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文檔簡介
1、按照2011年向前整理:1 .簡述RNA聚合酶II中的CTD序列在轉(zhuǎn)錄過程及轉(zhuǎn)錄后修飾中的作用。解釋:RNA聚合酶II最大亞基末端的竣基端結(jié)構(gòu)域(CTD)是由以七個(gè)氨基酸(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser)為重復(fù)單位的高度保守的重復(fù)序列組成的。主要作用有一下幾個(gè)方面:CTD可以接受轉(zhuǎn)錄因子TFIIH的磷酸化作用,使得RNA聚合酶從PolIIA狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)镻olIIO狀態(tài),最終導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄起始過渡到轉(zhuǎn)錄延伸階段;CTD參與新轉(zhuǎn)錄出的mRNA5端帽子的加工,它可以作為一個(gè)??奎c(diǎn),募集加帽酶中諸如鳥甘酸轉(zhuǎn)移酶、甲基轉(zhuǎn)移酶等,并且這種加工作用在RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄合成出2530個(gè)核甘酸時(shí)便
2、已經(jīng)開始,屬于共轉(zhuǎn)錄過程之一;CTD還參與mRNA5-3間的剪接過程,CTD可以作為剪接體的一個(gè)組裝位點(diǎn),使得剪接因子能夠快速識別mRNA上面的內(nèi)含子序列,介導(dǎo)包括可變剪接在內(nèi)的剪接過程;CTD序列還參與到mRNA多聚腺喋吟核甘酸的合成過程,和加帽過程一樣,CTD也是作為poly(A)聚合酶等酶??康奈稽c(diǎn),從而易于迅速的識別找到聚腺甘酸化信號,并且啟動加尾過程。2 .蛋白質(zhì)合成中是如何保證其翻譯的正確性?解釋:首先起始過程具有具有“第二遺傳密碼”保證機(jī)制。在tRNA的識別過程中,tRNA可以專一的和某一種氨基酸向識別結(jié)合,同時(shí),氨酰tRNA合成酶也具有高度白專一性,氨酰tRNA合成酶的專一性很
3、高,共有20種,每一種只用于單一種氨基酸與相應(yīng)tRNA的結(jié)合;tRNA上的某些結(jié)構(gòu)特征能使它在氨酰tRNA合成酶的催化下,與特定的氨基酸結(jié)合;這些結(jié)構(gòu)特征就是“第二遺傳密碼”(thesecondgeneticcode);第二遺傳密碼”常在tRNA的受體莖(acceptorstem)上,但在其他區(qū)域的也有不少;第二遺傳密碼”較復(fù)雜,且是非簡并的,但專一性同樣很強(qiáng)。在延伸過程中,氨酰tRNA結(jié)合到核糖體的A位中的過程具有校對功能,如錯誤的氨酰tRNA進(jìn)入了A位(反密碼子與密碼子不能很好配對),可進(jìn)行校正,當(dāng)配對正常時(shí),GTP可以水解從而使EF-Tu從A位點(diǎn)離去,但是當(dāng)配對不正常時(shí),GTP將無法水解
4、,于是平衡向著核糖體和GTP-EF-Tu-aa-tRNA三聯(lián)復(fù)合物解離的方向移動,完成校對作用;在終止的過程中,翻譯到達(dá)終止密碼子后,釋放因子及GTP結(jié)合到核糖體的相應(yīng)位點(diǎn),促使肽鏈與tRNA的連結(jié)斷開;接著釋放因子和tRNA從核糖體解離(這一過程需GTP水解);最后,核糖體與mRNA解離,核糖體大小亞基解離。3 .什么是選擇性剪接?具有什么生物學(xué)意義?解釋:定義:一個(gè)基因轉(zhuǎn)錄出來的RNA前體,通過不同的剪接方式(選擇不同的外顯子)而形成不同的成熟mRNA,產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì)。意義:通過選擇性剪接,可對基因的表達(dá)起一定的調(diào)控作用。選擇性剪接常用于在不同的組織或發(fā)育時(shí)期產(chǎn)生組織特異或調(diào)控發(fā)育的蛋白
5、質(zhì);選擇性剪接還可有重要的生物學(xué)效應(yīng),如在果蠅的性決定體系中起重要的作用。4 .簡述乳糖操縱子的組成及其表達(dá)調(diào)控的機(jī)制。解釋:組成:lacZ:-半乳糖昔酶(-galactosidase)基因lacY:半乳糖背透過酶(galactosidepermease基因lacA:半乳糖昔乙?;D(zhuǎn)移酶(galactosidetransacetylase)基因lacI:調(diào)節(jié)基因(regulatorygene)Operator:操縱區(qū)Repressor:阻遏子(阻遏物)Inducer:誘導(dǎo)物(異構(gòu)乳糖,allolactose)調(diào)控機(jī)制:阻遏物的負(fù)調(diào)控機(jī)制:A.當(dāng)沒有乳糖時(shí),阻遏物將阻止啟動子下游的鏈被打開。8.
