計(jì)算機(jī)科學(xué)的交叉學(xué)科。把基因組DNA序列信息作為信息分析的源頭，獲得蛋白質(zhì)編碼區(qū)的信息之后進(jìn)行蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)模擬和預(yù)測(cè)。核心是基因組信息學(xué)：基因組信息的獲取、處理、存儲(chǔ)、分配和解釋。發(fā)現(xiàn)新基因信息后進(jìn)行蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)擬合預(yù)測(cè)，依據(jù)蛋白質(zhì)的功能進(jìn)行藥物設(shè)計(jì)。69文檔之家-/狹義的生物信息學(xué)基因?qū)哟蔚纳镄畔W(xué)27文檔之家-http:醫(yī)學(xué)信息學(xué)的學(xué)科體系醫(yī)學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ)研究醫(yī)學(xué)信息技術(shù)研究醫(yī)學(xué)信息標(biāo)準(zhǔn)化研究醫(yī)學(xué)信息有序化研究醫(yī)學(xué)信息獲取方法研究醫(yī)學(xué)信息交流研究醫(yī)學(xué)圖象分析與處理技術(shù)研究醫(yī)學(xué)信息系統(tǒng)研究醫(yī)學(xué)決策支持系統(tǒng)研究醫(yī)學(xué)知識(shí)管理研究70文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)的學(xué)科體系醫(yī)學(xué)信息學(xué)基礎(chǔ)研究28文檔之家-http醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究進(jìn)展醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)挖掘理論、技術(shù)與方法的研究領(lǐng)域數(shù)據(jù)庫(kù)與跨庫(kù)檢索循證醫(yī)學(xué)信息資源的研究統(tǒng)一的醫(yī)學(xué)信息標(biāo)準(zhǔn)研究基于WEB的電子病歷系統(tǒng)研究整合的醫(yī)療信息系統(tǒng)研究智能化醫(yī)學(xué)專家系統(tǒng)研究小波理論在醫(yī)學(xué)圖象處理中的研究社區(qū)衛(wèi)生和公共衛(wèi)生系統(tǒng)的研究71文檔之家-/醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究進(jìn)展醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)挖掘理論、技術(shù)與方法的研究29文檔2、決策支持系統(tǒng)與數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)決策支持系統(tǒng)（DSS）：從數(shù)據(jù)庫(kù)中找出必要的數(shù)據(jù)，并利用數(shù)學(xué)模型的功能，為用戶產(chǎn)生所需的信息。數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)和數(shù)據(jù)挖掘數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)：是一個(gè)面向主題的、集成的、穩(wěn)定的、包含歷史數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)集合。它用于支持經(jīng)營(yíng)管理中的決策制定過(guò)程。數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的概念對(duì)收集不同來(lái)源的數(shù)據(jù)從新的角度提出了一種新的結(jié)構(gòu)方法數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的根本任務(wù)：把信息加以整理歸納并及時(shí)提供給管理決策人員。主要作用：提供報(bào)表和圖表、支持多維分析、數(shù)據(jù)挖掘的基礎(chǔ)。72文檔之家-/2、決策支持系統(tǒng)與數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)決策支持系統(tǒng)（DSS）：從數(shù)據(jù)庫(kù)中數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的主題：是指用戶使用數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)進(jìn)行決策時(shí)所關(guān)心的重點(diǎn)方面。面向主題：數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)內(nèi)的信息是按主題進(jìn)行組織，為按主題進(jìn)行決策的過(guò)程提供信息。集成：指信息是經(jīng)過(guò)系統(tǒng)加工、匯總和整理。穩(wěn)定：數(shù)據(jù)進(jìn)入數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)后，將長(zhǎng)期被保留。包含歷史數(shù)據(jù)：從過(guò)去某一時(shí)點(diǎn)到目前的各個(gè)階段的信息。73文檔之家-/數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)的主題：是指用戶使用數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)進(jìn)行決策時(shí)所關(guān)心的重點(diǎn)方數(shù)據(jù)挖掘：所謂數(shù)據(jù)挖掘，就是從數(shù)據(jù)庫(kù)中抽取隱含的、以前未知的、具有潛在應(yīng)用價(jià)值的信息的過(guò)程。數(shù)據(jù)挖掘是KDD最核心的部分。數(shù)據(jù)挖掘與傳統(tǒng)分析工具不同的是數(shù)據(jù)挖掘使用的是基于發(fā)現(xiàn)的方法，運(yùn)用模式匹配和其它算法決定數(shù)據(jù)之間的重要聯(lián)系。74文檔之家-/數(shù)據(jù)挖掘：32文檔之家-http://shop6369547第一步是描述數(shù)據(jù)---計(jì)算統(tǒng)計(jì)變量（比如平均值、均方差等），再用圖表或圖片直觀的表示出來(lái)，進(jìn)而可以看出一些變量之間的相關(guān)性（比如有一些值經(jīng)常同時(shí)出現(xiàn)）。歷史數(shù)據(jù)建立一個(gè)預(yù)言模型，然后再用另外一些數(shù)據(jù)對(duì)這個(gè)模型進(jìn)行測(cè)試。驗(yàn)證你的模型75文檔之家-/第一步是描述數(shù)據(jù)---計(jì)算統(tǒng)計(jì)變量（比如平均值、均方差等數(shù)據(jù)倉(cāng)庫(kù)系統(tǒng)的四個(gè)層次體系結(jié)構(gòu)：（1）數(shù)據(jù)源：整個(gè)系統(tǒng)的數(shù)據(jù)源泉（2）數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)與管理：不同于傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫(kù)，決定了外部數(shù)據(jù)的表現(xiàn)形式。