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主要內(nèi)容1微生物遺傳2微生物變異3微生物基因重組4菌種衰退、復(fù)壯和保藏

第4章微生物遺傳與變異第1頁(yè)第1頁(yè)引言(相關(guān)概念)遺傳(heredity或inheritance)指生物上一代將自己一整套遺傳因子傳遞給下一代行為或功效,含有極其穩(wěn)定特性。遺傳型(genotype):又稱(chēng)基因型,指某一生物個(gè)體所含有所有遺傳因子,即基因總和。遺傳型是一個(gè)內(nèi)在也許性或潛力,其實(shí)質(zhì)是遺傳物質(zhì)上所負(fù)載特定遺傳信息。表型(phenotype)含有一定遺傳型個(gè)體,在特定外界環(huán)境中,通過(guò)生長(zhǎng)和發(fā)育所表現(xiàn)出來(lái)種種形態(tài)和生理特性總和,即為其表型;即是遺傳型在適當(dāng)環(huán)境下詳細(xì)表現(xiàn)。遺傳型+環(huán)境條件表型代謝發(fā)育第2頁(yè)第2頁(yè)變異(variation):指生物體在某種外因或內(nèi)因作用下所引起遺傳物質(zhì)結(jié)構(gòu)或數(shù)量改變,亦即遺傳型改變。變異特點(diǎn)是在群體中以極低幾率出現(xiàn),性狀改變幅度極大,改變后性狀是穩(wěn)定、可遺傳。飾變(modification)指不包括遺傳物質(zhì)改變,而只發(fā)生在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)譯水平上表型改變,即一樣遺傳型生物,在不同外界條件下,會(huì)展現(xiàn)不同表型,這種表型上差異,只能稱(chēng)為適應(yīng)或飾變。其特點(diǎn)是整個(gè)群體中幾乎每一個(gè)體都發(fā)生一樣改變,性狀改變幅度較小,遺傳物質(zhì)不變。不是真正變異,是不遺傳。引發(fā)飾變?cè)蛳Ш?,表型即可恢?fù)。比如:粘質(zhì)沙雷氏菌:在25℃下培養(yǎng),產(chǎn)生深紅色靈桿菌素;在37℃下培養(yǎng),不產(chǎn)生色素;假如重新將溫度降到25℃,又恢復(fù)產(chǎn)色素能力。第3頁(yè)第3頁(yè)微生物是遺傳學(xué)研究中明星微生物細(xì)胞結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)樸,營(yíng)養(yǎng)體普通為單倍體,以便建立純系。諸多常見(jiàn)微生物都易于人工培養(yǎng),快速、大量生長(zhǎng)繁殖。對(duì)環(huán)境原因作用敏感,易于取得各類(lèi)突變株,操作性強(qiáng)。第4頁(yè)第4頁(yè)第一節(jié)微生物遺傳

