分子生物學(xué)試驗(yàn)常用工具酶總結(jié)_第1頁(yè)
分子生物學(xué)試驗(yàn)常用工具酶總結(jié)_第2頁(yè)
分子生物學(xué)試驗(yàn)常用工具酶總結(jié)_第3頁(yè)
分子生物學(xué)試驗(yàn)常用工具酶總結(jié)_第4頁(yè)
分子生物學(xué)試驗(yàn)常用工具酶總結(jié)_第5頁(yè)
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1、分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)常用工具酶總結(jié)現(xiàn)代分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)手冊(cè)工具酶基因工程:在人工可以控制條件下,將基因剪切或重新組合,再導(dǎo)入另一生物體內(nèi),使這些基因在其中表達(dá)并遺傳下去的一門(mén)技術(shù)。核心:對(duì)基因進(jìn)行人工切割、連接和重新組合,構(gòu)建重組DNA。工具酶:在基因工程的重組DNA過(guò)程中,所需要用到的酶的統(tǒng)稱(chēng)。一、限制性?xún)?nèi)切酶(restrictionendonuclease)主要功能:對(duì)外源性的雙鏈DNA進(jìn)行切割、水解,不允許外源性DNA存在于細(xì)菌自身細(xì)胞內(nèi)。(這種酶能對(duì)在自身細(xì)胞內(nèi)存在的DNA種類(lèi)給予限制限制性?xún)?nèi)切酶)限制-修飾系統(tǒng):合成限制性?xún)?nèi)切酶的細(xì)胞,其自身的DNA不受酶的切割,這是因?yàn)榧?xì)菌細(xì)胞還會(huì)合成一種

2、修飾酶,可以對(duì)自身DNA進(jìn)行修飾,即改變DNA原來(lái)具有的可以被限制性?xún)?nèi)切酶識(shí)別的核酸順序結(jié)構(gòu),從而不被限制性?xún)?nèi)切酶識(shí)別及切割、水解。保護(hù)自身遺傳物質(zhì)穩(wěn)定的機(jī)制。限制性?xún)?nèi)切酶:從原核生物中發(fā)現(xiàn)的,約600種,可識(shí)別108種不同的特定DNA順序。以?xún)?nèi)切方式水解核酸鏈中的磷酸二酯鍵,產(chǎn)生DNA片段的5'端為P,3'端為-OH。命名:獲得該酶的細(xì)菌屬名的第一個(gè)字母(大寫(xiě))+該菌種名的前兩個(gè)字母(小寫(xiě))+株系的字母(小寫(xiě))或數(shù)字+羅馬數(shù)字(同一株菌種不同內(nèi)切酶的編號(hào))彳列:細(xì)菌屬名細(xì)菌種名菌株名稱(chēng)限制酶名稱(chēng)ArthrobacterluteusAluIEscherichiacoliRY13

3、EcoRIBacillusamyloliquefaciensHHamHIHaemophilusinfluenzaeRdHindIII(一)三種常用內(nèi)切酶I型限制性?xún)?nèi)切酶同時(shí)兼有切割DNA的功能和修飾酶的修飾功能。在酶的識(shí)別位點(diǎn)上,若DNA兩條鏈菌沒(méi)有發(fā)生甲基化,則行使內(nèi)切酶的功能,對(duì)DNA進(jìn)行切割,同時(shí)轉(zhuǎn)變成ATP酶。若DNA雙鏈中有一條鏈已發(fā)生甲基化,則此類(lèi)酶顯示修飾酶的作用,對(duì)另一條DNA進(jìn)行甲基化修飾,然后在行切割功能。(實(shí)際上,有內(nèi)切酶、修飾酶、ATP酶及解旋酶四種功能)I型限制性?xún)?nèi)切酶在DNA鏈上的識(shí)別位點(diǎn)和切割位點(diǎn)不一致,也不固定沒(méi)有時(shí)間應(yīng)用價(jià)值。1. DNA甲基化:DNA化學(xué)修飾

