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文檔簡介
核酸和蛋白質(zhì)的生物合成第1頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月中心法則第2頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月一、DNA的生物合成(一)DNA的半保留復(fù)制(二)DNA復(fù)制的起始點(diǎn)和方向(三)原核細(xì)胞DNA的復(fù)制(四)真核細(xì)胞DNA的復(fù)制(五)反轉(zhuǎn)錄作用(RNA指導(dǎo)的DNA合成)(六)DNA的損傷與修復(fù)第3頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月復(fù)制(replication)是指遺傳物質(zhì)的傳代,以母鏈DNA為模板合成子鏈DNA的過程。復(fù)制親代DNA子代DNA第4頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(一)DNA的半保留復(fù)制
DNA生物合成時(shí),母鏈DNA解開為兩股單鏈,各自作為模板,按堿基配對(duì)規(guī)律,合成與模板互補(bǔ)的子鏈。子代細(xì)胞的DNA,一股單鏈從親代完整接受過來,另一股單鏈則完全重新合成,兩個(gè)子細(xì)胞的DNA都和親代DNA堿基序列一致,這種復(fù)制方式為半保留復(fù)制。第5頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月保證遺傳信息傳遞的忠實(shí)性;遺傳和變異的統(tǒng)一第6頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(二)DNA復(fù)制的起始點(diǎn)和方向DNA復(fù)制是從DNA上一個(gè)固定點(diǎn)開始的;DNA復(fù)制起始點(diǎn)稱為原點(diǎn);它的復(fù)制從原點(diǎn)開始可雙向同時(shí)進(jìn)行,也可以單向進(jìn)行;DNA復(fù)制是邊解鏈邊復(fù)制,復(fù)制中的DNA在復(fù)制點(diǎn)呈叉狀,這個(gè)分叉點(diǎn)稱為復(fù)制叉。第7頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月5’3’oriorioriori5’3’5’5’3’3’5’5’3’復(fù)制子3’真核生物DNA多復(fù)制子復(fù)制第8頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月半不連續(xù)復(fù)制順著解鏈方向生成的子鏈,復(fù)制是連續(xù)進(jìn)行的,這股鏈稱為領(lǐng)頭鏈。復(fù)制方向與解鏈方向相反,不能順著解鏈方向連續(xù)延長,這股不連續(xù)復(fù)制的鏈稱為隨從鏈。復(fù)制中的不連續(xù)片段稱為岡崎片段。第9頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月3
5
3
5
解鏈方向3′5′3′3′5′領(lǐng)頭鏈(leadingstrand)隨從鏈(laggingstrand)岡崎片段(okazakifragment)領(lǐng)頭鏈連續(xù)復(fù)制而隨從鏈不連續(xù)復(fù)制——復(fù)制的半不連續(xù)性第10頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月DNA復(fù)制的特點(diǎn)固定的起始點(diǎn)邊解鏈邊復(fù)制單向或雙向沿5
3
方向復(fù)制半保留復(fù)制半不連續(xù)第11頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月參與DNA復(fù)制的物質(zhì)模板:解開成單鏈的DNA母鏈底物:dNTP(dATP,dGTP,dCTP,dTTP)引物:提供3
-OH末端使dNTP可以依次聚合聚合酶:依賴DNA的DNA聚合酶,簡寫為DNA-pol其他的酶和蛋白質(zhì)因子第12頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(三)原核細(xì)胞DNA的復(fù)制復(fù)制的起始延長終止第13頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月5'3'5'dATPdGTPdTTPdCTPdTTPdGTPdATPdCTPOH3'3'DNA-poldNMP引物:短鏈RNA分子第14頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月領(lǐng)頭鏈的合成領(lǐng)頭鏈:順著解鏈方向生成的子鏈,復(fù)制是連續(xù)進(jìn)行的,這股鏈稱為領(lǐng)頭鏈。第15頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月隨從鏈的合成隨從鏈:復(fù)制方向與解鏈方向相反,為不連續(xù)復(fù)制,這股不連續(xù)復(fù)制的鏈稱為隨從鏈。復(fù)制中位于隨從鏈上的不連續(xù)片段稱為岡崎片段(okazakifragment)。第16頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(四)真核生物的DNA生物合成
