醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)信息檢索：文獻(xiàn)管理軟件

1、1,文獻(xiàn)管理軟件,2,文獻(xiàn)管理軟件,一、重要性 二、類型 三、Noteexpress文獻(xiàn)管理軟件,3,一、文獻(xiàn)管理軟件的重要性,4,一、文獻(xiàn)管理軟件重要性,上述問題歸納起來就是如何整理與利用查到的文獻(xiàn)進(jìn)行科研。 有效地彌補(bǔ)了文獻(xiàn)檢索與科研產(chǎn)出之間的一個重要環(huán)節(jié)“文獻(xiàn)管理”，切實(shí)地滿足了科研人員在文獻(xiàn)管理方面的多種需要，成為現(xiàn)代科研的重要工具。,文獻(xiàn)檢索,文獻(xiàn)管理,科研產(chǎn)出,5,二、文獻(xiàn)管理軟件類型,（一）按推出公司國別上可分為國內(nèi)文獻(xiàn)管理軟件和國外文獻(xiàn)管理軟件。 國外文獻(xiàn)管理軟件 主要適用于對英文參考文獻(xiàn)進(jìn)行管理，對中文環(huán)境支持較差。 常用的外文文獻(xiàn)管理軟件包括Endnote、Referenc

2、e Manager、RefWorks、Biblioscape等,6,二、文獻(xiàn)管理軟件類型,國內(nèi)文獻(xiàn)管理軟件 不僅能夠?qū)χ形膮⒖嘉墨I(xiàn)進(jìn)行管理，同時也能夠?qū)τ⑽膮⒖嘉墨I(xiàn)進(jìn)行管理，即同時支持常用中英文數(shù)據(jù)庫檢索與記錄導(dǎo)入，同時提供常用中英文期刊模板。 中文文獻(xiàn)管理軟件主要有NoteExpress、醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)王、NoteFirst團(tuán)隊(duì)科研協(xié)作系統(tǒng)、CNKI E-learing數(shù)字學(xué)習(xí)與研究平臺等,7,二、文獻(xiàn)管理軟件類型,（二）按用戶互聯(lián)方式可以分為單機(jī)版與網(wǎng)絡(luò)版 單機(jī)版管理軟件 或稱個人版文獻(xiàn)管理軟件，具備了文獻(xiàn)管理軟件的核心功能： 檢索國內(nèi)外數(shù)據(jù)庫; 以題錄為中心進(jìn)行知識管理； 添加附件與筆記； 自

3、動為論文添加參考文獻(xiàn)； 根據(jù)投稿期刊的要求自動改變參考文獻(xiàn)格式。 國內(nèi)的Noteexpress即是此類軟件的代表。,8,二、文獻(xiàn)管理軟件類型,網(wǎng)絡(luò)版文獻(xiàn)管理軟件 或稱團(tuán)隊(duì)版文獻(xiàn)管理軟件，是在個人版文獻(xiàn)管理軟件的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的，不僅具備個人版文獻(xiàn)管理軟件的核心功能，還可以建立群組，與群組成員共享科研資料，實(shí)時交流，督促學(xué)習(xí)，實(shí)現(xiàn)團(tuán)隊(duì)合作。NoteFirst是此類軟件的代表。,9,三、NoteExpress文獻(xiàn)管理軟件/CompanyWeb/,10,NE下載頁面,11,NoteExpress 核心功能,1. 建立并管理個人專題數(shù)據(jù)庫 按課題建立專題數(shù)據(jù)庫，

