分子生物學(xué)復(fù)習(xí)資料

分子生物學(xué)復(fù)習(xí)資料第二章nucleicacid（核酸）一以核苷酸為基本組成單位的生物信息大分子，包括脫氧核糖核酸（DNA）和核糖核酸（RNA）兩大類。DNA存在于細(xì)胞核和線粒體內(nèi)，攜帶遺傳信息，決定著細(xì)胞和個(gè)體的遺傳型；RNA存在于細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核和線粒體內(nèi)，參與遺傳信息的復(fù)制與表達(dá)。unusualcomponent（稀有堿基）又稱修飾堿基（themodifiedcomponent）指上述五種堿基環(huán)上的某一位置被一些化學(xué)基團(tuán)（如甲基化、甲硫基化等）修飾后的衍生物。一般這些堿基在核酸中的含量稀少，在各種類型核酸中的分布也不均一。如DNA中的修飾堿基主要見于噬菌體DNA，RNA中以tRNA含修飾堿基最多。Ribose戊糖RNA:D-核糖 DNA:D-2-脫氧核糖D-核糖的C-2所連的-OH脫去氧就是D-2脫氧核糖B-DNA：生理?xiàng)l件下最穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)；A-DNA：脫水條件下DNA雙螺旋、及生理?xiàng)l件下的RNA雙螺旋和DNA-RNA雜合雙螺旋中。結(jié)構(gòu)特征：右手雙螺旋、螺旋直徑2.6nm、螺距2.5nm，11個(gè)堿基/周；Z-DNA：存在于CGCGCGCG結(jié)晶體結(jié)構(gòu)中。結(jié)構(gòu)特征：左手螺旋、螺旋直徑1.8nm、螺距4.5nm、12堿基/周、核酸鏈骨架顯Z字型走行。Supercoil（超螺旋）：在共價(jià)閉環(huán)雙螺旋基礎(chǔ)上進(jìn)一步扭轉(zhuǎn)盤曲，形成超螺旋Chromosome（染色體）一獨(dú)立攜帶必需遺傳信息的DNA分子，并包括決定其結(jié)構(gòu)的有關(guān)蛋白質(zhì)。Chromatin（染色質(zhì)）：真核生物染色體都包含一個(gè)很長(zhǎng)的線性DNA分子，并被組裝在細(xì)胞核內(nèi)。染色質(zhì)用來(lái)描述構(gòu)成真核生物染色體的高度有序的DNA—蛋白質(zhì)復(fù)合物。染色質(zhì)結(jié)構(gòu)用來(lái)包裝和組構(gòu)染色體DNA,并能在細(xì)胞周期的不同階段調(diào)整壓縮DNA的水平。Centromere（著絲粒）一兩條染色單體相連的區(qū)域Telomere（端粒）一一條染色體的兩個(gè)末端染色粒之一，用于保持真核生物染色體末端穩(wěn)定性的DNA片段Chromatid（染色單體）一由染色體復(fù)制產(chǎn)生的兩股染色單體中之一，它們由著絲粒拉在一起，在有絲分裂時(shí)，染色單體變成分離的染色體。雙鏈RNA（dsRNA）誘導(dǎo)序列特異的轉(zhuǎn)錄后基因沉默。其作用具有放大和持續(xù)的特點(diǎn).Denaturation（核酸的變性）在某些理化因素作用下，核酸分子互補(bǔ)雙鏈之間氫鍵斷裂，使雙螺旋結(jié)構(gòu)松散變成單鏈的過程。如：溫度、酸堿、有機(jī)溶劑、尿素hyperchromiceffect（增色效應(yīng)）核酸在加熱變性過程中260nm波長(zhǎng)吸收值（A260）增加。它反映了核酸雙鏈的解鏈程度。meltingtemperature,Tm（解鏈溫度或熔解溫度） 核酸加溫變性過程中，A260達(dá)到最大值一半時(shí)的溫度。在Tm時(shí)，核酸分子內(nèi)50%的雙鏈結(jié)構(gòu)被解開。Renaturation（核酸的復(fù)性）又稱退火（annealing）:變性核酸在一定條件下，如溫度逐步恢復(fù)到生理范圍內(nèi)，兩條互補(bǔ)單鏈重新恢復(fù)天然的雙螺旋構(gòu)象。