體外診斷檢驗(yàn)系統(tǒng) 病原微生物檢測和鑒定用基于核酸擴(kuò)增的檢驗(yàn)程序 實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量實(shí)踐指南 征求意見稿_第1頁
體外診斷檢驗(yàn)系統(tǒng) 病原微生物檢測和鑒定用基于核酸擴(kuò)增的檢驗(yàn)程序 實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量實(shí)踐指南 征求意見稿_第2頁
體外診斷檢驗(yàn)系統(tǒng) 病原微生物檢測和鑒定用基于核酸擴(kuò)增的檢驗(yàn)程序 實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量實(shí)踐指南 征求意見稿_第3頁
體外診斷檢驗(yàn)系統(tǒng) 病原微生物檢測和鑒定用基于核酸擴(kuò)增的檢驗(yàn)程序 實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量實(shí)踐指南 征求意見稿_第4頁
體外診斷檢驗(yàn)系統(tǒng) 病原微生物檢測和鑒定用基于核酸擴(kuò)增的檢驗(yàn)程序 實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量實(shí)踐指南 征求意見稿_第5頁
已閱讀5頁,還剩72頁未讀, 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡介

1GB/T39367—20XX/ISO17822:2020體外診斷檢驗(yàn)系統(tǒng)基于核酸擴(kuò)增的病原微生物檢測和鑒定程序?qū)嶒?yàn)室質(zhì)量指南本文件描述了基于核酸擴(kuò)增的微生物病原體檢測、鑒定和定量方法,規(guī)定了在臨床實(shí)驗(yàn)室使用過程中相關(guān)的質(zhì)量保證要求。醫(yī)療器械的研發(fā)。但是,本文件包含實(shí)驗(yàn)室實(shí)施和使用過程中,對醫(yī)療器械和/或相應(yīng)過程的性能驗(yàn)證和性能確認(rèn)。2規(guī)范性引用文件下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。ISO15189醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量和能力的要求3術(shù)語和定義下列術(shù)語和定義適用于本文件。3.1準(zhǔn)確度accuracy測試結(jié)果或測量結(jié)果與真值間的一致程度。2GB/T39367—20XX/ISO17822:20203.2擴(kuò)增產(chǎn)物amplificationproduct通過DNA擴(kuò)增技術(shù)產(chǎn)生的特定DNA(3.17)片段,如聚合酶鏈反應(yīng)(PCR3.34)。3.3分析特異性analyticalspecificity特異性specificity測量系統(tǒng)的能力,用指定的測量程序,對一個或多個被測量(3.28)給出的測量結(jié)果互不依賴也不依賴于接受測量的系統(tǒng)中的任何其他量。3.4生物風(fēng)險biorisk可能導(dǎo)致危害的特定不良事件(在本文件中:意外感染或未經(jīng)授權(quán)的訪問、丟失、盜竊、誤用、轉(zhuǎn)移或故意釋放)發(fā)生的概率或機(jī)會。[來源:世衛(wèi)組織生物風(fēng)險管理,實(shí)驗(yàn)室生物安保指南,2006年9月]3.5生物安全biosafety描述為防止意外暴露于病原體和毒素或其意外釋放而實(shí)施的遏制原則、技術(shù)和實(shí)踐。[來源:世衛(wèi)組織生物風(fēng)險管理實(shí)驗(yàn)室生物安保指南,2006年9月]3.6生物安保biosecurity3GB/T39367—20XX/ISO17822:2020一套預(yù)防措施和行動,以減少有意或無意傳播傳染性疾病的風(fēng)險。注2:這些預(yù)防措施是實(shí)驗(yàn)室為防止危險病原體和毒素被惡意使用而3.7校準(zhǔn)calibration在規(guī)定條件下的一組操作,第一步是確定由測量標(biāo)準(zhǔn)提供的具有相關(guān)測量不確定度的量值與相應(yīng)示值之間的關(guān)系,第二步是用此關(guān)系根據(jù)示值確定測量結(jié)果。3.8有證參考物質(zhì)certifiedreferencematerial;CRMRM(3.41)以一種或多種指定特性的計量有效程序表征,并附有RM(3.41)證書,提供規(guī)定屬性的值、相關(guān)不確定度和計量學(xué)追溯性聲明。3.9臨床性能clinicalperformance<檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)>體外診斷檢驗(yàn)程序產(chǎn)生的特定臨床條件或生理狀態(tài)相關(guān)的結(jié)果與目標(biāo)人群和預(yù)期使用者一致的能力。3.10臨床靈敏度clinicalsensitivity診斷靈敏度diagnosticsensitivity<檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)>體外診斷檢驗(yàn)程序可以識別與特定疾病或狀態(tài)相關(guān)的目標(biāo)標(biāo)志物存在的能力。4GB/T39367—20XX/ISO17822:2020注1:在目標(biāo)標(biāo)志物已知存在的樣品(3.443.11臨床特異性clinicalspecificity診斷特異性diagnosticspecificity<檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)>體外診斷檢驗(yàn)程序可以識別特定疾病或狀態(tài)相關(guān)的目標(biāo)標(biāo)志物不存在的能力。注1:在目標(biāo)標(biāo)志物已知不存在的樣品(3.443.12互補(bǔ)DNAcomplementaryDNA;cDNA在逆轉(zhuǎn)錄酶存在下合成的與給定的RNA(3.42)互補(bǔ)的單鏈DNA(3.17作為合成DNA(3.17)拷貝的模板(3.47)。3.13污染contamination非預(yù)期材料或物質(zhì)的引入。3.14臨界值(陽性判斷值)cut-offvalue用于鑒別樣品(3.44),作為判斷特定疾病、狀態(tài)或被測量(3.28)存在或不存在的界限的量值。3.15變性denaturation5GB/T39367—20XX/ISO17822:2020導(dǎo)致核酸雙螺旋分離的物理和/或化學(xué)處理。3.16脫氧核糖核苷三磷酸deoxyribonucleosidetriphosphate,dNTP和/或脫氧尿苷三磷酸(dUTP)的溶液。3.17脫氧核糖核酸deoxyribonucleicacid,DNA以雙鏈(dsDNA)或單鏈(ssDNA)形式存在的脫氧核糖核苷酸聚合物。3.18PCR用DNA聚合酶DNApolymeraseforPCR反復(fù)催化DNA(3.17)合成的耐熱酶3.19DNA測序DNAsequencing確定DNA(3.17)分子中核苷酸堿基(腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶)的順序。3.20雜交hybridization在適當(dāng)反應(yīng)條件下互補(bǔ)核酸(3.32)序列特異性結(jié)合的過程。3.216GB/T39367—20XX/ISO17822:2020抑制inhibition降低擴(kuò)增或干擾檢測過程,可能導(dǎo)致假陰性結(jié)果或質(zhì)量下降。3.22干擾物質(zhì)interferingsubstances臨床標(biāo)本/樣品(3.44)中可改變檢查結(jié)果的內(nèi)源性或外源性物質(zhì)。3.23內(nèi)部檢驗(yàn)Inhouseassay實(shí)驗(yàn)室自建檢測laboratorydevelopedtest,LDT在一個實(shí)驗(yàn)室內(nèi)設(shè)計、制造和使用的一種體外診斷試驗(yàn)。3.24線性linearity分析方法在一定范圍內(nèi)給出與實(shí)驗(yàn)室樣品(3.44)中待測目標(biāo)核酸序列(3.46)數(shù)量成比例的儀器響應(yīng)或結(jié)果的能力。注2:術(shù)語線性經(jīng)常與方法的線性范圍相聯(lián)系,是指方法給出與目標(biāo)核酸序列(3.46)濃度成正比例的響應(yīng)或結(jié)果3.25檢出限limitofdetection,LOD由給定測量程序得到的測得量值,對于此值,在給定聲稱物質(zhì)中存在某成分的誤判概率為α?xí)r,聲稱不存在該成分的誤判概率為β。注2:在基于核酸的鑒定檢驗(yàn)中,檢出限為在方法規(guī)定的實(shí)驗(yàn)條件下注3:在定性分子方法和定量分子方法中,能夠穩(wěn)定檢測到的被測量的最低濃度(通常是在常規(guī)臨床實(shí)驗(yàn)室條件7GB/T39367—20XX/ISO17822:20203.26定量限limitofquantification,LOQ在方法規(guī)定的實(shí)驗(yàn)條件下能夠穩(wěn)定地以合理的統(tǒng)計確定性進(jìn)行測量的,在特定體積中的目標(biāo)核酸序列(3.46)的最低濃度或質(zhì)量。3.27反應(yīng)混合液mastermix除目標(biāo)DNA(3.17)和對照外,PCR(3.34)所需的試劑的混合物。3.28被測量measurand擬測量的量。-<擴(kuò)增注1:被測量的規(guī)范要求了解量的種類,包括任何相關(guān)3.29陰性(PCR)質(zhì)控negative(PCR)control在沒有目標(biāo)模板(3.47)的情況下進(jìn)行的反應(yīng)。3.30陰性(過程)質(zhì)控negative(process)control所采集標(biāo)本的無目標(biāo)病原體的樣品(3.44該樣品貫穿分析過程的所有階段。8GB/T39367—20XX/ISO17822:2020注:基于核酸的檢驗(yàn)過程通常包括樣品(3.44)制備、富集、核酸(3.32)提取和靶擴(kuò)增。3.31無模板對照notemplatecontrol,NTC包含除核酸(3.32)模板(3.47)外所有試劑的對照反應(yīng)。3.32核酸nucleicacid作為遺傳信息或信息表達(dá)媒介的大分子。3.33核酸提取nucleicacidextraction從生物物質(zhì)材料中分離出核酸(3.32)。3.34聚合酶鏈反應(yīng)polymerasechainreaction,PCR體外擴(kuò)增DNA(3.17)的酶促反應(yīng)程序。3.35多項(xiàng)式回歸polynomialregression使用不同階次多項(xiàng)式的最小二乘回歸。