4、收集多種途徑獲取的相關(guān)文獻(xiàn) 以題錄為核心，全面管理文獻(xiàn) 附件功能 筆記功能 2. 撰寫論文的好幫手 撰寫論文時，可以隨時從Word文檔中調(diào)閱、檢索相關(guān)文獻(xiàn)，并將重要的文獻(xiàn)自動按照期刊要求的格式，放在正在撰寫論文的參考文獻(xiàn)處 撰寫論文時，可以很快地找到相關(guān)的圖片、表格，將其按照期刊要求的格式插入論文相應(yīng)的位置 修改論文時，可自動重新對參考文獻(xiàn)排序 在轉(zhuǎn)投其他期刊時，可以很快將論文格式轉(zhuǎn)換成轉(zhuǎn)投其他期刊的格式,12,案例：想寫一篇“碳納米管應(yīng)用于腫瘤方面”的綜述如何利用NoteExpress軟件收集資料并輔助論文寫作？,1. 打開NoteExpress軟件，建立“碳納米管”專題數(shù)據(jù)庫 2. 收集相

5、關(guān)文獻(xiàn) 3. 文獻(xiàn)管理 4. 添加附件與筆記 5. 確立核心期刊、作者 6. 輔助撰寫論文,13,（一） 啟動NE,新建一數(shù)據(jù)庫,14,新建空白數(shù)據(jù)庫,15,（二）. 收集文獻(xiàn)，建立專題數(shù)據(jù)庫,數(shù)據(jù)庫檢索后批量導(dǎo)入 記錄導(dǎo)入NE時須選擇匹配的過濾器 一般外文數(shù)據(jù)庫保存題錄時，請選擇輸出格式為RIS、Refman或Endnote 在線聯(lián)機(jī)檢索 手工錄入 將Endnote等其它文獻(xiàn)管理軟件建立的數(shù)據(jù)庫文獻(xiàn)導(dǎo)入,16,Q：如何將常見中外文數(shù)據(jù)庫有關(guān)“碳納米管與腫瘤”的文獻(xiàn)全部存入Noteexpress專題數(shù)據(jù)庫？,舉例 中國學(xué)術(shù)期刊網(wǎng)絡(luò)出版總庫（中文多學(xué)科） 萬方數(shù)據(jù)知識服務(wù)平臺（中文多學(xué)科） Pu

6、bmed（外文，生命科學(xué)） WOS(外文，多學(xué)科，高質(zhì)量）,17,1. 中國學(xué)術(shù)期刊相關(guān)文獻(xiàn)存入NE,（1）利用NoteExpress在線檢索功能直接檢索 Tips: 校園網(wǎng)用戶可直接下載選定文獻(xiàn)全文 （2）利用CNKI檢索相關(guān)文獻(xiàn)，在檢索結(jié)果界面直接導(dǎo)入NoteExpress CNKI主頁基本檢索功能所獲檢索結(jié)果導(dǎo)入NE時，CNKI導(dǎo)出格式可選擇“Noteexpress”，NE導(dǎo)入時過濾器可選擇“Noteexpress” CNKI期刊高級檢索功能所獲檢索結(jié)果導(dǎo)入NE時，CNKI導(dǎo)出格式可選擇“自定義”，NE導(dǎo)入時過濾器可選擇“CNKI-Export（Custom)”,18,(1) NE直接檢

7、索CNKI(I),訪問路徑：“檢索” “在線檢索” “選擇在線數(shù)據(jù)庫” “CNKI中國知網(wǎng)-期刊” ”確定“,19,(1) NE直接檢索CNKI(II),系統(tǒng)自動勾選前50條記錄，可點(diǎn)擊“勾選題錄”功能鍵調(diào)整勾選記錄,限制近5年文獻(xiàn)方法：“期刊年限從”字段輸入“2009”,20,(1) NE直接檢索CNKI(III),列表表頭,數(shù)據(jù)庫記錄數(shù),21,下載CNKI全文（須校園網(wǎng)用戶）,選定文獻(xiàn)后，“檢索” “下載全文” “選擇全文數(shù)據(jù)庫” “從“CNKI-中國知網(wǎng)（IP登陸）”下載” “確定”,22,全文下載界面,23,(2)CNKI學(xué)術(shù)期刊（高級檢索）檢索結(jié)果導(dǎo)入NE(I),檢索并選擇文獻(xiàn)后，點(diǎn)