Hypochromicity（減色效應(yīng)）：?jiǎn)我坏暮塑账岬奈罩当萊NA和單鏈DNA的吸收值都大，單鏈DNA又比雙鏈DNA大。這種雙鏈DNA相對(duì)于單鏈DNA吸收值減少的現(xiàn)象稱為減色效應(yīng)molecularhybridization（分子雜交）：不同來(lái)源的核酸經(jīng)變性和復(fù)性的過程，其中一些不同的核苷酸單鏈由于存在局部堿基互補(bǔ)片段，而在復(fù)性時(shí)形成雜化雙鏈（heteroduple_）的過程。Probe（分子探針）：帶有某種標(biāo)記物的分子，如核苷酸鏈片段。第三章peptidebone（肽鍵）一個(gè)氨基酸的?-羧基與另一個(gè)氨基酸的?-氨基之間脫水縮合形成的化學(xué)鍵。peptideunit（肽平面——肽單元）參與構(gòu)成肽鍵的6個(gè)原子（C?1、C、O、N、H、C?2）被約束在同一個(gè)平面上，C?1和C?2處平面對(duì)角，這樣的平面單位稱為肽平面。Conformation（構(gòu)象）：指一類不涉及共價(jià)鍵改變的立體結(jié)構(gòu)問題。如蛋白質(zhì)的一、二、三、四級(jí)結(jié)構(gòu)。configuration（構(gòu)型）：指一類涉及共價(jià)鍵改變的立體結(jié)構(gòu)問題。如氨基酸的L-型和D-型。Primarystructure（一級(jí)結(jié)構(gòu)）指多肽鏈中氨基酸的排列順序稱為蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)。Secondarystructure（二級(jí)結(jié)構(gòu)）指多肽鏈主鏈以肽平面為單位折疊形成局部肽段的空間排布方式。即主鏈原子的局部空間排布（即構(gòu)象），并不涉及側(cè)鏈部分的位置-heli_（?-螺旋）蛋白質(zhì)分子中局部肽鏈的肽平面通過a碳原子旋轉(zhuǎn)，使碳鏈主鏈沿中心軸盤曲成穩(wěn)定的右手螺旋構(gòu)象-pleatedsheet（?-折疊）多肽鏈的局部肽段，以肽鍵平面為單位折疊成鋸齒狀的一種較伸展結(jié)構(gòu).-turn（?-轉(zhuǎn)角）多肽鏈中的某局部出現(xiàn)180度回折處形成的特定構(gòu)象randomcoil（無(wú)規(guī)則卷曲）沒有明確規(guī)律性的那部分肽段的結(jié)構(gòu)。但這些一無(wú)規(guī)則卷曲口也象其他二級(jí)結(jié)構(gòu)那樣是明確而穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)。即蛋白質(zhì)在其多肽鏈的不同區(qū)段可形成不同的二級(jí)結(jié)構(gòu)。supersecondarystructure（超二級(jí)結(jié)構(gòu)）即模體（motif）是指在多肽鏈內(nèi)順序上相互靠近的二級(jí)結(jié)構(gòu)常常在空間折疊中彼此相互作用，形成規(guī)則的二級(jí)結(jié)構(gòu)聚合體。Domain（結(jié)構(gòu)域）是指在較大蛋白質(zhì)分子中，由于多肽鏈上相鄰的超二級(jí)結(jié)構(gòu)緊密聯(lián)系，形成二個(gè)或多個(gè)在空間上可以明顯區(qū)別的局部區(qū)域（一般為球狀），常具有特定的功能。有時(shí)也稱功能域（functionaldomain）。tertiarystructure（三級(jí)結(jié)構(gòu)）指在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上，多肽鏈進(jìn)一步卷曲、折疊而形成具有一定規(guī)律的三維空間結(jié)構(gòu)。