第7章 蛋白質(zhì)組學(xué)

1、 蛋白質(zhì)組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)及其研究進(jìn)展 蛋白質(zhì)組學(xué)的含義蛋白質(zhì)組學(xué)的含義 蛋白質(zhì)組學(xué)研究的內(nèi)容蛋白質(zhì)組學(xué)研究的內(nèi)容 蛋白質(zhì)組學(xué)研究的手段蛋白質(zhì)組學(xué)研究的手段 蛋白質(zhì)組信息學(xué)蛋白質(zhì)組信息學(xué) 差異蛋白質(zhì)組學(xué)差異蛋白質(zhì)組學(xué) 蛋白質(zhì)組研究意義及前景蛋白質(zhì)組研究意義及前景什么是蛋白質(zhì)？蛋白質(zhì)是一種復(fù)雜的有機生物大分子，它們是生命活動的實際執(zhí)行者。 幾乎所有的生物催化劑-酶，都是蛋白質(zhì)。構(gòu)成細(xì)胞骨架和動物大部分結(jié)構(gòu)的纖維物質(zhì)也是蛋白質(zhì);膠原蛋白和角蛋白組成了皮膚，毛發(fā)和軟骨；肌肉大部分也是由蛋白質(zhì)組成。蛋白質(zhì)由一個一個的氨基酸首尾相接形成肽鏈，肽鏈再折疊形成一定空間結(jié)構(gòu)。什么是蛋白質(zhì)組？熒光染色的細(xì)

2、胞內(nèi)蛋白質(zhì) 生命現(xiàn)象的物質(zhì)基礎(chǔ)是核酸和蛋白質(zhì)，作為基因的載 體，核酸編制了所有的信息，而基因的表達(dá)產(chǎn)物蛋白 質(zhì)，才是各種生物功能的執(zhí)行者。蛋白質(zhì)組是功能基因組的新前沿，對基因表達(dá)的時空規(guī)律進(jìn)行揭示，比較了不同生理條件下或不同發(fā)育時期的功能蛋白質(zhì)組的差別和多樣性（mRNA剪切的結(jié)果或翻譯后加工的結(jié)果），才能在分子水平上全面、具體了解生命活動的過程，為個種生物學(xué)特征和生產(chǎn)應(yīng)用提供理論基礎(chǔ)。 基因疾病環(huán)境基因組和蛋白質(zhì)組到底有什么聯(lián)系？ 我們可以這樣理解生命，遺傳信息從DNA（基因）轉(zhuǎn)變?yōu)橐环N被稱作mRNA的中間轉(zhuǎn)載體，然后再合成各式各樣的結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)和功能蛋白質(zhì)，構(gòu)成一種有機體，完成生命的功能?；?/p>

3、 mRNA蛋白質(zhì)，三位一體，構(gòu)成了遺傳信息的流程圖，這即是傳統(tǒng)的中心法則。 現(xiàn)在已經(jīng)證明，一個基因并不只存在一個相應(yīng)的蛋白質(zhì)，可能會有幾個，甚至幾十個。什么情況下會有什么樣的蛋白，這不僅決定于基因，還與機體所處的周圍環(huán)境以及機體本身的生理狀態(tài)有關(guān)。蛋白質(zhì)組研究對我們有什么益處 蛋白質(zhì)組的研究能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質(zhì)組比較分析，我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”，它們可成為新藥物設(shè)計的分子靶點，或者也會為疾病的早期診斷提供分子標(biāo)志。牛胰島素晶體圖片牛胰島素晶體圖片蛋白質(zhì)組學(xué)的含義 蛋白質(zhì)組蛋白質(zhì)組(Proteome)(Pro

4、teome)一詞最早由澳大利亞學(xué)一詞最早由澳大利亞學(xué)者者 等于等于19941994年提出年提出, ,指的是由一指的是由一個基因組個基因組geneomegeneome或一個細(xì)胞、組織表達(dá)的所有或一個細(xì)胞、組織表達(dá)的所有proteinprotein。蛋白質(zhì)組學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)(proteomics)是在蛋白質(zhì)水是在蛋白質(zhì)水平上定量、動態(tài)、整體性地研究生物體。是整體平上定量、動態(tài)、整體性地研究生物體。是整體上研究細(xì)胞或組織內(nèi)，特定的時間和空間內(nèi)全部上研究細(xì)胞或組織內(nèi)，特定的時間和空間內(nèi)全部蛋白質(zhì)的組成及相互作用規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)的組成及相互作用規(guī)律的科學(xué)。 同基因組學(xué)一樣同基因組

5、學(xué)一樣, ,蛋白質(zhì)組學(xué)不是一個封閉的、蛋白質(zhì)組學(xué)不是一個封閉的、概念化的、穩(wěn)定的知識體系概念化的、穩(wěn)定的知識體系, ,而是一個領(lǐng)域。它旨而是一個領(lǐng)域。它旨在闡明生物體全部蛋白質(zhì)的表達(dá)模式及功能模式在闡明生物體全部蛋白質(zhì)的表達(dá)模式及功能模式, ,其內(nèi)容包括蛋白質(zhì)的定性鑒定、定量檢測、細(xì)胞其內(nèi)容包括蛋白質(zhì)的定性鑒定、定量檢測、細(xì)胞內(nèi)定位、相互作用研究等內(nèi)定位、相互作用研究等, ,最終揭示蛋白質(zhì)功能最終揭示蛋白質(zhì)功能, ,是基因組序列與基因功能之間的橋梁。是基因組序列與基因功能之間的橋梁。 結(jié)構(gòu)基因組功能基因組結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)組功能蛋白質(zhì)組蛋白質(zhì)組研究不同于基因組研究相對獨立緊密連接 蛋白質(zhì)組學(xué)研究的內(nèi)容

