華大醫(yī)學(xué)遺傳性乳腺癌產(chǎn)品介紹

華大華大醫(yī)學(xué)遺傳性乳腺癌基因檢測(cè)產(chǎn)品介紹華大醫(yī)學(xué)腫瘤產(chǎn)品線王海潮 華東腫瘤產(chǎn)品經(jīng)理

腫瘤的防治WHO號(hào)召1/3改善生存質(zhì)量1/3治愈1/3預(yù)防遺傳性腫瘤基因檢測(cè)

預(yù)防篇76.39%前10名癌癥每10萬(wàn)人發(fā)病數(shù)2002-2050中國(guó)癌癥發(fā)生和死亡預(yù)測(cè)（萬(wàn)人）我國(guó)腫瘤發(fā)病和死亡的總體情況-“癌情告急”腫瘤現(xiàn)狀癌癥分為散發(fā)性癌，家族性癌和遺傳性癌。約5-10%的癌癥是遺傳的，也就是說(shuō)特定的基因上發(fā)生的突變會(huì)在家族中遺傳，遺傳到這些突變的個(gè)體發(fā)生腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)會(huì)極大地增加。華大可通過(guò)對(duì)受檢者（腫瘤患者、患者親屬、健康人群）樣本進(jìn)行高通量測(cè)序，分析常見(jiàn)的17種遺傳性腫瘤相關(guān)的49個(gè)基因的突變情況，從而預(yù)測(cè)患癌風(fēng)險(xiǎn)，輔助醫(yī)生制定相應(yīng)風(fēng)險(xiǎn)管理方案?；驒z測(cè)意義遺傳性腫瘤基因檢測(cè)臨床意義基因檢測(cè)篩查高危（突變基因攜帶）人群1.預(yù)測(cè)患癌風(fēng)險(xiǎn)2.早期干預(yù)、治療3.節(jié)省治療時(shí)間、費(fèi)用癌癥患者基因檢測(cè)查找致病原因1.提供針對(duì)性治療方案（如乳腺癌靶向BRCA藥物）2.預(yù)測(cè)患其他癌癥的風(fēng)險(xiǎn)Textinhere1.在50歲之前確診的乳腺癌或卵巢癌患者及親屬2.男性乳腺癌患者及親屬3.雙側(cè)乳癌患者及親屬4.同時(shí)患有乳腺癌和卵巢癌的患者及親屬5.三陰癌患者及親戚適用人群1.確診為HNPCC或FAP的患者及親屬2.親屬為APC或MMR突變基因的攜帶者3.50歲之前確診為結(jié)直腸癌的患者及親屬4.有結(jié)腸息肉或有結(jié)直腸癌家族史的患者及親屬腫瘤患者腫瘤患者親屬及健康人群遺傳性結(jié)直腸癌14個(gè)基因遺傳性腫瘤panel女性套餐/男性套餐遺傳性乳腺癌2個(gè)基因/21個(gè)基因適用人群適用人群BRCA1，BRCA2，CHEK2，PALB2，BRIP1，TP53，PTEN，STK11，CDH1，ATM，BARD1，MLH1，MRE11A，MSH2，MSH6，MUTYH，NBN，PMS1，PMS2,RAD50，RAD51CAPC,AXIN2,EPCAM,MLH1,MLH3,MSH2,MSH6,MUTYH,PMS1,PMS2,STK11,PTEN,SMAD4,BMPR1A17種腫瘤相關(guān)的49個(gè)易感基因進(jìn)行檢測(cè)遺傳性腫瘤基因檢測(cè)產(chǎn)品-主要產(chǎn)品7BRCA1/2

基因BRCA1BRCA2BRCA1——定位于17q21，約100kb，含有24個(gè)外顯子，其中第1、4號(hào)外顯子不編碼氨基酸，另外22個(gè)轉(zhuǎn)錄出7.6kbmRNA，最終可編碼含1863個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)。而第11號(hào)外顯子較大，長(zhǎng)3.4kb。

已報(bào)道其突變位點(diǎn)多于1785個(gè)BRCA2——定位在13q12-13，有27個(gè)外顯子,僅編碼區(qū)就有11.4K。其中11號(hào)外顯子幾乎含編碼序列的一半，完整的BRCA2編碼3418個(gè)氨基酸的蛋白質(zhì)。已報(bào)道其突變位點(diǎn)多于2011個(gè)參考數(shù)據(jù)庫(kù)：遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測(cè)遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測(cè)BRCA1/2基因突變存在于：

5%～10%的乳腺癌10%～20%的卵巢癌40%～45%的遺傳性乳腺癌患者80%的乳腺癌和卵巢癌高發(fā)家族患者圖：BRCA突變基因攜帶者的患病風(fēng)險(xiǎn)癌癥類(lèi)型普通人患病風(fēng)險(xiǎn)

基因突變后患病風(fēng)險(xiǎn)BRCA1BRCA2乳腺癌12%50%-80%40%-70%繼發(fā)性乳腺癌3.5%~11%（5年）27%（5年）12%（5年）

40%-50%（20年）卵巢癌1%-2%24%-40%11%-18%男性乳腺癌0.1%1%-2%5%-10%前列腺癌15%(北歐人）

18%(美國(guó)黑人)<30%<39%胰腺癌0.50%1%-3%2%-7%Datafrom：NEnglJMed.1997;336:1401-1408；NatGenet,2006.38(8):p.873-5.