一、遺傳變異物質(zhì)基礎(chǔ)1883-1889年間,Weissmann提出種質(zhì)連續(xù)理論,認(rèn)為遺傳物質(zhì)是一個(gè)含有特定分子結(jié)構(gòu)化合物;20世紀(jì)初,發(fā)覺(jué)了染色體并提出了基因?qū)W說(shuō),使得遺傳物質(zhì)基礎(chǔ)范圍縮小到染色體上;1944年后,由于連續(xù)利用微生物這一有利試驗(yàn)對(duì)象進(jìn)行了三個(gè)著名試驗(yàn),才以確鑿事實(shí)證實(shí)核酸,尤其是DNA才是遺傳變異真正物質(zhì)基礎(chǔ)。典型轉(zhuǎn)化試驗(yàn)、噬菌體感染試驗(yàn)、植物病毒重組試驗(yàn)三個(gè)典型試驗(yàn)與遺傳物質(zhì)第5頁(yè)第5頁(yè)1、轉(zhuǎn)化試驗(yàn):肺炎鏈球菌(Streptococcuspneumoniae)以肺炎鏈球菌作為研究對(duì)象,肺炎鏈球菌能夠使人患肺炎,也能夠使小白鼠患敗血病而死亡;有莢膜者是致病性,它菌落表面光滑(smooth),稱(chēng)為S型;有不形成莢膜,無(wú)致病性,菌落外觀粗糙(rough),故稱(chēng)R型。Griffith典型轉(zhuǎn)化試驗(yàn)(1928)RII型活菌SIII型活菌SIII型熱死菌RII型活菌SIII型活菌混合培養(yǎng)健康健康健康健康健康健康健康病死病死病死第6頁(yè)第6頁(yè)Griffith(格里菲斯)轉(zhuǎn)化試驗(yàn)結(jié)果(有毒)死細(xì)菌中某種物質(zhì)轉(zhuǎn)移到(無(wú)毒)活細(xì)菌中,并使之含有毒性,造成小家鼠死亡;他將這種細(xì)菌遺傳類(lèi)型轉(zhuǎn)變稱(chēng)為轉(zhuǎn)化,并將引起轉(zhuǎn)化物質(zhì)稱(chēng)為轉(zhuǎn)化因子(tranformingprinciple);當(dāng)初化學(xué)與生化分析技術(shù)還無(wú)法鑒定殺死細(xì)菌中成份,因而不知轉(zhuǎn)化因子為何物。第7頁(yè)第7頁(yè)離體轉(zhuǎn)化試驗(yàn)1944年,O.T.Avery、C.M.Macleod和M.McCarty從熱死S型肺炎鏈球菌中提純了也許作為轉(zhuǎn)化因子各種成份,并在離體條件下進(jìn)行了轉(zhuǎn)化試驗(yàn)。Avery等體外培養(yǎng)試驗(yàn)(1944)分離后S型細(xì)胞物質(zhì)對(duì)R型細(xì)胞轉(zhuǎn)化第8頁(yè)第8頁(yè)離體轉(zhuǎn)化試驗(yàn)結(jié)果起源于加熱殺死SIII細(xì)菌,并使RII細(xì)菌轉(zhuǎn)化成為SIII型細(xì)菌轉(zhuǎn)化因子是DNA。Avery等人試驗(yàn)事實(shí)上表明:決定細(xì)菌遺傳類(lèi)型物質(zhì)是DNA,即證實(shí)了DNA就是遺傳物質(zhì)。第9頁(yè)第9頁(yè)2、噬菌體感染試驗(yàn)1952年,A.D.Hershey和M.Chase發(fā)表了證實(shí)噬菌體遺傳物質(zhì)基礎(chǔ)著名試驗(yàn)-噬菌體感染試驗(yàn)。首先,他們將E.coli培養(yǎng)在以放射性32P3O4或35S2O4作為磷源或硫源合成培養(yǎng)基中。結(jié)果,能夠取得含32P-DNA(噬菌體關(guān)鍵)噬菌體或含35S-蛋白質(zhì)(噬菌體外殼)兩種試驗(yàn)用噬菌體。第10頁(yè)第10頁(yè)蛋白質(zhì)外殼在噬菌體感染過(guò)程中,其蛋白質(zhì)外殼未進(jìn)入宿主細(xì)胞。第11頁(yè)第11頁(yè)DNA關(guān)鍵進(jìn)入宿主細(xì)胞DNA經(jīng)增殖、裝配后,能產(chǎn)生一大群既有DNA關(guān)鍵又有蛋白質(zhì)外殼完整噬菌體顆粒。證實(shí):在其DNA中,含有包括合成蛋白質(zhì)外殼在內(nèi)整套遺傳信息。通過(guò)電子顯微鏡觀測(cè)也證實(shí)了這個(gè)論點(diǎn)。從而證實(shí)了遺傳物質(zhì)基礎(chǔ)是DNA。第12頁(yè)第12頁(yè)3、植物病毒重組試驗(yàn)H.Fraenkel-Conrat(1956)用含RNA煙草花葉病毒(TMV)進(jìn)行了著名植物病毒重建試驗(yàn)。把TMV和HRV(霍氏車(chē)前花葉病毒)蛋白質(zhì)外殼與RNA相分離。用TMVRNA與HRV蛋白質(zhì)外殼,HRVRNA與TMV蛋白質(zhì)外殼重建后雜合病毒去感染煙草。第13頁(yè)第13頁(yè)植物病毒重組核酸(這里為RNA)是病毒遺傳物質(zhì)。至此,我們可確信無(wú)疑地得出結(jié)論,只有核酸才是貯存遺傳信息真正物質(zhì)。試驗(yàn)結(jié)果第14頁(yè)第14頁(yè)三個(gè)典型試驗(yàn)結(jié)果細(xì)胞生物遺傳物質(zhì)是雙鏈DNA;病毒遺傳物質(zhì)能夠是單鏈或雙鏈DNA或RNA,即:ssDNA,dsDNA,ssRNA或dsRNA。第15頁(yè)第15頁(yè)朊病毒發(fā)覺(jué)和思考無(wú)論是DNA還是RNA作為遺傳物質(zhì)基礎(chǔ)已是無(wú)可辨駁事實(shí)。但朊病毒發(fā)覺(jué)對(duì)“蛋白質(zhì)不是遺傳物質(zhì)”定論也帶來(lái)一些疑云。PrP是含有傳染性蛋白質(zhì)致病因子,迄今未發(fā)覺(jué)蛋白內(nèi)有核酸,但已知傳染性疾病傳播必須有核酸構(gòu)成遺傳物質(zhì),才干感染宿主并在宿主體內(nèi)自然繁殖。那么這是生命界又一特例呢?還是由于當(dāng)前人們結(jié)識(shí)和技術(shù)所限而尚未揭示生命之謎呢?尚有待于生命科學(xué)家去結(jié)識(shí)和摸索。第16頁(yè)第16頁(yè)(一)遺傳物質(zhì)DNA分子結(jié)構(gòu)及其多樣性第17頁(yè)第17頁(yè)第18頁(yè)第18頁(yè)1DNA復(fù)制4dNTP第19頁(yè)第19頁(yè)2轉(zhuǎn)錄3轉(zhuǎn)譯(翻譯)原核生物只有一個(gè)RNA多聚酶;轉(zhuǎn)錄后不需加工,直接作為mRNA;mRNA只能存活幾分鐘、幾小時(shí);轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)譯可同時(shí)進(jìn)行,是偶聯(lián);第20頁(yè)第20頁(yè)第21頁(yè)第21頁(yè)微生物基因表示調(diào)控調(diào)整基因也有轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)譯作用,以其模板生成蛋白質(zhì)稱(chēng)為阻遏蛋白或變構(gòu)蛋白。阻遏蛋白作用是能與操縱基因結(jié)合,制止了RNA聚合酶向結(jié)構(gòu)基因滑動(dòng),即使結(jié)構(gòu)基因失去了合成mRNA能力。先有調(diào)整基因決定阻遏蛋白,與操縱基因結(jié)合從而制止了基因表示。

基因控制系統(tǒng)操縱子調(diào)整基因啟動(dòng)基因操縱基因結(jié)構(gòu)基因第22頁(yè)第22頁(yè)

