指導(dǎo)原則中的臨床統(tǒng)計(jì)部分和IVDstatistics程序的指導(dǎo)思想_第1頁
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文檔簡介

1、指導(dǎo)原則中的臨床統(tǒng)計(jì)部分和IVDstatistics程序的指導(dǎo)思想蕓豆莢2013/12一、腫瘤標(biāo)志物類定量檢測試劑注冊申報(bào)資料指導(dǎo)原則(3)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗(yàn)證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。定性結(jié)果的一致性分析陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。以交叉表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進(jìn)行四格表卡方或kappa檢驗(yàn)以驗(yàn)證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。定量值相關(guān)性和一致性分析用回歸分析驗(yàn)證兩種試劑結(jié)果的相關(guān)性,以y=a+bx和R2的形式給出回歸分析的擬合方程,其中:y是考核試

2、劑結(jié)果,x是參比試劑結(jié)果,b是方程斜率,a是y軸截距,R2是判定系數(shù),同時(shí)應(yīng)給出b的95%(或99%置信區(qū)間,定量值結(jié)果應(yīng)無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。另外考慮到在不同的樣本濃度區(qū)間試劑的性能可能存在一定差異,因此,建議對總體濃度范圍進(jìn)行區(qū)間分層統(tǒng)計(jì),對不同濃度區(qū)間內(nèi)的結(jié)果進(jìn)行相關(guān)性分析以更好的驗(yàn)證兩種試劑的相關(guān)性。二、乙型肝炎病毒脫氧核糖核酸定量檢測試劑注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則(3)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗(yàn)證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。 兩組數(shù)據(jù)結(jié)果的相關(guān)性、線性回歸的結(jié)果。對相關(guān)性及線性方程的顯著性檢驗(yàn),驗(yàn)證兩種試劑定量結(jié)果

3、的一致性。陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。以交叉表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進(jìn)行四格表卡方或kappa檢驗(yàn)。另外考慮到對不同樣本類型的檢測結(jié)果可能存在一定差異,故建議對不同樣本類型分別進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,以對考核試劑的臨床性能進(jìn)行綜合分析。三、人類免疫缺陷病毒檢測試劑臨床研究注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則3.統(tǒng)計(jì)學(xué)分析(1)數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或驗(yàn)證鑒別以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改等。(2)一致性分析和相關(guān)性相關(guān)性主要包括陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。一般可采用

4、四格表卡方檢驗(yàn)或kappa檢驗(yàn)對兩種試劑定性檢測結(jié)果的一致性進(jìn)行分析。對于定量試劑,應(yīng)選用特定的數(shù)據(jù)分析模型(如Bland-Altman模型)對兩種試劑定量分析結(jié)果的一致性進(jìn)行分析。同時(shí),還應(yīng)采用回歸分析的方法分析兩種試劑檢測結(jié)果的相關(guān)性,以y=a+bx和R2的形式給出回歸分析的擬合方程,其中:y是考核試劑結(jié)果,x是對比試劑結(jié)果,b是方程斜率,a是y軸截距,R2是判定系數(shù),并給出a和b的95%(或99%置信區(qū)間。由于對不同的HIV-1基因型或者不同濃度區(qū)間樣本,試劑的性能可能存在一定差異,因此,建議對總體樣本,按照濃度范圍和/或基因型進(jìn)行區(qū)間分層統(tǒng)計(jì),對不同區(qū)間內(nèi)的結(jié)果進(jìn)行相關(guān)性和一致性分析,

5、以更好地驗(yàn)證兩種試劑的相關(guān)性。四、流行性感冒病毒核酸檢測試劑注冊申報(bào)資料指導(dǎo)原則(3)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗(yàn)證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。以交叉表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進(jìn)行四格表卡方或kappa檢驗(yàn)以驗(yàn)證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。另外考慮到對不同樣本類型以及不同年齡段人群的檢測結(jié)果可能存在一定差異,故建議對不同樣本類型及不同年齡段人群分別進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,以對考核試劑的臨床性能進(jìn)行綜合分析。五、流行性感冒病毒抗原檢測試劑注冊申報(bào)資

