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文檔簡介
.傳染病模型摘要當今社會,人們開始意識到通過定量地研究傳染病的傳播規(guī)律,建立傳染病的傳播模型,可以為預測和控制傳染病提供可靠、足夠的信息。本文利用微分方程穩(wěn)定性理論對傳統(tǒng)傳染病動力學建模方式進行綜述,且針對甲流,SARS等新生傳染病模型進行建模和分析。不同類型的傳染病的傳播過程有其各自不同的特點,我們不是從醫(yī)學的角度一一分析各種傳染病的傳播,而是從一般的傳播機理分析建立各種模型,如簡單模型,SI模型,SIS模型,SIR模型等。本文中,我們應用傳染病動力學模型來描述疾病發(fā)展變化的過程和傳播規(guī)律,運用聯(lián)立微分方程組體現(xiàn)疫情發(fā)展過程中各類人的內在因果聯(lián)系,并在此基礎上建立方程求解算法。然后,通過借助Matlab程序擬合出與實際較為符合的曲線并進行了疫情預測,評估各種控制措施的效果,從而不斷完善文中的模型。 本文由簡到難、全面地評價了該模型的合理性與實用性,而后對模型和數(shù)據(jù)也做了較為扼要的分析,進一步改進了模型的不妥之處。同時,在對問題進行較為全面評價的基礎上又引入更為全面合理的假設,運用雙線性函數(shù)模型對衛(wèi)生部的措施進行了評價并給出建議,做好模型的完善與優(yōu)化工作。 關鍵詞:傳染病模型,簡單模型,SI,SIS,SIR,微分方程,Matlab。,.一、問題重述 有一種傳染?。ㄈ鏢ARS、甲型H1N1)正在流行,現(xiàn)在希望建立適當?shù)臄?shù)學模型,利用已經(jīng)掌握的一些數(shù)據(jù)資料對該傳染病進行有效地研究,以期對其傳播蔓延進行必要的控制,減少人民生命財產的損失??紤]如下的幾個問題,建立適當?shù)臄?shù)學模型,并進行一定的比較分析和評價展望。1、不考慮環(huán)境的限制,設單位時間內感染人數(shù)的增長率是常數(shù),建立模型求t時刻的感染人數(shù)。2、假設單位時間內感染人數(shù)的增長率是感染人數(shù)的線性函數(shù),最大感染時的增長率為零。建立模型求t時刻的感染人數(shù)。3、假設總人口可分為傳染病患者和易感染者,易感染者因與患病者接觸而得病,而患病者會因治愈而減少且對該傳染病具有很強的免疫功能,建立模型分析t時刻患病者與易感染者的關系,并對傳染情況(如流行趨勢,是否最終消滅)進行預測。二、問題分析1、這是一個涉及傳染病傳播情況的實際問題,其中涉及傳染病感染人數(shù)隨時間的變化情況及一些初始資料,可通過建立相應的微分方程模型加以解決。2、問題表述中已給出了各子問題的一些相應的假設。3、在實際中,感染人數(shù)是離散變量,不具有連續(xù)可微性,不利于建立微分方程模型。但由于短時間內改變的是少數(shù)人口,這種變化與整體人口相比是微小的。 因此,為了利用數(shù)學工具建立微分方程模型,我們還需要一個基本假設:感染人數(shù)是時間的連續(xù)可微函數(shù)。三、模型假設模型二和模型三的假設條件:假設一:在疾病傳播期內所考察地區(qū)的總人數(shù)N不變,即不考慮生死,也不考慮遷移。人群分為易感染者(Susceptible)和已感染者(Infective)兩類(取兩個詞的第一個字母,稱之為SI模型),以下簡稱健康者和病人。時刻t這兩類人在總人數(shù)中所占比例分別記作s(t)和i(t)。 假設二:每個病人每天有效接觸的平均人數(shù)是常數(shù),稱為日接觸率。當病人與健康者接觸時,使健康者受感染變?yōu)椴∪恕?假設三:模型三在假設一和假設二的基礎上進行考慮,然后設病人每天治愈的比例為,稱為日治愈率。病人治愈后成為仍可被感染的健康者,顯然1/是這種傳染病的平均傳染期。 模型四的假設條件:假設四:總人數(shù)N不變。人群分為健康者、病人和病愈免疫的移出者(Removed)三類,稱SIR模型。三類人在總數(shù)N中占的比例分別記作s(t),i(t)和r(t)。 假設五:病人的日接觸率為l,日治愈率為m(與SI模型相同),傳染期接觸為 s=l/m。