




版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡介
ICS59.080
W59
備案號:62065-2019DB21
遼寧省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB21/T3084—2018
羽絨制品中鵝絨的鑒別
PCR法和實(shí)時(shí)熒光PCR法
IdentificationofGooseDownFiberinFeatherandDownProducts
-PCRmethodandreal-timefluorescencePCRmethod
DB21/T3084—2018
羽絨制品中鵝絨的鑒別PCR法和實(shí)時(shí)熒光PCR法
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了羽絨制品中鵝絨的PCR和實(shí)時(shí)熒光PCR鑒別方法。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于羽絨制品。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅所注日期的版本適用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB/T6682分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法
3術(shù)語和定義
3.1聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)polymerasechainreaction
一種模擬天然DNA復(fù)制的體外擴(kuò)增法,在DNA聚合酶催化下,以母鏈DNA為模板,以特定引物
為延伸起點(diǎn),以4種單核苷酸(dNTP)為底物,通過變性—退火—延伸的循環(huán)反應(yīng),使極少量的DNA
的特定片段,在短短幾小時(shí)內(nèi)擴(kuò)增上百萬倍。
3.2實(shí)時(shí)熒光PCRreal-timefluorescencepolymerasechainreaction
在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號積累實(shí)時(shí)監(jiān)測整個(gè)PCR進(jìn)程,最后通過曲線對未
知模板進(jìn)行定量或定性分析的方法。
4縮略語
下列縮略語適用于本文件。
bp:堿基對(basepair)
Ct值:每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號達(dá)到設(shè)定的閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)(cyclethreshold)
DNA:脫氧核糖核酸(deoxyribonuleicacid)
DTT:二硫疏糖醇
dNTP:脫氧核苷酸三磷酸(deoxyribonucleosidetriphosphate)
5原理
用試劑盒法或其他等效DNA提取法提取樣品中的DNA。針對鵝的線粒體DNA序列設(shè)計(jì)引物和探
針,通過單PCR、實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù),對DNA中的鵝成分分別進(jìn)行特異性擴(kuò)增,根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,判
定樣品中是否含有鵝絨。
1
DB21/T3084—2018
6試劑
6.1實(shí)驗(yàn)用水應(yīng)符合GB/T6682中一級水的規(guī)格。
6.2組織和毛發(fā)提取試劑盒TaKaRaMiniBESTUniversalGenomicDNAExtractionKitVer.5.0(TaKaRa
Code.9765)。參見附錄A中A.1。
6.3PremixExTaq?(ProbeqPCR)(TaKaRaCode.RR390A)參見附錄A中A.2。
6.4100%乙醇。
6.5溴化乙錠溶液。
6.6DNALaddarMarker。
7設(shè)備與器具
7.1PCR儀
