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會(huì)計(jì)學(xué)1結(jié)核分枝桿菌的核酸檢測(cè)會(huì)計(jì)學(xué)1結(jié)核分枝桿菌的核酸檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)是檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌特異的核酸序列;陽性結(jié)果提示該檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌核酸的存在,在排除核酸污染的情況下,可確定該檢測(cè)標(biāo)本中存在結(jié)核分枝桿菌。結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)較常采用的目的片段有16SrRNA、IS6110、MBP64、rpoB、hsp65等第1頁/共25頁結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)是檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌特異的核酸序列;第1頁結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)
增加分子生物學(xué)陽性可以作為確診標(biāo)準(zhǔn),及強(qiáng)調(diào)病原學(xué)檢查的重要性。3.4.2分子生物學(xué)檢查結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)陽性。4診斷原則肺結(jié)核的診斷是以病原學(xué)(包括細(xì)菌學(xué)、分子生物學(xué))檢查為主,結(jié)合流行病史、臨床表現(xiàn)、胸部影像、相關(guān)的輔助檢查及鑒別診斷等,進(jìn)行綜合分析做出診斷。以病原學(xué)、病理學(xué)結(jié)果作為確診依據(jù)。5.3確診病例結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)陽性,及胸部影像學(xué)檢查支持即可確診。第2頁/共25頁結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)
增加分子生物學(xué)陽性可以作為確診標(biāo)準(zhǔn),及常用技術(shù)傳統(tǒng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)半巢式全自動(dòng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)實(shí)時(shí)熒光核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)交叉引物恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)基因探針檢測(cè)第3頁/共25頁常用技術(shù)傳統(tǒng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)第3頁/共25頁抗酸染色每張檢查3-5min或更長(zhǎng)時(shí)間→陽性率低因素之一熒光染色1.陽性率30%2.無法區(qū)分TB
orNTB1.假陽性率高2.結(jié)合抗酸染色第4頁/共25頁抗酸染色每張檢查3-5min或更長(zhǎng)時(shí)間→陽性率低因素之一熒光結(jié)核菌需要先培養(yǎng)出來(2-6周)再加入不同濃度抗菌藥物的培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng)4-8周報(bào)告藥敏結(jié)果第5頁/共25頁結(jié)核菌需要先培養(yǎng)出來(2-6周)第5頁/共25頁2014年WHO關(guān)于結(jié)核診斷的標(biāo)準(zhǔn)肺結(jié)核所有患者,包括兒童,當(dāng)疑似肺結(jié)核并可咳痰時(shí),應(yīng)送2份痰做涂片鏡檢或1份痰做XpertMTB/RIF檢測(cè)對(duì)于涂陰