阻遏蛋白也能與培養(yǎng)基中底物(由結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)譯酶催化分解底物)相結(jié)合,當(dāng)阻遏蛋白與底物結(jié)合后,阻遏蛋白從操縱基因分離,從而開(kāi)放了RNA聚合酶通向結(jié)構(gòu)基因通道,便能轉(zhuǎn)錄成mRNA,并轉(zhuǎn)譯成蛋白質(zhì)(酶)。第23頁(yè)第23頁(yè)2.1遺傳物質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)存在部位和方式-七個(gè)水平細(xì)胞水平:存在于細(xì)胞核或核質(zhì)體,單核或多核細(xì)胞核水平:原與真核生物細(xì)胞核結(jié)構(gòu)不同,核外DNA;染色體水平:倍性(真核)和染色體數(shù);核酸水平:在原核中同染色體水平、存在部分二倍體DNA或RNA,復(fù)合或裸露,雙鏈或單鏈;基因水平:具自主復(fù)制能力遺傳功效單位,長(zhǎng)度與信息量,轉(zhuǎn)錄——翻譯;密碼子水平:信息單位,起始和終止;核苷酸水平:突變或互換單位,四種堿基。(二)遺傳物質(zhì)在微生物中存在第24頁(yè)第24頁(yè)2.2微生物遺傳物質(zhì)存在形式存在主要形式—染色體染色體外遺傳物質(zhì)真核微生物中細(xì)胞器DNA:葉綠體、線粒體、中心粒、毛基體等原核微生物和真核微生物酵母菌:質(zhì)粒插入序列、轉(zhuǎn)座子、Mu病毒等RNA作為遺傳物質(zhì)朊病毒遺傳物質(zhì)第25頁(yè)第25頁(yè)染色體指攜帶細(xì)胞功效所必備基因遺傳單元。病毒是非細(xì)胞生物,它們?nèi)走z傳基因稱(chēng)為基因組,但不足以形成染色體。原核生物染色體常為一個(gè)環(huán)狀DNA分子。真核生物細(xì)胞有幾條至幾十條染色體,各含一個(gè)線狀DNA分子。第26頁(yè)第26頁(yè)真核生物染色體結(jié)構(gòu)細(xì)菌染色體DNA大小和結(jié)構(gòu)第27頁(yè)第27頁(yè)原核生物質(zhì)粒游離于原核生物染色體外,含有獨(dú)立復(fù)制能力小型共價(jià)閉合環(huán)狀DNA分子,即cccDNA(circularcovalentlyclosedDNA),稱(chēng)為質(zhì)粒。質(zhì)粒含有超螺旋狀結(jié)構(gòu),攜帶著一些染色體所沒(méi)有基因,賦予原核生物一些對(duì)其生存必不可少特殊功效。第28頁(yè)第28頁(yè)質(zhì)粒特性自我復(fù)制能力,為復(fù)制子,單拷貝或多拷貝編碼產(chǎn)物賦予細(xì)菌一些性狀特性可自行丟失與消除(含質(zhì)粒細(xì)胞在正常培養(yǎng)基上遇化學(xué)、物理原因處理時(shí),質(zhì)粒復(fù)制受到克制而核染色體復(fù)制繼續(xù)進(jìn)行,子代細(xì)胞中質(zhì)粒消除)有轉(zhuǎn)移性(能夠通過(guò)轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)或接合作用而由一個(gè)細(xì)菌細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)菌細(xì)胞中,使兩個(gè)細(xì)胞都成為帶有質(zhì)粒細(xì)胞;質(zhì)粒轉(zhuǎn)移時(shí),它能夠單獨(dú)轉(zhuǎn)移,也能夠攜帶著染色體(片段)一起進(jìn)行轉(zhuǎn)移,因此它可成為基因工程載體)能夠在細(xì)胞質(zhì)中獨(dú)立于染色體之外獨(dú)立存在(游離態(tài)),也能夠通過(guò)互換摻入染色體上,以附加體(episome)形式存在)對(duì)于細(xì)菌生存并不是必要功效多樣化功效:進(jìn)行細(xì)胞間接合,并帶有一些基因,如產(chǎn)生毒素、抗藥性、固氮、產(chǎn)生酶類(lèi)、降解功效等。第29頁(yè)第29頁(yè)質(zhì)粒主要類(lèi)型致育因子Fertilityfactor,F(xiàn)因子(制育因子,性因子,約2%核染色體,94.5kb,編碼基因約1/3與接合相關(guān))抗性因子Resistancefactor,R因子(抗藥性因子,其基因編碼物質(zhì)對(duì)抗生素有抗性)Ti因子誘癌質(zhì)粒,可同植物細(xì)胞中核染色體整合,破壞控制細(xì)胞分裂激素調(diào)整系統(tǒng),從而使其變成癌細(xì)胞。Col因子大腸桿菌素因子,即使大腸桿菌分泌大腸桿菌素巨大質(zhì)粒分子量200~300×106Da,比普通質(zhì)粒大幾十到幾百倍,上面有固氮基因。降解性質(zhì)粒能夠編碼許多降解性酶類(lèi),使細(xì)菌降解特殊物質(zhì)。只在假單胞菌屬中發(fā)覺(jué)。它們降解性質(zhì)??蔀橐幌盗心芙到鈴?fù)雜物質(zhì)酶編碼,從而能利用普通細(xì)菌所難以分解物質(zhì)做碳源。第30頁(yè)第30頁(yè)產(chǎn)細(xì)菌素質(zhì)粒Bacteriocinproductionplasmid毒性質(zhì)粒Virulenceplasmid代謝質(zhì)粒Metabolicplasmid(降解質(zhì)粒)隱秘質(zhì)粒Crypticplasmid第31頁(yè)第31頁(yè)第二節(jié)微生物變異