6、蛋白質(zhì)組學(xué)研究的內(nèi)容蛋白質(zhì)表達(dá)模式蛋白質(zhì)表達(dá)模式( (或蛋白質(zhì)組組成或蛋白質(zhì)組組成) )的研究的研究 蛋白質(zhì)組組成的分析鑒定是蛋白質(zhì)組學(xué)中的與蛋白質(zhì)組組成的分析鑒定是蛋白質(zhì)組學(xué)中的與基因組學(xué)相對應(yīng)的主要內(nèi)容。它要求對蛋白質(zhì)組進(jìn)行基因組學(xué)相對應(yīng)的主要內(nèi)容。它要求對蛋白質(zhì)組進(jìn)行表征表征, ,即實現(xiàn)所有蛋白質(zhì)的分離、鑒定及其圖譜化。即實現(xiàn)所有蛋白質(zhì)的分離、鑒定及其圖譜化。雙向凝膠電泳雙向凝膠電泳(2-(2-D) )和質(zhì)譜和質(zhì)譜( (Mass spectrometry) )技技術(shù)是當(dāng)前分離鑒定蛋白質(zhì)的兩大支柱技術(shù)術(shù)是當(dāng)前分離鑒定蛋白質(zhì)的兩大支柱技術(shù) 蛋白質(zhì)組功能模式(目前主要集中在蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)關(guān)

7、系)的研究動物模型/細(xì)胞蛋白質(zhì)組研究蛋白質(zhì)組研究生物信息學(xué)分析功能分析人類疾病蛋白質(zhì)組新技術(shù)蛋白質(zhì)組研究的策略：平臺與整合原核及簡單真核生物的蛋白質(zhì)組研究 流感嗜血桿菌的蛋白質(zhì)組研究流感嗜血桿菌的蛋白質(zhì)組研究 大腸桿菌的蛋白質(zhì)組研究大腸桿菌的蛋白質(zhì)組研究 致病微生物的蛋白質(zhì)組研究致病微生物的蛋白質(zhì)組研究 釀酒酵母的蛋白質(zhì)組研究釀酒酵母的蛋白質(zhì)組研究 流感嗜血桿菌流感嗜血桿菌(Hae mophilus influenzae)(Hae mophilus influenzae)是第是第一個獲得基因組全序列的生物一個獲得基因組全序列的生物. .瑞士的一個小組通過瑞士的一個小組通過2-DPAGE2-DP

8、AGE研究了流感嗜血桿菌的蛋白質(zhì)組分研究了流感嗜血桿菌的蛋白質(zhì)組分, ,在在3-3-1010的范圍內(nèi)鑒定了約的范圍內(nèi)鑒定了約300300個蛋白質(zhì)組分個蛋白質(zhì)組分, ,然后用有兩個然后用有兩個尿素濃度的麥黃酮尿素濃度的麥黃酮(tricine)(tricine)膠分離了很難分離到的膠分離了很難分離到的5-20ku5-20ku范圍內(nèi)的蛋白質(zhì)范圍內(nèi)的蛋白質(zhì), ,還鑒定了其中的還鑒定了其中的8080種種. .另外用另外用肝素親和層析將堿性蛋白質(zhì)富集后肝素親和層析將堿性蛋白質(zhì)富集后, ,在在6-116-11的范的范圍內(nèi)又鑒定了圍內(nèi)又鑒定了102102個蛋白質(zhì)個蛋白質(zhì), ,其中許多是核酸結(jié)合蛋白其中許多是核

9、酸結(jié)合蛋白尤其是核糖體蛋白尤其是核糖體蛋白. .流感嗜血桿菌的蛋白質(zhì)組研究流感嗜血桿菌的蛋白質(zhì)組研究 華盛頓大學(xué)的另一個小組將雙向電華盛頓大學(xué)的另一個小組將雙向電泳得到的流感嗜血桿菌泳得到的流感嗜血桿菌303個蛋白質(zhì)斑點個蛋白質(zhì)斑點進(jìn)行質(zhì)譜分析進(jìn)行質(zhì)譜分析,確定了確定了263個蛋白質(zhì)個蛋白質(zhì),其中其中大部分是外膜蛋白大部分是外膜蛋白,以及與能量代謝和大以及與能量代謝和大分子合成相關(guān)的蛋白質(zhì)分子合成相關(guān)的蛋白質(zhì).另外發(fā)現(xiàn)了幾種另外發(fā)現(xiàn)了幾種不能在基因組中找到對應(yīng)序列的蛋白質(zhì)不能在基因組中找到對應(yīng)序列的蛋白質(zhì).令人驚奇的是令人驚奇的是,大約大約22%的被鑒定了的蛋的被鑒定了的蛋白質(zhì)表現(xiàn)出與預(yù)計不同

10、的等電點與分子白質(zhì)表現(xiàn)出與預(yù)計不同的等電點與分子質(zhì)量質(zhì)量,顯示它們可能經(jīng)過了翻譯后加工顯示它們可能經(jīng)過了翻譯后加工. 大腸桿菌全部大腸桿菌全部40004000多個基因的序列已被多個基因的序列已被測定測定, ,人們想到如果把雙向電泳得到的蛋白質(zhì)譜與人們想到如果把雙向電泳得到的蛋白質(zhì)譜與基因組分析結(jié)果聯(lián)合起來基因組分析結(jié)果聯(lián)合起來, ,就會得到更多有用的信就會得到更多有用的信息息. .基于此想法基于此想法, ,建立蛋白質(zhì)建立蛋白質(zhì) 基因聯(lián)合數(shù)據(jù)庫基因聯(lián)合數(shù)據(jù)庫, ,希望希望籍此來回答以下幾方面的問題籍此來回答以下幾方面的問題: : 所有編碼基因的所有編碼基因的產(chǎn)物在雙向圖譜上的位置產(chǎn)物在雙向圖譜上

11、的位置, , 各種蛋白質(zhì)的豐度各種蛋白質(zhì)的豐度, , 不同條件下各種蛋白質(zhì)表達(dá)水平及合成速率的不同條件下各種蛋白質(zhì)表達(dá)水平及合成速率的變化變化, , 各種蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的定位各種蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的定位, , 某些蛋白某些蛋白質(zhì)翻譯后修飾的方式及水平質(zhì)翻譯后修飾的方式及水平. .大腸桿菌的蛋白質(zhì)組研究大腸桿菌的蛋白質(zhì)組研究 目前目前,大腸桿菌的聯(lián)合數(shù)據(jù)庫已更新到第大腸桿菌的聯(lián)合數(shù)據(jù)庫已更新到第六版六版,大約包括大約包括1600個蛋白質(zhì)斑點的數(shù)據(jù)個蛋白質(zhì)斑點的數(shù)據(jù),其中其中大約大約400個蛋白質(zhì)斑點已與大約個蛋白質(zhì)斑點已與大約350個基因相對個基因相對應(yīng)應(yīng)(有些基因可能有多個蛋白質(zhì)產(chǎn)物有些基因可能有