疑似肺結(jié)核患者,應(yīng)當(dāng)使用XpertMTB/RIF或培養(yǎng)進(jìn)行診斷耐藥結(jié)核當(dāng)患者具有耐藥結(jié)核的風(fēng)險(xiǎn),或者合并HIV感染,或者病情嚴(yán)重時(shí),應(yīng)使用XpertMTB/RIF做初始診斷;肺外結(jié)核所有患者,包括兒童,懷疑有肺外結(jié)核時(shí),應(yīng)當(dāng)采集相應(yīng)的樣本進(jìn)行微生物學(xué)和組織學(xué)檢查;優(yōu)先推薦使用XpertMTB/RIF做初始診斷第6頁/共25頁2014年WHO關(guān)于結(jié)核診斷的標(biāo)準(zhǔn)肺結(jié)核第6頁/共25頁GeneXpertXpertMTB/RIF一種半巢式實(shí)時(shí)熒光PCR體外診斷技術(shù),可以檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌以及利福平耐藥性;針對(duì)rpoB基因81bp利福平耐藥核心區(qū)間(RRDR)設(shè)計(jì)引物、探針。5個(gè)探針結(jié)合到野生型,而不是突變體目標(biāo)。每個(gè)探針用不同的熒光染料標(biāo)記,允許同時(shí)檢測(cè)。第7頁/共25頁GeneXpertXpertMTB/RIF第7頁/共25頁痰標(biāo)本與處理液1:2混合吸取2ml處理樣品到反應(yīng)盒將反應(yīng)盒放入檢測(cè)模塊(手工操作完成)標(biāo)本自動(dòng)清洗過濾超聲裂解DNA提純DNA和PCR反應(yīng)試劑混合半巢式實(shí)時(shí)熒光定量核酸擴(kuò)增檢測(cè)打印檢測(cè)報(bào)告獲得檢測(cè)結(jié)果時(shí)間:1小時(shí)50分鐘系統(tǒng)內(nèi)自動(dòng)完成第8頁/共25頁痰標(biāo)本與處理液吸取2ml處理樣品將反應(yīng)盒放入檢測(cè)模塊(手工操INH單耐藥的患者通常不會(huì)考慮立即改變治療方案,與此相反,對(duì)RIF單耐藥的患者,無論INH是否耐藥,都會(huì)采取與耐多藥患者相同的治療方案1。
約90%利福平耐藥的結(jié)核患者同時(shí)異煙肼耐藥,也就是耐多藥結(jié)核患者2。SvenO.Friedrichetal,.SuitabilityofXpertMTB/RIFandGenotypeMTBDRplusforPatientSelectionforaTuberculosisClinicalTrial.JournalofClinicalMicrobiology.2011(49):2827-2831.
XichaoOuetal.AfeasibilitystudyofXpertMTB/RIFtestattheperipherallevellaboratoryinChina.InternationalJournalofInfectiousDiseases.2015(31):41-46.MTB/RIF檢測(cè)對(duì)MDR-TB的防控“結(jié)核+利福平耐藥”對(duì)多耐結(jié)核控制產(chǎn)生的效果最為顯著。即便補(bǔ)充異煙肼耐藥,能提升的效果有限。第9頁/共25頁INH單耐藥的患者通常不會(huì)考慮立即改變治療方案,與此相反,對(duì)環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增儀(TB-LAMP)體外定性檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群;在恒溫條件下進(jìn)行基因擴(kuò)增反應(yīng);4種引物識(shí)別6個(gè)區(qū)域,特異性高;擴(kuò)增反應(yīng)效率高,67℃,40min。主要優(yōu)點(diǎn)在于對(duì)實(shí)驗(yàn)室儀器的依賴程度較小,而且試劑成本較低。第10頁/共25頁環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增儀(TB-LAMP)第10頁/共25頁傳統(tǒng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)目的:定量檢測(cè)人標(biāo)本中的結(jié)核分枝桿菌核酸原理:PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)累計(jì)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的辦法。