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文檔簡介
1、BRET 生物發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù)簡介:生物發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移(BRET)技術(shù)是近10年來出現(xiàn)的一種新的檢測蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù).它的最大優(yōu)勢是能在活細胞中實時進行檢測,因此能夠進行相互作用動力學的研究。在應用這個系統(tǒng)研究感興趣的蛋白前,首先需要將Rluc或者EYFP 融合到每個蛋白或者他們的輔蛋白上。在細胞中,融合蛋白共表達,然后和熒光素酶和其底物腔腸素反應,當能量供體Rluc,能量受體EYFP 之間距離比較近的時候(10-100Å),那么光將從Rluc(峰值480nm發(fā)射)傳遞到EYFP,形成它的激發(fā),并且發(fā)射一個波長在530nm 的發(fā)射光,BRET 量化的程度以發(fā)射光53
2、0nm 和480nm 的比率表示。實驗流程1、用于BRET的表達質(zhì)粒構(gòu)建;2、融合蛋白表達檢測;3、BRET實驗;4、實驗結(jié)果分析及提交實驗報告客戶提供1、目的基因cDNA(也可由我公司提供基因克隆)2、用于實驗細胞(如果我公司細胞庫有可不需提供)公司提供詳細實驗步驟、使用儀器、及結(jié)果分析等詳細實驗報告。服務周期和價格具體咨詢本公司熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)熒光共振能量轉(zhuǎn)移-FRET(Fluorescent Resonance Energy Transfer)指兩個熒光發(fā)色基團在足夠靠近時,當供體分子吸收一定頻率的光子后被激發(fā)到更高的電子能態(tài),在該電子回到基態(tài)前,通過偶極子相互作用,實現(xiàn)了能
3、量向鄰近的受體分子轉(zhuǎn)移。 (1)FRET發(fā)生條件: 能量匹配:供體分子的發(fā)射光譜可以被受體分子吸收并產(chǎn)生熒光信號。供體分子的發(fā)射光譜應與受體分子的激發(fā)光譜必須有顯著重疊(>30%); 作用距離:供體分子與受體分子的作用距離為1-10nm; FRET效率公式:用于計算分子/基團間作用距離R 偶極-偶極作用:供體分子與受體分子作用時的向量必須滿足一定條件。(2)FRET的應用:通過FRET技術(shù)可以獲得有關(guān)兩個蛋白分子之間相互作用
4、的空間信息(作用距離、作用方向、能量傳遞效率)。常用于解決如下問題:蛋白分子的共定位;蛋白分子聚合體;轉(zhuǎn)錄機制;轉(zhuǎn)化途徑;分子運動;蛋白折疊等生物學問題。(3)FRET常見的供體-受體熒光分子對:熒光蛋白類:
5、0; 染料類:FRET檢測HIV附屬蛋白與細胞膜CD分子相互作用摘自:A Flow Cytometry-Based FRET Assay to Identify and Analyse Protein-Protein Interactions in Living CellsCarina Banning, Jo¨ r
6、g Votteler, et al. 圖釋:流式細胞儀FACSAria檢測FRET信號。(a)活的293T細胞分別單獨轉(zhuǎn)入CFP、YFP、CFP/YFP 、CFP/YFP融合蛋白作為對照,確定最好的圈門方式為CFP/FRET。(b)293T細胞經(jīng)過2%PFA處理后,YFP熒光強度出現(xiàn)明顯下降。篩選有相互作用的未知蛋白質(zhì)的流程 圖釋:流式細胞儀FACSAria進行FACS-FRET高通量篩選感興趣蛋白相互作用的未知蛋白。(a)FACS-FRET篩選流程。(b)在活的293T細胞中轉(zhuǎn)入Vpu-YFP作為誘餌,與等量的CFP融合蛋白(蛋白的cDNA庫)相互作用36小時后,分選FE
7、RT+細胞。 FRET研究蛋白酶功能摘自:Detection of Infective Poliovirus by a Simple, Rapid, and Sensitive Flow Cytometry Method Based on Fluorescence Resonance Energy Transfer TechnologyJason L. Cantera et al. Applied and environmental microbiology, Jan. 2010, p. 584-588 圖釋:流式細胞儀 FACSAria檢測脊髓灰質(zhì)