1X(一階多項(xiàng)式或線性擬合)2X2(二階多項(xiàng)式及2X23X3(三階多項(xiàng)式)9GB/T39367—20XX/ISO17822:20203.36PCR質(zhì)量級DNAPCR-qualityDNA具有足夠長度、純度和數(shù)量的,用于進(jìn)行PCR(3.34)反應(yīng)的DNA(3.17)模板(3.47)。3.37監(jiān)管機(jī)構(gòu)批準(zhǔn)的試劑盒regulatorybodyapprovedassay由制造商設(shè)計和開發(fā)并由監(jiān)管機(jī)構(gòu)批準(zhǔn)用于診斷目的的體外診斷產(chǎn)品。3.38逆轉(zhuǎn)錄reversetranscription,RT在一系列合適的條件下,利用與一條或多條寡核苷酸引物結(jié)合逆轉(zhuǎn)錄酶的酶活性從RNA(3.42)模板(3.47)合成DNA(3.17)的過程。3.39修改的IVD試劑盒modifiedIVDlabeledassays修改的IVD診斷產(chǎn)品modifiedIVDlabeledtests由制造商設(shè)計和開發(fā)并經(jīng)監(jiān)管機(jī)構(gòu)批準(zhǔn)的,或滿足用于診斷目的適用相關(guān)要求的體外診斷產(chǎn)品,但在實(shí)驗(yàn)室使用時這些體外診斷產(chǎn)品已發(fā)生更改。3.40實(shí)時熒光PCRrealtimePCR在同一反應(yīng)容器中結(jié)合PCR(3.34)和熒光探針檢測擴(kuò)增產(chǎn)物的方法。3.41參考物質(zhì)referencematerial,RM一種或多種指定特性足夠均勻和穩(wěn)定,在測量過程中已被證明適合其預(yù)期用途的物質(zhì)。注3:用途可以包括測量系統(tǒng)的校準(zhǔn)(3.7)、測量程序的評估、為其他GB/T39367—20XX/ISO17822:2020),3.42核糖核酸RNA,ribonucleicacid以雙鏈或單鏈的形式存在的核糖核苷酸聚合物。3.43穩(wěn)健性robustness盡管條件略有變化,但分析仍能以最佳方式進(jìn)行的能力。注:通常指盡管PCR(3.34)反應(yīng)3.44取自某個總體或某個批次的小部分或少量,理想情況下是整體的代表性選擇。3.45序列數(shù)據(jù)庫sequencedatabase<生物信息學(xué)>由核酸(3.32)序列、蛋白質(zhì)序列或其他聚合物序列及相關(guān)注釋組成的生物數(shù)據(jù)庫。注1:注釋可能與有機(jī)體、物種、功能、與特定疾病相關(guān)的突變、功能或結(jié)注2:已發(fā)表的基因組序列可以公開獲得,因?yàn)槊總€科學(xué)期刊都要求任何已發(fā)表3.46目標(biāo)序列targetsequence目標(biāo)核酸序列nucleicacidtargetsequence靶向檢測的特定DNA(3.17)序列,例如通過PCR(3.34)。3.47GB/T39367—20XX/ISO17822:2020指定新合成的DNA(3.17)或RNA(3.42)鏈的堿基序列的DNA或RNA鏈,這兩條鏈互補(bǔ)。3.48單向工作流unidirectionalworkflow正向工作流程forwardworkflow<檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)>物料/樣品處理的原則,用于確保原始樣品(3.44)、處理過的樣品(包括擴(kuò)增后的DNA(3.17))在整個檢驗(yàn)程序中保持物理隔離。3.49確認(rèn)validation通過提供客觀證據(jù)對特定的預(yù)期用途或應(yīng)用要求已得到滿足的認(rèn)定。3.50驗(yàn)證verification通過提供客觀證據(jù)對規(guī)定要求已得到滿足的認(rèn)定?!儞Q方法進(jìn)行計算;——進(jìn)行測試和演示;——文件發(fā)布前進(jìn)行評審。4微生物病原體實(shí)驗(yàn)室通用要求4.1實(shí)驗(yàn)室風(fēng)險管理和生物安全通用要求GB/T39367—20XX/ISO17822:2020醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)確保實(shí)驗(yàn)室員工和服務(wù)人員的安全和防護(hù)。ISO15190的要求適用。由于許多微生物具有致病性,應(yīng)采用適當(dāng)?shù)纳锇踩珮?biāo)準(zhǔn)。醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)對基于核酸的檢驗(yàn)過程進(jìn)行評估,以識別故障模式、操作錯誤、危險和危險狀況等相關(guān)風(fēng)險。應(yīng)在檢驗(yàn)項(xiàng)目開發(fā)前和開發(fā)過程中對患者和實(shí)驗(yàn)室工作人員的相關(guān)風(fēng)險進(jìn)行識別。應(yīng)在檢驗(yàn)活動實(shí)施前和實(shí)施過程中,以及在其運(yùn)行的生命周期內(nèi)經(jīng)常性的評估、監(jiān)控和降低相關(guān)風(fēng)險。4.2病原體檢測的通用實(shí)驗(yàn)室設(shè)置核酸擴(kuò)增檢測實(shí)驗(yàn)室設(shè)置應(yīng)遵循最佳實(shí)踐的通用要求,通常包括擴(kuò)增前和擴(kuò)增后的物理分區(qū),以及各實(shí)驗(yàn)流程的區(qū)域化。在進(jìn)行適當(dāng)?shù)娘L(fēng)險評估時,應(yīng)充分考慮病原體的因素。值得注意的是,樣品處理的風(fēng)險水平高于提取的核酸。因此,較高風(fēng)險類別的病原體樣本通常需要處理為較低風(fēng)險類別的核酸,然后進(jìn)行核酸擴(kuò)增檢測。但是,不能由此認(rèn)為提取程序可保證樣品無傳染性,仍然需要進(jìn)行相關(guān)安全風(fēng)險評估。為提高生物安全性,病原體滅活宜盡早進(jìn)行。但是,需要對滅活方法的有效性進(jìn)行確認(rèn),適當(dāng)?shù)娘L(fēng)險和安全程序仍然是必要的。管理和減少污染的通用實(shí)驗(yàn)室設(shè)置。污染源可分為五類,實(shí)驗(yàn)室的設(shè)置宜盡量減少每個潛在來源的污染風(fēng)險。來源于實(shí)驗(yàn)室外。病原體檢測通常不存在問題,雖然密切相關(guān)的環(huán)境物種可能導(dǎo)致污染風(fēng)險,該情況下宜使用正壓實(shí)驗(yàn)室。有關(guān)單向工作流和氣壓條件的詳細(xì)信息,參見7.2.2。主要污染源是由實(shí)驗(yàn)室大量核酸制備造成的。當(dāng)使用核酸擴(kuò)增檢測時,這是一個典型的問題,因?yàn)槠淇僧a(chǎn)生大量靶標(biāo)(擴(kuò)增產(chǎn)物這是所有核酸擴(kuò)增檢測污染的主要來源。實(shí)驗(yàn)室污染來源也可以來自使用包含目標(biāo)序列的載體。在病原體檢測中,它也可能來源于目標(biāo)病原體的微生物培養(yǎng)物。通過將樣品制備和檢測系統(tǒng)與可能產(chǎn)生大量核酸的其他實(shí)驗(yàn)室活動分隔開來,可降低污染風(fēng)險。宜通過使用專用實(shí)驗(yàn)設(shè)備和工作服來減少進(jìn)一步的污染風(fēng)險。事實(shí)上許多核酸擴(kuò)增檢測試劑來源于重組表達(dá),因此可能存在低水平的細(xì)菌DNA。當(dāng)靶向直系同源基因,如16S核糖體RNA基因時,將引起較大的問題。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020由于分析人員通常不攜帶病原體,所以一般不是病原體特異性核酸擴(kuò)增檢測的主要污染源。但是某些病原體(或密切相關(guān)的物種)可引起無癥狀感染,因此也是潛在的污染風(fēng)險。標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室程序(如使用防護(hù)服、手套、濾芯吸頭等)可降低污染風(fēng)險。通常是未被識別的潛在主要污染源。當(dāng)高濃度病原體樣品在低濃度或陰性樣品旁制備時,可能發(fā)生交叉污染。標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室程序(如使用濾芯吸頭)可降低污染風(fēng)險。以降低污染風(fēng)險。這可能包括限制人員走向和遵守從擴(kuò)增產(chǎn)物陰性區(qū)域到擴(kuò)增產(chǎn)物陽性區(qū)域的正向工作流,和/或使用一次性實(shí)驗(yàn)服或其他防護(hù)服。該做法可能不適用于核酸提取、擴(kuò)增和檢測自動化的單一工作流程封閉系統(tǒng)。最終應(yīng)以適當(dāng)?shù)姆绞奖O(jiān)測污染,以確定其對檢測結(jié)果的影響。實(shí)驗(yàn)室人員、保潔和所有其他進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室的人員應(yīng)接受培訓(xùn),并將培訓(xùn)形成記錄。更多信息參見第5章4.3商用設(shè)備(含軟件程序)對于核酸擴(kuò)增檢測的設(shè)備,包括分析所需的軟件程序,應(yīng)按照制造商的使用說明和實(shí)驗(yàn)室程序文件進(jìn)行安裝、驗(yàn)證、校準(zhǔn)和維護(hù)。在適用的情況下,應(yīng)對實(shí)驗(yàn)室儀器與現(xiàn)有IT基礎(chǔ)設(shè)施的整合情況進(jìn)行驗(yàn)證。如果同一核酸檢測項(xiàng)目可能使用多臺儀器,則應(yīng)進(jìn)行儀器間比較,以確保結(jié)果的可比性。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的儀器組件之間的接口,還應(yīng)驗(yàn)證制造商開發(fā)的儀器組件之間的接口。4.4實(shí)驗(yàn)室人員指定進(jìn)行核酸擴(kuò)增檢測的人員應(yīng)具備資格并接受培訓(xùn),達(dá)到特定核酸擴(kuò)增檢測和病原體操作所需的能力水平,包括接受繼續(xù)教育以維持能力。人員的資格和培訓(xùn)應(yīng)形成記錄。5病原體核酸擴(kuò)增檢測試劑盒的設(shè)計和建立一般情況下,設(shè)計的相關(guān)準(zhǔn)則應(yīng)列入設(shè)計計劃中。設(shè)計和建立的計劃應(yīng)包括:a)用戶需求和利益相關(guān)者要求的定義;b)預(yù)期醫(yī)療用途的定義;c)性能要求和規(guī)范以及基于預(yù)期用途的其他設(shè)計要求和規(guī)范;d)產(chǎn)品風(fēng)險評估;GB/T39367—20XX/ISO17822:2020e)試劑盒設(shè)計和試劑盒組分供應(yīng)商資格,宜包括但不限于:標(biāo)本采集與處理、核酸提取、核酸擴(kuò)增、目標(biāo)微生物病原體核酸的檢測與鑒定、實(shí)驗(yàn)室設(shè)計、工作流程和實(shí)驗(yàn)室實(shí)踐;f)可行性階段的實(shí)施;g)驗(yàn)證和確認(rèn)方案;h)性能指標(biāo)的驗(yàn)證;i)實(shí)驗(yàn)室規(guī)?;a(chǎn)流程的設(shè)計j)預(yù)期用途確認(rèn)k)試劑研發(fā)過程中和建立后的設(shè)計變更應(yīng)進(jìn)行記錄。