三級(jí)結(jié)構(gòu)是一條多肽鏈的完整的構(gòu)象，包括全部的主鏈和側(cè)鏈的專一性的空間排布。Quaternarystructure（四級(jí)結(jié)構(gòu)）指具有二條或二條以上獨(dú)立三級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈組成的蛋白質(zhì)，其多肽鏈間通過次級(jí)鍵相互結(jié)合，而形成空間結(jié)構(gòu)molecularchaperone（分子伴侶）：為蛋白質(zhì)折疊提供一個(gè)有利的折疊環(huán)境，與未折疊肽段的疏水部分可逆結(jié)合，防止聚集和錯(cuò)誤折疊，誘導(dǎo)正確折疊。如熱休克蛋白（heatshockprotein）等denaturation（蛋白質(zhì)的變性）天然蛋白質(zhì)的嚴(yán)密結(jié)構(gòu)在某些理化因素的作用下，其特定的空間結(jié)構(gòu)破壞，從而導(dǎo)致質(zhì)理化性質(zhì)改變和生物學(xué)活性喪失renaturation（復(fù)性）若蛋白質(zhì)變性程度較輕，去除變性因素后，有些蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)象和功能。densitygradient（密度梯度）：密度隨距離不同而改變，尤其指在試管或小室中，溶液的密度從一端向另一端改變。densitygradientzonalcentrifugation（密度梯度離心）：為了制備或分析，將大分子通過密度梯度進(jìn)行離心的方法。Electrophoresis（電泳）蛋白質(zhì)在高于或低于其等電點(diǎn)（pI）的溶液中為帶電的顆粒，在電場(chǎng)中能向正極或負(fù)極移動(dòng)。通過蛋白質(zhì)在電場(chǎng)中泳動(dòng)而達(dá)到分離各種蛋白質(zhì)的目的。Chromatography（層析）待分離蛋白質(zhì)溶液（流動(dòng)相）經(jīng)過一個(gè)固態(tài)物質(zhì)（固定相）時(shí)，根據(jù)溶液中待分離的蛋白質(zhì)顆粒大小、電核多少及親和力等，使待分離的蛋白質(zhì)組分在兩相中反復(fù)分配，并以不同的速度流經(jīng)固定相而達(dá)到分離蛋白質(zhì)的目的。第四章Gene（基因）：是指攜帶有遺傳信息的DNA或RNA序列，也稱為遺傳因子，是控制性狀的基本遺傳單位?；蛲ㄟ^指導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成來(lái)表達(dá)自己所攜帶的遺傳信息，從而控制生物個(gè)體的性狀表現(xiàn)。codingregions（編碼區(qū)），開放閱讀框（openreadingframe,ORF）：可以翻譯成蛋白質(zhì)的DNA區(qū)域；在真核細(xì)胞中，編碼區(qū)可被內(nèi)含子隔斷。internalnoncodingregions非編碼區(qū)，非翻譯區(qū)（untranslatedregions,UTRs）：轉(zhuǎn)錄單位中不能翻譯成蛋白質(zhì)的部分。在編碼區(qū)兩側(cè)的UTRs為5’和3'UTRs（或稱為前導(dǎo)和尾隨序列）。Operator（操縱子）：包含幾個(gè)基因及其共同調(diào)控元件的細(xì)菌基因座Locus（基因座）：又稱座位?；蛟谌旧w上所占的位置。在分子水平上，是有遺傳效應(yīng)的DNA序列。一個(gè)基因座可以是一個(gè)基因，一個(gè)基因的一部分，或具有某種調(diào)控作用的DNA序列。編碼在相同基因座上的DNA被稱為等位基因。