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文檔簡介
第一章一.名詞解釋:1.Genemanipulation基因操作。將在細(xì)胞外產(chǎn)生的核酸(物質(zhì))分子插入到病毒,質(zhì)?;蚱渌d體系統(tǒng)中,再整合到特定的宿主中,從而形成一種新的可持續(xù)繁殖的有機(jī)體。2.Interruptedgenes間斷基因。序列中間插入有與氨基酸編碼無關(guān)的DNA間隔區(qū),使一種基因分隔成不持續(xù)的若干區(qū)段。我們稱這種編碼序列不持續(xù)的基由于間斷基因。3.Promotor啟動子。DNA分子可以與RNA聚合酶特異結(jié)合的部位,也就是使轉(zhuǎn)錄開始的部位。4.Subcloning亞克隆。當(dāng)時(shí)始克隆中的外源DNA片段較長,具有許多目的基因以外的DNA片段時(shí),在諸如體現(xiàn)、序列分析和突變等操作中不便進(jìn)行,將目的基因所對應(yīng)的一小段DNA找出來,這個(gè)過程叫“亞克隆”。二.填空題1.基因操作(Genemanipulation)的關(guān)鍵部分是基因克?。╣enecloning),genecloning的基本要點(diǎn)有(),()和()。參照答案:克隆基因的類型;受體的選擇;載體的選擇2.()是遺傳物質(zhì)的基本單位,也是作為遺傳物質(zhì)的核酸分子上的一段片段。它可以是持續(xù)的,也可以是();可以是(),也可以是RNA;可以存在于染色體上,也可以()。參照答案:基因;不持續(xù)的;DNA;存在于染色體之外(如質(zhì)粒,噬菌體等)3.基因操作并不是一種法律概念,除了包括基因克隆外,還包括基因的()、()、()和()等與基因研究有關(guān)的內(nèi)容。參照答案:體現(xiàn);調(diào)控;檢測;改造4.啟動子(Promotor)是指()。一般一種Gene與否體現(xiàn),()是關(guān)鍵的一步,是起決定作用的。在轉(zhuǎn)錄過程中,Promoter還是()的結(jié)合位點(diǎn)。參照答案:基因轉(zhuǎn)錄過程中控制起始的部位;轉(zhuǎn)錄起始;RNA聚合酶5.原核生物的RNApolymerase重要由兩部分構(gòu)成:()和(),其中σ-因子并不參與RNA的合成,它的作用重要是()。關(guān)鍵酶;σ因子;識別要轉(zhuǎn)錄的起始位點(diǎn)6.從()到()的這一段距離稱為一種轉(zhuǎn)錄單位,或者一種轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,其中可包括一種或者多種Gene。啟動區(qū);終止區(qū)7.轉(zhuǎn)錄終止子重要有兩種,一種是(),另一種是()。依賴ρ因子;不依賴ρ因子8.Gene的書寫方式,一般是寫出的DNA序列總是與()相似的那條鏈,方向是從()到()。對于堿基的位置,一般自轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)向兩個(gè)方向編號,其中轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)定為(),()定為-1。參照答案:mRNA;5';3';+1;在起始點(diǎn)上游第一種堿基9.重疊基因(Overlappinggene)是指(),間隔基因(Interruptedgene)是指()參照答案:一種基因的序列中,單個(gè)DNA序列可編碼一種以上的蛋白質(zhì);在編碼序列中間插入的一段無編碼作用的堿基序列三.簡答題1.簡述基因克隆的兩個(gè)基本特性?參照答案:基因克隆的兩個(gè)基本特性是一是強(qiáng)調(diào)外源核酸分子(一般狀況下都是DNA)在不一樣宿主中的繁殖,打破自然種的界線未來自于不有關(guān)物種的基因放入一種宿主中是基因操作的一種重要特性,基因操作的另一種重要特性是繁殖。2.談?wù)勀銓ene的認(rèn)識,并簡要說說gene概念的發(fā)展?fàn)顩r?※3.怎樣理解gene及其產(chǎn)物的共線性和非共線性?參照答案:基因決定蛋白質(zhì)的序列構(gòu)成,是由密碼子對應(yīng)特定氨基酸所決定的。當(dāng)一種基因的核苷酸序列與其產(chǎn)物的氨基酸序列是一一對應(yīng)時(shí),則表明它們是共線性的。在原核生物中,基因及其產(chǎn)物是共線性的。70年代以來,在真核生物中,發(fā)現(xiàn)了間斷基因,后來發(fā)現(xiàn)這種間斷基因在真核生物中普遍存在,也就是后來所說的基因間存在著內(nèi)含子。內(nèi)含子指真核生物基因中不能被翻譯成蛋白質(zhì)的DNA片斷,但可被轉(zhuǎn)錄,當(dāng)兩側(cè)序列的轉(zhuǎn)錄RNA被剪接在一起時(shí),就將內(nèi)含子轉(zhuǎn)錄的RNA從整個(gè)轉(zhuǎn)錄物中除去。外顯子是指可以翻譯成蛋白質(zhì)的任一間斷的基因片段,一種基因可有多種外顯子。內(nèi)含子并不是一成不變的,具有相對性,對一種DNA片斷來說,在某個(gè)基因中是內(nèi)含子,但在另一種基因中卻可以作為外顯子。4.什么是genecloning?什么是亞克隆(subcloning)?參照答案:基因克隆:一定程度上等同于基因的分離,即從復(fù)雜的生物體基因組中,通過酶切,消化等環(huán)節(jié),分離帶有目的基因的DNA片段?;騺喛寺。撼醪娇寺≈械耐庠雌瓮^長,具有許多目的基因片段以外的DNA片段,在諸如體現(xiàn)、序列分析和突變等操作中不便進(jìn)行,因此必須將目的基因所對應(yīng)的一小段DNA找出來,這個(gè)過程叫“亞克隆”。5.假如從一種原核生物中cloning某基因(1-2kb),請談?wù)勊幕经h(huán)節(jié)?參照答案:①對原核生物染色體DNA進(jìn)行不完全酶切,純化所得到的DNA片斷,并與載體連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌;②得到轉(zhuǎn)化子后,根據(jù)目的基因兩側(cè)的已知序列設(shè)計(jì)探針,雜交,篩選轉(zhuǎn)化子;③所得到的轉(zhuǎn)化子中具有目的基因,深入作亞克隆,一步步地向目的基因迫近,最終可得到目的基因6.什么叫基因工程(GeneEngineering),試從理論和技術(shù)兩個(gè)方面談?wù)凣eneEngineering誕生的基礎(chǔ)?參照答案:基因工程(GeneEngineering)又稱基因操作(GeneManipulation)、重組DNA?;蚬こ淌且苑肿舆z傳學(xué)理論為基礎(chǔ),以分子生物學(xué)和微生物學(xué)的現(xiàn)代措施為手段,將不一樣來源的基因(DNA分子),按預(yù)先設(shè)計(jì)的藍(lán)圖,在體外構(gòu)建雜種DNA分子,然后導(dǎo)入活細(xì)胞,以變化生物原先的遺傳特性,獲得新品種,生產(chǎn)新產(chǎn)品,或是研究基因的構(gòu)造和功能。思索題問題:簡述基因操作、基因重組和基因工程的關(guān)系。思索題問題:為何說基因工程是生物學(xué)和遺傳學(xué)發(fā)展的必然產(chǎn)物?思索題問題:簡述基因的構(gòu)造構(gòu)成對基因操作的影響。第二章一.名詞解釋1.Restrictionandmodification限制和修飾。宿主特異性地降解外源遺傳物質(zhì)(DNA)的現(xiàn)象稱為限制。外源遺傳物質(zhì)通過甲基化等作用防止宿主的限制作用稱為修飾。2.Matchedends匹配末端。識別位點(diǎn)為回文對稱構(gòu)造的序列,經(jīng)限制酶切割后,產(chǎn)生的相似的,互補(bǔ)的末端稱為匹配粘端,亦即粘性末端(cohesiveend)。3.Bluntends平末端。在回文對稱軸上同步切割DNA的兩條鏈,產(chǎn)生的沒有堿基突出的末端稱為平末端。4.Isoschizomer:同裂酶。識別相似序列的限制酶稱同裂酶,但它們的切割位點(diǎn)也許不一樣。5.Isocaudiners:同尾酶。來源不一樣、識別序列不一樣,但產(chǎn)生相似粘性末端的酶。6.Sitepreferences:位點(diǎn)偏愛。某些限制酶對同一介質(zhì)中的不一樣位置的同一種識別序列體現(xiàn)出不一樣的切割效率的現(xiàn)象稱為位點(diǎn)偏愛。7.Staractivity星星活性。在極端非原則條件下,限制酶能切割與識別序列相似的序列,這個(gè)變化的特殊性稱星星活性。8.Nickingenzyme切口酶。有些限制酶只切割雙鏈DNA中的一條鏈,產(chǎn)生單鏈缺口,這種酶稱為切口酶。9.KlenowfragmentKlenow片段。KlenowDNA聚合酶是E.coliDNApolymerase經(jīng)蛋白酶(枯草桿菌蛋白酶)裂解而從全酶中除去5'--3'外切活性的多肽大片段,而聚合活性和3'--5'外切活性不受影響。10.Sequenase測序酶。