病原體特定的考慮項(xiàng)宜包括但不限于:病原體的基因、包括物種內(nèi)和跨物種的序列異質(zhì)性、“種下——使用多重Panel(如呼吸道多重P);——如使用的多重Panel不用于病原體的鑒別,考慮項(xiàng)可包括潛伏期、攜帶、參考區(qū)間等。5.1質(zhì)控品5.1.1質(zhì)控品的檢查為了獲得可靠的數(shù)據(jù)和檢測結(jié)果,選擇和使用合適的質(zhì)量控制和質(zhì)控品至關(guān)重要。實(shí)驗(yàn)室在進(jìn)行性能驗(yàn)證或者性能確認(rèn)之前,應(yīng)先明確質(zhì)控品的要求和規(guī)范。質(zhì)控品的使用頻率可根據(jù)性能驗(yàn)證或者性能確認(rèn)結(jié)果的檢測性能特征來確定。在適當(dāng)?shù)那闆r下,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)使用質(zhì)控品(例如,能夠評估核酸提取過程有效性的質(zhì)控品)進(jìn)行檢測,減少由于整體或部分檢測程序的性能不足而產(chǎn)生錯誤結(jié)果的可能性。特別是質(zhì)量保證程序的設(shè)計應(yīng)盡量減少假陽性和假陰性結(jié)果的產(chǎn)生。核酸擴(kuò)增檢測方法的內(nèi)參/抑制物對照可以是外源性的同源內(nèi)參/對照、外源性的非同源內(nèi)參/對照、內(nèi)源性的非同源內(nèi)參/對照。如果在標(biāo)本制備前加入,內(nèi)參也可以作為全過程的對照。核酸擴(kuò)增檢測的兩個主要階段需要進(jìn)行質(zhì)量控制,以避免可能的檢測失敗1)從樣品采集到提取核酸的整個前處理流程(2)核酸擴(kuò)增和檢測在內(nèi)的過程。核酸擴(kuò)增檢測應(yīng)包含正確的質(zhì)控措施,以確保所生成數(shù)據(jù)的整體質(zhì)量和可靠性。對質(zhì)控品和質(zhì)控程序選擇的理由應(yīng)進(jìn)行記錄。陰性質(zhì)控的目的是在沒有預(yù)期靶標(biāo)的情況下進(jìn)行檢測,以評價由方法的非特異性或污染導(dǎo)致的假陽性結(jié)果。最簡單的陰性質(zhì)控可以通過無模板反應(yīng)實(shí)現(xiàn),然而更復(fù)雜的陰性質(zhì)控通常包括樣品中可能也存在的核酸,例如人DNA,以評估檢測的特異性。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020陰性質(zhì)控可用于評價整個過程,以提供假陽性來源的進(jìn)一步信息(例如,樣品處理過程中的交叉污染)。在這種情況下,可以使用適當(dāng)?shù)纳飿悠坊蚝铣商娲铮ㄈ缪?、貯存液但在用于評估假陽性之前,應(yīng)證明其不含病原體靶核酸。陽性質(zhì)控的目的是用于評價假陰性結(jié)果和檢測的質(zhì)量,適用于對整個實(shí)驗(yàn)過程或單個樣品的評價。陽性質(zhì)控品可以是純化的核酸、純化的擴(kuò)增產(chǎn)物、含有靶核酸序列的載體(例如質(zhì)粒)和合成核酸(見表1)。如使用載體或擴(kuò)增產(chǎn)物,應(yīng)在其加入PCR反應(yīng)體系之前(見圖1將其稀釋至適當(dāng)濃度(≤107copies/μL以減少高濃度核酸造成污染的可能。在已經(jīng)驗(yàn)證的合理稀釋度下,含有目標(biāo)病原體的貯存液可用作陽性質(zhì)控(如病毒檢測)。應(yīng)選擇適合的質(zhì)控品濃度,以驗(yàn)證檢測方法在分析決定水平和臨床決定水平的性能。對于定性程序,陽性質(zhì)控品(擴(kuò)增或提?。┑臐舛纫私咏栃詷颖局休^低的臨床病原體載量水平。對于定量程序,除非標(biāo)準(zhǔn)曲線已經(jīng)涵蓋,否則宜使用接近報告范圍上限的強(qiáng)陽性質(zhì)控和接近檢測下限的弱陽性質(zhì)控。標(biāo)準(zhǔn)曲線可以是系列稀釋的病原體基因組核酸或等同物(例如,含有靶向核酸序列的質(zhì)粒)。但是,這不適用于評價動態(tài)范圍或校準(zhǔn)整個過程。因此,在可能的情況下,建議使用適當(dāng)基質(zhì)中連續(xù)稀釋的完整病原體,以覆蓋提取過程的線性動態(tài)范圍。由于潛在的引物二聚體污染,不宜將擴(kuò)增產(chǎn)物用于建立標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果質(zhì)控品由實(shí)驗(yàn)室設(shè)計和制備(加入靶標(biāo)的混合樣本、內(nèi)參等宜制備和保存足夠的單管樣品以避免反復(fù)凍融。對于實(shí)驗(yàn)室自制的質(zhì)控品,需要對其穩(wěn)定性進(jìn)行確認(rèn)。自制的質(zhì)控品不應(yīng)在明確的保質(zhì)期外使用。在適當(dāng)?shù)那闆r下,宜實(shí)施全過程對照(例如,能夠同時評價分析前/分析中程序(如提?。┯行缘膶φ掌罚?。更多信息見表1。提取對照可以是一批含有目標(biāo)核酸的患者標(biāo)本,或添加目標(biāo)病原體的無病原體基質(zhì)?;|(zhì)宜與待測樣品相同或相似。內(nèi)參和抑制物對照(即能夠檢測到抑制的對照品)應(yīng)盡可能模擬靶核酸,但不能被靶向病原的試劑檢出。抑制物對照通常是可評價分子生物學(xué)檢測步驟(例如,PCR和逆轉(zhuǎn)錄)的核酸物質(zhì)。建議在適當(dāng)?shù)那闆r下使用整個病原體作為內(nèi)參,而不僅是使用核酸。內(nèi)參宜以已知濃度加到所有待測標(biāo)本中。內(nèi)參宜在產(chǎn)量、完整性和純度方面具有與提取靶序列相似的特征,且不與靶核酸競爭。其表1陽性質(zhì)控和陰性質(zhì)控的示例聚體,這可能與使用dsDNA結(jié)GB/T39367—20XX/ISO17822:2020測檢測)的假陽性結(jié)果)酸酸類型和加入內(nèi)參的反應(yīng)階段5.1.2確定目標(biāo)序列核酸擴(kuò)增方法確認(rèn)和驗(yàn)證的核心在于對核酸序列的選擇,一方面包括擴(kuò)增所用的引物,另一方面也包括了靶標(biāo)序列。通常情況下,檢測的靈敏度主要取決于引物與基因靶序列結(jié)合的效率。同時檢測的特異性在很大程度上取決于待擴(kuò)增的基因區(qū)域的選擇?;虬邢騾^(qū)域的選擇應(yīng)根據(jù)文件中規(guī)定的檢測預(yù)期用途來確定。對于多重檢測試劑盒,每個靶序列之間不宜呈現(xiàn)任何同源性以盡可能減少交叉反應(yīng)。如果選擇了靶區(qū)域,應(yīng)使用適當(dāng)?shù)暮怂嵝蛄袛?shù)據(jù)庫評估該序列與其他生物體的同源程度,宜使用多個數(shù)據(jù)庫對序列進(jìn)行驗(yàn)證。在選擇引物時,除非使用多態(tài)性來鑒別病原體,否則宜使用已知目標(biāo)序列,并避免多態(tài)性區(qū)域。引物的設(shè)計宜根據(jù)所用的分析方法,如PCR、等溫擴(kuò)增技術(shù)或其他方法。宜參考相關(guān)指南進(jìn)行設(shè)計,例如,“出版物中實(shí)時熒光定量PCR[35]或數(shù)字PCR[4]方法應(yīng)提供信息的最低要求”。GB/T39367—20XX/ISO17822:20205.2性能驗(yàn)證和性能確認(rèn)一般來說,檢測可以劃分為四大類:b)因未滿足患者具體需求,實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行了修改的IVD試劑盒/診斷產(chǎn)品;c)實(shí)驗(yàn)室自建的試劑盒/檢測(LDT);d)市場上可購買,僅限研究用(RUO)的檢測。表2描述了對應(yīng)每一類型檢測方法,進(jìn)行性能確認(rèn)或性能驗(yàn)證的可能決定。表2性能驗(yàn)證或性能確認(rèn)的可能決定是否是是是是是是6檢測系統(tǒng)的驗(yàn)證或確認(rèn)附錄B給出了進(jìn)一步的信息。6.1性能驗(yàn)證或確認(rèn)的方法有兩種方式可用來評價方法的檢測性能。第一種方式為進(jìn)行方法比較的研究,即采用已開發(fā)的方法和一個有效的參比方法對標(biāo)本/樣品進(jìn)行平行檢測。方法比較適用于有效的參比方法已在實(shí)驗(yàn)室使用或者可在其它臨床實(shí)驗(yàn)室使用,并最好使用實(shí)驗(yàn)室所在地的患者標(biāo)本/樣品。第二種方式,如果無法獲得患者標(biāo)本/樣品來評價性能特征,尤其是準(zhǔn)確度時,可在預(yù)期基質(zhì)中加入已知量值的分析物,測試新試劑盒能否檢出。可能有一些研究必須使用真實(shí)的患者標(biāo)本/樣品,具體視風(fēng)險分析情況而定。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020添加的標(biāo)本/樣品需要具有明確特征,可能包括標(biāo)準(zhǔn)、質(zhì)控物、能力驗(yàn)證材料或具有已知或公認(rèn)值的患者樣品。7LDT的設(shè)計和建立7.1概述LDT建立的規(guī)劃階段應(yīng)包括設(shè)計階段和可行性測試階段。在可行性測試階段,應(yīng)收集初步性能數(shù)據(jù),并通過故障排除和優(yōu)化流程來確定性能特征,并制定有效的性能確認(rèn)程序。在技術(shù)層面,實(shí)驗(yàn)室宜對方法研發(fā)所需的必要設(shè)備、試劑、成本以及質(zhì)控品和參考物質(zhì)等進(jìn)行調(diào)研,并在試劑設(shè)計和性能確認(rèn)過程中,考慮檢測過程所需的時間和開展檢測的可行性。方法建立過程應(yīng)包括初始評估(需求、預(yù)期用途、試驗(yàn)要求)、設(shè)計和開發(fā)規(guī)劃、方法研發(fā)、性能7.1.1確定客戶/患者和利益相關(guān)者對分析預(yù)期用途的需求實(shí)驗(yàn)室應(yīng)了解當(dāng)?shù)胤ㄒ?guī)和倫理原則,以維護(hù)客戶、患者和公眾信任關(guān)系[30]。利益相關(guān)者的需求和要求(如監(jiān)管機(jī)構(gòu)或法律規(guī)定)應(yīng)予以識別和記錄??蛻?患者的需求應(yīng)予以識別和記錄。規(guī)定標(biāo)本收集和處理程序以及接收/拒收標(biāo)準(zhǔn)。檢測的預(yù)期用途,包括臨床效果,應(yīng)予以驗(yàn)證。宜通過考慮以下因素來確定預(yù)期用途,包括但不限于:a)檢測的目的、益處和用途(如篩查、診斷、預(yù)測、監(jiān)測、確認(rèn));c)檢測結(jié)果在患者管理中的應(yīng)用;e)收集和處理程序;f)標(biāo)本接收/拒收標(biāo)準(zhǔn);應(yīng)決定是否繼續(xù)進(jìn)行設(shè)計和研發(fā)規(guī)劃。