4、的一種形式,能在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現(xiàn)(外遺傳機(jī)制)。多發(fā)生于CpG二核昔序列上(在甲基轉(zhuǎn)移酶的催化下,DNA的CG兩個(gè)核甘酸中的胞口密呢被選擇性添加甲基,形成5-甲基胞喀呢)。甲基化位點(diǎn)可隨DNA的復(fù)制而遺傳(DNA復(fù)制后,甲基化酶可將新和成的未甲基化的位點(diǎn)進(jìn)行甲基化)。DNA甲基化可引起基因組中相應(yīng)區(qū)域染色質(zhì)結(jié)構(gòu)變化,使DNA失去限制性?xún)?nèi)切酶的切割位點(diǎn),以及DNA酶的敏感位點(diǎn),使染色質(zhì)高度螺旋化,凝縮成團(tuán),失去轉(zhuǎn)錄活性?!縄II型限制性?xún)?nèi)切酶具有內(nèi)切酶和甲基化修飾酶作用。2. 具有專(zhuān)一的識(shí)別順序,其切割位點(diǎn)在識(shí)別順序旁邊的幾個(gè)核甘酸對(duì)的固定位置上。(可識(shí)別短的不對(duì)稱(chēng)序列,切

5、割位點(diǎn)與識(shí)別序列約距2426bp)|型限制性?xún)?nèi)切酶也具有限制-修飾系統(tǒng),但由限制酶和修飾酶這兩種不同的酶共同來(lái)執(zhí)行這一系統(tǒng)的功能。即II型限制性?xún)?nèi)切酶有在識(shí)別位點(diǎn)的切割功能,而不具備甲基化修飾活性,修飾作用由相應(yīng)的修飾酶完成。兩種酶識(shí)別同一DNA特定序列,卻發(fā)揮不同作用。能識(shí)別雙鏈DNA的特異順序,并在該順序內(nèi)的固定位置上進(jìn)行切割,產(chǎn)生特異的DNA片段。II型限制性?xún)?nèi)切酶的識(shí)別位點(diǎn)和切割位點(diǎn)是專(zhuān)一和固定的,對(duì)相同的基因片段的切割,總是得到同樣核甘酸順序的小DNA片段。這些切割后的不同大小的DNA片段,可以與統(tǒng)一內(nèi)切酶切割后的來(lái)源不同的其他DNA片段實(shí)行連接,而構(gòu)建重組DNA基因工程技術(shù)的核心I

6、I型限制性?xún)?nèi)切酶識(shí)別的專(zhuān)一核甘酸順序,最常見(jiàn)的是46個(gè)堿基對(duì)。II型限制性?xún)?nèi)切酶的識(shí)別順序是一個(gè)回文對(duì)稱(chēng)順序(反轉(zhuǎn)重復(fù)順序),具有180°的旋轉(zhuǎn)對(duì)稱(chēng)性。識(shí)別順序有一個(gè)中心對(duì)稱(chēng)軸,從這個(gè)軸朝兩個(gè)方面讀序都是相同的。這類(lèi)酶切割DNA可有兩種形式。交錯(cuò)切割方式:如:5,GAATTCT3,CTTAAG7,tHcoRII5T-<AATTC-3?y-CTTAAG,T又如:jS'CTCGAGm3"G4GCTC5'*1今JI產(chǎn)生4個(gè)核君醪酬的丁潞M抹端r-CTCGAG-y3"GAGCTC-5'每種酶切割后個(gè)產(chǎn)生兩個(gè)DNA片段,每一個(gè)片段個(gè)含有一個(gè)單鏈

7、末端,單鏈末端是互補(bǔ)的,可以通過(guò)形成“氫鍵”而黏合。不同來(lái)源的兩條DNA片段經(jīng)同一種酶切割后,產(chǎn)生互補(bǔ)的黏性末端,通過(guò)選擇合適的DNA鏈接,可將兩條異源性DNA片段組合在一起。一一重組DNA的最基本原理用選擇專(zhuān)一性不同而產(chǎn)生相同黏性末端的兩種酶切割兩條不同的DNA片段,可使重組后的DNA片段不再被原來(lái)的酶所切割。如:SalI酶切割后產(chǎn)生的黏性末端st,XhoI酶切割后產(chǎn)生的黏性末端TCGAC+'3'51-GTCGAGTCT"兩者經(jīng)連接酶連接產(chǎn)生的序列3,cmcTOT,既不被SalI酶切割,也不被XhoI酶切割。在質(zhì)粒改造上很有用在同一位置上切割DNA5(鏈,產(chǎn)生平頭末

