細(xì)菌多樣性的開題報告課件

姓名：卡依爾·玉素甫

指導(dǎo)教師：艾爾肯·熱合曼教授

專業(yè)：微生物

研究方向：資源微生物塔河中游胡楊內(nèi)生細(xì)菌的分離鑒定及多樣性分析2008級碩士研究生畢業(yè)論文開題報告資源微生物實(shí)驗(yàn)室1.

報告內(nèi)容1研究背景、目的及意義2研究內(nèi)容、技術(shù)路線及可行性3預(yù)期結(jié)果4研究計劃5參考文獻(xiàn)2.

1研究背景、目的及意義3.

1.1研究背景4.5.5030全世界胡楊林分布圖6.7.8.

1.2研究目的：1)對胡楊內(nèi)生細(xì)菌進(jìn)行篩選、純化，用現(xiàn)代分子生物學(xué)方法進(jìn)行分子鑒定，闡明胡楊內(nèi)生細(xì)菌的多樣性分布和種群結(jié)構(gòu)。2)進(jìn)行16SrDNA鑒定和構(gòu)建進(jìn)化樹來確定它們之間的親緣關(guān)系，可以得知在塔里木河中游胡楊內(nèi)生細(xì)菌多樣性。3)對潛在新種進(jìn)行多相分類學(xué)鑒定，確定其進(jìn)化地位。9.尉犁采樣地點(diǎn)·卡爾曲尕Vgan河Kiyik河10.采樣地點(diǎn)11.12.

1.3研究意義1）首次探討胡楊莖桿液內(nèi)生細(xì)菌的種群結(jié)構(gòu)和分布狀況。2）闡述干旱、地下水面比較低的環(huán)境下胡楊樹內(nèi)生細(xì)菌種類的多樣性。3）研究具有潛在應(yīng)用價值的菌株及其特色產(chǎn)物。4）進(jìn)一步探索胡楊內(nèi)生細(xì)菌的抗菌和抗蟲機(jī)制。13.THANKYOUSUCCESS2023/11/2914.

2.研究內(nèi)容、技術(shù)路線及可行性15.2.1研究內(nèi)容

從塔里木河中游胡楊林區(qū)廢棄的Vgan河和Kiyik古河道兩岸的原始胡楊作為采樣目標(biāo)，抽出胡楊莖稈液，然后用三種培養(yǎng)基（TSA,LB,NA）進(jìn)行細(xì)菌的分離、純化和鑒定，分析在鹽含量高、干旱的土壤環(huán)境中胡楊內(nèi)生細(xì)菌種類的多樣性，對潛在的新種進(jìn)行多相分類學(xué)鑒定。16.分離純化菌種鑒定多樣性分析系統(tǒng)發(fā)育多相分類學(xué)鑒定代謝產(chǎn)物分析菌種保藏斜面保藏甘油保藏冷凍干燥保藏2.2技術(shù)路線形態(tài)觀察樣本采集分離純化17.多相分類學(xué)鑒定表型遺傳型系統(tǒng)發(fā)育表達(dá)特征化學(xué)分類形態(tài)、大小、染色、運(yùn)動性、鞭毛和莢膜生理生化(API50CH)酶學(xué)(APIZYM)脂肪酸醌全基因組部分基因組

DNA相似性（雜交）G+C（摩爾百分含量）16SrDNA序列同源比對16SrDNA序列進(jìn)化分析確定進(jìn)化地位18.

2.3可行性分析

1）本研究采用的實(shí)驗(yàn)方法和技術(shù)路線都是非常成熟的。2）我們實(shí)驗(yàn)室可以提供完成本研究的相關(guān)條件。3）本人在微生物學(xué)和分子生物學(xué)理論方面知識扎實(shí)，查閱了大量的文獻(xiàn)，在導(dǎo)師、師兄和師姐的指導(dǎo)下，積累了豐富的實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)。這為我實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行奠定了理論和實(shí)踐基礎(chǔ)。

19.

2.4特色與創(chuàng)新

特色本研究選取的樣點(diǎn)是世界保存較完整、較偏僻、未受人類活動污染的自然胡楊林保護(hù)區(qū)。首次對具有耐鹽堿、耐熱、耐旱、耐寒、耐貧瘠特性的胡楊樹中抽出莖桿液進(jìn)行內(nèi)生細(xì)菌的多樣性分析。20.

創(chuàng)新1）首次對胡楊莖桿內(nèi)生細(xì)菌進(jìn)行研究，初步闡明胡楊內(nèi)生細(xì)菌的多樣性和種群結(jié)構(gòu)。2）對分析胡楊內(nèi)生菌的多樣性提供新的數(shù)據(jù)。3）對特色菌株進(jìn)行精確的分類學(xué)鑒定。21.3.預(yù)期結(jié)果1)初步鑒定塔河中游胡楊內(nèi)生細(xì)菌的生態(tài)分布及優(yōu)勢種。2)期待發(fā)現(xiàn)1-2株新種或新紀(jì)錄種。3)向GenBank注冊細(xì)菌16SrDNA序列≥30個。4)擬發(fā)表文章1-2篇。22.2009年4月-2009年5月采樣2009年5月-2009年6月查閱文獻(xiàn)2009年6月-2010年1月分離純化與保種2010年1月-2010年5月分子鑒定2010年5月-2010年6月多樣性分析2010年6月-2010年9月拮抗菌株的篩選2010年9月-2011年2月特色產(chǎn)物分析2011年2月-2011年5月實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析及數(shù)據(jù)處理，撰寫論文2011年5月-2011年6月送審論文，畢業(yè)答辯

4.實(shí)驗(yàn)計劃23.

5.參考文獻(xiàn)[1]楊海蓮,孫曉璐.宋末.植物內(nèi)生細(xì)菌研究.微生物通報,1998,25(4):224-226.[2]趙東紅,陸玲,秦懷蘭.一種微生物發(fā)酵產(chǎn)藍(lán)色素的穩(wěn)定性及毒研究.食品與發(fā)酵工業(yè),1998,24(5).[3]東秀珠,蔡妙英.常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊.北京:科學(xué)出版社,2001.[4]谷蘇,邵華,蔣曉華,等.藥用植物內(nèi)生真菌多樣性及其活性成分的潛在應(yīng)用價值.中國藥學(xué)雜志,2001,36(1):14?15.[5]楊瑞先,陳立軍,等.油菜內(nèi)生細(xì)菌種群多樣性分析.西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版),2005:33.[6]喬海莉;田呈明;駱有慶;馮曉峰;孫建華;趙新麗.新疆天然胡楊林土壤微生物多樣性的研究.北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報.2007:5.

24.

[7]ShimizuM,NakagawaY,SatoY,etal.Studiesonendophyticactinomycetes(I):Streptomycessp.isolatedfromRhododendronanditsantifungalactivity?JGenPlantPathol,2002,66(4):360?366.[8]Bowen,G.D.,Rovira,A.D.,1991.In:Waisel,Y.,Eschel,A.,Kafkafi,U.(Eds.),PlantRoots:TheHiddenHalf.MarcelDekker,NewYork,pp.349–388.[9]Chaintreuil,C.,Giraud,E.,Prin,Y.,Lorquin,J.,Ba?,A.,Gillis,M.,deLajudie,P.,Dreyfus,B.,2000.PhotosyntheticBradyrhizobiaarenaturalentophytesoftheAfricanwildriceOryzabreviligulata.Appl.Environ.Microbiol.66,5437–5447.[10]BaiY,DAoustF,SmithDL,etal.Isola