2.1基因突變和突變率基因突變(genemutatiaon)簡(jiǎn)稱(chēng)突變,是變異一個(gè),指生物體內(nèi)遺傳物質(zhì)分子結(jié)構(gòu)忽然發(fā)生可遺傳改變,突變幾率普通在10-6~10-9范圍內(nèi)。突變率(mutationrate):每一細(xì)胞在每一世代發(fā)生某一性狀突變幾率,稱(chēng)為突變率,它能夠用每一單位群體在每一世代中產(chǎn)生突變株數(shù)目來(lái)表示。第32頁(yè)第32頁(yè)變異基因突變基因重組誘變自發(fā)突變點(diǎn)突變?nèi)旧w畸變堿基置換移碼突變轉(zhuǎn)換顛換缺失添加缺失添加易位倒位第33頁(yè)第33頁(yè)2.2突變類(lèi)型凡能用選擇性培養(yǎng)基快速選擇出來(lái)突變型,稱(chēng)為選擇性突變株(selectivemutant),如營(yíng)養(yǎng)缺點(diǎn)型、抗性突變型和條件致死型等;反之則稱(chēng)為非選擇性突變株(non-selectivemutant),如形態(tài)突變型、抗原突變型和產(chǎn)量突變型等。選擇性突變非選擇性突變(死活突變)營(yíng)養(yǎng)缺點(diǎn)型抗性突變型條件致死突變型形態(tài)突變型抗原突變型產(chǎn)量突變型(非死活突變)第34頁(yè)第34頁(yè)2.3突變特點(diǎn)不相應(yīng)性:突變性狀與原因之間無(wú)直接相應(yīng)關(guān)系。自發(fā)性:突變能夠在沒(méi)有些人為誘變?cè)蛱幚硐伦园l(fā)地產(chǎn)生。稀有性:突變率低且穩(wěn)定。獨(dú)立性:各種突變獨(dú)立發(fā)生,不會(huì)互相影響。可誘發(fā)性:誘變劑可提升突變率。穩(wěn)定性:變異性狀穩(wěn)定可遺傳。可逆性:從原始野生型基因到變異株突變稱(chēng)為正向突變(forwardmutation),從突變株回到野生型過(guò)程則稱(chēng)為回復(fù)突變或回變(backmutation或reversemutation)。第35頁(yè)第35頁(yè)兩種見(jiàn)解一個(gè)觀點(diǎn)認(rèn)為,是通過(guò)適應(yīng)而發(fā)生,即各種抗性是由其環(huán)境(指其中所含抵抗對(duì)象)誘發(fā)出來(lái),突變?cè)蚝屯蛔冃誀铋g是相相應(yīng),并認(rèn)為這就是“定向變異”,也有些人稱(chēng)它為“馴化”或“馴養(yǎng)”。另一個(gè)見(jiàn)解則認(rèn)為,基因突變是自發(fā),且與環(huán)境是不相正確。由于其中有自發(fā)突變、誘發(fā)突變、誘變劑與選擇條件等各種原因錯(cuò)綜在一起,因此難以探究問(wèn)題實(shí)質(zhì)。第36頁(yè)第36頁(yè)基因突變自發(fā)性和不相應(yīng)性1943年,S.E.Luria和M.Delbruck依據(jù)統(tǒng)計(jì)學(xué)原理,設(shè)計(jì)了變量試驗(yàn)(fluctuationtest),又稱(chēng)波動(dòng)試驗(yàn)或彷徨試驗(yàn);1949年,Newcombe設(shè)計(jì)了涂布試驗(yàn)(Newcombeexperiment);1952年,J.Lederberg夫婦發(fā)表了著名《平板影印培養(yǎng)法和細(xì)菌突變株間接選擇》論文,它更加好證實(shí)了微生物抗藥性是在未接觸藥物前自發(fā)產(chǎn)生。第37頁(yè)第37頁(yè)Luria等變量試驗(yàn)敏感于噬菌體T1T1第38頁(yè)第38頁(yè)試驗(yàn)要點(diǎn)是:取敏感于噬菌體T1大腸桿菌對(duì)數(shù)期肉湯培養(yǎng)物,用新鮮培養(yǎng)液稀釋成濃度為103個(gè)/m1細(xì)菌懸液,然后在甲、乙兩試管內(nèi)各裝10m1。接著把甲管中菌液先分裝在50支小試管中(每管裝0.2m1),保溫24—36小時(shí)后,即把各支小管菌液分別倒在50個(gè)預(yù)先涂有T1平板上,經(jīng)培養(yǎng)后分別計(jì)算各皿上所產(chǎn)生抗噬菌體菌落數(shù);乙管中10ml菌液不經(jīng)分裝先整管保溫24—36小時(shí),然后才分成50份加到同樣涂有Tl平板上,經(jīng)適當(dāng)培養(yǎng)后,同樣分別計(jì)算各皿上產(chǎn)生抗性菌落數(shù)。結(jié)果發(fā)覺(jué),來(lái)自甲管50皿中,各皿間抗性菌落數(shù)相差極大,而來(lái)自乙管則各皿數(shù)目基本相同。這就闡明大腸桿菌抗噬菌體性狀突變,不是由所抗環(huán)境原因——噬菌體誘導(dǎo)出來(lái),而是在它接觸到噬菌體前,在某一次細(xì)胞分裂過(guò)程中隨機(jī)地自發(fā)產(chǎn)生。這一自發(fā)突變發(fā)生得越早,則抗性菌落出現(xiàn)得越多,反之則越少。噬菌體這里僅起著淘汰原始未突變敏感菌作用。利用這一辦法,還可計(jì)算出突變率。第39頁(yè)第39頁(yè)涂布試驗(yàn)第40頁(yè)第40頁(yè)平板影印培養(yǎng)法第41頁(yè)第41頁(yè)3基因突變機(jī)制3.1自發(fā)突變機(jī)制(1)背景輻射、環(huán)境原因(2)微生物本身有害物質(zhì)(3)互變異構(gòu)效應(yīng)(4)環(huán)出效應(yīng)第42頁(yè)第42頁(yè)3.2誘發(fā)突變機(jī)制誘發(fā)突變基因突變第43頁(yè)第43頁(yè)一對(duì)堿基被另外一對(duì)堿基置換。轉(zhuǎn)換(transition):即DNA鏈中一個(gè)嘌呤被嘌呤或嘧啶被嘧啶所置換。顛換(transversion):即一個(gè)嘌呤被嘧啶或嘧啶被嘌呤所置換。堿基置換第44頁(yè)第44頁(yè)堿基轉(zhuǎn)換分子機(jī)制——以亞硝酸為例