8、端。如:1CGCC-353'CCGC5nTRea口嚼SL-GGcc-r3CCGG5n(二)其他類(lèi)型內(nèi)切酶1.同工酶(Boschizomer):來(lái)源不同的兩種II型內(nèi)切酶,它們識(shí)別核甘酸順序及切割位點(diǎn)都相同,差別只在于當(dāng)識(shí)別核甘酸序列中有甲基化的核甘酸時(shí),一種內(nèi)切酶可以切割,而另一種不能。如:HpaII和MspI識(shí)別順序都是5,CCGG3若其中有5-甲基胞口密嗟)則只有Msp酶可切割(GGmCC)。2.Subset酶:識(shí)別順序及切割位點(diǎn)相互有關(guān)的酶,互稱(chēng)Subset酶。如:SamI酶所識(shí)別的6個(gè)核甘酸順序中含有HpaII酶識(shí)別的4個(gè)核甘酸順序。所以這兩個(gè)酶可以相互代替使用,它們所切割的D

9、NA片段可以相互連接。3 .可變酶(特殊的):識(shí)別核甘酸順序一般都大于6個(gè),但其中一個(gè)或幾個(gè)核昔酸時(shí)可以變化的。.遠(yuǎn)距離切割酶:識(shí)別核甘酸順序的位置與切割的位點(diǎn)不一致,一般切割位點(diǎn)與指標(biāo)核甘酸順序的位置之間有10個(gè)左右核甘酸的距離。與I型內(nèi)切酶相似,不過(guò)I型內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)與切割位點(diǎn)的距離更遠(yuǎn)一些。(三)甲基化酶(不屬于內(nèi)切酶)使識(shí)別順序中的某個(gè)核甘酸發(fā)生甲基化,保護(hù)DNA不被限制性?xún)?nèi)切酶切開(kāi)。M5C(5-甲基胞喀噬)大多數(shù)以M5CpG的形式存在,即CpG島中的C最容易是甲基化的底物,而甲基化又與受之調(diào)控的基因的表達(dá)程度有關(guān)。因此,研究CpG島的甲基化是研究基因調(diào)控的一個(gè)重要方向。當(dāng)甲基化酶和限

10、制性?xún)?nèi)切酶共同使用時(shí),常??梢允褂卸鄠€(gè)識(shí)別位點(diǎn)的內(nèi)切酶只對(duì)其中一個(gè)識(shí)別位點(diǎn)有切割效果,其他位點(diǎn)因被甲基化酶修飾而不能被切割。5-CPvCG?uG-3*如:限制性?xún)?nèi)切酶Aval的識(shí)別順序是'等Py可以是任何一種喀呢,pu可以是任何一種喋吟。因此可以有4種識(shí)別順序。如果同時(shí)使用甲基化酶Taql和甲基化酶HpaH,則AvaI的識(shí)別順序?qū)⒅皇?'CCCGAG3'。E:二y-AGCnXCCOOACwTTTTCOCeGGAC-a,-I.;JSLCTQGtNTTmxAjUXCCTC'T匚ch.nuc«,nT7*cTCGAnGCGCC<XGMTTTTCCCGCC

11、AG-I'r-tcgacutccgcutcgwtcthaamxmx工ctc*'1Af*CH,i-AGtTCGOCCCC.4C-.k-TTACC'I*x.r(TljGCCTCH.3.(IX,ACXTTTTCC"CCt;3lC-ftnvuAGXmTCH,事安,*mwmih*t的配X-庠BRJUMrniNfF£FtG*TT申%等的獻(xiàn)瓶噬序術(shù)一sa7如上圖,一個(gè)基因片段被AvaI酶切割時(shí),片段中有三個(gè)AvaI酶識(shí)別順序,該片段被切割成4個(gè)片段。但若先用TaqI甲基化酶和HpaII甲基化酶作用該片段時(shí),片段中某些核甘酸發(fā)生甲基化修飾而不能被切割,再用AvaI酶