7.2實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀
7.3電泳裝置
7.4凝膠成像儀
7.5冰箱:4℃~20℃
7.6天平:精度為0.0001g
7.7分析研磨機(jī)
7.8微孔干浴器或水浴鍋
7.9瞬時(shí)離心機(jī)
7.10渦旋混合器
7.111.5mL磁分離架
7.12微量可調(diào)移液器:0.1μL~2.5μL,1μL~10μL,2μL~20μL,10μL~100μL,20μL~200μL,
100μL~1000μL。
7.131.5mL離心管,2.0mL離心管
7.14PCR薄壁管
7.15實(shí)時(shí)熒光PCR光學(xué)反應(yīng)管
7.16超凈工作臺
8取樣
從羽絨服或其他羽絨制品的不同部位取樣,混合均勻后,再取約1g試樣。
9制樣
將樣品剪碎,經(jīng)分析研磨機(jī)打散混勻,再次盡量剪碎至2mm以下,再次用分析研磨機(jī)混勻。
10DNA的提取
10.1組織裂解
2
DB21/T3084—2018
稱取約5mg試樣,放入2mL離心管中,每個(gè)樣平行提取2管,加入180μL的緩沖液GL(Buffer
GL)、20μL的蛋白酶K(ProteinaseK)和10μL的核糖核酸酶A(RNaseA,10mg/mL),于56℃
水浴溫浴至組織完全裂解3小時(shí)。如殘存纖維狀組織無法完全裂解,裂解之后先12,000rpm離心2分
鐘,去除雜質(zhì)之后再進(jìn)行后續(xù)操作。向裂解液中加入200μL緩沖液GB(BufferGB)和200μL100%
乙醇,充分吸打混勻。
注:溫浴時(shí)可時(shí)常將樣品取出進(jìn)行振蕩或吸打以加速裂解。
10.2將核酸純化柱(SpinColumn)安置于收集管(CollectionTube)上,溶液移至核酸純化柱中,12,000
rpm離心2分鐘,棄濾液。
10.3將500μL的緩沖液WA(BufferWA)加入至核酸純化柱中,12,000rpm離心1分鐘,棄濾液。
10.4將700μL的緩沖液WB加入至核酸純化柱中,12,000rpm離心1分鐘,棄濾液。
10.5確認(rèn)緩沖液WB中已經(jīng)加入了指定體積的100%乙醇。
10.6沿核酸純化柱管壁四周加入緩沖液WB,這樣有助于完全沖洗沾附于管壁上的鹽份。
10.7重復(fù)操作步驟4。
10.8將核酸純化柱安置于收集管上,12,000rpm離心2分鐘。
10.9將核酸純化柱安置于新的1.5mL的離心管上,在核酸純化柱膜的中央處加入50μL~200μL的
滅菌水或洗脫液(ElutionBuffer),室溫靜置5分鐘。
10.10將滅菌蒸餾水或洗脫液加熱至65℃使用時(shí)有利于提高洗脫效率。
10.1112,000rpm離心2分鐘洗脫DNA。如需獲得更大收量,可將離下液重新加入到核酸純化柱膜的
中央或再加入50L~200μL的滅菌水或洗脫液,室溫靜置5分鐘后,12,000rpm離心2分鐘洗脫DNA。
11DNA的鑒別
11.1質(zhì)量控制
進(jìn)行PCR、實(shí)時(shí)熒光PCR鑒別時(shí)設(shè)置陽性對照、陰性對照和空白對照。陽性對照:擴(kuò)增鵝成分時(shí)
用鵝絨DNA。陰性對照:擴(kuò)增鵝成分時(shí)用非鵝絨DNA,空白對照:實(shí)驗(yàn)用水。
11.2PCR法
11.2.1引物
所用引物信息見表1。
表1PCR擴(kuò)增所用引物
擴(kuò)增成分引物名稱引物序列退火溫度/℃產(chǎn)物大小/bp
Goose-cytb-F5’-GCTACTAGCCATACACTAC-3’60.3375
鵝
Goose-cytb-R5’-GTTGGATTGTCTACTGAGA-3’60.0375
11.2.2PCR反應(yīng)體系
premixExTaq(2×)12.5μL,10μmol/L引物各1μL,DNA模板2μL,ddH2O8.5μL
11.2.3反應(yīng)條件
95℃,30s;95℃,5s,退火溫度(見表1),60℃,30s,40個(gè)循環(huán)。
注:不同儀器可根據(jù)儀器要求將反應(yīng)參數(shù)作適當(dāng)調(diào)整。
3
DB21/T3084—2018
11.2.4PCR產(chǎn)物的檢測
