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FGGRWARD前決策·投資一定要有前瞻的眼光深圳“20+8”之合成生物產(chǎn)業(yè)——前景機遇與技術(shù)趨勢探析前瞻產(chǎn)業(yè)研究院2024年1月報告主創(chuàng):徐文強院長報告制作:廖子璇CONTENTS目錄01
深圳市合成生物產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀與機遇03
合成生物產(chǎn)業(yè)技術(shù)發(fā)展趨勢合成生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展挑戰(zhàn)深圳市合成生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展總結(jié)與建議F
R
WARD前1.1合成生物發(fā)展歷程及界定1.2全國與深圳市合成生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀1.3深圳市合成生物產(chǎn)業(yè)政策機遇1.4深圳市合成生物產(chǎn)業(yè)優(yōu)勢總結(jié)優(yōu)勢機遇真核細胞基因編輯原核細胞底盤細胞通用植物底盤反饋生物設(shè)計微生物組生物基制品基因組
元
件線
路
生物網(wǎng)格合成生物學(xué)是一門以工程學(xué)思想為指導(dǎo)、多學(xué)科結(jié)合的新興領(lǐng)域,通過一系列重新設(shè)計與技術(shù)改造生物體或細胞以使其具有新的能力,在此過程中設(shè)計與構(gòu)建一系列新的標準化的生物元件、組件與系統(tǒng),
以實現(xiàn)理想的生物制造能力。合成生物學(xué)的本質(zhì)是讓細胞為人類工作生產(chǎn)想要的物質(zhì)。該技術(shù)突破自
然進化的限制,以“人工設(shè)計與編寫基因組”為核心,可針對特定需求從工程學(xué)角度設(shè)計構(gòu)建元器件或模塊。合成生物學(xué)示意圖1.1.1合成生物定義界定:讓細胞為人類工作生產(chǎn)想要的物質(zhì)前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨
領(lǐng)
研(股票
院599)發(fā)酵過程
純化分離從研發(fā)到應(yīng)用資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理細胞篩選細胞培養(yǎng)2011年,國家植物基因研究中心(北京)第一屆理事會第二次會議在遺傳發(fā)育所召開2015年,華大面向全球發(fā)布自主研發(fā)的首款桌面型高通量測序系統(tǒng)BGISEQ-5002018年,華大在國際頂級學(xué)術(shù)期刊《細胞》上發(fā)表了迄今為止最大規(guī)模的中國人基因組學(xué)大數(shù)據(jù)研究成果
2019年,深圳合成生物學(xué)創(chuàng)新研究院成立2021年12月,國家合成生物技術(shù)創(chuàng)新中心核心研發(fā)基地項目主體完工1.1.2合成生物發(fā)展歷程:中國當前處于發(fā)展新階段1990年10月,“人類基因組計劃”在美國首先啟動,進而英、日、法、德相繼參與,組成了國際“人類基因組計劃”協(xié)作組。1994年,中國“人類基因組計劃”(CHGP)啟
動1997年中國專家商議要申請加入國際“人類基因組計劃”,推動中國基因組科學(xué)的發(fā)展。2008年初,深圳華大基因研究院、英國桑格研究所以及美國國立人類基因組研究所等多家機構(gòu)共同啟動了“千人基因組計劃”。成果于2010年10月28日以封面文章形式發(fā)表在《自然》雜志上。2008年,中國科學(xué)院合成生物學(xué)重點實驗室成立,是國內(nèi)第一個合成生物
學(xué)重點實驗室2022年至今,由合成生物學(xué)帶動的技術(shù)平臺已經(jīng)在很多領(lǐng)域落地應(yīng)用。合成生物學(xué)的研究范式從大數(shù)據(jù)開始,經(jīng)歷數(shù)據(jù)挖掘、建模和演
算,最后發(fā)展到由人工智能(AI)
引領(lǐng)的數(shù)字合成生物學(xué)。它把生命科學(xué)推向預(yù)測科學(xué),使其有了強大的預(yù)測能力,成為融合實驗科學(xué)、
工程科學(xué)和預(yù)測科學(xué)的新興交叉學(xué)科,AI賦能的數(shù)字合成生物學(xué)將會是未來行業(yè)發(fā)展的重要方向之一。1999年,國際“人類基因組計劃”協(xié)作組公布了中國加入“人類基因組計劃”的申請,并于同年9月1日正式向全世界宣布。1999年,北京華大基因研究中心成立,與遺傳所人類基因組中心等共同承擔基因序列工作。擴張和
發(fā)展期2001-2013年2014-2021年合成生物發(fā)展歷程發(fā)展初期1990-2000年20152018201920212005年,華大基因牽頭中華協(xié)作組,承擔的10%國際人類基因組單體型圖計劃(HapMap)
在
《Nature》
發(fā)表20082022發(fā)展新階段199019941997199920052022年至今前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨
領(lǐng)
(研股票
5院99)2011資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理1.1.2合成生物政策發(fā)展歷程:中國合成生物產(chǎn)業(yè)起步相對較晚翦瞪產(chǎn)業(yè)研究院對比中國與歐美等發(fā)達國家的政策歷程,中國合成生物產(chǎn)業(yè)起步相對較晚,但是發(fā)展速度驚人,從“十三五”開
始,合成生物學(xué)被列為戰(zhàn)略前瞻性重大科學(xué)問題和前沿共性生物技術(shù),國家出臺了一系列政策支持合成生物學(xué)的發(fā)展。政策歷程
20142015
2016
201720182019202020212022
2023《合成生物學(xué)時代的生物防御》
《2021美國創(chuàng)新與競爭法案》
《國家生物技術(shù)和生物制造計劃》《關(guān)于推進生物技術(shù)和生物制造創(chuàng)新以實現(xiàn)可持續(xù)、安全和可靠《2019年工程生物學(xué)研究與開發(fā)法案》
的美國生物經(jīng)濟的第14081號行政命令》《至2030年國家生物經(jīng)濟戰(zhàn)略》《“十三五”國家戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)發(fā)展規(guī)劃》《英國生命科學(xué)戰(zhàn)略:構(gòu)建生命
科學(xué)生態(tài)系統(tǒng)》《生物戰(zhàn)略2019》《世界領(lǐng)先IT國
家創(chuàng)造宣言》《工程生物學(xué)國家愿景》《工程生物學(xué):英國經(jīng)濟和國家目標的機遇《產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整指導(dǎo)目錄
(2023年本》《關(guān)于加快傳統(tǒng)制造業(yè)轉(zhuǎn)《工業(yè)領(lǐng)域碳達峰實施方案》
型升級的指導(dǎo)意見》《“十四五”原材料工業(yè)發(fā)展規(guī)劃》《歐盟生物經(jīng)濟戰(zhàn)略進展報告》《國家生物質(zhì)能戰(zhàn)略的
基石》《地平線2020(歐盟科研框架計劃)》《關(guān)于合成生物學(xué)定義
的意見》啟動敏捷生物鑄造廠聯(lián)盟計劃《技術(shù)評估:合成生物學(xué)》《向國會報告:合成生物學(xué)》《國防部科技優(yōu)先事項》《關(guān)于擴大戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)投資培育壯大新增長點增長極的指導(dǎo)意見》《國務(wù)院關(guān)于全面加強基礎(chǔ)
科學(xué)研究的若干意見》《加強“從0到1”基礎(chǔ)研究工作方案》《面向生物經(jīng)濟的歐洲化學(xué)工業(yè)路線圖》《“十四五”生物經(jīng)濟
發(fā)展規(guī)劃》英
國
中
國《英國合成生物學(xué)戰(zhàn)略計劃》資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理美
國歐
盟基因組編輯金斯瑞、SynthegoIIlumina、PacBio、Thermo、Fisher、PacBio、連川生物Twist、金斯瑞、script、Codex、泓迅生物、IDT、藍晶微生物Twist、伯科生、
NykodeGingko、惠和生物、Amyris
