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文檔簡介

細(xì)菌的分類與命名,第六章細(xì)菌的分類與命名,一、生物的分類六界:動物界、植物界、真菌界、原生生物界、原核生物界、病毒界。細(xì)菌分類層次與其他生物相同,即:界、門、綱、目、科(Family)、屬(Genus)、種(Species)。,細(xì)菌的分類與命名,二、細(xì)菌分類的指征1.形態(tài)學(xué)特性2.培養(yǎng)特性3.生活方式4.生理生化特性5.抗原構(gòu)造6.對噬菌體的敏感性7對抗生素及其他化學(xué)物質(zhì)的敏感性8病原性9遺傳學(xué)特征。,細(xì)菌的分類與命名,三、細(xì)菌分類的方法1、數(shù)值分類法2分子生物學(xué)分類法3血清學(xué)方法:共同抗原4化學(xué)分類法:比較細(xì)菌各種細(xì)胞成分,細(xì)菌的分類與命名,1.數(shù)值分類法其分類范疇的基本單位是種,根據(jù)比較細(xì)菌在形態(tài)、生理和生化等方面的特性,計算出相似值來確定種的分類歸屬。,細(xì)菌的分類與命名,2分子生物學(xué)分類法(種系發(fā)生)1)DNA中G+C摩爾百分?jǐn)?shù)(%)含量測定(G+C)mol%含量:某一生物DNA中的G+C配對堿基按摩爾數(shù)計算占全部堿基的百分?jǐn)?shù)。(反映該生物遺傳性能的一種本質(zhì)特征)。測定方法:梯度密度離心法、解鏈溫度法(Tm)等。,細(xì)菌的分類與命名,2)DNA或RNA同源性的測定DNA-DNA雜交試驗(hybridization)原理:同源DNA單鏈或非同源DNA單鏈,只要它們彼此在核苷酸序列上有相應(yīng)互補的部分,就可產(chǎn)生不同程度的結(jié)合。應(yīng)用:通過在體外測定菌株間DNA的雜合率,據(jù)此推算出DNA的相似程度,判斷它們在親緣關(guān)系上的親疏,幫助分類鑒定。,細(xì)菌的分類與命名,3)rRNA的分析rRNA在遺傳信息傳遞中起重要作用,特別是16SrRNA能反映各種細(xì)菌間在系統(tǒng)發(fā)生方面的關(guān)系。從該rRNA的堿基序列可繪制系統(tǒng)發(fā)生樹。,細(xì)菌的分類與命名,四、細(xì)菌的分類體系細(xì)菌分類有三個主要體系前蘇聯(lián)、法國、美國伯杰氏分類系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊,該手冊共四卷(1984-1989)。并于1994年出版了伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊第9版,將細(xì)菌門分為33個部分,其中與獸醫(yī)學(xué)和醫(yī)學(xué)有關(guān)的計13個部分。,細(xì)菌的分類與命名,五、細(xì)菌種的劃分和種以下的分類單位(一)種(Species)種是生物分類的基本單位。凡屬同種的生物,均具有共同的基本性狀特征。它是生物在一定演化階段,具有相對穩(wěn)定的一定性狀特征的實體。,細(xì)菌的分類與命名,(二)種以下的分類單位1.亞種(subspecies):種內(nèi)可能存在一些在某些性狀上相互差異的類別。2.型(type)與亞型(subtype):僅僅是某一方面的性狀,如血清型。型內(nèi)還可按進(jìn)一步的性狀差異區(qū)分為不同亞型。,細(xì)菌的分類與命名,3.菌株(strain)(品系):是指同種細(xì)菌中不同來源的純培養(yǎng)物。具有典型特征的菌株稱為典型株或代表株或標(biāo)準(zhǔn)株。不同菌株可能性狀完全相同,也可能有某種微小差異。,細(xì)菌的分類與命名,六、細(xì)菌的命名“雙名法”命名(國際細(xì)菌命名規(guī)約)由屬名和種名兩部分組成。屬名(第一字母大寫)在前,種名在后。均用拉丁文或拉丁化的文字表示。翻譯時,種名在前,屬名在后。如Staphylococcusaureus未確定種名的細(xì)

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