是改造的T7噬菌體DNA聚合酶,切除了99%以上的3'--5'外切活性。SequenaseVersion2切除了所有的3'--5'外切活性,用于雙脫氧鏈終止法對長片段進(jìn)行測序。11.Reversetranscriptase反轉(zhuǎn)錄酶。即依賴于RNA的DNA聚合酶,它有5'--3'合成DNA活性,不過無3'--5'外切活性。它來自AMV(禽成髓細(xì)胞瘤病毒)或Mo-MLV(Moloney鼠白血病病毒,又稱M-MuLV)。12.Terminaltransferase末端轉(zhuǎn)移酶。來源于小牛胸腺,是存在于前淋巴細(xì)胞及分化初期的類淋巴樣細(xì)胞內(nèi)的一種不尋常的DNA聚合酶,在二價(jià)陽離子存在下,末端轉(zhuǎn)移酶催化dNTP加于DNA分子的3'羥基端。若dNTP為T或C,此二價(jià)陽離子首選鈷離子;若dNTP為A或G,此二價(jià)陽離子首選鎂離子。13.Ligase連接酶。催化DNA5'磷酸基與3'羥基之間形成磷酸二酯鍵,將兩段核酸連接起來的酶。14.T4polynucleotidekinaseT4多核苷酸激酶。催化ATP的γ-磷酸基轉(zhuǎn)移至DNA或RNA的5'末端。15.Alkalinephosphatase堿性磷酸酶。重要來源于牛小腸(Calfintestinalalkalinephosphatase),簡稱CIP或CIAP,也有來自細(xì)菌(BAP)。催化除去DNA或RNA5'磷酸。16.S1nucleaseSl核酸酶。來源于米曲霉(Aspergillusoryzae),可降解單鏈DNA或RNA,產(chǎn)生帶5'磷酸的單核苷酸或寡核苷酸雙鏈;對dsDNA,dsRNA,DNA:RNA雜交體不敏感。17.ExonuleaseЩ外切核酸酶Щ。來源于大腸桿菌,催化從dsDNA3'-OH逐一清除單核苷酸的反應(yīng),底物為dsDNA或線狀和帶切口或缺口的環(huán)狀DNA,反應(yīng)成果是在dsDNA上產(chǎn)生長的單鏈區(qū)。18.Singlestrandbindingprotein單鏈結(jié)合蛋白。此蛋白能協(xié)同地與ssDNA結(jié)合而不與dsDNA結(jié)合,可以減弱鏈內(nèi)二級構(gòu)造的穩(wěn)定性,從而加速互補(bǔ)多核苷酸的重新退火,并通過消除阻礙DNA聚合酶前進(jìn)的鏈內(nèi)二級構(gòu)造,而提高這些聚合酶的持續(xù)作用能力。19.ProteinaseK蛋白酶K是具有高活性的絲氨酸蛋白酶,屬枯草桿菌蛋白酶,可以水解范圍廣泛的肽鍵,尤其適合水解羧基末端至芳香族氨基酸和中性氨基酸之間的肽鍵。K指該蛋白酶通過水解角蛋白(keratin)可認(rèn)為該霉菌提供所有所需的碳源和氮源。20.Lysozymes溶菌酶。一類水解細(xì)菌細(xì)胞壁中肽聚糖的酶,常用的是卵清溶菌酶,用于破碎細(xì)胞。二.填空題1.Ecok的一般分子構(gòu)成為R2M2S,在這些亞基中,R亞基具有()的作用,M亞基具有()的作用,S亞基具有()的作用,當(dāng)該該酶發(fā)生作用時(shí),需用到的輔因子有:()、()、()。限制酶;甲基化;識別DNA序列;ATP;SAM;Mg2+2.限制性內(nèi)切核酸酶(Restrictionendonuclease)的命名是按屬名和種名相結(jié)合的原則的,一般第一種大寫字母取自(),第二、三個(gè)字母取自(),第四個(gè)字母則用()表達(dá)。參照答案:屬名的第一種字母;種名的前兩個(gè)字母;菌株名3.Ⅱ型限制酶識別回文對稱序列,在回文序列()或()切割DNA,產(chǎn)生帶3'-OH和5'-P基團(tuán)的DNA的產(chǎn)物,需()的存在才能發(fā)揮活性,對應(yīng)的修飾酶只需SAM。參照答案:內(nèi)部;附近;Mg2+4.從因特網(wǎng)上可以找到限制酶的數(shù)據(jù)庫(),該網(wǎng)站由NewEnglandBiolabs企業(yè)維護(hù)()。REBASE5.識別相似序列的限制酶稱()同裂酶6.Ⅰ-CeuI酶是衣滴蟲葉綠體大rRNA基因的內(nèi)含子編碼的產(chǎn)物,識別位點(diǎn)為()bp,識別的關(guān)鍵部位為()至()位置的19bp,反應(yīng)溫度為37℃7.位點(diǎn)偏愛是指:()限制酶對不一樣位置的同一種識別序列體現(xiàn)出不一樣的切割效率8.1單位NaeⅠ或NarⅠ的定義:()參照答案:切割1μg腺病毒2DNA在50ul體系中1小時(shí)所需的酶量9.有些限制酶只切割雙鏈DNA中的一條鏈,產(chǎn)生單鏈缺口,即()切口酶10.個(gè)體間DNA限制性片段長度的差異叫()限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)11.DNA載體經(jīng)HindⅢ切割后產(chǎn)生粘性末端,能發(fā)生載體自連,影響載體與外源DNA的連接效率,常用的防止載體自連的措施有()、()。去磷酸化;部分補(bǔ)平12.完全的回文序列應(yīng)具有兩個(gè)特點(diǎn)即()和()。參照答案:可以在中間劃一種對稱軸,兩側(cè)的序列兩兩對稱互補(bǔ)配對;兩條互補(bǔ)鏈的5'--3'的序列構(gòu)成相似,即將一條鏈旋轉(zhuǎn)180°,則兩條鏈重疊13.DcmMethylase(Dcm甲基化酶)的識別序列為()和(),該酶的作用位點(diǎn)為()。CCTGG;CCAGG;第二個(gè)胞嘧啶C的C5位置填空題問題:大腸桿菌中至少有三種依賴于甲基化的限制系統(tǒng)()、()、()。它們識別的序列各不相似,但只識別通過甲基化的序列,都限制CpG甲基化酶作用的DNA。mcrA;mcrBC;mrr14.分別寫出如下限制性內(nèi)切核酸酶(Restrictionendonuclease)的識別序列EcoRⅠ()、Sau3AⅠ()、HindⅢ()。GAATTC;GATC;AAGCTT15.Weiss單位的定義為()參照答案:在37℃下20分鐘內(nèi)催化1nmol32P從焦磷酸根置換到[γ,β16.限制性內(nèi)切核酸酶(Restrictionendonuclease)一般保留在()濃度的甘油溶液中。50%17.載體和外源DNA經(jīng)酶切,在進(jìn)行下一步操作前,需消除限制性內(nèi)切核酸酶(Restrictionendonuclease)的影響。常用的措施有()、()、()、()。參照答案:EDTA法;加熱法;苯酚抽提法;試劑盒除酶法18.對DNA進(jìn)行雙酶切時(shí),酶切緩沖液的選擇原則有(1)()、(2)()、(3)()參照答案:可選用都合適的緩沖液或通用緩沖液;若緩沖液不可替代則先用低濃度的,再加適量NaCl和第二種酶;先用低鹽緩沖液再用高鹽緩沖液19.DnaseⅠ為內(nèi)切核酸酶,在不一樣的輔因子條件下,產(chǎn)生不一樣的酶切效果,當(dāng)Mg2+存在時(shí)();當(dāng)Mn2+存在時(shí)()。參照答案:獨(dú)立作用于每條DNA鏈,且切割位點(diǎn)隨機(jī);可在兩條鏈的大體同一位置切割dsDNA,產(chǎn)生平端或1到2個(gè)核甘酸突出的DNA片斷20.KlenowDNA聚合酶是E.coliDNApolymerase經(jīng)蛋白酶裂解而從全酶中除去()活性的多肽大片斷,而其他活性保持不變。5'--3'的外切活性T4phageDNApolymerase分子量為()kDa,該酶的3'--5'的外切活性比Klenow酶強(qiáng)()倍,由于它不從單鏈DNA模板上替代引物,故可用于()。114;200;提高誘變反應(yīng)21.反轉(zhuǎn)錄酶來自AMV或Mo-MLV,即依賴于RNA的DNA聚合酶,它有()活性,但無()活性。5'--3'合成DNA的;3'--5'的外切22.末端轉(zhuǎn)移酶來源于(),是存在于前淋巴細(xì)胞及分化初期的類淋巴樣細(xì)胞內(nèi)的一種不尋常的DNA聚合酶,在()存在下,末端轉(zhuǎn)移酶催化dNTP加于DNA分子的3'羥基端。小牛胸腺;Mg2+23.T4DNA連接酶的分子量為68kDa,它可以催化DNA5'磷酸基與3'羥基之間形成磷酸二酯鍵。反應(yīng)底物為粘端、切口、平端的RNA或DNA。低濃度()和()可以提高平端連接效率。聚乙二醇PEG;單價(jià)陽離子24.E.coliDNA連接酶與T4DNA連接酶相似,但需()的參與,且其平端連接效率低常用于置換合成法。煙酰胺-腺嘌呤二核苷酸(NAD+)T4多核苷酸激酶在高濃度的ATP時(shí)發(fā)揮最佳活性,()是其強(qiáng)烈克制劑。NH4+25.BAL31核酸酶重要活性為3'外切核酸酶活性,可從線性DNA兩條鏈的3'端清除掉單核苷酸;還可從內(nèi)部切割核酸,作用于單鏈。BAL31發(fā)生作用依賴(),()可克制其活性。Ca2+;EGTA26.綠豆核酸酶來源于綠豆芽,與S1酶相似,但比S1酶更溫和,在()上才切割,可使DNA突出端變成平端。大切口27.核糖核酸酶A來源于牛胰,為內(nèi)切核酸酶,可特異襲擊()??