、ZymergenOriCiro
、康碼
生Novozyme、蔚藍生物、Absci、諾唯贊、Codexis、
弈柯菜、Arzeda、百圖生科金丹科技、海正生物、凱賽生物、國生科技、Braskem
、DanimerScientificLygos、凱賽生物、梅花生物、華恒生物、LumenBioscience、欣貝菜、瑞德林、森瑞斯態(tài)創(chuàng)生物、巨子生物、未名拾光、華熙生物、中科財揚Beyond
Meat、星期零、安琪酵母、
Biomilq、帝斯曼、一兮生物、嘉必優(yōu)EditasMedicine、Caribou
Bio
、
瑞風(fēng)生物、Intellia明巨諾、復(fù)星凱特、恒潤達生、覬基因、南京傳奇達安基因、華大基因、科華生物、艾德生物Greenlight、AgBiome、Corteva聚維元創(chuàng)合成生物學(xué)本身的發(fā)展和增長受益于多種技術(shù)的融合,從產(chǎn)業(yè)鏈來看,上游生物體設(shè)計企業(yè)主要提供底層技術(shù)和應(yīng)用支持,比如DNA
測序/合成/存儲、基因編輯、蛋白設(shè)計和催化,代表性企業(yè)有Twist、
金斯瑞、script、Codex
等;中下游企業(yè)負責(zé)合成生物產(chǎn)品制造,例如材料與化學(xué)品等領(lǐng)域,代表性
企業(yè)有金丹科技、海正生物、BioNTech等。1.2.1全國合成生物產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀:合成生物產(chǎn)業(yè)鏈覆蓋面龐大Therapeutics下游上游中游工業(yè)化學(xué)品醫(yī)療健康前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
研(股票
院599)農(nóng)業(yè)能源食品資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理根據(jù)Research
and
Markets披露的信息,2023年,中國合成生物市場規(guī)模達到11.5億美元,隨著應(yīng)用場景的增多和技術(shù)的改善,市場逐漸擴容,合成生物在未來10年內(nèi)將對各個行業(yè)產(chǎn)生重要影響。2023年中國合成生物學(xué)對不同行業(yè)的影響0-5年
5-10年10+年燃料農(nóng)業(yè)
礦業(yè)電力手機
建筑
機械合成生物學(xué)信息參考》
前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理化學(xué)品紡織品食品(不包
含肉類)時尚水1.2.2全國合成生物產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀:合成生物產(chǎn)業(yè)應(yīng)用領(lǐng)域廣泛美容醫(yī)療設(shè)備電子產(chǎn)品生物制藥非處方藥產(chǎn)品替代工
藝
改
進
原
材
料
變
化肉類和水產(chǎn)養(yǎng)殖前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
研(股票
9院599)天津已經(jīng)明確將生物制造作為帶動未來經(jīng)濟高質(zhì)量發(fā)展的關(guān)鍵力量,加快推動天津生物經(jīng)濟前瞻布局、創(chuàng)新發(fā)展。依托天津大學(xué)、中科院天津生物科
技工程研究所、國家合成生物技術(shù)創(chuàng)新中心、教育部合成生物學(xué)前沿科學(xué)中心、合成生物學(xué)海河實驗室等創(chuàng)新平臺,天津?qū)⒓涌齑蛟旌铣缮锂a(chǎn)業(yè)發(fā)
展新高地。其中,國家合成生物技術(shù)創(chuàng)新中心是國家級科技創(chuàng)新平臺,是我國搶占全球生物產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新制高點的“國之重器”,是集核心技術(shù)研發(fā)、技術(shù)轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化、企業(yè)培育、資本運營四位一體的新型研發(fā)平臺。同時,天津還將建立特色產(chǎn)業(yè)基地,推動“生物制造谷”建設(shè)。進一步發(fā)揮天津港口、自貿(mào)試
驗區(qū)、自主創(chuàng)新示范區(qū)綜合優(yōu)勢,與大型中央企業(yè)合作,在津設(shè)立健康糖產(chǎn)業(yè)園區(qū)。合成生物上市公司華熙生物,也在天津投資6.3億,建成了全球
最大的合成生物中試轉(zhuǎn)化平臺。山東匯聚了很多老牌的發(fā)酵企業(yè)。早在2017年,由青島能源所、山東大學(xué)、齊魯工業(yè)大學(xué).
、青島蔚藍生物集團等7家發(fā)起單位共同建立了山東省合成
生物技術(shù)創(chuàng)新中心。華熙生物、金城藥業(yè)、三元生物、山東赫達、山東福瑞達、青島蔚藍生物等合成生物技術(shù)相關(guān)企業(yè),總部都在山東。2023年1月,山東省”兩會”政府工作報告中明確提出把“合成生物”產(chǎn)業(yè)作為大力培育支持的創(chuàng)新產(chǎn)突出”合成生物”等關(guān)鍵領(lǐng)域核心技術(shù)攻關(guān),扎實推進先進制造業(yè)強省行動,著力深化新舊動能轉(zhuǎn)換,加快推動山東醫(yī)藥健康產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。上海是我國第一個合成生物學(xué)重點實驗室、第一個合成生物學(xué)科學(xué)聯(lián)盟,第一個合成生物學(xué)專業(yè)委員會誕生地。從2020年開始,上海就密集發(fā)布了合成生物產(chǎn)業(yè)相關(guān)政策。2022年11月21日發(fā)布《上海市加快打造全球生物醫(yī)藥研發(fā)經(jīng)濟和產(chǎn)業(yè)化高地的若干政策措施》瞄準合成生物學(xué)、基因編輯、干
細胞與再生醫(yī)學(xué)、細胞治療與基因治療、人工智能輔助藥物設(shè)計等重點領(lǐng)域,布局若千市級科技重大專項和戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)重大項目。2023年10月,上海市印發(fā)《上海市加快合成生物創(chuàng)新策源打造高端生物制造產(chǎn)業(yè)集群行動方案(2023-2025年)》,目標到2025年培育1至2家年銷售收
入超過10億元的優(yōu)勢企業(yè),建設(shè)3個左右具有特色和國內(nèi)領(lǐng)先優(yōu)勢的產(chǎn)業(yè)基地;到2030年,基本建成具有全球影響力的高端生物制造產(chǎn)業(yè)集群。2023年2月20日,浙江省發(fā)布了《浙江省人民政府辦公廳關(guān)于培育發(fā)展未來產(chǎn)業(yè)的指導(dǎo)意見》,提出要優(yōu)先發(fā)展”合成生物”等9個快速成長的未來產(chǎn)業(yè)。具體包括加快發(fā)展定量合成、基因編輯、蛋白質(zhì)設(shè)計、細胞設(shè)計、高通量篩選等前沿技術(shù),推動合成生物技術(shù)在生物智造、生物育種等領(lǐng)域的顛
覆性創(chuàng)新與工程化應(yīng)用。浙江省的合成生物產(chǎn)業(yè)布局主要集中在杭州市。人才方面,杭州在合成生物領(lǐng)域已擁有鄭裕國院士、楊立榮教授、李永泉教授等一批行業(yè)領(lǐng)域頂級專
家,引進了曾安平院士、王寶俊教授等一批“鰓鵬計劃”人才,逐漸形成了以浙江大學(xué)、西湖大學(xué)等為代表的優(yōu)勢科研團隊。重點平臺方面,杭州獲批建設(shè)了國家化學(xué)原料藥合成工程技術(shù)研究中心,布局微生物生化與代謝工程、生物有機合成、藥物合成生物學(xué)等省級重點實驗室。2023年7月,浙江省合成生物產(chǎn)業(yè)技術(shù)聯(lián)盟,由浙江大學(xué)杭州國際科創(chuàng)中心牽頭,傳化集團等多家企事業(yè)單位共同發(fā)起成立。2023年8月,傳化科技城核心產(chǎn)業(yè)載體-錢灣生物港正式開園,將逐步構(gòu)建起以合成生物為核心的生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)集群,打造國內(nèi)首個”合成生物成果轉(zhuǎn)化基地”,橫向兼顧CGT、醫(yī)療器械,縱向聚焦化工、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域?qū)铣缮锏膽?yīng)用,發(fā)揮傳化集團“鏈主”優(yōu)勢,構(gòu)建合成生物“科研-轉(zhuǎn)化-產(chǎn)品”一體的產(chǎn)業(yè)鏈、供應(yīng)鏈和價值鏈。1
