核酸化學(xué)的教案_第1頁
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文檔簡介

核酸化學(xué)的教案第1頁/共182頁核蛋白磷酸核苷堿基戊糖蛋白質(zhì)

核酸是由幾十個(gè)甚至幾千萬個(gè)核苷酸聚合而成的具有一定空間結(jié)構(gòu)的大分子化合物。核酸→核苷酸第2頁/共182頁一、核酸的概念和重要性

(一)核酸的概念

核酸英文名nucleicacid(NA)

1868年瑞士F.Miescher(米歇爾)發(fā)現(xiàn)了核酸。第3頁/共182頁(二)核酸的重要性

第4頁/共182頁二、核酸的類別、分布和組成

(一)類別

nucleicacidribonucleicacid,RNAdeoxyribonucleicacid,DNA第5頁/共182頁(二)分布

第6頁/共182頁(三)組成

1.堿基(base):又稱含氮堿(1)嘧啶堿(pyrimidine,Py)第7頁/共182頁第8頁/共182頁(2)嘌呤堿(purine,Pu)其它嘌呤(核酸的代謝產(chǎn)物):黃嘌呤、次黃嘌呤、尿酸等第9頁/共182頁(3)修飾堿基(modifiedbase):也稱稀有堿基(minorbase)第10頁/共182頁(4)堿基的性質(zhì)①一般的物理性質(zhì)②互變異構(gòu)現(xiàn)象uracil酮式uracil烯醇式第11頁/共182頁③堿基的紫外吸收最大吸收峰在260nm附近第12頁/共182頁④堿基的解離第13頁/共182頁第14頁/共182頁2.戊糖(pentose)(1)結(jié)構(gòu)β-D-核糖β-D-2-脫氧核糖β-D-2-O-甲基核糖第15頁/共182頁(2)性質(zhì)①氧化反應(yīng)第16頁/共182頁②堿水解2′-核苷酸3′-核苷酸混合物第17頁/共182頁③顏色反應(yīng)D-核糖+濃HCl+綠色(苔黑酚法)FeCl3D-2-脫氧核糖+藍(lán)色(二苯胺法)H+第18頁/共182頁3.磷酸(phosphoricacid)第19頁/共182頁三、核苷、核苷酸

(一)核苷(nucleoside)

1.核苷的結(jié)構(gòu)核苷:含N苷,β-苷第20頁/共182頁核苷中戊糖與堿基的連接方式:

腺嘌呤核苷(adenosine)胞嘧啶脫氧核苷(deoxycytidne)第21頁/共182頁第22頁/共182頁核苷核糖核苷(核苷):A、G、C、U脫氧核糖核苷(脫氧核苷):dA、dG、dC、dT命名,簡寫符號天然核苷:一般為反式構(gòu)象第23頁/共182頁2.修飾核苷(modifiednucleoside):也稱稀有核苷(minornucleoside)修飾核苷包括三種情況:(1)由修飾堿基和糖組成的核苷(2)由非修飾堿基和2-O-甲基核糖組成的核苷(3)由堿基與糖連接方式特殊的核苷第24頁/共182頁(1)(2)第25頁/共182頁(3)(ψ)第26頁/共182頁

還有一些核苷,它們的堿基不是嘌呤環(huán),但可把它們看作是鳥苷的衍生物,如Y核苷、Q核苷。第27頁/共182頁修飾核苷的簡寫符號

少數(shù)修飾核苷用單字符號如D、ψ、I;但大多數(shù)修飾核苷是將堿基取代基、取代位置和取代數(shù)目寫在核苷單字符號的左邊,用小寫英文字母代表取代基。第28頁/共182頁取代基用下列小寫英文字母表示:甲基m乙?;鵤c氨基n甲硫基ms羥基o或h硫基s異戊烯基i羧基c第29頁/共182頁例:第30頁/共182頁注意:例:2’-O-甲基腺苷Am

含修飾核糖的核苷即2’-O-甲基核苷的表示方法,在核苷符號的右下方注上一個(gè)小寫m。第31頁/共182頁3.核苷的性質(zhì)(1)物理性質(zhì)(2)互變異構(gòu)現(xiàn)象(3)紫外吸收:OD260↑(4)兩性解離AdeACytCGuaGpKa4.13.634.44.13.31.6第32頁/共182頁(二)核苷酸(nucleotide,Nt)1.核苷酸的結(jié)構(gòu)(1)(核糖)核苷酸(ribonucleotide):