將適量5×TBE稀釋成0.5×TBE溶液,配制2.0%瓊脂糖凝膠,取15μLPCR產(chǎn)物,點(diǎn)樣進(jìn)行電泳,
并加DNAmarker點(diǎn)樣以判斷PCR產(chǎn)物的片段大小。電壓大小根據(jù)電泳槽長度來確定,一般控制在3
V/cm~5V/cm長度,電泳時(shí)間根據(jù)溴酚藍(lán)的移動(dòng)位置來確定。電泳結(jié)束后,將凝膠置溴化乙錠溶液(10
μg/μL)中浸泡30min。用凝膠成像系統(tǒng)觀察、拍照、記錄與分析電泳結(jié)果。
11.2.5PCR結(jié)果及判斷
陽性對照出現(xiàn)預(yù)期大小的擴(kuò)增條帶,陰性對照和空白對照均未出現(xiàn)條帶;待測樣品未出現(xiàn)預(yù)期大小
的擴(kuò)增條帶,判斷結(jié)果為陰性。待測樣品出現(xiàn)預(yù)期大小的擴(kuò)增條帶,判斷結(jié)果為可疑陽性,需進(jìn)一
步確證。
11.2.6結(jié)果確證實(shí)驗(yàn)
可疑陽性結(jié)果的采用實(shí)時(shí)熒光PCR法進(jìn)行確證。
11.3實(shí)時(shí)熒光PCR法
11.3.1引物及探針
所用的引物、探針見表2。
表2實(shí)時(shí)熒光PCR所用引物、探針
擴(kuò)增成分引物名稱引物序列退火溫度/℃產(chǎn)物大小/bp
Goose-cytb-F5’-GCTACTAGCCATACACTAC-3’60.3375
鵝Goose-cytb-R5’-GTTGGATTGTCTACTGAGA-3’60.0375
Goose-cytb-P5’-(FAM)CGCAGACACTTCACTCGCCT(Eclipse)-3’70.0375
11.3.2PCR反應(yīng)體系
PremixExTaq(2×)12.5μL,PremixExTaq(2×)12.5μL,PrimerF(10μM)1μL,Primer
R(10μM)1μL,Probe(5μM)1μL,DNA×2μL,dH2O7.5μL,×Negativecontrol反應(yīng)時(shí),加入
RNasefreedH2O,×Positive反應(yīng)時(shí),做2個(gè)平行樣。
11.3.3PCR反應(yīng)條件
95℃,30s;95℃,5s,退火溫度(見表2),60℃,30s,40個(gè)循環(huán)。
注:不同儀器可根據(jù)儀器要求和PremixExTaqTM使用說明書將反應(yīng)參數(shù)作適當(dāng)調(diào)整。
11.3.4結(jié)果分析
反應(yīng)結(jié)束后,應(yīng)設(shè)置無效基線范圍,基線范圍選擇在3~15個(gè)循環(huán),如果有強(qiáng)陽性樣本,應(yīng)根據(jù)實(shí)
際情況調(diào)整基線范圍。閾值設(shè)置原則以基線剛好超過正常陰性對照擴(kuò)增曲線的最高點(diǎn),且Ct值=40為
準(zhǔn)。設(shè)置閾值后,分析樣品的檢測結(jié)果。
11.3.5結(jié)果判斷
待測樣品鵝成分檢測Ct值大于或等于40,內(nèi)參照基因檢測Ct值在23~30之間者,陰性對照、陽性
對照和空白對照結(jié)果正常者,則可判定該樣品未檢出鵝源性DNA成分。
4
DB21/T3084—2018
待測樣品鵝成分檢測Ct值小于或等于36,內(nèi)參照基因檢測Ct值在20~30之間者,陰性對照、陽性
對照和空白對照結(jié)果正常者,則可判定該樣品檢出鵝源性DNA成分。
待測樣品鵝成分檢測Ct值在36~40之間,應(yīng)重做實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增。再次擴(kuò)增后的結(jié)果Ct值仍小
于40者,且陰性對照、陽性對照和空白對照結(jié)果正常,則可判定該樣品檢出鵝源性DNA成分;再次
擴(kuò)增后結(jié)果Ct值大于40,且陰性對照/陽性對照和空白對照結(jié)果正常,可判定該樣品未檢出鵝源性DNA
成分。
11.4結(jié)果表述
該樣品未檢出鵝源性DNA成分,
該樣品檢出鵝源性DNA成分。
12防止污染的措施
檢測過程中防止交叉污染的措施參照GB/T19495.2。
5
DB21/T3084—2018
AA
附錄A
(資料性附錄)
試劑盒