.2.3全國合成生物產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀:各地區(qū)均積極布局合成生物領(lǐng)域天津山
東上海浙江
產(chǎn)瞻業(yè)咨
領(lǐng)資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理一直以來,深圳始終瞄準國家和“雙區(qū)”建設(shè)的重大戰(zhàn)略需求,著力融合信息技術(shù)(IT)
和生物技術(shù)(BT),
不斷搶占科技發(fā)展的制高點。除了出臺多個扶持行業(yè)發(fā)展的政策外,深圳首創(chuàng)的“樓上樓下”創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)綜合體模式,誕生了眾多合成生物的明星企業(yè)。“樓上樓下”創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)綜合體模式指的是“樓上創(chuàng)新、樓下創(chuàng)業(yè)”,該綜合體
聚焦合成生物領(lǐng)域,表面是科研人員與企業(yè)人員在同一棟大樓工作,實質(zhì)是產(chǎn)研雙向融合。樓上注重產(chǎn)業(yè)應(yīng)用研究,樓下企業(yè)孵化聚集,打通從原始創(chuàng)新到
推動創(chuàng)業(yè)發(fā)展的創(chuàng)新路徑。2022年6月,深圳發(fā)布《關(guān)于發(fā)展壯大戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)集群和培育發(fā)展未來產(chǎn)業(yè)的
意見》,計劃打造20個戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)和
8個未來產(chǎn)業(yè)的產(chǎn)業(yè)集群,合成生物位列
八大未來產(chǎn)業(yè)之首1.2.4深圳合成生物產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀:深圳較早布局合成生物學(xué)賽道樓下-一企業(yè)孵化聚集目2018年,合成生物重大科技基礎(chǔ)設(shè)施獲市發(fā)改委批復(fù)選
址光明科學(xué)城開始建設(shè)Q0企2022年
2019年2018年2019年,在深圳市科創(chuàng)委的支持下,深圳合成
生物學(xué)創(chuàng)新研究院應(yīng)運2017年,深圳先進院成立合成生物學(xué)研究所
較早布局合成生物學(xué)賽道資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理樓上--產(chǎn)業(yè)應(yīng)用研究2017年激發(fā)創(chuàng)意而生梅麗科技MEIL.ITECHHaploX
海普洛斯華因康基因HYK
GENE儒翰基因RH
GENETECHGeneMind安序源BiocrestechSiYOMiCRO中科欣揚近鄰生物
PROXYBIOSYNCERESBIOSCIENCESThe
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物佰B1O奧FO長R上游1.2.5深圳合成生物產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀:產(chǎn)業(yè)鏈布局較為完善下游中游Acen
Med愛生
醫(yī)
學(xué)Biocreltech高通量篩選技術(shù)基因測序技術(shù)∈xoRNA基因編輯技術(shù)合成生物平臺搭建及產(chǎn)品制造醫(yī)療健康、工業(yè)化學(xué)品等領(lǐng)域平安醫(yī)療
GCNCUS今是科技SININGENE思凝一云佰奧長生B
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E基因合成技術(shù)HAVY
HEALTH寰
匯
醫(yī)
療資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理基礎(chǔ)技術(shù)深圳精準醫(yī)療科技有限公司新宙
邦
CAPCHEM生
物
集
團BI口
GR口uP冠
馳GUANCH1作為大灣區(qū)綜合性國家科學(xué)中心先行啟動區(qū),光明科學(xué)城承載建設(shè)了全球首個合成生物研究重大科技基礎(chǔ)設(shè)施,同時深圳市工程生物產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新中心、中國科學(xué)院深圳理工大學(xué)(籌)合成生物學(xué)院、合成
生物產(chǎn)業(yè)園等相繼落地。截至2022年,深圳光明區(qū)內(nèi)合成生物企業(yè)總量已突破80家,總估值超270億創(chuàng)新中心和產(chǎn)業(yè)園是光明科學(xué)城合成生物企業(yè)的主要聚集形式,關(guān)注科研和產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化的創(chuàng)新中心是企
業(yè)“孵化器”,從“孵化器”“成長畢業(yè)”的企業(yè)
可以進入場地更大的產(chǎn)業(yè)園,進入更大規(guī)模的實驗
或生產(chǎn)。創(chuàng)新中心、政府等會對企業(yè)全程關(guān)注,為
不同發(fā)展階段的企業(yè)提供所需支持。未來2023年光明區(qū)政府工作報告表示,未來將大力培育5大未來產(chǎn)業(yè)集群。優(yōu)先發(fā)展合成生物產(chǎn)業(yè)集群,高標準建成光明合成生物產(chǎn)業(yè)園,組建產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新聯(lián)盟,鞏固先發(fā)優(yōu)勢,打
造具有全球影響力的合成生物產(chǎn)業(yè)高地。1.2.6深圳合成生物產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀:光明區(qū)發(fā)展形勢較好首創(chuàng)創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)綜合體模式·
首創(chuàng)“樓上樓下”創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)綜合體模式,打通從原始創(chuàng)新到推動創(chuàng)業(yè)發(fā)展的創(chuàng)新路徑,被國家發(fā)
改委列入推廣深圳經(jīng)驗47條企業(yè)傾向于落戶光明區(qū)·2020年以來,國內(nèi)新成立的合成生物企業(yè)中,有40%落戶
深圳,其中近80%企業(yè)集中在光明區(qū)出臺全國首個政策·
出臺全國首個合成生物
專項扶持政策《深圳市
光明區(qū)關(guān)于支持合成生
物創(chuàng)新鏈產(chǎn)業(yè)鏈融合發(fā)
展的若干措施》重點發(fā)展方向之首·在深圳市重點培育的“20+8”產(chǎn)業(yè)集群中合成生物居8個未來產(chǎn)業(yè)重
點發(fā)展方向之首光明區(qū)合成生物
產(chǎn)業(yè)的發(fā)展特點先有創(chuàng)新,再有產(chǎn)業(yè)產(chǎn)業(yè)總估值超270億元·
2018年光明區(qū)成立以來,已聚集合成生物企業(yè)突破
80家,總估值超270億元首支合成生物基金·
國內(nèi)首支合成生物產(chǎn)業(yè)
基金2022年落戶光明區(qū),
目標基金規(guī)模15億元光明區(qū)合成生物產(chǎn)業(yè)創(chuàng)下多項“首位”
產(chǎn)瞻業(yè)咨
研(股票資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理元
。深圳八大未來產(chǎn)業(yè)序號
產(chǎn)業(yè)產(chǎn)業(yè)新一代信息
技術(shù)12345網(wǎng)絡(luò)與通信半導(dǎo)體與集成電路超高清視頻顯示智能終端智能傳感器綠色低碳新材料新能
源安全節(jié)能環(huán)保智能網(wǎng)聯(lián)汽車電子信息材料、新能源材
料、結(jié)構(gòu)和功能材料、生
物材料、前沿新材料、材
料基因組等高端醫(yī)療器械5-10年內(nèi)有望成長為戰(zhàn)略新興產(chǎn)業(yè)數(shù)字與時尚678軟件與信息服務(wù)數(shù)字創(chuàng)意現(xiàn)代時尚生物醫(yī)藥18
