文獻(xiàn)管理課件

文獻(xiàn)管理Referencemanager計(jì)算機(jī)應(yīng)用

王祿山May,2007文獻(xiàn)管理以《論語(yǔ)·學(xué)而》第一首段開(kāi)篇：

子曰：

學(xué)而時(shí)習(xí)之，不亦說(shuō)乎？

有朋自遠(yuǎn)方來(lái)，不亦樂(lè)乎？

人不知不慍，不亦君子乎？論語(yǔ)今讀文獻(xiàn)管理（一）孔子在此彰顯出求知、求學(xué)、求道的身心狀態(tài)的歷程描繪出人與真理接觸互動(dòng)的生活圖像（二）求知、求學(xué)、求道之三難

1、學(xué)而厭（學(xué)而不習(xí)、不時(shí)）2、學(xué)而孤（獨(dú)學(xué)無(wú)友）3、學(xué)而驕（驕而怨怒）學(xué)習(xí)之道在於超越上述三難的處境達(dá)到君子的身心境界。論語(yǔ)今讀文獻(xiàn)管理學(xué)習(xí)什么？知識(shí)信息數(shù)據(jù)課本科學(xué)雜志實(shí)驗(yàn)結(jié)果求知、求學(xué)與求道大學(xué)懷疑精神自學(xué)方法文獻(xiàn)管理

20002004RelatedRecords?TimeCitedCiting19951973跨越時(shí)間的限制

回顧創(chuàng)意的起源與前瞻研究的進(jìn)展1999198519961980求學(xué)更應(yīng)了解研究“歷史”遠(yuǎn)古朋友學(xué)習(xí)智慧文獻(xiàn)管理課本科學(xué)雜志科研成果創(chuàng)新性結(jié)果具有首創(chuàng)性1、背景介紹（提出問(wèn)題）2、材料、方法、結(jié)果（分析問(wèn)題）3、討論及結(jié)論（解決問(wèn)題）科技論文參考文獻(xiàn)求學(xué)更應(yīng)了解“歷史”—參考文獻(xiàn)文獻(xiàn)管理參考文獻(xiàn)的功能與作用

1）參考文獻(xiàn)是科技論文的重要組成部分，它不僅能為作者的論點(diǎn)提供有力的論據(jù)，而且可以精練文字節(jié)約篇幅，增加論文的信息量，具有很高的信息價(jià)值。2）論文作者在其課題的選題論證、實(shí)驗(yàn)研究、以及總結(jié)和書(shū)寫(xiě)論文的過(guò)程中，都要參閱和利用大量的科學(xué)文獻(xiàn)，由于作者在撰寫(xiě)論文時(shí)，不可能將所有引用前人成果都詳盡地復(fù)述，只能將其主要引用文獻(xiàn)注明出處列于文后?？蒲泄ぷ鳎簭牟殚單墨I(xiàn)開(kāi)始。文獻(xiàn)管理3）參考文獻(xiàn)注明了被引理論、觀點(diǎn)、方法、數(shù)據(jù)的來(lái)源，反映了論文的真實(shí)科學(xué)依據(jù)，沒(méi)有參考文獻(xiàn)的科學(xué)論文，應(yīng)視為作者忽略了科學(xué)工作的繼承性，也反映了作者科學(xué)學(xué)風(fēng)和態(tài)度的欠缺。4）引用一定數(shù)量的參考文獻(xiàn)，既表明學(xué)科的繼承性和作者對(duì)他人勞動(dòng)成果的尊重，也為編輯部、審稿專(zhuān)家和讀者提供了鑒別論文價(jià)值水平的重要信息。5）參考文獻(xiàn)為讀者和審閱專(zhuān)家提供了與論文有關(guān)的文獻(xiàn)題錄，便于檢索，以達(dá)到共享信息資源和推動(dòng)科技進(jìn)步的作用。6）著錄參考文獻(xiàn)有助于科技信息人員進(jìn)行信息研究和文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)研究?？蒲泄ぷ鳎簭牟殚單墨I(xiàn)開(kāi)始。文獻(xiàn)管理如何查閱參考文獻(xiàn)？原始文獻(xiàn)文獻(xiàn)管理文獻(xiàn)管理中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù)ElsevierScience文獻(xiàn)管理ElsevierScience是世界上公認(rèn)的高品位學(xué)術(shù)出版公司，也是全球最大的出版商，已有100多年的歷史。除了出版圖書(shū)外，還是當(dāng)今世界最大的學(xué)術(shù)期刊出版商，內(nèi)容涉及生命科學(xué)，物理，醫(yī)學(xué)，工程技術(shù)及社會(huì)科學(xué)，其中許多為核心期刊。近年來(lái)，Elsevier公司合并了一些出版社，如AcademicPress、CellPress的學(xué)術(shù)期刊全文數(shù)據(jù)也已加入到ScienceDirect，目前國(guó)際網(wǎng)站的服務(wù)器上安裝有1500多種期刊。

