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文檔簡介
臨床科研中常用的統(tǒng)計(jì)分析方法演示文稿當(dāng)前第1頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)(優(yōu)選)臨床科研中常用的統(tǒng)計(jì)分析方法當(dāng)前第2頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)一、如何正確抉擇統(tǒng)計(jì)方法1分析集2研究目的3資料類型4設(shè)計(jì)類型5方法的應(yīng)用/適用條件當(dāng)前第3頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)1分析集(ANALYSISSET)分析集應(yīng)在研究設(shè)計(jì)階段確定,建立規(guī)則。意向性分析集(intentiontotreat,ITT)全分析集(Fullanalysisset,F(xiàn)AS)符合方案集(perprotocolset,PPS)安全集(safetyset,SS)當(dāng)前第4頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)使用適宜、正確的統(tǒng)計(jì)分析方法是統(tǒng)計(jì)結(jié)論真實(shí)可靠的重要保證。統(tǒng)計(jì)分析包括:統(tǒng)計(jì)描述:選擇什么樣的指標(biāo),選用統(tǒng)計(jì)表還是圖取決于資料的性質(zhì)及研究目的等統(tǒng)計(jì)推斷:方法的正確抉擇與研究目的、資料類型、設(shè)計(jì)類型、樣本大小、資料分布類型、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、特定條件綜合分析等有關(guān)。當(dāng)前第5頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)2研究目的研究目的通常有:估計(jì)——參數(shù)的點(diǎn)估計(jì)和區(qū)間估計(jì)比較——t、u、ANOVA篩選主要影響因素—回歸相關(guān)分析——各種相關(guān)建立臨床醫(yī)學(xué)參考值范圍校正與控制混雜因素——協(xié)方差分析、CMH因果關(guān)系分析——通徑分析預(yù)測(cè)、預(yù)報(bào)分析——回歸。等等當(dāng)前第6頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)3資料類型資料類型包括三個(gè)方面數(shù)據(jù)性質(zhì)定量資料定性資料資料分布類型正態(tài)分布偏態(tài)分布分布類型不清結(jié)局變量的類型數(shù)值變量分類變量二分類無序多分類有序分類當(dāng)前第7頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)4設(shè)計(jì)類型統(tǒng)計(jì)設(shè)計(jì)的類型取決于研究目的,實(shí)際上是為了更好地達(dá)到研究目的而采取的設(shè)計(jì)方案從統(tǒng)計(jì)學(xué)上來講,臨床上常用的有:完全隨機(jī)設(shè)計(jì)配對(duì)設(shè)計(jì)隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)交叉設(shè)計(jì)序貫設(shè)計(jì)重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)……當(dāng)前第8頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)5統(tǒng)計(jì)方法的應(yīng)用/使用條件對(duì)樣本量的要求對(duì)應(yīng)變量、自變量分布類型的要求對(duì)數(shù)據(jù)缺失程度的要求當(dāng)前第9頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)二、常用的統(tǒng)計(jì)分析方法差異性檢驗(yàn)療效性檢驗(yàn)優(yōu)效性等效性非劣效性當(dāng)前第10頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)2.1差異性檢驗(yàn)——(1)臨床試驗(yàn)中的3種數(shù)據(jù)來源處理反應(yīng)影響因素當(dāng)前第11頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)基線測(cè)定數(shù)據(jù)的可比性:20個(gè)指標(biāo)中有4個(gè)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,則隨機(jī)有問題(P=0.0159)2.1差異性檢驗(yàn)——(2)當(dāng)前第12頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)定性數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)描述統(tǒng)計(jì)描述頻數(shù)和百分比統(tǒng)計(jì)推論兩個(gè)率的比較卡方檢驗(yàn)、Fisher;logistic回歸等級(jí)定性反應(yīng)變量卡方、Ridit、秩和檢驗(yàn)、CMH2.1差異性檢驗(yàn)——(3)當(dāng)前第13頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)定量數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)描述例數(shù)、均數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)差、中位數(shù)、四分位數(shù)間距、最大值、最小值統(tǒng)計(jì)推論t檢驗(yàn)ANOVAGLM(協(xié)方差)生存時(shí)間N年生存率、中位生存期、無病進(jìn)展時(shí)間等LifetableK-MtestCOX2.1差異性檢驗(yàn)——(4)當(dāng)前第14頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)申杰主編.