8、炎病毒(PV1)10倍感染BGM-PV細胞,8小時后上機檢測。AC病毒濃度分別為0.40.004,D為陰性對照。雙分子熒光互補技術(shù)BiFC(Bimolecular Fluorescence Complementation)是將熒光報告蛋白按照規(guī)則分成沒有熒光的兩段,分別與誘餌蛋白和捕獲蛋白融合,只有在誘餌蛋白和捕獲蛋白發(fā)生相互作用的情況下,兩段不完整的熒光報告蛋白才會形成完整的報告蛋白,發(fā)出熒光?;罴毎占螅诹魇郊毎麅x中的檢測是實時進行的,只要細胞中有熒光產(chǎn)生就會被捕捉到信號,因此,不論是親和力較弱的結(jié)合還是暫時性的結(jié)合都不會被遺漏。 雙分子熒光互補技術(shù)原理示意圖(a) 誘餌和捕
9、獲蛋白分別攜帶CYFP和NYFP兩段YFP熒光蛋白片段(b) 誘餌和捕獲蛋白結(jié)合同時CYFP與NYFP形成YFP (c) 形成的YFP發(fā)出熒光(1)BiFC檢測的特點: 活細胞分析; 可以用于研究2種或2種以上的啟動子調(diào)控之下的蛋白質(zhì)相互作用; 具有很高的信噪比,弱蛋白相互作用也可以檢測到(>7nm)。(2)可用于BiFC的熒光蛋白: GFP、BFP、CFP、YFP,生理條件可用的黃色的Venus和citrine,青色的cerulean;
10、0; 紅色系統(tǒng):mRFP2Q66T、mCherry;Venus(EYFP的變體)是目前用于 BiFC分析最多的熒光蛋白,因為其熒光強且背景敏感度降低,是BiFC分析理想的熒光蛋白。 常見的用于雙分子熒光互補技術(shù)的熒光蛋白BiFC研究復合體中亞基間的相互作用摘自:Detection and Characterization of Influenza A Virus PA-PB2 Interaction through a Bimolecular Fluorescence Complementation AssayJoseph N. Hemerka, Dan Wa
11、ng,et al. JOURNAL OF VIROLOGY, Apr. 2009, p. 3944-3955圖釋:流式細胞儀 FACSCalibur檢測流感病毒復合體中亞基PA-PB2間的相互作用。(B)流式檢測同時轉(zhuǎn)入PA/PB2的COS-1細胞及單轉(zhuǎn)入PA-VC的細胞的Venus熒光信號,顯示轉(zhuǎn)入24小時后的熒光強度。(C)螢火蟲熒光蛋白酶顯示,轉(zhuǎn)入單或雙質(zhì)粒的細胞,螢火蟲熒光蛋白酶活性一致。BiFC研究信號傳導通路中蛋白質(zhì)間的相互作用摘自:Characterization of the latent membrane protein 1 signaling complex of Epst
12、ein-Barr virus in the membrane of mammalian cells with bimolecular fluorescence complementationPooja Talaty, Amanda Emery, et al. Virology Journal 2011, 8:414 圖釋:流式細胞儀FACSLSRII檢測BiFC信號。LMP1-NYFP和LMP1-NYFP突變體分別與CYFP-TRAF2、CYFP-TRAF3轉(zhuǎn)入細胞內(nèi),檢測其相互作用。曲線藍色部分為出現(xiàn)YFP的熒光陽性表達,表明LMP1與CYFP、CYFP均存在相互作用??破找幌耂C
13、I科學引文索引(Science Citation Index, 簡稱 SCI )于1957 年由美國科學信息研究所(Institute for Scientific Information, 簡稱 ISI)在美國費城創(chuàng)辦,是由美國科學信息研究所(ISI)1961年創(chuàng)辦出版的引文數(shù)據(jù)庫。SCI(科學引文索引 )、EI(工程索引 )、ISTP(科技會議錄索引 ) 是世界著名的三大科技文獻檢索系統(tǒng),是國際公認的進行科學統(tǒng)計與科學評價的主要檢索工具。1976 年,ISI 在 SCI 基礎上引出期刊引用報告(journal citation report,JCR),提供了一套統(tǒng)計數(shù)據(jù),展示科學期刊被引用
14、情況、發(fā)表論文數(shù)量以及論文的平均被引用情況。在 JCR 中可以計算出每種期刊的影響因子(Impact Factor,IF)。影響因子的高低,在一定程度上可以反應一個期刊的影響力。(百度百科)期刊的影響因子(Impact factor;IF)計算方式:IF 2014 = (該雜志2012-2013年發(fā)表文章在2014年被引用的次數(shù) / (該雜志2012-2013年發(fā)表文章的總數(shù))附件是最近兩年的SCI期刊列表,2014年植物學類我紅色標注了部分,不過期刊名都是縮寫, 2013年的是全稱期刊名。影響因子從高到低排列,大體代表了期刊的水平檔次。三大國際頂尖期刊CNS, 指CELL, NATURE, SCIENCE。國際植物學專業(yè)期刊中,最好的研究論文期刊是Plant Cell ( IF2004=9.338),當然今年新創(chuàng)刊的NATUR
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