第11頁/共25頁傳統(tǒng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)目的:定量檢測(cè)人標(biāo)本中的結(jié)核分枝桿XpertMTB/RIFTB-LAMP結(jié)核桿菌DNA目的基因片段rpoBgryB及IS6110IS6110方法半巢式實(shí)時(shí)熒光PCR環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增實(shí)時(shí)熒光定量PCR時(shí)間2小時(shí)1小時(shí)2.5小時(shí)檢測(cè)敏感度131菌條/ml100菌條/ml1000~10000菌條/ml優(yōu)點(diǎn)全自動(dòng)、同時(shí)檢測(cè)利福平耐藥基因、特異性高,生物安全性高67℃恒溫?cái)U(kuò)增,擴(kuò)增時(shí)間短,特異性高,生物安全性高適合大批量篩查,低費(fèi)用缺點(diǎn)最多一次同時(shí)檢測(cè)八個(gè)樣本標(biāo)本用量較少,除痰標(biāo)本以外的標(biāo)本需進(jìn)一步認(rèn)證假陽性,易污染,需專業(yè)人員操作第12頁/共25頁XpertMTB/RIFTB-LAMP結(jié)核桿菌DNA目的樣本類型(一)抗酸桿菌涂片鏡檢:
痰液、支氣管灌洗液、支氣管抽吸物、肺穿刺物、肺活檢標(biāo)本、胃灌洗液、體液、組織、膿腫物、吸出的膿液、創(chuàng)傷標(biāo)本、大便標(biāo)本分枝桿菌分離培養(yǎng):痰液、支氣管灌洗液、支氣管抽吸物、肺穿刺物、肺活檢標(biāo)本、胃灌洗液、體液、組織、膿腫物、吸出的膿液、創(chuàng)傷標(biāo)本、大便標(biāo)本、血液結(jié)核分枝桿菌的核酸檢測(cè):痰液、支氣管灌洗液、支氣管抽吸物、肺穿刺物、肺活檢標(biāo)本、胃灌洗液、體液、組織、膿腫物、吸出的膿液、創(chuàng)傷標(biāo)本、大便標(biāo)本、血液(GeneXpert除外)、病理切片第13頁/共25頁樣本類型(一)抗酸桿菌涂片鏡檢:第13頁/共25頁樣本類型(二)分枝桿菌菌種鑒定
臨床分枝桿菌分離培養(yǎng)物結(jié)核分枝桿菌藥物敏感性試驗(yàn):臨床分離結(jié)核桿菌純培養(yǎng)物結(jié)核抗體的檢測(cè):血清IFN-γ釋放試驗(yàn)(T-SPOT.TB):肝素鋰或肝素鈉抗凝血第14頁/共25頁樣本類型(二)分枝桿菌菌種鑒定第14頁/共25頁標(biāo)本留取標(biāo)準(zhǔn)1.痰標(biāo)本:
(1)可疑肺結(jié)核患者:初診病人應(yīng)收集3份標(biāo)本(當(dāng)日即時(shí)、夜間和次日晨痰),治療中或隨訪病人應(yīng)按期留取2份痰標(biāo)本(晨痰、夜間痰),體積3~5ml,盛于廣口和具有螺旋蓋子的痰瓶中。(2)即時(shí)痰采集后立即送檢,夜間痰和晨痰采集后常溫保存不應(yīng)超過12小時(shí),對(duì)當(dāng)日不能進(jìn)行涂片檢查的標(biāo)本,須置于4℃冰箱保存,注意防止痰液干涸或污染。(3)對(duì)無法咳痰的患者:可使用高滲鹽水(3%NaCl)誘導(dǎo)痰或收集清晨胃液標(biāo)本,或使用支氣管鏡采集支氣管灌洗液標(biāo)本。第15頁/共25頁標(biāo)本留取標(biāo)準(zhǔn)1.痰標(biāo)本:第15頁/共25頁2.支氣管抽吸物、支氣管肺泡灌洗標(biāo)本、肺穿刺物、肺活檢標(biāo)本(1)對(duì)于不能留取痰標(biāo)本的患者:推薦使用侵入性采集技術(shù)獲取標(biāo)本,比如纖維支氣管鏡檢查、細(xì)針肺穿刺、肺活組織檢查。(2)嚴(yán)格器械清潔和消毒,避免引起交叉污染和感染。(3)支氣管鏡不能接觸自來水,通免污染環(huán)境分枝桿菌。