生物醫(yī)藥1
9
大
健
康19高端裝備制造101112工業(yè)母機智能機器人激光與增材制造精密儀器設(shè)備海洋經(jīng)濟海洋工程裝備和輔助設(shè)備海洋通信技術(shù)與設(shè)備、海20
洋交通設(shè)備、海洋能源、
海洋生物醫(yī)藥、海洋養(yǎng)殖
和深加工、海洋環(huán)保等、10-15年內(nèi)有望成為戰(zhàn)略新興產(chǎn)業(yè)2022
年6月,深圳發(fā)布《關(guān)于發(fā)展壯大戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)集群和培育發(fā)展未來產(chǎn)業(yè)的意見》,前瞻布局8大未來產(chǎn)業(yè),其中合成生物位列8大未來產(chǎn)業(yè)之首,《意見》提出要重點發(fā)展合成生物底層技術(shù)、定量合成生物技術(shù)、生物創(chuàng)制等領(lǐng)域,加快突破人工噬菌體、人工腫瘤治療等創(chuàng)制關(guān)鍵技術(shù),推進合成生物重大科技基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè),建設(shè)合
成生物學(xué)研發(fā)基地與產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新中心。1.3.1深圳合成生物政策機遇:合成生物為八大未來產(chǎn)業(yè)之首
前瞻產(chǎn)業(yè)研究院1
合成生物2區(qū)塊鏈3
細胞與基因4
空天技術(shù)5腦科學(xué)與類腦智能7可見光通信與光計算發(fā)展未來產(chǎn)業(yè)的意見》
前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理6
深地深海8
量子信息1
314151617動未來產(chǎn)業(yè)交叉融合發(fā)展支持搭建“類腦智能+機器人”、“可見光通信+深地深?!?、“光計算算”、“量子計算+合成生物”等未來產(chǎn)業(yè)跨界融合示范場景,拓展合技術(shù)在細胞與基因治療、細胞與基因技術(shù)在生物育種中的應(yīng)用示范。資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理提升科研平臺保障能力支持建設(shè)與未來產(chǎn)業(yè)關(guān)聯(lián)的合成生物研究、腦解析與腦
材料基因組等重大科技基礎(chǔ)設(shè)施、質(zhì)量基礎(chǔ)設(shè)施、實驗
施、自然科技資源庫以及野外科學(xué)觀測研究站(網(wǎng))等
件平臺,對于新建項目按相關(guān)政策予以一定資金資助。支持建設(shè)概念驗證中心、中試驗證和成支持科研醫(yī)療機構(gòu)建設(shè)合成生物、腦科學(xué)與類腦智能、
與基因治療等領(lǐng)域的臨床驗證與應(yīng)用平臺。2022年6月,深圳出臺了《深圳市培育發(fā)展未來產(chǎn)業(yè)行動計劃(2022—
2025年)》,本措施重點支持八大未
來產(chǎn)業(yè),其中合成生物、區(qū)塊鏈、細胞與基因、空天技術(shù)等未來產(chǎn)業(yè)
在5至10年內(nèi)有望成長為戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)。支持探索未來產(chǎn)業(yè)相關(guān)科學(xué)問題爭取國家財政資金支持,組織實施部市聯(lián)動國家重點研發(fā)計劃“合成
點專項。支持與香港、澳門的高校和科研機構(gòu)開展科技合作,推動粵
產(chǎn)學(xué)研融合,實施深港澳科技計劃項目,按相關(guān)政策予以最高300萬1.3.2深圳合成生物政策機遇:未來合成生物有望成長為戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨
領(lǐng)
(研股票
5院99)01203合成生物產(chǎn)業(yè)平臺建設(shè)資助項目·
加快培育引進行業(yè)龍頭CRO、CMO、CDMO
等合成生物領(lǐng)域產(chǎn)業(yè)公共服務(wù)平臺,按項目所獲市級資助的25%給予最高1000
萬元資助;各級財政資金支持總額不超過項目總投資?!?/p>
建
設(shè)合成生物領(lǐng)域中試、合成生物專用CNAS認
證測試實驗室等共享平臺,按實際建設(shè)投資(僅限固定資產(chǎn)類投資)的50%,給予最高500
萬元資助;共享平臺建設(shè)經(jīng)費來源為非財政預(yù)算單位,若申報單位為財政預(yù)算單位,僅對自籌部分給予資助。·對
上述平臺,按照上一自然年度服務(wù)收入的10%,給予最高300萬元資助。02合成生物專業(yè)資質(zhì)認證資助項目·
對
新
取
得FDA、EMA、PMDA
等機構(gòu)批準獲得境
外上市資質(zhì)的藥品和醫(yī)療器械,按實際投入研發(fā)費用給予每個產(chǎn)品最高100萬元資助;·
對
新
取
得新藥臨床試驗批文的機構(gòu)每個產(chǎn)品,
按實際投入研發(fā)費用給予最高100萬元資助;·
對通
過DMF、CEP、MF注冊的生物原料藥,按實際投入研發(fā)費用給予每個產(chǎn)品最高50
萬元
資助;·
對取得國家食品藥品監(jiān)督管理局核準的化妝
品原料目錄認證的材料,按實際投入研發(fā)費用給予每個產(chǎn)品最高20萬資助。2021年10月,光明區(qū)發(fā)布了全國首個合成生物領(lǐng)域?qū)m椃龀终摺豆饷鲄^(qū)關(guān)于支持合成生物創(chuàng)新鏈產(chǎn)業(yè)鏈融合發(fā)展的若干措施》,“真金白銀”支持合成生物戰(zhàn)略科技力量建設(shè)、創(chuàng)新鏈建設(shè)、產(chǎn)業(yè)
鏈建設(shè)等,其中,合成生物科技專項配套資助項目,單個單位年度資助金額最高為1000萬元。04合成生物企業(yè)專精特新認定資助項目對初次認定為工信部專精特新“小巨
人
”的合成生物企業(yè)給予一次性
200萬元獎勵,對初次認定為省級“專精特新”中小企業(yè)的合成生物
企業(yè)給予一次性100
萬元獎勵,對初次認定為市級“專精特新”中
小
企業(yè)的合成生物企業(yè)給予一次性50
萬元獎勵。同一企業(yè)獲更高層級認
定的,按高層級獎勵金額進行差額
獎勵。單個企業(yè)各級獎勵不超過200萬元。01合成生物科技專項配套資助項目·
對獲得“合成生物學(xué)”“綠色生物制造”等國家、省、市級重點專項或課題的承擔單位,對國家級項目按所獲資金的20%給予資助,單個項目最高1000萬元;·
對省級項目按所獲資金的30%給予資助,單個項目最高500
萬元;·對市級項目按所獲資金的30%給予資助,單個項目最高300
萬元。單個單位年度資助金額最高為1000
萬元。1.3.3深圳合成生物政策機遇:全國首個產(chǎn)業(yè)專項扶持政策前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨
領(lǐng)
研(股票
院599)獨合發(fā)展的若干措施》前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理當前,深圳已經(jīng)成為我國合成生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展最為迅猛的城市之一,深圳建設(shè)了國內(nèi)首個合成生物產(chǎn)業(yè)園、推出國內(nèi)首只合成生物天使基金、發(fā)布國內(nèi)首個支持合成生物產(chǎn)業(yè)政策,召開了國內(nèi)最大合成生
物產(chǎn)業(yè)大會,助力合成生物從科學(xué)研究到產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化再到產(chǎn)業(yè)集群的兩次跨越。政
策
優(yōu)
勢產(chǎn)
業(yè)
優(yōu)
勢全國首個產(chǎn)業(yè)專項扶持政策“真金白銀”支持合成生物戰(zhàn)略科技力量
建設(shè)、創(chuàng)新鏈建設(shè)、產(chǎn)業(yè)鏈建設(shè)、生態(tài)鏈
建設(shè)等,其中,合成生物科技專項配套資
助項目,單個單位年度資助金額最高為1000萬元。合成生物為八大未來產(chǎn)業(yè)之首2022年6月,深圳發(fā)布《關(guān)于發(fā)展壯大
戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)集群和培育發(fā)展未來
產(chǎn)業(yè)的意見》,前瞻布局8大未來產(chǎn)業(yè),
其中合成生物位列8大未來產(chǎn)業(yè)之首。產(chǎn)業(yè)鏈布局較為完善深圳合成生物產(chǎn)業(yè)鏈布局較為完善,