第33頁/共182頁2’,3’,5’一核糖核苷酸(2′-AMP)(3′-AMP)(5′-AMP)第34頁/共182頁第35頁/共182頁3’,5’一脫氧核糖核苷酸Deoxyadenosine3’-monphosphate(3’-dAMP)Deoxyadenosine5’-monphosphate(5’-dAMP)(2)脫氧(核糖)核苷酸(deoxyribonucleotide):第36頁/共182頁第37頁/共182頁2.核苷酸的性質(zhì)(1)一般物理性質(zhì)(2)互變異構(gòu)現(xiàn)象(3)紫外吸收第38頁/共182頁第39頁/共182頁4種單核苷酸吸收光譜的標(biāo)準(zhǔn)比值250/260280/260290/2602.07.02.07.02.07.05’-CMP0.460.842.100.991.550.305’-AMP0.850.800.220.150.030.0035’-UMP0.740.730.380.400.030.035’-GMP1.221.150.680.680.400.28光密度比值pH核苷酸

第40頁/共182頁A260:樣品在260nm處的吸收值E260:所測核苷酸的摩爾消光系數(shù)C:核苷酸樣品的濃度(mg/ml)核苷酸(mg)=×Mr×N×V第41頁/共182頁胞嘧啶核苷酸的解離(4)核苷酸的兩性解離和等電點(diǎn)第42頁/共182頁4種核苷酸的解離曲線第43頁/共182頁可在pH2.0~5.0之間分離各種核苷酸pH3.5時(shí)各核苷酸所帶電荷核苷酸磷酸基電荷堿基的電荷凈電荷AMP-1+0.54-0.46GMP-1+0.05-0.95CMP-1+0.84-0.16UMP-1+0-1第44頁/共182頁(三)核苷酸的重要衍生物1.ATP類的高能磷酸化合物AMPADPATP第45頁/共182頁第46頁/共182頁2.環(huán)狀核苷酸第47頁/共182頁細(xì)胞內(nèi):ATPcAMP+PPi磷酸二酯酶5′-AMP腺苷酸環(huán)化酶(AC)

第48頁/共182頁3.核苷多磷酸類第49頁/共182頁四、DNA的結(jié)構(gòu)

(一)DNA的一級結(jié)構(gòu)

1.DNA分子中核苷酸的連接方式第50頁/共182頁RNA第51頁/共182頁簡寫方法:線條式、文字式第52頁/共182頁2.DNA分子中核苷酸的排列順序英國Sanger1975年加減法,1977年末端終止法美國Maxam和Gilbert1977年化學(xué)斷裂法第53頁/共182頁(1)酶法(雙脫氧法、末端終止法)第54頁/共182頁第55頁/共182頁(2)化學(xué)法(化學(xué)斷裂法)

利用多核苷酸激酶將32P標(biāo)記在DNA的5’末端,用特異的化學(xué)試劑修飾DNA分子中的不同堿基,然后用特異的試劑在特異的地方斷裂,產(chǎn)生長短不同的DNA片段,再進(jìn)行電泳,放射自顯影,即可讀出DNA序列。第56頁/共182頁(二)DNA的二級結(jié)構(gòu)

1.提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的根據(jù)(1)x-光衍射分析20世紀(jì)40年代Astbury1952年M.Wilkins第57頁/共182頁第58頁/共182頁(2)DNA堿基組成的定量分析20世紀(jì)40年代chargaff規(guī)則①DNA堿基組成有種的特異性,但沒有組織、器官特異性。②A=T;G=C;A+G=T+C第59頁/共182頁2.DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型(double-helicalstructure)1953年Watson和Crick提出了DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)。第60頁/共182頁(3)堿基、糖、磷酸的位置。DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)要點(diǎn):(1)兩條反向平行的多核苷酸鏈,右手雙螺旋。(4)雙螺旋的直徑,螺距。(2)大溝(深溝)小溝(淺溝)第61頁/共182頁(5)堿基配對(6)堿基的序列第62頁/共182頁穩(wěn)定DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵(1)互補(bǔ)堿基對之間的氫鍵(2)堿基堆積力(base-stackingforces)(3)磷酸基上的負(fù)電荷與介質(zhì)中的陽離子之間形成的離子鍵第63頁/共182頁3.DNA雙螺旋的種類WatsonCrickDNA雙螺旋結(jié)構(gòu)(B型DNA)