12、切割時(shí),只能被切割成兩個(gè)片段。【一甲基化酶對(duì)DNA的某位點(diǎn)進(jìn)行甲基化修飾,進(jìn)而抵御內(nèi)切酶的切割一一構(gòu)建重組質(zhì)粒】(四)與內(nèi)切酶相關(guān)的幾個(gè)概念1 .酶活性單位及標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系酶活性單位:在一定溫度、PH及離子強(qiáng)度下,1h內(nèi)完全酶解(切割)特定底物DNA,所需限制內(nèi)切酶的量。(底物DNA:多用人噬菌體DNA又是可以用某一種酶在入噬菌體DNA上的切割位點(diǎn),來(lái)推算用這種酶切割這種DNA時(shí)所需的活性單位。)2 標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系:在50M反應(yīng)體系及指定溫度下,使用特定的緩沖體系,用1個(gè)活性單位的限制內(nèi)切酶,酶解1聞底物DNA反應(yīng)1個(gè)小時(shí)。(若底物比1四多或少,可參照標(biāo)準(zhǔn)體系比例增加或減少酶用量。但增加酶用量時(shí),

13、需注意不可加量過(guò)多一一內(nèi)切酶中通常含有甘油防凍劑,加入酶量過(guò)多,其中的甘油會(huì)降低內(nèi)切酶識(shí)別順序的特異性。也可通過(guò)延長(zhǎng)反應(yīng)時(shí)間來(lái)保證完全的酶切。).星號(hào)活力限制性?xún)?nèi)切酶在非標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)條件下,切割一些與特異性識(shí)別順序相類(lèi)似的順序活性(該酶的第二活性)。(產(chǎn)生許多不想得到的片段;內(nèi)切酶的識(shí)別切割能力下降,識(shí)別特異性下降。)引起星號(hào)活力的因素:過(guò)高的甘油含量(5為;低鹽離子強(qiáng)度(25mmol/L);高PH值(8.0);含有有機(jī)溶劑;含有非Mg二價(jià)離子;酶量過(guò)大(酶解1聞底物DNA用的內(nèi)切酶大于100個(gè)活性單位)。3 .限制性?xún)?nèi)切酶底物位點(diǎn)優(yōu)勢(shì)效應(yīng)限制性?xún)?nèi)切酶對(duì)同一DNA片段切割時(shí),在對(duì)其可以識(shí)別的位點(diǎn)上

14、表現(xiàn)出不同的切割速率的現(xiàn)象。4 .限制性?xún)?nèi)切酶質(zhì)量有良好的酶活性;不存在任何其他核酸內(nèi)切酶和外切酶的污染;長(zhǎng)時(shí)間的酶切反應(yīng)不發(fā)生識(shí)別順序特異性的降低;被某一酶切割后的DNA經(jīng)重新連接后,仍能被同一酶再次識(shí)別并再次切割。內(nèi)切酶質(zhì)量的鑒定:50M反應(yīng)體系中以等量?jī)?nèi)切酶分別以1h和12h(過(guò)夜)時(shí)間來(lái)切割底物DNA,用凝膠電泳檢查酶切結(jié)果。若不出現(xiàn)條帶數(shù)目的差別,則內(nèi)切酶質(zhì)量好。在T4DNA連接酶作用下,重新連接被內(nèi)切酶切割后的DNA片段,再用同一酶切割,若所產(chǎn)生的DNA片段的大小和數(shù)目和第一次切割的結(jié)果完全一樣,則說(shuō)明酶的質(zhì)量好。一一可鑒定是否混有其他內(nèi)切酶和磷酸脂酶(DNA被內(nèi)切酶切割后,只有各

