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1、電泳出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象電泳出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象,英文成為 smear-,就是彌散。其原因,主要從以下兩個方面考慮:拖尾:產(chǎn)物在凝膠上呈 Smear 狀態(tài)。原因:1 .模板不純2 .Buffer 不合適3 .退火溫度偏低4 .酶量過多5 .dNTP、Mg2 然度偏高6 .循環(huán)次數(shù)過多對策:1 .純化模板2 .更換 Buffer3 .適當(dāng)提高退火溫度4 .適量用酶5 .適當(dāng)降低 dNTPffi 鎂離子的濃度6 .減少循環(huán)次數(shù)1、PCRT 物自身原因:往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差,dNTP度過高,Mg2 袱度過高,退火溫度過低,循環(huán)次數(shù)過多,而造成 PCR 勺非特異性產(chǎn)物過多。對策:減少 Taq 酶的量,或調(diào)換另
2、一來源的酶。減少 dNTP 的濃度。適當(dāng)降低Mg2 然度。增加模板量,減少引物的用量,減少循環(huán)次數(shù),提高退火溫度。2、電泳體系的問題:(1)電泳緩沖液 TAEc 者 TBE 的污染,建議更換緩沖液。(2)上樣時樣品漂了,建議增加上樣緩沖液的用量,以及小心加樣。(3)電壓太高。(4)適當(dāng)把你的膠的濃度加大。 (根據(jù)你的片斷大小而定)(5)觀察你的 marker 是否也存在拖尾現(xiàn)象,作為對照。PCRfi 尾及假陽性的原因及對策拖尾現(xiàn)象:產(chǎn)物在凝膠上呈 Smear 狀態(tài)。原因:1 .模板不純2 .Buffer 不合適3 .退火溫度偏低4 .酶量過多5 .dNTP、Mg2 然度偏高6 .循環(huán)次數(shù)過多對策:1 .純化模板2 .更換 Buffer3 .適當(dāng)提高退火溫度4 .適量用酶5 .適當(dāng)降低 dNTPffi 鎂離子的濃度6 .減少循環(huán)次數(shù)假陽性現(xiàn)象:空白對照出現(xiàn)目的擴增產(chǎn)物原因:靶序列或擴增產(chǎn)物的交*污染對策:1 .操作時應(yīng)小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內(nèi)或濺出離心管外;2 .除酶及不能耐高溫的物質(zhì)外,所有試劑或器材均應(yīng)高壓消毒。
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