12、多個蛋白質(zhì)產(chǎn)物),對于這些對于這些蛋白質(zhì)蛋白質(zhì),這個數(shù)據(jù)庫可以提供這個數(shù)據(jù)庫可以提供基因名稱、蛋白質(zhì)基因名稱、蛋白質(zhì)名稱、名稱、EC 編號、功能范疇、編號、功能范疇、Swiss-prot數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫編號、編號、enbank序列號、基因圖譜的位置、染序列號、基因圖譜的位置、染色體上的轉(zhuǎn)錄方向以及一些生理信息色體上的轉(zhuǎn)錄方向以及一些生理信息(如在不如在不同生長條件下該蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的豐度同生長條件下該蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)的豐度).蛋白質(zhì)組的一個重要應(yīng)用是在闡明新抗生素作用蛋白質(zhì)組的一個重要應(yīng)用是在闡明新抗生素作用機理的研究上機理的研究上. .當(dāng)今當(dāng)今, ,細(xì)菌對大多數(shù)抗生素都有了抗性細(xì)菌對大多數(shù)抗生素都

13、有了抗性, ,尋找作用于細(xì)菌內(nèi)新的靶子的研究工作已經(jīng)展開尋找作用于細(xì)菌內(nèi)新的靶子的研究工作已經(jīng)展開, ,找找到了許多有效的抗菌化合物到了許多有效的抗菌化合物. .但目前遇到的困難在于但目前遇到的困難在于難以揭示新的化合物的作用靶子及其作用機理難以揭示新的化合物的作用靶子及其作用機理. .有時有時雖在體外發(fā)現(xiàn)新化合物能夠使某種蛋白質(zhì)失活雖在體外發(fā)現(xiàn)新化合物能夠使某種蛋白質(zhì)失活, ,但在但在體內(nèi)是否有這種現(xiàn)象和這是否是抗菌的主要機制仍然體內(nèi)是否有這種現(xiàn)象和這是否是抗菌的主要機制仍然未知未知, ,現(xiàn)在雙向電泳分析提供了一個有效手段現(xiàn)在雙向電泳分析提供了一個有效手段. . 致病微生物的蛋白質(zhì)組研究致病

14、微生物的蛋白質(zhì)組研究 例如在研究抑制核糖體類抗生素對細(xì)菌的作用機例如在研究抑制核糖體類抗生素對細(xì)菌的作用機制時制時, ,對對1212種作用于翻譯過程的不同階段和核糖體內(nèi)不種作用于翻譯過程的不同階段和核糖體內(nèi)不同分子的抗生素加以考察同分子的抗生素加以考察, ,發(fā)現(xiàn)其中發(fā)現(xiàn)其中8 8種誘導(dǎo)冷休克反種誘導(dǎo)冷休克反應(yīng)的一系列蛋白質(zhì)應(yīng)的一系列蛋白質(zhì), ,另另4 4種誘導(dǎo)一系列熱休克反應(yīng)的蛋種誘導(dǎo)一系列熱休克反應(yīng)的蛋白質(zhì)白質(zhì), ,因此預(yù)計新的作用于核糖體的化合物也是誘導(dǎo)這因此預(yù)計新的作用于核糖體的化合物也是誘導(dǎo)這兩種反應(yīng)兩種反應(yīng), ,并且籍此可以推測大腸桿菌對冷熱的反應(yīng)發(fā)并且籍此可以推測大腸桿菌對冷熱的反

15、應(yīng)發(fā)生于核糖體水平上生于核糖體水平上. .蛋白質(zhì)組研究的重要優(yōu)勢在于能夠蛋白質(zhì)組研究的重要優(yōu)勢在于能夠從整體水平上分析不同條件下蛋白質(zhì)譜的變化從整體水平上分析不同條件下蛋白質(zhì)譜的變化. .例如作例如作為一種差異顯示技術(shù)為一種差異顯示技術(shù), ,這一技術(shù)已被用于比較結(jié)核分枝這一技術(shù)已被用于比較結(jié)核分枝桿菌與牛結(jié)核分枝桿菌蛋白的不同桿菌與牛結(jié)核分枝桿菌蛋白的不同, ,結(jié)果發(fā)現(xiàn)一些在基結(jié)果發(fā)現(xiàn)一些在基因水平上很類似的蛋白在蛋白質(zhì)水平上有很大差別因水平上很類似的蛋白在蛋白質(zhì)水平上有很大差別, ,這這可能部分解釋近年來牛痘作為結(jié)核病疫苗會出現(xiàn)失敗可能部分解釋近年來牛痘作為結(jié)核病疫苗會出現(xiàn)失敗的現(xiàn)象的現(xiàn)象

16、。利用雙向電泳技術(shù)分析酵母蛋白譜的工作早于蛋白質(zhì)組利用雙向電泳技術(shù)分析酵母蛋白譜的工作早于蛋白質(zhì)組概念的提出概念的提出. .釀酒酵母釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)(Saccharomyces cerevisiae)基因組基因組的完成及其蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫在互聯(lián)網(wǎng)上的建立的完成及其蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫在互聯(lián)網(wǎng)上的建立, ,大大加速了這大大加速了這一工作一工作. .最新版的數(shù)據(jù)庫包括最新版的數(shù)據(jù)庫包括60006000多頁多頁, ,每頁代表一個已知或每頁代表一個已知或推測的酵母蛋白推測的酵母蛋白. .它包含以下幾方面的信息它包含以下幾方面的信息: : 以序列為基以序列為基礎(chǔ)的已知和推

17、測的酵母蛋白的特征信息礎(chǔ)的已知和推測的酵母蛋白的特征信息, ,如分子質(zhì)量、等電如分子質(zhì)量、等電點、氨基酸組成、多肽片段大小等點、氨基酸組成、多肽片段大小等; ; 一些研究得到的關(guān)于一些研究得到的關(guān)于各種蛋白質(zhì)在翻譯后加工、亞細(xì)胞定位、功能分類方面的信各種蛋白質(zhì)在翻譯后加工、亞細(xì)胞定位、功能分類方面的信息息; ; 從以往的超過從以往的超過50005000篇關(guān)于酵母蛋白研究的文章中獲得篇關(guān)于酵母蛋白研究的文章中獲得的有關(guān)各種蛋白質(zhì)功能、相互作用、突變表型的信息的有關(guān)各種蛋白質(zhì)功能、相互作用、突變表型的信息. .借助借助數(shù)據(jù)庫的有力推動數(shù)據(jù)庫的有力推動, ,在雙向電泳蛋白質(zhì)譜上最明顯的蛋白質(zhì)在雙向電