在基因測序、基因編輯等環(huán)節(jié)發(fā)展較
好,涌現(xiàn)一眾優(yōu)質(zhì)企業(yè)。人才優(yōu)勢明顯,創(chuàng)新氛圍濃厚人才供給:打造了一支以青年海歸為
主,形成了全球最大規(guī)模的合成生物
學(xué)領(lǐng)域研究團隊;成果轉(zhuǎn)化:打造了源頭創(chuàng)新至成果轉(zhuǎn)
移轉(zhuǎn)化一體化創(chuàng)新平臺——深圳市工
程生物產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新中心。1.4深圳市合成生物產(chǎn)業(yè)優(yōu)勢總結(jié)前瞻產(chǎn)業(yè)研究院中國產(chǎn)業(yè)咨詢領(lǐng)導(dǎo)者(股票:839599)資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理2.1合成生物行業(yè)中長期發(fā)展規(guī)劃滯后2.2合成生物行業(yè)面臨選品難題和工藝放大難題2.3合成生物行業(yè)產(chǎn)業(yè)化能力不足2.4合成生物行業(yè)應(yīng)用研發(fā)主體錯位挑戰(zhàn)我國從頂層設(shè)計上明確了合成生物的重要戰(zhàn)略地位,并逐步加強了該領(lǐng)域的國家宏觀戰(zhàn)略謀劃,但合成生物領(lǐng)域的長期、短期技術(shù)發(fā)展路線整體規(guī)劃,技術(shù)發(fā)展實施路徑、生物倫理監(jiān)管體系構(gòu)建等仍處
于空白地帶。目前,合成生物學(xué)領(lǐng)域的專項政策規(guī)劃并未出臺,如何實現(xiàn)從基礎(chǔ)研究到技術(shù)創(chuàng)新,從
工程平臺建設(shè)到產(chǎn)品開發(fā)、產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化等多層次、分階段的發(fā)展方式和發(fā)展路徑仍不明確。基礎(chǔ)研究發(fā)展方式和發(fā)展路徑仍不明確產(chǎn)品開發(fā)技術(shù)創(chuàng)新產(chǎn)品轉(zhuǎn)化技術(shù)發(fā)展路
線整體規(guī)劃生物倫理監(jiān)管體系2.1
合成生物中長期發(fā)展規(guī)劃滯后:許多監(jiān)管領(lǐng)域處于空白地帶技術(shù)發(fā)展
實施路徑
仍處于空白地帶資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理工程平臺建設(shè)首先,選品要評估市場空間及需求剛性。選品是合成生物學(xué)產(chǎn)品生產(chǎn)過程的第一個門檻,需要理性評估目標產(chǎn)品利用生物合成途徑生成的難度,并與其他生成路徑進行比較。錯誤的選品在進入后期商業(yè)
化開發(fā)階段后失敗帶來的代價較大。其次,選品要適合合成生物學(xué)方法生產(chǎn)。如果產(chǎn)品處于代謝流關(guān)鍵環(huán)節(jié),可能影響細胞正常生命活動攝入
排出選品時需要考慮的因素大規(guī)模生產(chǎn)中的分離純化成本合成生物學(xué)方法所得產(chǎn)品性能與傳統(tǒng)方式是否有差異產(chǎn)品在微生物能量和生物質(zhì)intracellularextracellular大規(guī)模生產(chǎn)時過量表達的產(chǎn)物可能會帶來細胞毒性細胞代謝流中預(yù)估整體成本
所處環(huán)節(jié)降低的范圍是否會對細胞產(chǎn)生毒性或生
存壓力2.2.1選品難題:錯誤的選品將帶來較大的代價選擇生物合成途徑中的終產(chǎn)物,可能降低后續(xù)步驟的難度評估所選產(chǎn)品利用合成生物學(xué)方式進
行生產(chǎn)的難度前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
研(股票
9院599)倍生生物中國科學(xué)院前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理在利用合成生物學(xué)方式生產(chǎn)產(chǎn)品時,產(chǎn)物結(jié)構(gòu)越復(fù)雜,對應(yīng)的代謝通路優(yōu)化的復(fù)雜度以及分離純化的難度也呈指數(shù)級提升,導(dǎo)致項目整體耗時及成本大幅提升。在所有環(huán)節(jié)均采用生物合成難度較大時,
選擇將部分步驟通過化學(xué)合成的方式實現(xiàn),構(gòu)建生物合成與化學(xué)合成的組合,則可能實現(xiàn)整體的成本
和效率的最優(yōu),提升規(guī)模化生產(chǎn)成功率。Amyris規(guī)?;a(chǎn)青蒿素生物合成與化學(xué)合成結(jié)合辦法ADH1,ALDH1
ADsHAmorphadiene青蒿酸(青蒿素前體)合成生物學(xué)方式生產(chǎn)H青蒿素2.2.2工藝放大難題:可能導(dǎo)致項目整體耗時及成本大幅提升H?C
OPPH?
C
OPPCH?CH?
DMAPPCYP71AV1,
H
ERG20CPR1,CYB5HHO0Artemisinicacid0H?C
SCoA
Acetyl-CoA生
物
合
成
十
化
學(xué)
合
成ERG12ERG8ERG19OHOPPFPP前中國
業(yè)
詢領(lǐng)業(yè)導(dǎo)者研(股票究:839院599)ERG10ERG13tHMG1(X3)源:Amy
ris
Science
前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理MevalonateH?CIPPHO?COH三H2015年以來,我國在合成生物領(lǐng)域研究發(fā)文躍居全球第二,但論文篇均影響力低于世界平均水平。我國合成生物領(lǐng)域論文的整體質(zhì)量還不夠高,且研究發(fā)文領(lǐng)域多集中在應(yīng)用領(lǐng)域,論文在前沿和核心技
術(shù)領(lǐng)域的創(chuàng)新能力與歐美發(fā)達國家仍有較大差距;同時,雖然國內(nèi)研究機構(gòu)應(yīng)用研究成果凸顯,但創(chuàng)
新成果的產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用實踐較少,科企融合度較低,對產(chǎn)業(yè)的推動力量較弱,近幾年全球合成生物學(xué)主
要研究項目和成果都集中在歐美等國家。西班牙瓦倫西亞大學(xué)“通過國際合作促進合成生物學(xué)標準化”研究項目,約220萬歐元Ron
milo等將大腸桿菌碳源從有機碳轉(zhuǎn)化為二氧化碳1、Biotechrabbit
公司研發(fā)出無
細胞蛋白合成系統(tǒng)2、Tarryn
Miller等制造出“人
工葉綠體”1、David
Baker團隊發(fā)布RoseTTAFold,
基于大規(guī)模深度學(xué)習(xí)的結(jié)構(gòu)建模范圍從
真核細胞的蛋白質(zhì)單體擴展到了蛋白質(zhì)
復(fù)合物,并可以預(yù)測蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互
作用的分子細節(jié)2、Wendell
Lim
團隊設(shè)計了兩步正反饋電路,使T細胞能夠根據(jù)抗原密度閾值來
分辨目標1、喬治亞研究院利用新開發(fā)的合成生物學(xué)和基因工程技術(shù),使用重組的4-hydrophenylacetate3-monooxygenase
和FAD還原酶基因,改造腸道中的益生菌
2、伊利諾伊大學(xué)厄巴納·
香檳分校的團
隊于《Cell》發(fā)表論文,實現(xiàn)了有史以
來最完整的活細胞計算機模擬1、ShaoYY等利用CRISPR-Cas創(chuàng)建單染
色體啤酒酵母細胞2、Sc2.0
計劃完成單酵母染色體組裝1、澳大利亞國立大學(xué)”提高作物抗逆性
和產(chǎn)量的智能植物和解決方案”項目,2000萬澳元2、丹麥技術(shù)大學(xué)“合成生物學(xué)指導(dǎo)下的
惡臭假單胞菌生物氟化工程”項目,800
萬歐元3、西班牙高等科學(xué)研究理事會“基于合
成微生物聯(lián)盟的黃酮類化合物合成生物
學(xué)生產(chǎn)平臺”項目,740萬歐元麻省理工設(shè)計出第一個完全依賴蛋白質(zhì)互作的合成生物學(xué)電
路美國馬里蘭大學(xué)醫(yī)學(xué)院宣布首
例轉(zhuǎn)基因豬心臟移植手術(shù)實現(xiàn)2.3合成生物產(chǎn)業(yè)化能力不足:創(chuàng)新成果產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用實踐較少2023