6、料指導(dǎo)原則(3)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗(yàn)證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。定性結(jié)果的一致性分析陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。以交叉表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進(jìn)行四格表卡方或kappa檢驗(yàn)以驗(yàn)證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。另外考慮到對不同樣本類型以及不同年齡段人群的檢測結(jié)果可能存在一定差異,故建議對不同樣本類型及不同年齡段人群分別進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,以對考核試劑的臨床性能進(jìn)行綜合分析。六、流式細(xì)胞儀配套用檢測試劑注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則(3)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新

7、檢測或第三方驗(yàn)證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。相關(guān)性和一致性分析可以采用線性回歸的方式驗(yàn)證兩種試劑結(jié)果的相關(guān)性,以y=a+bx和R2的形式列出回歸分析的擬合方程,其中:y是考核試劑結(jié)果,x是參比試劑結(jié)果,b是方程斜率,a是y軸截距,R2是判定系數(shù),同時(shí)應(yīng)給出b的95%(或99%置信區(qū)間,定量值結(jié)果應(yīng)無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。另外考慮到某些檢測指標(biāo)在不同的樣本濃度區(qū)間、不同年齡段人群或不同疾病來源的樣本可能有較明顯的差異,因此,如有必要,建議以上述相關(guān)要素為依據(jù)分組并對各組數(shù)據(jù)分別進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,以更好的驗(yàn)證兩種試劑的相關(guān)性。七、病原體特異性M型免疫球蛋

8、白定性檢測試劑注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則(3)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗(yàn)證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。定性結(jié)果的一致性分析陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。以交叉表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進(jìn)行四格表卡方或kappa檢驗(yàn)以驗(yàn)證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。另外考慮到對不同樣本類型以及不同人群的檢測結(jié)果可能存在一定差異,故建議對不同樣本類型及不同人群分別進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,以對考核試劑的臨床性能進(jìn)行綜合分析。八、弓形蟲、風(fēng)疹病毒、巨細(xì)胞病毒、單純皰疹病毒2型抗體及IgG抗體親合力檢測試

9、劑注冊申報(bào)資料技術(shù)指導(dǎo)原則5.統(tǒng)計(jì)學(xué)分析對臨床試驗(yàn)結(jié)果的統(tǒng)計(jì)應(yīng)選擇合適的統(tǒng)計(jì)方法,如檢測結(jié)果一致性分析、RO8析和陰性/陽性符合率等。對于本類定性檢測試劑對比實(shí)驗(yàn)的等效性研究,常選擇配對2X2表的形式總結(jié)兩種試劑的定性檢測結(jié)果,對定性結(jié)果進(jìn)行x2檢驗(yàn)或kappa檢驗(yàn)以檢驗(yàn)兩種檢測試劑檢測的一致性。統(tǒng)計(jì)學(xué)分析應(yīng)可以證明兩種方法的檢測結(jié)果無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,并驗(yàn)證其一致性是否具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。以kappa檢驗(yàn)為例,除應(yīng)計(jì)算kappa值外,還應(yīng)對總體kappa值與“0”之間的差別是否具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義進(jìn)行假設(shè)檢驗(yàn)。對于半定量檢測試劑對比實(shí)驗(yàn)的等效性研究,應(yīng)在上述統(tǒng)計(jì)分析的基礎(chǔ)上,根據(jù)臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)分布特點(diǎn),采

10、用Person相關(guān)系數(shù)等統(tǒng)計(jì)方法對考核試劑檢測值與對比試劑檢測值線性相關(guān)關(guān)系進(jìn)行分析。在臨床研究方案中應(yīng)明確統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)假設(shè),即評價(jià)考核試劑與對比試劑是否等效的標(biāo)準(zhǔn)。對于定量檢測試劑對比實(shí)驗(yàn)的等效性研究,用回歸分析驗(yàn)證兩種試劑結(jié)果的一致性,建議統(tǒng)計(jì)學(xué)負(fù)責(zé)人根據(jù)試驗(yàn)設(shè)計(jì)特點(diǎn),選擇適用的回歸分析方法,如Deming回歸、Passing-Bablok回歸分析等。(3)臨床研究結(jié)果及分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗(yàn)證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、對灰區(qū)樣本、異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。結(jié)果的一致性分析計(jì)算陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。采