18、泳蛋白質(zhì)譜上最明顯的蛋白質(zhì)斑點的大部分得到鑒定斑點的大部分得到鑒定. .釀酒酵母的蛋白質(zhì)組研究釀酒酵母的蛋白質(zhì)組研究 正在丹麥進(jìn)行的一項研究計劃分別作出野生正在丹麥進(jìn)行的一項研究計劃分別作出野生型和將基因系統(tǒng)缺失的缺陷型酵母的雙向蛋白質(zhì)型和將基因系統(tǒng)缺失的缺陷型酵母的雙向蛋白質(zhì)圖譜圖譜. .初步的研究表明初步的研究表明, ,缺失單一基因?qū)?dǎo)致的結(jié)缺失單一基因?qū)?dǎo)致的結(jié)果并不只是缺乏此基因編碼的蛋白質(zhì)果并不只是缺乏此基因編碼的蛋白質(zhì), ,而是能導(dǎo)而是能導(dǎo)致其他一系列蛋白質(zhì)量的改變致其他一系列蛋白質(zhì)量的改變. .一些蛋白質(zhì)減少一些蛋白質(zhì)減少而另一些蛋白質(zhì)增多而另一些蛋白質(zhì)增多, ,當(dāng)然還有一些蛋白

19、質(zhì)被加當(dāng)然還有一些蛋白質(zhì)被加工修飾而導(dǎo)致性狀改變工修飾而導(dǎo)致性狀改變. . 單一基因缺失的結(jié)果總是引起蛋白質(zhì)組全單一基因缺失的結(jié)果總是引起蛋白質(zhì)組全局性的變化局性的變化. .大約大約20%20%的酵母基因缺失是致死性的酵母基因缺失是致死性的的, ,另外另外80%80%則不然則不然, ,這時機體能通過調(diào)節(jié)蛋白這時機體能通過調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的表達(dá)來對抗這種內(nèi)源性的變化質(zhì)的表達(dá)來對抗這種內(nèi)源性的變化. .這種基這種基 因因缺失的研究可能會告訴我們一些關(guān)于缺失的研究可能會告訴我們一些關(guān)于細(xì)胞內(nèi)蛋細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)分子間相互白質(zhì)分子間相互“對話對話”和和“作用作用”的重要信的重要信息息, ,如蛋白質(zhì)間的物理聯(lián)系如蛋

20、白質(zhì)間的物理聯(lián)系( (這些蛋白質(zhì)可能會這些蛋白質(zhì)可能會組成蛋白質(zhì)復(fù)合物組成蛋白質(zhì)復(fù)合物) )、信號傳遞途徑、信號傳遞途徑, ,以幫助我以幫助我們了解細(xì)胞是如何構(gòu)成的以及是如何協(xié)同工作們了解細(xì)胞是如何構(gòu)成的以及是如何協(xié)同工作的。的。 多細(xì)胞真核生物的蛋白質(zhì)組研究多細(xì)胞真核生物的蛋白質(zhì)組研究 線蟲的蛋白質(zhì)組研究線蟲的蛋白質(zhì)組研究 果蠅的蛋白質(zhì)組研究果蠅的蛋白質(zhì)組研究 人類的蛋白質(zhì)組研究人類的蛋白質(zhì)組研究 植物的蛋白質(zhì)組研究植物的蛋白質(zhì)組研究 利用雙向電泳技術(shù)利用雙向電泳技術(shù), ,iniini對線蟲對線蟲( (.elegans).elegans)進(jìn)行了蛋白質(zhì)組分析進(jìn)行了蛋白質(zhì)組分析, ,在等電點在等

21、電點3.5-93.5-9和分子質(zhì)量和分子質(zhì)量10-200k10-200k的范圍內(nèi)可分辨的范圍內(nèi)可分辨20002000個以上的蛋白質(zhì)斑點個以上的蛋白質(zhì)斑點, ,然后利用然后利用微量測序技術(shù)對其中微量測序技術(shù)對其中2424個斑點進(jìn)行分析個斑點進(jìn)行分析, ,得到其得到其中中1212個蛋白質(zhì)的端序列個蛋白質(zhì)的端序列. .其余的由于端封閉其余的由于端封閉而未能測出序列而未能測出序列. .已測出的已測出的1212個中有個中有1 1個未能找個未能找到與其匹配的基因到與其匹配的基因. .另外另外1111個與能量代謝、酸性個與能量代謝、酸性核蛋白、蛋白等對應(yīng)核蛋白、蛋白等對應(yīng). .elegans.elegans

22、的的1900019000個個基因已于基因已于19981998年年1212月全部測出月全部測出, ,預(yù)計會對蛋白質(zhì)預(yù)計會對蛋白質(zhì)組的研究提供幫助組的研究提供幫助 。線蟲的蛋白質(zhì)組研究線蟲的蛋白質(zhì)組研究不同性別果蠅不同性別果蠅( () )成蟲成蟲的頭、胸、腹部的蛋白質(zhì)組圖譜已被分的頭、胸、腹部的蛋白質(zhì)組圖譜已被分別作出別作出, ,總共約有總共約有12001200個蛋白質(zhì)被檢出個蛋白質(zhì)被檢出, ,其中的大多數(shù)在頭、胸、腹中是相同的其中的大多數(shù)在頭、胸、腹中是相同的, ,但也發(fā)現(xiàn)了一部分其部位、性別特異的但也發(fā)現(xiàn)了一部分其部位、性別特異的蛋白質(zhì)蛋白質(zhì). . 果蠅的蛋白質(zhì)組研究果蠅的蛋白質(zhì)組研究 人類的

23、蛋白質(zhì)組研究吸引了最多的注意力人類的蛋白質(zhì)組研究吸引了最多的注意力. .由于人有著大量的組織、細(xì)胞類型和發(fā)育階段由于人有著大量的組織、細(xì)胞類型和發(fā)育階段, ,對人蛋白質(zhì)組的研究主要聚焦在特異的組織、細(xì)對人蛋白質(zhì)組的研究主要聚焦在特異的組織、細(xì)胞和疾病上胞和疾病上. .已有的證據(jù)表明已有的證據(jù)表明, ,盡管人的不同組織盡管人的不同組織有著很大的功能差別有著很大的功能差別, ,但其中的許多蛋白質(zhì)是看但其中的許多蛋白質(zhì)是看家蛋白家蛋白, ,因此它們的雙向圖譜可能也是近似的因此它們的雙向圖譜可能也是近似的. .這這點與簡單生物不同點與簡單生物不同, ,簡單生物在不同的發(fā)育階段簡單生物在不同的發(fā)育階段有