文獻(xiàn)管理綜述（Review)文獻(xiàn)專(zhuān)家分析（專(zhuān)業(yè)），對(duì)從事科技工作的初學(xué)者重要。是文獻(xiàn)的深入加工，而不是簡(jiǎn)單的羅列。綜述是對(duì)相關(guān)進(jìn)展作出（專(zhuān)家）評(píng)判。如何查閱參考文獻(xiàn)？CurrentOpinionsJournalsAnnualReviewJournals文獻(xiàn)管理影響因子高綜合性雜志科普性寫(xiě)作文獻(xiàn)綜述好在線(xiàn)他引全文獻(xiàn)管理文獻(xiàn)管理二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)及檢索BiologicalAbstractMedline/Pubmed文獻(xiàn)管理二次文獻(xiàn)綜述文獻(xiàn)信息加工，一般為科技論文的摘要如何查閱參考文獻(xiàn)？文獻(xiàn)管理二次文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)及檢索生物學(xué)文獻(xiàn)中國(guó)期刊網(wǎng)文獻(xiàn)管理概述收錄范圍:

1MEDLINE2PreMEDLINE3Publishersuppliedcitations文獻(xiàn)管理MEDLINE收錄了全世界70個(gè)國(guó)家和地區(qū)的4600余種生物醫(yī)學(xué)期刊，起始時(shí)間1953年，目前文摘條目1200

萬(wàn)篇，年報(bào)道量近40萬(wàn)條，英文刊物占90%、3/4有英文摘要，周更新。內(nèi)容涉及：醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、牙醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、衛(wèi)生保健、獸醫(yī)學(xué)等專(zhuān)業(yè)。記錄標(biāo)注[PubMed-indexedforMEDLINE]文獻(xiàn)管理PublisherSuppliedCitation出版商直接向PubMed遞送的電子記錄。記錄標(biāo)注[PubMed-assuppliedbypublisher]備注：提供的數(shù)據(jù)如果超出MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)的收錄范圍，如在綜合性科學(xué)雜志（Science，Nature）上發(fā)表的地理學(xué)文章等，將不被采用。PreMEDLINE是臨時(shí)性醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)，每天接收新數(shù)據(jù)，經(jīng)MeSH詞表標(biāo)引后，每周向medline移加一次。記錄標(biāo)注[PubMed-inprocess]文獻(xiàn)管理AB-Abstract LA-LanguageAD-Affiliation MH-MeSHTermsAU-Authors

PMID-PubMedUniqueIdentifierCY-Country PT-PublicationTypeDP-PublicationDate

SO-SourceEDAT-EntrezDate TA-JournalTitleAbbreviation

GS-GeneSymbo TI-TitleIS-ISSN UID-UniqueIdentifiersVI-Volume PG備注：檢索詞[字段標(biāo)識(shí)符]字段標(biāo)識(shí)符文獻(xiàn)管理自動(dòng)詞語(yǔ)匹配鏈接點(diǎn)多，部分在網(wǎng)上免費(fèi)獲得全文也可以直接定購(gòu)原文PubMed的特點(diǎn)文獻(xiàn)管理AutomaticTermMapping詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換1、MeSHTranslationtableVitaminc轉(zhuǎn)換為“ascorbicacid”[MeshTerms]ORvitaminc[TextWord]備注：想要查驗(yàn)檢索詞的轉(zhuǎn)換情況，并進(jìn)行調(diào)整和保存檢索策略，可點(diǎn)擊“details”按鈕檢索規(guī)則文獻(xiàn)管理AutomaticTermMapping2、JournalsTranslationtableNewEnglandjournalofmedicine轉(zhuǎn)換為“NEnglJMed”[Journal]備注：三種不同的表達(dá)方式

