
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文檔簡介
1、.第一章 蛋白質(zhì)1、必需氨基酸(essential amino acid)必需 氨基酸 指的是人體自身不能合成或合成速度不能滿足人體需要,必須從食物中攝取的氨 基酸。分別是:賴氨酸 、色氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸 、氨酸、異 亮氨酸 、亮氨酸、 纈氨酸 。2、等電點 (isoelectric point,pI)在某一 PH的溶液中,氨基酸解離成陽離子和陰離子的趨勢與相等,稱為間性離子,呈電中性,此時溶液的PH稱為該氨基酸的等電點。3、模體( motif )在蛋白質(zhì)分子中,可發(fā)現(xiàn) 2 個或者 3 個具有二級結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個特殊的空間構(gòu)象,并具有相應(yīng)的功能,被稱為模體4、結(jié)構(gòu)域(
2、 domain)分子量較大的蛋白質(zhì)??烧郫B成多個結(jié)構(gòu)較為緊密的區(qū)域,該區(qū)域具有獨立的構(gòu)象,并各行其功能,稱為結(jié)構(gòu)域5、蛋白質(zhì)的變性(protein denaturation)在某些物理和化學(xué)因素作用下, 蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象被破壞, 即有序的空間結(jié)構(gòu)變成無序的空間結(jié)構(gòu), 從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)的改變和生物活性的喪失, 但是一級結(jié)構(gòu)沒有改變稱為蛋白質(zhì)的變性。6、蛋白質(zhì)的復(fù)性(protein renaturation):若蛋白質(zhì)變性程度較輕,去除變性因素后,有些蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)象和功能,稱為復(fù)性7、亞基 (subunit):在蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)中,有二個或二個以上具有獨立的三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈
3、,彼此借次級鍵相連,成為一定的空間結(jié)構(gòu)。具有獨立三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈單位,稱為亞基或亞單位,8、別構(gòu)效應(yīng)(變位效應(yīng),allosteric effect):蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的改變伴隨其功能的變化, 稱為變構(gòu)效應(yīng)。 具有變構(gòu)效應(yīng)的蛋白質(zhì)稱為變構(gòu)蛋白,常有四級結(jié)構(gòu),例如血紅蛋白。(書上)凡蛋白質(zhì)分子因與某種小分子物質(zhì)相互作用發(fā)生構(gòu)象改變, 因而改變了這種蛋白質(zhì)與其它分子進(jìn)行反應(yīng)的能力,這一現(xiàn)象稱為變構(gòu)作用。( PPT上)12 / 129 分子?。?molecular disease)由于遺傳物質(zhì)(DNA)的突變,導(dǎo)致其編碼的蛋白質(zhì)分子的氨基酸序列異常,而引起其功能改變的遺傳性疾病。第二章核酸1核酸的變性(
4、denaturation)在某些理化因素作用下,DNA分子互補(bǔ)堿基對之間氫鍵斷裂,DNA雙螺旋打開,變?yōu)閱捂湣?退火( annealing)變性 DNA在適當(dāng)條件下, 兩條互補(bǔ)鏈可重新恢復(fù)天然的雙螺旋結(jié)構(gòu),復(fù)性。這一現(xiàn)象稱退火,又稱3分子雜交(molecular hybridization)不同來源的核酸變性后合并在一起進(jìn)行復(fù)性。只要這些核酸分子的核苷酸序列中含有可以形成堿基互補(bǔ)配對的序列,彼此之間即可形成局部雙鏈,即所謂的雜化雙鏈這個過程叫雜交或核酸分子雜交。(heteroduplex)。4.解鏈溫度( melting temperature, Tm)在解鏈過程中,紫外吸光度的變化A260
