第八章檢索方法

第八章PUBMED檢索系統(tǒng)

劉軍鳳

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第一節(jié)概述

一、醫(yī)學文獻分析與檢索系統(tǒng)（MEDLARS）

醫(yī)學文獻分析與檢索系統(tǒng)（MedicalLiteratureAnalysisandRetrievalSystem）簡稱MEDLARS，是美國國立醫(yī)學圖書館（NationalLibraryofMedicine，簡稱NLM）研制開發(fā)的一個醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫檢索系統(tǒng)。

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MEDLARS擁有近40個數(shù)據(jù)庫，各數(shù)據(jù)庫收錄的學科范圍涉及醫(yī)學的各個領(lǐng)域，包括基礎(chǔ)醫(yī)學、臨床醫(yī)學、生物學、藥理學、毒理學、環(huán)境醫(yī)學、職業(yè)病學、營養(yǎng)衛(wèi)生、衛(wèi)生保健、衛(wèi)生管理、情報學、心理學、醫(yī)學倫理學、牙科學、護理學、獸醫(yī)學等。其中，最大的數(shù)據(jù)庫就是Medline數(shù)據(jù)庫。

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二、Medline數(shù)據(jù)庫

MEDLINE（MEDLARSonLine）：醫(yī)學文獻聯(lián)機數(shù)據(jù)庫，收錄1966年以來70多個國家3900多種生物醫(yī)學期刊中的約1000萬條文獻題錄。收入美國《醫(yī)學索引》（IM）、《國際護理索引》（INI）、《牙科索引》（IDL）的全部文獻題錄。覆蓋了臨床醫(yī)學、預防醫(yī)學、護理學、口腔醫(yī)學、藥理學、基礎(chǔ)醫(yī)學等學科領(lǐng)域。目前四頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

Internet網(wǎng)絡(luò)上有三十多個站點提供FreeMedline檢索服務(wù)，如：PubMed,HealthGate，Medscape，MedicalMatrix，BioMedNet等。但只有PubMed是官方網(wǎng)站。

/pubmed目前五頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

三、Pubmed檢索系統(tǒng)

PubMed是美國立醫(yī)學圖書館(NLM)下屬的國立生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的基于WWW的查詢系統(tǒng)，提供免費的MEDLINE、PREMEDLINE及其他相關(guān)數(shù)據(jù)庫的鏈接與接入服務(wù)。目前六頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

PubMed因和生物醫(yī)學文獻出版商聯(lián)合，可連接這些出版商網(wǎng)點獲取期刊全文數(shù)據(jù)。PubMed還提供與綜合分子生物學數(shù)據(jù)庫的鏈接與接入服務(wù)，包括Protein、Nucleotide、Structure、Genome、3DDomains、Gene、PopSet、OMIM、Taxonomy等數(shù)據(jù)庫。目前七頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前八頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前九頁\總數(shù)八十三頁\編于七點第二節(jié)檢索方法一、普通檢索：在檢索輸入框中可直接輸入主題詞、自由詞、著者姓名、期刊名等進行檢索，也可輸入邏輯表達式進行檢索或進行字段限定檢索。(1)主題檢索：須遵循《醫(yī)學主題詞表》(MedicalSubjectHeadings簡稱MeSH)中所收集的詞匯進行檢索。如：lungneoplasms/radiography[mh]目前十頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

(2)自由詞檢索：在檢索框中輸入一個或多個檢索詞，確定即可。如：輸入brain[tw]和輸入brain,結(jié)果是不一樣的。

details:"brain"[MeSHTerms]OR"brain"[AllFields]目前十一頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

注意詞匯自動轉(zhuǎn)換功能：

PubMed按順序使用如下4種表或索引，對檢索詞進行轉(zhuǎn)換后再檢索。

①MeSH轉(zhuǎn)換表：包括MeSH詞、參見詞、副主題詞等。如果系統(tǒng)在該表中發(fā)現(xiàn)了與檢索詞相匹配的詞，就會自動將其轉(zhuǎn)換為相應(yīng)的MeSH詞和自由詞進行檢索。例如：鍵入"Vitaminh"，系統(tǒng)將其轉(zhuǎn)換成"Biotin[MeSHTems]ORBiotin[AllFields]ORVitaminh[AllFields]"后進行檢索。目前十二頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

②刊名轉(zhuǎn)換表：包括刊名全稱、MEDLINE形式的縮寫。該轉(zhuǎn)換表能把鍵入的刊名全稱轉(zhuǎn)換為“MEDLINE縮寫[JournalName]”后進行檢索。例如：鍵入："newenglandjournalofmedicine",PubMed將其轉(zhuǎn)換為"NEnglJMed"[Journal]OR"newenglandjournalofmedicine"[AllFields]后進行檢索。

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③短語表：如果PubMed系統(tǒng)在MeSH和刊名轉(zhuǎn)換表中未發(fā)現(xiàn)與檢索詞相匹配的詞，就會查找短語表。

④著者索引：如果鍵入的詞語未在上述各表中找到相匹配的詞，或者鍵入的詞是一個后面跟有1~2個字母的短語，PubMed即查著者索引。目前十四頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

如果仍然找不到匹配詞，PubMed就會把該詞斷開后再重復上述自動詞匯轉(zhuǎn)換過程。或把單個詞用AND聯(lián)一起在全部字段中檢索。如：“singlecell”，系統(tǒng)就會自動將其分成兩個詞，按("singleperson"[MeSHTerms]OR("single"[AllFields]AND"person"[AllFields])OR"singleperson"[AllFields]OR"single"[AllFields])AND("cells"[MeSHTerms]OR"cells"[AllFields]OR"cell"[AllFields])進行檢索。目前十五頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