7.1.2性能驗(yàn)證的一般標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)驗(yàn)證IVD制造商說明書中描述的IVD診斷產(chǎn)品的關(guān)鍵性能指標(biāo),以證明其在本實(shí)驗(yàn)室環(huán)境下的性能。對于定性檢測,應(yīng)將陽性和陰性結(jié)果與參比方法進(jìn)行比較。對于定量檢測,應(yīng)比較覆蓋全部GB/T39367—20XX/ISO17822:2020可報告范圍的定量結(jié)果(準(zhǔn)確度并進(jìn)行精密度研究。此外,宜對制造商宣稱的檢出限/可報告范圍和測量不確定度等(如適用)進(jìn)行驗(yàn)證,如涉及參考區(qū)間實(shí)驗(yàn)室宜進(jìn)行驗(yàn)證。更多信息參見附錄B。如果實(shí)驗(yàn)室正在開發(fā)自建檢測(LDT)或修改IVD診斷產(chǎn)品,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)進(jìn)行驗(yàn)證,確定并證明其宣稱的如準(zhǔn)確性、精密度、分析敏感性、分析特異性(干擾物質(zhì)的影響)、可報告范圍,以及臨床適用的參考區(qū)間等方面。有關(guān)干擾物質(zhì)的數(shù)據(jù)可從文獻(xiàn)或在其他實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行的研究中獲得,若條件允許,宜進(jìn)行驗(yàn)證。性能驗(yàn)證宜在即將開展臨床檢測的實(shí)驗(yàn)室內(nèi)完成;如果經(jīng)過驗(yàn)證的檢測方法轉(zhuǎn)移到另外一個實(shí)驗(yàn)室開展,新實(shí)驗(yàn)室宜確定性能特征未受遷移或任何環(huán)境條件變化(溫度、濕度等)的影響。在實(shí)驗(yàn)室使用IVD診斷產(chǎn)品進(jìn)行檢測時,應(yīng)進(jìn)行性能驗(yàn)證。根據(jù)方法建立的流程,作為實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量管理體系的一部分,應(yīng)對驗(yàn)證程序(如驗(yàn)證計劃、驗(yàn)證執(zhí)行)、數(shù)據(jù)、結(jié)果以及結(jié)果不一致的可能解釋進(jìn)行記錄。宜關(guān)注準(zhǔn)確性、精密度和可報告范圍,如果符合要求,宜先由實(shí)驗(yàn)室主任或指定人員批準(zhǔn)該方法可作為診斷試驗(yàn),再用于患者檢測。7.1.3檢測方法預(yù)設(shè)性能指標(biāo)的驗(yàn)證應(yīng)分析實(shí)驗(yàn)流程中各步驟對結(jié)果有效性和可靠性造成的潛在影響和風(fēng)險。一般情況下,對可能影響檢查結(jié)果的診斷工作流程的所有步驟,例如標(biāo)本采集、運(yùn)輸、保存、預(yù)處理、提取、提取后可能需要的保存、以及檢測過程如擴(kuò)增、數(shù)據(jù)分析、結(jié)果報告等,都要進(jìn)行規(guī)定和驗(yàn)證。風(fēng)險分析應(yīng)明確整個實(shí)驗(yàn)流程任何步驟中不可控因素的影響。應(yīng)采取措施降低不可接受的風(fēng)險。在驗(yàn)證過程中,宜檢查實(shí)驗(yàn)室內(nèi)的數(shù)據(jù)報告;如果數(shù)據(jù)從實(shí)驗(yàn)室信息系統(tǒng)進(jìn)一步傳輸?shù)结t(yī)院信息系統(tǒng),宜驗(yàn)證原始樣本檢測和報告后數(shù)據(jù)傳輸?shù)谋U嫘?。檢測方法應(yīng)包括可發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)流程步驟中錯誤的適當(dāng)對照(見5.1)。性能驗(yàn)證宜采用與實(shí)際檢測相同的替代基質(zhì)和臨床樣本??墒褂眠m當(dāng)?shù)臒o靶標(biāo)基質(zhì)(如混合血清樣本或糞便懸液)稀釋含有明確量值病原體的臨床樣本,樣本中可加入內(nèi)參。替代基質(zhì)宜加入完整病原體和內(nèi)參。宜避免污染或引入干擾物質(zhì)。對潛在污染和/或干擾物質(zhì)的持續(xù)控制宜整合到檢測系統(tǒng)中。對于多重檢測,該檢測宜在預(yù)期用途中的多重感染情況下進(jìn)行驗(yàn)證,例如幾種病原體和/或病原體與對照。GB/T39367—20XX/ISO17822:20207.1.4預(yù)期用途的確認(rèn)根據(jù)性能確認(rèn)計劃,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)描述并記錄與疾病或其他臨床背景相關(guān)檢測的性能特征。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)確定與檢測的臨床相關(guān)性和臨床有用性密切相關(guān)的性能特征。這些特征應(yīng)記錄為臨床性能特征。為了衡量實(shí)驗(yàn)室檢測是否以臨床相關(guān)方式定性和/或定量分析物,在適用時,宜計算陰性預(yù)測值和陽性預(yù)測值。注:典型的臨床性能特征包括臨床(診斷)特異性、臨床(診斷)敏感性、測量范圍和參考區(qū)間。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)對檢測方法的預(yù)期用途進(jìn)行確認(rèn),并與現(xiàn)有的參比方法(如有)進(jìn)行比較。如果沒有可用的參比方法,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)通過適當(dāng)設(shè)計的研究確認(rèn)預(yù)期用途。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)在性能確認(rèn)報告中明確記錄確認(rèn)結(jié)論。更多信息參見7.4.1.1和附錄B。7.2核酸擴(kuò)增檢測程序的流程分析檢測結(jié)果的可信度在體外診斷領(lǐng)域至關(guān)重要,因?yàn)槠淇赡軐颊弋a(chǎn)生社會心理、法醫(yī)及治療方面的影響。因此,在本標(biāo)準(zhǔn)中,檢測方法的選擇或初始試驗(yàn)都應(yīng)以檢測目標(biāo)微生物是否存在為目的。典型的核酸擴(kuò)增檢測宜包含以下步驟:——樣本采集、運(yùn)輸和保存;——核酸提取及純化;——擴(kuò)增(變性、退火、延伸——檢測目標(biāo)直系同源基因;——數(shù)據(jù)分析和解讀。避免擴(kuò)增產(chǎn)物的殘留污染是在核酸擴(kuò)增檢測的所有步驟中的關(guān)鍵挑戰(zhàn)。7.2.1分析前工作流程要求標(biāo)本采集、運(yùn)輸和保存的要求應(yīng)在使用說明書中規(guī)定,可參考ISO15189的要求。應(yīng)特別注意樣本采集、運(yùn)輸和保存對用于核酸提取的標(biāo)本存在的可能影響。示例:標(biāo)本類型、標(biāo)本容器、標(biāo)本可接受性標(biāo)準(zhǔn)、減少核酸降加劑要求、運(yùn)輸條件、保存條件、穩(wěn)定性因素醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)依據(jù)樣本采集手冊中相應(yīng)部分的說明,納入標(biāo)本采集、運(yùn)輸和保存要求。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020核酸擴(kuò)增檢測的標(biāo)本接收區(qū)和錄入?yún)^(qū)宜獨(dú)立于檢測區(qū)域?;颊邩颖疽思皶r處理并妥善保存以盡可能減少核酸的降解。實(shí)驗(yàn)室宜只接受指定的樣品保存容器。更多信息參見附件A。多次凍融可破壞樣本完整性及降低核酸產(chǎn)量,因此,若未另行規(guī)定和驗(yàn)證,宜避免反復(fù)凍融。定量檢測和低濃度水平檢測可能更易受影響[29]。對于核酸提取及提取后核酸穩(wěn)定的條件,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)進(jìn)行規(guī)定、驗(yàn)證,并在使用說明書中明確。即使即使在同一條件下,不同樣本類型,其穩(wěn)定性可能不同。因此,每種樣本類型的穩(wěn)定性都需要通過檢測來明確。新病原體和不常見的癥狀通常需要額外的研究來確定最佳樣本類型和樣本量。更多信息參見附樣本中提取的核酸純度、完整性和產(chǎn)量應(yīng)滿足預(yù)期用途。如果樣本中的核酸量不足,應(yīng)對同一樣本重新提取,或再次采集樣本以進(jìn)行提取。更多信息參見附錄A,關(guān)于核酸制備和穩(wěn)定性的更多信息參見ISO21571[13]。評估核酸提取效率的方實(shí)驗(yàn)室應(yīng)按照使用說明書制備和保存提取的核酸,以確保純度、完整性和穩(wěn)定性滿足檢測要求。7.2.2分析中工作流程要求為了降低污染風(fēng)險,實(shí)驗(yàn)室程序至少應(yīng)包含以下注意事項(xiàng)(如適用)。對于使用獨(dú)立設(shè)備和耗材的實(shí)驗(yàn)室工作流程要求,不適用于使用自動化儀器(樣本制備、擴(kuò)增和檢測一體)的實(shí)驗(yàn)室。a)應(yīng)按照生物安全水平使用個人防護(hù)裝備(PPE見EP23-A[23]、EP18-A2[22]、ISO35001[19]宜在特定區(qū)域內(nèi)使用專用實(shí)驗(yàn)服(如顏色標(biāo)記)。實(shí)驗(yàn)服宜專人專用,且宜在出入每個區(qū)域時更換、定期更換、并考慮特定的清潔要求。實(shí)驗(yàn)室也可以使用一次性的實(shí)驗(yàn)服。宜對不宜疊放的實(shí)驗(yàn)服配備單獨(dú)的衣架;實(shí)驗(yàn)室人員如從一個實(shí)驗(yàn)區(qū)到另一個實(shí)驗(yàn)區(qū),需更換手套以避免交叉污染。宜使用長袖手套,為防止過敏可使用無粉手套;操作人員應(yīng)佩戴護(hù)目鏡、口罩或防護(hù)罩,或當(dāng)?shù)厣锇踩ㄒ?guī)所要求的其他個人防護(hù)裝備;若有需要,宜考慮在不同的房間使用套鞋或可洗的實(shí)驗(yàn)室用鞋。b)試劑準(zhǔn)備、標(biāo)本制備及擴(kuò)增后分析的各區(qū)域,應(yīng)使用專用設(shè)備(包括機(jī)器人)和適當(dāng)?shù)暮牟模鐜V芯吸頭。c)為了減少樣本間的交叉污染,如果檢測流程需要打開PCR反應(yīng)管,建議在開蓋之前對所有樣本的PCR管先進(jìn)行瞬時離心。d)宜在非樣本組分(如PCR反應(yīng)預(yù)混液、dNTPs、引物、緩沖液和酶)配制完成后,在專用區(qū)域?qū)颖净蚝怂崽崛∥锛尤敕磻?yīng)管。