5、達(dá)到最大變化值的一半時所對應(yīng)的溫度稱為Tm第三章 酶1. 變構(gòu)酶( allosteric enzyme)一些小分子物質(zhì)能夠與酶的活性中心以外的調(diào)節(jié)部位或亞基以非共價鍵形式結(jié)合,使酶發(fā)生變構(gòu)而改變其催化活性,這種酶稱為變構(gòu)酶2. 同工酶( isozyme )指催化相同的化學(xué)反應(yīng),但酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)乃至免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶3. 酶原( zymogen)有些酶在細(xì)胞合成或初分泌,或在其發(fā)揮催化功能前只有酶的無活性前體,必須在一定條件下,這些酶的前體水解開一個或者幾個特定的肽鍵,致使構(gòu)想發(fā)生改變,表現(xiàn)出酶的活性,這種無活性酶的前體稱為酶原。4. 活性中心(active center)酶分子
6、中的必需基團(tuán)相對集中,組成具有特定空間結(jié)構(gòu)的區(qū)域,能與底物特異結(jié)合并將底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物。5 米氏常數(shù)( Km)Km是當(dāng)酶促反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半時的底物濃度。單位:mol/L 。6 變構(gòu)調(diào)節(jié)( allosteric regulation)一些小分子物質(zhì)能夠與酶的活性中心以外的調(diào)節(jié)部位或亞基以非共價鍵形式結(jié)合,使酶的構(gòu)象發(fā)生改變,使酶的活性改變,這種現(xiàn)象稱為變構(gòu)調(diào)節(jié)7 酶的化學(xué)修飾Chemical modification酶蛋白肽鏈上的一些基團(tuán)可與某種化學(xué)基團(tuán)發(fā)生可逆的共價結(jié)合,從而改變酶的活性。稱為酶的化學(xué)修飾(Chemical modification)或共價修飾(covalent mod
7、ification)8 必需基團(tuán)( essential group)酶分子中與催化作用直接相關(guān)、不可缺少的化學(xué)基團(tuán)。( 催化基團(tuán)、結(jié)合基團(tuán))9 全酶 holoenzyme:即酶蛋白與輔助因子。酶蛋白和輔助因子單獨存在都不具有酶活性, 只有全酶具有酶活性。10 酶( enzyme)是由活細(xì)胞產(chǎn)生, 對其底物具有高度催化效能和高度專一性,能在細(xì)胞外起同樣催化作用的一類生物催化劑。第四章糖代1. 糖異生 gluconeogenesis從非糖物質(zhì)(乳酸、甘油、生糖氨基酸)轉(zhuǎn)變?yōu)槠咸烟腔蛘咛窃倪^程稱為糖異生2. 糖酵解( glycolysis)與無氧氧化(anaerobic oxidation)在機(jī)體
8、缺氧條件下,葡萄糖經(jīng)一系列酶促反應(yīng)生成丙酮酸進(jìn)而還原生成乳酸的過程,稱為糖降解,亦稱為無氧氧化3. 有氧氧化( Aerobic Oxidation)葡萄糖或糖原在有氧條件下徹底氧化成H2O和 CO2,同時釋放出能量的過程,這是糖氧化的主要方式。第五章脂代1.必需脂肪酸 (essential fatty acid)人體必需但自身不能合成或合成不足,生四烯酸。必須依賴食物供給的脂肪酸,如亞油酸、 亞麻酸和花2.酮體 (ketone body)肝細(xì)胞通過脂酸 - 氧化產(chǎn)生的大量乙酰為被稱為酮體的化合物,包括乙酰乙酸,COA除通過氧化生成- 羥丁酸,丙酮。ATP供能外, 還在線粒體轉(zhuǎn)化3脂肪動員 (f
9、at mobilization)儲存在脂肪細(xì)胞中的脂肪,化利用的過程。被脂酶逐步水解為游離脂酸與甘油,并釋放入血以供其他組織氧4. 脂肪酸的 - 氧化( -oxidation of fatty acid)脂酰 CoA進(jìn)入線粒體基質(zhì)后,從脂?;?碳原子開始,經(jīng)過脫氫、加水、再脫氫、硫解等 4 步連續(xù)反應(yīng), 脂?;鶖嗔旬a(chǎn)生1 分子乙酰CoA和 1 分子比原來少兩個碳原子的脂酰CoA。第六章生物氧化1.生物氧化( biological oxidation)物質(zhì)在生物體進(jìn)行氧化稱生物氧化,主要指糖、脂肪、蛋白質(zhì)等在體分解時逐步釋放能量, 最終生成CO2 和 H2O 的過程。2 氧化磷酸化 (oxid