(4)對(duì)難以診斷的病例推薦使用其他侵入性技術(shù)采集標(biāo)本,比如細(xì)針穿刺、開放肺活組織檢查,無菌條件下采集的經(jīng)支氣管活檢和其他活檢標(biāo)本,運(yùn)輸過程中,應(yīng)加入0.5~1ml無菌的生理鹽水。(5)支氣管分泌物至少2~5ml;支氣管肺泡灌洗液至少20-50ml。第16頁/共25頁2.支氣管抽吸物、支氣管肺泡灌洗標(biāo)本、肺穿刺物、肺活檢標(biāo)本第3.胃灌洗液(1)嬰幼兒、兒童和遲鈍者診斷肺結(jié)核時(shí),鑒于無法采集標(biāo)本或支氣管灌洗液,推薦采集胃液標(biāo)本,通過胃灌洗咽下去的痰液。(2)標(biāo)本應(yīng)在采集4小時(shí)內(nèi)送到實(shí)驗(yàn)室,否則應(yīng)置于一次性內(nèi)含100ml碳酸鈉酸他的無菌容器中。(3)胃灌洗液需連續(xù)采集3天,體積5~10ml,調(diào)節(jié)pH至中性。4.尿液(1)采集標(biāo)本前,應(yīng)清洗外生殖器,推薦連續(xù)采集3天清晨中段尿于無菌容器中,用于培養(yǎng)的尿液標(biāo)本至少需要40ml(2)只有在不能獲得中段尿時(shí),可以使用導(dǎo)尿術(shù)采集標(biāo)本。(3)標(biāo)本運(yùn)送不及時(shí),應(yīng)冷藏保存。第17頁/共25頁3.胃灌洗液第17頁/共25頁5.無菌采集的體液(腦脊液、胸水、腹水、心包積液、關(guān)節(jié)液、骨髓)(1)臨床醫(yī)生采用抽吸技術(shù)或外科操作無菌收集體液標(biāo)本于無菌容器。結(jié)核桿菌DNA及Xpert標(biāo)本:為防止標(biāo)本凝固,需加入EDTA抗凝處理(可注入于長(zhǎng)紫管中顛倒混勻抗凝處理)。IFN-γ釋放試驗(yàn)(T-SPOT.TB)標(biāo)本:分離淋巴細(xì)胞需加入肝素抗凝,抗凝比例為100ml胸腹水加入0.8ml肝素,顛倒混勻。(2)標(biāo)本盡可能快的運(yùn)送到實(shí)驗(yàn)室(3)應(yīng)提交足夠量的樣本,腦脊液>5ml,胸水和腹水5~10ml。第18頁/共25頁5.無菌采集的體液(腦脊液、胸水、腹水、心包積液、關(guān)節(jié)液、6.無菌采集的組織(淋巴結(jié)、皮膚和其他活檢標(biāo)本)(1)采集標(biāo)本盡可能無菌操作,放置到無固定劑或防腐劑的無菌容器中,不能浸泡在鹽水或其他液體或用紗布包裹,重量不少于1g。應(yīng)迅速運(yùn)送到實(shí)驗(yàn)室,對(duì)于長(zhǎng)時(shí)間的運(yùn)輸,為防止脫水可加入無菌鹽水,保持溫度在4~15℃(2)針對(duì)皮膚潰瘍,宜從病變組織周邊采集活檢標(biāo)本。(3)福爾馬林溶液浸泡過的標(biāo)本不能用于培養(yǎng)檢查。(4)極少量的活檢標(biāo)本可以浸泡在少量無菌鹽溶液中。第19頁/共25頁6.無菌采集的組織(淋巴結(jié)、皮膚和其他活檢標(biāo)本)第19頁/共7.血液(1)如果血液標(biāo)本接種培養(yǎng)基之前需要運(yùn)輸,肝素成檸檬酸鹽可以用于抗凝。EDTA抗凝和凝固的血不能做培養(yǎng)。(2)血液和腦脊液標(biāo)本培養(yǎng)推使且MYCO/FLYTIC瓶(BD)血培養(yǎng)瓶。(暫時(shí)不做)8.大便標(biāo)本大便標(biāo)本涂片的敏感性只有32%~34%,不能根據(jù)涂片的結(jié)果決定是否進(jìn)行培養(yǎng)。第20頁/共25頁7.血液第20頁/共25頁9、病理組織切片(核酸檢測(cè))在一只干凈的離心管中加入6-12片5-10μm厚的FFPE,勿切白片。
病理組織切片已固定,結(jié)核分枝桿菌已無活性,無法做培養(yǎng)。第21頁/共25頁9、病理組織切片(核酸檢測(cè))第21頁/共25頁DNA擴(kuò)增技術(shù)檢測(cè)有哪些不足相比DNA檢測(cè)技術(shù),RNA檢測(cè)更適合判斷病原體轉(zhuǎn)錄活性,DNA檢測(cè)技術(shù)不能判斷病原體轉(zhuǎn)錄活性,不能區(qū)分潛伏感染和活動(dòng)性感染(活動(dòng)性感染:指示RNA轉(zhuǎn)錄活躍,潛伏感染:指示RNA不轉(zhuǎn)錄)交叉污染問題變溫檢測(cè),對(duì)儀器要求高抑制反應(yīng)(Taq酶)第22頁/共25頁DNA擴(kuò)增技術(shù)檢測(cè)有哪些不足相比DNA檢測(cè)技術(shù),RNA檢測(cè)更免疫斑點(diǎn)干擾素釋放試驗(yàn)結(jié)核菌感染的免疫應(yīng)答反應(yīng)主要是細(xì)胞介導(dǎo)免疫反應(yīng);T-SPOT.TB定量檢測(cè)人外周抗凝全血中受結(jié)核桿菌特異混合多肽抗原(ESAT-6和CFP-10)刺激分泌細(xì)胞因子干擾素的效應(yīng)T淋巴細(xì)胞數(shù)量。