8、擊“導(dǎo)出/參考文獻(xiàn)”,24,(2)CNKI學(xué)術(shù)期刊（高級檢索）檢索結(jié)果導(dǎo)入NE(II),選擇文獻(xiàn)后點(diǎn)擊“導(dǎo)出/參考文獻(xiàn)”,25,(2)CNKI學(xué)術(shù)期刊（高級檢索）檢索結(jié)果導(dǎo)入NE(III),路徑：“自定義” “全選” “導(dǎo)出”,CNKI學(xué)術(shù)期刊（高級檢索）結(jié)果導(dǎo)出時如果選擇“自定義”格式后選擇全部字段，導(dǎo)入NE后引文有頁碼，如果選擇“NoteExpress”格式，導(dǎo)入NE時引文沒頁碼,26,(2)CNKI學(xué)術(shù)期刊檢索結(jié)果導(dǎo)入NE(IV),進(jìn)入NE界面，點(diǎn)擊“文件” “導(dǎo)入題錄”，將檢索結(jié)果導(dǎo)入NE時，須將過濾器設(shè)置為“CNKI-Export(Custom)”,27,2. 萬方數(shù)據(jù)文獻(xiàn)存入NE,

9、（1）利用NoteExpress在線檢索功能直接檢索 （2）利用萬方檢索相關(guān)文獻(xiàn)存盤后，利用NoteExpress導(dǎo)入功能導(dǎo)入NE 萬方檢索結(jié)果界面只能單篇選擇文獻(xiàn)并導(dǎo)出 在萬方主頁利用基本檢索功能得到的檢索結(jié)果導(dǎo)入NE時，過濾器為“Noteexpress”,28,萬方檢索結(jié)果導(dǎo)入NE（I）,在萬方主頁輸入提問詞，點(diǎn)擊“檢索論文”檢索，在檢索結(jié)果界面將“起始年-結(jié)束年”限定在“2009-2014”后點(diǎn)擊“在結(jié)果中檢索”，獲取近5年文獻(xiàn)，閱讀每篇文獻(xiàn)，在滿意文獻(xiàn)下點(diǎn)擊“導(dǎo)出”,29,萬方檢索結(jié)果導(dǎo)入NE（II）,路徑“NoteExpress” ”導(dǎo)出”,30,萬方檢索結(jié)果導(dǎo)入NE（III）,進(jìn)入

10、NE界面，點(diǎn)擊“文件” “導(dǎo)入題錄”，將檢索結(jié)果導(dǎo)入NE時，須將過濾器設(shè)置為“NoteExpress”,31,3. Pubmed檢索結(jié)果導(dǎo)入NE,Pubmed檢索時瀏覽器須為IE8以上版本 Pubmed文獻(xiàn)輸出時須選擇“MEDLINE”格式 NE導(dǎo)入時過濾器選擇為“Pubmed”,32,Pubmed檢索結(jié)果導(dǎo)入NE（I）,在Pubmed主頁檢索文獻(xiàn)后，將Publication dates限制為“5 years點(diǎn)擊“Send to”，Choose Destination選擇為“citation manager”，后點(diǎn)擊”Create File”,33,Pubmed檢索結(jié)果導(dǎo)入NE（II）,Pub

11、med檢索結(jié)果導(dǎo)入NE時，過濾器須選擇為“Pubmed”,34,4. WOS檢索結(jié)果導(dǎo)入NE,WOS檢索結(jié)果輸出時選擇“endnote”或者“其他參考文獻(xiàn)格式” 導(dǎo)入NE時選擇“Web of Science”過濾器,35,4. WOS檢索結(jié)果導(dǎo)入NE：檢索文獻(xiàn),36,4. WOS檢索結(jié)果導(dǎo)入NE：選擇文獻(xiàn),利用WOS檢索文獻(xiàn)后，在檢索結(jié)果界面選擇“保存至Endnote，在彈出框中選擇記錄數(shù)與記錄內(nèi)容后點(diǎn)擊“發(fā)送”,37,4. WOS檢索結(jié)果導(dǎo)入NE：在NE中導(dǎo)入題錄,WOS檢索結(jié)果導(dǎo)入NE時，過濾器須選擇為“Web of Science”,38,5. EV檢索結(jié)果導(dǎo)入NE,EV檢索文獻(xiàn)后，選擇

