PubMed使用指南

1、醫(yī)學文獻資源檢索與利用PubMed數(shù)據(jù)庫檢索中山大學醫(yī)學文獻檢索教研室朱偉麗2011年5月Outline數(shù)據(jù)庫概況數(shù)據(jù)庫概況數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)庫檢索檢索結果處理檢索結果處理yNCBIyNCBI1、PubMed-概況-紙質版（Index Medicus,IM美國醫(yī)學索引）-光盤版（MEDLARS on Line ,MEDLINE）-網(wǎng)絡版(PubMed)，收錄時間范圍：1947-，部分期刊回溯至創(chuàng)刊年。數(shù)據(jù)每日更新(Tuesday Saturday)-世界上權威性的生物醫(yī)學書目生物醫(yī)學書目型數(shù)據(jù)庫，收錄全世界范圍內(nèi)70多個國家和地區(qū)近5000種生物醫(yī)學相關期刊論文期刊論文

2、，主要收錄英語語種期刊，少部分其他語種期刊。- 學科范圍涵蓋基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、護理學、口腔醫(yī)學、獸醫(yī)學、營養(yǎng)衛(wèi)生、藥理和藥劑學、預防醫(yī)學、衛(wèi)生管理、醫(yī)療保健和情報科學領域，2000年起新增生物、環(huán)境科學、海洋生物、植物和動物學、生物物理學和生物化學等生命科學領域- 全球免費免費使用，部分文獻免費獲取全文- 集成在NCBI平臺，訪問網(wǎng)址(/pubmed)1 PubMed-概況記錄組成- OldMEDLINEPubMed - OLDMEDLINE ：1947-1965年間的MEDLINE數(shù)據(jù)，正在做回溯加工，補充主題詞及部分全文鏈接- MEDL

3、INEPubMed-indexed for MEDLINE：標引了主題詞被MEDLINE正式收錄的文獻數(shù)據(jù)。- PreMEDLINE PubMed-in process：已被MEDLINE錄用，正處于加工標引狀態(tài)的文獻數(shù)據(jù)。- Epub ahead of print PubMed-as supplied by publisher：由出版商提供的紙質版尚未正式出版的文獻，大部分最終會轉入PubMed-in process，再正式轉入MEDLINE，部分不在MEDLINE收錄學科范圍內(nèi)的數(shù)據(jù)，最終會轉化為PubMed-as supplied by publisher/PubMed 狀態(tài)。- Pub

4、lisher-Supplied PubMed-as supplied by publisher/PubMed：由出版商提供但因其學科不在MEDLINE收錄學科范圍內(nèi)，而最終未進入MEDLINE但保留在PubMed中的文獻數(shù)據(jù)。OLDMEDLINEMEDLINEPreMEDLINEEpub ahead of print supplied by publisherPubMed/supplied by publisher未入選數(shù)據(jù)PubMed標引主題詞入選數(shù)據(jù)PubMED形成示意圖檢索區(qū)檢索區(qū)2PubMed-檢索- 基本檢索- Limit限定檢索- MeSH詞檢索（主題檢索）- 檢索史組配檢索- C

5、linical Queries（臨床咨詢模塊）- Single Citation Matcher（單篇引文匹配）PubMed基本檢索- 支持布爾邏輯運算 AND, OR, NOT- 支持截詞檢索*- 支持字段檢索：如liver cancerti- 支持短語檢索 “ ”- 自動詞語匹配(字段限定、詞組、截詞檢索時該功能失效)案例1(自動詞語匹配）請利用PubMed檢索有關結腸造口術后患者的護理的相關文獻。 檢索詞： 結腸造口術-colostomy 護理-nursingcolostomy nursing自動詞語匹配: PubMed對檢索用戶輸入的檢索詞,如果不限定檢索字段,系統(tǒng)依次到MeSH轉換表

6、、刊名轉換表、作者全名轉換表、作者索引表、合作者全名轉換表、合作者轉換表進行詞語的核對、轉換和檢索，如果在上述六個表中都找不到匹配的短語，系統(tǒng)將短語拆開，繼續(xù)到這六個表中搜索，短語斷開部分為AND關系。如果拆到的單詞在上述五個表中還是找不到匹配詞，將到所有字段中去搜索這些單詞，單詞之間的邏輯關系也是AND 。案例2（截詞檢索） 請利用PubMed檢索有關肝移植患者術后生活質量的相關文獻。 檢索詞： 肝移植-liver transplant* 生活質量-quality of lifeliver transplant* quality of life案例3（精確檢索） 利用PubMed檢索有關胎兒

7、染色體異常的產(chǎn)前診斷研究。 產(chǎn)前診斷： Prenatal Diagnosis 胎兒染色體異常：Fetal Chromosomal Abnormalities“Prenatal Diagnosis” “Fetal Chromosomal Abnormalities”案例4（字段檢索）檢索cell雜志上發(fā)表的有關干細胞移植方面的文獻檢索詞：stem cell transplant* cellta常用字段：ti(題名）、 tiab（題名或摘要）、 au（作者）、 1au(第一作者）、lastau(最后一位作者）、ta（刊名）、ad(地址）、all（所有字段）、majr(主要主題詞）、mh（主題詞)P