(見圖1)e)除了擴(kuò)增后需進(jìn)行PCR產(chǎn)物分析(如凝膠電泳或DNA測序)之外,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)保持反應(yīng)管加蓋密封,并應(yīng)盡可能少的打開管蓋。只有當(dāng)需要的情況下進(jìn)行開蓋,且開蓋前對PCR反應(yīng)管進(jìn)行瞬時離心。f)宜避免在不同工作區(qū)域之間移動設(shè)備(包含IT設(shè)備)。易攜類物品,如移液器、手套、筆、實(shí)驗(yàn)記錄本和計時器,是造成污染的來源,應(yīng)在每一個工作區(qū)域內(nèi)專用,各工作區(qū)域的物品不GB/T39367—20XX/ISO17822:2020準(zhǔn)許混用。此外,這同樣適用于標(biāo)準(zhǔn)操作程序及其他打印和書寫材料,如工作表。建議盡量避免各區(qū)域間任何樣品和檢測相關(guān)物品的移動,如需要,宜按照單向工作流進(jìn)行(從低污染區(qū)到高污染區(qū))。(見圖1)至少應(yīng)使用2個單獨(dú)的房間(若進(jìn)行巢式PCR可擴(kuò)展到3個)進(jìn)行前PCR、后PCR和巢式PCR(如需要)。各工作步驟(用虛線標(biāo)注)應(yīng)在專用區(qū)域,最好在特定的房間內(nèi)進(jìn)行。試劑和樣本制備間/區(qū)域不宜共用冰箱和冰柜,以避免將樣品和核酸提取物與試劑在同一位置存放。如需共用,宜進(jìn)行明確的歸類管理(如在二級容器中分離見CLSIMM19A。擴(kuò)增前及擴(kuò)增后核酸(如樣品和PCR產(chǎn)物)應(yīng)存放在置于不同區(qū)域的單獨(dú)冰箱或冰柜中,最好存放在各自的房間/區(qū)域。圖1使用獨(dú)立房間或工作區(qū)的單向工作流示例7.2.3分析后工作流程要求工作流程最后的步驟是檢測結(jié)果的報告和解釋。實(shí)驗(yàn)室的結(jié)果報告可由LIS系統(tǒng)支持,宜采用預(yù)設(shè)的可編輯的報告模板。檢測報告的要求宜符合法律規(guī)范并整合到實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量管理系統(tǒng)中,報告的要求應(yīng)在SOP或?qū)嶒?yàn)室手冊中予以說明。GB/T39367—20XX/ISO17822:20207.3驗(yàn)證和確認(rèn)的性能特征7.3.1檢測范圍實(shí)驗(yàn)室應(yīng)僅報告在驗(yàn)證或確認(rèn)過程中已建立的檢測范圍內(nèi)的定量結(jié)果。驗(yàn)證研究中線性范圍的確定通常不適用于定性核酸檢測方法。然而,線性范圍的概念適用于定性報告的半定量檢測。線性范圍的下限應(yīng)與臨床應(yīng)用相關(guān),并且在臨床應(yīng)用中可接受。若適用,線性范圍的上限宜與臨床應(yīng)用相關(guān)。若結(jié)果高于線性范圍的上限,則標(biāo)本/樣品可用適當(dāng)?shù)木彌_液或基質(zhì)稀釋。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)考慮精密度較差時對線性的影響,并將精密度研究作為線性研究的一部分。為充分確定定量下限,可以在接近定量下限的低濃度增加額外的重復(fù)檢測。更多信息參見附錄B。為建立LDTs的線性范圍,建議實(shí)驗(yàn)室在預(yù)期測量范圍內(nèi)對5到10個濃度水平進(jìn)行研究。為確定盡可能寬的線性范圍,可在同一批中增加預(yù)期測量范圍以外濃度水平的樣品。當(dāng)預(yù)期值和測量值呈現(xiàn)明顯的線性關(guān)系時,實(shí)驗(yàn)室可使用線性回歸進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,但應(yīng)首選基于對數(shù)轉(zhuǎn)換的PCR數(shù)據(jù)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)僅定量報告在線性范圍內(nèi)的結(jié)果。NAAT線性范圍相關(guān)的指南見GB/T42077—2022標(biāo)準(zhǔn)[7]。注2:進(jìn)行多項(xiàng)式回歸分析,以找到充分?jǐn)M合數(shù)據(jù)點(diǎn)的多項(xiàng)式函數(shù),差異。一階、二階和三階多項(xiàng)式回歸分析均7.3.2準(zhǔn)確度診斷準(zhǔn)確度的不同衡量標(biāo)準(zhǔn)與診斷程序的不同方面有關(guān):一些衡量標(biāo)準(zhǔn)用于評估鑒別的正確性,而另一些衡量標(biāo)準(zhǔn)用于評估其預(yù)測能力。診斷準(zhǔn)確度的衡量標(biāo)準(zhǔn)不是固定不變的,有些取決于疾病的流行率,而另一些取決于疾病的范圍和定義。此外,診斷準(zhǔn)確度的衡量與研究的設(shè)計極為相關(guān)。不嚴(yán)格依照方法學(xué)標(biāo)準(zhǔn)的研究通常會高估或低估檢測的性能指標(biāo),從而影響研究結(jié)果的適用性[37]。檢測程序的準(zhǔn)確度表示測量值與理論值或可接受參考值之間的一致性程度。檢測結(jié)果的一致性程度是由系統(tǒng)誤差(偏倚,表示為正確度)和隨機(jī)誤差(表示為測量精密度)造成的。7.3.2.1正確度研究GB/T39367—20XX/ISO17822:2020實(shí)驗(yàn)室宜在一段時間內(nèi)檢測,以反映典型實(shí)驗(yàn)室條件下的檢測性能。正確度研究宜按照研究設(shè)計、統(tǒng)計學(xué)推薦和ISO15189標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行。對于多重檢測,如果日常使用的分析方法均未涵蓋多重檢測的所有分析物,宜使用多個比較研究。宜為每個分析物以及多重檢測選擇適當(dāng)?shù)臄?shù)據(jù)分析方法以確定正確度。實(shí)驗(yàn)室宜選擇并檢測適當(dāng)數(shù)量的標(biāo)本。理想情況下,準(zhǔn)確度部分的驗(yàn)證宜采用臨床樣品,應(yīng)選擇具有足夠數(shù)量且有代表性的臨床樣品類型(如血液、血漿、糞便、體液)。如果在整個分析或報告范圍內(nèi)無法獲得這些樣品,則可使用適當(dāng)?shù)臒o目標(biāo)分析物基質(zhì)(如混合血清樣品或糞便懸浮液)稀釋含有已知量值病原體的臨床樣品或人造樣品,并可以在檢測前于樣品中添加內(nèi)參。為明確檢測的正確度,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)以圖形和統(tǒng)計方式解釋獲得的數(shù)據(jù)。對方法學(xué)比較的數(shù)據(jù),實(shí)驗(yàn)室宜使用線性回歸分析的散點(diǎn)圖和95%一致性界限的差值圖來展示。7.3.2.2精密度研究在適當(dāng)?shù)那闆r下,應(yīng)使用已知分析物濃度的樣品進(jìn)行精密度的研究。應(yīng)在盡可能接近適當(dāng)臨床標(biāo)本的基質(zhì)中選擇或制備樣品。用于完成研究的測試材料可以包括標(biāo)準(zhǔn)品、質(zhì)控品、能力驗(yàn)證樣品或足夠數(shù)量的患者標(biāo)本。精密度研究應(yīng)測試重復(fù)性、中間精密度和再現(xiàn)性(如適用)。重復(fù)性是采用相同方法、相同設(shè)備和相同操作人員,在相同實(shí)驗(yàn)室短時間內(nèi)對同一物質(zhì)進(jìn)行多次重中間精密度是采用相同方法、相同設(shè)備和相同操作人員,在相同實(shí)驗(yàn)室較長時間內(nèi)對同一物質(zhì)進(jìn)行多次重復(fù)測量。再現(xiàn)性是采用相同方法,不同操作人員和(或)不同設(shè)備,在不同實(shí)驗(yàn)室對同一物質(zhì)進(jìn)行多次重復(fù)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)根據(jù)檢測的預(yù)期用途,確定適當(dāng)?shù)难芯繒r長和標(biāo)本數(shù)量進(jìn)行精密度研究。精密度研究宜按照研究設(shè)計、統(tǒng)計學(xué)推薦和ISO15189進(jìn)行。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020實(shí)驗(yàn)室宜在精密度研究設(shè)計中考慮并納入可能的重要變異來源,如不同的操作人員、多試劑批次、多臺儀器。定性檢測中,精密度研究應(yīng)提供分析物濃度在接近檢出限時的不精密度。精密度研究設(shè)計宜納入整個動態(tài)范圍內(nèi)適當(dāng)?shù)臐舛葮悠罚悍謩e設(shè)定為檢出限濃度、高于檢出限濃度20%,以及低于檢出限濃度20%。三個樣品重復(fù)檢測40次。定量檢測中,精密度研究應(yīng)至少納入高濃度水平樣品、低濃度水平樣品和盡可能接近醫(yī)學(xué)決定水平濃度(通常為檢出限)樣品。通常較高的變異出現(xiàn)在測量范圍兩端的低濃度和高濃度水平。若三個濃度水平的精密度估計值存在較大差異,則應(yīng)檢測其它濃度,以充分反映檢測方法的精密度。建議精密度研究設(shè)計可計算批間和批內(nèi)變異,二者相結(jié)合以計算檢測方法的總變異。測結(jié)果的標(biāo)準(zhǔn)差、為算術(shù)平均數(shù))的估計值。實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行數(shù)據(jù)分析時,應(yīng)根據(jù)文件化的可接受標(biāo)準(zhǔn)對精密度研究結(jié)果進(jìn)行評價。不精密度通常表示為目標(biāo)值±2SD/3SD或目標(biāo)值±某個百分比(如目標(biāo)值的10%)。一般來說CV不宜超過15%;最低定量限的精密度不宜超過20%。在確定可接受的精密度性能時,建議構(gòu)建精密度特征圖,其中標(biāo)出SD或CV作為分析物濃度的函數(shù)。7.4分析敏感性/檢出限實(shí)驗(yàn)室應(yīng)確定定量和定性測試的LOD,即在可接受的精密度水平檢測到樣品中分析物的最低實(shí)際濃度。在確定分析特異性時,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)進(jìn)行交叉反應(yīng)性和干擾物質(zhì)研究。交叉反應(yīng)生物體包括與靶標(biāo)具有序列同源性的生物體、可同時存在于標(biāo)本中的正常菌群以及引起類似疾病狀態(tài)或臨床共感染的生物體。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)對檢測方法進(jìn)行干擾物質(zhì)研究(干擾篩查可添加潛在干擾物質(zhì)到含有目標(biāo)核酸的標(biāo)本中,通過分析干擾物質(zhì)的影響來進(jìn)行。應(yīng)使用適合標(biāo)本基質(zhì)的潛在干擾物質(zhì),確定其在檢測系統(tǒng)中對每種標(biāo)本類型的干擾/交叉反應(yīng)性。