中醫(yī)統(tǒng)計(jì)學(xué).北京:科學(xué)出版社,2009:P33.當(dāng)前第15頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)2.2臨床試驗(yàn)的優(yōu)效性、等效性、非劣效性檢驗(yàn)方法差異性檢驗(yàn):通常所用的統(tǒng)計(jì)分析方法都是進(jìn)行的差異性檢驗(yàn)臨床試驗(yàn)的三種檢驗(yàn),確切的說是為三種設(shè)計(jì)而進(jìn)行的分析方法金丕煥.臨床試驗(yàn).復(fù)旦大學(xué)出版社.p86當(dāng)前第16頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)統(tǒng)計(jì)分析方法同差異性檢驗(yàn)方法,但是單側(cè)檢驗(yàn)。須在研究設(shè)計(jì)階段確定。當(dāng)前第17頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)當(dāng)前第18頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)當(dāng)前第19頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)當(dāng)前第20頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)當(dāng)前第21頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)可信區(qū)間估計(jì)當(dāng)前第22頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)3.中醫(yī)領(lǐng)域的應(yīng)用當(dāng)前第23頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)當(dāng)前第24頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)方差分析——一類方法完全隨機(jī)設(shè)計(jì)隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)交叉設(shè)計(jì)拉丁方設(shè)計(jì)析因設(shè)計(jì)正交設(shè)計(jì)均勻設(shè)計(jì)嵌套設(shè)計(jì)重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)裂區(qū)設(shè)計(jì)協(xié)方差分析多元方差分析重復(fù)測(cè)量的方差分析當(dāng)前第25頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)協(xié)方差分析的概念協(xié)方差分析模型協(xié)方差分析舉例協(xié)方差分析當(dāng)前第26頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)試驗(yàn)設(shè)計(jì)的三項(xiàng)基本原則,目的就是為了排除非處理因素的干擾和影響,使試驗(yàn)誤差的估計(jì)降到最低限度,從而可以準(zhǔn)確地獲得處理因素的試驗(yàn)效應(yīng)。但在某些實(shí)際問題中,有些因素在目前還不能控制或難以控制,如在動(dòng)物飼養(yǎng)試驗(yàn)中,動(dòng)物增加的平均體重不僅僅與動(dòng)物的進(jìn)食量有關(guān),甚至與各動(dòng)物的初始重量等因素有關(guān)系。如果直接進(jìn)行方差分析,會(huì)因?yàn)榛祀s因素的影響而無法得出正確結(jié)論。一、協(xié)方差分析的概念當(dāng)前第27頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)協(xié)方差分析(AnalysisofCovariance)是將回歸分析與方差分析結(jié)合起來使用的一種分析方法。它先將定量的影響因素看作自變量,或稱為協(xié)變量,建立因變量隨自變量變化的回歸方程,這樣就可以利用回歸方程把因變量的變化中受定量因素的影響扣除掉,從而能夠較合理地比較因變量的總體均數(shù)之間是否有顯著性的差別,增加了分析的準(zhǔn)確性。
協(xié)方差分析的功用就是用處理前的基數(shù)矯正處理后的結(jié)果,提高其精確度。定義當(dāng)前第28頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)考察某因素對(duì)因變量Y的影響,布置了一單項(xiàng)分類資料的試驗(yàn),其方差分析模型為:yij=μi+εij
μi該因素第i個(gè)水平的效應(yīng),εij為隨機(jī)誤差同時(shí)收集到與y有密切回歸關(guān)系的變量x,其方差分析模型變?yōu)椋簓ij=μi+b(xij-x)+dijb為y對(duì)x的回歸系數(shù),dij為隨機(jī)誤差二、協(xié)方差分析模型ˉ平行性假定:各組協(xié)變量和因變量的關(guān)系是線性的各組殘差正態(tài)各組回歸斜率相等,即各組回歸線是平行的當(dāng)前第29頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)1、比較三種豬飼料A1,A3,A3對(duì)豬催肥的效果,測(cè)得每頭豬增加的重量(y)與初始重量(x)與數(shù)據(jù)如表。試測(cè)定三種飼料對(duì)豬的催肥有無顯著的不同?初始重量與豬的增加重量之間有無明顯的關(guān)系?