6、 當(dāng)有乳糖時(shí),inducer(乳糖)將和阻遏物結(jié)合,導(dǎo)致阻遏物無法結(jié)合到啟動子下游的序列。CAP-cAMP的正調(diào)控機(jī)制:A.cAMP在細(xì)胞中的濃度與葡萄糖的含量成反比,它與一種稱為代謝物激活蛋白(cataboliteactivatorprotein,又稱CAP,另一稱呼是環(huán)腺甘酸受體蛋白:cAMPreceptorprotein,CRP)一起,起到正調(diào)控作用。因此,起正調(diào)控作用的是CAP-cAMP。B.乳糖操縱子的啟動子實(shí)際上是一種弱啟動子,其-35box與原核啟動子相應(yīng)的共同序列相差甚大,因此才需要CAP-cAMP進(jìn)行正調(diào)控;如果是強(qiáng)啟動子(與共同序列十分相近),則不需要正調(diào)控,但這種情況會使
7、得即使葡萄糖存在,乳糖操縱子也一樣運(yùn)作。C.通過對有關(guān)突變體進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)CAP-cAMP的結(jié)合位點(diǎn)在啟動子的上游(與啟動子緊密相鄰),該位點(diǎn)稱為激活物位點(diǎn)(activatorsite)。CAP-cAMP結(jié)合到激活物位點(diǎn)后,就會促進(jìn)RNA聚合酶與DNA形成openpromotercomplex(CAP-cAMP能加快closedpromotercomplex的形成,從而提供了更多形成openpromotercomplex的機(jī)會),結(jié)果是促進(jìn)轉(zhuǎn)錄。5 .簡述枯草桿菌色氨酸操縱子的衰減作用機(jī)理。解釋:衰減(弱化)作用指的是p因子非依賴性的終止。在最后的序列中會形成一段強(qiáng)的G-C結(jié)合區(qū)間(單純的RN
8、A之間),然后形成一段A-T弱結(jié)合的相互作用(RNA和DNA之間)。前導(dǎo)區(qū)與弱化子轉(zhuǎn)錄物的第一種較穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)有一終止子(Pindependentterminator),能使弱化作用發(fā)生,轉(zhuǎn)錄終止轉(zhuǎn)錄物的第二種較不穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)沒有終止子,轉(zhuǎn)錄能繼續(xù)色氨酸的多寡決定形成哪一種結(jié)構(gòu)(在轉(zhuǎn)錄與翻譯偶聯(lián)的情況下)。所以我們要注意的是在細(xì)菌中,當(dāng)色氨酸操縱子的前導(dǎo)區(qū)轉(zhuǎn)錄后,便開始了翻譯過程。當(dāng)核糖體到達(dá)色氨酸密碼子后,會出現(xiàn)色氨酸依賴性翻譯受阻和前進(jìn)問題:A.色氨酸缺乏,核糖體不能前進(jìn),翻譯受阻,前導(dǎo)區(qū)與弱化子轉(zhuǎn)錄物只能形成第二種結(jié)構(gòu);結(jié)構(gòu)基因能轉(zhuǎn)錄。B.色氨酸充足,前導(dǎo)肽的翻譯能順利完成,前導(dǎo)區(qū)與弱化子轉(zhuǎn)