第17頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月?多復(fù)制子復(fù)制子(replicon):相鄰兩個(gè)復(fù)制起點(diǎn)之間的距離。復(fù)制子是獨(dú)立完成復(fù)制的功能單位。復(fù)制有時(shí)序性,即復(fù)制子以分組方式激活而不是同步起動(dòng)。
復(fù)制的起始第18頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月3
5
5
3
領(lǐng)頭鏈3
5
3
5
親代DNA隨從鏈引物核小體復(fù)制的延長DNA-polδDNA-polα第19頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月3
5
3
3
55
3
3
5+5
3
3
3
5
5
5′復(fù)制的終止染色體DNA呈線狀,復(fù)制在末端停止。第20頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月1、親代DNA為模板嚴(yán)格遵守堿基配對(duì)規(guī)律2、復(fù)制延長時(shí)聚合酶對(duì)堿基的選擇功能3、復(fù)制出錯(cuò)時(shí)DNA-pol的即時(shí)校讀功能4、錯(cuò)配修復(fù)機(jī)制DNA復(fù)制具有保真性第21頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(五)反轉(zhuǎn)錄作用(RNA指導(dǎo)的DNA合成)指遺傳信息從RNA流向DNA,是RNA指導(dǎo)下的DNA合成過程,即以RNA為模板,四種dNTP為原料,合成與RNA互補(bǔ)的DNA單鏈。RNADNA
逆轉(zhuǎn)錄酶第22頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月逆轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase)
催化逆轉(zhuǎn)錄過程的酶稱逆轉(zhuǎn)錄酶,RNA病毒中都含有此酶。具有三種酶活性:
RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶
RNA酶
DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶第23頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月逆轉(zhuǎn)錄過程RNA模板逆轉(zhuǎn)錄酶(RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶)DNA-RNA雜化雙鏈逆轉(zhuǎn)錄酶(RNA酶)單鏈DNA逆轉(zhuǎn)錄酶(DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶)雙鏈DNA第24頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(六)DNA的損傷與修復(fù)DNADamage(Mutation)andRepair第25頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)改變而引起的遺傳信息改變,均可稱為突變。在復(fù)制過程中發(fā)生的DNA突變稱為DNA損傷(DNAdamage)。從分子水平來看,突變就是DNA分子上堿基的改變。
第26頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月引發(fā)突變的因素物理因素如紫外線(ultraviolet,UV)、各種輻射UV胸腺嘧啶二體第27頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月化學(xué)因素第28頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月DNA損傷的修復(fù)修復(fù)(repairing)
是對(duì)已發(fā)生分子改變的補(bǔ)償措施,使其回復(fù)為原有的天然狀態(tài)。光修復(fù)(lightrepairing)切除修復(fù)(excisionrepairing)重組修復(fù)(recombinationrepairing)SOS修復(fù)
修復(fù)的主要類型第29頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月二、RNA的生物合成第30頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月轉(zhuǎn)錄(transcription)
生物體以DNA為模板合成RNA的過程
DNA
RNA轉(zhuǎn)錄第31頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(一)參與轉(zhuǎn)錄的物質(zhì)原料:
NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)
模板:
DNA酶:
RNA聚合酶(RNA-pol)其他蛋白質(zhì)因子第32頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月
結(jié)構(gòu)基因(structuralgene):能轉(zhuǎn)錄生成RNA的DNA區(qū)段。
模板鏈(templatestrand):
DNA雙鏈中按堿基配對(duì)規(guī)律能指引轉(zhuǎn)錄生成RNA的一股鏈。
編碼鏈(codingstrand):