沙NA:RNA中未雜交的RNA區(qū),可用來確定DNA或RNA中單堿基突變的位置。RNA上嘧啶殘基的3'端28.用于構(gòu)建嵌套缺失體常用到的核酸酶有()、()、()。DnaseⅠ;外切核酸酶Ⅲ;BAL3129.瓊脂糖酶作用于低熔點(diǎn)瓊脂糖,它的活性是可切割瓊脂糖酶亞單位。由于此酶可分解瓊脂糖,因此應(yīng)用于()。分離大片段DNA三.選擇題1.限制性內(nèi)切酶一般保留在()濃度的甘油溶液中。C50%點(diǎn)評:合適濃度的甘油和二甲基亞砜可以作為冰凍保護(hù)劑,保護(hù)生物大分子的活性。2.限制性圖譜與限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)圖譜的最明顯區(qū)別在于()參照答案:A前者是物理圖譜后者是連鎖圖點(diǎn)評:詳細(xì)理解兩者的概念3.迄今為止所發(fā)現(xiàn)的限制性內(nèi)切核酸酶可以作用于()只能作用于雙鏈DNA點(diǎn)評:限制性內(nèi)切核酸酶的識別和切割序列有很強(qiáng)的特異性,尤其是第Ⅱ型的限制性內(nèi)切酶。4.已知某一內(nèi)切酶在一種環(huán)狀DNA上有4個(gè)切點(diǎn),當(dāng)用此酶切割該環(huán)狀DNA,可以得到(4)個(gè)片段點(diǎn)評:注意DNA分子的形狀,其他條件相似的時(shí)候,線狀比環(huán)狀產(chǎn)生的片段要多一種。5.甘油會使許多限制性內(nèi)切核酸酶的特異性發(fā)生變化,是導(dǎo)致某些酶星星活性的重要原因之一,防止的措施是在酶切反應(yīng)體系中,將甘油的濃度控制在()如下A5%點(diǎn)評:低溫下保留生物大分子時(shí),甘油可以作為冰凍保護(hù)劑,但反應(yīng)體系中甘油濃度過高會導(dǎo)致星星活性。6.在下列進(jìn)行DNA部分酶切的條件中,控制哪一項(xiàng)最佳()D酶量點(diǎn)評:多種酶均有適合自己的反應(yīng)溫度;同步根據(jù)酶反應(yīng)動力學(xué),酶切反應(yīng)一定期間后酶的活性就會減弱或喪失,因此控制酶量是最合適的7.下列試劑中,哪一種可以螯合Ca2+離子()DEGTA點(diǎn)評:EDTA螯合Mg2+等金屬離子,EGTA螯合Ca2+離子。8.DNA被某種酶切割后,電泳得到的電泳帶有些擴(kuò)散,下列原因中,哪一項(xiàng)不太也許()C酶失活點(diǎn)評:理解限制性內(nèi)切酶酶切本質(zhì)和DNA電泳試驗(yàn)原理。9.nick與gap的區(qū)別在于()A前者是斷開了一種磷酸二酯鍵,后者是指DNA的單鏈中有較小的缺失10.可以在切口部位起作用的酶是()BS1核酸酶點(diǎn)評:BAL31核酸酶重要活性為3'外切核酸酶活性,可以從線性DNA兩條鏈的3'端去掉單核苷酸;S1核酸酶可降解單鏈DNA或RNA,產(chǎn)生帶5'磷酸的單核苷酸或寡核苷酸,中等濃度可在切口或小缺口處切割雙鏈;核糖核酸酶A可以特異襲擊RNA上的嘧啶殘基的3'端,可除去DNA:RNA中未雜交的RNA區(qū);λ外切核酸酶可以作用于dsDNA,持續(xù)逐一釋放5’單核苷酸。11.Klenow酶與DNA聚合酶相比,前者喪失了()活性參照答案:A5'--3'外切酶點(diǎn)評:KlenowDNA聚合酶是E.coliDNApolymerase經(jīng)蛋白酶(枯草桿菌蛋白酶)裂解而從全酶中除去5'--3'外切活性的多肽大片段,而聚合活性和3'--5'外切活性不受影響。12.限制酶的命名遵照一定的原則,波及來源(宿主),菌株或生物型。命名時(shí)()參照答案:A屬名第一字母,種名頭兩個(gè)字母,菌株號,然后再加上序號(羅馬字)點(diǎn)評:限制酶的命名遵照一定的原則,波及來源(宿主),菌株或生物型。命名時(shí),依次取屬名第一字母,種名頭兩個(gè)字母,菌株號,然后再加上序號(羅馬字)如下對同裂酶的描述中,哪一項(xiàng)是對的的()A識別相似序列的限制酶稱同裂酶點(diǎn)評:識別相似序列的限制酶稱同裂酶,但它們的切割位點(diǎn)也許不一樣。詳細(xì)可分為:同裂同切酶、同序異切酶、“同功多位”等13.下列DNA聚合酶中,哪一種酶只切割雙鏈DNA中的一條鏈,產(chǎn)生單鏈切口,即切口酶()ADnaseⅠ點(diǎn)評:在Mg2+存在下,獨(dú)立作用于每條DNA鏈,且切割位點(diǎn)隨機(jī)。在Mn2+存在下,它可在兩條鏈的大體同一位置切割dsDNA,產(chǎn)生平端或1~2個(gè)核苷酸突出的DNA片段;KlenowDNA聚合酶是E.coliDNApolymerase經(jīng)蛋白酶(枯草桿菌蛋白酶)裂解而從全酶中除去5'--3'外切活性的多肽大片段,而聚合活性和3'--5'外切活性不受影響;T4噬菌體DNA聚合酶與KlenowDNA聚合酶相似,但3'--5'外切活性強(qiáng)200倍,且不從單鏈DNA模板上替代引物;T7噬菌體DNA聚合酶的活性功能與T4噬菌體DNA聚合酶和KlenowDNA聚合酶類似,但3'--5'外切活性為Klenow的1000倍。14.BAP與CIAP的區(qū)別在于()BCIAP68℃時(shí)失活,而BAP68點(diǎn)評:CIAP來源于牛小腸堿性磷酸酶,而BAP來自細(xì)菌的堿性磷酸酶。BAP抗性強(qiáng)、抗高溫和清除污劑。CIAP可用蛋白酶K消化滅活,或在5mMEDTA下。65℃或75℃處理10分鐘,然后用酚、氯仿抽提,純化去磷酸化的DNA,從而除去CIAP的活性。15.下列哪一種酶作用時(shí)需要引物()B反轉(zhuǎn)錄酶點(diǎn)評:其他三種酶均只需要DNA鏈即可16.CIAP催化脫磷酸時(shí)有兩種最適溫度,37℃和56點(diǎn)評:3'端突出時(shí),磷酸基團(tuán)是內(nèi)陷的,需要劇烈一點(diǎn)的反應(yīng)條件。17.有關(guān)宿主控制的限制修飾現(xiàn)象的本質(zhì),下述描述中只有()不恰當(dāng)參照答案:D這一系統(tǒng)的核酸酶都是Ⅱ類限制性內(nèi)切核酸酶點(diǎn)評:根據(jù)酶的亞單位構(gòu)成、識別序列的種類和與否需要輔助因子,限制與修飾系統(tǒng)至少可分為四類:Ⅱ型、Ⅱs型、Ⅰ型、Ⅲ型18.限制性內(nèi)切核酸酶可以特異性地識別()C雙鏈DNA的特定堿基序列點(diǎn)評:理解限制性內(nèi)切酶的識別序列。19.如下為同尾酶的是()BBamHⅠ,Sau3AⅠ,StyⅠ點(diǎn)評:所謂同尾酶即他們可以產(chǎn)生相似的粘性突出末端。其中B選項(xiàng)中BamHⅠ識別位點(diǎn)為G↓GATCC,Sau3AⅠ識別位點(diǎn)為↓GATC,StyⅠ識別位點(diǎn)為CC↓WWGG。(W=AorT)在長模板鏈的指導(dǎo)下引物延伸合成長的DNA互補(bǔ)鏈時(shí)應(yīng)選用()BT7DNA聚合酶點(diǎn)評:T7DNA聚合酶是所有DNA聚合酶中持續(xù)合成能力最強(qiáng)的一種20.在大腸桿菌中,大多數(shù)均有三個(gè)位點(diǎn)特異性的DNA甲基化酶,如下選項(xiàng)中哪一種酶不包括在內(nèi)()DSssⅠ點(diǎn)評:SssⅠ甲基化酶來自原核生物Spiroplasma21.在大腸桿菌中,至少有3種依賴于甲基化的限制系統(tǒng),如下選項(xiàng)中不屬于這3種的為()CmcrD點(diǎn)評:無mcrD22.如下幾種核酸酶中,不能用于嵌套缺失的為()BS1核酸酶點(diǎn)評:S1核酸酶可降解單鏈DNA或RNA,酶濃度大時(shí)可完全消化雙鏈,中等濃度可在切口或小缺口處切割雙鏈。23.下面有關(guān)限制酶的論述哪個(gè)是錯誤的()A限制酶是外切酶而不是內(nèi)切酶點(diǎn)評:理解限制性內(nèi)切酶的特性。24.在下列酶中,催化反應(yīng)不需要ATP的是()DBamHⅠ點(diǎn)評:Ⅰ型和Ⅲ型限制性內(nèi)切酶在發(fā)生限制作用時(shí)需要ATP,Ⅱ型則不需要,而BamHⅠ為Ⅱ型限制性內(nèi)切酶,在催化反應(yīng)時(shí)不需要ATP25.DNA連接酶在體內(nèi)的重要作用是在DNA復(fù)制、修復(fù)中封閉缺口,下列對DNA連接酶的描述中,那項(xiàng)是對的的()參照答案:A將雙鏈DNA分子中的5'磷酸基團(tuán)同3'-OH末端重新形成磷酸二酯鍵點(diǎn)評:理解DNA連接酶的特性。26.下列酶中,除()外都具有磷酸酶的活性ABamHⅠ點(diǎn)評:磷酸酶活性包括磷酸化活性和去磷酸化活性。四.簡答題1.簡述限制性內(nèi)切核酸酶(Restrictionendonuclease)的概念及其生物學(xué)功能?參照答案:定義:指識別DNA的特異序列,并在識別位點(diǎn)或其周圍切割雙鏈DNA的一類內(nèi)切酶。生物學(xué)功能:保護(hù)宿主不受外來DNA分子的感染,可降解外來的DNA分子,從而制止其復(fù)制和整合到細(xì)胞中。2.PCR引物設(shè)計(jì)引入酶切位點(diǎn)時(shí),為何需在酶切位點(diǎn)后加上某些堿基?