9、錄物能形成第一種較穩(wěn)定的結(jié)構(gòu),導(dǎo)致弱化作用發(fā)生。簡而言之,色氨酸操縱子的模型為:1)當(dāng)色氨酸濃度下降時(shí),阻遏蛋白沒有活性,無法和操縱區(qū)相結(jié)合,于是RNA聚合酶可以前進(jìn)。并且,前導(dǎo)肽合成受阻,核糖體結(jié)合在RNA上面,形成1-2,3-4結(jié)合方式(2,3結(jié)合),終止信號不停止,反而繼續(xù)進(jìn)行下去。2)當(dāng)色氨酸濃度上升時(shí),阻遏蛋白有活性,結(jié)合于操縱區(qū),阻止RNA聚合酶和啟動子的結(jié)合。此外,前導(dǎo)肽合成完全,形成1,2-3,4結(jié)合方式,前導(dǎo)肽掉下來,從而使得RNA聚合酶掉下來,合成提前終止。色氨酸操縱子的調(diào)控必須達(dá)成有一定的必要條件:1)轉(zhuǎn)錄與翻譯偶聯(lián),且速率大致相等2)每個(gè)結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物都有其起始密碼
10、子,核糖體從各個(gè)基因的mRNA的起始信號(密碼子)開始翻譯,即結(jié)構(gòu)基因的翻譯與前導(dǎo)序列的翻譯無關(guān)3)細(xì)菌能符合這樣的要求,說明其體系中各組分的協(xié)調(diào)性。.轉(zhuǎn)座的概念和類型解釋:定義:轉(zhuǎn)座因子(transposableelement,TE)是細(xì)胞中能改變自身座位的一段DNA序列,可從復(fù)制子的一個(gè)座位跳躍到另一個(gè)座位,也可從同一個(gè)細(xì)胞的一個(gè)復(fù)制子跳躍到另一個(gè)復(fù)制子,DNA片斷的這種運(yùn)動稱為轉(zhuǎn)座。6 )在細(xì)菌發(fā)現(xiàn)了兩種轉(zhuǎn)座類型:2) A.復(fù)制性轉(zhuǎn)座(replicativetransposition)轉(zhuǎn)座過程有DNA復(fù)制,結(jié)果一個(gè)轉(zhuǎn)座子留在原位,另一個(gè)插入到新的位點(diǎn)B.保守性轉(zhuǎn)座(conservativ
11、etransposition)轉(zhuǎn)座子離開原位置,插入到新的位點(diǎn);這種轉(zhuǎn)座又稱非復(fù)制性轉(zhuǎn)座(nonreplicativetransposition)真核生物中的轉(zhuǎn)座類型:A. 玉米的Ds(dissociation)和Ac(activator)最早發(fā)現(xiàn)(1940s)的轉(zhuǎn)座子,與某些品種的玉米種子上的色斑變化有關(guān)(玉米種子的顏色由C基因編碼的因子造成;若C基因突變,就沒有色素產(chǎn)生,種子幾乎白色;若部分細(xì)胞產(chǎn)生回復(fù)突變,就會在種子上形成顏色斑點(diǎn))。Ac能自行轉(zhuǎn)座,而Ds必須要有Ac的幫助才能轉(zhuǎn)座Ac或Ds插入到功能基因中,就會使該基因失活。Ac與細(xì)菌的轉(zhuǎn)座子相似,約4500bp,兩端有反向重復(fù)序列,中
12、部含有轉(zhuǎn)座酶基因。Ds是Ac的衍生物(功能不全,不能自主轉(zhuǎn)座),有Ds-a、Ds-b、Ds-c3種。B. 反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子(retrotransposons)以RNA作為中介進(jìn)行復(fù)制(轉(zhuǎn)座),與反轉(zhuǎn)錄病毒(retroviruses)的復(fù)制相似,含有編碼反轉(zhuǎn)錄酶的基因,能進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄;酵母中的Tyttransposonyeast)、果蠅中的copia等反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的兩端有LTRs(longterminalrepeats)。7.真核生物轉(zhuǎn)錄延伸過程中染色質(zhì)的變化,目前比較認(rèn)可的模型是怎么樣的?解釋:在轉(zhuǎn)錄過程中(含延伸)的染色質(zhì)變化包括以下幾個(gè)方面:1) 組蛋白對5srRNA基因轉(zhuǎn)錄的影響卵母細(xì)胞5Sr