DNA雙鏈中與模板鏈相對(duì)應(yīng)的另一條鏈1、模板第33頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月第34頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月不對(duì)稱轉(zhuǎn)錄:在DNA分子雙鏈上,一股鏈用作模板指導(dǎo)轉(zhuǎn)錄,另一股鏈不轉(zhuǎn)錄;模板鏈并非總是在同一條鏈上。
第35頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月2、原料
4種核糖核苷三磷酸:
ATP、GTP、CTP、UTP
作為RNA聚合酶的底物第36頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月3、RNA聚合酶全稱:依賴DNA的RNA聚合酶
(DNA-dependentRNApolymerase)簡稱:RNA-pol它以DNA為模板,4種NTP為原料,按A=U、C
G堿基配對(duì)規(guī)則,催化合成5′→3′方向的RNA鏈。第37頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月原核生物的RNA聚合酶第38頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月真核生物的RNA聚合酶第39頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月4、終止因子(ρ)其作用是協(xié)助RNA聚合酶辨認(rèn)終止點(diǎn)并終止轉(zhuǎn)錄第40頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(二)轉(zhuǎn)錄的過程
轉(zhuǎn)錄是以DNA為模板合成RNA的過程包括起始、延長和終止三個(gè)階段第41頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月1、起始階段轉(zhuǎn)錄起始需解決兩個(gè)問題:RNA聚合酶必須準(zhǔn)確地結(jié)合在轉(zhuǎn)錄模板的起始區(qū)域。DNA雙鏈解開,使其中的一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板。第42頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月2、延長階段
RNA–pol聚合酶核心酶沿著DNA模板鏈3′→5′方向,催化合成5′→3′方向的RNA鏈。(NMP)n+NTP
(NMP)n+1+PPi第43頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(三)終止階段
RNA聚合酶在DNA模板鏈上停止滑動(dòng),轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA鏈停止延長并從轉(zhuǎn)錄復(fù)合物上脫落下來分類依賴ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止依賴莖環(huán)結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄終止第44頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月轉(zhuǎn)錄全過程第45頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(三)轉(zhuǎn)錄后加工真核生物轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA都要經(jīng)過一系列改變才能成為有生物活性的RNA分子。第46頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月1、mRNA的轉(zhuǎn)錄后加工
mRNA的前體分子被稱為核內(nèi)不均一RNA(hnRNA)
hnRNA需進(jìn)行5′端(形成帽子結(jié)構(gòu)m7GpppGp—)和3′端(加多聚腺苷酸尾巴polyA)的修飾,再進(jìn)行剪接加工,才能成為成熟mRNA。第47頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月mRNA的剪接外顯子(exon):能編碼多肽鏈中氨基酸的序列的被稱為外顯子。內(nèi)含子(intron):不被翻譯的插入序列被稱為內(nèi)含子。
mRNA的剪接:除去hnRNA中的內(nèi)含子,將外顯子連接。第48頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月2、tRNA的轉(zhuǎn)錄后加工第49頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月3、rRNA的轉(zhuǎn)錄后加工第50頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月第十三章蛋白質(zhì)的生物合成一、遺傳密碼二、核糖體三、轉(zhuǎn)移RNA的功能四、蛋白質(zhì)生物合成的分子機(jī)制五、真核生物與原核生物蛋白質(zhì)合成的差異第51頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月mRNA分子中的遺傳信息轉(zhuǎn)變?yōu)榈鞍踪|(zhì)的氨基酸排列順序的過程稱為翻譯(translation)第52頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月蛋白質(zhì)的生物合成體系原料:20種氨基酸模板:mRNA場所:核蛋白體氨基酸的“搬運(yùn)工具”:tRNA酶與蛋白質(zhì)因子:啟動(dòng)、延長、終止因子能量:ATP、GTP無機(jī)離子第53頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月起始密碼(initiationcoden):5′端第一個(gè)AUG表示起動(dòng)信號(hào),并代表甲酰甲硫氨酸(細(xì)菌)或甲硫氨酸(高等動(dòng)物)