四、符號說明t 某一具體時刻x(t)病人人數(shù)每天每個病人有效接觸的人數(shù)N總人數(shù)s(t)健康者總人數(shù)i(t)病人總人數(shù)i初始時刻病人的比例t病人的最大值日治愈率1/平均傳染率接觸率r(t)移出者s初始時刻健康者的比例五、模型的建立與求解模型1 在這個最簡單的模型中,設時刻t的病人人數(shù)x(t)是連續(xù)、可微函數(shù),并且每天每個病人有效接觸(足以使人致病的接觸)的人數(shù)為常數(shù),考察t到病人人數(shù)的增加,就有方程(1)的解為 結果表明,隨著t的增加,病人人數(shù)x(t)無限增長,這顯然是不符合實際的。 建模失敗的原因在于:在病人有效接觸的人群中,有健康人也有病人,而其中只有健康人才可以被傳染為病人,所以在改進的模型中必須區(qū)別這兩種人。 模型2(SI模型) 又因為方程(5)是Logistic模型。它的解為 這時病人增加的最快,可以認為是醫(yī)院的門診量最大的一天,預示著傳染病高潮的到來,是醫(yī)療衛(wèi)生部門關注的時刻。 其原因是模型中沒有考慮到病人可以治愈,人群中的健康者只能變成病人,病人不會再變成健康者。 模型3(SIS模型) 有些傳染病如傷風、痢疾等愈合后免疫力很低,可以假定無免疫性,于是病人被治愈后變成健康者,健康者還可以被感染再變成病人,所以這個模型成為SIS模型。考慮到這一模型的假設條件,于是有 (8)可得微分方程 0 (9)定義 (10)其中是整個傳染期內每個病人有效接觸的平均人數(shù),稱為接觸數(shù)。得到 (11)模型4(SIR模型)大多數(shù)傳染者如天花 流感 肝炎 麻疹等治愈后均有很強的免疫力,所以病愈的人既非健康者(易感染者),也非病人(已感染者),因此他們將被移除傳染系統(tǒng),我們稱之為移除者,記為R類。SIR模型是指易感染者被傳染后變?yōu)楦腥咀?,感病者可以被治愈,并會產生免疫力,變?yōu)橐瞥?。人員流動圖為:S-I-R。1.模型構成:在假設1中顯然有: s(t) + i(t) + r(t) = 1 (12)對于病愈免疫的移出者的數(shù)量應為 (13)不妨設初始時刻的易感染者、染病者、恢復者的比例分別為(0),(0),=0,則SIR基礎模型用微分方程組表示如下: (14)s(t) , i(t)的求解極度困難,在此我們先做數(shù)值計算來預估計s(t) , i(t)的一般變化規(guī)律。 2.數(shù)值計算在方程(3)中設=1,=0.3,i(0)= 0.02,s(0)=0.98,用MATLAB軟件編程:function y=ill(t,x)a=1;b=0.3;y=a*x(1)*x(2)-b*x(1);-a*x(1)*x(2);ts=0:50;x0=0.20,0.98;t,x=ode45(ill,ts,x0);plot(t,x(:,1),t,x(:,2)pauseplot(x(:,2),x(:,1) 輸出的簡明計算結果列入表1。i(t) , s(t)的圖形以下兩個圖形,is圖形稱為相軌線,初值i(0)=0.02,s(0)=0.98相當于圖2中的P0點,隨著t的增,(s,i)沿軌線自右向左運動.由表1、圖1、圖2可以看出,i(t)由初值增長至約t=7時達到最大值,然后減少,t,i0,s(t)則單調減少,t,s0.0398. 并分析i(t),s(t)的一般變化規(guī)律.表1 i(t),s(t)的數(shù)值計算結果t 0 1 2 3 4 5 6 7 8i(t)0.02000.03900.07320.12850.20330.27950.33120.34440.3247s(t)0.98000.95250.90190.81690.69270.54380.39950.28390.2027 t 9 10 15 20 25 30 35 40 45i(t)0.28630.24180.07870.02230.00610.00170.00050.00010s(t)0.14930.11450.05430.04340.04080.04010.03990.03990.039813.