10、ative phosphorylation)氧化磷酸化(oxidativephosphorylation)是指代物氧化脫氫,經(jīng)線粒體電子呼吸鏈傳遞釋放能量,偶聯(lián)驅(qū)動ADP磷酸化生成ATP的過程,又稱為偶聯(lián)磷酸化。3 氧化呼吸鏈 (oxidative respiratory chain)代物脫下的成對氫原子( 2H)通過多種酶和輔酶所催化的氧化還原反應(yīng)逐步傳遞,最終與氧結(jié)合生成水,釋放的能量驅(qū)動ATP生成 .這一系列酶和輔酶稱為電子傳遞鏈(electron transfer chain)。它與細(xì)胞攝取氧的呼吸過程相關(guān),故又稱呼吸鏈(respiratory chain)4.底物水平磷酸化(subs
11、trate-level phosphorylation)物質(zhì)在生物氧化過程中,常生成一些含有高能鍵的化合物,而這些化合物可直接偶聯(lián)ATP或 GTP的合成,這種產(chǎn)生ATP等高能分子的方式稱為底物水平磷酸化第七章氨基酸代1.一碳單位( one carbon unit)某些氨基酸代中產(chǎn)生的含有一個碳原子的基團(tuán)。包括:甲基,甲烯基,甲炔基,甲?;瑏啺奔谆?.必需氨基酸 ( essential amino)體不能合成,必需由食物供給的氨基酸,包括:纈、亮、異亮、苯丙、色、蛋、賴3. 腐敗作用 (putrefaction):未被吸收的氨基酸與未被消化的蛋白質(zhì)在大腸菌中的代作用。第八章 核酸代1. 從頭
12、合成途徑(de novo synthesispathway):利用磷酸核糖、氨基酸、二氧化碳等簡單物質(zhì)為原料,經(jīng)過一系列酶促反應(yīng),合成核苷酸的途徑。2. 補(bǔ)救合成途徑(salvagesynthesis反應(yīng),合成核苷酸的過程,稱為補(bǔ)救合成pathway): 利用體游離的嘌呤或嘌呤核苷,經(jīng)過簡單的/ 重新利用途徑。第九章物質(zhì)代的聯(lián)系和調(diào)節(jié)1. 共價修飾( covalent modification)酶蛋白肽鏈上某些氨基酸殘基在其它酶的催化下發(fā)生共價修飾,從而引起酶活性的改變,稱為酶的化學(xué)修飾。修飾形式:乙?;⒓谆?、腺苷化與磷酸化等,磷酸化是最常見的重要修飾形式2. 變構(gòu)調(diào)節(jié)( alloster
13、ic regulation)小分子化合物與酶蛋白的調(diào)節(jié)亞基或調(diào)節(jié)部位進(jìn)行非共價結(jié)合,引起酶構(gòu)象變化,從而改變酶的活性。變構(gòu)調(diào)節(jié)不引起酶的構(gòu)型變化,不涉與共價鍵變化。3. 代調(diào)節(jié) Regulation of Metabolism機(jī)體根據(jù)外環(huán)境的變化調(diào)節(jié)各種物質(zhì)代通路的強(qiáng)度、方向和速度。4. 動態(tài)平衡Dynamic Equilibrium體物質(zhì)不斷更新、適時補(bǔ)充, 通過一定的調(diào)節(jié)機(jī)制保持代的動態(tài)平衡,以防止中間產(chǎn)物的堆積和缺乏。5. 化學(xué)修飾Chemical Modification酶蛋白肽鏈上某些氨基酸殘基在其它酶的催化下發(fā)生共價修飾,從而引起酶活性的改變,稱為酶的化學(xué)修飾。修飾形式:乙?;?、甲
14、基化、腺苷化與磷酸化等,磷酸化是最常見的重要修飾形式6. 關(guān)鍵酶 (key enzyme) :代途徑中,催化單向/ 不可逆 / 非平衡反應(yīng)的酶,其活性決定代途徑的方向。關(guān)鍵酶常位于代途徑的第一步驟或分叉點。7. 限速酶 (rate-limitingenzyme) :催化代途徑中速度最慢步驟的酶,它的活性決定代途徑的總速度。限速酶常位于代調(diào)節(jié)的樞紐步驟。8. 誘導(dǎo)( induction):使酶的生成增多增快,加速酶合成的化合物稱為誘導(dǎo)劑(inducer )9. 阻遏( repression):使酶的生成減少減慢,減少酶合成的化合物稱為阻遏劑(repressor)第十章 DNA的生物合成1. 中心
15、法則(the central dogma)是指遺傳信息從DNA傳遞給 RNA,再從 RNA傳遞給蛋白質(zhì),即完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過程。也可以從DNA傳遞給 DNA,即完成DNA的復(fù)制過程。2. 半保留復(fù)制(semi-conservative replication)DNA復(fù)制時,母鏈DNA解開為兩股單鏈,各自作為模板按堿基配對規(guī)律,合成與模板互補(bǔ)的子鏈。子代DNA,一股鏈從親代完整地承受過來,另一股鏈則完全重新合成。兩個子代DNA都和親代DNA堿基序列一致。這種復(fù)制方式稱為半保留復(fù)制(semi-conservative replication)。3. 逆轉(zhuǎn)錄( reverse transc