用于確定分析特異性的數(shù)據(jù)分析應(yīng)遵循常用的統(tǒng)計方法,如配對t檢驗(yàn)、重復(fù)測量檢驗(yàn)或配對差異檢驗(yàn)。具體的分析可基于檢測和對照樣品的均值之間的差異,以及該檢測具有臨床意義的允許誤差來進(jìn)行。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020實(shí)驗(yàn)室應(yīng)通過對已知目標(biāo)物質(zhì)濃度樣品進(jìn)行覆蓋預(yù)期LOD水平的系列稀釋,經(jīng)驗(yàn)性地確定LOD。應(yīng)確定將在臨床實(shí)驗(yàn)室常規(guī)檢測的每種類型標(biāo)本基質(zhì)的分析敏感性。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)確認(rèn)每種基因型的分析敏感性(如合理)。為確定檢出限,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)檢測統(tǒng)計學(xué)上適當(dāng)數(shù)量的樣品。對于數(shù)據(jù)分析,實(shí)驗(yàn)室宜使用probit分析法,確定可穩(wěn)定檢出的最低濃度水平。Probit回歸分析可產(chǎn)生probit(概率單位)值,并將其轉(zhuǎn)換為C95值(95%樣品中可檢測到的濃度表明檢出限為一定數(shù)量的拷貝數(shù)/ml,且含有該濃度的樣品將在95%的受試樣品中檢測到。對于多重檢測,應(yīng)使用多重檢測方法確定每種分析物的LOD。7.4.1分析確認(rèn)7.4.1.1研究報告的確認(rèn)收集所有必要的性能確認(rèn)數(shù)據(jù)后,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)撰寫性能確認(rèn)報告。該報告應(yīng)包括主要要求、所用方法的完整描述、性能確認(rèn)研究的清晰描述以及獲得的所有詳細(xì)分析結(jié)果。本文件應(yīng)記錄經(jīng)性能確認(rèn)的實(shí)驗(yàn)流程中各個步驟(例如,檢驗(yàn)前步驟)、使用的試劑和條件以及參與研究的操作人員。本文件將包括接受/拒絕標(biāo)準(zhǔn)、樣品重復(fù)/再分析的詳細(xì)信息以及檢測結(jié)果的臨床解讀信息。應(yīng)提供文獻(xiàn)參考,補(bǔ)充實(shí)驗(yàn)室性能確認(rèn)研究結(jié)果,并填補(bǔ)可能缺乏直接證據(jù)的潛在空白。報告完成后,應(yīng)按照實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量管理體系進(jìn)行評估。最后,實(shí)驗(yàn)室主任應(yīng)簽署報告并注明日期,聲明檢測方法已(或未)準(zhǔn)備好用于常規(guī)臨床實(shí)施。只要方法開發(fā)的條件沒有改變,性能確認(rèn)是一次性的過程。如果現(xiàn)有方法以任何方式進(jìn)行修改,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)重新確認(rèn)。7.4.1.2部分確認(rèn)當(dāng)對已驗(yàn)證的方法進(jìn)行了不會改變檢測方法原理的微小變更(取決于改變)時,可以進(jìn)行部分性能確認(rèn)。例如,如果更換了同一種樣本類型的采集裝置或容器,但預(yù)期不會對樣本本身產(chǎn)生影響,在這種情況下,僅需對有限數(shù)量的樣品(如5~10個)進(jìn)行準(zhǔn)確性和精密度測試,以進(jìn)行最小限度的性能確認(rèn)。GB/T39367—20XX/ISO17822:20208實(shí)驗(yàn)室實(shí)施和使用一旦完成性能驗(yàn)證/性能確認(rèn),檢測項(xiàng)目需要整合到實(shí)驗(yàn)室的工作流程和質(zhì)量管理體系中。宜編寫一份完整的標(biāo)準(zhǔn)操作程序用于指導(dǎo)日常操作。對于廠家已完成性能確認(rèn)的核酸檢測體外診斷試劑,醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室在未對其進(jìn)行修改的情況下,投入臨床應(yīng)用前必須進(jìn)行性能驗(yàn)證。對已完成性能確認(rèn)的體外診斷試劑,醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室對其所進(jìn)行的任何后續(xù)修改都需要在再次進(jìn)行性能確認(rèn),且需遵循ISO15189的要求。在開展項(xiàng)目之前,實(shí)驗(yàn)室宜制定一套日常質(zhì)量控制和質(zhì)量保證體系(參見表1和表2)。在開展新項(xiàng)目之前,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)對人員進(jìn)行培訓(xùn)和能力評估,以滿足質(zhì)量需求。實(shí)驗(yàn)室宜為臨床醫(yī)生和其他用戶提供該新項(xiàng)目臨床應(yīng)用的咨詢服務(wù)。9結(jié)果的報告和解釋實(shí)驗(yàn)室應(yīng)制定適當(dāng)?shù)腟OP以確保檢驗(yàn)結(jié)果報告的及時性。定量檢測項(xiàng)目的結(jié)果通常宜報告為目標(biāo)核酸分子在特定體積的體液、特定數(shù)量的細(xì)胞或特定量的組織中的分子數(shù)量(如,拷貝數(shù)、基因組當(dāng)量、國際單位IU)。通常情況下,宜使用Log10轉(zhuǎn)換的數(shù)據(jù)報告定量檢測結(jié)果。宜報告程序的檢測范圍,明確標(biāo)識所使用的單位(例如,每毫升血漿中的拷貝數(shù))。定性檢測項(xiàng)目不宜報告為“陽性”或“陰性”,其可能會引起解釋上的歧義,而宜使用“檢出”或“未檢出”,“存在”或“不存在”。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)制定一套結(jié)果報告SOP,以確保所有結(jié)果在發(fā)布前均經(jīng)過授權(quán)人員的審核和確認(rèn)。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)編寫一套數(shù)據(jù)分析工具及其參數(shù)使用的SOP。對于不確定的檢測結(jié)果,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)制定復(fù)檢程序,可對同一樣品采用相同或不同方法進(jìn)行重復(fù)檢測和/或重新采樣復(fù)檢。陽性判斷值(cut-off值)應(yīng)作為報告的解釋性注釋。對于定量檢測和沒有明確cut-off值的檢測項(xiàng)目,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)在報告中注明該檢測項(xiàng)目經(jīng)過確認(rèn)的檢出限、定量限(如涉及)。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020實(shí)驗(yàn)室應(yīng)明確可對臨床患者管理決策產(chǎn)生重大影響的檢測結(jié)果,并應(yīng)制定相應(yīng)的SOP以確保結(jié)果發(fā)布后及時通知相關(guān)臨床醫(yī)生。結(jié)果報告中應(yīng)注明任何已知的且具有臨床意義的局限性。注:局限性可包括交叉反應(yīng)、不同基因型和干擾物質(zhì)等對檢測結(jié)果質(zhì)量的影響。IVD或LDT產(chǎn)品必須附帶操作程序。任何有意或無意偏離說明書/操作程序的情況(如離心時離心力不正確或由于冰箱故障導(dǎo)致的反復(fù)凍融)均應(yīng)進(jìn)行記錄,并制定是否接受相關(guān)檢測結(jié)果的程序。10質(zhì)量保證程序醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)實(shí)施適當(dāng)?shù)馁|(zhì)量保證程序,以確保核酸檢測結(jié)果的質(zhì)量??蓞⒖糏SO15189。應(yīng)特別設(shè)計質(zhì)量保證程序以盡量減少假陽性和假陰性結(jié)果。檢測方法一旦經(jīng)過性能確認(rèn),實(shí)驗(yàn)室在使用過程中應(yīng)對檢測性能進(jìn)行定期監(jiān)測,宜包括使用各種質(zhì)控品監(jiān)測試劑性能、儀器設(shè)備運(yùn)行狀態(tài)以及人員操作等。持續(xù)監(jiān)測過程中的數(shù)據(jù)應(yīng)進(jìn)行記錄。10.1性能監(jiān)測和分析優(yōu)化為進(jìn)行檢測性能的內(nèi)部監(jiān)測,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)在臨床檢測前的性能確認(rèn)和日常檢測工作中,以適當(dāng)?shù)念l率使用合適的內(nèi)參和外部質(zhì)控品。實(shí)驗(yàn)室應(yīng)定期對外部質(zhì)控品進(jìn)行評估,以保證其結(jié)果始終在預(yù)設(shè)范圍之內(nèi)。宜將內(nèi)參添加至樣本基質(zhì)中(如血清、血漿、培養(yǎng)基等并獨(dú)立于目標(biāo)序列進(jìn)行提取、擴(kuò)增、分析和檢測。內(nèi)參應(yīng)和目標(biāo)序列在同一樣本管中進(jìn)行處理。實(shí)驗(yàn)室需要監(jiān)控基因組數(shù)據(jù)庫的升級和更新,特別需要關(guān)注對檢測的性能參數(shù)或結(jié)果解釋存在重大影響的新發(fā)現(xiàn)。推薦使用內(nèi)參,但應(yīng)評估并盡量減少內(nèi)參競爭對目標(biāo)序列檢測性能的影響。實(shí)驗(yàn)室宜定期核查檢測的性能參數(shù)。持續(xù)監(jiān)測過程中的數(shù)據(jù)應(yīng)予以解釋和記錄。10.2實(shí)驗(yàn)室間比對計劃。如無適合的EQA計劃,實(shí)驗(yàn)室宜定期組織內(nèi)部能力驗(yàn)證計劃。詳見ISO15189。參加EQA計劃前,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)仔細(xì)評估該計劃的適用范圍和預(yù)期目的,以及對被分析物定性和/或定量檢測所使用的方法。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020應(yīng)至少每年參加一次內(nèi)部組織的或外部組織的能力驗(yàn)證計劃。推薦至少每年參加兩次實(shí)驗(yàn)室間比對。外部質(zhì)控品(Externalqualitycontrols)應(yīng)和臨床標(biāo)本在同一批次內(nèi)進(jìn)行檢測,但不應(yīng)在同一管或同一孔中進(jìn)行檢測。