結(jié)核特異性抗原ESAT-6和CFP-10由結(jié)核桿菌基因組RD1區(qū)相同的操縱子編碼的蛋白;所以的卡介苗菌株均丟失該基因序列絕大多數(shù)環(huán)境分枝桿菌也不存在RD1區(qū)第23頁/共25頁免疫斑點(diǎn)干擾素釋放試驗(yàn)結(jié)核菌感染的免疫應(yīng)答反應(yīng)主要是細(xì)胞介導(dǎo)標(biāo)本采集:肝素或檸檬酸鈉抗凝的外周靜脈血分離單個(gè)核細(xì)胞,每個(gè)檢測(cè)孔含有25萬個(gè)細(xì)胞。每個(gè)檢測(cè)標(biāo)本分4個(gè)孔:空白對(duì)照,陽性對(duì)照,兩個(gè)樣本孔37℃孵育16-20個(gè)小時(shí)洗滌-抗體孵育1h-洗滌-顯色-計(jì)數(shù)藍(lán)色斑點(diǎn)陰性結(jié)果:患者體內(nèi)不存在結(jié)核桿菌特異的效應(yīng)T細(xì)胞;排除結(jié)核感染(包括排除肺外結(jié)核感染)陽性結(jié)果:患者存在結(jié)核感染,但是不能區(qū)別是否為活動(dòng)性結(jié)核病。第24頁/共25頁標(biāo)本采集:肝素或檸檬酸鈉抗凝的外周靜脈血第24頁/共25頁感謝您的觀看。第25頁/共25頁感謝您的觀看。第25頁/共25頁會(huì)計(jì)學(xué)27結(jié)核分枝桿菌的核酸檢測(cè)會(huì)計(jì)學(xué)1結(jié)核分枝桿菌的核酸檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)是檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌特異的核酸序列;陽性結(jié)果提示該檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌核酸的存在,在排除核酸污染的情況下,可確定該檢測(cè)標(biāo)本中存在結(jié)核分枝桿菌。結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)較常采用的目的片段有16SrRNA、IS6110、MBP64、rpoB、hsp65等第1頁/共25頁結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)是檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌特異的核酸序列;第1頁結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)
增加分子生物學(xué)陽性可以作為確診標(biāo)準(zhǔn),及強(qiáng)調(diào)病原學(xué)檢查的重要性。3.4.2分子生物學(xué)檢查結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)陽性。4診斷原則肺結(jié)核的診斷是以病原學(xué)(包括細(xì)菌學(xué)、分子生物學(xué))檢查為主,結(jié)合流行病史、臨床表現(xiàn)、胸部影像、相關(guān)的輔助檢查及鑒別診斷等,進(jìn)行綜合分析做出診斷。以病原學(xué)、病理學(xué)結(jié)果作為確診依據(jù)。5.3確診病例結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)陽性,及胸部影像學(xué)檢查支持即可確診。第2頁/共25頁結(jié)核分枝桿菌核酸檢測(cè)