三、協(xié)方差舉例水平觀察值A(chǔ)1x1513111212161417y8583657680918490A2x1716181821221918y9790100951031069994A3x2224202325273032y89918395100102105110當(dāng)前第30頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)1、平方和2、回歸關(guān)系的顯著性檢驗(yàn)協(xié)方差舉例變異來源自由度平方和均方F值回歸誤差1201010.76227.6151010.7611.3888.8**當(dāng)前第31頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)3、糾正后的處理間方差分析4、用回歸糾正每處理的平均增重協(xié)方差舉例變異來源自由度平方和均方F值處理誤差220707.218227.615353.60911.38131.07**總變異22934.833yi=μi+b(xi-x)ˉ當(dāng)前第32頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)1、統(tǒng)計(jì)資料應(yīng)服從正態(tài)分布,否則要做適當(dāng)?shù)慕y(tǒng)計(jì)代換。2、做一般方差分析時(shí)處理間差異顯著,而做協(xié)方差分析時(shí),處理間差異反而不顯著,說明所謂的差異是由于初始的試驗(yàn)條件造成的,并非處理間真正的差異。3、做一般方差分析時(shí)處理間差異不顯著,而做協(xié)方差分析時(shí),處理間差異反而顯著,說明除去試驗(yàn)條件的影響后處理間有真正的差異。注意的問題當(dāng)前第33頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)的方差分析當(dāng)前第34頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)一、重復(fù)測(cè)量資料的數(shù)據(jù)特征當(dāng)對(duì)同一受試對(duì)象在不同時(shí)間重復(fù)測(cè)量次數(shù)p≥3時(shí),稱為重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)或重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)。測(cè)量時(shí)間點(diǎn)受試者12…p1y11y12…y1p2y21y22…y2p:nyn1yn2…ynp當(dāng)前第35頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)圖例當(dāng)前第36頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)重復(fù)測(cè)量資料是同一受試對(duì)象的同一觀察指標(biāo)在不同時(shí)間點(diǎn)上進(jìn)行多次測(cè)量所得的資料,常用來分析該觀察指標(biāo)在不同時(shí)間點(diǎn)上的變化。有時(shí)是從同一個(gè)體的不同部位(或組織)上重復(fù)測(cè)量獲得的指標(biāo)的觀測(cè)值。目的:就是比較不同時(shí)間點(diǎn)動(dòng)態(tài)變化趨勢(shì)的特征當(dāng)前第37頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)問題?想一想?同一觀察單位具有多個(gè)觀察值,而這些觀察值來自同一受試對(duì)象的不同時(shí)點(diǎn)(部位等),這類數(shù)據(jù)間往往有相關(guān)性存在,違背了方差分析要求數(shù)據(jù)滿足獨(dú)立性基本條件。當(dāng)前第38頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)在這種情況下:若使用一般的方差分析,就不能充分揭示出內(nèi)在的特點(diǎn),有時(shí)甚至?xí)贸鲥e(cuò)誤結(jié)論。所以重復(fù)測(cè)量資料需要采用專門的統(tǒng)計(jì)分析方法,該方法是近代統(tǒng)計(jì)學(xué)研究的熱點(diǎn)之一。當(dāng)前第39頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)實(shí)際中:重復(fù)測(cè)量資料比獨(dú)立資料更多見?!衽R床研究中,需要觀察病人在不同時(shí)間的某些生理、生化或病理指標(biāo)的變化趨勢(shì),研究不同時(shí)間或療程的治療效果?!窳餍胁W(xué)研究中,觀察隊(duì)列人群在不同時(shí)間上的發(fā)病情況。研究不同職業(yè)、性別人群實(shí)施某種控制后,不同時(shí)間的多次效果考察。●衛(wèi)生學(xué)研究中,縱向觀察兒童生長發(fā)育規(guī)律等,不同地區(qū)和環(huán)境營養(yǎng)狀況。當(dāng)前第40頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)提醒大家重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)在醫(yī)學(xué)研究中十分常見,在醫(yī)學(xué)類雜志上約占四分之一,而且統(tǒng)計(jì)表達(dá)和分析誤用情況嚴(yán)重。當(dāng)前第41頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)主要優(yōu)點(diǎn)減少樣本含量控制個(gè)體變異非實(shí)驗(yàn)因素(干擾因素)當(dāng)前第42頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)●單變量重復(fù)測(cè)量方差分析1.單組重復(fù)測(cè)量指同一組內(nèi)(或接受同一種處理)的多個(gè)受試者,在多個(gè)時(shí)間點(diǎn)上的反應(yīng)變量所作的測(cè)量,又稱為單變量重復(fù)測(cè)量。測(cè)量時(shí)間點(diǎn)受試者12…p1y11y12…y1p2y21y22…y2p:nyn1yn2…ynp當(dāng)前第43頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)2.多組重復(fù)測(cè)量(多組并不等于多因素)指將受試者按處理的不同水平分為幾個(gè)組,對(duì)這些組內(nèi)的每一受試者,都在不同時(shí)間點(diǎn)對(duì)他們的反應(yīng)變量進(jìn)行測(cè)量。