11、用適當(dāng)?shù)慕y(tǒng)計(jì)學(xué)方法,對定性檢測試劑進(jìn)行一致性評價(jià),對半定量檢測試劑進(jìn)行線性相關(guān)性分析,對定量檢測試劑進(jìn)行一致性分析。另外考慮到對不同樣本類型以及不同人群的檢測結(jié)果可能存在一定差異,故建議對不同樣本類型及不同人群分別進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,以對考核試劑的臨床性能進(jìn)行綜合分析。九、天津市體外診斷試劑(第二類產(chǎn)品)臨床研究技術(shù)審查指導(dǎo)原則五、試驗(yàn)數(shù)據(jù)分析(一)對臨床試驗(yàn)結(jié)果的統(tǒng)計(jì)應(yīng)選擇合適的統(tǒng)計(jì)方法。1、對定性試劑,應(yīng)分析考核試劑的敏感性、特異性、陽性預(yù)期值、陰性預(yù)期值、陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間、考核試劑和對比試劑的一致性(如kappa值)。2、對定量試劑,應(yīng)分析考核試

12、劑陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間、考核試劑和對比試劑的一致性(如kappa值)等之外,還應(yīng)該分析考核試劑與對比試劑的相關(guān)性、線性回歸、定量準(zhǔn)確性及一致性(如Bland-Altman模型),如入選樣本存在不同分型還應(yīng)進(jìn)行分組分析考核試劑與對比試劑的相關(guān)性、線性回歸、定量準(zhǔn)確性及一致性(如Bland-Altman模型)等。3、對于對比實(shí)驗(yàn)的等效性研究,最常用是對考核試劑和對比試劑兩組檢測結(jié)果的相關(guān)及線性回歸分析,應(yīng)重點(diǎn)觀察相關(guān)系數(shù)(r值)、回歸方程斜率及y軸截距等指標(biāo)。4、對于統(tǒng)計(jì)方法的選擇可以選擇多種方法,而不用過于強(qiáng)調(diào)一種方法。在臨床研究方案中應(yīng)明確統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)假

13、設(shè),即評價(jià)考核試劑與對比試劑是否等效的標(biāo)準(zhǔn)。十、C反應(yīng)蛋白定量檢測試劑盒注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則(征求意見稿)(3)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析數(shù)據(jù)預(yù)處理、差異數(shù)據(jù)的重新檢測或第三方驗(yàn)證以及是否納入最終數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、對異常值或缺失值的處理、研究過程中是否涉及對方案的修改。定量值相關(guān)性和一致性分析用回歸分析驗(yàn)證兩種試劑結(jié)果的相關(guān)性,以y=a+bx和R2的形式給出回歸分析的擬合方程,其中:y是考核試劑結(jié)果,x是參比試劑結(jié)果,b是方程斜率,a是y軸截距,R2是判定系數(shù),同時(shí)應(yīng)給出b的95%(或99%置信區(qū)間,定量值結(jié)果應(yīng)無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。另外考慮到在不同的樣本濃度區(qū)間試劑的性能可能存在一定差異,因此,建議對總體濃度范圍進(jìn)行區(qū)

14、間分層統(tǒng)計(jì),對不同濃度區(qū)間內(nèi)的結(jié)果進(jìn)行相關(guān)性分析以更好的驗(yàn)證兩種試劑的相關(guān)性。從以上的原則中可以看出,對于診斷試劑的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析基本是一致的,對于定性試劑,主要是1、陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%(或99%的置信區(qū)間。2、行四格表卡方或kappa檢驗(yàn)以驗(yàn)證兩種試劑定性結(jié)果的一致性。做完這些統(tǒng)計(jì)應(yīng)該是足夠了。這些在IVDstatistics中都有體現(xiàn)。這里探討幾個(gè)統(tǒng)計(jì)技術(shù)方面的話題:1、95%勺可信區(qū)間:目前有好幾種算法:可參見程序和幫助文件:個(gè)人感覺最常用的是二項(xiàng)分布法,這個(gè)算法應(yīng)該是最準(zhǔn)確的算法,但只能用程序算;另外用比較多的Wald法(點(diǎn)估計(jì),近似正態(tài)分布法?),這個(gè)算法最簡單