13、RNA基因的啟動子區(qū)域在體細(xì)胞中具核小體結(jié)構(gòu),因而表達(dá)被抑制;在卵母細(xì)胞中,這些基因的啟動子區(qū)域基本上無核小體結(jié)構(gòu),因此可與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,使基因轉(zhuǎn)錄;轉(zhuǎn)錄因子與組蛋白在啟動子區(qū)處于一種相互競爭的狀態(tài),轉(zhuǎn)錄因子取勝,則基因可轉(zhuǎn)錄;組蛋白取勝,則基因關(guān)閉;實(shí)驗(yàn)表明,若把組蛋白H1除去,則原來在體細(xì)胞不能轉(zhuǎn)錄的卵母細(xì)胞5SrRNA基因也變得可轉(zhuǎn)錄;因此,H1對在啟動子區(qū)域形成穩(wěn)定的核小體結(jié)構(gòu)是必需的。2) 組蛋白對II類基因轉(zhuǎn)錄的影響原則上與III類基因的情況相同;若啟動子區(qū)上有核小體結(jié)構(gòu),則基因不轉(zhuǎn)錄;若沒有核小體結(jié)構(gòu),則可轉(zhuǎn)錄;核小體結(jié)構(gòu)只由核心組蛋白(H2A,H2B,H3,H4)與DNA構(gòu)成時(shí)
14、,即能起到抑制基因轉(zhuǎn)錄的作用,且一般的轉(zhuǎn)錄激活子不能解除這種抑制(這里和III型基因顯著不同,III型基因只要沒有H1就不能夠發(fā)揮作用,而在II類中,H1只是起著更加穩(wěn)固的作用,并且作用可以被激活子抵消);若核小體結(jié)構(gòu)還含有組蛋白H1,那么其抑制基因轉(zhuǎn)錄的能力更強(qiáng),但H1的這種作用可被轉(zhuǎn)錄激活子抵消。3) 核小體定位(nucleosomepositioning)轉(zhuǎn)錄激活子能使核小體結(jié)構(gòu)不在啟動子區(qū)內(nèi)形成,而只在啟動子周圍形成;核小體定位使得啟動子區(qū)成為無核小體區(qū)(nucleosome-freezones),對DNase高度敏感。4) 組蛋白乙?;?histoneacetylation)乙?;?/p>
15、形式是在賴氨酸側(cè)鏈的氨基上加上乙?;唤M蛋白是否乙?;c基因的活性有關(guān),乙?;慕M蛋白對轉(zhuǎn)錄的抑制作用較弱,因?yàn)橐阴;菇M蛋白易從DNA上脫落,從而使核小體結(jié)構(gòu)(染色質(zhì)結(jié)構(gòu))發(fā)生變化;起乙?;饔玫拿甘墙M蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶(histonacetyltransferase,HAT),它能把供體乙酰輔酶A(acetyl-CoA)的乙?;D(zhuǎn)移到核心組蛋白(H2A,H2B,H3,H4);酵母中的組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶還是一種轉(zhuǎn)錄激活子的輔助因子,其他一些轉(zhuǎn)錄激活子的輔助因子也是組蛋白乙酰基轉(zhuǎn)移酶。細(xì)胞核中的組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶(HATA)與細(xì)胞質(zhì)中的組蛋白乙酰基轉(zhuǎn)移酶(HATB)作用不同:HATA能結(jié)合到染色