HNO2胞嘧啶(C)尿嘧啶(U)HNO2腺嘌呤(A)次黃嘌呤(H)HNO2鳥(niǎo)嘌呤(G)黃嘌呤(X)這些反應(yīng)及形成物均可在DNA復(fù)制中產(chǎn)生影響,主要是使堿基對(duì)發(fā)生轉(zhuǎn)換。第45頁(yè)第45頁(yè)第46頁(yè)第46頁(yè)腺嘌呤(A)變成次黃嘌呤(H)后引起轉(zhuǎn)換過(guò)程:①腺嘌呤氧化脫氨后形成烯醇式次黃嘌呤(He)②He通過(guò)互變異構(gòu)效應(yīng)形成酮式次黃嘌呤(HK)③DNA復(fù)制時(shí),HK與胞嘧啶(C)配對(duì)④DNA第二次復(fù)制時(shí),C與G正常配對(duì),實(shí)現(xiàn)了轉(zhuǎn)換。第47頁(yè)第47頁(yè)亞硝酸引起AT-GC轉(zhuǎn)換細(xì)節(jié)第48頁(yè)第48頁(yè)移碼突變誘變劑使DNA分子中一個(gè)或少數(shù)幾種核苷酸增長(zhǎng)或缺失,從而使后面所有遺傳密碼發(fā)生轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)譯錯(cuò)誤。由移碼突變所產(chǎn)生突變株,稱(chēng)為移碼突變株(frame-shiftmutant)。與染色體畸變相比,移碼突變也只能算是DNA分子微小損傷。丫啶類(lèi)染料,包括原黃素、丫啶黃、丫啶橙和α-氨基丫啶等,以及一系列稱(chēng)為ICR類(lèi)化合物,都是移碼突變有效誘變劑。第49頁(yè)第49頁(yè)丫啶類(lèi)化合物誘發(fā)移碼突變及其回復(fù)突變圖示:第50頁(yè)第50頁(yè)第51頁(yè)第51頁(yè)染色體畸變(chromosomalaberration)一些理化因子,如X射線等輻射及烷化劑、亞硝酸等,除了能引起點(diǎn)突變外,還會(huì)引起DNA大損傷(macrolesion)——染色體畸變,它包括:染色體結(jié)構(gòu)上改變:缺失(deletion)重復(fù)(duplication)易位(translocation)倒位(inversion)染色體數(shù)目的改變第52頁(yè)第52頁(yè)分為染色體內(nèi)畸變和染色體間畸變兩類(lèi)。染色體內(nèi)畸變:只涉及一條染色體上改變,如發(fā)生染色體部分缺失或重復(fù)時(shí),其結(jié)果可造成基因減少或增長(zhǎng);如發(fā)生倒位或易位時(shí),則可造成基因排列順序改變,但數(shù)目卻不改變。倒位--------是指斷裂下來(lái)一段染色體旋轉(zhuǎn)180后,重新插入到本來(lái)染色體原位置上,從而使其基因順序與其它基因順序相反;易位--------是指斷裂下來(lái)一小段染色體再順向或逆向地插入到同一條染色體其它部位上。染色體間畸變:指非同源染色體間易位。第53頁(yè)第53頁(yè)第54頁(yè)第54頁(yè)轉(zhuǎn)座因子(transposibleelement),跳躍基因(jumpinggene)在染色體組中或染色體組間能改變本身位置一段DNA順序。染色體畸變幾種形式插入序列(insertionsequence):分子量小,0.7~1.4kb,只能引起轉(zhuǎn)座效應(yīng)而不含其它任何基因。轉(zhuǎn)座子(Tn,transposon):分子量為2~25kb,含有幾種到十幾種基因。能插到受體DNA分子許多位點(diǎn)上。Mu噬菌體(mutatorphage):是E.Coli一個(gè)溫和噬菌體,分子量大,約37kb,含20多個(gè)基因,能夠引起插入突變。第55頁(yè)第55頁(yè)誘變劑共性原則很各種化學(xué)物質(zhì),能以各種機(jī)制造成DNA突變;化學(xué)藥劑對(duì)細(xì)菌誘變率與其對(duì)動(dòng)物致癌性成正比;超出95%致癌物質(zhì)對(duì)微生物有誘變作用;90%以上非致癌物質(zhì)對(duì)微生物沒(méi)有誘變作用。誘變劑(mutagen):凡能提升突變率任何理化因子,就稱(chēng)為誘變劑。種類(lèi):誘變劑種類(lèi)諸多,作用方式多樣。即使是同一個(gè)誘變劑,也常有幾種作用方式。第56頁(yè)第56頁(yè)若干誘變劑作用機(jī)制及誘變功效

有些人認(rèn)為,由于它們是一個(gè)平面型三環(huán)分子,結(jié)構(gòu)與一個(gè)嘌呤–嘧啶對(duì)十分相同,故能嵌入兩個(gè)相鄰DNA堿基對(duì)之間,造成雙螺旋部分解開(kāi)(兩個(gè)堿基對(duì)本來(lái)相距0.34nm,當(dāng)嵌入一個(gè)丫啶分子時(shí),就變成0.68nm),從而在DNA復(fù)制過(guò)程中,會(huì)使鏈上增添或缺失一個(gè)堿基,結(jié)果就引起了移碼突變。

誘變?cè)? 在DNA上初級(jí)效應(yīng) 遺傳效應(yīng)堿基類(lèi)似物 摻入作用 AT=GC雙向轉(zhuǎn)換羥胺 與胞嘧啶起反應(yīng) GC→AT轉(zhuǎn)換亞硝酸 A、G、C氧化脫氨作用 AT=GC雙向轉(zhuǎn)換交聯(lián) 缺失 烷化劑 烷化堿基(主要是G) AT=GC雙向轉(zhuǎn)換 烷化磷酸基團(tuán) AT→TA顛換 喪失烷化嘌呤 GC→CG顛換 糖-磷酸骨架斷裂 巨大損傷(缺失、重復(fù)、倒位、易位) 丫啶類(lèi)堿基之間互相作用(雙鏈變形) 碼組移動(dòng)(+或-) 紫外線 形成嘧啶水合物 GC→AT轉(zhuǎn)換 形成嘧啶二聚體 碼組移動(dòng)(+或-) 交聯(lián) 電離輻射 堿基羥基化核降解 AT=GC雙向轉(zhuǎn)換DNA降解 碼組移動(dòng)(+或-) 糖-磷酸骨架斷裂 巨大損傷(缺失、重復(fù)、倒位、易位) 喪失嘌呤

加熱 C脫氨基 CG→TA轉(zhuǎn)換Mu噬菌體 結(jié)合到一個(gè)基因中間 碼組移動(dòng) 第57頁(yè)第57頁(yè)Ames試驗(yàn)美國(guó)加利福尼亞大學(xué)BruceAmes專(zhuān)家于1966年創(chuàng)造;檢測(cè)鼠傷寒沙門(mén)氏菌(Salmonellatyphmurium)組氨酸營(yíng)養(yǎng)缺點(diǎn)型菌株(his-)回復(fù)突變率;回復(fù)突變(reversemutation或backmutation):突變體失去野生型性狀,能夠通過(guò)第二次突變得到恢復(fù),這種第二次突變稱(chēng)為回復(fù)突變。第58頁(yè)第58頁(yè)Ames試驗(yàn)操作第59頁(yè)第59頁(yè)艾姆氏試驗(yàn)基本辦法缺點(diǎn)型菌株?duì)I養(yǎng)缺乏型平板37℃2~3天.. ......:.¨.:..:..;.;...¨.:.:.¨.:..:..;.;...¨.:.. .....待測(cè)試劑正?;貜?fù)突變誘變劑誘變艾姆氏試驗(yàn)已成為測(cè)試化學(xué)物質(zhì)誘變作用原則辦法,其原理是檢查待測(cè)試劑能否使?fàn)I養(yǎng)缺點(diǎn)型菌株回復(fù)突變?cè)鲩L(zhǎng)。