外部質(zhì)控品的檢測數(shù)據(jù)應(yīng)進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,以監(jiān)測一段時間內(nèi)的檢測性能。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020樣品制備的分析前因素A.1血清和血漿A.1.1樣品采集對于血清樣品,應(yīng)使用含有血清分離膠的真空采血管采集外周血。將采血管置于室溫下一小時,待樣品完全凝固后離心。在采血管中添加促凝劑可縮短血液凝固時間。對于血漿樣品,宜使用含有EDTA的真空采血管。不建議與細(xì)胞免疫學(xué)或染色體分析樣品共用血樣,因這些樣品常使用肝素抗凝管。當(dāng)通過IVH導(dǎo)管抽血時,宜舍棄初始幾毫升血液,采集后續(xù)的血液作為樣品,以避免肝素的潛在影CPD)抗凝的血漿,與EDTA抗凝血漿都可用于核酸擴(kuò)增檢測。采血后應(yīng)立即將EDTA抗凝采血管反復(fù)顛倒混勻,以防止血液凝固形成纖維蛋白沉淀。由于肝素會抑制核酸擴(kuò)增,因此不宜使用肝素抗凝的采血管。有沉淀、變色或因冷凍造成脫水現(xiàn)象的樣品,不應(yīng)進(jìn)行檢測。這可能由于存儲條件不適當(dāng),如長期暴露在高溫環(huán)境或反復(fù)凍融導(dǎo)致。若提取的核酸保存在適當(dāng)條件下,則可用于復(fù)檢。宜盡量減少并記錄凍融次數(shù)。A.1.2樣品貯存和運(yùn)輸病毒樣品在血清和血漿中相對穩(wěn)定。分離后,血清和血漿樣品可冷藏保存(2℃~8℃)。一些IVD制造商已經(jīng)證明血清和血漿樣品可以在2℃~8℃的條件下保存7天。如長期保存,建議將樣本進(jìn)行冷凍。例如,對于HBV,用于DNA檢測的樣品宜在-20℃或更低溫度下保存,對于甲型肝炎病毒(HAV)、丙型肝炎病毒(HCV)和戊型肝炎病毒(HEV宜在-70℃或更低溫度下保存。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020宜避免將樣品轉(zhuǎn)移到另一個容器中。如果樣品在離心后不能立即進(jìn)行檢測,宜將原始采血管中分離-20℃或以下)保存以備用。對于丙型肝炎病毒(HCV)和人類免疫缺陷病毒(HIV宜在采血后6小時內(nèi)分離血清或血漿,對于乙型肝炎病毒(HBV最好在24小時內(nèi)完成分離。A.1.3干擾物質(zhì)的控制所有人類樣品中都可能含有潛在的“干擾物質(zhì)”;這些物質(zhì)可能會干擾目標(biāo)分析物的擴(kuò)增和/或檢測。干擾物質(zhì)可以是內(nèi)源性的或外源性的。當(dāng)濃度足夠高時,一些內(nèi)源性干擾物質(zhì)是肉眼可見的,如血紅蛋白、甘油三酯和膽紅素。病理過程的大量產(chǎn)物可能是其他內(nèi)源性干擾物質(zhì)的來源,例如骨髓瘤患者的輕鏈或糖尿病患者的葡萄糖。這些干擾物質(zhì)通常是不可見的。內(nèi)源性干擾物質(zhì)還包括用于治療的物質(zhì),如抗凝劑、藥物、血漿擴(kuò)張劑和腸外營養(yǎng)。內(nèi)源性干擾物質(zhì)還包括患者攝入的物質(zhì),包括酒精、娛樂性藥物、維生素和其他營養(yǎng)補(bǔ)充劑。干擾物質(zhì)也可以是“外源性”的;這些是在樣品采集過程中引入的污染物,可能包括手套粉末。為了最大限度地減少已知干擾物質(zhì)(例如肝素)的影響,宜將樣品收集在指定容器中。核酸提取有時可以去除或失活干擾物質(zhì),但由于潛在的干擾物質(zhì)種類繁多,并且其中許多是不可見的,因此,證明每個樣品或從每個樣品提取的核酸都能夠?qū)崿F(xiàn)靶基因的擴(kuò)增和檢測是非常重要的,可通過向每個樣品添加擴(kuò)增對照(內(nèi)參)來完成。如果內(nèi)參的結(jié)果未處于預(yù)期范圍(或沒有擴(kuò)增則可能存在抑制物。更多信息請參見參考文獻(xiàn)[38]和[20]。如果檢測試劑中包含內(nèi)參,則可以評估擴(kuò)增反應(yīng)的抑制效果,并減少假陰性結(jié)果的發(fā)生率。在沒有內(nèi)參的情況下,可以向已提取的DNA或cDNA溶液中加入已知量的質(zhì)粒DNA,并評估其擴(kuò)增效果以確認(rèn)抑制物的影響。A.2尿A.2.1樣品采集斷,例如淋病奈瑟菌、衣原體及其他病原體的檢測。尿液的病原體檢測宜采集最可能含有致病病原體基因組DNA和RNA的尿液樣品,建議首選早晨的初始排尿樣品。在一天的排尿過程中,病原體會被多次排尿沖洗掉,從而導(dǎo)致假陰性的結(jié)果;并且大量白細(xì)胞、紅細(xì)胞和脫落的上皮細(xì)胞的存在也可能會干擾檢測,進(jìn)一步導(dǎo)致假陰性。在診斷胎兒或新生兒巨細(xì)胞病毒感染時,建議使用出生時的首次排尿樣品。A.2.2樣品保存和運(yùn)輸GB/T39367—20XX/ISO17822:2020懷疑血尿或膽紅素尿的尿液樣品和含有大量沉淀物的尿液樣品不宜進(jìn)行檢測。血尿是由尿道或膀胱的炎癥導(dǎo)致的,其原因可能是感染性或非感染性病因,如輻射。樣品被冷藏時,尿液也會形成沉淀。尿液樣品(男性)可用于沙眼衣原體和淋病奈瑟菌的核酸檢測。此時,尿液樣品宜冷藏保存(2℃~8℃),并在四天內(nèi)進(jìn)行核酸提取。樣品通過標(biāo)準(zhǔn)方法正確提取后,DNA在冷藏條件下(2℃~8℃)可穩(wěn)定保存一周或更長時間,否則建議將樣品凍存。由于細(xì)菌生長而出現(xiàn)渾濁外觀的尿液樣品不宜用于檢測。菌尿樣品產(chǎn)生的可能原因包括未在適當(dāng)?shù)臈l件下保存樣品,例如在不恰當(dāng)?shù)谋4鏈囟认聦悠烽L時間放置在收集容器中。如需長期保存,最好將樣品進(jìn)行冷凍。A.2.3樣品制備疑似為血尿或膽紅素尿,以及含有大量沉淀物的尿液樣品不宜進(jìn)行檢測。檢測病毒時,可將樣品離心取上清液進(jìn)行分析。檢測細(xì)菌時,因不當(dāng)離心可能會沉淀細(xì)菌,宜謹(jǐn)慎使用上清液,宜反復(fù)顛倒樣品采集管使樣品充分混勻。因樣品冷藏易致沉淀物的形成,因此,在移液和后續(xù)分析之前,應(yīng)將冷藏樣品在37℃下孵育30分鐘,使沉淀物盡可能溶解。為了盡可能降低雜質(zhì)的影響,宜選擇包含離心柱、微孔濾膜或磁珠顆粒的核酸提取試劑。為了監(jiān)測雜質(zhì)對核酸擴(kuò)增反應(yīng)的實(shí)際抑制作用,宜使用檢測試劑盒中自帶的內(nèi)參。如果以上標(biāo)準(zhǔn)品無法獲得,需要采用拷貝數(shù)接近檢出限的質(zhì)粒DNA單獨(dú)進(jìn)行添加-回收實(shí)驗(yàn)。確認(rèn)雜質(zhì)的干擾后,可通過稀釋核酸樣品以消除抑制作用。但是,值得注意的是,該過程存在一定的風(fēng)險,即目標(biāo)核酸可能被稀釋到低于檢出限的水平,從而導(dǎo)致假陰性結(jié)果。A.3痰A(chǔ).3.1樣品采集痰標(biāo)本主要用于感染性疾病的診斷和監(jiān)測,例如肺炎或由結(jié)核桿菌、非結(jié)核分枝桿菌等引起的疾病。對于結(jié)核分枝桿菌的檢測,痰標(biāo)本的質(zhì)量保證至關(guān)重要。通過肉眼觀察評估痰標(biāo)本質(zhì)量,確認(rèn)是膿性痰而不是唾液。如果受檢者自己咳痰有困難,宜考慮使用吸痰管吸痰或用胃液作為替代標(biāo)本。此外,宜考慮收集替代標(biāo)本,包括混合痰、胃液、支氣管肺泡灌洗液(BAL)和支氣管刮取物。A.3.2樣品保存和運(yùn)輸GB/T39367—20XX/ISO17822:2020對于核酸檢測,痰標(biāo)本宜使用NALC-NaOH去污,并懸浮在磷酸鹽緩沖液中。懸浮液能冷藏保存一周(2℃~8℃),冷凍可保存更長時間。使用標(biāo)準(zhǔn)方法正確提取的DNA在冷藏(2℃~8℃)條件下可穩(wěn)定一周或更長時間。如需長期保存,最好將樣品進(jìn)行冷凍。為避免標(biāo)本反復(fù)凍融,凍存前宜將懸浮液等分裝。提取核酸的穩(wěn)定性與提取條件密切相關(guān)。粘度較差的痰標(biāo)本,如在高溫、反復(fù)凍融等不恰當(dāng)?shù)臈l件暴露較長時間,則不宜對其進(jìn)行檢測??捎萌庋塾^察來判斷標(biāo)本為膿性痰而非唾液,并且宜使用非粘稠的(唾液樣或黏液樣,根據(jù)Miller-Jones分類)的標(biāo)本。如標(biāo)本為唾液,通常是由于患者咳痰不足或痰分泌有限引起的。當(dāng)標(biāo)本中痰太少時,目標(biāo)病原體如抗酸桿菌和非結(jié)核分枝桿菌可能檢測不到,并可能產(chǎn)生假陰性結(jié)果。A.3.3樣品制備受感染的呼吸道(如支氣管)出血可能導(dǎo)致痰標(biāo)本含有大量血液,這種標(biāo)本不適合進(jìn)行檢測。當(dāng)痰中混入大量血液時,痰液離心沉淀物中血紅蛋白污染是不可避免的,需充分考慮對隨后PCR或轉(zhuǎn)錄介導(dǎo)議重新采集痰標(biāo)本。這尤其適用于只采集到唾液的情況。必要時,將痰的剩余部分(含有粘液包圍的細(xì)胞成分和細(xì)菌)溶解在N-乙?;?L半胱氨酸4℃10分鐘,再用于核酸提取。如果試劑說明書中注明了標(biāo)本的預(yù)處理程序,則按照制造商說明書進(jìn)行操作。如果洗滌和離心后的沉淀物的顏色接近白色,則在接下來的步驟中可能不會發(fā)生血紅蛋白對反應(yīng)的抑制。A.4全血和骨髓A.4.1樣品采集將規(guī)定體積的血液抽取到含有抗凝劑(EDTA和其他)的采血管后,宜立即顛倒采血管并輕輕混合。使用了含抗凝劑(EDTA和其他)的采血管時,無需添加穩(wěn)定劑。A.4.2樣品保存和運(yùn)輸GB/T39367—20XX/ISO17822:2020若標(biāo)本用于檢測引起菌血癥或敗血癥的病原體,室溫下長期保存標(biāo)本可能會降低檢測靈敏度。因此,用于此類檢測的細(xì)胞長期存放時,宜將其存放在超低溫條件下(-70℃或更低)。對于骨髓標(biāo)本(骨髓抽吸物宜將規(guī)定體積的標(biāo)本在特殊的保存液(含F(xiàn)BS的細(xì)胞培養(yǎng)基)中冷藏(2℃~8℃)保存。A.4.3樣品制備在含有纖維蛋白凝塊的標(biāo)本中,纖維蛋白可影響細(xì)菌的離心收集以及從液體中取樣,并可能導(dǎo)致定量測定的準(zhǔn)確性降低。通過試管內(nèi)容物流動性不佳或移液操作,可判斷是否存在纖維蛋白凝塊。提取核酸前,應(yīng)物理破碎標(biāo)本中的纖維蛋白凝塊,直到其開始分解,進(jìn)而纖維蛋白充分分散在整個標(biāo)本中,然后進(jìn)行檢測。在DNA提取過程中,可添加DTT(二硫蘇糖醇)和蛋白消化酶蛋白酶K促進(jìn)纖維蛋白降解。注1:肝素的影響能夠通過使用核酸提取試劑盒來降低,因核酸A.5胸腔積液、腹水、心包液、胰液和支氣管肺泡灌洗液A.5.1樣品采集標(biāo)本采集時,宜避免引入血細(xì)胞成分。宜使用含檸檬酸鈉或EDTA的容器收集胸腔積液,因?yàn)椴杉蟮男厍环e液有時候會因纖維蛋白沉積而發(fā)生凝固。A.5.2樣品保存和運(yùn)輸宜在采集標(biāo)本當(dāng)天提取核酸,否則宜冷藏(2℃~8℃)保存標(biāo)本。若長期保存,每個標(biāo)本收集后宜-70℃或以下)。