16、質(zhì)上,使核小體中的核心組蛋白(N端尾部)乙?;?,從而促進(jìn)轉(zhuǎn)錄;HATB是使細(xì)胞質(zhì)中新合成出來的H3和H4乙?;?,從而使它們能正確地組裝到核小體中(它們的乙酰基在組裝后就會被組蛋白去乙?;赋?。5)組蛋白去乙?;?histonedeacetylation)核心組蛋白去乙酰化能抑制轉(zhuǎn)錄。去乙?;山M蛋白去乙?;?histonedeacetylases)催化。組蛋白去乙?;敢c其他轉(zhuǎn)錄抑制因子相互作用,才能在合適的區(qū)域使組蛋白去乙?;?。例如前面講過的甲狀腺受體TR-RXR他是一個(gè)沉默子,它一方面和甲狀腺素應(yīng)答元件(thethyroidhormoneresponseelement,TRE)結(jié)合
17、,一方面和其他因子結(jié)合介導(dǎo)和組蛋白去乙?;附Y(jié)合,介導(dǎo)沉默作用。但是當(dāng)甲狀腺激素和TR-RXR結(jié)合時(shí),會促進(jìn)一系列增強(qiáng)子的作用,介導(dǎo)轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的形成。6) 染色質(zhì)重建(chromatinremodeling,染色質(zhì)改造)組蛋白乙?;€不足以改變核小體核心,還必須重建核小體核心,才能在增強(qiáng)子和啟動子處產(chǎn)生無核小體區(qū),使基因可轉(zhuǎn)錄。至少有4類蛋白質(zhì)參與染色質(zhì)重建:SWI/SNF家族、ISWI家族、NuRD家族、INO80家族。這4類蛋白質(zhì)都能改變核小體核心的結(jié)構(gòu),其中一些蛋白質(zhì)也可能會移動核小體。7) 異染色質(zhì)與基因沉默(silencing)異染色質(zhì)不但能使其內(nèi)的基因沉默,而且使附近的基因也沉默,
18、如端粒位置效應(yīng)(telomerepositioneffect,TPE),即距端粒3kb內(nèi)的基因都沉默。參與形成異染色質(zhì)的蛋白質(zhì):RAP1,SIR2,SIR3,SIR4(silencinginformationregulator,SIR),H3,H4。H4上16位的賴氨酸乙?;茏柚巩惾旧|(zhì)的形成。8)核小體與轉(zhuǎn)錄延伸兩種假說:聚合酶能使核小體結(jié)構(gòu)變得足夠松散,因而不用除去核小體也能前進(jìn);聚合酶前進(jìn)時(shí),能把遇到的核小體移動位置,因而轉(zhuǎn)錄后,所有核小體的位置都發(fā)生了改變。事實(shí)表明,第二種假說是正確的,且在轉(zhuǎn)錄后,核小體一般是被后移了(移到聚合酶后)。8) RNA轉(zhuǎn)錄后加工有哪些?解釋:1) RN
19、A剪接:斷裂基因;核mRNA前體的剪接;A. 自剪接的內(nèi)含子;I類內(nèi)含子;II類內(nèi)含子;tRNA剪接主要是核tRNA內(nèi)含子的剪接;2)加帽和聚腺甘酸化;3)rRNA與tRNA的加工;rRNA的加工(真核和原核有所不同,主要表現(xiàn)在使用的酶不同);tRNA的加工;A.真核和原核有所不同,主要是由于原核是多順反子引起;B.真核和原核的tRNA5端的加工成熟都需要RnaseP的參與;C.真核和原核的tRNA3端的加工都需要6中Rnase的參與:RnaseD/BN/T/PH/II和PNPase,其中PNPasaRnasePH和RnaseT最重要。5) 4)反式剪接RNA編輯;RNA干擾(干涉/沉默)一一