表3.1(余松林)當(dāng)前第44頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)1.單組重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)方差分析2.兩組重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)方差分析●單變量重復(fù)測(cè)量方差分析當(dāng)前第45頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)二、重復(fù)測(cè)量資料分析的前提條件和基本步驟1.前提條件:首先要求樣本是隨機(jī)的,除了滿足一般方差分析條件外,特別強(qiáng)調(diào)滿足協(xié)方差陣(covariancematrix)球形性。sphericity當(dāng)前第46頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)概念:協(xié)方差陣的球?qū)ΨQ性是指該對(duì)角線元素(方差)相等、非主對(duì)角線元素(協(xié)方差)為零方差指在某一時(shí)點(diǎn)上測(cè)定值變異的大小,而協(xié)方差是指在兩個(gè)不同時(shí)點(diǎn)上測(cè)定值相互變異的大小。如果在某個(gè)時(shí)點(diǎn)上的取值不影響其它時(shí)點(diǎn)上的取值。則協(xié)方差為0,相反,則不為0。由協(xié)方差構(gòu)成的矩陣稱為協(xié)方差陣。00當(dāng)前第47頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)若球?qū)ΨQ性得不到滿足,方差分析的F值是有偏的,會(huì)增大Ⅰ類錯(cuò)誤的概率2.用Mauchly法檢驗(yàn)協(xié)方差陣的球形性質(zhì)如果P值大于α,說明協(xié)方差陣的球?qū)ΨQ性質(zhì)得到滿足。否則,必須對(duì)與時(shí)間有關(guān)的F統(tǒng)計(jì)量的分子和分母自由度進(jìn)行調(diào)整,減少Ⅰ類錯(cuò)誤的概率。調(diào)整系數(shù)為:ε(讀:epsilon)當(dāng)前第48頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)3.自由度常用調(diào)整方法①Greenhouse-Geisser法,簡稱:G-G法②Huynh-Feldt法,簡稱:H-F法③Lower-bound法,簡稱:L-B下界法以上前兩種方法較復(fù)雜,采用軟件計(jì)算。當(dāng)前第49頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)4.舉例:單組重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的方差分析觀察10名慢性乙型肝炎患者治療前、治療12周、24周、36周四個(gè)時(shí)間點(diǎn)上谷丙轉(zhuǎn)氨酶(ALT)水平的變化趨勢(shì),結(jié)果見下表,試進(jìn)行統(tǒng)計(jì)推斷。當(dāng)前第50頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)分析:數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)上與完全區(qū)組設(shè)計(jì)相似
但實(shí)質(zhì)不同各觀測(cè)點(diǎn)時(shí)間順序是固定的,不能隨機(jī)分配;不同觀測(cè)點(diǎn)數(shù)據(jù)彼此不獨(dú)立或不完全獨(dú)立,存在一定的相關(guān)性。當(dāng)前第51頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)SAS結(jié)果中包括偏相關(guān)陣當(dāng)前第52頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)例題
1.建立假設(shè),確定檢驗(yàn)水準(zhǔn)?。?.012.進(jìn)行球?qū)ΨQ性檢驗(yàn)球?qū)ΨQ性通常采用
Mauchly’stest檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)來判斷當(dāng)前第53頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)3.調(diào)整時(shí)間點(diǎn)F值的自由度
調(diào)整原則:⑴當(dāng)資料滿足“球?qū)ΨQ”(Sphericity)條件時(shí)(P>α),不作調(diào)整。⑵當(dāng)資料不滿足“球?qū)ΨQ”條件時(shí)(P<α),時(shí)間點(diǎn)間F值的自由度需要調(diào)整。常用的調(diào)整方法當(dāng)前第54頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)時(shí)間點(diǎn)間誤差4.計(jì)算F值當(dāng)前第55頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)球?qū)ΨQ性通常采用