12、記錄并點(diǎn)擊”Download”, 存盤格式選擇“RIS,Endnote,ProCite,Reference Manager” EV檢索結(jié)果導(dǎo)入NE時，過濾器選擇為 “RefMan-(RIS)”,39,5. EV檢索結(jié)果導(dǎo)入NE,EV檢索并選擇文獻(xiàn)后，點(diǎn)擊“Download”,40,EV檢索結(jié)果存盤時文件格式選擇為”RIS,Endnote,ProCite,Reference Manager”,41,EV檢索結(jié)果導(dǎo)入NE時過濾器選擇為“RefMan-(RIS)”,42,6. 手工錄入,路徑：題錄新建題錄 在新建題錄界面輸入記錄各項(xiàng)信息后點(diǎn)擊“文件”后選擇“保存并關(guān)閉”,43,NoteExpress

13、手工錄入題錄界面,多個作者輸入時須分行,44,（三）. 文獻(xiàn)管理,題錄數(shù)據(jù)庫組織管理包括分類、去重、排 序、檢索、文獻(xiàn)的閱讀狀態(tài)標(biāo)記等,45,題錄數(shù)據(jù)庫組織管理的分類,通過建立樹形結(jié)構(gòu)目錄，可以輕松建立多個層次文件夾,在文件夾處單擊鼠標(biāo)右鍵，可對文件夾進(jìn)行管理,46,未去重前的NE數(shù)據(jù)庫,去重前專題數(shù)據(jù)庫總記錄數(shù)(2090),部分重復(fù)記錄,47,題錄數(shù)據(jù)庫的去重（I）,操作步驟 “題錄”-“全部選擇” “檢索”-“查找重復(fù)題錄” 在“查找重復(fù)題錄”界面設(shè)定待查文件夾及待查重字段后，點(diǎn)擊“查找”,48,題錄數(shù)據(jù)庫的去重（II）,查找重復(fù)題錄后點(diǎn)擊“題錄”-“從所有文件夾中刪除”并確認(rèn),本例中共找

14、到有重復(fù)的題錄數(shù)為1065，其中可刪除題錄數(shù)為583條,49,重復(fù)題錄中保存下來的記錄,保存下來的重復(fù)記錄數(shù),50,去重后的專題數(shù)據(jù)庫,點(diǎn)擊“題錄”文件夾，返回去重后的專題數(shù)據(jù)庫,51,題錄數(shù)據(jù)庫的排序及檢索,52,自定義NE表頭,53,設(shè)置指定題錄的優(yōu)先級,選定題錄后點(diǎn)擊鼠標(biāo)右鍵，為題錄設(shè)置優(yōu)先級,題錄的優(yōu)先級顯示,54,設(shè)置指定題錄的標(biāo)簽,55,按標(biāo)簽查找相關(guān)文獻(xiàn),點(diǎn)擊標(biāo)簽，獲取所有相關(guān)標(biāo)簽文獻(xiàn),56,（四） 為題錄添加附件與筆記,NoteExpress支持為題錄添加全文、MP3、圖片、視頻等多種格式文件附件 支持在閱讀文獻(xiàn)過程中隨時寫下筆記,57,為指定題錄添加附件,58,在文獻(xiàn)閱讀過程