當(dāng)DNA鈉鹽纖維相對濕度和鹽的種類改變時(shí),DNA的構(gòu)象發(fā)生改變。不同DNA纖維的空間結(jié)構(gòu)類型結(jié)晶狀態(tài)ANa鹽,相對濕度75%時(shí)結(jié)晶BNa鹽,相對濕度92%時(shí)結(jié)晶C鋰鹽,相對濕度66%時(shí)結(jié)晶第64頁/共182頁A-DNA:與B-DNA相同處:與B-DNA不同點(diǎn):(1)螺體寬而短,直徑2.55nm;11個(gè)核苷酸一圈,螺距2.46nm。(2)堿基的傾角大一些:傾角19o。A-DNA:RNA分子中的雙螺旋區(qū);DNA-RNA雜交分子。

A-DNA和B-DNA之間可以相互轉(zhuǎn)換,推測在轉(zhuǎn)錄時(shí),DNA分子發(fā)生B→A的轉(zhuǎn)變。

反向的兩條多核苷酸鏈,右手螺旋。第65頁/共182頁C型DNA的一些數(shù)據(jù)與B型DNA很相似。C-DNA:第66頁/共182頁4.DNA雙螺旋的研究進(jìn)展(1)Z-DNA1979年美國A·Rich等人發(fā)現(xiàn)了左旋DNA(左手DNA雙螺旋結(jié)構(gòu))晶體X-光衍射分析d(CpGpCpGpCp-Gp)第67頁/共182頁Z-DNA的特點(diǎn)第68頁/共182頁第69頁/共182頁Z-DNA的生物功能:與基因表達(dá)、基因調(diào)控有關(guān)。第70頁/共182頁(2)三螺旋DNA第71頁/共182頁(3)四螺旋DNA第72頁/共182頁DNA雙鏈線狀雙鏈環(huán)狀單鏈線狀:動物病毒MVM單鏈環(huán)狀:噬菌體φX174真核細(xì)胞染色體DNA噬菌體T2,T5,T7,λ,P22

E-Coli染色體DNA線粒體DNA葉綠體DNA多瘤病毒DNA,病毒SV40DNA噬菌體λ和φX174的復(fù)制型第73頁/共182頁(三)DNA的三級結(jié)構(gòu)

噬菌體T2DNA長約50μmE-coliDNA長約1mm人生殖細(xì)胞DNA長約1m第74頁/共182頁雙鏈環(huán)狀DNA(doublestrandedcyclicDNA,DSCDNA):

雙鏈環(huán)狀DNA在自然界是廣泛存在的,如一些病毒DNA、一些噬菌體DNA、細(xì)菌質(zhì)粒DNA、線粒體和葉綠體DNA等。第75頁/共182頁1.共價(jià)閉合環(huán)狀DNA(covalentlyclosedcircularDNA,cccDNA)的超螺旋結(jié)構(gòu)(superhelicalstructure)形成超螺旋的基礎(chǔ):DNA雙螺旋的扭曲形成超螺旋(superhelix)第76頁/共182頁負(fù)超螺旋正超螺旋第77頁/共182頁超螺旋DNA的性質(zhì)結(jié)構(gòu)緊密,粘度較低,浮力密度大,沉降速度快。變性第78頁/共182頁2.開環(huán)DNA(opencircularDNA,ocDNA)也稱松環(huán)DNA(relaxedcircularDNA,rcDNA)第79頁/共182頁+第80頁/共182頁3.連環(huán)DNA(CatenanesDNA)單體二聚體第81頁/共182頁第82頁/共182頁(四)真核細(xì)胞染色體DNA結(jié)構(gòu)

1.重復(fù)序列(repeatedsequence)(1)高度重復(fù)序列(highlyrepeatedsequence)衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)基因組(genome)第83頁/共182頁主體DNA(bulkDNA)衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)第84頁/共182頁第85頁/共182頁(2)中度重復(fù)序列(moderatelyrepeatedsequence)(3)單一序列(uniquesequence)第86頁/共182頁2.回文結(jié)構(gòu)(palindromicstructure)

(1)回文結(jié)構(gòu)