參照答案:限制酶切割DNA時(shí)對識別序列兩端的非識別序列有長度規(guī)定,也就是說在識別序列兩端必須要有一定數(shù)量的核苷酸,否則限制酶將難以發(fā)揮切割活性。因此,一般需在設(shè)計(jì)引物時(shí)在限制酶切位點(diǎn)外另加3~4個(gè)堿基。3.試回答影響限制性內(nèi)切核酸酶(Restrictionendonuclease)切割效率的原因?參照答案:外因:反應(yīng)條件、底物純度、反應(yīng)溫度和限制性內(nèi)切酶自身的活性;內(nèi)因:位點(diǎn)偏愛性;甲基化;底物的構(gòu)象。4.在酶切緩沖液中,一般需加入BSA,請問加入BSA的作用是什么?并簡述其原理?參照答案:作用是提供一定的蛋白質(zhì)濃度,起保護(hù)限制性內(nèi)切酶的作用。限制性內(nèi)切酶在稀釋液中會迅速變性,BSA是一種很好的可加入酶反應(yīng)液中的中性蛋白質(zhì)。5.何謂Staractivity?簡述Staractivity的影響原因及克服措施?參照答案:在極端非原則條件下,限制酶能切割與識別序列相似的序列,這個(gè)變化的特性稱為星星活性。引起星星活性的的原因:①高甘油濃度(>5%);②酶過量(>100U/ml);③低離子強(qiáng)度(<25mM);④高pH(>8.0);⑤有機(jī)溶劑如PMSD(二甲基亞砜)、乙醇、乙二醇、二甲基乙酰胺(dimethylacetamide)、二甲基甲酰胺(dimethylformamide)和sulphalane等;⑥用其他二價(jià)陽離子Mn2+、Cu2+、Co2+或Zn2+替代Mg2+。星星活性的克制措施:①減少酶的用量,防止過量酶切,減少甘油濃度;②保證反應(yīng)體系中無有機(jī)溶劑或乙醇;③提高離子強(qiáng)度到100~150mM(在不克制酶活性的前提下);④減少反應(yīng)pH至7.0;⑤使用Mg2+作為二價(jià)陽離子。6.某DNA序列中存在DpnI酶切位點(diǎn),以此DNA為模板,在體外合成DNA序列,當(dāng)用該酶進(jìn)行酶切時(shí),發(fā)現(xiàn)切割不動,試分析也許原因?參照答案:生物體內(nèi)的DNA序列也許是通過甲基化修飾的,而在體外合成時(shí),缺乏這種修飾作用。當(dāng)用依賴于甲基化的限制酶DpnI來切割非甲基化的序列時(shí),就會出現(xiàn)不能切割的狀況。7.天然的質(zhì)粒載體(plasmidvectors)一般需經(jīng)改造后才能應(yīng)用,包括清除不必要的片段,引入多克隆位點(diǎn)等。試問在此過程中怎樣增減酶切位點(diǎn)?參照答案:在酶切水平上,通過酶切和連接產(chǎn)生新的酶切位點(diǎn)。①將產(chǎn)生的5'突出端補(bǔ)平后,再連接以產(chǎn)生新的酶切位點(diǎn);②同尾末端的連接,不一樣的同尾酶切割DNA產(chǎn)生的末端,再互相連接時(shí),可產(chǎn)生新的酶切位點(diǎn),同步本來的酶切位點(diǎn)卻消失;③平末端的連接8.雙脫氧終止法測定DNA序列的片段一般不能太長,怎樣運(yùn)用本章所學(xué)知識測定較長片段的DNA序列?參照答案:①將所需要測序的DNA片斷采用2種不一樣的限制性內(nèi)切酶切割,產(chǎn)生不一樣的酶切片段,將此酶切片段連接到載體上,測序后,拼接,即可得到全長的DNA序列;②用一種限制性內(nèi)切酶進(jìn)行部分酶切,酶切產(chǎn)物與載體連接后,測序,拼接,即可得到全長DNA片斷。采用以上任一措施均可,需要注意的是,在進(jìn)行部分酶切時(shí),應(yīng)當(dāng)控制好條件,要保證所得到的酶切片斷能覆蓋所需測序的DNA片斷。9.大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ,具有3'--5’參照答案:①運(yùn)用E.coliDNA聚合酶的5'--3'外切核酸酶活性,可用切口平移法標(biāo)識DNA,所有DNA聚合酶中只有此酶有此反應(yīng);②用于cDNA克隆中的第二鏈,即單純的DNA聚合活性;③對3'突出端的DNA作末端標(biāo)識(互換或置換反應(yīng))。10.用T4phageDNApolymerase可進(jìn)行末端標(biāo)識,試簡述其原理?參照答案:T4phageDNA聚合酶具有3'--5'外切活性和5'--3'的聚合酶活性,3'--5'的外切活性可以被5'--3'的聚合活性所封閉,首先在反應(yīng)體系中加入一種dNTP,產(chǎn)生3'凹端,然后加入通過標(biāo)識的dNTP,運(yùn)用T4phageDNA聚合酶的聚合活性補(bǔ)平3'凹端,即可得到標(biāo)識了末端的DNA片斷。11.BAP和CIAP有何作用?為何一般采用CIAP而不采用BAP?參照答案:作用:催化除去DNA或RNA5'磷酸。BAP抗性強(qiáng),抗高溫和去污劑。CIAP可用蛋白酶K消化滅活,或在5mMEDTA下,65℃處理或7512.依賴于DNA的RNA聚合酶包括SP6噬菌體RNA聚合酶和T4或T7噬菌體RNA聚合酶,此類聚合酶可用于體現(xiàn)外源基因,論述常用的構(gòu)建方略?參照答案:①將T7RNA聚合酶基因置于E.colilacUV5啟動子之下,插入到λ噬菌體中,感染E.coli,建立穩(wěn)定的溶源菌。E.coliBL21(DE3)菌株即為將lacUV5啟動子和T7聚合酶基因置于λ噬菌體DE3區(qū),該λ噬菌體DNA整合于染色體的BL21處。若將T7噬菌體啟動子控制的目的基因經(jīng)質(zhì)粒載體導(dǎo)入該宿主菌中,在IPTG誘導(dǎo)下,可啟動外源基因的體現(xiàn);②先導(dǎo)入帶T7噬菌體啟動子控制的目的基因的質(zhì)粒,再用λ噬菌體(帶T7RNA聚合酶基因)感染E.coli,激活目的基因的體現(xiàn)。13.簡述T4多核苷酸激酶的活性和用途?參照答案:T4多核苷酸激酶的活性催化ATP的γ-磷酸基轉(zhuǎn)移到DNA或RNA的5'末端??审w現(xiàn)為兩種反應(yīng),正反應(yīng)指ATP的γ-磷酸基被轉(zhuǎn)移到去磷酸化的DNA5'端,用于對缺乏5'-磷酸的DNA進(jìn)行磷酸化。在互換反應(yīng)中,過量的ATP可使該激酶將磷酸化的5'端磷酸轉(zhuǎn)移給ADP,然后DNA從【γ-32P】ATP中獲得放射性標(biāo)識的γ-磷酸而重新磷酸化,因此可用于DNA的末端標(biāo)識。用途:該酶重要用于對缺乏5'-磷酸的DNA或合成接頭進(jìn)行磷酸化,同步可對末端進(jìn)行標(biāo)識。通過互換反應(yīng),用于標(biāo)識5'末端,以供Maxam-Gilbert法測序、S1核酸酶分析以及其他須使用末端標(biāo)識DNA的環(huán)節(jié)。思索題問題:限制性內(nèi)切酶可劃分為哪幾種類型,各自有何特點(diǎn)?思索題問題:哪些酶可用于DNA片段的末端標(biāo)識?思索題問題:DNA聚合酶有哪些類型,各有什么活性?思索題問題:在分子克隆中所用的酶重要作用于哪些底物?第三章一.名詞解釋1.Vehicle載體。將外源DNA或基因攜帶入宿主細(xì)胞(hostcell)的工具稱為載體。具有如下三個(gè)必須元件:復(fù)制原點(diǎn)、多克隆位點(diǎn)和篩選標(biāo)識。2.Geneclone基因克隆??寺∽鲃釉~時(shí),指從單一祖先產(chǎn)生同一的DNA分子群體或細(xì)胞群體的過程;作名詞時(shí)指從一種共同祖先無性繁殖下來的一群遺傳上同一的DNA分子、細(xì)胞或個(gè)體所構(gòu)成的特殊的生命群體。運(yùn)用重組DNA技術(shù)分離目的基因,稱之為基因克隆。3.Genelibrary基因文庫。由大量的具有基因組DNA(即某畢生物的所有DNA次序)的不一樣DNA片段的克隆所構(gòu)成的群體,稱之為基因文庫。4.Plasmidincompatibility質(zhì)粒不相容性。運(yùn)用同一復(fù)制系統(tǒng)的兩個(gè)質(zhì)粒在同一宿主中不能共存的現(xiàn)象稱質(zhì)粒的不相容性,它是指在第二個(gè)質(zhì)粒導(dǎo)入后,在不波及DNA限制系統(tǒng)時(shí)出現(xiàn)的現(xiàn)象。5.α-complementationα-互補(bǔ)。指lacZ基因上缺失近操縱基因區(qū)段的突變體與帶有完整的近操縱基因區(qū)段的α-半乳糖苷酶陰性的突變體之間實(shí)現(xiàn)的互補(bǔ)。這兩個(gè)無酶學(xué)活性的產(chǎn)物混合在一起時(shí),可恢復(fù)α-半乳糖苷酶的活性。6.X-gal/IPTG兩者都是乳糖的衍生物,X-gal:乳糖操縱子底物,可以作為生色劑,被α-半乳糖苷酶分解后可產(chǎn)生蘭色產(chǎn)物,可使菌落展現(xiàn)蘭色;IPTG:乳糖操縱子誘導(dǎo)物。7.lyticgrowth裂解生長狀態(tài)。