帝斯曼的開創(chuàng)性研究合成生物法生產(chǎn)維生素A,即將全面上市資料來源:Regenesis
前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理1、ACS
Synthetic
Biology指出,
合成生物學(xué)有可能顛覆現(xiàn)有腺相
關(guān)病毒
(AAVs)
的生產(chǎn)模式2、Imec
計劃開發(fā)納米芯片,推進
合成生物行業(yè)發(fā)展麥考瑞大學(xué)建設(shè)“合成生物學(xué)卓越中心”項目,2.4億澳元前中瞻國產(chǎn)業(yè)產(chǎn)咨詢領(lǐng)業(yè)導(dǎo)者研(股票究:839院599)20212022201820192020我國合成生物學(xué)應(yīng)用研究主要以科研院所為主體,缺乏大型產(chǎn)業(yè)巨頭和優(yōu)質(zhì)初創(chuàng)研發(fā)企業(yè)。目前國內(nèi)生物合成行業(yè)的主要代表企業(yè)為凱賽生物、衍進科技和迪贏生物等,企業(yè)多為初創(chuàng)公司,規(guī)模相對較小,
與歐美發(fā)達國家形成的大型跨國企業(yè)巨頭,協(xié)同多投融資渠道的初創(chuàng)企業(yè)融合發(fā)展的產(chǎn)業(yè)格局相比仍
有較大差距。雖然近兩年不斷有新的創(chuàng)新型合成生物公司出現(xiàn),但主要為平臺工具服務(wù)和應(yīng)用產(chǎn)品導(dǎo)
向型公司,涉及使能技術(shù)開發(fā)的公司較少,產(chǎn)業(yè)主體規(guī)模和自主創(chuàng)新能力均較弱。中國企業(yè)多為初創(chuàng)公司,規(guī)模相對較小,擁有的核心技術(shù)及知識產(chǎn)權(quán)較少,與歐美發(fā)
達國家形成的大型跨國企業(yè)巨頭,協(xié)同多
投融資渠道的初創(chuàng)企業(yè)融合發(fā)展的產(chǎn)業(yè)格
局相比仍有較大差距。2.4合成生物應(yīng)用研發(fā)主體錯位:缺乏大型產(chǎn)業(yè)巨頭和優(yōu)質(zhì)初創(chuàng)企業(yè)Bota華恒生物HUAHENG
BIOTECH迪羸生物Dynasty
Gene海外企業(yè)LUMENB
I0S
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CE中國企業(yè)CATHAYINDUSTRIAL
BIOTECH
ti
lb
MyersbousSqBri:0
o藍晶微生物
Bluepha前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
研(股票
9院599)ArcadiaAMBRXCargill資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理kBUFEFOUNDRY3.1合成生物產(chǎn)業(yè)技術(shù)特點3.2基因測序技術(shù)趨勢與突破方向3.3基因編輯技術(shù)趨勢與突破方向3.4基因組裝技術(shù)趨勢與突破方向3.5基因合成技術(shù)趨勢與突破方向3.6酶的定向進化技術(shù)趨勢與突破方向技術(shù)合成生物是典型的交叉學(xué)科。從技術(shù)過程來看,經(jīng)歷了上游底盤設(shè)計、菌種構(gòu)建;中游的發(fā)酵條件優(yōu)化;以及下游的分離提取。當中不僅運用到了分子生物學(xué)技術(shù)、AI
深度學(xué)習(xí)、高通量篩選等方法,還用到了發(fā)酵工藝放大、流體力學(xué)、分離提取制備等技術(shù)。菌種構(gòu)建
底物產(chǎn)物基因1
基因2
基因3廢液提取酶
1酶2
酶3分離提取搖瓶
種子罐3.1.1合成生物產(chǎn)業(yè)技術(shù)特點中間物1
中間物2中間物3
目標產(chǎn)物大發(fā)酵罐資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
研(股票
9院599)平板菌體化學(xué)合成天然提取合成生物生產(chǎn)成本生產(chǎn)能力能耗污染碳排放化學(xué)合成油氣資源--精煉/合成—提取口高效率、技術(shù)成熟、較低成本口高溫、高壓、高排放、高污染、化石依賴天然提取種植/飼養(yǎng)—收割/宰殺—提取口流程短、能耗低、技術(shù)簡單口得率低、污染重、成本高、原料依賴合成生物再生資源—培養(yǎng)/發(fā)酵—提取口較高效率、較低成本、常溫常壓、低排放口技術(shù)不成熟、研發(fā)周期長、菌種易泄露以合成生物生產(chǎn)流程的特點,合成生物被認為是綠色、環(huán)保、高效、可循環(huán)可再生的生產(chǎn)方式。相比化學(xué)合成工藝、天然提取工藝,有著明顯的優(yōu)勢。因此,合成生物被認為是最有潛力替代化學(xué)合成、
天然提取等成熟工藝的新型技術(shù)手段。合成生物也被政府、資本界和產(chǎn)業(yè)界賦予了厚望。3.1.2合成生物工藝優(yōu)勢前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨
領(lǐng)
研(股票
9院599)資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理高中低高中
低基因測序技術(shù)落地場景比較個性化消費疾病篩查生殖健康實時熒光定量PCR數(shù)字PCR二代測速三代測序FISH基因芯片基因測序不同技術(shù)互為補充,NGS
測序應(yīng)用更為廣泛。伴隨對基因測序理解的不斷深入,不同測序技術(shù)與方法亦不斷涌現(xiàn)。在下游較為成熟的商業(yè)化應(yīng)用中,二代高通量測序在各個細分場景均有一席之
地,二代與三代測序的應(yīng)用場景盡管有所重合,但由于技術(shù)特點不同,也具備各自獨特的應(yīng)用領(lǐng)域。對少量樣本或少量基因組靶點(≤20個)的小DNA區(qū)域進行測序時,Sanger
測
序是很好的選擇使用場景廣泛,例如,生殖健康、疾病篩查、伴隨診斷與個性化消費等目前多為實驗室場景,例如,即時檢測傳染源、單細胞RNA測序與De
novo測序等3.2.
1基因測序技術(shù):NGS
測序應(yīng)用更為廣泛準確度高、通量較低通量大、測序速度快、經(jīng)濟性較高讀長長、成本較高應(yīng)用場景一代測序(Sanger測序)
測序
特點二代測序(高通量測序)三代測序(單分子測序)三代測序(單分子測序)前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
研(股票
9院599)rd
Nanopore
前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理二代測序(高通量測序)一代測序
(Sanger測序)基因測序技術(shù)原理比較得益于測序技術(shù)的持續(xù)進步和測序成本的快速下降,NGS應(yīng)用不僅局限于全基因組分析,更深入推動了基礎(chǔ)科研上基因組學(xué)和臨床上疾病精準醫(yī)療的進步??紤]到不同細胞測序的差異性,以及測序在體
內(nèi)不同位置/時間上的更加豐富信息,更多全新領(lǐng)域及概念逐步進入基因測序領(lǐng)域的探索范疇。單細胞測序與傳統(tǒng)測序區(qū)別?Standardgenomesequencing時空組學(xué),為測序增加時間/空間維度的影響因素考量:該技術(shù)在單細胞轉(zhuǎn)錄
組測序的基礎(chǔ)上,通過空間解析轉(zhuǎn)錄組學(xué)的方法,定位細胞及其組學(xué)信息在
組織中的空間位置,我們認為有望成為補充醫(yī)學(xué)圖像和組織病理學(xué)數(shù)據(jù)的診
斷工具。2022年9月,華大生命科學(xué)研究院基于其時空組學(xué)Stereo-seq技術(shù)繪
制首個蝶螈腦再生時空圖譜,為神經(jīng)系統(tǒng)再生醫(yī)學(xué)研究治療提供新方向。單細胞測序,單個細胞維度上的測序活動,體現(xiàn)個體差異性因素:通過捕獲
和擴增單個細胞里的多組學(xué)物質(zhì)(包括DNA、RNA和蛋白等)來進行測序,從
而以更高的分辨率分析樣品中的異質(zhì)性信息。2022年7月,北京大學(xué)課題組利
用三代測序技術(shù)首次在單細胞水平上完成了Mb級連續(xù)性的人類基因組組裝。3.2.2基因測序技術(shù):新興技術(shù)體系及應(yīng)用概念不斷涌現(xiàn)
料來源:GSK
前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
研(股票
9院599)第三代基因編輯技術(shù)備受人們關(guān)注CRISPR-Cas
技術(shù)是基于原核生物(細菌和古生菌)一種免疫系統(tǒng)而開發(fā)