15、個(gè)片段的3OH和5P基團(tuán)完好才能再次連接,連接的DNA仍能提供同一酶的相同切割位點(diǎn),才會(huì)出現(xiàn)上面所說(shuō)的兩個(gè)完全相同的結(jié)果。)二、DNA重組常用的其他酶類(lèi)(一)DNA聚合酶(DNApolymerase)將一個(gè)脫氧三磷酸核甘酸加到引物(primer)的3-OH上,再釋放出一個(gè)焦磷酸分子(ppi)。1 .大腸桿菌DNA聚合酶(EcoliDNApolymerase)聚合酶I、II、III聚合酶I、II主要參與DNA修復(fù),III主要參與DNA復(fù)制。三種都有沿模板按5'e方向合成互補(bǔ)DNA鏈的活性和按3'S'向的外切酶活性。聚合酶I還有5'e'向的外切酶活性。5&#

16、39;一3'聚合酶活性:填補(bǔ)DNA鏈上的缺口,或參與修復(fù)DNA合成過(guò)程中切除RN用|物后留下的空缺部分。3'-5'外切酶活性:消除在聚合作用中摻入的錯(cuò)誤核甘酸。5'-CGCAICT3;GCGMg24鬃合酶1¥CGC3sGCGdAMPmn>dCMP5'一3'外切酶活性:切除受損的DNA?分一即門(mén)CGCATCTAG小3;GCGTAGATC5二聚合酶15,CATCTAG31.公明3:GCGTAGATC-5Z四螞【切口平移:切口產(chǎn)生3'羥基和5'磷酸基團(tuán),被小片段降解,缺口位點(diǎn)沿著雙鏈向3'端移動(dòng),射性標(biāo)記核甘酸的

17、技術(shù)。duplexDftA.duplex;0IMAconiriiriinanickMftha3'OH中§位0byI861件Aevefjgjlfiucsfitter#af<?mewed1re>mtfie5"s&oiIherwekby¥-3rexoinudeaseacliEyc>lE.sJofiDMApatyrmrdsI麗Id:nudQ!iClosir&pk»»dbyinccrporator占laba-odhudM4«s>byE.口NApdyneraseiRepeli1iOHcJarcire

18、st*mtransEocnionH巾crocJcandu-niformabellng*1meSyrttiWSiZfid>MAgtrsndiKlenow酶:大腸桿菌DNA聚合酶I(109000Da)經(jīng)舒替蘭酶(枯草桿菌蛋白酶)水解獲得的76000Da片段。具有5'3'聚合酶活性和3'5'外切酶活性??捎糜谔钛a(bǔ)DNA單鏈末端成為雙鏈??捎糜诤铣蒫DNA第二鏈。<若將單核甘酸標(biāo)記放射性核素,則可是合成的DNA雙鏈上帶上放射性核素標(biāo)記。可用此酶通過(guò)切口平移來(lái)進(jìn)行探針的放射性核素標(biāo)記>DNA延伸合成3'端,5'端是在體外向DNA分子引入放

19、當(dāng)雙鏈DNA分子的一條鏈上產(chǎn)生切口時(shí),E.coli聚合酶I就可以將核普酸連接到切口的3,-OH末騎。2 .噬菌體DN隙合酶T4DNA聚合酶,也具有5'3'聚合酶活性和外切酶活性。外切酶活性比大腸桿菌DNAIK合酶外切酶活性強(qiáng)200倍。可用于探針的放射性核素標(biāo)記。3 .噬熱水牛菌DN隙合酶從噬熱水生菌ThemusaquaticusYT-1菌株中分離得到。耐熱其中TaqDN咪合酶使用最多。7075C生物活性最高。在7580C條件下,每個(gè)酶蛋白分子每秒可以延長(zhǎng)150個(gè)核甘酸一一被廣泛應(yīng)用于體外擴(kuò)增特異性DNA>t段的技術(shù)(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),PCR(二)RN咪合酶能利用DNAf乍為