噬菌體侵染宿主細(xì)胞后,大量復(fù)制并組裝成子代噬菌體顆粒,導(dǎo)致宿主細(xì)胞裂解的現(xiàn)象稱裂解生長狀態(tài)。8.lysogenicstate溶源狀態(tài)。噬菌體侵染宿主細(xì)胞后,將λ噬菌體基因組DNA通過位點(diǎn)專一性重組整合到宿主的染色體DNA中,并隨宿主的繁殖傳給子代細(xì)胞的現(xiàn)象稱溶源狀態(tài)。9.Multiplicityofinfection感染復(fù)數(shù)。指單個(gè)宿主細(xì)胞感染的噬菌體顆粒數(shù),等于試驗(yàn)所用的噬菌體與細(xì)胞的數(shù)量之比。10.Insertionvectors插入型載體。通過特定的酶切位點(diǎn)容許外源DNA片段插入的載體稱為插入型載體。11.Replacementvectors置換型載體。而容許外源DNA片段替代載體的非必須DNA片段的載體,稱為置換型載體。12.Cosmid粘粒。帶有將DNA包裝到噬菌體顆粒中所需的cos序列的質(zhì)粒。包括質(zhì)粒復(fù)制起點(diǎn),可以象質(zhì)粒同樣轉(zhuǎn)化并增殖;包括cos位點(diǎn),可以象噬菌體顆粒同樣包裝、侵染。13.ReplicativeformDNA復(fù)制型DNA。在宿主細(xì)胞內(nèi),感染性的單鏈?zhǔn)删wDNA(正鏈)在宿主酶的作用下轉(zhuǎn)變成環(huán)狀雙鏈DNA,用于DNA的復(fù)制,這種雙鏈DNA稱為復(fù)制型DNA。14.Phagemid噬菌粒。具有ColE1復(fù)制起點(diǎn)及單拷貝的絲狀體噬菌體重要基因間隔區(qū)的質(zhì)粒載體。此基因間隔區(qū)含病毒DNA合成的起始與終止及噬菌體顆粒形態(tài)發(fā)生所必須的所有順式作用序列。含phagemid的細(xì)菌被噬菌體感染后,基因Ⅱ蛋白作用于間隔區(qū),啟動滾環(huán)復(fù)制產(chǎn)生ssDNA并進(jìn)行包裝。15.M13K07helpphageM13KO7輔助噬菌體。M13單鏈絲狀噬菌體的衍生株,基因Ⅱ帶有一種G--T的突變。M13KO7基因組雙鏈DNA可體現(xiàn)產(chǎn)生子代單鏈DNA所必需的所有蛋白。M13K07中突變的基因Ⅱ產(chǎn)物與自身攜帶的噬菌體復(fù)制起點(diǎn)的作用尚不如它與克隆于噬菌粒pUCll8和pUCll9中的病毒復(fù)制起點(diǎn)的作用有效,可以保證在細(xì)胞所產(chǎn)生的病毒顆粒中來自噬菌粒的單鏈DNA可以占據(jù)優(yōu)勢。16.Yeastartificialchromosomes酵母人工染色體載體。運(yùn)用釀酒酵母(Saccharomycescerevisiae)染色體的復(fù)制元件來驅(qū)動外源DNA片段復(fù)制的載體稱為酵母人工染色體載體。由自主復(fù)制序列、著絲粒、復(fù)制子及選擇標(biāo)識等元件構(gòu)成。17.Bacterialartificialchromosomes細(xì)菌人工染色體。是基于大腸桿菌的F質(zhì)粒構(gòu)建的高通量低拷貝質(zhì)粒載體。包括嚴(yán)謹(jǐn)型控制的復(fù)制區(qū)oriS、啟動DNA復(fù)制的由ATP驅(qū)動的解旋酶((RepE),以及三個(gè)保證低拷貝并使質(zhì)粒精確分派至子代細(xì)胞的基因座(parA,parB和parC)等元件)。18.P1artificialchromosomesP1人工染色體載體。結(jié)合了P1載體和BAC載體的特性,是P1噬菌體載體的改善載體。重組分子不能通過體外包裝來感染宿主細(xì)胞,而只能通過電轉(zhuǎn)化來將重組分子導(dǎo)入宿主細(xì)胞。19.Shuttlevector穿梭載體??梢栽趦深惒灰粯拥乃拗髦袕?fù)制、增殖和選擇的載體稱為穿梭載體。二.填空題1.載體(Vehicle)的類型有(),(),(),()等。參照答案:質(zhì)粒載體;噬菌體載體;粘粒載體;噬菌粒載體2.Genecloning是指(),基因文庫(Genelibrary)是指()。參照答案:運(yùn)用重組DNA技術(shù)分離目的基因;由大量的具有基因DNA(即某畢生物的所有DNA次序)的不一樣DNA片段的克隆所構(gòu)成的群體3.Plasmid的定義是(),Plasmid能進(jìn)行自我復(fù)制,大多數(shù)為()鏈()狀DNA分子,大小一般為()kb。染色體外的遺傳因子;雙;閉環(huán);1~2004.()即為質(zhì)粒的拷貝數(shù),按照質(zhì)粒拷貝數(shù)的多少,質(zhì)??梢苑譃椋ǎ┖停ǎǎ┵|(zhì)粒多數(shù)是某些具有轉(zhuǎn)移能力的大質(zhì)粒;()質(zhì)粒多數(shù)是某些不具有轉(zhuǎn)移能力的小質(zhì)粒。參照答案:單個(gè)細(xì)胞中所具有的質(zhì)粒DNA分子數(shù)目;嚴(yán)謹(jǐn)型;松弛型;嚴(yán)謹(jǐn)型;松弛型填空題松弛型質(zhì)粒和嚴(yán)謹(jǐn)型質(zhì)粒融合后來,雜合質(zhì)粒一般優(yōu)先使用()的復(fù)制子。松弛型5.()稱之為質(zhì)粒的不相容性。假如兩個(gè)質(zhì)粒不能穩(wěn)定地共存于同一種寄主細(xì)胞中,則它們屬于()(填相似或不一樣)的不相容群。參照答案:兩個(gè)質(zhì)粒在同一宿主中不能共存的現(xiàn)象;相似6.質(zhì)粒具有轉(zhuǎn)移性,它是指(),它需要(),()和()參照答案:在自然條件下,諸多質(zhì)??梢酝ㄟ^稱為細(xì)菌接合的作用轉(zhuǎn)移到新宿主內(nèi);移動基因mob;轉(zhuǎn)移基因tra;轉(zhuǎn)移起始位點(diǎn)7.根據(jù)質(zhì)粒的轉(zhuǎn)移性可以將質(zhì)粒分為()和(),一般大質(zhì)粒都是(),()一般都是小質(zhì)粒,其上沒有()參照答案:接合型質(zhì)粒;非接合型質(zhì)粒;接合型質(zhì)粒;非接合型質(zhì)粒;編碼其DNA轉(zhuǎn)移的基因8.按其用途可將標(biāo)識基因分為選擇標(biāo)識和篩選標(biāo)識,選擇標(biāo)識一般用于(),篩選標(biāo)識一般用于()鑒別目的DNA(載體)的存在;將特殊表型的重組子挑選出來9.常用的用來鑒定重組質(zhì)粒的細(xì)菌菌落的措施有(),(),()等。參照答案:α-互補(bǔ);插入失活;原位雜交10.pBR322質(zhì)粒是基因工程最重要的人工質(zhì)粒之一,它的大小約為()kb,用于其組建的三個(gè)親本質(zhì)粒是(),(),和()。此質(zhì)粒具有一種colE1松弛型質(zhì)粒復(fù)制子,兩個(gè)篩選標(biāo)識氨芐青霉素抗性基因和四環(huán)素抗性基因,其中colE1松弛型質(zhì)粒復(fù)制子來源于(),氨芐青霉素抗性基因來源于(),四環(huán)素抗性基因來源于()參照答案:4.3;pM131;pSC101;pSF2124;pM131;pSF2124;pSC10111.pUC系列的質(zhì)粒載體是由()和()兩種質(zhì)粒構(gòu)建而來的,其中氨芐青霉素抗性基因來自于(),多克隆位點(diǎn)MCS來自于()。pUC系列的質(zhì)粒載體一般是成對存在的如pUC18和pUC19,其重要區(qū)別是()。參照答案:pBR322;M13mp18/19;pBR322;M13mp18/19;MCS方向不一樣12.質(zhì)粒載體的附加功能要素重要有(),(),()等。參照答案:α-互補(bǔ);ssDNAphageorigin,promotor13.λ噬菌體Genome的長度約為()kb,其DNA分子為()(填單或雙)鏈。它的DNA分子既可以以()狀存在也可以以環(huán)狀存在,并且可以自然成環(huán),其原因是在λ噬菌體的線性分子的兩端各有一種長度為()個(gè)堿基的天然粘性末端,這種粘性末端可以自然成環(huán),成環(huán)后的粘性末端就叫做()。參照答案:50;雙;線;12;cos位點(diǎn)14.λ噬菌體在感染大腸桿菌后來,可以進(jìn)入Lyticgrowth也可以進(jìn)入Lysogenicstate。假如其基因組DNA通過專一性重組整合到宿主染色體中,則其進(jìn)入();它也可以選擇進(jìn)入(),大量復(fù)制并組裝子代噬菌體顆粒。Lysogenicstate;Lyticgrowth15.在λ噬菌體載體中,常用的選擇標(biāo)識有(),cⅠ基因失活,和()等。參照答案:LacZ;spi篩選16.改造后的λ噬菌體才可用作載體,按照改造方式的不一樣可將其分為兩種類型,即插入型載體(insertionvectors)和替代型載體(replacementvectors)。其中Insertionvectors是指();Replacementvectors是指()參照答案:通過特定的酶切位點(diǎn)容許外源DNA片斷插入的載體;容許外源DNA片斷替代載體的非必須DNA片斷的載體17.λgt10是一種由λ噬菌體衍生而來的insertionvectors,重要用于()。