增加分子生物學(xué)陽性可以作為確診標(biāo)準(zhǔn),及常用技術(shù)傳統(tǒng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)半巢式全自動(dòng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)實(shí)時(shí)熒光核酸恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)交叉引物恒溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)基因探針檢測(cè)第3頁/共25頁常用技術(shù)傳統(tǒng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)第3頁/共25頁抗酸染色每張檢查3-5min或更長(zhǎng)時(shí)間→陽性率低因素之一熒光染色1.陽性率30%2.無法區(qū)分TB
orNTB1.假陽性率高2.結(jié)合抗酸染色第4頁/共25頁抗酸染色每張檢查3-5min或更長(zhǎng)時(shí)間→陽性率低因素之一熒光結(jié)核菌需要先培養(yǎng)出來(2-6周)再加入不同濃度抗菌藥物的培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng)4-8周報(bào)告藥敏結(jié)果第5頁/共25頁結(jié)核菌需要先培養(yǎng)出來(2-6周)第5頁/共25頁2014年WHO關(guān)于結(jié)核診斷的標(biāo)準(zhǔn)肺結(jié)核所有患者,包括兒童,當(dāng)疑似肺結(jié)核并可咳痰時(shí),應(yīng)送2份痰做涂片鏡檢或1份痰做XpertMTB/RIF檢測(cè)對(duì)于涂陰疑似肺結(jié)核患者,應(yīng)當(dāng)使用XpertMTB/RIF或培養(yǎng)進(jìn)行診斷耐藥結(jié)核當(dāng)患者具有耐藥結(jié)核的風(fēng)險(xiǎn),或者合并HIV感染,或者病情嚴(yán)重時(shí),應(yīng)使用XpertMTB/RIF做初始診斷;肺外結(jié)核所有患者,包括兒童,懷疑有肺外結(jié)核時(shí),應(yīng)當(dāng)采集相應(yīng)的樣本進(jìn)行微生物學(xué)和組織學(xué)檢查;優(yōu)先推薦使用XpertMTB/RIF做初始診斷第6頁/共25頁2014年WHO關(guān)于結(jié)核診斷的標(biāo)準(zhǔn)肺結(jié)核第6頁/共25頁GeneXpertXpertMTB/RIF一種半巢式實(shí)時(shí)熒光PCR體外診斷技術(shù),可以檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌以及利福平耐藥性;針對(duì)rpoB基因81bp利福平耐藥核心區(qū)間(RRDR)設(shè)計(jì)引物、探針。5個(gè)探針結(jié)合到野生型,而不是突變體目標(biāo)。每個(gè)探針用不同的熒光染料標(biāo)記,允許同時(shí)檢測(cè)。第7頁/共25頁GeneXpertXpertMTB/RIF第7頁/共25頁痰標(biāo)本與處理液1:2混合吸取2ml處理樣品到反應(yīng)盒將反應(yīng)盒放入檢測(cè)模塊(手工操作完成)標(biāo)本自動(dòng)清洗過濾超聲裂解DNA提純DNA和PCR反應(yīng)試劑混合半巢式實(shí)時(shí)熒光定量核酸擴(kuò)增檢測(cè)打印檢測(cè)報(bào)告獲得檢測(cè)結(jié)果時(shí)間:1小時(shí)50分鐘系統(tǒng)內(nèi)自動(dòng)完成第8頁/共25頁痰標(biāo)本與處理液吸取2ml處理樣品將反應(yīng)盒放入檢測(cè)模塊(手工操INH單耐藥的患者通常不會(huì)考慮立即改變治療方案,與此相反,對(duì)RIF單耐藥的患者,無論INH是否耐藥,都會(huì)采取與耐多藥患者相同的治療方案1。
約90%利福平耐藥的結(jié)核患者同時(shí)異煙肼耐藥,也就是耐多藥結(jié)核患者2。SvenO.Friedrichetal,.SuitabilityofXpertMTB/RIFandGenotypeMTBDRplusforPatientSelectionforaTuberculosisClinicalTrial.JournalofClinicalMicrobiology.2011(49):2827-2831.