20、模板,催化四種核糖核甘三磷酸(NTP底物合成RNAI:核仁中,轉(zhuǎn)錄rRNA順序RNAII:細(xì)胞質(zhì)中,轉(zhuǎn)錄大多數(shù)基因(蛋白質(zhì)基因和部分核內(nèi)小RNA基1I聚合因),轉(zhuǎn)錄是需要“TATA框(酶開(kāi)始結(jié)合的位置,啟動(dòng)子,II型轉(zhuǎn)錄單位特有的)。III:細(xì)胞核質(zhì)中,轉(zhuǎn)錄tRNA5SrRNA基因等少數(shù)幾個(gè)基因。(核質(zhì):由單一密閉環(huán)狀DNA分子反復(fù)回旋卷曲盤(pán)繞組成的松散網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。無(wú)核膜、核仁)(三)DNA!接酶一一基因工程比用的工具酶T4DNA連接酶(T4DNAligase)Mg2+依賴(lài)性酶催化雙鏈DNAh具有相鄰的3'羥基和5'磷酸末端單鏈缺口的修復(fù),以及具有黏性末端或平端的DNAt段的端端

21、連接的酶。DN啦接既可發(fā)生在DN砌子之間,也可發(fā)生在分子內(nèi)部。高濃度的DNA末端有利于分子間連接,低濃度則有利于環(huán)狀DN砌子的形成。DN啦接酶只能連接雙鏈DNAW不能連接單鏈DNA(四)反轉(zhuǎn)錄酶(逆轉(zhuǎn)錄酶,reversetranscriptase)以RNAJ模板指導(dǎo)三磷酸脫氧核甘酸合成互補(bǔ)DNA(cDNA的酶。需要Mg+、Mn+作為輔助因子I反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)SscDNA1反轉(zhuǎn)錄誨、DNA聚合馥以RNA為模板時(shí),在反轉(zhuǎn)錄酶作用下,先合成單鏈DNA(ssDNA。再在反轉(zhuǎn)錄酶和DN咪合酶I作用下,以單鏈DNAJ模板合成“發(fā)夾”型的雙鏈DNA(dsDNA)odscDMA1核窿-51dsDNA,VJA最后在核酸

22、酶S1作用下,切割成兩條單鏈DNA反轉(zhuǎn)錄酶可用來(lái)把任何基因的mRNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA拷貝,然后可大量擴(kuò)增插入載體后的DNA。可用來(lái)標(biāo)記cDNA作為放射性的分子探針。(五)核糖核甘酸A(RNaseA,ribnucleaseA)核酸內(nèi)切酶。特異的攻擊RNA上喀呢殘基的3'端,切割與相鄰核甘酸形成的磷酸二酯鍵,產(chǎn)生3'-磷酸喀噬核甘酸和以3'-磷酸喀嚏核甘酸結(jié)尾的寡核昔峻(一類(lèi)只有20個(gè)以下堿基的短鏈核甘酸的總稱(chēng)。寡核甘酸可以很容易地與它們的互補(bǔ)對(duì)鏈接,所以常用作探針確定DNA或RNA的結(jié)構(gòu))。高濃度時(shí),可對(duì)單鏈RNA的任何位點(diǎn)進(jìn)行切割;低濃度時(shí),只切割C和U的位點(diǎn)。一一檢測(cè)

23、寡核甘酸片段中是否含有C和U。有顯著的細(xì)胞毒性。RNaseA可用于檢測(cè)基因突變:利用RNA探針與突變基因形成RNA-DNA雜交體時(shí),突變點(diǎn)處不能產(chǎn)生堿基互補(bǔ)(局部單鏈)這一特點(diǎn),用RNaseA進(jìn)行切割,切割產(chǎn)物可通過(guò)跑變性膠得到分離,可用放射自顯影等其他方法檢查片段數(shù)目及大小,從而推知發(fā)生突變的位點(diǎn)。RNA探針可通過(guò)將相應(yīng)的DNA片段克隆至含有SP6或T7啟動(dòng)子的載體中得到。在操作RNA的實(shí)驗(yàn)時(shí)一定要戴口罩和手套(RNaseA存在非常廣泛,人唾液、汗液中均含有),以避免有RNase的污染,所用的容器及蒸儲(chǔ)水也都必須經(jīng)去RNase處理。【用DEPC處理:0.1?100比例力口DEPC,37C12