表：BRCA1/2基因突變攜帶者相關(guān)腫瘤患病風(fēng)險(xiǎn)Genetic/FamilialHigh-RiskAssessment:BreastandOvarianVersion1.2014NCCN.org遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測(cè)

2基因檢測(cè)BRCA1BRCA2

21基因檢測(cè)BRCA1,BRCA2,CHEK2,PALB2,BRIP1,TP53,PTEN,STK11,CDH1,ATM,BARD1,MLH1,MRE11,MSH2,MSH6,MUTYH,NBN,PMS1,PMS2,RAD50,RAD51C在50歲之前確診的乳腺癌或卵巢癌患者及親屬男性乳腺癌患者及親屬；雙側(cè)乳癌患者及親屬同時(shí)患有乳腺癌和卵巢癌的患者及親屬三陰癌患者及親屬適用人群遺傳性乳腺癌/卵巢癌基因檢測(cè)11真實(shí)案例PrY.-J.BIGNONbilBC(55)OC(57)BC(53)BC(34)

OC（36）BC(30)BC(55)OC(65)BC(28)Ovariectomy?家族基因檢測(cè)結(jié)果Sanger驗(yàn)證患者control乳腺癌預(yù)防措施

產(chǎn)前診斷

PGD乳腺切除卵巢切除

口服避孕藥他莫西芬化學(xué)預(yù)防手術(shù)預(yù)防生殖細(xì)胞保存>90%96%60%53%18歲開(kāi)始，每月進(jìn)行乳腺自檢；25歲開(kāi)始，每年或每半年進(jìn)行一次臨床乳腺檢查；25a-29歲，推薦每年進(jìn)行乳腺磁共振成像(MRI)檢測(cè)，如無(wú)條件進(jìn)行MRI檢測(cè)，則每年進(jìn)行一次乳腺X線檢查；30-75歲，每年進(jìn)行一次乳腺X線檢查或乳腺磁共振成像(MRI)；75歲之后，根據(jù)受檢者個(gè)人情況進(jìn)行監(jiān)測(cè)管理。華大技術(shù)特點(diǎn)13項(xiàng)目開(kāi)展流程高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析報(bào)告解讀親屬驗(yàn)證發(fā)送報(bào)告文庫(kù)制備質(zhì)控QC檢測(cè)富集度質(zhì)控下機(jī)數(shù)據(jù)質(zhì)控DNA質(zhì)量質(zhì)控解讀規(guī)范化流程雙人復(fù)核醫(yī)院就診樣本采集DNA提取先證者DNA目標(biāo)區(qū)域捕獲Sanger，QPCR陽(yáng)性驗(yàn)證*遺傳咨詢與生活指導(dǎo)專(zhuān)業(yè)團(tuán)隊(duì)*Sanger、QPCR陽(yáng)性驗(yàn)證：是針對(duì)NGS結(jié)果為陽(yáng)性的樣本進(jìn)行驗(yàn)證，其中QPCR僅針對(duì)CNV結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。數(shù)據(jù)庫(kù)及解讀工具頻率參考數(shù)據(jù)庫(kù)：dbSNP，1000G，Localdatabase突變數(shù)據(jù)庫(kù)：基因蛋白信息數(shù)據(jù)庫(kù)：NCBI，Uniprot檢索引擎：命名：網(wǎng)站：報(bào)告內(nèi)容樣本信息檢測(cè)信息檢測(cè)結(jié)果結(jié)果說(shuō)明陽(yáng)性結(jié)果陰性結(jié)果未明結(jié)果建議附錄遺傳性乳腺癌卵巢癌BRCA1、BRCA2基因檢測(cè)報(bào)告(報(bào)告咨詢團(tuán)隊(duì)：）變異類(lèi)型Class5:致病突變（Pathogenic）Class4:疑似致病突變（LikelyPathogenic）Class3:臨床意義未明突變（VariantsofUnknownClinicalSignificance）Class2:疑似良性突變（likelyNon－Pathogenic）Class1:良性多態(tài)性（Benign）分類(lèi)規(guī)則：遺傳性腫瘤突變臨床意義分類(lèi)規(guī)則.xlsx關(guān)于華大醫(yī)學(xué)華大基因，擁有世界最大基因組測(cè)繪設(shè)備和能力的機(jī)構(gòu)新一代測(cè)序平臺(tái)服務(wù)產(chǎn)品涵蓋動(dòng)植物、微生物、海洋等多個(gè)領(lǐng)域BGISEQ1000BGISEQ100IlluminaHiSeqTM2000AppliedBiosystemsSOLiDTM4SystemRocheGSFLXPlatformIonTorrent3730測(cè)序平臺(tái)采用最新的光路系統(tǒng)設(shè)計(jì)，結(jié)合更優(yōu)化的試劑組合和全自動(dòng)化操作流程，在提高產(chǎn)率、提高數(shù)據(jù)質(zhì)量的同時(shí)最大限度的降低試劑的消耗。ABI3730xl基因分型平臺(tái)在分析人類(lèi)疾病相關(guān)位點(diǎn)與結(jié)構(gòu)變異以及動(dòng)植物農(nóng)藝性狀相關(guān)位點(diǎn)上有廣泛應(yīng)用。IlluminaiScanSequenomMassARRAYiPLEXGold全基因組酶切圖譜平臺(tái)快速定位序列位置，已廣泛應(yīng)用于比較基因組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)突變基因、輔助高通量測(cè)序的數(shù)據(jù)組裝以及菌株分型。OpGenArgusOpticalMappingSystem蛋白質(zhì)譜平臺(tái)實(shí)現(xiàn)對(duì)動(dòng)植物、微生物等進(jìn)行大規(guī)模的蛋白質(zhì)組學(xué)研究。應(yīng)用領(lǐng)域涉及營(yíng)養(yǎng)學(xué)、藥學(xué)、臨床研究、法醫(yī)毒理學(xué)、食品安全分析、環(huán)境監(jiān)測(cè)等等。信息