24、著極不相同的蛋白質(zhì)組有著極不相同的蛋白質(zhì)組. .因此對于人類來說因此對于人類來說, ,一一個高質(zhì)量的基本的雙向圖譜是非常有用的個高質(zhì)量的基本的雙向圖譜是非常有用的, ,它可它可以作為其他組織、細(xì)胞的參照圖譜以作為其他組織、細(xì)胞的參照圖譜. .人的各種組人的各種組織、器官、細(xì)胞乃至各種細(xì)胞器已被廣泛研究織、器官、細(xì)胞乃至各種細(xì)胞器已被廣泛研究. .人類的蛋白質(zhì)組研究人類的蛋白質(zhì)組研究 人的各種體液人的各種體液( (血液、淋巴、脊髓、乳汁血液、淋巴、脊髓、乳汁和尿等和尿等) )都被用于研究與某些疾病的關(guān)系都被用于研究與某些疾病的關(guān)系. .最近最近澳大利亞科學(xué)家利用雙向電泳技術(shù)研究眼淚中澳大利亞科學(xué)

25、家利用雙向電泳技術(shù)研究眼淚中的蛋白質(zhì)與生理狀態(tài)的關(guān)系的蛋白質(zhì)與生理狀態(tài)的關(guān)系. .他們發(fā)現(xiàn)了一種他們發(fā)現(xiàn)了一種新的蛋白質(zhì)新的蛋白質(zhì), ,這個蛋白質(zhì)非常相似于在乳腺癌這個蛋白質(zhì)非常相似于在乳腺癌細(xì)胞里高表達(dá)的另一種蛋白質(zhì)細(xì)胞里高表達(dá)的另一種蛋白質(zhì). .這個發(fā)現(xiàn)可能這個發(fā)現(xiàn)可能會提供疾病診治的新的手段會提供疾病診治的新的手段. .在一項利用蛋白在一項利用蛋白質(zhì)組研究技術(shù)進(jìn)行的酒精對人體毒性的研究中質(zhì)組研究技術(shù)進(jìn)行的酒精對人體毒性的研究中發(fā)現(xiàn)發(fā)現(xiàn), ,乙醇會改變血清蛋白糖基化作用乙醇會改變血清蛋白糖基化作用, ,導(dǎo)致許導(dǎo)致許多糖蛋白的糖基缺乏多糖蛋白的糖基缺乏, ,如轉(zhuǎn)鐵蛋白。如轉(zhuǎn)鐵蛋白。 腫瘤至今

26、仍是人類的一個頑敵腫瘤至今仍是人類的一個頑敵. .癌細(xì)胞不僅有癌細(xì)胞不僅有許多特異蛋白質(zhì)產(chǎn)物許多特異蛋白質(zhì)產(chǎn)物, ,而且這些產(chǎn)物還會影響其他而且這些產(chǎn)物還會影響其他蛋白質(zhì)的翻譯后加工及許多蛋白質(zhì)的表達(dá)水平蛋白質(zhì)的翻譯后加工及許多蛋白質(zhì)的表達(dá)水平. .腫腫瘤的蛋白質(zhì)組研究能提供一些以往其他技術(shù)所不能瘤的蛋白質(zhì)組研究能提供一些以往其他技術(shù)所不能提供的早期診斷依據(jù)提供的早期診斷依據(jù), ,例如利用不同細(xì)胞組織的特例如利用不同細(xì)胞組織的特征蛋白質(zhì)譜征蛋白質(zhì)譜, ,可以判別一些難以判定來源的腫瘤細(xì)可以判別一些難以判定來源的腫瘤細(xì)胞的來源胞的來源. .丹麥的一個小組利用蛋白質(zhì)組研究技術(shù)丹麥的一個小組利用蛋白

27、質(zhì)組研究技術(shù)結(jié)合組織冰凍切片技術(shù)分析了結(jié)合組織冰凍切片技術(shù)分析了150150例膀胱癌病人的例膀胱癌病人的組織組織, ,發(fā)現(xiàn)在所有的鱗狀細(xì)胞瘤的尿液中均能發(fā)現(xiàn)發(fā)現(xiàn)在所有的鱗狀細(xì)胞瘤的尿液中均能發(fā)現(xiàn)一種化學(xué)引誘劑一種化學(xué)引誘劑銀屑素銀屑素( (),),推測其極可能作為這種腫瘤的早期標(biāo)志物推測其極可能作為這種腫瘤的早期標(biāo)志物. .基因組計劃無疑為醫(yī)療、醫(yī)藥領(lǐng)域帶來一場革基因組計劃無疑為醫(yī)療、醫(yī)藥領(lǐng)域帶來一場革命命, ,但也應(yīng)該看到但也應(yīng)該看到, ,單純的遺傳分析很難診斷多因單純的遺傳分析很難診斷多因素的疾病素的疾病. .復(fù)雜的基因間相互作用復(fù)雜的基因間相互作用, ,細(xì)胞內(nèi)活動和細(xì)胞內(nèi)活動和環(huán)境的影響

28、都會影響基因的表達(dá)及蛋白質(zhì)的翻譯環(huán)境的影響都會影響基因的表達(dá)及蛋白質(zhì)的翻譯后加工后加工. .因此因此, ,可靠的診斷和治療應(yīng)基于機體漸進(jìn)可靠的診斷和治療應(yīng)基于機體漸進(jìn)發(fā)展過程的調(diào)控及失調(diào)發(fā)展過程的調(diào)控及失調(diào), ,并且必須考慮到環(huán)境因素并且必須考慮到環(huán)境因素的影響的影響. .蛋白質(zhì)組的研究正是探索這一領(lǐng)域的有力蛋白質(zhì)組的研究正是探索這一領(lǐng)域的有力武器武器. . 人們不難預(yù)期人們不難預(yù)期, ,基因組計劃的不斷推進(jìn)會基因組計劃的不斷推進(jìn)會給蛋白質(zhì)組研究提供更多更全的數(shù)據(jù)庫給蛋白質(zhì)組研究提供更多更全的數(shù)據(jù)庫; ;生物生物信息學(xué)的發(fā)展會給蛋白質(zhì)組計劃提供更方便有信息學(xué)的發(fā)展會給蛋白質(zhì)組計劃提供更方便有效