回文結(jié)構(gòu)也稱反向重復(fù)(invertedrepeats)第87頁/共182頁(2)發(fā)夾形和十字形第88頁/共182頁五、RNA的結(jié)構(gòu)(一)RNA的類別

1.核糖體RNA(ribosomalRNA,rRNA)2.轉(zhuǎn)移RNA(transferRNA,tRNA)3.信使RNA(messengerRNA,mRNA)第89頁/共182頁4.其它類別的RNA(1)病毒RNA(ViralRNA,rRNA)(2)核內(nèi)RNA(nuclearRNA,nRNA)①不均一核RNA(heterogeneousnuclearRNA,HnRNA)②小分子核RNA(smallnuclearRNA,snRNA)③小分子核仁RNA(smallnucleolarRNA,snoRNA)④染色體RNA(chromosomalRNA,chRNA)(3)線粒體RNA(mitochondrialRNA,mitRNA)(4)葉綠體RNA(chloroplastRNA,chlRNA或ctRNA)第90頁/共182頁(二)RNA的一級結(jié)構(gòu)

1.RNA分子中核苷酸之間的連接方式3′,5′-磷酸二酯鍵第91頁/共182頁2.RNA分子中核苷酸的排列順序酵母tRNAAla小片段重疊法直接閱讀法(直讀法)

1965年第92頁/共182頁3.幾類RNA的一級結(jié)構(gòu)(1)tRNA的一級結(jié)構(gòu)tRNA一級結(jié)構(gòu)的共同點(diǎn):①M(fèi)r較?。∕r25000),沉降常數(shù)4S。②各種tRNA的鏈長很接近,一般在73~93個(gè)核苷酸之間。③tRNA分子中約20多個(gè)位置上的核苷酸是保守的(不變和半不變的)④各種tRNA的3′一端為CCA;5′一端大多數(shù)為pG,少數(shù)為pC。⑤tRNA分子中含有較多的修飾成分。第93頁/共182頁(2)rRNA的一級結(jié)構(gòu)原核生物核糖體70S50S30S5SrRNA,23SrRNA34種蛋白質(zhì)16SrRNA21種蛋白質(zhì)第94頁/共182頁真核生物核糖體80S60S40S5SrRNA,5.8SrRNA,28SrRNA49種蛋白質(zhì)18SrRNA33種蛋白質(zhì)第95頁/共182頁第96頁/共182頁(3)mRNA的一級結(jié)構(gòu)真核生物mRNA的一級結(jié)構(gòu)可用下式表示:5′-帽子5′-非密碼區(qū)密碼區(qū)3′-非密碼區(qū)polyA5′-cap:m7G(5′)pppNmp5′-capcap0:m7G(5′)pppNpcap1:m7G(5′)pppNmpNpcap2:m7G(5′)pppNmpNmpNp

第97頁/共182頁5′-cap的功能(1)防止mRNA被核酸酶降解。(2)為mRNA翻譯活性所必需。(3)與蛋白質(zhì)合成的正確起始有關(guān)。第98頁/共182頁3′-polyA:polyA的殘基數(shù)20~200個(gè),或更多。polyA的功能(1)保護(hù)mRNA,免受核酸外切酶的作用。(2)與翻譯有關(guān),沒有polyA翻譯活性降低。(3)與mRNA從細(xì)胞核轉(zhuǎn)移到細(xì)胞質(zhì)有關(guān)。第99頁/共182頁RNA前體成熟RNA(有功能的RNA)斷裂、修剪、修飾第100頁/共182頁(三)RNA的二級結(jié)構(gòu)

大多數(shù)天然RNA是一條單鏈,通過自身回折形成部分螺旋區(qū),部分非螺旋區(qū)。

少數(shù)病毒RNA如水稻矮縮病毒、呼腸孤病毒、傷瘤病毒等RNA是雙鏈螺旋,類似于DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)。第101頁/共182頁RNA中雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的因素主要是堿基堆積力,其次是氫鍵。第102頁/共182頁1.tRNA的二級結(jié)構(gòu)(1)aa接受臂(aminoacidarm)(2)二氫尿嘧啶環(huán)(dihydrouridineloop,DHUloop)(3)反密碼環(huán)(anticodonloop)(4)額外環(huán)(extraloop)(5)TψC環(huán)(TψCloop)第103頁/共182頁1980年牛心線粒體tRNAser只有63個(gè)核苷酸,沉降常數(shù)3S,缺少D環(huán)和D臂,呈二葉草型。