刊名全稱(chēng)、MEDLINE刊名縮寫(xiě)格式、ISSN檢索規(guī)則文獻(xiàn)管理AutomaticTermMapping3、PhraseList在前兩個(gè)表中均未找到，而在短語(yǔ)列表中找到這個(gè)詞4、AuthorIndex姓（全稱(chēng)）在前,名在后（首字母縮寫(xiě)）smithjc當(dāng)一個(gè)短語(yǔ)在前三個(gè)表中都找不到匹配詞，并且有1或2個(gè)字母在詞后時(shí)，PubMed就在該索引中查找。檢索規(guī)則文獻(xiàn)管理備注：如果在上述4個(gè)表或索引中仍找不到相匹配的詞時(shí)，PubMed就將短語(yǔ)劈開(kāi)，再重復(fù)以上順序單獨(dú)分別查找，直到找到相匹配的詞。如果仍找不到匹配詞，則用AND將短語(yǔ)中的單個(gè)詞連接起來(lái)在全部字段中查找。例：pressurepoint轉(zhuǎn)換為((“pressure”[MeSHTerms]ORpressure[TextWord])ANDpoint[AllFields])檢索規(guī)則文獻(xiàn)管理短語(yǔ)檢索：如果在短語(yǔ)上加雙引號(hào)，將不執(zhí)行轉(zhuǎn)換功能例如：“singlecell”“oxygenfreeradicals”檢索規(guī)則截詞檢索：例：輸入bacter*，檢出bacteria、bacterium等備注：將不執(zhí)行轉(zhuǎn)換功能；截詞檢索只限于單詞，對(duì)詞組無(wú)效。文獻(xiàn)管理布爾邏輯運(yùn)算：AND、OR、NOT必須大寫(xiě)。

E-coliANDhamburger；vitamincORzinc；

traceelementNOTzinc邏輯符的運(yùn)算次序是從左至右，括號(hào)內(nèi)的檢索式可作為一個(gè)單元，優(yōu)先運(yùn)行。布爾邏輯檢索允許在檢索詞后面附加字段標(biāo)識(shí)例如：dna[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]檢索規(guī)則文獻(xiàn)管理基本檢索-BasicSearch高級(jí)檢索-AdvancedSearch限定檢索-LimitsSearch期刊檢索–JournalSearch主題詞檢索-MeSHBrowser檢索途徑與方法文獻(xiàn)管理基本檢索文獻(xiàn)管理檢索步驟：輸入檢索詞，點(diǎn)[Go]按鈕或按回車(chē)檢索詞的輸入形式：

輸入單詞或短語(yǔ)或表達(dá)式，也可用*及“”如，aspirin；stomachulcerIddmANDapoptosisasthmaKamadaA或asthma,KamadaA

者著姓名：wengxz、“wengxz”[au]

刊名標(biāo)題：刊名全稱(chēng)、縮寫(xiě)、ISSN

Journalofleukocytebiology、Jleukocbiol、0741-5400文獻(xiàn)管理備注：刊名后附加字段標(biāo)識(shí)符

刊名與主題詞相同的期刊

genetherapy[ta]、science[ta]、cell[ta]

單個(gè)詞刊名的期刊,Scanning[ta]帶括號(hào)刊名的期刊，錄入時(shí)應(yīng)將括號(hào)省略

JHandSurg[Am]輸入格式為JHandSurgAm文獻(xiàn)管理高級(jí)檢索文獻(xiàn)管理檢索“阿爾茨海默病的基因治療”檢索步驟：在Searchfor框中輸入alzheimerdisease，點(diǎn)擊特征欄的[Preview/Index]按鈕在“AllFields”選擇一個(gè)檢索字段，其右側(cè)輸入框中輸入檢索詞genetherapy，點(diǎn)擊[AND]，點(diǎn)擊屏幕上部[Preview]開(kāi)始檢索并顯示記錄條數(shù)，這樣可以反復(fù)操作；若點(diǎn)擊[Go]則顯示結(jié)果。文獻(xiàn)管理如果選擇一個(gè)檢索字段，在提問(wèn)框中輸入檢索詞，點(diǎn)擊[Index]，則系統(tǒng)顯示相應(yīng)字段的索引詞列表。選中一個(gè)索引詞，點(diǎn)擊邏輯符（AND、OR、NOT），被選中的索引詞會(huì)自動(dòng)粘貼在提問(wèn)框中，然后點(diǎn)擊“Preview”或“Go”按鈕備注：在高級(jí)檢索界面，可以用邏輯組配符將檢索歷史中的序號(hào)加以組配。例，#1ANDenglish文獻(xiàn)管理限定檢索文獻(xiàn)管理檢索“近2年有關(guān)細(xì)胞凋亡的綜述文獻(xiàn)”檢索步驟：在特征欄點(diǎn)擊“Limits”鍵輸入檢索詞apoptosis在Limitedto欄下,進(jìn)行如下各種限定：