密碼子(codon):mRNA從5′端→3′端,每3個(gè)核苷酸組成一組,代表相應(yīng)的氨基酸或翻譯起始、終止信號(hào)。終止密碼(terminationcoden):UAA、UAG或UGA(不編碼氨基酸)一、遺傳密碼第54頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月遺傳密碼表UCUCUCUCAGAGAGAG第三個(gè)字母第55頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月密碼子的特點(diǎn)1、不重疊性2、簡并性3、通用性4、連續(xù)性第56頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月二、核糖體核糖體(核蛋白體)是多肽鏈合成的裝置核糖體可游離存在,真核中,也可同內(nèi)質(zhì)網(wǎng)結(jié)合,形成粗糙的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。原核中,與mRNA形成串狀——多核糖體。第57頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月原核生物真核生物核糖體小亞基大亞基核糖體小亞基大亞基S值70S30S50S80S40S60SrRNA16S-rRNA5S-rRNA23S-rRNA18S-rRNA28S-rRNA5S-rRNA5.8S-rRNA蛋白質(zhì)rpS21種rpL36種rpS33種rpL49種不同細(xì)胞核糖體的組成蛋白質(zhì)rRNA第58頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月原核生物翻譯過程中核糖體結(jié)構(gòu)與功能A位:氨基酰位(結(jié)合AA-tRNA)P位:肽酰位(結(jié)合肽酰-tRNA和起始Met-tRNA)E位:排出位(轉(zhuǎn)肽酶、GTP酶)第59頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月三、轉(zhuǎn)移RNA的功能一種tRNA可攜帶一種氨基酸;而一種氨基酸可由數(shù)種tRNA攜帶。第60頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月搬運(yùn)工具—tRNA與氨基酸結(jié)合與氨酰-tRNA合成酶結(jié)合識(shí)別密碼子與核糖體結(jié)合第61頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月四、蛋白質(zhì)生物合成的分子機(jī)制蛋白質(zhì)合成的過程大致分為五個(gè)階段:氨基酸的激活;肽鏈合成的起動(dòng);肽鏈的延長;肽鏈合成的終止和釋放;肽鏈的折疊和加工處理。第62頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(一)氨基酸的激活(1)氨酰-tRNA合成酶:高度特異識(shí)別氨基酸、tRNA;校對(duì)活性(2)能量:1個(gè)ATP(2個(gè)高能鍵)氨基酸+tRNA氨酰-tRNAATPAMP+PPi氨酰-tRNA合成酶第63頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(二)在核糖體上合成多肽
1、起始復(fù)合物的生成(1)起始因子3種IF(原核):IF1、IF2、IF3多種eIF(真核):eIF2是合成調(diào)控的關(guān)鍵物質(zhì)(2)能量:GTP(真核體系還需ATP)(3)起始AA-tRNAfMet-tRNAfmet(原核)Met-tRNAmet(真核)(4)起始復(fù)合物組成:大、小亞基、mRNA、起始因子、起始AA-tRNA第64頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月小亞基先與起始AA-tRNA結(jié)合(真核)起始復(fù)合物形成過程核蛋白體的拆離、mRNA就位、起始tRNA結(jié)合、大亞基結(jié)合小亞基先與mRNA結(jié)合(原核)第65頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月2、肽鏈延長
(1)延長因子EF-T:真核為EF-T1與T2,原核為EF-Tu、Ts與EF-G(2)能量:GTP
方向:N端→C端(肽鏈);5′端→3′端(mRNA)(3)過程進(jìn)位:EF-Tu、Ts或T1、GTP;進(jìn)入A位轉(zhuǎn)肽:轉(zhuǎn)肽酶;P位酰基與A位氨基反應(yīng)轉(zhuǎn)位、脫落、移位:EF-G(轉(zhuǎn)位酶)或T2、GTP
;由A位移至P位,A位留空第66頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月肽鏈的延長12122323進(jìn)位肽鍵形成移位進(jìn)位(Tu\Ts)GTPGTPN-端235′3′C-端肽鍵形成15′3′(EF-G)