(3)著者檢索：遵循“姓前名后”原則，姓用全稱，名用縮寫。如：SmithJRSmithJ@Yang[AU]目前十六頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

(4)刊名檢索：可用期刊名全稱，也可用MesH期刊名縮寫檢索。如：Molecularbiologyofthecell[ta]Molbiolcell[ta]

(5)文獻類型檢索：文獻類型標識符[PT]，如欲檢索綜述文獻可使用檢索式review[PT]即可。目前十七頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

(6)出版年代檢索：如：1998[dp]or[edat]or[mhda](7)地址檢索：如：Japan[AD](8)語種檢索：如：Chinese[LA](9)截詞檢索：在詞根或詞尾上加上特定的符號（*），可擴大檢索范圍，防止漏檢。如：Comput*目前十八頁\總數(shù)八十三頁\編于七點computeer,computers,computed,computize,computized,computization等詞的文獻全部檢出。(10)邏輯組配檢索：如：檢索“兒童哮喘治療原語種為英語的綜述文獻”asthma/therapy[mh]ANDreview[pt]ANDchild[mh]ANDenglish[la](11)詞組檢索：當強迫PubMed檢索一個詞組時，將詞組用引號括起，系統(tǒng)關(guān)閉自動詞語匹配和自動擴展功能。

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Pubmed檢索規(guī)則：Pubmed進行字段限定檢索時，字段標識符加在檢索詞之后；字段標識符必須用方括號括起來；大小寫以及檢索詞與方括號之間有無空格無關(guān)緊要。Pubmed處理布爾邏輯表達式是按從左到右的順序進行的。但可以通過括號來改變運算順序。如果Pubmed發(fā)現(xiàn)檢索式中有非限定的詞組，它就自動檢索該詞組，再將該集合與檢索式的其它項進行運算。目前二十頁\總數(shù)八十三頁\編于七點字段標識符[AD]：機構(gòu)、第一作者地址[ALL]：所有字段[AU]：作者姓名[TA]：期刊名[LA]：語種[MAJR]：主要概念的醫(yī)學主題詞[MH]：醫(yī)學主題詞[PT]：出版類型[TW]：文本詞[TI]：題名[DP]:出版日期目前二十一頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前二十二頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前二十三頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前二十四頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前二十五頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前二十六頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前二十七頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前二十八頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前二十九頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前三十頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前三十一頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前三十二頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前三十三頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前三十四頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前三十五頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前三十六頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前三十七頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前三十八頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前三十九頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前四十頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前四十一頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前四十二頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前四十三頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前四十四頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前四十五頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前四十六頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前四十七頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前四十八頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前四十九頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前五十頁\總數(shù)八十三頁\編于七點練習題：1、查肺腫瘤放射療法，任選題錄、文摘、全文各1篇，按Medline格式顯示。（lungneoplasms/radiography[mh]）2、比較brain[tw]和brain的檢索結(jié)果3、檢索Vitaminh,查驗檢索詞的轉(zhuǎn)換情況4、比較SmithJR[AU]和SmithJR的檢索結(jié)果5、查期刊molecularbiologyofthecell上的文章6、檢索肺腫瘤2002年綜述文獻目前五十一頁\總數(shù)八十三頁\編于七點二、高級檢索：在首頁或檢索結(jié)果頁面點擊Advanced，即可進入高級檢索頁面。在高級檢索頁面可進行檢索式的構(gòu)建檢索、可瀏覽檢索歷史、還可選擇其它更多檢索方式檢索。目前五十二頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前五十三頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

1、Builder：可進行檢索式的構(gòu)建，從索引表中選詞檢索；可編制及修改檢索策略；可預覽檢索策略和檢索結(jié)果的記錄數(shù)并對滿意的檢索策略進行檢索。

目前五十四頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前五十五頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前五十六頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前五十七頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前五十八頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前五十九頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前六十頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前六十一頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前六十二頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前六十三頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

2、History：可查看檢索策略及檢索結(jié)果記錄數(shù)；可將檢索表達式重新組合檢索；可保存檢索策略到“MyNCBI”中做定題檢索。SearchHistory僅保存檢索式8個小時。目前六十四頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前六十五頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前六十六頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

3、MoreResources：可鏈接進入MeshDatabase、JournalsDatabase、SingleCitationMatcher、ClinicalQueries、Topic-SpecificQueries進行其它檢索方式的檢索。即MeSH檢索、期刊檢索、單篇文章匹配檢索、臨床文獻查詢、特殊主題查詢等。目前六十七頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前六十八頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前六十九頁\總數(shù)八十三頁\編于七點

練習：1.獲得性免疫缺陷綜合癥(AcquiredImmunodeficiencySyndrome)的綜述性文獻。2.腎衰動物實驗文獻(kidneyfailure)要帶文摘。3.查2008年至今腫瘤方面的論文,帶免費全文。4.查"T.R.Gordon"發(fā)表的論文。5.高血壓(hypertension)和糖尿病(diabetesmellitus)的關(guān)系方面的英文文獻。

目前七十頁\總數(shù)八十三頁\編于七點三、MeSH檢索：

①可進行主題詞的查找并檢索該主題詞的文獻；②可進行主題詞與副主題詞組配檢索；③可進行主題詞的加權(quán)檢索；④可進行主題詞的擴展檢索。目前七十一頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前七十二頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前七十三頁\總數(shù)八十三頁\編于七點目前七十四頁\總數(shù)