它缺失了具有溶源整合的();λgt11載體也是一種insertionvectors,該載體的最大特點(diǎn)是在最左側(cè)可替代區(qū)置換了一段()基因,可編碼β-半乳糖苷酶,在IPTG/X-gal平板上可形成()色噬菌斑。參照答案:克隆小的cDNA;b257;lacZ;藍(lán)18.λ噬菌體由于受到包裝的限制,插入外源DNA片段后,其總的DNA長度應(yīng)當(dāng)在噬菌體genome的()范圍內(nèi)。78%~105%19Cosmid實(shí)際上是由()和()構(gòu)成的雜合載體,也可以說是帶有()序列的質(zhì)粒。cos位點(diǎn);質(zhì)粒;cos20.染色體步查指()。采用一段分離自某一重組體一端的非反復(fù)DNA片段作為探針以鑒定具有相鄰序列的重組克隆。21Cosmid的構(gòu)成包括三個(gè)部分:(),()和(),其中復(fù)制子來源于(),cos序列來源于()。質(zhì)粒復(fù)制起點(diǎn);cos位點(diǎn);抗性標(biāo)識;質(zhì)粒;噬菌體22.λ噬菌體的最大克隆片段是()kb,Cosmid的最大克隆片段可到達(dá)()kb。23;4523.運(yùn)用λ噬菌體載體構(gòu)建的genelibrary中,文庫是以()的形式存在的;用質(zhì)粒載體構(gòu)建的genelibrary是以()的形式存在的;粘粒載體構(gòu)建的genelibrary是以()的形式存在的。噬菌斑;菌落;菌落24.M13噬菌體顆粒是()狀的,其基因組為()(填單或雙)鏈DNA。它只感染()性大腸桿菌,感染宿主后來,其噬菌體顆粒的釋放不像λ噬菌體那樣要裂解宿主菌,而是()。絲;單;雄;從感染的細(xì)胞中分泌出噬菌體顆粒25.M13噬菌體僅有兩個(gè)大的基因間隔區(qū),分別位于()與()之間以及()和()之間,這些基因間隔區(qū)內(nèi)具有()的元件。其中,()稱為IG區(qū),它有三個(gè)最重要的功能即(),()和()。參照答案:Ⅷ;Ⅲ;Ⅱ;Ⅳ;調(diào)整基因體現(xiàn)和DNA合成;GeneⅡ和GeneⅣ之間的間隔區(qū);具有可對包裝及DNA在病毒顆粒中的定向進(jìn)行調(diào)控的順式作用因子;正鏈與負(fù)鏈DNA合成起始和終止位點(diǎn);不依賴與ρ因子的轉(zhuǎn)錄終止信號26.RFDNA是指()。參照答案:復(fù)制型DNA,感染性的單鏈?zhǔn)删wDNA(正鏈)在宿主酶的作用下轉(zhuǎn)變成環(huán)狀雙鏈DNA,用于DNA的復(fù)制。27.M13K07輔助噬菌體是()的衍生株,它帶有一種來自()的復(fù)制起點(diǎn),還帶有一種來自()的卡那霉素抗性基因,用作選擇標(biāo)識;基因Ⅱ帶有一種()的突變,導(dǎo)致基因蛋白質(zhì)第40位氨基酸由甲硫氨酸變?yōu)楫惲涟彼?。參照答案:M13phage;p15A;Tn903;G-T28.YAC載體基本構(gòu)成元件有(),(),(),()和()。參照答案:復(fù)制起點(diǎn);著絲粒;端粒;MCS;篩選標(biāo)識29.體現(xiàn)載體(Expressvector)是在常規(guī)載體的基礎(chǔ)上衍生而來的,其構(gòu)建的原理重要是增長一種(),以及有助于體現(xiàn)產(chǎn)物的分泌、分離或純化的元件;穿梭載體(Shuttlevector)是指()體現(xiàn)元件;可以在兩類不一樣宿主中復(fù)制、增殖和選擇的載體三.選擇題1.氨芐青霉素的工作原理為()A可以克制細(xì)胞壁肽聚糖的合成點(diǎn)評:B、D為四環(huán)素的工作原理;C為氯霉素的工作原理2.pUC18與pUC19的區(qū)別在于()B兩者的多克隆位點(diǎn)方向相反點(diǎn)評:系列載體的區(qū)別一般不大,重要是克隆方向或讀碼框等方面的差異。3.載體所具有的特點(diǎn)中,如下描述不恰當(dāng)?shù)氖牵ǎ﹨⒄沾鸢福篋必須具有較高的拷貝數(shù),便于制備點(diǎn)評:對于那些有劑量限制的基因克隆需要使用低拷貝的質(zhì)粒載體4.復(fù)制子由三部分構(gòu)成,如下不屬于的為()D啟動子點(diǎn)評:理解質(zhì)粒的生物學(xué)性質(zhì)。5.pBluescriptM13載體在多克隆位點(diǎn)的兩側(cè)引入了T7和T3兩個(gè)噬菌體的啟動子,這樣增長了該載體的功能,如下4種功能哪一種是不對的的()參照答案:D運(yùn)用這兩個(gè)啟動子進(jìn)行定點(diǎn)突變點(diǎn)評:理解pBluescriptM13載體的工作原理及特性。6.以粘粒為載體轉(zhuǎn)染受體菌后,平板上生長的菌落會出現(xiàn)大小不一、生長速度不一的現(xiàn)象,其原因是()D重組體中插入片段的大小不一樣點(diǎn)評:插入片段自身的復(fù)制以及插入片段在宿主菌中的體現(xiàn)產(chǎn)物都會影響宿主的生長。7.噬菌粒是由質(zhì)粒和噬菌體DNA共同構(gòu)成的,其中來自質(zhì)粒的重要構(gòu)造是(),而來自噬菌體的重要構(gòu)造是()A,A重組體中插入片段的大小不一樣點(diǎn)評:理解噬菌粒的生物學(xué)特性。8.野生型的M13有10個(gè)基因,分為三個(gè)功能基團(tuán),其中與復(fù)制有關(guān)的兩個(gè)基因是()A基因Ⅱ;基因Ⅳ點(diǎn)評:熟悉M13噬菌體的遺傳學(xué)性質(zhì)。9.M13單鏈?zhǔn)删w的復(fù)制分為三個(gè)階段,如下哪一項(xiàng)不屬于此()DSS→SS點(diǎn)評:RFDNA特指M13單鏈?zhǔn)删w復(fù)制型雙鏈DNA10.λ噬菌體DNA和M13單鏈?zhǔn)删wDNA在成熟前的DNA復(fù)制類型為()A滾環(huán)復(fù)制模型點(diǎn)評:λ噬菌體DNA和M13單鏈?zhǔn)删w侵染宿主后,都是先θ復(fù)制模型,后轉(zhuǎn)為滾環(huán)復(fù)制模型。11.如下對pUC18的描述中,錯誤的為()C可以在輔助質(zhì)粒的協(xié)助下合成單鏈DNA點(diǎn)評:pUC18沒有IG區(qū),不也許形成單鏈。12.如下對粘粒為載體的重組體的描述對的的是()B各重組體在平板上生長的速度不一樣,轉(zhuǎn)化子中插入片段的擴(kuò)增量也是不一樣的點(diǎn)評:理解粘粒載體的工作原理。13.下列哪種克隆載體對外源DNA的裝載量最大()B酵母人工染色體(YAC點(diǎn)評:人工染色體包括YAC、BAC、PAC等,其特點(diǎn)是可以裝載大的(100kb以上)外源DNA片段。14.同一種質(zhì)粒DNA,以三種不一樣的形式存在,電泳時(shí),它們的遷移速率是()參照答案:BSCDNA>LDNA>OCDNA點(diǎn)評:DNA分子構(gòu)造越緊湊,泳動時(shí)受到的阻力越小,遷移速率越大。15.有關(guān)穿梭質(zhì)粒載體,下面哪一種說法最對的()參照答案:A在不一樣的宿主細(xì)胞中使用不一樣的復(fù)制起點(diǎn)點(diǎn)評:可以在兩類不一樣的宿主中復(fù)制、增殖和選擇的載體稱為穿梭載體。16.反向反復(fù)序列:()C可以回折形成發(fā)夾構(gòu)造17.λ噬菌體線性DNA分子的兩端各有一種()個(gè)堿基構(gòu)成的天然黏性末端參照答案:B12點(diǎn)評:λ噬菌體線性DNA分子的兩端各有一種12個(gè)堿基構(gòu)成的天然粘性末端,稱為cos位點(diǎn)。18.下列有關(guān)細(xì)菌人工染色體(BAC)的特點(diǎn)描述,除()以外都是對的的參照答案:BBAC載體在大腸桿菌中為高拷貝點(diǎn)評:細(xì)菌人工染色體。是基于大腸桿菌的F質(zhì)粒構(gòu)建的高通量低拷貝質(zhì)粒載體。包括嚴(yán)謹(jǐn)型控制的復(fù)制區(qū)oriS、啟動DNA復(fù)制的由ATP驅(qū)動的解旋酶(RepE),以及三個(gè)保證低拷貝并使質(zhì)粒精確分派至子代細(xì)胞的基因座(parA,parB和parC)等元件。19.粘粒(cosmid)是一種人工建造的載體,下列對它的描述中哪一項(xiàng)是不對的的()D進(jìn)入受體細(xì)胞后,可引起溶源化反應(yīng)點(diǎn)評:粘粒指帶有將DNA包裝到噬菌體顆粒中所需的cos序列的質(zhì)粒。包括質(zhì)粒復(fù)制起點(diǎn),可以像質(zhì)粒同樣轉(zhuǎn)化并增殖;包括cos位點(diǎn),可以像噬菌體顆粒同樣包裝、侵染。20.松弛型質(zhì)粒:()A在寄主細(xì)胞中拷貝數(shù)較多點(diǎn)評:理解松弛型質(zhì)粒的概念。21.有關(guān)質(zhì)粒的不相容性,下列哪一種說法對的()參照答案:C假如兩個(gè)質(zhì)粒不相容,闡明它們的復(fù)制機(jī)制相似點(diǎn)評:運(yùn)用同一復(fù)制系統(tǒng)的兩個(gè)質(zhì)粒在同一宿主中不能共存的現(xiàn)象稱質(zhì)粒的不相容性,它是指在第二個(gè)質(zhì)粒導(dǎo)入后,在不波及DNA限制系統(tǒng)時(shí)出現(xiàn)的現(xiàn)象。