16、ription) 以 RNA為模板合成DNA的過程稱為逆轉(zhuǎn)錄4. 岡崎片段( Okazaki fragment)在 DNA復(fù)制中存在不連續(xù)的片段,這種不連續(xù)復(fù)制的DNA片段稱作岡崎片段(Okazaki fragment )5. 引發(fā)體 (primosome)解旋酶、拓?fù)洚悩?gòu)酶、 引 物酶和引物以與單鏈結(jié)合蛋白形成的復(fù)合體稱為引發(fā)體(primosome)第十一章 RNA的生物合成1. 啟動子( promoter )是位于轉(zhuǎn)錄起始點上游的一段DNA序列, 是 RNA聚合酶的識別和結(jié)合部位。在轉(zhuǎn)錄調(diào)控中起著重要作用。2. 外顯子( exon )在斷裂基因與初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中出現(xiàn),并表達(dá)為成熟RNA的核酸
17、序列。3. 含子( intron)隔斷基因的線性表達(dá),在剪接過程中被去除的核酸序列。4. RNA 編輯( RNA editing)遺傳信息在RNA水平發(fā)生改變,由一個基因產(chǎn)生不止一種蛋白質(zhì)的加工方式。5. 核酶( ribozyme ) 具有催化活性的RNA6. 轉(zhuǎn)錄作用(DNA-dependent RNA synthesis)在 RNA聚合酶催化下,以DNA為模板,以4 種三磷酸核苷(ATP, GTP, CTP, UTP ) 為原料進(jìn)行的 RNA聚合反應(yīng)。7. 終止子 (terminator)在基因單位中,具有停止轉(zhuǎn)錄作用的部位,包括 GC富集區(qū)和AT富集區(qū) ,也稱終止子。8. 轉(zhuǎn)錄因子tra
18、nscriptional factor, TF反式作用因子中, 直接或間接結(jié)合RNA聚合酶的, 稱為轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionalfactors, TF)。9. 剪接作用( mRNA splicing)剪切 hnRNA中含子序列,將各外顯子序列連接為成熟mRNA的過程。10. 不對稱轉(zhuǎn)錄(asymmetric transcription)DNA片段轉(zhuǎn)錄時,雙鏈DNA中只有一條鏈作為轉(zhuǎn)錄的模板,這種轉(zhuǎn)錄方式稱為不對稱轉(zhuǎn)錄11. 模板鏈( template strand) 指導(dǎo) RNA合成的 DNA鏈12. 編碼鏈( coding strand)與模板鏈互補(bǔ)的另一條DNA鏈。無轉(zhuǎn)錄功能,
19、其序列與轉(zhuǎn)錄的RNA序列相同。13. 轉(zhuǎn)錄泡 (transcription bubble)由 DNA雙鏈(打開約17bp) ,RNA 聚合酶與新合成的RNA鏈局部形成的結(jié)構(gòu).14. 單順反子一條 mRNA模板只含有一個翻譯起始點和一個終止點,因而一個基因編碼一條多肽鏈或RNA鏈,每個基因轉(zhuǎn)錄有各自的調(diào)節(jié)元件。15. 多順反子在原核細(xì)胞中,通常是幾種不同的mRNA連在一起,相互之間由一段短的不編碼蛋白質(zhì)的間 隔序列所隔開,這種mRNA叫做多順反子mRN。A 這樣的一條mRNA鏈含有指導(dǎo)合成幾種蛋白質(zhì)的信息。第十二章蛋白質(zhì)的生物合成1. 核糖體循環(huán)(Ribosome Cycle )蛋白質(zhì)翻譯過程中
20、,核糖體大小亞基聚合完成肽鏈起始、延長與終止過程后解離,它們還可以再聚合成完整的核糖體,開始新的肽鏈合成,循環(huán)往復(fù)。2. 分子伴侶(molecular chaperone)是細(xì)胞一類保守蛋白質(zhì),可識別肽鏈的非天然構(gòu)象,促進(jìn)各功能域和整體蛋白質(zhì)的正確折疊3. 信號肽 (signal peptide)各種新生分泌型蛋白的N 端有保守的氨基酸序列第十三章基因表達(dá)調(diào)控1. 基因( Gene)負(fù)載特定遺傳信息的DNA片段,包括:DNA編碼序列、非編碼調(diào)節(jié)序列和含子序列。2. 管家基因( housekeeping gene)生物體某些基因產(chǎn)物在整個生命過程中都是需要的或必不可少的,這類產(chǎn)物的編碼基因在生物