近年來發(fā)現(xiàn)2種線蟲線粒體tRNA也不是標(biāo)準(zhǔn)的三葉草結(jié)構(gòu)。第104頁/共182頁2.rRNA的二級結(jié)構(gòu)第105頁/共182頁第106頁/共182頁3.mRNA的二級結(jié)構(gòu)第107頁/共182頁(四)RNA的三級結(jié)構(gòu)tRNA的三級結(jié)構(gòu)第108頁/共182頁六、核酸酶類包括核酸水解酶、合成酶、連接酶等。(一)核酸水解酶的分類

1.底物:核糖核酸酶(ribonuclease,RNase)脫氧核糖核酸酶(deoxyribonuclease,DNase)2.作用方式:核酸內(nèi)切酶(endonuclease)3.按磷酸二酯鍵斷裂的方式4.其它:如雙鏈酶、單鏈酶等核酸外切酶(exonuclease)第109頁/共182頁(二)核糖核酸酶類

1.牛胰核糖核酸酶(pancreaticribonuclease,

簡稱RNaseA或RNaseI)第110頁/共182頁2.核糖核酸酶T1(ribonucleaseT1,簡稱RNaseT1)第111頁/共182頁3.核糖核酸酶T2(ribonucleaseT2,簡稱RNaseT2)主要作用點(diǎn)為Ap殘基,水解速度A>>U>G>CAUCGAG第112頁/共182頁(三)脫氧核糖核酸酶

1.牛胰脫氧核糖核酸酶(pancreaticdeoxyribonuclease簡稱DNaseI)第113頁/共182頁2.牛脾脫氧核糖核酸酶(spleendeoxyribonuclease,簡稱DNaseII)第114頁/共182頁3.限制性內(nèi)切酶(restrictionendonuclease)簡稱限制酶

限制性內(nèi)切酶主要降解外源的未經(jīng)特殊修飾的DNA,對自身起了保護(hù)作用。發(fā)現(xiàn)概況:第115頁/共182頁(1)限制性內(nèi)切酶的特征①具有嚴(yán)格的堿基專一性,有專一的識別順序、切點(diǎn)②粘性未端,平整末端第116頁/共182頁(2)限制性內(nèi)切酶的命名ECoRI第117頁/共182頁

(3)限制性內(nèi)切酶舉例第118頁/共182頁第119頁/共182頁(四)非專一性核酸酶類(nonspecificnuclease)介紹二種外切酶1.蛇毒磷酸二酯酶(venomphosphodiesterase)5-核苷酸第120頁/共182頁蛇毒磷酸二酯酶對末端磷酸基有嚴(yán)格的要求寡核苷酸水解速度最快較慢,水解速度降低10倍最慢,幾乎不作用,水解速度再降低100倍第121頁/共182頁橘青霉磷酸二酯酶專一性:與蛇毒磷酸二酯酶相同第122頁/共182頁2.牛脾磷酸二酯酶對末端磷酸基的要求與蛇毒磷酸二酯酶相反+3′-核苷酸第123頁/共182頁(五)磷酸單酯酶

將單核苷酸或寡核苷酸末端的磷酸單酯鍵切開,得到磷酸和其它產(chǎn)物1.特異性磷酸單酯酶2.非特異性磷酸單酯酶磷酸基無論在3′或5′位,都能水解,如E.Coli磷酸單酯酶(1)磷酸基連在5′位才能水解,如牛精液5′-核苷酸酶(2)磷酸基連在3′位才能水解,如麥芽3′一核苷酸酶第124頁/共182頁七、核酸的性質(zhì)和最常用的研究方法

(一)一般性質(zhì):分子大小、性狀、溶解度。

分子大?。篋NAMr106~1010或更大性狀:DNA為白色纖維狀固體,而RNA為白色粉末。溶解度:DNA和RNA均不溶于一般的有機(jī)溶劑,微溶于水,但它們的鈉鹽在水中溶解度較大。RNAMr104~106或更大第125頁/共182頁(二)粘度

(三)酸堿性質(zhì)