20、轉(zhuǎn)錄后基因沉默。9.比較原核生物和真核生物翻譯起始、延伸和終止的異同A起始的異同:相同點(diǎn):1)都需要tRNA識別氨基酸并裝載;2)都需要核糖體大小亞基解離;3)都需要起始因子。不同點(diǎn):1)起始tRNA攜帶的氨基酸不同,原核是甲酰甲硫氨酸,而真核是甲硫氨酸;2)原核中甲酰甲硫氨酸識別的起始密碼子有三種AUG/GUG/UUG,而甲硫氨酸只識別AUG;3)原核中不需要通過掃描尋找起始密碼子,而真核中需要掃描尋找起始密碼子;4)原核中需要SD序列幫助mRNA與小亞基結(jié)合,而真核沒有SD序列,需要5端帽子引導(dǎo)兩者結(jié)合;5)原核中起始因子比較簡單,種類少,而真核中起始因子要復(fù)雜的多,種類也多;6)原核中起
21、始的控制是通過mRNA二級結(jié)構(gòu)影響起始和反饋控制,而真核中通過起始因子磷酸化來控制。7)原核中的mRNA上有兩個(gè)以上的可讀框(ORF),為多順反子,而真核生物的一條mRNA上面只有一個(gè)ORF;8)原核翻譯速度快,而真核翻譯速度慢,但是可以有多個(gè)核糖體結(jié)合在上面進(jìn)行同時(shí)翻譯。B延伸過程:兩者相似都包括進(jìn)位、轉(zhuǎn)肽、移位,都需要延伸因子和GTP,只是延伸因子不同。C終止過程:終止過程也相似:都需要釋放因子和一些相關(guān)的蛋白質(zhì)參與。.啟動子在基因內(nèi)的基因如何進(jìn)行轉(zhuǎn)錄具有內(nèi)部啟動子的在真核生物中主要為III類轉(zhuǎn)錄因子參與的轉(zhuǎn)錄。在III類轉(zhuǎn)錄因子中有三種重要的轉(zhuǎn)錄因子:TFIIIA和B和CoTFIIIC結(jié)
22、合到基因內(nèi)部的啟動子中(如果是5SrRNA基因,則先有TFIIIA結(jié)合到啟動子區(qū)),再幫助TFIIIB結(jié)合到啟動子上游區(qū)(轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游),而TFIIIB則幫助PolIII結(jié)合在起始位點(diǎn)周圍。TFIIIB里面有TBP。轉(zhuǎn)錄開始后,TFIIIC(或TFIIIA和C)被除去,而TFIIIB留在原位,可促進(jìn)另一輪的轉(zhuǎn)錄。.組蛋白乙?;瘜蜣D(zhuǎn)錄的影響主要作用是促進(jìn)轉(zhuǎn)錄的進(jìn)行。乙酰化的形式是在賴氨酸側(cè)鏈的氨基上加上乙酰基;組蛋白是否乙酰化與基因的活性有關(guān),乙?;慕M蛋白對轉(zhuǎn)錄的抑制作用較弱,因?yàn)橐阴;菇M蛋白易從DNA上脫落,從而使核小體結(jié)構(gòu)(染色質(zhì)結(jié)構(gòu))發(fā)生變化;起乙酰化作用的酶是組蛋白乙?;D(zhuǎn)移
23、酶(histonacetyltransferase,HAT),它能把供體乙酰輔酶A(acetyl-CoA)的乙?;D(zhuǎn)移到核心組蛋白(H2A,H2B,H3,H4);酵母中的組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶還是一種轉(zhuǎn)錄激活子的輔助因子,其他一些轉(zhuǎn)錄激活子的輔助因子也是組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶。細(xì)胞核中的組蛋白乙酰基轉(zhuǎn)移酶(HATA)與細(xì)胞質(zhì)中的組蛋白乙?;D(zhuǎn)移酶(HATB)作用不同:HATA能結(jié)合到染色質(zhì)上,使核小體中的核心組蛋白(N端尾部)乙?;?,從而促進(jìn)轉(zhuǎn)錄;HATB是使細(xì)胞質(zhì)中新合成出來的H3和H4乙?;?,從而使它們能正確地組裝到核小體中(它們的乙酰基在組裝后就會被組蛋白去乙?;赋ィ?。10 .RNA編輯的機(jī)