為防止標(biāo)本采集后細(xì)菌生長,宜嚴(yán)格遵守標(biāo)本保存條件。膿性標(biāo)本含有多種不同類型的細(xì)菌,使用堿性熱處理進(jìn)行DNA提取可能導(dǎo)致假陰性結(jié)果。A.5.3樣品制備當(dāng)溶血導(dǎo)致標(biāo)本中含有大量細(xì)胞成分(包括血紅蛋白)時,需關(guān)注PCR抑制導(dǎo)致的敏感性降低。在含有纖維蛋白凝塊的標(biāo)本中,細(xì)菌的離心收集以及準(zhǔn)確取樣可能受到影響,并可能導(dǎo)致定量測定的準(zhǔn)確性降低。通過試管內(nèi)容物流動性不佳或移液操作,可判斷是否存在纖維蛋白凝塊。提取核酸前,應(yīng)物理破碎標(biāo)本中的纖維蛋白凝塊,直到其開始分解,進(jìn)而纖維蛋白充分分散在整個標(biāo)本中,然后進(jìn)行檢測。在提取DNA的過程中,加入酸解離步驟,使纖維蛋白充分分解至整個標(biāo)本中。然后,將含有纖維GB/T39367—20XX/ISO17822:2020蛋白的整個標(biāo)本用于分析。在DNA提取過程中,可加入DTT(二硫蘇糖醇)和蛋白酶K促進(jìn)纖維蛋白降解。A.6淋巴結(jié)和實(shí)體組織(活檢或手術(shù))A.6.1樣品采集在采集標(biāo)本時,宜將受影響的病變區(qū)域與未受影響的區(qū)域分離并保存。組織標(biāo)本的形態(tài)學(xué)檢查有助于區(qū)分靶細(xì)胞部分和其他部分,以便能夠?qū)⑵浞蛛x和取出進(jìn)行檢測。對于大的或過大的標(biāo)本,被影響的病變(靶細(xì)胞)占整個標(biāo)本的比例較小。被影響的病變可被其他組織稀釋,這可能降低檢測靈敏度,最終導(dǎo)致假陰性結(jié)果。對于結(jié)核桿菌的檢測,可通過顯微鏡下的形態(tài)學(xué)檢查來確認(rèn)病變。A.6.2樣品保存和運(yùn)輸通過活檢或手術(shù)獲取的組織標(biāo)本宜立即在超低溫(-70℃或更低)下冷凍,以防止組織自溶導(dǎo)致核酸降解。此時,最好從獲取的組織中僅取出受影響的病灶。對于結(jié)核桿菌的檢測,可以通過形態(tài)學(xué)檢查確認(rèn)病變。對于FFPE,通過活檢或手術(shù)獲取的組織標(biāo)本宜盡快浸泡在固定劑中。如果不能立即進(jìn)行固定,最好將組織標(biāo)本存放在冰箱(4℃)中,并在大約3小時內(nèi)固定??稍?℃~8℃條件下進(jìn)行組織標(biāo)本運(yùn)輸。A.6.3樣品制備受影響的病變可被其他組織稀釋,這可能會降低檢測靈敏度,最終導(dǎo)致假陰性結(jié)果。對于結(jié)核桿菌的檢測,可以通過顯微鏡下的形態(tài)學(xué)檢查確認(rèn)病變。激光顯微切割可以從玻片上制備的冰凍組織切片中準(zhǔn)確采集靶細(xì)胞。最簡單和最容易的方法是用刀片手動收集靶細(xì)胞部分,盡可能去除玻片上石蠟包埋組織切片中不必要的細(xì)胞部分。在使用胃活檢組織檢測幽門螺桿菌(H.pylori)和肝活檢組織檢測丙型肝炎病毒和乙型肝炎病毒時,紅細(xì)胞污染會導(dǎo)致PCR擴(kuò)增不良,從而導(dǎo)致假陰性結(jié)果。紅細(xì)胞污染狀況可以通過肉眼觀察鐵銹色或測定血紅蛋白濃度確認(rèn)。通過使用基于純化方法的核酸提取試劑盒,能夠降低PCR擴(kuò)增受到污染雜質(zhì)的抑制作用,在純化過程中,核酸可吸附到過濾器、膜或磁性顆粒上,通過洗脫去除雜質(zhì)。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020A.7糞便標(biāo)本患者采樣前的飲食情況可能會對檢測結(jié)果產(chǎn)生抑制作用。A.7.1樣品采集糞便已被用于分子方法檢測病原體的標(biāo)本,主要用于診斷病毒性腹瀉。糞便標(biāo)本也可用于出血性大腸埃希菌的鑒定或相對少見的Vero毒素基因檢測。因?yàn)闃?biāo)本是在腹瀉癥狀最嚴(yán)重時采集的,所以大多數(shù)都是水樣便。特別注意,在醫(yī)療機(jī)構(gòu)外采集糞便標(biāo)本時,宜嚴(yán)格按照操作說明進(jìn)行采集。A.7.2樣品保存和運(yùn)輸在沒有能夠保存樣品的添加劑的情況下,糞便標(biāo)本宜在采集后一天內(nèi)冷凍在-20℃或以下。否則它的質(zhì)量可能會下降。將標(biāo)本長期置于室溫下,會導(dǎo)致多種非目標(biāo)細(xì)菌的增殖,降低目標(biāo)病原體的檢測靈敏度,增加非特異性擴(kuò)增事件的發(fā)生頻率,最終導(dǎo)致假陰性結(jié)果。病毒核酸也可能被細(xì)菌產(chǎn)生的蛋白酶和核酸酶降解,從而導(dǎo)致檢測結(jié)果假陰性。A.7.3樣品制備在分析之前,從技術(shù)上很難檢測出標(biāo)本狀態(tài)異常。由于標(biāo)本狀態(tài)異常在檢測前不易識別,因此核酸擴(kuò)增檢測目標(biāo)病原菌的靈敏度降低的可能性始終存在。GB/T39367—20XX/ISO17822:2020(資料性)試驗(yàn)的驗(yàn)證和確認(rèn)試驗(yàn)在進(jìn)行應(yīng)用前應(yīng)視預(yù)期用途進(jìn)行適當(dāng)?shù)男阅艽_認(rèn)或驗(yàn)證,以下為相關(guān)的驗(yàn)證或確認(rèn)流程。圖2試驗(yàn)的驗(yàn)證和確認(rèn)流程GB/T39367—20XX/ISO17822:2020參考文獻(xiàn)[1]GB/T3358.2—2009,統(tǒng)計學(xué)詞匯及符號第2部分:應(yīng)用統(tǒng)計[2]GB/T15000.7,標(biāo)準(zhǔn)樣品工作導(dǎo)則第7部分:標(biāo)準(zhǔn)樣品生產(chǎn)者能力的通用要求[3]GB/T19000—2016,質(zhì)量管理體系基礎(chǔ)和術(shù)語[4]GB/T21415—2008,體外診斷醫(yī)療器械生物樣品中量的測量校準(zhǔn)品和控制物質(zhì)賦值的計量學(xué)溯源性[5]GB/T29791.1—2013,體外診斷醫(yī)療器械制造商提供的信息(標(biāo)示)第1部分:術(shù)語、定義和通用要求[6]GB/T33260.1—2016,檢出能力第1部分:術(shù)語和定義[7]GB/T42077—2022,生物技術(shù)核酸靶序列定量方法的性能評價要求qPCR法和dPCR法[8]GB/T42216.1—2022,分子體外診斷檢驗(yàn)福爾馬林固定及石蠟包埋組織檢驗(yàn)前過程的規(guī)范第1部分:分離RNA[9]GB/T43278—2023,醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室風(fēng)險管理在醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室的應(yīng)用[10]GB/T43279.1—2023,分子體外診斷檢驗(yàn)靜脈全血檢驗(yàn)前過程的規(guī)范第1部分:分離細(xì)胞RNA[11]ISOGuide30:2015,Referencematerials.Selectedtermsanddefinitions[12]ISO/IECGuide99:2007,Internationalvocabularyofmetrology—Basicandgeneralconceptsandassociatedterms(VIM;JCGM200;2012[32])[13]ISO21571:2005+Amd1:2013,Foodstuffs—Methodsofanalysisforthedetectionofgeneticallymodifiedorganismsandderivedproducts-Nucleicacidextraction[14]ISO21572:2013,Foodstuffs—Molecularbiomarkeranalysis—Protein-basedmethods[15]ISO22174:2005,Microbiologyoffoodandanimalfeedingstuffs—Polymerasechainreaction(PCR)forthedetectionoffood-bornepathogens—Generalrequirementsanddefinitions[16]ISO24276:2006,Foodstuffs—Methodsofanalysisforthedetectionofgeneticallymodifiedorganismsandderivedproducts—Generalrequirementsanddefinitions[17]ISO24276:2006/Amd2013,Foodstuffs-Methodsofanalysisforthedetectionofgeneticallymodifiedorganismsandderivedproducts-Generalrequirementsanddefinitions—Amendment1[18]ISO/IEC25062:2006,(INCITS354)PreviewSoftwareengineering—SoftwareproductQualityRequirementsandEvaluation(SQuaRE)—CommonIndustryFormat(CIF)forusabilitytestreports[19]ISO35001:2019,BioriskmanagementforlaboratoriesandotherrelatedorganisationsGB/T39367—20XX/ISO17822:2020[20]CLSIEP07;InterferencetestinginClinicalChemistry,3rdedition;Wayne;PA:ClinicalandLaboratoryStandardsInstitute;2018[21]CLSIEP17-A2;EvaluationofDetectionCapabilityforClinicalLaboratoryMeasurementProcedures,2ndEdition;ApprovedGuideline;Wayne,PA:ClinicalandLaboratoryStandardsInstitute2012[22]CLSIEP18-A2;RiskManagementTechniquestoIdentifyandControlLaboratoryErrorSources;ApprovedGuideline-SecondEdition;Wayne,PA:ClinicalandLaboratoryStandardsInstitute;2009[23]CLSIEP23-ATM:LaboratoryQualityControlBasedonRiskManagement;ApprovedGuideline;Wayne,PA:ClinicalandLaboratoryStandardsInstitute2011[24]CLSI,MM03;MolecularDiagnosticMethodsforinfectiousdisease.3

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評論

0/150

提交評論