第60頁(yè)第60頁(yè)應(yīng)用實(shí)例國(guó)外曾開(kāi)發(fā)了一個(gè)減少婦女妊娠反應(yīng)藥物“反應(yīng)?!保捎谄渌幮黠@,在60-70年代十分流行;但隨后人們就發(fā)覺(jué)畸形兒出生率明顯增高,并且生產(chǎn)畸形兒婦女大多曾服用“反應(yīng)停”,以后采用Ames試驗(yàn)發(fā)覺(jué)這種物質(zhì)確實(shí)含有很強(qiáng)致突變作用,因此這種藥物被嚴(yán)禁使用;第61頁(yè)第61頁(yè)Ames試驗(yàn)補(bǔ)充由于生物體內(nèi)、體外也許存在差別,可在體外加入哺乳動(dòng)物(如大鼠)微粒體酶系統(tǒng),使待測(cè)物活化,使Ames試驗(yàn)準(zhǔn)確率達(dá)80-90%。第62頁(yè)第62頁(yè)4DNA損傷修復(fù)4.1紫外線對(duì)DNA損傷及修復(fù)在光照下光解酶轉(zhuǎn)變紫外線誘導(dǎo)胸腺嘧啶二聚體返回單聚體。光照第63頁(yè)第63頁(yè)第64頁(yè)第64頁(yè)第65頁(yè)第65頁(yè)4.2切補(bǔ)修復(fù)〔暗修復(fù)〕

為把它與光復(fù)活作用區(qū)分開(kāi),切補(bǔ)修復(fù)常稱(chēng)為暗修復(fù)。它作為許多不同類(lèi)型DNA損傷修復(fù)普遍系統(tǒng),如嘧啶二聚體和錯(cuò)誤堿基配對(duì)引發(fā)DNA損傷。B、C和基因產(chǎn)物結(jié)合形成一個(gè)核酸內(nèi)切酶,它能識(shí)別堿基改變所引發(fā)DNA螺旋扭曲。uvrABC內(nèi)切核酸酶在損傷任何一邊作一切口,聚合酶I切除和替換損傷部位堿基,DNA連接酶將缺口填補(bǔ)上。

第66頁(yè)第66頁(yè)1、由核酸內(nèi)切酶切開(kāi)二聚體5’末端,形成3’-OH和5’-P單鏈缺口2、核酸外切酶從5’-P到3’-OH方向切除二聚體,并擴(kuò)大缺口。3、DNA聚合酶以另一條互補(bǔ)鏈為模板,從原有鏈上暴露3’-OH端起合成缺失片段。4、連接酶將新合成3’-OH與原有5’-P相連接。第67頁(yè)第67頁(yè)4.3重組修復(fù)(復(fù)制后修復(fù))

胸腺嘧啶二聚體不能被復(fù)制,不是在此位點(diǎn)阻塞,而是DNA聚合酶能跳過(guò)該損傷部位,沿著下面DNA模板,恢復(fù)DNA繼續(xù)合成。在新合成DNA子鏈上二聚體對(duì)面留下一個(gè)缺口。由于需要一個(gè)完整鏈作為模板,不能用切補(bǔ)修復(fù)來(lái)恢復(fù)。而這個(gè)缺口能由RecA蛋白調(diào)控通過(guò)與母鏈DNA螺旋發(fā)生重組來(lái)填補(bǔ)。母鏈DNA在二聚體對(duì)面應(yīng)當(dāng)含有完整序列。盡管重組并不能修復(fù)損傷,它確創(chuàng)造了兩個(gè)新DNA分子,通過(guò)切補(bǔ)修復(fù)完畢了修復(fù)功效。

第68頁(yè)第68頁(yè)細(xì)胞在不切除二聚體情況下,以帶有二聚體這條鏈為模板合成互補(bǔ)單鏈,但在每個(gè)二聚體附近留有一空隙。通過(guò)染色體互換,空隙部位就不在面對(duì)著胸腺嘧啶二聚體,而是面對(duì)著正常單鏈,在這種條件下,DNA聚合酶和連接酶起作用將空隙部位進(jìn)行修復(fù),重組修復(fù)中DNA損傷并沒(méi)有清除,但伴隨微生物傳代繁殖,損傷百分比逐步減少。第69頁(yè)第69頁(yè)4.4SOS修復(fù)系統(tǒng)

細(xì)胞中有許多基因和操縱子受RecA蛋白協(xié)同調(diào)控和LexA蛋白阻遏轉(zhuǎn)錄。它涉及處理DNA損傷和稱(chēng)為SOS修復(fù)系統(tǒng)。為一個(gè)傾向差錯(cuò)修復(fù)系統(tǒng),該系統(tǒng)與DNA聚合酶互相作用,使之通過(guò)嘧啶二聚體繼續(xù)復(fù)制DNA。3’——5’校正讀碼能力酶被克制,結(jié)果堿基能隨機(jī)插入二聚體對(duì)面,沒(méi)有準(zhǔn)確堿基對(duì)(參見(jiàn)C2),這個(gè)機(jī)制是紫外線因此致突變主要原因,由于大多數(shù)其它系統(tǒng)是準(zhǔn)確修復(fù)DNA。

SOS—修復(fù)系統(tǒng)是由RecA蛋白誘導(dǎo),由于存在DNA損傷,RecA蛋白構(gòu)型改變顯示出激活態(tài)。激活態(tài)熱RecA蛋白引起LexA蛋白被蛋白水解酶切開(kāi),結(jié)果LexA蛋白不再作為一個(gè)轉(zhuǎn)錄阻遏物。只要細(xì)胞中存在DNA損傷,SOS修復(fù)系統(tǒng)基因就能表示。一旦DNA損傷被消除,RecA蛋白不再有活性,不再作為L(zhǎng)exA蛋白水解誘導(dǎo)物,IexA蛋白在細(xì)胞中累積,并且克制SOS—修復(fù)基因轉(zhuǎn)錄。第70頁(yè)第70頁(yè)第71頁(yè)第71頁(yè)第三節(jié)微生物基因重組

