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Word第第頁(yè)畢業(yè)設(shè)計(jì)開(kāi)題報(bào)告的模板1、二維定量結(jié)構(gòu)活性關(guān)系方法(2d-qsar)傳統(tǒng)的二維定量結(jié)構(gòu)活性關(guān)系方法許多,有hansch法、基團(tuán)奉獻(xiàn)法和分子連接性指數(shù)法等[3]。
其中最為有名、應(yīng)用最為廣泛的是hansch法。它假設(shè)同系列化合某些生物活性的改變是和它們某些可測(cè)量的物理化學(xué)性質(zhì)(疏水性、電性質(zhì)和空間立體性質(zhì)等)的改變相聯(lián)系的,并假定這些因子是彼此孤立的,采納多重自由能相關(guān)法,借助多重線性回來(lái)等統(tǒng)計(jì)方法就可以得到定量結(jié)構(gòu)活性關(guān)系模型。
基團(tuán)奉獻(xiàn)法是free-wilson在對(duì)有機(jī)物亞結(jié)構(gòu)信息和生物毒性的相關(guān)討論基礎(chǔ)上建立的一種方法。這種模式認(rèn)為有機(jī)物與受體間的毒性效應(yīng)是該有機(jī)物特定位置上不同取代基團(tuán)毒性奉獻(xiàn)的加和。free-wilson法僅適用于具有相同母體結(jié)構(gòu)的有機(jī)物,常被用來(lái)對(duì)有機(jī)物進(jìn)行毒性初評(píng)。
分子連接性指數(shù)法(molecularconnectiveindex,mci)是由kier和hall提出的。它是依據(jù)分子中各個(gè)骨架原子排列或相連接的方式來(lái)描述分子的結(jié)構(gòu)性質(zhì)。mci是一種拓?fù)鋵W(xué)參數(shù),有零階項(xiàng)(0xv)、易階項(xiàng)(1xv)、二階項(xiàng)(2xv)等等,可以依據(jù)分子的結(jié)構(gòu)式和原子的點(diǎn)價(jià)(δ)計(jì)算得到,與有機(jī)物的毒性數(shù)據(jù)有較好的相關(guān)性。mci能較強(qiáng)地反映分子的立體結(jié)構(gòu),但反映子電子結(jié)構(gòu)的力量較弱,因此缺乏明確的物理意義,但由于其具有便利、簡(jiǎn)潔且不依靠于試驗(yàn)等優(yōu)點(diǎn),近年來(lái)得到廣泛應(yīng)用和進(jìn)展[4~8]。
2、三維定量結(jié)構(gòu)活性關(guān)系方法(3d-qsar)隨著結(jié)構(gòu)活性關(guān)系理論和統(tǒng)計(jì)方法的進(jìn)一步進(jìn)展,20世紀(jì)80年月,三維結(jié)構(gòu)信息被間續(xù)引入到定量結(jié)構(gòu)活性關(guān)系討論中,即3d-qsar。與2d-qsar比較,3d-qsar方法在物理化學(xué)上的意義更為明確,能間接反映藥物分子和靶點(diǎn)之間的非鍵互相作用特征。因此,近十多年來(lái)3d-qsar方法得到了快速的進(jìn)展和廣泛的應(yīng)用,討論方法也許多[9],比方分子樣子分(molecularshapeanalysis,msa),距離幾何方法(distancegeometry,dg,比較分子力場(chǎng)分析(comparativemolecularfieldanalysis,comfa),比較分子相像因子分析(comparativemolecularsimilarityindicesanalysicomsia)以及虛擬受體(phesudoreceptor)等方法。其中應(yīng)用最為廣泛的comfa方法。
3、隨著技術(shù)的進(jìn)展和生產(chǎn)技術(shù)的進(jìn)步,又消失了一些先進(jìn)的方法來(lái)構(gòu)建qsar模型,都具有很好的預(yù)報(bào)力量。其中又以啟發(fā)發(fā)(heuristicmethod,簡(jiǎn)稱hm),支持向量機(jī)(supportvectormachine,簡(jiǎn)稱svm),基因表達(dá)式編程(geneexpressionprogramming,簡(jiǎn)稱gep)比較常見(jiàn)。支持向量機(jī)(supportvectormachine)是vapnik[10]等人依據(jù)統(tǒng)計(jì)學(xué)理論提出的一種新的通用學(xué)習(xí)方法,它是建立在統(tǒng)計(jì)學(xué)理論的vc維理論和結(jié)構(gòu)風(fēng)險(xiǎn)最小原理基礎(chǔ)上的,能較好地解決小樣本、非線性、高維數(shù)等實(shí)際問(wèn)題[11-12],已勝利地應(yīng)用于分類、函數(shù)靠近和時(shí)間序列預(yù)報(bào)等方面[13-15];基因表達(dá)式編程(gep)是基于生物學(xué)遺傳思想,保持了生物學(xué)的特性,具有良好的結(jié)果重現(xiàn)性,同時(shí)也能夠進(jìn)行“遺傳變異”掌握,最終能獲得牢靠的試驗(yàn)效果。
三、主要討論內(nèi)容
1、查閱中外文文獻(xiàn)選取數(shù)據(jù)來(lái)源。
2、理化參數(shù)與結(jié)構(gòu)參數(shù)的計(jì)算。
3、詳細(xì)的結(jié)構(gòu)參數(shù)的分析。
4、svm與gep的方法討論。
5、定量結(jié)構(gòu)關(guān)系式的建立。
6、定量結(jié)構(gòu)關(guān)系式的驗(yàn)證。
7、得出結(jié)論和總結(jié)。
四、論文工作打算
3月中旬—4月初:選題。
4月初—4月底:查閱資料,熟識(shí)試驗(yàn)原理及方法,預(yù)備開(kāi)題報(bào)告。
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