選擇字段、只檢帶文摘的記錄、文獻(xiàn)類(lèi)型（選擇review）、語(yǔ)種、子集、年齡組、人類(lèi)或動(dòng)物實(shí)驗(yàn)、性別、錄入系統(tǒng)日期（2years）、文獻(xiàn)出版日期點(diǎn)擊“Go”文獻(xiàn)管理期刊

(Journal)

檢索JAMA文獻(xiàn)管理文獻(xiàn)管理文獻(xiàn)管理期刊編目信息瀏覽頁(yè)機(jī)讀格式NLM館藏情況文獻(xiàn)管理主題詞(MeSH)

檢索AminatedTutorial文獻(xiàn)管理檢索“阿司匹林引起胃潰瘍的文獻(xiàn)”檢索步驟：點(diǎn)擊“MeshBrowser”，進(jìn)入MeSH瀏覽器的首頁(yè)在提問(wèn)框中輸入aspirin，點(diǎn)擊[Go]按鈕，顯示該主題詞的定義。點(diǎn)擊該詞可做如下3種選擇：

選擇副主題詞adverseeffects；

RestrictSearchtoMajorTopicheadingsonly；

DoNotExplodethisterm瀏覽樹(shù)形結(jié)構(gòu)文獻(xiàn)管理……文獻(xiàn)管理文獻(xiàn)管理檢索結(jié)果文獻(xiàn)管理1、結(jié)果的顯示Display旁的下拉菜單，選擇記錄格式：

summary默認(rèn)、brief、Abstract、Citation、ASN.1、MEDLINE、XML等格式顯示所有記錄;記錄前方框：顯示標(biāo)記記錄顯示每屏記錄條數(shù)

Show：默認(rèn)20（5-500）

page:1of13Next文獻(xiàn)管理2、排序(Sort)

著者（Author）FirstAuthor,LastAuthor

刊名（Journal）出版日期（PubDate）3、打印或存盤(pán)(sentto)純文本格式Sentto-Text

/file/Clipboard/email打?。菏褂脼g覽器的打印功能，存盤(pán)：點(diǎn)Sendto下拉按鈕選file

首先選擇所要存盤(pán)的數(shù)據(jù)（show），其次點(diǎn)擊display顯示所要存盤(pán)的格式，然后點(diǎn)Sendto-file即可文獻(xiàn)管理RelatedArticles-鏈接相關(guān)文獻(xiàn)鏈接NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)

Necleotide、Protein、Genome、Structure、Popset、Taxonomy、OMIM、Books、Probeset、3DDomainsLinksBooks-鏈接相關(guān)圖書(shū)

Linkout–

鏈接外部資源，與生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)出版商Web站點(diǎn)期刊全文的鏈接鏈接(link)功能文獻(xiàn)管理ReferenceManager文獻(xiàn)管理

Day-to-dayorganisedreading/archivingThesiswriting;300-400referencesWritingpapersre-submissiontodifferentjournalsWhydoyouneedcitationmanagementsoftware?文獻(xiàn)管理SoftwarepackagesavailableAdeptScientific;()Endnote,ReferenceManager,ProcitePapyrus,Biblioscape3.3RefWorks;www.文獻(xiàn)管理Whatcancitationmanagersoftwaredo?KeeptrackofallkeypapersinafieldRescueandimportreferencesviaInternetconnectiondirectlyintoyourdatabase(s)文獻(xiàn)管理“Citewhileyouwrite”;automaticembeddingofcitationsinWorddocumentGeneratebibliographiesinanyjournalstyle(forendofyearreports,thesis,papers)Whatcancitationmanagersoftwaredo?文獻(xiàn)管理InternetReferenceSearcher

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cerevisiaehomologofmammaliantranslationinitiationfactor-4bcontributestoRNAhelicaseactivity.EMBOJ.12,3997-4003.Borman,A.M.,Kirchweger,R.,Ziegler,E.,Rhoads,R.E.,Skern,T.,andKean,K.M.(1997).EIF4Ganditsproteolyticcleavageproducts:effectoninitiationofproteins