3.1原核微生物基因重組主要有:轉(zhuǎn)化(transformation)是指細(xì)胞從周?chē)橘|(zhì)中攝取來(lái)自不同基因型細(xì)胞DNA,使受體基因型或表型發(fā)生對(duì)應(yīng)改變過(guò)程。轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)是由噬菌體介導(dǎo)將DNA片段從供體菌轉(zhuǎn)移到受體菌過(guò)程。接合(conjugation)在供體細(xì)胞和受體細(xì)胞直接接觸后,質(zhì)粒從供體細(xì)胞向受體細(xì)胞轉(zhuǎn)移過(guò)程。原生質(zhì)融合等幾個(gè)方式第72頁(yè)第72頁(yè)3.1.1轉(zhuǎn)化(transformation)轉(zhuǎn)化現(xiàn)象是在1928年由Griffith進(jìn)行肺炎雙球菌研究中發(fā)覺(jué)。受體菌直接接受供體菌DNA片段而取得部分新遺傳性狀現(xiàn)象,就稱(chēng)為轉(zhuǎn)化或轉(zhuǎn)化作用。第73頁(yè)第73頁(yè)枯草芽孢桿菌自然轉(zhuǎn)化模型:

a)細(xì)菌生長(zhǎng)在一定培養(yǎng)條件下生長(zhǎng)到一定階段,以枯草芽孢桿菌為例是在葡萄糖基本培養(yǎng)基中培養(yǎng)到對(duì)數(shù)生長(zhǎng)末期到穩(wěn)定期,細(xì)胞向胞外分泌一個(gè)小分子蛋白質(zhì),稱(chēng)為感受態(tài)因子,其分子量為5000到10000道爾頓。

b)當(dāng)培養(yǎng)液中感受態(tài)因子積累到一定濃度后,與細(xì)胞表面受體互相作用,通過(guò)一系列信號(hào)傳遞系統(tǒng)誘導(dǎo)一些感受態(tài)一特異蛋白質(zhì)(competencespecificprotein)表示,其中一個(gè)是自溶素(autolysin),它表示使細(xì)胞表面DNA結(jié)合蛋白及核酸酶裸露出來(lái),使其含有與DNA結(jié)合活性。

c)DNA以雙鏈形式在細(xì)胞表面幾種位點(diǎn)上結(jié)合并遭到核酸酶切割,核酸內(nèi)切酶首先切斷DNA雙鏈中一條鏈,被切斷鏈遭到核酸酶降解,成為寡核苷酸釋放到培養(yǎng)基中,另一條鏈與感受態(tài)一特異蛋白質(zhì)結(jié)合,并被引導(dǎo)進(jìn)入細(xì)胞,