29、的計算機分析軟件效的計算機分析軟件; ;國際互聯(lián)網(wǎng)會使各國各國際互聯(lián)網(wǎng)會使各國各領(lǐng)域科學(xué)家有關(guān)蛋白質(zhì)組研究的成果出現(xiàn)新的領(lǐng)域科學(xué)家有關(guān)蛋白質(zhì)組研究的成果出現(xiàn)新的集成集成; ;新的技術(shù)會不斷涌現(xiàn)新的技術(shù)會不斷涌現(xiàn), ,蛋白質(zhì)組研究方法蛋白質(zhì)組研究方法會象技術(shù)一樣易于操作會象技術(shù)一樣易于操作, ,并滲透到人類并滲透到人類活動的方方面面活動的方方面面, ,對工業(yè)、農(nóng)業(yè)、醫(yī)療衛(wèi)生各對工業(yè)、農(nóng)業(yè)、醫(yī)療衛(wèi)生各行各業(yè)帶來新的革命。行各業(yè)帶來新的革命。功能蛋白質(zhì)組學(xué)功能蛋白質(zhì)組學(xué)功能蛋白質(zhì)組學(xué)的提出及概念功能蛋白質(zhì)組學(xué)的提出及概念 功能蛋白質(zhì)組學(xué)是指從動態(tài)和整體的角度研功能蛋白質(zhì)組學(xué)是指從動態(tài)和整體的角度研究

30、蛋白質(zhì)的功能及其結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)，是位于對個別蛋究蛋白質(zhì)的功能及其結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)，是位于對個別蛋白質(zhì)的傳統(tǒng)研究和以全部蛋白質(zhì)為研究對象的蛋白質(zhì)的傳統(tǒng)研究和以全部蛋白質(zhì)為研究對象的蛋白質(zhì)組研究之間的層次。白質(zhì)組研究之間的層次。功能蛋白質(zhì)組學(xué)的研究內(nèi)容功能蛋白質(zhì)組學(xué)的研究內(nèi)容 蛋白質(zhì)群體研究蛋白質(zhì)群體研究蛋白質(zhì)組生物信息學(xué)Bench works (2D, MS, etc)DatabasesBioinformatics數(shù)據(jù)庫 說明 WWW地址蛋白質(zhì)序列庫:SWISS-PROT 內(nèi)容豐富,提示詳盡 http:/www.expasy.ch/sport/PIR較 http:/www-nbrf.georgetown.ed

31、u/pir/pir-psi.htmlTrEMBL (EMBL的翻譯) http:/www.expasy.ch/sprot/OWL (非冗余庫) http:/www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/dbbrowser/OWL/OWL.html核苷酸數(shù)據(jù)庫:EMBL 歐州分子生物學(xué)http:/www.ebi.ac.uk/ebi-docs/embl-db/ebi/topembl.htmlGenBank美國生物工程信息中心/Web/Search/index.htmldbESTCDNA序列標(biāo)記http:/www.ncbi.nlm.nih.g

32、ov/dbEST/模體與域:PROSITE 序列模體 http:/www.expasy.ch/sport/prosite.htmlBLOCKS 保守序列 / ProDom蛋白質(zhì)域http:/protein.toulouse.inra.fr/prodom.htmlSBASE蛋白質(zhì)域http:/base.icgeb.trieste.it/sbase/二維電泳(2DPAGE):WORLD-2DPAGE國際2DPAGE庫的完整索引http:/www.expasy.ch/ch2d/2d-index.htmlLinksto2DPAGEPhoretix公司

33、的連絡(luò)表http:/ 用于蛋白質(zhì)鑒定的數(shù)據(jù)庫搜索軟件屬性參數(shù)/軟件名稱 WWW地址蛋白質(zhì)質(zhì)量+蛋白質(zhì)序列標(biāo)記PeptideSearchhttp:/www.mann.embl-heidelberg.de/Services/PeptideSearch/PeptideSearchIntro.htmlTagIdenthttp:/expasy.hcuge.ch/sprot/tagident.html蛋白質(zhì)的肽質(zhì)印記:MassSearchhttp:/cbrg.inf.ethz.ch/subsection3-1-3.htmlMS-Fithttp:/falcon.ludwig.ucl.ac.uk/ucsfht

34、ml/msfit.htmPetideSearchhttp:/www.mann.embl-heidelberg.de/Services/PeptideSearch/PeptideSearchIntro.htmlProFound/PROWL/prot-id-main.html 蛋白質(zhì)組學(xué)研究的手段蛋白質(zhì)組學(xué)研究的手段蛋白質(zhì)組分析概述蛋白質(zhì)組分析概述蛋白質(zhì)組研究的核心蛋白質(zhì)組研究的核心用于分離的雙向電泳用于分離的雙向電泳(2 -DE) 蛋白質(zhì)組研究的百科全書蛋白質(zhì)組研究的百科全書數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫(database) 蛋白質(zhì)組技術(shù)的支柱蛋白質(zhì)組技術(shù)的支

35、柱鑒定技術(shù)鑒定技術(shù)(Identication)蛋白質(zhì)組技術(shù)的規(guī)模蛋白質(zhì)組技術(shù)的規(guī)模高流通量篩選高流通量篩選(HTS) 目前雙向凝膠電泳一般只能分辨到目前雙向凝膠電泳一般只能分辨到1000-30001000-3000個個蛋白質(zhì)點蛋白質(zhì)點(SPOT),(SPOT),而一個細(xì)胞系可以表達(dá)上萬個基因而一個細(xì)胞系可以表達(dá)上萬個基因, ,加上蛋白質(zhì)加工修飾的多樣性加上蛋白質(zhì)加工修飾的多樣性, ,一個樣品中的蛋白種類一個樣品中的蛋白種類可達(dá)可達(dá)10106 6種。因此種。因此, ,對于一些低拷貝蛋白對于一些低拷貝蛋白, ,通常先將蛋白通常先將蛋白粗提液通過親和柱純化粗提液通過親和柱純化, ,再由一維或二維電泳