15、中作筆記,此處兩個方塊代表此文獻(xiàn)有附件及筆記,點(diǎn)擊“筆記”后，在下方文本框添加筆記,寫完筆記后點(diǎn)此存盤,59,（五）文獻(xiàn)信息統(tǒng)計(jì),NE提供了基本的統(tǒng)計(jì)功能，可以方便地獲取某一專題的核心作者、核心期刊、論文數(shù)量發(fā)展趨勢等信息。 如果需要對某個虛擬文件夾進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，右擊該文件夾，從列表中選擇“文件夾信息統(tǒng)計(jì)”。在彈出查看中，選擇需要統(tǒng)計(jì)的字段進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，NE將會推送相應(yīng)的統(tǒng)計(jì)結(jié)果（統(tǒng)計(jì)結(jié)果可輸出另存）。,60,文件夾信息統(tǒng)計(jì),61,按作者統(tǒng)計(jì)，獲取本專題核心作者,62,按期刊統(tǒng)計(jì)，獲取本專題核心期刊,63,（六） 輔助撰寫論文,撰寫論文時，可以隨時從Word文檔中調(diào)閱、檢索相關(guān)文獻(xiàn)，并將重要的文獻(xiàn)自動

16、按照期刊要求的格式，放在正在撰寫論文的參考文獻(xiàn)處。 撰寫論文時，可以很快地找到相關(guān)的圖片、表格，按照期刊要求的格式插入論文相應(yīng)的位置。 修改論文時，可自動重新對參考文獻(xiàn)排序。 在轉(zhuǎn)投其他期刊時，可以很快將論文格式轉(zhuǎn)換成轉(zhuǎn)投其他期刊的格式,64,在寫作時插入?yún)⒖嘉墨I(xiàn),NoteExpress快捷鍵,“Numbered(Multilingual)”（順序編碼制）參考文獻(xiàn)格式,65,自動轉(zhuǎn)換參考文獻(xiàn)格式(1),66,自動轉(zhuǎn)換參考文獻(xiàn)格式(2),“Author-Data(Multilingual)”（著者-出版年制）參考文獻(xiàn)格式,67,選擇更多參考文獻(xiàn)格式,68,中華腫瘤雜志參考文獻(xiàn)格式,69,Note

17、Express快捷鍵,轉(zhuǎn)到NoteExpress 在數(shù)據(jù)庫中檢索 插入引文 插入注釋 插入筆記 格式化參考文獻(xiàn) 編輯引文,定位引文 查找引文 去除格式化 更新題錄信息 設(shè)置 排列窗口位置 NoteExpress幫助,1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14,70,NE使用中常見問題及解決方案,（一）數(shù)據(jù)庫下載記錄無法導(dǎo)入NE 數(shù)據(jù)庫下載記錄要順利導(dǎo)入NE，數(shù)據(jù)庫下載文件格式必須與NE導(dǎo)入時選擇的過濾器格式匹配，如果不能導(dǎo)入，很可能是文件格式與過濾器不匹配。試著更改文件格式或者過濾器格式至兩者匹配。 （二）外文數(shù)據(jù)庫文件下載時沒有NE文件管理軟件格式怎么辦？ 沒關(guān)系，就選

18、或者外文數(shù)據(jù)庫文件下載處的第一個文件管理軟件格式，在導(dǎo)入NE時選擇匹配的過濾器即可。,71,NE使用中常見問題及解決方案,（三）無法直接下載全文 原因主要有3點(diǎn)：A. 沒有全文下載權(quán)限，例如不是校園網(wǎng)用戶；B. 有全文下載權(quán)限，例如是校園網(wǎng)用戶，但一次下載文獻(xiàn)量過多，如上百篇；C. 數(shù)據(jù)庫原因。碰到這種情況最好是不利用NE的下載全文功能，而是去訪問CNKI等數(shù)據(jù)庫，利用數(shù)據(jù)庫下載全文以后再將全文作為NE相關(guān)題錄的附件添加。,72,NE使用中常見問題及解決方案,（四）安裝NE后，文字處理軟件沒有出現(xiàn)NE工具欄 這是NE安裝過程中，文字處理軟件沒有自動加載NE工具欄，需要手工加載。不同版本文字處理軟件加載方法不同：,73,Word2003手動加載NE工具條的方法,若NoteExpres