24、制?RNA與中心法則的關(guān)系?機(jī)制:基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的mRNA分子中,由于核甘酸的缺失,插入或置換,基因轉(zhuǎn)錄物的序列不與基因編碼序列互補(bǔ),使翻譯生成的蛋白質(zhì)的氨基酸組成,不同于基因序列中的編碼信息,這種現(xiàn)象稱為RNA編輯。簡單來說就是指mRNA加U或減U。編輯的機(jī)制為:在轉(zhuǎn)錄后進(jìn)行,沿3-5方向進(jìn)行,由gRNA(guideRNA,向?qū)NA)指導(dǎo)進(jìn)行;一些gRNA由大環(huán)的某些區(qū)域編碼,另一些gRNA由小環(huán)編碼;大部分gRNA80ntoRNA與中心法則的關(guān)系:遺傳信息從DNA傳遞給信息RNA的轉(zhuǎn)錄;在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下,以RNA為模板合成DNA;以RNA為模板合成蛋白質(zhì),體現(xiàn)生物性狀;以RNA為模板復(fù)制
25、RNA(如某些只有RNA的病毒).簡述基因組學(xué)的幾個(gè)分支基因組學(xué)是把基因組作為研究對象的學(xué)科:1) 結(jié)構(gòu)基因組學(xué)(structuralgenomics)基因組結(jié)構(gòu)(genomestructure)定位基因(genemapping)2) 測定基因組全序歹U(whole-genomesequencing)功能基因組學(xué)(functionalgenomics)大規(guī)模、高通量分析基因組中基因表達(dá)的技術(shù)基因功能的分析3)進(jìn)化基因組學(xué)(evolutionarygenomics)在整體水平上研究基因和基因組的結(jié)構(gòu)、功能的起源與進(jìn)化;比較基因組學(xué)(comparativegenomics-進(jìn)化基因組學(xué)的初始階段;
26、通過比較,發(fā)現(xiàn)基因組中蛋白質(zhì)和功能RNA基因的密度與生物的復(fù)雜程度有一定的負(fù)相關(guān)。14 .與類核基因組(原核基因組)相比,核基因組在結(jié)構(gòu)上有什么特點(diǎn)?類核基因組:環(huán)狀,較??;通常由單拷貝或低拷貝(low-copy)的DNA序列組成;基因排列緊密,較少非編碼序歹Ustreamlined”核基因組:多線狀;大小一般要比類核基因組大好幾個(gè)數(shù)量級,且變化范圍很大;有大量的非編碼序列(重復(fù)序列、內(nèi)含子等),內(nèi)含子是基因中的插入序列。真核生物的genomesize一般要比原核生物的大很多,且變化范圍也很大(最大/最小可達(dá)8萬);真核生物基因組存在C值佯謬現(xiàn)象(基因組中基因數(shù)目與基因組大小無關(guān))。.簡述增強(qiáng)
