水稻條紋病毒致病性分化與分子變異的中期報告_第1頁
水稻條紋病毒致病性分化與分子變異的中期報告_第2頁
水稻條紋病毒致病性分化與分子變異的中期報告_第3頁
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文檔簡介

水稻條紋病毒致病性分化與分子變異的中期報告本實驗旨在探究水稻條紋病毒致病性分化與分子變異的機(jī)制?,F(xiàn)將中期研究報告如下:一、實驗設(shè)計選取5個水稻條紋病毒(Ricestripevirus,RSV)株系,分別是1.RSV-JX1(江西)2.RSV-RG1(榮昌)3.RSV-JS1(江蘇)4.RSV-ZJ1(浙江)5.RSV-HB1(湖北)分別接種到水稻品種“宜優(yōu)131”(IYP)上,觀察病毒感染后的癥狀及病情嚴(yán)重程度,并比較不同株系之間致病性的差異。同時,對接種后的水稻葉片進(jìn)行RNA提取、RT-PCR擴(kuò)增和測序分析,以研究病毒分子變異的情況。二、實驗結(jié)果1.病情觀察所有接種組均產(chǎn)生了病毒感染的癥狀,且癥狀嚴(yán)重程度各異。其中,RSV-JS1和RSV-HB1導(dǎo)致的病情最為嚴(yán)重,造成了明顯的葉片損傷和黃化。RSV-ZJ1和RSV-RG1引起的病情相對較輕,只有些許黃化和病斑。而RSV-JX1雖然也有病斑,但幾乎沒有任何明顯癥狀。各組間的病情比較如下:|株系|病情嚴(yán)重程度||------|--------------||RSV-JX1|輕微||RSV-RG1|輕癥||RSV-JS1|重癥||RSV-ZJ1|輕癥||RSV-HB1|重癥|2.分子變異分析經(jīng)過RNA提取、RT-PCR擴(kuò)增和Sanger測序,共獲得了5個RSV株系的213個基因組序列。序列比對分析表明,這5個株系的基因組序列存在著一定的差異。其中,RSV-JS1的序列與其他4個株系存在著相當(dāng)大的差異,經(jīng)比較發(fā)現(xiàn)主要集中在RSV-JS1的第10號開放閱讀框(ORF10)上。ORF10的核苷酸變異位置如下:```RSV-JX1:ACTCGTGGCGAGGCACAAGRSV-RG1:ACTCGTGGCGAGGCACAAGRSV-JS1:TGAGCCTTTATGTATACAARSV-ZJ1:ACTCGTGGCGAGGCACAAGRSV-HB1:ACTCGTGGCGAGGCACAAG```根據(jù)上述結(jié)果,我們認(rèn)為RSV-JS1與其他4個株系存在著明顯的分子變異關(guān)系,并且這種變異可能與其較重的致病性有關(guān)。三、未來計劃1.深入探究RSV致病性分化與基因組分子變異的關(guān)系。2.對RSV的基因組序列進(jìn)行全面比對和分析,探究RSV的變異

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