(四)紫外吸收

由于核酸中堿基的共軛雙鍵,所以對紫外有強(qiáng)烈吸收,最大吸收峰在260nm附近,利用這一特性可進(jìn)行核酸的定量測定。第126頁/共182頁1.紫外分光光度法首先根據(jù)A260/A280的比值判斷核酸樣品的純度純DNA:A260/A280=1.8純RNA:A260/A280=2.0(若樣品中含有雜蛋白或苯酚,則A260/A280比值明顯降低)純的核酸樣品可根據(jù)260nm的光吸收值算出其含量若260nm光吸收值為1相當(dāng)于50μg/ml雙螺旋DNA或相當(dāng)于40μg/ml單鏈DNA或RNA或相當(dāng)于20μg/ml寡核苷酸。第127頁/共182頁2.摩爾磷消光系數(shù)(molarabsorptivity)法A:樣品的光吸收值C:每升溶液中磷的摩爾數(shù)L:光徑∵∴在pH7.0時(shí);DNA的為~6600,RNA的為7700~7800。:摩爾磷消光系數(shù),也稱摩爾磷吸光系數(shù)知道了磷的含量就可知核酸的含量第128頁/共182頁3.增色效應(yīng)與減色效應(yīng)增色效應(yīng)(hyperchromiceffect)減色效應(yīng)(hypochromiceffect)第129頁/共182頁(五)沉降特性

1.核酸浮力密度的測定浮力密度:經(jīng)密度梯度沉降平衡法測出的密度氯化絕(CsCl)密度梯度沉降平衡第130頁/共182頁第131頁/共182頁用1~2個(gè)已知浮力密度的標(biāo)準(zhǔn)DNA樣品作參考式中ρ:未知DNA的密度ρ0:標(biāo)準(zhǔn)DNA的密度ω:角速度(弧度/秒)r:未知DNA與轉(zhuǎn)軸之間的距離r0:已知DNA與轉(zhuǎn)軸之間的距離第132頁/共182頁2.DNA中G-C含量的測定G-C對的含量與浮力密度之間呈正比關(guān)系Rolfe-Meselson導(dǎo)出了如下公式:ρ=0.100(G-C%)+1.658(g/cm3)知道了浮力密度就可計(jì)算出G-C對的含量第133頁/共182頁3.核酸的構(gòu)象和分離ρ:RNA>環(huán)狀DNA>線狀DNA>蛋白質(zhì)DNA沉降第134頁/共182頁(六)核酸的變性、復(fù)性和雜交

1.變性(denaturation)核酸變性的概念引起核酸變性的因素

第135頁/共182頁(1)熱變性結(jié)構(gòu):螺旋→線團(tuán)理化性質(zhì):紫外吸收↑粘度↓比旋光度↓生物活性:生物活性↓或喪失第136頁/共182頁(2)熔點(diǎn)(Tm)Tm:熔點(diǎn),熔解溫度,變性溫度,解鏈溫度

第137頁/共182頁(3)影響Tm值的因素①DNA的均一性②DNA中G-C對的含量

經(jīng)驗(yàn)式:(G-C)%=(Tm-69.3)×2.44③鹽離子強(qiáng)度第138頁/共182頁2.復(fù)性(renaturation)(1)復(fù)性理化性質(zhì):↓比旋光度↑粘度↑高于Tm值5℃

復(fù)性也稱退火(annealing)生物活性得到部分恢復(fù)第139頁/共182頁(2)影響復(fù)性的因素①樣品的性質(zhì)②DNA的濃度③DNA片段的大?、軠囟娶蓦x子強(qiáng)度第140頁/共182頁(3)復(fù)性動力學(xué)DNA的復(fù)性過程是一種雙分子反應(yīng)S:singlestrandDNAD:doublestrandDNA經(jīng)重排,積分等