36、分離。單再由一維或二維電泳分離。單向電泳的優(yōu)點在于幾乎所有蛋白質(zhì)均溶于向電泳的優(yōu)點在于幾乎所有蛋白質(zhì)均溶于, ,分子分子量在量在10000-30000010000-300000范圍內(nèi)均能有效分離范圍內(nèi)均能有效分離, ,極酸、極堿蛋極酸、極堿蛋白極易檢出。雙向凝膠電泳白極易檢出。雙向凝膠電泳(2-dimensional gel (2-dimensional gel electrophoresis)electrophoresis)原理簡明原理簡明, ,第一向進(jìn)行等電聚焦第一向進(jìn)行等電聚焦, ,蛋蛋白質(zhì)沿梯度分離白質(zhì)沿梯度分離, ,至各自的等電點至各自的等電點; ;隨后隨后, ,在沿垂直在沿垂直的方

37、向進(jìn)行分子量的分離。的方向進(jìn)行分子量的分離。8080年代固相化梯度年代固相化梯度( (,IPG),IPG)的發(fā)明和完善的發(fā)明和完善, ,解決了梯度不穩(wěn)的問題解決了梯度不穩(wěn)的問題, ,使使2-2-的重復(fù)性和上樣量大為改善。的重復(fù)性和上樣量大為改善。雙向凝膠電泳（雙向凝膠電泳（2-DE2-DE）樣品的制備樣品的制備高分辨率和重復(fù)性高分辨率和重復(fù)性 分離后的斑點檢測分離后的斑點檢測(spot detection) 概念概念 蛋白質(zhì)組研究的發(fā)展以雙向電泳技術(shù)作為核蛋白質(zhì)組研究的發(fā)展以雙向電泳技術(shù)作為核心心. . 雙向電泳由雙向電泳由arrellarrell，s s于于19751975年首次建年首次建立

38、并成功地分離約立并成功地分離約10001000個個 蛋白蛋白, ,并表并表明蛋白質(zhì)譜不是穩(wěn)定的明蛋白質(zhì)譜不是穩(wěn)定的, ,而是隨環(huán)境而變化而是隨環(huán)境而變化 。雙。雙向電泳原理簡明向電泳原理簡明, ,第一向進(jìn)行等電聚焦第一向進(jìn)行等電聚焦, ,蛋白質(zhì)沿蛋白質(zhì)沿梯度分離至各自的等電點梯度分離至各自的等電點, ,隨后隨后, ,再沿垂直的再沿垂直的方向進(jìn)行分子量的分離方向進(jìn)行分子量的分離. . 目前目前, ,隨著技術(shù)的飛速發(fā)隨著技術(shù)的飛速發(fā)展展, ,已能分離出已能分離出1000010000個斑點個斑點( () ) 樣品制備和溶解同樣事關(guān)樣品制備和溶解同樣事關(guān)2- 2- 的成效的成效, ,目目標(biāo)是盡可能擴(kuò)大

39、其溶解度和解聚標(biāo)是盡可能擴(kuò)大其溶解度和解聚, ,以提高分辨率以提高分辨率 用化學(xué)法和機械裂解法破碎以盡可能溶解和解聚用化學(xué)法和機械裂解法破碎以盡可能溶解和解聚蛋白蛋白, ,兩者聯(lián)合有協(xié)同作用兩者聯(lián)合有協(xié)同作用 對樣品的預(yù)處對樣品的預(yù)處理涉及溶解、變性和還原來完全破壞蛋白間的相理涉及溶解、變性和還原來完全破壞蛋白間的相互作用互作用, ,并除去如核酸等非蛋白物質(zhì)并除去如核酸等非蛋白物質(zhì) 。理想的狀。理想的狀態(tài)是人們應(yīng)一步完成蛋白的完全處理態(tài)是人們應(yīng)一步完成蛋白的完全處理 。 低豐度蛋白在細(xì)胞內(nèi)可能具有重要的調(diào)節(jié)低豐度蛋白在細(xì)胞內(nèi)可能具有重要的調(diào)節(jié)功能功能, ,代表蛋白質(zhì)組研究的代表蛋白質(zhì)組研究的“

40、冰山之尖冰山之尖”, ,故分故分高低豐度蛋白是一種挑戰(zhàn)亞細(xì)胞分級和蛋白質(zhì)高低豐度蛋白是一種挑戰(zhàn)亞細(xì)胞分級和蛋白質(zhì)預(yù)分級、提高加樣量預(yù)分級、提高加樣量( (已達(dá)到已達(dá)到1 11515級的標(biāo)級的標(biāo)準(zhǔn)準(zhǔn)) ) 、應(yīng)用敏感性檢測、應(yīng)用敏感性檢測, ,可以提高其敏感性可以提高其敏感性 如如一種多肽免疫一種多肽免疫2 -2 -印跡是利用幾種單克隆印跡是利用幾種單克隆抗體技術(shù)來分析和檢測提高組蛋白和核糖體蛋抗體技術(shù)來分析和檢測提高組蛋白和核糖體蛋白等堿性蛋白的分離是另一難點，白等堿性蛋白的分離是另一難點， 由于堿性由于堿性范圍內(nèi)凝膠基質(zhì)的不穩(wěn)定及逆向電滲流的范圍內(nèi)凝膠基質(zhì)的不穩(wěn)定及逆向電滲流的產(chǎn)生產(chǎn)生, ,

41、對對pIpI超過超過1010的堿性蛋白的堿性蛋白, ,通過產(chǎn)生通過產(chǎn)生0 010%10%的山梨醇梯度和的山梨醇梯度和16%16%的異丙醇可減少之，的異丙醇可減少之， 亦可亦可用雙甲基丙烯酰胺來增加基質(zhì)的穩(wěn)定性。用雙甲基丙烯酰胺來增加基質(zhì)的穩(wěn)定性。 2 -2 -面臨的挑戰(zhàn)是高分辨率和重復(fù)性面臨的挑戰(zhàn)是高分辨率和重復(fù)性 ：高分辨率確保蛋白最大程度的分離高分辨率確保蛋白最大程度的分離, ,高重復(fù)性允高重復(fù)性允許進(jìn)行凝膠間配比許進(jìn)行凝膠間配比. .對對2-2-而言而言, ,有有3 3種方法分種方法分離蛋白離蛋白: :1)ISO-DALT1)ISO-DALT以以FarrellFarrell, ,s s技