21、體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)3. 誘導(dǎo)( induction)基因表達(dá)水平在特定環(huán)境中增高的現(xiàn)象,這類基因叫可誘導(dǎo)基因4. 阻遏( repression)基因?qū)Νh(huán)境信號應(yīng)答表現(xiàn)為表達(dá)水平降低,這類基因叫可阻遏基因5. 操縱子(operon )由功能相關(guān)的一組基因在染色體上串聯(lián),共同構(gòu)成的一個轉(zhuǎn)錄單位。一個操縱子只含一個啟動序列與數(shù)個可轉(zhuǎn)錄的編碼基因6. 順式作用元件(cis-acting element)可影響自身基因表達(dá)活性的DNA序列7. 增強(qiáng)子( enhancer )遠(yuǎn)離轉(zhuǎn)錄起始位點(1 30kb) ,決定基因的特異性表達(dá),增強(qiáng)啟動子轉(zhuǎn)錄活性的DNA序列。其發(fā)揮作用的方式通常與方向、距離無
22、關(guān)8. 沉默子 silencer某些基因的負(fù)性調(diào)節(jié)元件,當(dāng)其結(jié)合特異蛋白因子時,對基因轉(zhuǎn)錄起阻遏作用。有些DNA序列既可作為正性、又可作為負(fù)性調(diào)節(jié)元件發(fā)揮順式調(diào)節(jié)作用9. 反式作用因子(trans-acting factors)指能直接或間接地識別或結(jié)合在各類順式作用元件 核心序列上參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。10. 基因 組( Genome)指來自一個生物體的一整套遺傳物質(zhì),對原核生物與噬菌體來說,它們的基因組就是單個環(huán)狀染色體所含的全部基因,對于真核生物而言,基因組是指一個生物體的染色體所包含的全 部 DNA11. 基因表達(dá)( Gene Expression)指細(xì)胞 在生命過程中, 把
23、儲存在 DNA順序中 遺傳信息 經(jīng)過轉(zhuǎn)錄和翻譯, 轉(zhuǎn)變成具有 生物活性的蛋白質(zhì)分子。第十三章基因工程與基因重組1. 基因工程( genetic engineering)是將外源基因通過體外重組后導(dǎo)入受體細(xì)胞,使這個基因能在受體細(xì)胞復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、 翻譯表達(dá)的操作。1.重組 DNA技術(shù)( recombinantDNAtechnique)在體外重新組合脫氧核苷酸(DNA)分子,并使它們在適當(dāng)?shù)募?xì)胞中增殖的遺傳操作。1.限制性核酸切酶(restriction endonuclease):存在于細(xì)菌體,能夠識別和切割雙鏈DNA部特定核苷酸序列的一類核酸酶。1.聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)在反應(yīng)體系中加入模板DN
24、A、dNTP、特別設(shè)計的特異引物與耐熱的DNA聚合酶(常用 Taq 酶), 經(jīng)多次變性、退火、延伸循環(huán)反應(yīng),使目的DNA呈指數(shù)合成的過程1.cDNA文庫 (cDNA library)以 mRNA為模板,利用反轉(zhuǎn)錄酶合成與mRNA互補(bǔ)的 DNA,再復(fù)制成雙鏈cDNA片段,與適當(dāng)載體連接后轉(zhuǎn)入受體菌,這些受體菌包含了所有cDNA信息,總稱cDNA文庫。常用于篩選編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因。1.基因組 DNA文庫 (genomic DNA library)利用限制性核酸切酶將組織或細(xì)胞染色體DNA切割后, 與適當(dāng)載體連接后轉(zhuǎn)入受體菌,這些受體菌包含了所有基因組DNA信息,總稱基因組DNA文庫第十五章細(xì)胞信息轉(zhuǎn)導(dǎo)1. 第二信使 (secondary messenger)在細(xì)胞傳遞信息的小分子物質(zhì),如:Ca2+、DAG、IP3 、Cer (神經(jīng)酰胺)、cAMP、cGMP、花生四烯酸與其代產(chǎn)物等。2.G 蛋白 (guanylate binding pr
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