E_on（外顯子）：基因中編碼的序列，轉(zhuǎn)錄單位余下部分通過剪接結(jié)合起來(lái)并表達(dá)的區(qū)域，是基因中對(duì)應(yīng)于mRNA序列的區(qū)域。Intron（內(nèi)含子）：基因中不編碼的、打斷轉(zhuǎn)錄單位的間插序列，必需在RNA水平上去除。Genome（基因組）：生物機(jī)體一個(gè)細(xì)胞所有不同染色體上全部的DNA總和稱為基因組?；蚪M中不同區(qū)域具有不同的功能，有些是編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因，有些是復(fù)制及轉(zhuǎn)錄的調(diào)控信號(hào)，有些區(qū)域的功能尚不清楚。Genomeinprokaryoticcell（原核生物基因組）：環(huán)狀或線狀的雙鏈分子所含有的全部DNA，包括染色體外的質(zhì)?；蚪M。euKaryoticgenome（真核生物基因組）：真核生物的基因組，包括染色體基因組和核內(nèi)染色體外基因組，以及細(xì)胞質(zhì)中的線粒體、葉綠體基因組等。C值（C-value）：是指一個(gè)單倍體基因組中的全部DNA含量。C值矛盾（C-valueparado_）:生物體形態(tài)學(xué)復(fù)雜程度與C值大小不一致的現(xiàn)象。uniquesequence（單拷貝序列）：非重復(fù)序列，在基因組中只有一個(gè)拷貝－結(jié)構(gòu)基因。moderatelyrepetitivesequence（中度重復(fù)序列）幾十到幾十萬(wàn)個(gè)拷貝，一般是不編碼的序列satelliteDNA（衛(wèi)星DNA）,隨體DNA：高度重復(fù)序列，百萬(wàn)次重復(fù)，占總序列10-60%，6-100bp，不轉(zhuǎn)錄。invertedrepeatsequence（反向重復(fù)序列）：兩個(gè)序列相同但方向相反在同一DNA鏈上互補(bǔ)拷貝的一段重復(fù)序列multigenefamily（多基因家族）真核生物基因組中許多來(lái)源相同、結(jié)構(gòu)相似、功能相關(guān)的一組基因。mutation（突變）：在基因組的某一特定區(qū)域核苷酸序列發(fā)生改變而引起的基因型穩(wěn)定的可遺傳的改變。Mutant（突變體）：帶有某一特定突變基因的基因組、細(xì)胞或個(gè)體。genemutation（基因突變）：局部突變，即影響單個(gè)核苷酸或一小簇核苷酸。發(fā)生在某一基因內(nèi)部，會(huì)影響基因產(chǎn)物的性質(zhì)或干擾其表達(dá)。genetransfer（基因轉(zhuǎn)移）：外源的遺傳信息進(jìn)入一個(gè)細(xì)胞的現(xiàn)象。這種過程在細(xì)菌和真核生物中都會(huì)自然發(fā)生接合（conjugation）指通過細(xì)胞的直接接觸（如菌毛），遺傳信息從供體單向轉(zhuǎn)移到受體的過程。轉(zhuǎn)化（transformation）細(xì)胞從周圍介質(zhì)中吸收裸露的DNA,而獲得新的遺傳表型。轉(zhuǎn)導(dǎo)（transduction）通過病毒介導(dǎo)發(fā)生在供體細(xì)胞與受體細(xì)胞之間的DNA轉(zhuǎn)移及基因重組。轉(zhuǎn)座（transposition）由插入序列和轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)移或重排。轉(zhuǎn)座子（transposon）：在基因組中可以移動(dòng)的一段DNA序列。RecombinantDNA不同DNA之間發(fā)生共價(jià)連接形成新的DNA分子。重組產(chǎn)物為重組體DNA。位點(diǎn)特異性重組：由整合酶或轉(zhuǎn)座酶