第67頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(1)釋放因子RF:原核:3種真核:1種(2)能量:GTP(3)轉(zhuǎn)肽酶活性轉(zhuǎn)變:轉(zhuǎn)肽酶→酯酶(水解酶)
3、終止第68頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月參與翻譯的蛋白質(zhì)因子階段原核真核功能
IF1
IF2
eIF2參與起始復(fù)合物的形成
IF3
eIF3、eIF4C
起始CBPI與mRNA帽子結(jié)合
eIF4ABF參與尋找第一個(gè)AUG
eIF5協(xié)助eIF2、eIF3、eIF4C的釋放
eIF6協(xié)助60S亞基從無活性的核糖體上解離
EF-Tu
eEF1
協(xié)助氨酰-tRNA進(jìn)入核糖體延長EF-Ts
eEF1
幫助EF-Tu、eEF1
周轉(zhuǎn)
EF-G
eEF2移位因子終止RF-1eRF釋放完整的肽鏈
RF-2因子前加“e”表示真核生物(eukaryotic)第69頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月(三)翻譯后加工1、去除N-甲?;ㄔ耍┗騈-蛋氨酸(真核)2、二硫鍵形成:生成胱氨酸5、水解修剪
3、氨基酸側(cè)鏈修飾:羥化(生成羥脯氨酸、羥賴氨酸)、乙?;?、磷酸化、甲基化與羥甲基化、加糖、加脂,等
6、亞基聚合
4、輔基結(jié)合
多肽鏈折疊為天然三維結(jié)構(gòu)肽鏈一級(jí)結(jié)構(gòu)的修飾空間結(jié)構(gòu)的修飾第70頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月IF-3IF-11.核蛋白體大小亞基分離第71頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月AUG5'3'IF-3IF-12.mRNA在小亞基定位結(jié)合第72頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月IF-3IF-1IF-2GTP3.起始氨基酰tRNA(fMet-tRNAimet)結(jié)合到小亞基AUG5'3'第73頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月IF-3IF-1IF-2GTPGDPPi4.核蛋白體大亞基結(jié)合,起始復(fù)合物形成AUG5'3'第74頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月IF-3IF-1AUG5'3'IF-2GTPIF-2-GTPGDPPi第75頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月核蛋白體大小亞基分離;起始氨基酰-tRNA結(jié)合;mRNA在核蛋白體小亞基準(zhǔn)確就位;核蛋白體大亞基結(jié)合。第76頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月met40S60SMetMet40S60SmRNAeIF-2B、eIF-3、eIF-6①elF-3②GDP+Pi各種elF釋放elF-5④ATPADP+PielF4E,elF4G,elF4A,elF4B,PAB③MetMet-tRNAiMet-elF-2
-GTP真核生物翻譯起始復(fù)合物形成過程第77頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月又稱注冊(cè)(registration)1、進(jìn)位指根據(jù)mRNA下一組遺傳密碼指導(dǎo),使相應(yīng)氨基酰-tRNA進(jìn)入核蛋白體A位。
第78頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月延長因子EF-T催化進(jìn)位(原核生物)
第79頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月第80頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月TuTsGTPGDPAUG5'3'TuTsGTP第81頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月2、轉(zhuǎn)肽由轉(zhuǎn)肽酶催化的肽鍵形成過程第82頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月3、移位延長因子EF-G有移位酶(translocase)活性,可結(jié)合并水解1分子GTP,促進(jìn)核蛋白體向mRNA的3'側(cè)移動(dòng)。第83頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月進(jìn)位移位轉(zhuǎn)肽第84頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月原核肽鏈合成終止過程第85頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月UAG5'3'RFCOO-第86頁,課件共93頁,創(chuàng)作于2023年2月多核蛋白體
1個(gè)mRNA和多個(gè)核蛋白體的聚合物,體現(xiàn)了蛋白質(zhì)合成的高速、高效性。每個(gè)核糖體都獨(dú)立完成一條多肽鏈的合成,所以這種多核糖體可以在一條mRNA鏈上同時(shí)合成多條相同的多肽鏈,大大
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