XichaoOuetal.AfeasibilitystudyofXpertMTB/RIFtestattheperipherallevellaboratoryinChina.InternationalJournalofInfectiousDiseases.2015(31):41-46.MTB/RIF檢測(cè)對(duì)MDR-TB的防控“結(jié)核+利福平耐藥”對(duì)多耐結(jié)核控制產(chǎn)生的效果最為顯著。即便補(bǔ)充異煙肼耐藥,能提升的效果有限。第9頁/共25頁INH單耐藥的患者通常不會(huì)考慮立即改變治療方案,與此相反,對(duì)環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增儀(TB-LAMP)體外定性檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群;在恒溫條件下進(jìn)行基因擴(kuò)增反應(yīng);4種引物識(shí)別6個(gè)區(qū)域,特異性高;擴(kuò)增反應(yīng)效率高,67℃,40min。主要優(yōu)點(diǎn)在于對(duì)實(shí)驗(yàn)室儀器的依賴程度較小,而且試劑成本較低。第10頁/共25頁環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增儀(TB-LAMP)第10頁/共25頁傳統(tǒng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)目的:定量檢測(cè)人標(biāo)本中的結(jié)核分枝桿菌核酸原理:PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)累計(jì)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的辦法。第11頁/共25頁傳統(tǒng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)目的:定量檢測(cè)人標(biāo)本中的結(jié)核分枝桿XpertMTB/RIFTB-LAMP結(jié)核桿菌DNA目的基因片段rpoBgryB及IS6110IS6110方法半巢式實(shí)時(shí)熒光PCR環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增實(shí)時(shí)熒光定量PCR時(shí)間2小時(shí)1小時(shí)2.5小時(shí)檢測(cè)敏感度131菌條/ml100菌條/ml1000~10000菌條/ml優(yōu)點(diǎn)全自動(dòng)、同時(shí)檢測(cè)利福平耐藥基因、特異性高,生物安全性高67℃恒溫?cái)U(kuò)增,擴(kuò)增時(shí)間短,特異性高,生物安全性高適合大批量篩查,低費(fèi)用缺點(diǎn)最多一次同時(shí)檢測(cè)八個(gè)樣本標(biāo)本用量較少,除痰標(biāo)本以外的標(biāo)本需進(jìn)一步認(rèn)證假陽性,易污染,需專業(yè)人員操作第12頁/共25頁XpertMTB/RIFTB-LAMP結(jié)核桿菌DNA目的樣本類型(一)抗酸桿菌涂片鏡檢:
痰液、支氣管灌洗液、支氣管抽吸物、肺穿刺物、肺活檢標(biāo)本、胃灌洗液、體液、組織、膿腫物、吸出的膿液、創(chuàng)傷標(biāo)本、大便標(biāo)本分枝桿菌分離培養(yǎng):痰液、支氣管灌洗液、支氣管抽吸物、肺穿刺物、肺活檢標(biāo)本、胃灌洗液、體液、組織、膿腫物、吸出的膿液、創(chuàng)傷標(biāo)本、大便標(biāo)本、血液結(jié)核分枝桿菌的核酸檢測(cè):痰液、支氣管灌洗液、支氣管抽吸物、肺穿刺物、肺活檢標(biāo)本、胃灌洗液、體液、組織、膿腫物、吸出的膿液、創(chuàng)傷標(biāo)本、大便標(biāo)本、血液(GeneXpert除外)、病理切片第13頁/共25頁樣本類型(一)抗酸桿菌涂片鏡檢:第13頁/共25頁樣本類型(二)分枝桿菌菌種鑒定
臨床分枝桿菌分離培養(yǎng)物結(jié)核分枝桿菌藥物敏感性試驗(yàn):臨床分離結(jié)核桿菌純培養(yǎng)物結(jié)核抗體的檢測(cè):血清IFN-γ釋放試驗(yàn)(T-SPOT.TB):肝素鋰或肝素鈉抗凝血第14頁/共25頁樣本類型(二)分枝桿菌菌種鑒定第14頁/共25頁標(biāo)本留取標(biāo)準(zhǔn)1.痰標(biāo)本:
