配體受體結(jié)合ppt課件

1、配體受體結(jié)合1;.2配體受體結(jié)合函數(shù)配體受體結(jié)合函數(shù)配體配體 - 受體結(jié)合模型受體結(jié)合模型溶劑對配體受體結(jié)合的影響溶劑對配體受體結(jié)合的影響物理性質(zhì)決定的配體物理性質(zhì)決定的配體 - 受體結(jié)合受體結(jié)合 目目 錄錄3通則通則回目錄配體配體受體在活體內(nèi)的交互取決于大量的多樣的因素受體在活體內(nèi)的交互取決于大量的多樣的因素。一旦配體和受體足夠接近,配體可以分散和到達(dá)到對應(yīng)受體的結(jié)合位點。這需要配體和受體之間的識別。這可能是由配體和受體之間的長程靜電相互作用,然后由短程氫鍵和范德華相互作用。這些相互作用廣泛變化。水分子將被綁定取代，雖然有些可能留存在表面和居中綁定影響。4配體L和受體R：結(jié)合過程對應(yīng)的處理確

2、定所述雙分子締合速率常數(shù)，導(dǎo)通率，Kon。在解除綁定過程決定了雙分子解離速率常數(shù)，解離速率，Koff。配體受體結(jié)合函數(shù)配體受體結(jié)合函數(shù)回目錄5系統(tǒng)的受體配體結(jié)合。 （a）在鎖和鑰匙模型中，配體（綠色）恰好裝配到受體結(jié)合位點（紫色）。 （b）該配體與受體弱相關(guān)聯(lián)和誘導(dǎo)產(chǎn)生的結(jié)合構(gòu)象變化。（c）配體優(yōu)先結(jié)合于該受體的某些一致構(gòu)象。實施方法實施方法回目錄6在配體在配體 - 受體結(jié)合的第一種模型，埃米爾受體結(jié)合的第一種模型，埃米爾菲舍爾提出，受體和配體組合在一起就像鎖菲舍爾提出，受體和配體組合在一起就像鎖和鑰匙和鑰匙.在這個比喻中，可以方便的觀看鎖和鑰匙之間的區(qū)別。然而，在鎖和鑰匙的畫在這個比喻中，可

3、以方便的觀看鎖和鑰匙之間的區(qū)別。然而，在鎖和鑰匙的畫面，受體和配體是剛性的實體。在現(xiàn)實中，結(jié)合是伴隨某種程度的構(gòu)象變化的。這可面，受體和配體是剛性的實體。在現(xiàn)實中，結(jié)合是伴隨某種程度的構(gòu)象變化的。這可以在以在“拉鏈拉鏈”或者或者“手到手套手到手套”的類比來形容受體的類比來形容受體 - 配體相互作用。構(gòu)象變化可以被配體相互作用。構(gòu)象變化可以被認(rèn)為是一種由于結(jié)合不同優(yōu)勢構(gòu)象的誘導(dǎo)契合。構(gòu)象選擇合奏分子中的結(jié)合和未結(jié)合認(rèn)為是一種由于結(jié)合不同優(yōu)勢構(gòu)象的誘導(dǎo)契合。構(gòu)象選擇合奏分子中的結(jié)合和未結(jié)合狀態(tài)或兩者的組合。一些結(jié)合模型都是在藥物設(shè)計特別感興趣的。狀態(tài)或兩者的組合。一些結(jié)合模型都是在藥物設(shè)計特別感興

4、趣的。配體 - 受體結(jié)合模型回目錄7溶劑周圍的配體和受體對它們的結(jié)合有非常重要的影響。與像甲醇或脂質(zhì)膜的疏水性內(nèi)部非極性環(huán)境相比在像水的極性溶劑中結(jié)合親和力非常不同。這是因為結(jié)合總是涉及配體 - 受體相互作用和配體 - 溶劑和受體 - 溶劑相互作用之間的競爭。周圍的離子強(qiáng)度和pH會影響配體和受體之間的靜電相互作用的強(qiáng)度。Viscogens和擁擠代理也可以影響配體 - 受體結(jié)合。它們可通過它們的粘度影響結(jié)合親和力或通過動力學(xué)改變介電性能。溶劑對配體受體結(jié)合的影響溶劑對配體受體結(jié)合的影響回目錄8配體 - 受體結(jié)合包括通過配體置換的配體 - 水分子和受體水分子的相互作用受體和水與水的相互作用。范德華

5、相互作用貢獻(xiàn)毫不遜色于配體 - 受體親和力。物理性質(zhì)作用的配體物理性質(zhì)作用的配體 - 受體結(jié)合受體結(jié)合9受體 - 配體絡(luò)合中的水。 （a）主要尿蛋白-I（MUP-I）與結(jié)合的配體（PDB代碼1I06）。兩水域（紫色球）的配體結(jié)合囊（表面表示）的疏水性環(huán)境使得極性基團(tuán)的相互作用呈現(xiàn)在親脂性信息素上（棒表示）。 （b）該周質(zhì)的復(fù)雜寡肽結(jié)合蛋白與OPPA肽（LysGluLys）（PDB代碼1JEU）。蛋白質(zhì)的唯一活性中心殘基如圖（棒表示）。水分子（紫色球）調(diào)解它的肽配體之間的相互作用（周質(zhì)寡肽結(jié)合蛋白）。 （c）蛋白激酶C的相互作用蛋白（PKCI）二聚物（PDB代碼1KPA）具有干燥表面與大多數(shù)晶體

6、觀察水分子（紫色球）形成的界面周圍的環(huán)。10在晶體結(jié)構(gòu)中學(xué)習(xí)配體 - 受體表面的包裝方式和水合模式。一些界面是很好填充水分子（例如，見，圖c）。有序界面水分子位點往往在既定位置上，水分子可以調(diào)節(jié)受體和配體之間的氫鍵（圖b）。特別有序水分子位點有時被認(rèn)為是溶質(zhì)的固有部分。界面水分子位點可以改變一個結(jié)合位點的特異性，因為它們有能力接受和捐贈達(dá)四個氫鍵。如示于（圖a）的例子中，界面的水分子可允許相當(dāng)疏水受體位點與配體相互作用并適應(yīng)其氫鍵的能力。11 靜電相互作用在配體 - 受體結(jié)合發(fā)揮一個顯著的作用。它們是長程、隨距離變化的為 ，因此特別重要對于分子識別。在整個分子中的電荷分布，每個分子可被認(rèn)為具有不僅一個凈電荷。在配體 - 受體模型研究中，局部電荷通常分配到原子中心。相同電荷排斥和不同電荷相吸。因此，許多積極和消極的方面構(gòu)成一個庫侖靜電能量配體 - 受體復(fù)合物，下式給出：1r12其中，0是自由空間的介電常數(shù)，為周圍介質(zhì)的相對介電常數(shù)，并且QL和QR是局部原子點電荷的配體和受體。庫侖定律適用于均勻電介質(zhì)。如果該系統(tǒng)的所有的原子都明確建模，包括溶劑中所有