24、h,高溫5min除去DEP熨留。含Tris的溶液不能用0.1%DEP(Ct理(DEPS和Tris的氨基反應(yīng)而降解,失去滅活RNase的能力),通??筛挠肈EP(Ct理過(guò)的水來(lái)配DEPC已配好的可用1%DEPC理(不過(guò)會(huì)有DEP噴留)(六)核糖核酸酶T1(RNaseT1)核酸內(nèi)切酶。特異地攻擊鳥(niǎo)甘酸3惻的磷酸基團(tuán),切割與其相鄰核甘酸的5'-磷酯鍵,產(chǎn)生3'-磷酸鳥(niǎo)音和以3'-磷酸鳥(niǎo)喋吟核甘酸結(jié)尾的寡核甘酸。主要用于RNA測(cè)序和指紋圖譜分析/也可和RNase合用,以除去樣品中RNA;除去DNA-RNA雜交體中雜交體的RNA區(qū)。(七)核糖核酸酶H(RNaseH)核酸內(nèi)切酶。水

25、解RNA-DNA雜交體中的RNA鏈,產(chǎn)生5'-磷酸寡核甘酸和5'-磷酸核糖核甘。;使RNA被切割后成為DNA聚合酶合成第二條cDNA的引物,形成cDNA。(八)脫氧核糖核酸酶I(DNaseI,deoxyribonucleaseI)核酸內(nèi)切酶。Mg2+條件下,隨機(jī)切割單、雙鏈DNA,產(chǎn)生5'磷酸末端的單脫氧核甘酸和寡脫氧核甘酸。Mn2+存在下能將雙鏈DNA同時(shí)切斷,是DNA片段化。其活性依賴(lài)于Ca2+(輔因子),活化劑:Mg2+,抑制劑:螯合劑(EDTA等)DNase污染:用具要高溫處理,樣品中加EDTA,抑制酶活性;或冰水中滅活。、用途:除去RNA樣品中污染的基因組DN

26、A;轉(zhuǎn)錄反應(yīng)后DNA模板的降解。(九)核酸酶S1(nucleaseS1)內(nèi)切酶(高度單鏈特異)。酶解單鏈DNA、單鏈RNA,產(chǎn)生5'-磷酸的單核甘酸或寡核甘酸。對(duì)雙鏈DNA、雙鏈RNA和DNA-RNA雜交體相對(duì)不敏感。需要低水平的Zn2+激活,PH4.04.3,抑制劑:螯合劑(EDTA、檸檬酸等)、磷酸緩沖液、和0.6%左右的SDS溶液。S1核酸酶的水解功能可以作用于雙鏈核酸分子的單鏈區(qū),并從單戀部分切斷核酸分子,且這種單鏈區(qū)可以小刀只有一個(gè)堿基對(duì)的程度。一一去除DNA片段中突出的單鏈末端;切開(kāi)合成dsDNA時(shí)形成的“發(fā)火”結(jié)構(gòu)。(十)核酸酶Bal31水解超螺旋DNA成開(kāi)環(huán)狀,進(jìn)而成為線狀DNA。有外切酶活性,在Mg2+、Ca2+參與下,能從DNA雙鏈兩端連續(xù)向中間切割水解??捎糜贒NA鏈的限制性?xún)?nèi)切酶切割位點(diǎn)分析(繪制DNA限制圖譜);縮短DNA片段。(H一)核酸外切酶(exonuclease)是具有從DNA分子鏈的末端順次水解磷酸二酯鍵而生成單核甘酸作用的酶。兩種:水解磷酸二酯鍵的5'端生成3'-單核甘酸的酶;水解磷酸二酯鍵的3'端生成5'-單核甘酸的酶(大腸桿菌核酸外切酶I、II和III)。核酸外切酶III:從雙鏈DNA3O誼一降解切除5'單核甘酸。才0115Oii孑亍不降解單鏈DNA3'突出的雙鏈DNA具有多種酶

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