27、子的作用機(jī)制增強(qiáng)子:能增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄的元件,但又不是啟動子的一部分(無位置、方向的限制)增強(qiáng)子常在啟動子的上游,但也可以在基因內(nèi)部(如內(nèi)含子中)。增強(qiáng)子的遠(yuǎn)距離作用:激活子是使增強(qiáng)子能遠(yuǎn)距離作用的原因。4種可能性(第三、四種可能性較符合實(shí)際情況)Coiling(changeintopology)超螺旋Sliding滑行Looping成環(huán)Facilitatedtracking(loopingandtracking)異化追蹤。遠(yuǎn)距離增強(qiáng)子元件的成環(huán)作用機(jī)制。15 .tRNA的轉(zhuǎn)錄后加工有哪些?tRNA加工:真核和原核加工的不同點(diǎn):1)在真核生物中,tRNA前體含單個(gè)tRNA分子,兩端有額外的序列,其加工
28、是要除去這些額外的序列2)在原核生物中,tRNA前體含1至多個(gè)tRNA分子,或與rRNA前體混在一起,故其加工首先要把含單個(gè)tRNA分子的片段切割出來(由RNaseIII負(fù)責(zé)),然后再除去5及3端額外的序列真核與原核加工的相同點(diǎn):1)真核生物與原核生物tRNA5端的加工成熟由RNaseP負(fù)責(zé),一次切割即除去5端的額外的序列RNaseP含有2個(gè)亞基,一個(gè)是RNA(M1RNA,125kD),另一個(gè)是蛋白質(zhì)(14kD),而起催化(酶切)作用的是RNA這個(gè)亞基。2)真核生物與原核生物tRNA3端的加工成熟有6種RNase參與RNaseDRNaseBNRNaseTRNasePHRNaseIIPNPase
29、(polynucleotidephosphorylase,多核甘酸磷酸化酶)PNPasaRNasePH和RNaseT最為重要。tRNA剪接:核tRNA內(nèi)含子:內(nèi)含子較小(10bp左右),且只有1個(gè),一般在相應(yīng)于反密碼子的堿基附近(與反密碼子的3端隔1個(gè)核甘酸)tRNA剪接(tRNAsplicing)的步驟:分2步進(jìn)行,需要tRNA內(nèi)切酶及RNA連接酶的參與Step1:由剪接內(nèi)切酶把內(nèi)含子切除Step2:由RNA連接酶把兩個(gè)外顯子連接起來17.真核mRNA5帽子和3pol(A)的功能帽子分步合成:首先,RNA三磷酸酯酶將mRNA末端的磷酸集團(tuán)去掉,然后鳥昔轉(zhuǎn)移酶水解GTP在此末端加上GMP,接著
30、兩個(gè)甲基轉(zhuǎn)移酶分別將鳥昔第7位的N和倒數(shù)第二個(gè)堿基的2-OH甲基化。帽子功能:(1)保護(hù)mRNA:一般的RNase不能切割含有3個(gè)磷酸基的帽子;(2)提高翻譯能力(增加mRNA的可譯性):通過與帽子結(jié)合蛋白結(jié)合,mRNA能更好地進(jìn)入核糖體;(3)有利于mRNA在細(xì)胞內(nèi)的運(yùn)輸(運(yùn)出細(xì)胞核):若沒有帽子,則mRNA基本上留在細(xì)胞核;(4)使mRNA前體能正確剪接:第一個(gè)內(nèi)含子的剪接所需。多聚腺甘酸化功能:(1)保護(hù)mRNA,延長其壽命(半衰期);(2)提高mRNA的翻譯能力,能與poly(A)結(jié)合蛋白poly(A)bindingproteinI結(jié)合,促進(jìn)翻譯,促進(jìn)mRNA與核糖體結(jié)合。多聚腺甘酸化的發(fā)生需要前體mRNA的剪切和在剪切處的多聚腺甘酸化,polyA和polyn的CTD等參與。(3)促進(jìn)最后一個(gè)內(nèi)含子的切除。18 .
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