MAUCHLY’STEST檢驗(yàn)來判斷其結(jié)果按α=0.1水準(zhǔn)檢驗(yàn),不滿足球?qū)ΨQ性,對(duì)系數(shù)ε進(jìn)行校正,其結(jié)果如下:結(jié)果顯示:治療前與治療后不同時(shí)間轉(zhuǎn)氨酶平均水平不同。當(dāng)前第56頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)5.單組重復(fù)測(cè)量方差分析數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)6.基本程序格式Nouni不打印輸出單變量分析結(jié)果Printe產(chǎn)生Mauchly球性檢驗(yàn)的統(tǒng)計(jì)量χ2、P值當(dāng)前第57頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)分析:單組重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)分析的缺陷只能分析觀察對(duì)象的觀測(cè)值在不同時(shí)間點(diǎn)的差別。專業(yè)認(rèn)為:不同時(shí)間點(diǎn)上的觀測(cè)值變化可能是“處理”的作用,也可能是患者病情的自然變化,與“處理”無關(guān),如果要分析“處理”效應(yīng),必須設(shè)立一個(gè)平行對(duì)照組,通過組間差別的大小說明“處理”組效應(yīng)的大小。兩獨(dú)立樣本重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)是將N個(gè)受試對(duì)象隨機(jī)地等分兩組,一組作為實(shí)驗(yàn)組,另一組作為對(duì)照組。當(dāng)前第58頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)
為研究國產(chǎn)某藥品與同類型進(jìn)口藥品對(duì)慢性乙型肝炎患者谷丙轉(zhuǎn)氨酶(ALT)水平的影響,將20名慢性乙型肝炎患者隨機(jī)分為兩組,一組服用國產(chǎn)藥作為實(shí)驗(yàn)組,一組服用進(jìn)口藥作為對(duì)照組。對(duì)每一患者在治療前、治療后12周、24周、36周重復(fù)4次測(cè)量ALT水平,實(shí)驗(yàn)結(jié)果見下表。問兩種藥物對(duì)慢性乙型肝炎患者的ALT水平影響是否不同?5.舉例:兩組重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)方差分析當(dāng)前第59頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)表國產(chǎn)藥進(jìn)口藥當(dāng)前第60頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)分析結(jié)果同一患者重復(fù)測(cè)量值就是組間差異患者之間的個(gè)體差異就是組內(nèi)誤差兩樣本重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)方差分析結(jié)果當(dāng)前第61頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)程序如下兩組重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)當(dāng)前第62頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)相關(guān)分析結(jié)果球?qū)ΨQ性檢驗(yàn)結(jié)果當(dāng)前第63頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)方差分析結(jié)果當(dāng)前第64頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)結(jié)果顯示匯總總結(jié)論為:不同藥物對(duì)ALT水平未見不同,但兩藥物在不同時(shí)間點(diǎn)ALT有差別,藥物與時(shí)間的交互作用無意義。當(dāng)前第65頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)問題?從以上分析可見:無論單組或兩組分析,我們僅算出總的有差別,兩兩比較未知的?分析方法與一般方差分析不同。Contrast(1)產(chǎn)生不同水平間同括弧內(nèi)指定的參考水平對(duì)比檢驗(yàn)Summary
定義每個(gè)對(duì)比組生成方差分析表當(dāng)前第66頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)后多個(gè)重復(fù)測(cè)量時(shí)間點(diǎn)與前第1時(shí)間點(diǎn)比原程序如下:當(dāng)前第67頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)結(jié)果分析當(dāng)前第68頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)兩組比較數(shù)據(jù)分析當(dāng)前第69頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)所關(guān)注的結(jié)果如下當(dāng)前第70頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)CONTRAST(1)結(jié)果比較結(jié)構(gòu)當(dāng)前第71頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)有時(shí)試驗(yàn)僅對(duì)先后兩個(gè)時(shí)間點(diǎn)的比較感興趣,也希望比較水平1與2、2與3、3與4比
可用選擇項(xiàng)PROFILE,程序如下:procglmdata=SASfeng.p178;modeltime0time12time24time36=A/nouni;repeatedtimeprofile/printmsummary;run;提示:顯示不同水平比較時(shí)的結(jié)構(gòu)當(dāng)前第72頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)顯示不同水平比較時(shí)的結(jié)構(gòu)當(dāng)前第73頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)當(dāng)興趣在于1個(gè)水平與以后的所有水平的比較時(shí),可選HELMERT………….;repeatedtimehelmert/printmsummary;………….;當(dāng)前第74頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)小結(jié):兩兩比較參數(shù)選擇repeatedtime?