8、ubMed限定檢索功能：a 字段限定 b 時間限定 c 文獻類型限定 d 語種限定 e 年齡性別限定 f 全文獲取限定 g 檢索子集限定 案例1 作者與文獻語種限定 檢索2002年以來PubMed收錄的葛堅教授發(fā)表的青光眼的中文文獻。檢索詞： 作者：ge jian2002年以后的作者檢索可以用全稱年以后的作者檢索可以用全稱 主題概念：glaucoma Limits：2002-2010 出版年限 Chinese 語種限定 作者檢索tipsw 作者輸入格式:姓前名后,姓用全稱,名字用首字母,姓與名之間不加標點符號。如Michael R, Nash - Nash MRw 自動轉換作者名檢索:輸入Sm

9、ith jau 將檢索出Smith ja,Smith jb,Smith jr等w 作者精確檢索:“ ”將作者名引起來,再加au 如輸入“smith j”au則僅檢索出姓為Smith,名首字母為j的作者的文獻.ge jian glaucoma案例2 文獻時間與類型限定 利用PubMed檢索近十年來干擾素治療多發(fā)性硬化癥的綜述文獻 干擾素interferon beta 多發(fā)性硬化癥multiple sclerosis 限定：last 10 years Revieww 檢索肝移植患者術后生活質量的研究，要求檢索詞出現(xiàn)在篇名中，檢索結果可以獲取全文。 檢索詞：liver transplantation

10、、quality of life 檢索字段： 篇名 限定：link to full text案例3 全文獲取限定Liver transplantation quality of life案例4 文獻子集限定護理類雜志上發(fā)表的有關循證護理研究的文獻 檢索詞：evidence based nursing 檢索字段： MeSH 限定：subset-nursing journalsPubMed-主題詞檢索 PubMed依據(jù)MeSH詞表（醫(yī)學主題詞表）對所收錄數(shù)據(jù)進行主題標引利用主題詞檢索可以提高文獻檢索效率MeSH網(wǎng)絡版本集成在PubMed數(shù)據(jù)庫中案例 檢索有關結腸造口 (colostomy)患者的護

11、理（nursing)的文獻colostomy 主題詞注釋 可組配的副主題詞 主題詞加權與擴展入口詞 主題詞樹主要主題詞限定檢索(加權檢索) 檢索近十年以來PubMed收錄的甘精胰島素治療2型糖尿病的臨床研究文獻。 檢索詞： 甘精胰島素： insulin glargine 2型糖尿?。簍ype 2 diabetes mellitus PubMed-檢索史組配檢索檢索史組配檢索同義詞如2型糖尿病w non insulin dependent diabetes mellitusw NIDDMw Type 2 Diabetes （Mellitus ）w Adult-Onset Diabetes Mel

12、litus w Maturity-Onset Diabetes Mellitus w Stable Diabetes Mellitus w Slow-Onset Diabetes Mellitus w Ketosis resistant diabetes. PubMed-Clinical Queries 為幫助臨床醫(yī)生更有效地獲取PubMed數(shù)據(jù)庫中一般疾病的病因學、預后、診斷、治療及預防等方面的信息，PubMed設置了Clinical Queries功能 。該功能具備特殊的過濾器裝置能將上述主題文獻集中提供檢索。. PubMed-Single Citation Matcher功能功能:輸入題

13、錄信息，查找特定文獻，參考文獻補缺。注意:w 刊名要準確，縮寫要標準w 作者字段第一作者與最后一名作者需用簡寫Example:查找： smithies oliver 發(fā)表在blood第12期上關Hematopoietic stem cells的文獻的篇名、其他作者、頁碼等信息。3 PubMed-檢索結果處理w 檢索結果顯示w 檢索輸出、保存w 全文鏈接：LinkoutSummary：默認格式，包括作者、篇名、出處、相關文獻鏈接Summary (text)：summary的文本形式Abstract：篇名、作者、摘要、出處、主題詞、全文鏈接標記等Abstract（text）： 篇名，作者，摘要，出處MEDLINE：所有記錄字段XML格式、PMID list可通過Display下拉菜單選擇其它顯示方式七種檢索結果顯示格式檢索結果顯示檢索結果輸出、保存剪貼板:Clipboard(臨時保存）注意:w Clipboard(剪貼板)最多只能保存500條w 最多可以保存8小時w 長期保存,應存到myNCBI的collection中全文鏈接-LinkOut4、 PubMed-MyNCBIw 永久保存檢索結果w 保存檢索策略，追課題發(fā)展w 個性化設置永久保存檢索結果注冊登錄注冊登錄檢索數(shù)據(jù)庫PubMed最近的操作保存的文獻保存的檢索策略保存在coll