42、術(shù)為基礎(chǔ)技術(shù)為基礎(chǔ) 第一第一向應(yīng)用載體兩性電解質(zhì)向應(yīng)用載體兩性電解質(zhì), ,在管膠內(nèi)建立梯度在管膠內(nèi)建立梯度 隨著聚焦時間的延長隨著聚焦時間的延長, ,梯度不穩(wěn)梯度不穩(wěn), ,易產(chǎn)生陰易產(chǎn)生陰極漂極漂. .2)NEPH2)NEPH用于分離堿性蛋白用于分離堿性蛋白( (7.0) 7.0) 如如果聚焦達(dá)到平衡狀態(tài)果聚焦達(dá)到平衡狀態(tài), ,堿性蛋白會離開凝膠基堿性蛋白會離開凝膠基質(zhì)而丟失質(zhì)而丟失 因此因此, ,在等電區(qū)域的遷移須在平衡狀在等電區(qū)域的遷移須在平衡狀態(tài)之前完成態(tài)之前完成, ,但很難控制。但很難控制。3)IPG-DALT3)IPG-DALT發(fā)展于發(fā)展于8080年代早期年代早期. .由于固相由于固

43、相梯度的出現(xiàn)解決了梯度不穩(wěn)的問題梯度的出現(xiàn)解決了梯度不穩(wěn)的問題 . .通過通過immobilineimmobiline共價偶聯(lián)于丙烯酰胺產(chǎn)生固共價偶聯(lián)于丙烯酰胺產(chǎn)生固定的梯度定的梯度, ,克服了的缺點克服了的缺點, ,從而達(dá)到從而達(dá)到高度的重復(fù)性高度的重復(fù)性 目前可以精確制作線性、漸進(jìn)目前可以精確制作線性、漸進(jìn)性和型曲線性和型曲線, ,范圍或?qū)捇蛘奶荻确秶驅(qū)捇蛘奶荻? . 新新的酸性的酸性3-53-5或堿性或堿性6-116-11的的IPGIPG凝膠梯度凝膠梯度聯(lián)合商品化的聯(lián)合商品化的4-74-7的梯度可對蛋白質(zhì)形成的梯度可對蛋白質(zhì)形成蛋白質(zhì)組重疊群從而有效分離蛋白質(zhì)組重疊群從而有效分離.

44、 . 分離后的斑點檢測分離后的斑點檢測( () )亦很重要亦很重要 . .所采用的檢測策略所采用的檢測策略和分離后所采用的方法的相互作用是很重要和分離后所采用的方法的相互作用是很重要的的. . 此外此外, ,還需考慮反應(yīng)的線性、飽和閾還需考慮反應(yīng)的線性、飽和閾/ /動動態(tài)范圍、敏感性、對細(xì)胞蛋白群的全體定量態(tài)范圍、敏感性、對細(xì)胞蛋白群的全體定量分析的適應(yīng)性、可行性分析的適應(yīng)性、可行性. . 目前目前, ,沒有一種蛋沒有一種蛋白染色覆蓋廣泛的濃度和及分離后分析白染色覆蓋廣泛的濃度和及分離后分析技術(shù)技術(shù). . 銀染已成為一種檢測銀染已成為一種檢測2- D2- D的流行方法的流行方法, ,可檢測少到

45、可檢測少到2 25 5的蛋白的蛋白, ,因此較考馬斯亮因此較考馬斯亮藍(lán)藍(lán)- 250- 250敏感敏感. . 多數(shù)糖蛋白不能被考馬斯亮多數(shù)糖蛋白不能被考馬斯亮藍(lán)染色藍(lán)染色, ,一些有機染料不適于膜一些有機染料不適于膜 放射放射性標(biāo)記不依賴其代謝的活性性標(biāo)記不依賴其代謝的活性, ,并僅適于對合成并僅適于對合成的蛋白質(zhì)檢測的蛋白質(zhì)檢測. .另有一種改良的另有一種改良的2- 2- ( (差異差異凝膠電泳凝膠電泳),),即應(yīng)用兩種不同的染料熒光標(biāo)記兩即應(yīng)用兩種不同的染料熒光標(biāo)記兩個樣品個樣品, ,使在同一凝膠上電泳后的凝膠圖象為使在同一凝膠上電泳后的凝膠圖象為兩個兩個, ,避免了幾種避免了幾種2 -2

46、-的比較的比較, ,可在納克級可在納克級進(jìn)行檢測進(jìn)行檢測. .蛋白質(zhì)組技術(shù)的支柱蛋白質(zhì)組技術(shù)的支柱鑒定技術(shù)鑒定技術(shù) 與質(zhì)譜與質(zhì)譜(mass spectrometry)相關(guān)的技術(shù)相關(guān)的技術(shù) 氨基酸組分分析氨基酸組分分析 圖象分析技術(shù)圖象分析技術(shù)(Image analysis) 微量測序微量測序(micro-sequencing) 肽質(zhì)指紋術(shù)肽質(zhì)指紋術(shù)（peptide mass fingerprint,PMF） 肽片段肽片段（peptide fragment)的部分測序的部分測序 質(zhì)譜技術(shù)的現(xiàn)狀質(zhì)譜技術(shù)的現(xiàn)狀 質(zhì)譜技術(shù)的應(yīng)用質(zhì)譜技術(shù)的應(yīng)用質(zhì)譜技術(shù)的應(yīng)用質(zhì)譜技術(shù)的應(yīng)用 蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)和DNA的序列測定的序列測定 分析復(fù)合體的蛋白質(zhì)組分析復(fù)合體的蛋白質(zhì)組 研究蛋白質(zhì)修飾研究蛋白質(zhì)修飾 分析單核苷酸多態(tài)性分析單核苷酸多態(tài)性 研究生物分子的相互作用研究生物分子的相互作用 鑒定蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)鑒定蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)圖象分析技術(shù)圖象分析技術(shù)“滿天星滿天星”式的式的2 圖譜分析不能依靠本能的直覺圖譜分析不能依靠本能的直覺,每一個圖每一個圖象上斑點的上調(diào)、下調(diào)及出現(xiàn)、消失象上斑點的上調(diào)、下調(diào)及出現(xiàn)、消失,都可能在生理和病理狀態(tài)下產(chǎn)都可能在生理和病理狀態(tài)下產(chǎn)生生,必須依靠計算機為基礎(chǔ)的數(shù)據(jù)處理必須依靠計算機為基礎(chǔ)的數(shù)據(jù)處理,進(jìn)行定量分析進(jìn)行