相軌線分析我們在數(shù)值計算和圖形觀察的基礎上,利用相軌線討論解i(t),s(t)的性質。 D = (s,i)| s0,i0 , s + i 1 (15)在方程(14)中消去并注意到的定義,可得 (16)所以: 利用積分特性容易求出方程(5)的解為: (17)在定義域D內,(17)式表示的曲線即為相軌線,如圖3所示.其中箭頭表示了隨著時間t的增加s(t)和i(t)的變化趨向。圖3下面根據(jù)(14),(17)式和圖3分析s(t),i(t)和r(t)的變化情況(t時它們的極限值分別記作, 和).1. 不論初始條件s0,i0如何,病人將消失,即:2. 最終未被感染的健康者的比例是 ,在(7)式中令i=0得到, 是方在(0,1/)內的根.在圖形上 是相軌線與s軸在(0,1/)內交點的橫坐標3.若1/,則開始有,i(t)先增加, 令=0,可得當s=1/時,i(t)達到最大值:然后s1/(即1/s0)時傳染病就會蔓延.而減小傳染期接觸數(shù),即提高閾值1/使得1/(即 1/),傳染病就不會蔓延(健康者比例的初始值是一定的,通??烧J為接近1)。并且,即使1/, 減小時, 增加(通過作圖分析), 降低,也控制了蔓延的程度.我們注意到在=中,人們的衛(wèi)生水平越高,日接觸率越小;醫(yī)療水平越高,日治愈率越大,于是越小,所以提高衛(wèi)生水平和醫(yī)療水平有助于控制傳染病的蔓延.從另一方面看, 是傳染期內一個病人傳染的健康者的平均數(shù),稱為交換數(shù),其含義是一病人被個健康者交換.所以當 即時必有 .既然交換數(shù)不超過1,病人比例i(t)絕不會增加,傳染病不會蔓延。5. 群體免疫和預防:根據(jù)對SIR模型的分析,當 時傳染病不會蔓延.所以為制止蔓延,除了提高衛(wèi)生和醫(yī)療水平,使閾值1/變大以外,另一個途徑是降低 ,這可以通過比如預防接種使群體免疫的辦法做到。忽略病人比例的初始值有,于是傳染病不會蔓延的條件 可以表為這就是說,只要通過群體免疫使初始時刻的移出者比例(即免疫比例)就可以制止傳染病的蔓延。這種辦法生效的前提條件是免疫者要均勻分布在全體人口中,實際上這是很難做到的。據(jù)估計當時印度等國天花傳染病的接觸數(shù) =5,至少要有80%的人接受免疫才行。據(jù)世界衛(wèi)生組織報告,即使花費大量資金提高,也因很難做到免疫者的均勻分布,使得天花直到1977年才在全世界根除。而有些傳染病的更高,根除就更加困難。6.模型驗證:上世紀初在印度孟買發(fā)生的一次瘟疫中幾乎所有病人都死亡了。死亡相當于移出傳染系統(tǒng),有關部門記錄了每天移出者的人數(shù),即有了的實際數(shù)據(jù),Kermack等人用這組數(shù)據(jù)對SIR模型作了驗證。首先,由方程(12),(14)可以得到 ,兩邊積分得所以: (8)再 (9)當 時,?。?3)式右端Taylor展開式的前3項得: (10)在初始值=0 下解高階常微分方程得: (11)其中, 從而容易由(10)式得出:然后取定參數(shù) s0, 等,畫出(11)式的圖形,如圖4中的曲線,實際數(shù)據(jù)在圖中用圓點表示,可以看出,理論曲線與實際數(shù)據(jù)吻合得相當不錯。六、模型評價與推廣根據(jù)傳染病的模型建立研究進而推廣產生了傳染病動力學模型。傳染病動力學1是對進行理論性定量研究的一種重要方法,是根據(jù)種群生長的特性,疾病的發(fā)生及在種群內的傳播,發(fā)展規(guī)律,以及與之有關的社會等因素,建立能反映傳染病動力學特性的數(shù)學模型,通過對模型動力學性態(tài)的定性,定量分析和數(shù)值模擬,來分析疾病的發(fā)展過程,揭示流行規(guī)律,預測變化趨勢,分析疾病流行的原因和關鍵。對于2003年發(fā)生的SARS疫情,國內外學者建立了大量的動力學模型研究其傳播規(guī)律和趨勢,研究各種隔離預防措施的強度對控制流行的作用,為決策部門提供參考.有關SARS傳播動力學研究多數(shù)采用的是SIR或SEIR模型.評價措施效果或擬合實
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