/?msummary;Contrast(1)表示2個(gè)時(shí)間點(diǎn),其中第1個(gè)時(shí)間點(diǎn)為參考點(diǎn)Profile表示1與2比、2與3比、3與4比Helmert表示在1個(gè)水平后與所有的水平比較Printe產(chǎn)生Mauchly’s的χ2值和P值Printm產(chǎn)生不同水平比較結(jié)構(gòu)陣產(chǎn)生對(duì)比組的方差分析表當(dāng)前第75頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)1.重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的主要特征是什么?2.重復(fù)測(cè)量SAS數(shù)據(jù)錄入結(jié)構(gòu)?3.球?qū)ΨQ性檢驗(yàn)?4.不同水平間與不同組間比較選項(xiàng)?5.推斷結(jié)論?當(dāng)前第76頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)兩組,一組給予曲明片十模擬曲明膠囊,另一組給予曲明膠囊十模擬曲明片。所有患者每天堅(jiān)持服藥,共服藥6個(gè)月(24周),受試期間禁用任何影響體重的藥物,而且受試對(duì)象行為、飲食及運(yùn)動(dòng)與服藥前的平衡期均保持一致。分別于平衡期(0周)、服藥后的8周、16周、24周測(cè)定肥胖患者的體重(kg)得表9-13的資料。例題為研究減肥新藥鹽酸西布曲明片和鹽酸西布曲明膠囊的減肥效果是否不同,以及肥胖患者服藥后不同時(shí)間的體重隨時(shí)間的變化情況。采用雙盲雙模擬隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn),將體重指數(shù)BMI>27的肥胖患者40名隨機(jī)等分成當(dāng)前第77頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)表9-13當(dāng)前第78頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)可以看出重復(fù)測(cè)量資料中同一受試對(duì)象(看成區(qū)組)的數(shù)據(jù)高度相關(guān)無論哪位受試對(duì)象服用曲明片劑或是膠囊,其服藥后8周、16周和24周的體重均和前面時(shí)間點(diǎn)(含服藥前的0周)的體重相關(guān)。不同時(shí)點(diǎn)數(shù)據(jù)其相關(guān)性較強(qiáng)。當(dāng)前第79頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)重復(fù)測(cè)量資料方差分析的基本步驟分為三步:當(dāng)前第80頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)⑵計(jì)算檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量:使用統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行計(jì)算結(jié)果如下:當(dāng)前第81頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)⑶確定P值,做出推斷結(jié)論:
根據(jù)專業(yè)知識(shí)和假設(shè)檢驗(yàn),直接由計(jì)算機(jī)所給P值做出推斷結(jié)論。按α=0.05水準(zhǔn),減肥藥劑型k(片劑和膠囊),劑型k與時(shí)間i的交互效應(yīng)ki均不拒絕H0,無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,還不能認(rèn)為曲明不同劑型的減肥效果不同,也還不能認(rèn)為劑型k與時(shí)間i間有交互效應(yīng)。而時(shí)間因素i拒絕H0,接受H1,有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,可認(rèn)為服用減肥藥鹽酸西市曲明前后不同時(shí)間(8周、16周和24周)的平均體重不全相同。當(dāng)前第82頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)重復(fù)測(cè)量資料方差分析的前提條件重復(fù)測(cè)量資料的方差分析,除了滿足一般方差分析的條件外,還要滿足協(xié)方差陣的球形性或復(fù)合對(duì)稱性。若條件不能滿足,F(xiàn)值有偏性,通常采用Mauchly檢驗(yàn)來判斷,通過軟件選參數(shù)計(jì)算。當(dāng)前第83頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)校正后的結(jié)果:當(dāng)前第84頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)兩組重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)當(dāng)前第85頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)SAS程序顯示該資料不滿足球?qū)ΨQ性,參看校正結(jié)果。當(dāng)前第86頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)結(jié)果表明經(jīng)G-G和H-F調(diào)整后,按α=0.05檢驗(yàn)水準(zhǔn),A(不同藥物)和A與TIME(時(shí)間)無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,后者無交互作用,而時(shí)間因素間有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。當(dāng)前第87頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)例4
用丹參注射液治療7例慢性腎功能衰竭患者,治療前后不同時(shí)間各患者的血尿素氮(BUN)的變化,如表所示。試比較治療前后不同時(shí)間各患者血尿素氮的變化是否不同?
