變應(yīng)性鼻炎相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜分析的任務(wù)書_第1頁(yè)
變應(yīng)性鼻炎相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜分析的任務(wù)書_第2頁(yè)
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變應(yīng)性鼻炎相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜分析的任務(wù)書任務(wù)書任務(wù)名稱:變應(yīng)性鼻炎相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜分析任務(wù)概述:本次任務(wù)旨在利用生物信息學(xué)技術(shù),探究變應(yīng)性鼻炎相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)在變應(yīng)性鼻炎發(fā)生過程中的表達(dá)譜,為該疾病的預(yù)防和治療提供新的思路和方法。任務(wù)內(nèi)容:1.了解變應(yīng)性鼻炎的病理生理過程、病因和發(fā)病機(jī)制,明確需要分析的樣本類型和樣本量,包括正常對(duì)照組和變應(yīng)性鼻炎患者組。2.收集公共數(shù)據(jù)庫(kù)中的變應(yīng)性鼻炎相關(guān)的lncRNA數(shù)據(jù)集,如GENCODE、Lncipedia和NONCODE等,利用生物信息學(xué)工具進(jìn)行篩選和過濾,最終確定適合本次研究的候選基因。3.根據(jù)樣本的RNA測(cè)序數(shù)據(jù),利用基因差異表達(dá)分析工具(如DESeq、edgeR、limma等)進(jìn)行差異表達(dá)分析,挑選出顯著差異表達(dá)的變應(yīng)性鼻炎相關(guān)lncRNA基因。4.利用生物信息學(xué)工具預(yù)測(cè)差異表達(dá)lncRNA的功能和調(diào)控機(jī)制,如基因本體論(GO)和通路分析,構(gòu)建lncRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),挖掘與變應(yīng)性鼻炎相關(guān)的調(diào)控模式和通路。5.驗(yàn)證lncRNA表達(dá)差異和功能分析的結(jié)果,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR和RNA干擾技術(shù),檢測(cè)lncRNA的表達(dá)水平和調(diào)控效應(yīng),并進(jìn)一步研究與變應(yīng)性鼻炎發(fā)生和發(fā)展的關(guān)系。6.利用機(jī)器學(xué)習(xí)算法(如支持向量機(jī),隨機(jī)森林等)對(duì)lncRNA基因進(jìn)行分類和預(yù)測(cè),分析其在變應(yīng)性鼻炎診斷與預(yù)測(cè)中的潛在作用。7.撰寫研究論文,介紹實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)分析和結(jié)果解釋,總結(jié)研究意義和啟示,為變應(yīng)性鼻炎的診斷、治療和防控提供新思路和方法。任務(wù)要求:1.能夠熟練運(yùn)用生物信息學(xué)工具進(jìn)行差異表達(dá)分析、功能分析和共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建等研究,具有一定的編程和數(shù)據(jù)處理能力。2.具備實(shí)驗(yàn)室分子生物學(xué)技術(shù)操作技能,如RNA提取、RT-qPCR、RNA干擾等,能夠高效完成驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)。3.具備較好的文獻(xiàn)閱讀和英文寫作能力,能夠撰寫流暢、結(jié)構(gòu)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)难芯空撐?,并進(jìn)行學(xué)術(shù)報(bào)告和口頭交流。4.能夠積極配合課題組其他成員開展合作研究,具有良好的團(tuán)隊(duì)協(xié)作能力和溝通能力。任務(wù)時(shí)間:任務(wù)周期為6個(gè)月,具體任務(wù)時(shí)間為2021年6月1日至2021年11月30日。任務(wù)預(yù)算:根據(jù)研究所需的RNA測(cè)序、實(shí)時(shí)熒光定量PCR、RNA干擾等實(shí)驗(yàn)所需的試劑和設(shè)備,以及文獻(xiàn)檢索和參考書籍等費(fèi)用計(jì)算預(yù)算,預(yù)計(jì)費(fèi)用為15萬元人民幣。其中,人員費(fèi)用為10萬元,試劑和設(shè)備費(fèi)用為5萬元。費(fèi)用狀況需及時(shí)向課題負(fù)責(zé)人匯報(bào)并按照實(shí)際情況進(jìn)行調(diào)整。任務(wù)評(píng)估:任務(wù)完成后,將根據(jù)論文質(zhì)量、實(shí)驗(yàn)進(jìn)展情況、成果發(fā)表情況、團(tuán)隊(duì)合作等多方面進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)。評(píng)估結(jié)果將作為任務(wù)完成的重要參考依據(jù)。任務(wù)指導(dǎo):本課題由醫(yī)學(xué)研究所某教授負(fù)責(zé)指導(dǎo),對(duì)學(xué)員工作進(jìn)行指導(dǎo)和評(píng)審,同時(shí),課題組

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