22.一般狀況下,質(zhì)粒的存在狀況如下描述對的的是()A獨(dú)立存在點(diǎn)評:質(zhì)粒指細(xì)菌或某些低等生物里面存在的獨(dú)立于染色體外的雙鏈閉合環(huán)狀DNA分子(目前也發(fā)既有線狀的),它常常攜帶某些不必需的遺傳信息。23.轉(zhuǎn)座子不包括下列哪個(gè)部分()D反復(fù)序列點(diǎn)評:理解轉(zhuǎn)座子的概念。24.下列哪一項(xiàng)不是質(zhì)粒載體必備的基本特性()D含lacZ點(diǎn)評:lacZ是一種篩選標(biāo)識,可以使載體使用的愈加以便,但不是載體的必需元件。25.質(zhì)粒的消失和染色體的突變是不一樣的,表目前()參照答案:A前者不能恢復(fù),后者可以通過答復(fù)突變恢復(fù)該基因的性狀點(diǎn)評:理解答復(fù)突變。26.如下的描述中,哪一項(xiàng)是對的的()參照答案:C假如細(xì)菌的某種表型特性在UV處理下喪失后不再恢復(fù),這種表型有也許是質(zhì)粒賦予的點(diǎn)評:理解質(zhì)粒的生物學(xué)性質(zhì)及質(zhì)粒載體的工作原理。27.線性質(zhì)粒復(fù)制的引物來自于()參照答案:D自身末端的端粒序列點(diǎn)評:參照染色體的復(fù)制。28.下面有關(guān)松弛型質(zhì)粒的性質(zhì)描述中,()是不對的的A一般帶有抗性標(biāo)識點(diǎn)評:氯霉素可以增長質(zhì)粒的復(fù)制,而不影響染色體的復(fù)制。29ColE1是唯一用作遺傳工程載體的自然質(zhì)粒,如下對這種質(zhì)粒描述不對的的是()B具有四環(huán)素抗性點(diǎn)評:ColE1是自然質(zhì)粒,沒有四環(huán)素抗性基因,不能通過抗性篩選30.如下不是體現(xiàn)載體所必須的條件是()C啟動子不需要受控制點(diǎn)評:體現(xiàn)載體與克隆載體相比就是多了體現(xiàn)所必須的多種遺傳元件。四.簡答題1.何為載體?一種理想的載體應(yīng)具有那些特點(diǎn)?參照答案:將外源DNA或目的基因攜帶入宿主細(xì)胞的工具稱為載體。載體應(yīng)具有:①在宿主細(xì)胞內(nèi)必須可以自主復(fù)制(具有復(fù)制原點(diǎn));②必須具有合適的酶切位點(diǎn),供外源DNA片段插入,同步不影響其復(fù)制;③有一定的選擇標(biāo)識,用于篩選;④其他:有一定的拷貝數(shù),便于制備。2.含pMB1或(ColE1)復(fù)制子的plasmid是怎樣復(fù)制的,其調(diào)整機(jī)制怎樣?參照答案:復(fù)制方式:在復(fù)制時(shí),首先合成前RNAⅡ,即前引物,并與DNA形成雜交體;而后RnaseH切割前RNAⅡ,使之成為成熟的RNAⅡ,并形成三葉草二級構(gòu)造。該引物引導(dǎo)質(zhì)粒的復(fù)制。調(diào)整機(jī)制:形成的RNAⅠ可控制RNAⅡ形成二級構(gòu)造,同步Rop增強(qiáng)RNAⅠ的作用,從而控制質(zhì)粒的拷貝數(shù)。減弱RNAⅠ和RNAⅡ之間互相作用的突變,將增長帶有pMB1或(ColE1)復(fù)制子的拷貝數(shù)。3.當(dāng)向細(xì)菌培養(yǎng)基中加入氯霉素時(shí),可以使細(xì)菌質(zhì)粒的拷貝數(shù)得到擴(kuò)增,試分析其原理?參照答案:pMB1質(zhì)粒的復(fù)制并不需要質(zhì)粒編碼的功能蛋白,而是完全依托宿主提供的半衰期較長的酶(DNA聚合酶Ⅰ,DNA聚合酶Ⅲ),依賴于DNA的RNA聚合酶,以及宿主基因dnaB、dnaC、dnaD和danZ的產(chǎn)物。因此,雖然存在克制蛋白質(zhì)合成并阻斷細(xì)菌染色體復(fù)制的氯霉素或壯觀霉素等抗生素時(shí),帶有pMB1(或ColE1)復(fù)制子的質(zhì)粒將繼續(xù)復(fù)制,最終每個(gè)細(xì)胞中可積聚2~3千個(gè)質(zhì)粒。4.抗性基因(Resistantgene)是目前使用的最廣泛的選擇標(biāo)識,常用的抗生素抗性有哪幾種?并舉兩例闡明其原理?參照答案:氨芐青霉素抗性基因(ampr)、四環(huán)素抗性基因(tetr)、氯霉素抗性基因(Cmr)、卡那霉素和新霉素抗性基因(kanr,neor)以及琥珀突變克制基因supF。青霉素克制細(xì)胞壁肽聚糖的合成,與有關(guān)的酶結(jié)合,克制轉(zhuǎn)肽反應(yīng)并克制其活性。Ampr編碼一種酶,可分泌進(jìn)入細(xì)胞的周質(zhì)區(qū),并催化β-內(nèi)酰胺環(huán)水解,從而解除氨芐青霉素的毒性。四環(huán)素與核糖體30S亞基的一種蛋白質(zhì)結(jié)合,從而克制核糖體的轉(zhuǎn)位。Tetr編碼一種由399個(gè)氨基酸構(gòu)成的膜結(jié)合蛋白,可制止四環(huán)素進(jìn)入細(xì)胞。5.何為α-complement?怎樣運(yùn)用α-complement來篩選插入了外源DNA的重組質(zhì)粒?參照答案:α-complementation指lacZ基因上缺失近操縱基因區(qū)段的突變體與帶有完整的近操縱基因區(qū)段的β-半乳糖苷酶陰性的突變體之間實(shí)現(xiàn)互補(bǔ)。α-complementation是基于在兩個(gè)不一樣的缺陷β-半乳糖苷酶之間可實(shí)現(xiàn)功能互補(bǔ)而建立的。實(shí)現(xiàn)α-complement重要有兩部分構(gòu)成:LacZ△M15,放在F質(zhì)?;蛉旧w上,隨宿主傳代;LacZ',放在載體上,作為篩選標(biāo)識,當(dāng)在LacZ'中插入一種片斷后,將不可防止地導(dǎo)致產(chǎn)生無α-complement能力的β-半乳糖苷酶片斷。在誘導(dǎo)物IPTG和底物X-gal(同步可作為生色劑)的作用下,含重組質(zhì)粒的菌落不能產(chǎn)生有活性的β-半乳糖苷酶,不能分解X-gal,展現(xiàn)白色,而含非重組質(zhì)粒的菌落則展現(xiàn)蘭色。以此到達(dá)篩選的目的。6.為何野生型的λ噬菌體DNA不適宜作為基因工程載體?參照答案:①野生型噬菌體DNA沒有容載能力,由于噬菌體的頭部對DNA包裝的量是有限制的,不能不小于基因組的105%,因此要將λ噬菌體改導(dǎo)致載體,必須削減分子量;②野生型的λ噬菌體對于某些常用的酶均有多種識別和切割位點(diǎn),不便于克??;③沒有可供選擇的標(biāo)識;④野生型的λ噬菌體具有感染性,因此不夠安全。7.試簡述λ噬菌體的Lyticgrowth和Lysogenicstate兩種循環(huán)的分化及其調(diào)整過程?參照答案:Lyticgrowth是λ噬菌體在宿主中大量復(fù)制并組裝成子代λ噬菌體顆粒,導(dǎo)致宿主細(xì)胞裂解。Lysogenicstate為λ噬菌體基因組DNA通過位點(diǎn)專一性重組整合到宿主染色體DNA中隨宿主的繁殖傳到子代細(xì)胞。調(diào)整過程:由感染復(fù)數(shù)和細(xì)胞的營養(yǎng)狀態(tài)決定的,感染復(fù)數(shù)越高,營養(yǎng)狀態(tài)越差,則溶源化的頻率就越高。溶源現(xiàn)象的生化媒介也許是3'--5'cAMP,它在細(xì)胞內(nèi)的濃度會隨營養(yǎng)條件的變化而變化,當(dāng)細(xì)胞在富營養(yǎng)培養(yǎng)基中生長時(shí),cAMP的濃度較低,有助于裂解生長;在缺乏cAMP的突變細(xì)胞中,更有助于裂解生長此外一種重要的調(diào)整原因是噬菌體的CⅡ蛋白,它是噬菌體基因轉(zhuǎn)錄的激活子,克制裂解功能基因的體現(xiàn),催化噬菌體DNA整合到細(xì)菌的染色體中去。高濃度的CⅡ蛋白增進(jìn)溶源化,而低濃度的CⅡ蛋白增進(jìn)裂解生長。當(dāng)CⅡ蛋白濃度足夠時(shí),激活CⅠ蛋白和基因int的體現(xiàn),導(dǎo)致噬菌體DNA與染色體整合,朝著溶源態(tài)生長。8.用λ噬菌體載體進(jìn)行g(shù)enecloning時(shí),重要運(yùn)用λ噬菌體的生物學(xué)特性作選擇標(biāo)識,其中有cI失活和Spi篩選,請問什么叫cI篩選?什么叫Spi篩選?參照答案:CⅠ蛋白控制溶源態(tài)的形成,裂解生長受到克制,當(dāng)外源基因片段插入cⅠ中,cⅠ蛋白失活,溶源態(tài)打破而進(jìn)入裂解生長而篩選出重組克隆,叫做cⅠ篩選。野生型噬菌體在帶有P2原噬菌體的溶源性E.coli中的生長會受到限制的表型,稱作Spi+,即對P2噬菌體的干擾敏感(sensitivetoP2interference)。假如λ噬菌體缺乏兩個(gè)參與重組的基因red和gam,同步帶有chi位點(diǎn),并且宿主菌為rec+,則可以在P2溶源性E.coli中生長良好,噬菌體的這種表型稱作Spi-。