表4-5丹參注射液治療慢性腎衰患者不同時(shí)間的BUN(mg/dl)變化
治療后不同患者治療前第2周第4周第6周
160.741.034.536.2265.244.741.239.4366.342.440.537.7467.149.143.340.2562.838.540.135.8672.552.344.637.6758.035.038.637.2當(dāng)前第88頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)題意分析:本題要探討治療前后“不同時(shí)間”,又要研究“不同患者”的血尿素氮的變化,是屬于按兩因素分組的多個(gè)均數(shù)間比較的重復(fù)測(cè)量方差分析
首先在Insight中建立數(shù)據(jù)集,本題變量FL為不同治療時(shí)間的分組變量,如治療前為1,治療后第2周為2,…,第6周為4。X為BUN的測(cè)定值。建好結(jié)構(gòu)錄入數(shù)據(jù),格式如圖4-17所示,數(shù)據(jù)集名為L2,存入SASUSER庫中,備用。當(dāng)前第89頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)如圖所示:當(dāng)前第90頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)91生存分析SURVIVALANALYSIS
當(dāng)前第91頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)92何為生存分析當(dāng)前第92頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)93傳統(tǒng)方法在分析隨訪資料時(shí)的困難時(shí)間和生存結(jié)局都成為了要關(guān)心的因素
?除了生存結(jié)局作為判定標(biāo)準(zhǔn)以外,只要能讓病人存活時(shí)間延長,這種藥物也應(yīng)當(dāng)是被認(rèn)為有效的。即時(shí)間延長也認(rèn)為有效
?如果將兩者均作為應(yīng)變量擬和多元模型,因?yàn)闀r(shí)間分布不明(一般不呈正態(tài)分布,在不同情況下的分布規(guī)律也不同),擬和多元模型極為困難當(dāng)前第93頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)94傳統(tǒng)方法在分析隨訪資料時(shí)的困難存在大量失訪的資料?失去聯(lián)系(病人搬走,電話號(hào)碼改變)?無法觀察到結(jié)局(死于其他原因)?研究截止顯然,將失訪數(shù)據(jù)無論是算作死亡還是存活似乎都不大合理當(dāng)前第94頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)95第一節(jié)概述當(dāng)前第95頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)96一、基本概念
(一)生存時(shí)間(survivaltime):1.定義:廣義的生存時(shí)間是指從某個(gè)起始事件開始到某個(gè)終點(diǎn)事件的發(fā)生(出現(xiàn)反應(yīng))所經(jīng)歷的時(shí)間。也稱失效時(shí)間(failuretime)。2.特點(diǎn):(1)分布類型不易確定。一般不服從正態(tài)分布,有時(shí)近似服從指數(shù)分布、Weibull分布、
Gompertz分布等,多數(shù)情況下往往不服從任何規(guī)則的分布類型。
當(dāng)前第96頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)97(2)生存時(shí)間的影響因素多而復(fù)雜且不易控制。(3)根據(jù)研究對(duì)象的結(jié)局,生存時(shí)間數(shù)據(jù)可分兩種類型:①完全數(shù)據(jù)(completedata):觀察對(duì)象在觀察期內(nèi)出現(xiàn)反應(yīng)(終點(diǎn)事件),這時(shí)記錄到的時(shí)間信息是完整的,這種生存時(shí)間數(shù)據(jù)稱為完全數(shù)據(jù)。
②截尾數(shù)據(jù)(截尾值、刪失數(shù)據(jù),censoreddata):尚未觀察到研究對(duì)象出現(xiàn)反應(yīng)(終點(diǎn)事件)時(shí),即由于某種原因停止了隨訪,這時(shí)記錄到的時(shí)間信息是不完整的,這種生存時(shí)間數(shù)據(jù)稱為不完全數(shù)據(jù)或截尾值。常用符號(hào)“+”表示。
當(dāng)前第97頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)98截尾值(CENSOREDVALUE)出現(xiàn)的原因截尾的原因主要有3種:①失訪:生存但中途失訪:包括拒絕訪問、失去聯(lián)系等。②退出:中途退出試驗(yàn)、改變治療方案、死于其它與研究無關(guān)的原因:如肺癌患者死于心機(jī)梗塞、自殺或因車禍死亡,終止隨訪時(shí)間為死亡時(shí)間。③終止:指觀察期結(jié)束時(shí)仍未出現(xiàn)結(jié)局。當(dāng)前第98頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)99關(guān)于截尾或刪失隨訪開始事件失訪失訪研究截止時(shí)仍存活研究截止時(shí)點(diǎn)患者進(jìn)入期間刪失的模式圖當(dāng)前第99頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)100當(dāng)前第100頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)101當(dāng)前第101頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)102當(dāng)前第102頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)103當(dāng)前第103頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)104當(dāng)前第104頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)105當(dāng)前第105頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)106當(dāng)前第106頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)107風(fēng)險(xiǎn)函數(shù)與生存函數(shù)的關(guān)系當(dāng)前第107頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)108當(dāng)前第108頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)109當(dāng)前第109頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)110當(dāng)前第110頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)111第二節(jié)生存率估計(jì)的非參數(shù)法