A.1試劑盒TaKaRaMiniBESTUniversalGenomicDNAExtractionKitVer.5.0(TaKaRaCode.9765)
組成(50次)
本試劑盒分試劑PartI與PartII兩部分。
PartI-20℃保存
蛋白酶K(proteinaseK,20mg/mL)1mL
核糖核酸酶A(RNaseA,10mg/mL)0.5mL
PartII室溫(15-25℃)保存
緩沖液GL(BufferGL)×112mL
緩沖液GB(BufferGB)×112mL
緩沖液WA(BufferWA)×128mL
緩沖液WB(BufferWB)×224mL
洗脫液(elutionbuffer)14mL
離心管(SpinColumns)50支
收集管(Collectiontubes)50支
A.2試劑盒PremixExTaq?(ProbeqPCR)(TaKaRaCode.RR390A)
組成(50μL反應(yīng)×200次)
PremixExTaq(ProbeqPCR)(2×Conc.)×11.0mL×5支
ROXReferenceDye(50×Conc.)×2200μL×1支
ROXReferenceDyeII(50×Conc.)×2200μL×1支
非商業(yè)性聲明:附錄A所列參考試劑盒僅為提供參考,并不涉及商業(yè)目的,鼓勵(lì)標(biāo)準(zhǔn)使用者嘗試使
用不同廠家或型號的試劑盒及試劑。
6
DB21/T3084—2018
BB
附錄B
(資料性附錄)
擴(kuò)增產(chǎn)物序列
鵝擴(kuò)增產(chǎn)物序列(375bp)
Attcctagccatgcactactcaccagacgcctcaaccgccttttcatcaatcgcccacatcactcgagacgtaaattatggctga
atcatccgctaccttcacgccaatggcgcctcaatattctttatctgcctcttcctacacatcgggcgaggcctatattacggatcatt
tctctactcagaaacctgaaacatcggcattatcctcctgcttgcaactatagcaacagccttcataggctatgtcctcccgtgaggcc
aaatatcattctgaggggccacagtaattacaaacttactatccgccatcccatacattgggacagacctagttcaatgaatctgagga
ggctactcagtagacagtcccac
7
DB21/T3084—2018
參考文獻(xiàn)
[1
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 云南裝飾工程合同標(biāo)準(zhǔn)文本
- 保時(shí)捷銷售合同標(biāo)準(zhǔn)文本
- 公平合作合同標(biāo)準(zhǔn)文本
- 中學(xué)設(shè)備改造合同標(biāo)準(zhǔn)文本
- 修樹勞務(wù)合同標(biāo)準(zhǔn)文本
- 停車設(shè)備回收供貨合同標(biāo)準(zhǔn)文本
- 中介房產(chǎn)員工合同標(biāo)準(zhǔn)文本
- 68歲勞務(wù)合同標(biāo)準(zhǔn)文本
- 住宅質(zhì)保合同標(biāo)準(zhǔn)文本
- 代簽流轉(zhuǎn)合同標(biāo)準(zhǔn)文本
- 冷庫維護(hù)保養(yǎng)合同范本
- 工業(yè)互聯(lián)網(wǎng)基礎(chǔ) 課件 3.1 工業(yè)互聯(lián)網(wǎng)平臺概述
- 智慧酒店智能化系統(tǒng)解決方案
- 2025年合肥濱湖職業(yè)技術(shù)學(xué)院單招職業(yè)技能測試題庫完美版
- 《中建三局工程管理實(shí)習(xí)報(bào)告》2000字
- 家庭牧場申請書
- 2025年遼寧醫(yī)藥職業(yè)學(xué)院高職單招職業(yè)技能測試近5年??及鎱⒖碱}庫含答案解析
- 模塊綜合試卷-2024版化學(xué)高三總復(fù)習(xí)
- 福建省寧德市2024-2025學(xué)年九年級上學(xué)期期末考試道德與法治試題
- 第3課 珍惜水資源(說課稿)-2023-2024學(xué)年五年級下冊科學(xué)教科版
- 2025年中儲糧集團(tuán)公司招聘筆試參考題庫含答案解析
評論
0/150
提交評論