式中 C0:t=0時(shí),起始DNA的濃度(mol/L)C:t時(shí)間時(shí),單鏈DNA的濃度(mol/L)k:復(fù)性反應(yīng)常數(shù)(L/mol·sec)t:復(fù)性時(shí)間(sec)CC0=11+kC0t第141頁/共182頁Cot:時(shí)的Cot值,即指復(fù)性完成一半時(shí)的Cot值。第142頁/共182頁3.雜交(hybridization)核酸的雜交:是指不同來源的單鏈核酸之間可通過堿基互補(bǔ)形成雙螺旋結(jié)構(gòu)。單鏈DNA與單鏈DNA雜交(DNA-DNA)利用核酸雜交可檢測特定的核苷酸片段或研究同源性等。單鏈DNA與單鏈RNA雜交(DNA-RNA)單鏈RNA與單鏈RNA雜交(RNA-RNA)第143頁/共182頁用硝酸纖維素膜作為支持物進(jìn)行雜交1975年英國E.M.Southern首創(chuàng)的Southernblotting(Southern印跡)原理方法探針:作為檢測用的已知DNA序列或RNA序列的片段第144頁/共182頁1977年G.K.Stark首創(chuàng)Northernblotting

(Northern印跡)Westernblotting(Western印跡)

第145頁/共182頁(七)凝膠電泳核酸研究中最常用的方法優(yōu)點(diǎn):簡單、快速、靈敏、成本低。通過凝膠電泳(1)可進(jìn)行核酸分離,知道核酸的純度。(2)測定分子大小。(3)估計(jì)核酸的構(gòu)象。第146頁/共182頁凝膠電泳兼有分子篩效應(yīng)和電荷效應(yīng)1.瓊脂糖凝膠電泳(agarosegelelectrophoresis)

瓊脂糖凝膠電泳的遷移率主要與分子大小、膠濃度、核酸構(gòu)象、電流等有關(guān)。2.聚丙烯酰胺凝膠電泳(polyacrylamidegelelectrophoresis)用于分析RNA或Mr小于1000bp的DNA片段適用于大分子核酸,一般用于DNA分析。第147頁/共182頁八、核酸的生物功能

(一)DNA的生物功能

1.DNA與遺傳(1)DNA是主要的遺傳物質(zhì)間接證據(jù)直接證據(jù)第148頁/共182頁①細(xì)菌轉(zhuǎn)化作用(transformation

)肺炎球菌(pneumococcus)1928年細(xì)菌學(xué)家Griffith細(xì)菌毒性實(shí)驗(yàn)第149頁/共182頁1944年Avery細(xì)菌轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)

轉(zhuǎn)化作用:轉(zhuǎn)化作用的物質(zhì)稱轉(zhuǎn)化因子

從一種細(xì)菌中得到DNA通過一定途徑進(jìn)入另一種細(xì)菌,從而引起后者遺傳特性的改變。第150頁/共182頁②噬菌體感染實(shí)驗(yàn)1952年美國Hershey噬菌體感染實(shí)驗(yàn)第151頁/共182頁第152頁/共182頁③轉(zhuǎn)導(dǎo)作用(transduction)④人工合成基因的表達(dá)第153頁/共182頁(2)DNA的復(fù)制(replication)第154頁/共182頁(3)DNA的轉(zhuǎn)錄(transcription)第155頁/共182頁2.DNA與變異突變?nèi)旧w畸變基因突變第156頁/共182頁(1)基因突變(geneticmutation)基因概念的發(fā)展、補(bǔ)充什么是基因突變第157頁/共182頁基因突變的幾種主要形式①堿基取代(basesubstitution,也稱堿基置換)A.轉(zhuǎn)換(transition)B.顛換(transversion)②堿基缺失(basedeletion)③堿基插入(baseinsertion)第158頁/共182頁突變的原因①自發(fā)突變②誘發(fā)突變?nèi)缱贤饩€、X-射線、亞硝酸、烷化劑、堿基類似物等第159頁/共182頁嘧啶二聚體第160頁/共182頁脫氨第161頁/共182頁(2)基因重組(generecombination)基因的體外重組,即基因工程(geneticengineering)①獲得目的基因②基因載體(vector)③目的基因與基因載體連接形成重組DNA④通過轉(zhuǎn)化或其它方法將重組DNA分子引入受體細(xì)胞⑤被轉(zhuǎn)化細(xì)胞的篩選和繁殖第162頁/共182頁第163頁/共182頁3.DNA與遺傳性疾病、癌變的關(guān)系(1)鐮刀狀紅細(xì)胞貧血病的DNA點(diǎn)突變(2)白化病的基因缺失(3)癌變第164頁/共182頁(二)RNA的生物功能

1.RNA與蛋白質(zhì)的生物合成(1)mRNA與遺傳密碼遺傳密碼(geneticcode)密碼子(codon)mRNA的主要功能第165頁/共182頁(

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