當(dāng)前第111頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)112當(dāng)前第112頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)113當(dāng)前第113頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)114當(dāng)前第114頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)115圖16-2兩種療法治療后白血病患者的生存率曲線10.900.7930.68670.56110.42130.21當(dāng)前第115頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)116當(dāng)前第116頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)117當(dāng)前第117頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)118當(dāng)前第118頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)119當(dāng)前第119頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)120當(dāng)前第120頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)121當(dāng)前第121頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)122當(dāng)前第122頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)123當(dāng)前第123頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)124當(dāng)前第124頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)125第三節(jié)生存率的比較
生存率比較的假設(shè)檢驗(yàn)方法有參數(shù)法、半?yún)?shù)法和非參數(shù)法,因醫(yī)學(xué)研究中的生存時(shí)間資料大多為不規(guī)則分布或者分布未知,常采用非參數(shù)法進(jìn)行假設(shè)檢驗(yàn)。非參數(shù)法是將生存率曲線作為整體進(jìn)行曲線與曲線之間的比較,其零假設(shè)為各總體生存率曲線相同。常用的非參數(shù)檢驗(yàn)方法有l(wèi)og-rank檢驗(yàn)(時(shí)序檢驗(yàn))、Gehan比分檢驗(yàn)和Breslow檢驗(yàn)等。當(dāng)前第125頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)126當(dāng)前第126頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)127當(dāng)前第127頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)128當(dāng)前第128頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)129當(dāng)前第129頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)130當(dāng)前第130頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)131續(xù)表當(dāng)前第131頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)132當(dāng)前第132頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)133當(dāng)前第133頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)134對(duì)于大樣本資料生存率的比較,可以將其整理成頻數(shù)表形式,采用壽命表法計(jì)算生存率然后進(jìn)行比較,其基本原理與上述方法相同。當(dāng)前第134頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)135第四節(jié)COX比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型
當(dāng)前第135頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)136當(dāng)前第136頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)137一、COX比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型的基本形式
看下面例子當(dāng)前第137頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)138如果分析x1-x6這6個(gè)因素對(duì)生存時(shí)間t的影響,能否用線性回歸分析建立時(shí)間t與影響因素間的線性回歸方程?或建立生存函數(shù)S(t)與影響因素間的線性回歸方程?
t=b0+b1x1+b2x2+┅+b6x6?S(t)=b0+b1x1+b2x2+┅+b6x6?1、生存時(shí)間t一般不服從正態(tài)分布;2、生存時(shí)間t中含有截尾值。當(dāng)前第138頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)139利用生存率函數(shù)S(t,X)與風(fēng)險(xiǎn)函數(shù)h(t,X)的關(guān)系可導(dǎo)出較好的解決截尾值的問題反映了協(xié)變量X與生存函數(shù)的關(guān)系Cox模型的基本形式當(dāng)前第139頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)140所有危險(xiǎn)因素為0時(shí)的基礎(chǔ)風(fēng)險(xiǎn)率,它是未知的,但假定它與h(t,X)是呈比例的。右側(cè)可分為兩部分:h0(t)沒有明確的定義,分布無明確的假定,參數(shù)無法估計(jì),為非參數(shù)部分;另一部分是參數(shù)部分,其參數(shù)可以通過樣本的實(shí)際觀察值來估計(jì)的,正因?yàn)镃ox模型有非參數(shù)和參數(shù)兩部分組成,故又稱為半?yún)?shù)模型。當(dāng)前第140頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)141當(dāng)前第141頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)142當(dāng)前第142頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)143當(dāng)前第143頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)144當(dāng)前第144頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)145當(dāng)前第145頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)146二、COX回歸分析的步驟:
確定自變量和因變量參數(shù)估計(jì),擬和模型對(duì)模型的假設(shè)檢驗(yàn)?zāi)P偷慕忉尲皯?yīng)用對(duì)模型的擬和優(yōu)度檢驗(yàn)
當(dāng)前第146頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)147模型的參數(shù)估計(jì)(一)參數(shù)估計(jì)-偏似然估計(jì)當(dāng)前第147頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)148代表ti時(shí)刻以后危險(xiǎn)集R(ti)中對(duì)似然函數(shù)作貢獻(xiàn)的個(gè)體將n個(gè)病人死亡的條件概率相乘當(dāng)前第148頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)149模型的假設(shè)檢驗(yàn)
當(dāng)前第149頁\共有156頁\編于星期二\17點(diǎn)150當(dāng)前第
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