d)進(jìn)入細(xì)胞外源DNA通過(guò)同源重組以置換方式整合進(jìn)受體染色體DNA,經(jīng)復(fù)制和細(xì)胞分裂后形成重組體。第74頁(yè)第74頁(yè)3.1.2轉(zhuǎn)染(transfection)假如把噬菌體或其它病毒DNA(或RNA)抽提出來(lái),讓它去感染感受態(tài)宿主細(xì)胞,并進(jìn)而產(chǎn)生正常噬菌體或病毒后代,這種現(xiàn)象稱(chēng)為轉(zhuǎn)染(transfection)。它與轉(zhuǎn)化不同之處是病毒或噬菌體并非遺傳基因供體菌,中間也不發(fā)生任何遺傳因子互換或整合,最終也不產(chǎn)生含有雜種性質(zhì)轉(zhuǎn)化子。第75頁(yè)第75頁(yè)3.1.3轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)轉(zhuǎn)導(dǎo)現(xiàn)象是由J.Lederberg等1952年研究鼠傷寒沙門(mén)氏菌時(shí)發(fā)覺(jué)。通過(guò)完全缺點(diǎn)或部分缺點(diǎn)噬菌體媒介,把供體細(xì)胞DNA小片段攜帶到受體細(xì)胞中,通過(guò)互換與整合,從而使后者取得前者部分遺傳性狀現(xiàn)象,稱(chēng)為轉(zhuǎn)導(dǎo)。第76頁(yè)第76頁(yè)轉(zhuǎn)導(dǎo)類(lèi)型依據(jù)轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體起源和性質(zhì)不同,能夠區(qū)分為兩種類(lèi)型轉(zhuǎn)導(dǎo)作用。普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)因?yàn)橥耆秉c(diǎn)型噬菌體攜帶了供體菌染色體片段,當(dāng)它去感染受體菌時(shí),使后者取得這部分遺傳性狀現(xiàn)象稱(chēng)為普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)完全普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)(穩(wěn)定轉(zhuǎn)導(dǎo)子),簡(jiǎn)稱(chēng)完全轉(zhuǎn)導(dǎo);流產(chǎn)轉(zhuǎn)導(dǎo)(不穩(wěn)定轉(zhuǎn)導(dǎo)子);特點(diǎn):供體任何基因都有可能進(jìn)入受體細(xì)胞局限轉(zhuǎn)導(dǎo)是指經(jīng)過(guò)部分缺點(diǎn)溫和噬菌體把供體菌少數(shù)特定基因攜帶到受體菌中并取得表示轉(zhuǎn)導(dǎo)現(xiàn)象低頻轉(zhuǎn)導(dǎo)高頻轉(zhuǎn)導(dǎo)特點(diǎn):只傳遞供體菌少數(shù)特定基因第77頁(yè)第77頁(yè)3.1.4溶源轉(zhuǎn)變?nèi)茉崔D(zhuǎn)變(lysogenicconversion):是一個(gè)與轉(zhuǎn)導(dǎo)相同,但本質(zhì)上卻不相同特殊現(xiàn)象,即當(dāng)溫和噬菌體感染其宿主后,發(fā)生溶源化,因噬菌體基因整合到宿主核基因組上,而使后者取得除免疫性以外新性狀現(xiàn)象,稱(chēng)為溶源轉(zhuǎn)變。當(dāng)宿主喪失這一噬菌體時(shí),經(jīng)過(guò)溶源轉(zhuǎn)變而取得性狀也同時(shí)消失。溶源轉(zhuǎn)變與轉(zhuǎn)導(dǎo)有本質(zhì)上不同,首先是它溫和噬菌體不攜帶任何供體菌基因;其次,這種噬菌體是完整,而不是缺點(diǎn)。第78頁(yè)第78頁(yè)3.1.5接合(conjugation)供體菌(“雄”)經(jīng)過(guò)其性菌毛與受體菌(“雌”)相接觸,前者經(jīng)過(guò)傳遞不同長(zhǎng)度單鏈DNA給后者,并在后者細(xì)胞中進(jìn)行雙鏈化或深入與核染色體發(fā)生互換、整合,從而使后者取得供體菌遺傳性狀現(xiàn)象,稱(chēng)為接合。第79頁(yè)第79頁(yè)3.1.6原生質(zhì)體融合(protoplastfusion)經(jīng)過(guò)人為方法,使遺傳性狀不同兩細(xì)胞原生質(zhì)體發(fā)生融合,并進(jìn)而發(fā)生遺傳重組以產(chǎn)生同時(shí)帶有雙親性狀、遺傳穩(wěn)定融合子(fusant)過(guò)程,稱(chēng)為原生質(zhì)體融合。第80頁(yè)第80頁(yè)3.2真核微生物基因重組在真核微生物中,基因重組主要有:有性雜交準(zhǔn)性雜交原生質(zhì)體融合轉(zhuǎn)化等形式第81頁(yè)第81頁(yè)3.2.1有性雜交普通指性細(xì)胞間接合和隨之發(fā)生染色體重組,并產(chǎn)生新遺傳型后代一個(gè)育種技術(shù);第82頁(yè)第82頁(yè)3.2.2準(zhǔn)性雜交(parasexualhybridization)準(zhǔn)性生殖是一個(gè)類(lèi)似有性生殖,但比有性生殖更為原始一個(gè)生殖方式,它能夠使同種生物兩個(gè)不同菌株體細(xì)胞發(fā)生融合,且不以減數(shù)分裂方式而造成低頻率基因重組并產(chǎn)生重組子。準(zhǔn)性生殖常見(jiàn)于一些真菌,尤其是半知菌。第83頁(yè)第83頁(yè)3.3微生物遺傳變異知識(shí)應(yīng)用誘變育種原生質(zhì)體融合育種基因工程微生物菌種衰退、復(fù)壯和保藏第84頁(yè)第84頁(yè)3.3.1誘變育種普通辦法1.出發(fā)菌株誘變處理:出發(fā)菌株選擇,誘變劑選擇,選擇最適誘變劑量2.突變體篩選:初篩、復(fù)篩。第85頁(yè)第85頁(yè)誘變育種基本規(guī)律第86頁(yè)第86頁(yè)誘變育種基本過(guò)程選擇選擇適當(dāng)出發(fā)菌株↓制備待處理菌懸液↓誘變處理↓篩選↓保藏和擴(kuò)大試驗(yàn)第87頁(yè)第87頁(yè)出發(fā)菌株選擇出發(fā)菌株——用來(lái)育種處理起始菌株。出發(fā)菌株應(yīng)具備:①對(duì)誘變劑敏感性高;②含有特定生產(chǎn)性狀能力或潛力;出發(fā)菌株起源:①自然界直接分離到野生型菌株;②歷經(jīng)生產(chǎn)考驗(yàn)菌株;③已經(jīng)歷多次育種處理菌株。第88頁(yè)第88頁(yè)3.3.2原生質(zhì)體融合育種融合環(huán)節(jié):選擇親本、原生質(zhì)體制備、原生質(zhì)體融合、原生質(zhì)體再生、融合子檢出與鑒定。第89頁(yè)第89頁(yè)3.3.3基因工程(geneengineering)基因工程是指在基因水平上遺傳過(guò)程,它是用人為辦法將所需要某一供體生物遺傳物質(zhì)-DNA大分子提取出來(lái),在離體條件下用適當(dāng)工具酶進(jìn)行切割后,把它與作為載體(vactor)DNA分子連接起來(lái),然后與載體一起導(dǎo)入某一更易生長(zhǎng)、繁殖受體菌中,讓外源遺傳物質(zhì)在其中進(jìn)行正常復(fù)制和表示,從而取得新物種一個(gè)育種技術(shù)。第90頁(yè)第90頁(yè)基因工程基本操作目的基因取得:從適當(dāng)供體細(xì)胞DNA中直接分離;通過(guò)反轉(zhuǎn)錄酶作用由mRNA合成cDNA;由化學(xué)辦法合成特定功效基因;載體選擇:目的基因與載體DNA體外重組:重組載體引入受體細(xì)胞。第91頁(yè)第91頁(yè)4菌種衰退、復(fù)壯和保藏

4.1菌種衰退(degeneration)菌種衰退和復(fù)壯遺傳性變異是絕正確,穩(wěn)定是相正確,退化變異是大量,而進(jìn)化性變異卻是個(gè)別,假如不進(jìn)行自覺(jué)、認(rèn)真人工選擇,大量自發(fā)突變株就會(huì)造成菌種衰退。衰退:菌種在培養(yǎng)或保藏過(guò)程中,由于自發(fā)突變存在,出現(xiàn)一些原有優(yōu)良生產(chǎn)性狀劣化、遺傳標(biāo)識(shí)丟失等現(xiàn)象。第92頁(yè)第92頁(yè)常見(jiàn)衰退現(xiàn)象菌落和細(xì)胞形態(tài)改變;生長(zhǎng)速度緩慢,產(chǎn)孢子越來(lái)越少;抵抗力、抗不良環(huán)境能力削弱等;代謝產(chǎn)物生產(chǎn)能力下降;其對(duì)宿主寄生能力下降等。第93頁(yè)第93頁(yè)衰退預(yù)防控制傳代次數(shù);創(chuàng)造良好培養(yǎng)條件;利用不同類(lèi)型細(xì)胞進(jìn)行接種傳代;采取有效菌種保藏方法。第94頁(yè)第94頁(yè)4.2復(fù)壯(rejuvenation)狹義復(fù)壯僅是一個(gè)消極辦法,指是在菌種已發(fā)生衰退情況下,通過(guò)

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