因此,通過λ噬菌體載體DNA上的red和/或gam基因的缺失或替代,可在P2噬菌體溶源性細(xì)菌中鑒別重組和非重組λ噬菌體。9.簡述λ噬菌體載體的克隆原理及一般環(huán)節(jié)?參照答案:λ噬菌體載體屬于克隆載體,重要用于克隆DNA片斷。工作原理:λ噬菌體載體克隆外源DNA片斷的原理與質(zhì)粒載體的工作原理是類似的,只是在形式上有許多差異。載體和外源DNA片斷通過酶切后,外源DNA片斷插入到載體的合適位置,或置換載體的填充片段。這種連接后的重組DNA保留增殖性能,但由于分子量太大,不能象重組質(zhì)粒DNA那樣可通過轉(zhuǎn)化措施進(jìn)入大腸桿菌。通過提取λ噬菌體的蛋白質(zhì)外殼,可在體外將重組噬菌體DNA進(jìn)行包裝,形成噬菌體顆粒。這樣的噬菌體顆粒保留對大腸桿菌的感染能力,可將被包裝的重組噬菌體DNA注射到宿主菌中。通過裂解生長,可增殖重組噬菌體??寺…h(huán)節(jié):①通過裂解過程增殖載體;②載體與外源DNA的酶切;③外源DNA與載體的連接;④重組噬菌體的體外包裝;⑤包裝噬菌體顆粒的感染;⑥篩選。10.Cosmid的工作原理是什么?參照答案:粘粒載體的重要原理類似λ噬菌體載體。在外源片斷與載體連接時(shí),粘粒載體相稱于λ噬菌體載體的左右臂,cos位點(diǎn)通過粘端退火后,再與外源片斷相間連接成多聯(lián)體。當(dāng)多聯(lián)體與λ噬菌體包裝蛋白混合時(shí),λ噬菌體A基因蛋白的terminase功能將切割兩個(gè)cos位點(diǎn),并將兩個(gè)同方向cos位點(diǎn)之間的片斷包裝到λ噬菌體顆粒中去。這些噬菌體顆粒感染大腸桿菌時(shí),線狀的重組DNA就象λ噬菌體DNA同樣,被注入細(xì)胞并通過cos位點(diǎn)環(huán)化。這樣形成的環(huán)化分子具有完整的粘粒載體,可象質(zhì)粒同樣復(fù)制并使其宿主獲得抗藥性。因而,帶有重組粘粒的細(xì)菌可用含合適抗生素的培養(yǎng)基挑選。通過這種方式,就將外源DNA片斷通過粘粒載體克隆到大腸桿菌中去了。11.構(gòu)建粘粒文庫時(shí)會碰到哪些問題?你怎樣處理?參照答案:運(yùn)用粘粒構(gòu)建基因文庫時(shí)會碰到許多困難:①載體分子會自身連接,從而導(dǎo)致效率大大減少甚至失敗。通過對載體作去磷酸化處理或使用雙cos位點(diǎn)載體或?qū)d體的酶切產(chǎn)物進(jìn)行部分補(bǔ)平可處理這一問題;②多種外源片斷插入載體中,會誤將兩個(gè)本來不相連的DNA片斷認(rèn)為是基因組中的持續(xù)DNA片斷。通過搜集35~45kb的部分酶切外源DNA片斷與載體連接、使用雙cos位點(diǎn)載體或?qū)d體和外源片斷的酶切產(chǎn)物進(jìn)行部分補(bǔ)平,可處理這一問題。③提取的基因組DNA長度不不小于200kb,將使部分酶切后形成的35~45kb片斷只有少部分在其兩端帶有酶切位點(diǎn),致使目的DNA的可用性大大減少。在對外源DNA片斷作部分酶切之前,應(yīng)檢查其大小,假如不不小于200kb則不能用于構(gòu)建文庫;④提取的總DNA純度不高,也許由于出現(xiàn)酶解克制物而得不到理想的酶切產(chǎn)物。因此,在制備總DNA時(shí),應(yīng)小心防止混入的有機(jī)相和水相交界處的物質(zhì)。假如問題仍舊出現(xiàn),可用氯化銫梯度離心措施純化DNA或重新制備總DNA;⑤在構(gòu)建的文庫中常常出現(xiàn)不含外源片斷的克隆。這種“空”克隆的比例依載體的不一樣和操作的小心程度而不一樣一般而言,使用單cos位點(diǎn)的載體,約有5%的克隆是空的。使用雙cos位點(diǎn)的載體,產(chǎn)生空克隆的比例要低得多;⑥不一樣重組質(zhì)??截悢?shù)可以有很大差異,導(dǎo)致收獲量相差懸殊。每當(dāng)對文庫作一次噬菌體的擴(kuò)增,這些差異將會被深入放大;⑦盡管文庫似乎全面,但也許不能獲得目的克隆。限制酶位點(diǎn)的非隨機(jī)分布、包裝蛋白污染限制酶、重組引起的序列缺失和擴(kuò)增時(shí)目的克隆也許被淘汰等都是產(chǎn)生這種現(xiàn)象的原因。12.絲狀噬菌體克隆中常常會碰到哪兩類問題?可用何種措施來處理?參照答案:①外源DNA區(qū)段的部分缺失,克隆于絲狀噬菌體基因間隔區(qū)的外源基因趨于不穩(wěn)定。外源基因越大,缺失突變率越高,盡量防止帶有讓感染細(xì)菌在液體培養(yǎng)中持續(xù)生長,可以使這種現(xiàn)象減少到最低程度(盡管不能完全消除)。對的的做法是,用保留于-70℃的重組噬菌體原種轉(zhuǎn)染合適的宿主菌,鋪成平板,并從分隔良好的單個(gè)噬斑的中央挑取細(xì)菌進(jìn)行小規(guī)模培養(yǎng);②13.噬菌粒(Phagemid)具有那些特性?許多phagemid均有一種重要的缺陷,即在輔助噬菌體感染后,有時(shí)候單鏈DNA的產(chǎn)量較低且反復(fù)性一般較差,試分析其原因?參照答案:①雙鏈DNA既穩(wěn)定,又高產(chǎn),具有常規(guī)質(zhì)粒的特性;②免卻了將外源DNA片斷從質(zhì)粒亞克隆于噬菌體載體;③由于載體足夠小,故可得到長達(dá)10kb的外源DNA區(qū)段的單鏈。原因:①噬菌體攜帶的基因間隔區(qū)確實(shí)切序列,攜帶完整基因間隔區(qū)的質(zhì)??捎捎诟蓴_輔助病毒DNA復(fù)制而克制子代噬菌體顆粒的產(chǎn)生;②基因間隔區(qū)插入質(zhì)粒的詳細(xì)位置,基因間隔區(qū)插入pBR322HindⅢ位點(diǎn)所構(gòu)成的噬菌粒,會嚴(yán)重干擾野生型噬菌體的生長,而將基因間隔區(qū)插入AhaⅢ位點(diǎn)則否則;③輔助噬菌體的性質(zhì),野生型絲狀噬菌體及其抗干擾突變株都被用作輔助噬菌體。輔助噬菌體基因間隔區(qū)插入了lacZ序列,因而基因Ⅱ產(chǎn)物對它的識別不那么有效;④克隆于噬菌粒的外源DNA的大小與性質(zhì),因外源DNA片斷的大小而異,單鏈DNA的產(chǎn)量可以在5~10倍之間有所差異(一般來說,外源DNA越大,產(chǎn)量越低)。此外,由于某些尚不清晰的原因,大小相似的外源DNA,其單鏈DNA的產(chǎn)量也參差不齊。14.YAC載體具有什么樣的功能性元件?為何它在克隆大片段時(shí)具有很大的優(yōu)越性?參照答案:YAC帶有天然染色體所有的功能元件,包括一種著絲粒,一種復(fù)制起點(diǎn),兩個(gè)端粒。YAC可以容納長達(dá)幾百kb的外源DNA,這是質(zhì)粒和粘粒辦不到的。大片斷的插入更有也許包括完整的基因,在染色體步移中每次容許更大的步移距離,同步減少完整基因組文庫所需的克隆數(shù)目。思索題問題:作為一種最基本的載體,它必須具有哪些功能元件?思索題問題:何為α-互補(bǔ)?在載體構(gòu)建中有何作用?思索題問題:請簡要描述?噬菌體溶原狀態(tài)和裂解循環(huán)的基因調(diào)控模式,及其在構(gòu)建載體中的作用。思索題問題:簡述M13K07輔助噬菌體的遺傳學(xué)特性和生物學(xué)功能,及其在制備單鏈DNA中的作用。第四章一.名詞解釋1.TAEbuffer醋酸緩沖液。由Tris堿、醋酸和EDTA等成分構(gòu)成的緩沖體系,用于瓊脂糖凝膠電泳。2.SDS十二烷基磺酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳。用于檢測蛋白質(zhì)分子量的電泳措施,待分離蛋白質(zhì)是變性的,泳動速率只與分子量有關(guān),與自身所帶電荷無關(guān)。3.SouthernblotSouthern雜交。一種檢測DNA分子的措施。將DNA片段從瓊脂糖凝膠轉(zhuǎn)移到濾膜,結(jié)合了DNA分子的濾膜先與特定的預(yù)雜交液進(jìn)行預(yù)雜交,然后與標(biāo)識的核酸探針和濾膜混合。假如濾膜上的DNA分子存在與探針同源的序列,那么探針將與該分子形成雜合雙鏈,從而吸附在濾膜上。在通過一定的洗滌程序?qū)⒂坞x的探針分子除去后,通過放射自顯影或生化檢測,就可判斷濾膜上與否存在與探針同源的DNA分子及其分子量。4.NorthernblotNorthern雜交。用于檢測細(xì)胞或組織樣品中與否存在與探針同源的mRNA分子的檢測措施。過程與Southern雜交相似,只不過在Blotting過程中轉(zhuǎn)移的是RNA而不是DNA。5.WesternblotWestern雜交。用來檢測細(xì)胞或組織樣品中與否存在能被某抗體識別的蛋白質(zhì)的措施。將蛋白質(zhì)樣品從SDS凝膠通過電轉(zhuǎn)移方式轉(zhuǎn)移到濾膜,通過抗體以免疫反應(yīng)形式檢測濾膜上與否存在被抗體識別的蛋白質(zhì),并判斷其分子量。所用的探針不是DNA或RNA,而是針對某一蛋白質(zhì)制備的特異性抗體。6.Colonyhybridization菌落雜交。
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