的,稱之為Clusteredregularlyinterspacedshortpalindro-micrepeats-CRISPR-associatedproteins(規(guī)律成簇間隔短回文重復(fù)及其相關(guān)蛋白),簡稱CRISPR-Cas
系統(tǒng)。由于該技術(shù)合成簡單、周期
短、操作靈活、效率高等優(yōu)點,目
前備受人們關(guān)注。CRISPR-Cas
技術(shù)TALENs
(轉(zhuǎn)錄激活因子效應(yīng)物)是繼ZFNs
之后的另一種較為靈活和高效的靶向編輯技術(shù),TALENs
在結(jié)構(gòu)上與ZFNs類似,是由特異性的DNA
結(jié)合蛋白-TALE蛋白和Fok
I核酸酶兩部分
組成。136aaTALEN:NH?-
-CO0HNLS
TAL序列識別模塊ZFNs
(鋅指核酸酶)技術(shù)是第一代基因組編輯技術(shù),
其功能的實現(xiàn)是基于具有獨
特的DNA序列識別的鋅指蛋
白
(ZFP)
發(fā)展起來的。ZFNs
由特異性識別序列的鋅指蛋白(ZFP)和Fokl核酸
內(nèi)切酶組成。3.3.1
基因編輯技術(shù):第三代基因編輯技術(shù)備受人們關(guān)注ZFNs技術(shù)TGTIGGCTTGATGCTGTT
ACTGGAGAATTCACTGTAAGTTAACCTAGTTCGGGCCACAACCGAAACTACGACAATGACCAGTGACATTCAATTGGATCAAGCCCGGIYOJ—TALENs技
術(shù)前瞻產(chǎn)業(yè)研究院中國產(chǎn)業(yè)咨詢領(lǐng)導(dǎo)者(股票:839599)第二代基因編輯技術(shù)第一代基因編輯技術(shù)來源:中關(guān)村前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理ZFP結(jié)合結(jié)構(gòu)域開始應(yīng)用時間DNA
結(jié)
合結(jié)構(gòu)域DNA修
飾
結(jié)構(gòu)域靶序列大小技術(shù)難度開發(fā)周期成本靶向精確度靶向修飾
效率用于藥物的成熟度是否可對任
何基因位點
進行編輯多靶點
編輯ZFNs1996年鋅指蛋白
(ZFP)Fokl(9-12
bp)*2是難TALENs2010年轉(zhuǎn)錄激活因子效應(yīng)
物
(TALEs)Fok
l(8-31
bp)*2是難基因編輯是一種新興的能夠較為精確的對生物體基因組特定目標基因進行修飾的基因工程技術(shù)。作為革命性的基因編輯技術(shù),CRISPR/Cas
的優(yōu)勢非常明顯,相較于ZFNs
和TALENs,CR
ISPR/Cas
的設(shè)計難
度和構(gòu)建難度都要小的多,成本更低,開發(fā)周期更短,靶向修飾效率更高,此外CRISPR/Cas
還具有
可以多靶點編輯和可以編輯RNA
的優(yōu)勢,這是前兩種技術(shù)所不具備的。Cas9蛋白
20bp+NGG高
中
低3.3.2基因編輯技術(shù):
CRISPR/Cas
技術(shù)優(yōu)勢明顯前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
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9院599)2012年來源:中關(guān)村前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理否,受限于
PAM容易sgRNACRISPR/Cas9被認為是CRISPR1.0,其開創(chuàng)了基因編輯新時代,但局限性也非常明顯。目前已有一批CRISPR
2.0新技術(shù)問世,能以比CRISPR
1.0更精確、更通用的方式編輯DNA。CRISPR
1.0基因編輯
療法獲批,為下一代基因編輯技術(shù)走上舞臺中央奠定了基礎(chǔ)。表觀基因組編輯先導(dǎo)編輯3'nPrimer-bindingsiteRTCas9pegRNA5'uGuidesequence◆單堿基編輯可以應(yīng)用到治療囊性纖維化突變,這些突變會損害肺部和消化系統(tǒng),這是傳統(tǒng)的CRISPR/Cas9沒有辦法解決的問題。CRISPR/Cas9技
術(shù)之所以無法解決做到是因為“CRISPR更善于摧毀而不是修復(fù)”?!衄F(xiàn)在,單堿基編輯的療法已經(jīng)進入了早期臨床試驗
中應(yīng)用,包括治療高膽固醇以及某些類型的白血病?!舨贿^,盡管這項技術(shù)非常精確,但卻有一些缺陷:它只能改變特定的DNA序列,無法將新的DNA片段插◆先導(dǎo)編輯能夠能夠?qū)崿F(xiàn)任意堿基替換、DNA
片段插
入和缺失。相較于單堿基編輯,它更為靈活,幾乎
可以靶向并修正基因組中的任何位點?!糇?019年以來,科學(xué)家通過改良酶的設(shè)計,讓先導(dǎo)
編輯變得更有效率。同時采取其他改進措施,防止
細胞自然的DNA修復(fù)機制引發(fā)錯誤?!襞c此同時,科研人員正在嘗試在技術(shù)方面開拓新的
領(lǐng)域,他們試圖在基因組的特定位置插入越來越大
的DNA片段?!舫烁淖兓蜃陨淼男蛄校珻RISPR
系統(tǒng)還可以通過
修改“表觀基因組”來調(diào)控基因活性,這包括對DNA的化學(xué)修飾。◆深入地理解表觀基因組能夠幫助開發(fā)更有效的治療
方法,甚至解決其他形式的CRISPR編輯無法處理的
疾病。3
.3
.3基因編輯技術(shù):CRISPR
2.0新技術(shù)問世
源:深究科學(xué)前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理堿基編輯前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
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9院599)RTtemplate
with
edit入到基因組中。0E-PCR1989年
,Pease
等提出重疊延伸PCR技術(shù)(Overlap
extensionpolymerasechainreaction
,0E-PCR),這種方法可以用于組裝更長片段的DNA。0E-PCR示意圖如左圖所
示,將末端具有重疊序列的DNA片段
通過變性、退火,然后互為引物,經(jīng)聚合酶延伸得到融合的DNA,
一般可以將2-6個DNA片段按比例混合作
為模板,以最外側(cè)兩端的寡核苷酸作為引物,進行重疊延伸,同時要保證相鄰的兩個DNA片段之間有20-40bp的同源重疊區(qū)。由于0E-PCR方法操作簡單,省時省力,已經(jīng)得到了廣泛的應(yīng)用?;蚪M裝技術(shù)相對成熟,低成本、自動化、
一體化是未來發(fā)展方向。受到技術(shù)的限制,DNA
片段從頭合成的長度有限,更長基因或基因組有賴于通過核苷酸片段的酶促組裝或體內(nèi)組裝獲得,通常使用的
寡核苷酸組裝方法有兩種:連接酶組裝法
(ligase
chain
reaction,LCR)和聚合酶組裝法3.4基因組裝技術(shù):低成本、自動化、一體化是發(fā)展方向
NA組裝技術(shù)》
前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理(polymerasecycling
assemb
ly,PCA)。前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
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院599)Massiveamplificationofthe
target
fragment1960-2003年
2004-2007
2008年至今19832004固相亞磷酰胺三酯合成法TdT酶
介
導(dǎo)(DNAScript/Nuclera/MolecularAssemblies)TdT-dNTP
交聯(lián)體(Ansa
Biotechnologies)混合酶介導(dǎo)(Camena
Bioscience/KemSystems)Synthomics(≤1536)基因合成技術(shù)大體可以分為化學(xué)法和生物法。第一代技術(shù)是固相合成法;第二代則是芯片合成法,主要有光化學(xué)法、噴墨法、電化學(xué)法,可以并行進行多條不同序列基因合成;第三代則是酶促合成法,
其合成副產(chǎn)物少、條件溫和。一代合成(固相柱式)
二代合成(固相芯片)
三代合成(生物酶)3.5.1
基因合成技術(shù):生物合成時代已緩緩拉開序幕
斗來源:中合基因前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理光化學(xué)
(LC
Sciences)電化學(xué)(CustomArray)噴墨打印(Twist