(1)可疑肺結(jié)核患者:初診病人應(yīng)收集3份標(biāo)本(當(dāng)日即時(shí)、夜間和次日晨痰),治療中或隨訪病人應(yīng)按期留取2份痰標(biāo)本(晨痰、夜間痰),體積3~5ml,盛于廣口和具有螺旋蓋子的痰瓶中。(2)即時(shí)痰采集后立即送檢,夜間痰和晨痰采集后常溫保存不應(yīng)超過12小時(shí),對(duì)當(dāng)日不能進(jìn)行涂片檢查的標(biāo)本,須置于4℃冰箱保存,注意防止痰液干涸或污染。(3)對(duì)無法咳痰的患者:可使用高滲鹽水(3%NaCl)誘導(dǎo)痰或收集清晨胃液標(biāo)本,或使用支氣管鏡采集支氣管灌洗液標(biāo)本。第15頁/共25頁標(biāo)本留取標(biāo)準(zhǔn)1.痰標(biāo)本:第15頁/共25頁2.支氣管抽吸物、支氣管肺泡灌洗標(biāo)本、肺穿刺物、肺活檢標(biāo)本(1)對(duì)于不能留取痰標(biāo)本的患者:推薦使用侵入性采集技術(shù)獲取標(biāo)本,比如纖維支氣管鏡檢查、細(xì)針肺穿刺、肺活組織檢查。(2)嚴(yán)格器械清潔和消毒,避免引起交叉污染和感染。(3)支氣管鏡不能接觸自來水,通免污染環(huán)境分枝桿菌。
(4)對(duì)難以診斷的病例推薦使用其他侵入性技術(shù)采集標(biāo)本,比如細(xì)針穿刺、開放肺活組織檢查,無菌條件下采集的經(jīng)支氣管活檢和其他活檢標(biāo)本,運(yùn)輸過程中,應(yīng)加入0.5~1ml無菌的生理鹽水。(5)支氣管分泌物至少2~5ml;支氣管肺泡灌洗液至少20-50ml。第16頁/共25頁2.支氣管抽吸物、支氣管肺泡灌洗標(biāo)本、肺穿刺物、肺活檢標(biāo)本第3.胃灌洗液(1)嬰幼兒、兒童和遲鈍者診斷肺結(jié)核時(shí),鑒于無法采集標(biāo)本或支氣管灌洗液,推薦采集胃液標(biāo)本,通過胃灌洗咽下去的痰液。(2)標(biāo)本應(yīng)在采集4小時(shí)內(nèi)送到實(shí)驗(yàn)室,否則應(yīng)置于一次性內(nèi)含100ml碳酸鈉酸他的無菌容器中。(3)胃灌洗液需連續(xù)采集3天,體積5~10ml,調(diào)節(jié)pH至中性。4.尿液(1)采集標(biāo)本前,應(yīng)清洗外生殖器,推薦連續(xù)采集3天清晨中段尿于無菌容器中,用于培養(yǎng)的尿液標(biāo)本至少需要40ml(2)只有在不能獲得中段尿時(shí),可以使用導(dǎo)尿術(shù)采集標(biāo)本。(3)標(biāo)本運(yùn)送不及時(shí),應(yīng)冷藏保存。第17頁/共25頁3.胃灌洗液第17頁/共25頁5.無菌采集的體液(腦脊液、胸水、腹水、心包積液、關(guān)節(jié)液、骨髓)(1)臨床醫(yī)生采用抽吸技術(shù)或外科操作無菌收集體液標(biāo)本于無菌容器。結(jié)核桿菌DNA及Xpert標(biāo)本:為防止標(biāo)本凝固,需加入EDTA抗凝處理(可注入于長(zhǎng)紫管中顛倒混勻抗凝處理)。IFN-γ釋放試驗(yàn)(T-SPOT.TB)標(biāo)本:分離淋巴細(xì)胞需加入肝素抗凝,抗凝比例為100ml胸腹水加入0.8ml肝素,顛倒混勻。(2)標(biāo)本盡可能快的運(yùn)送到實(shí)驗(yàn)室(3)應(yīng)提交足夠量的樣本,腦脊液>5ml,胸水和腹水5~10ml。第18頁/共25頁5.無菌采集的體液(腦脊液、胸水、腹水、心包積液、關(guān)節(jié)液、6.無菌采集的組織(淋巴結(jié)、皮膚和其他活檢標(biāo)本)(1)采集標(biāo)本盡可能無菌操作,放置到無固定劑或防腐劑的無菌容器中,不能浸泡在鹽水或其他液體或用紗布包裹,重量不少于1g。應(yīng)迅速運(yùn)送到實(shí)驗(yàn)室,對(duì)于長(zhǎng)時(shí)間的運(yùn)輸,為防止脫水可加入無菌鹽水,保持溫度在4~15℃(2)針對(duì)皮膚潰瘍,宜從病變組
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