Bioscience)集成電路控制(Evonetix)基于分選的高通量并行合成(BGI)化學(xué)法合成◆主流成熟◆單步效率限制合成長度約200nt◆合式過積中十旦估田右圭化學(xué)試劉DrOligo(≤768)Mermade(≤192)擎科/領(lǐng)坤/儀鉑(≤1536)生物法合成◆作用條件溫和◆避免使用有毒化學(xué)試劑技術(shù)成熟效率穩(wěn)定通量低成本高技術(shù)成型通量高
成本低效率不穩(wěn)定前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
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院599)1981亞磷酸酰胺法2008TdT
酶
合成法1955磷酸二酯法技術(shù)原理驗證高效環(huán)保芯片合成法2022年7月
2023年3月
2023年8月◆由中合基因自主研發(fā)的國內(nèi)首臺
自動化“Kb
級基因拼接儀”完成
測試,這標志著該設(shè)備工作樣機
研制成功?!舸嗽O(shè)備采用創(chuàng)新的拼接工藝及全
球首創(chuàng)的開源拼接服務(wù)模式,不
僅填補了國內(nèi)合成生物學(xué)底層裝
備在基因拼接與糾錯階段的空白,
還彌補了國外自動拼接設(shè)備在國
內(nèi)應(yīng)用模式的缺陷,助力我國合
成生物學(xué)領(lǐng)域健康發(fā)展。資料來源:前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理以生物制造及生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)為代表的生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)的飛速發(fā)展倒推DNA合成技術(shù)向第三代-生物合成技術(shù)邁進。近年來,DNA生物合成技術(shù)及裝備開發(fā)屢有突破,第三代DNA合成技術(shù)-生物合成的時代已緩
緩拉開序幕。2021年6月◆
DNA
Script推出世界首臺采用
酶促技術(shù)的臺式DNA
打印機SYNYAX平臺,并于2022年實
現(xiàn)初步商業(yè)化推廣?!?/p>
SYNTAX
平臺為各種規(guī)模的實
驗室提供內(nèi)部DNA
打印-
無需
使用有毒有機化學(xué)品或第三方
DNA
服務(wù)提供商的延長交付等
待時間?!?/p>
SYNTAX
平臺可提高工作流程
的效率和控制力,從而提高實
驗室的生產(chǎn)力以加速創(chuàng)新?!?/p>
2023年3月,Ansa
基于Keasling團隊在2018年發(fā)布的
酶
促DNA
合成技術(shù),宣布成功
從頭合成1005個堿基的DNA序列?!?/p>
2023年3月,MolecularAssemblies也公布了新進展,宣稱已將第一批酶法合成的寡
核苷酸運送給頂尖的生物技術(shù)、
學(xué)術(shù)和合成生物學(xué)研究人員。3.5.2基因合成技術(shù):生物合成時代已緩緩拉開序幕◆2022年7月,中合基因完成國內(nèi)首臺DNA生物合成儀原理樣
機開發(fā),實現(xiàn)合成長度50nt,
單步合成準確率99%,并完成
數(shù)千萬天使輪融資。前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
研(股票
9院599)酶的定向進化,旨在試管中模擬自然進化過程,通過提高基因突變率和設(shè)計特殊的篩選、選擇方法,快速獲得擁有特定性能的酶。因此,定向進化又被稱為“代替自然選擇的上帝之手”,為試管中的達
爾文主義。酶的定向進化步驟通過對蛋白編碼序列進行隨機突變、定點突變或重組構(gòu)建基因突變體庫定向篩選、選擇以獲得具有改進表型
的突變體蛋白質(zhì)定向進化原理①I①D①I①①WDT①O①MDN以該突變體作為下一輪基因多樣化的起點,進行定向進化的迭代,直到獲得性能最優(yōu)的突變體D①D①用研究進展》前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理3.6.1
酶的定向進化技術(shù):快速獲得擁有特定性能的酶前中國產(chǎn)瞻業(yè)咨產(chǎn)詢領(lǐng)
研(股票
9院599)I①①I①①W①T高效構(gòu)建多樣化的基因突變體庫是定向進化的關(guān)鍵步驟之一。早期通過化學(xué)試劑(如甲磺酸乙酯、亞硝酸等)或射線對基因進行無差別隨機突變的傳統(tǒng)方法,由于突變率低并且極易造成基因組不穩(wěn)定而
逐漸被淘汰。取而代之的是一系列相對可控且有高突變率的體外突變法和體內(nèi)突變法??梢援a(chǎn)生非隨機突變的定點飽和突變
(site-saturationmutagenesis,SSM)序列飽和突變
(sequencesaturation
mutagenesis,SeSaM)合成文庫
(synthetic
library
generation)等可以產(chǎn)生隨機突變的易錯PCR(error-prone
PCR,epPCR)aDNA改組
(DNA
shuffling)近
年
來
,CRISPR-Cas介導(dǎo)的重組技術(shù)實現(xiàn)了在原核與真核細胞中對目的基因進行高效的片段插入、刪除和替換,大大提高了原核與真核細胞中重組
的效率注:a—
基于CRISPR-CAS9同源重組的突變;b—
基于NCAS9和DNA聚合酶I
的
突
變
;c—
基
于NCAS9
和堿基編輯器的突變3.6.2酶的定向進化技術(shù):高效構(gòu)建多樣化的基因突變體庫基于CRISPR的體內(nèi)突變方法nCas9Error-proneDNAPXO
立用研究進展》
前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理轉(zhuǎn)換gRNAlibrary基于CRISPR-Cas9同源重組的突變
基于nCas9和DNA聚合酶1的突變
基于nCas9和堿基編輯器的突變CnCas9Deaminase選擇迭代周期
體外突變法bestvariantCas9b創(chuàng)建序列覆蓋率高、多樣性強的突變體庫,能最大程度挖掘不同氨基酸序列與其對應(yīng)表型之間的關(guān)系,理論上能夠提高獲得理想突變體的概率。然而,絕大部分篩選和選擇技術(shù)通量低、準確性差,導(dǎo)致難
以實現(xiàn)對目標蛋白質(zhì)序列全面且深入的挖掘。因此,開發(fā)更快速、靈敏、準確的高通量篩選技術(shù),是連續(xù)進化旨在無人為干預(yù)的情況下完成基因突變、蛋白表達、表型選擇與篩選的迭代實驗。連續(xù)定向
進化通過縮短每輪的進化時間來增加迭代次數(shù),從而提高獲得目標性狀突變體的概率。由D.Liu開發(fā)
的噬菌體輔助的連續(xù)進化系統(tǒng)(phage-assisted
continuous
evolution,PACE)是較經(jīng)典的案例。隨宿主細胞連續(xù)流入
噬菌體輔助連續(xù)進化過程
持續(xù)流出平板篩選法展示法熒光篩選法質(zhì)譜法紅外檢測法特殊光譜檢測法3.6.3酶的定向進化技術(shù):高通量定向進化的新方法
用研究進展》
前瞻產(chǎn)業(yè)研究院整理需要標記
的技術(shù)不需要標
記的
技術(shù)MP:突變質(zhì)粒(Mutagensis
Plasmid)AP:
輔助質(zhì)粒(Accessory
Plasmid)
SP:
選擇質(zhì)粒(Selection
Plasmid)攜帶突變靶基因的感染性后代0C0非傳染性的后代提高定向進化效率的關(guān)鍵所在。新型高通量篩選技術(shù)選擇噬菌體:編碼抗原基因庫前瞻產(chǎn)業(yè)研究院中國產(chǎn)業(yè)咨詢領(lǐng)導(dǎo)者(股票:839599)連續(xù)突變近年來隨著人工智能的高速發(fā)展,借助同源建模與機器學(xué)習(xí)對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進行預(yù)測的準確性日益增加,不同的算法及軟件被開發(fā)以用于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的計算。包括Modeller、Rosetta、AIphaFold
2等在內(nèi)
的多種方法已被廣泛用于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預(yù)測。其中,最廣為人知的計算方法為AIphaFold
2,這種算
法是通過生物信息學(xué)和物理方法結(jié)合的方法進行預(yù)測。AIphaFold
2計算原理示意
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