15、,但準(zhǔn)確度較低。2、配對卡方檢驗(yàn)(McNemar在國內(nèi)的教科書中,都是用傳統(tǒng)的公式,b+c40時(shí)用校正公式。但在不同的程序中,并不相同,SPSSR采用精確概率法,MedCalc在25時(shí)用精確概率法,而在25時(shí)用校正的公式,而SAS好象只用傳統(tǒng)的公式計(jì)算。這里我無法認(rèn)定用哪種算法好,但應(yīng)都有道理,不能認(rèn)定為錯(cuò)。我想可能理論上精確概率法最好,但只能用程序算,另外對于很大的數(shù)據(jù),可能出現(xiàn)無法計(jì)算的情況。3、一致性檢驗(yàn)這是指導(dǎo)原則中的必選項(xiàng)之一。然而在一般的教科書中,只對Kappa系數(shù)計(jì)算進(jìn)行了說明,對于其95%的可信區(qū)間和非0檢驗(yàn)提的很少。統(tǒng)計(jì)上Kappa系數(shù)不只應(yīng)用于配對的四格表,對于半定量的有序

16、數(shù)據(jù)同樣適用,反過來可認(rèn)為四格表是有序數(shù)據(jù)的最簡單的特例。在這里要注意的事Kappa的標(biāo)準(zhǔn)誤有兩個(gè),分別用于可信區(qū)間和非0檢驗(yàn),計(jì)算公式不同,SPS竽口MedCalc都沒能同時(shí)給出計(jì)算值,另有限的幾篇中文期刊文章竟然不少用錯(cuò)了。關(guān)于這兩個(gè)Se的計(jì)算公式在程序的幫助里可以找到,Se(K)用于計(jì)算可信區(qū)間,Se0(K)用于非0的檢驗(yàn)。定量試劑的臨床統(tǒng)計(jì):1、以上指導(dǎo)原則均指出要進(jìn)行回歸分析,即計(jì)算回歸方程y=a+bx,相關(guān)系數(shù)(R)或R2;從統(tǒng)計(jì)學(xué)角度,對方程進(jìn)行檢驗(yàn),即a,b的檢測,得出直線相關(guān)關(guān)系是否成立。事實(shí)上對方程的檢驗(yàn),對比的檢驗(yàn),還有對r值的檢驗(yàn)結(jié)果和意義都是一樣的,該檢驗(yàn)和算法在方法

17、上沒有什么異義,教科書以及多數(shù)的軟件結(jié)果都是一樣的。在統(tǒng)計(jì)上,應(yīng)該同時(shí)對這些值的95%CI進(jìn)行計(jì)算,并作散點(diǎn)圖,顯示出更多或更直觀的結(jié)果。注意的是如果數(shù)據(jù)不呈正態(tài)分布,此時(shí)r值不應(yīng)采用簡單相關(guān)系數(shù),而應(yīng)計(jì)算秩(spearman)相關(guān)系數(shù)。2、Bland-Altman分析:這在部分的指導(dǎo)原則中指出來了。Bland-Altman分析主要是作一個(gè)圖,用差值或比值等,一般來說界外值在5%以內(nèi),說明一致性較好,但沒有嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn)。不過從圖上可以直觀的看出數(shù)據(jù)的離散程度。3、t檢驗(yàn)或秩和檢驗(yàn),配對定量的數(shù)據(jù)需不需要t檢驗(yàn)?從以上的指導(dǎo)原則上看并沒有要求??赡芤?yàn)槭翘?xí)慣了吧,大多數(shù)人都可能會(huì)進(jìn)行t檢驗(yàn),在算

18、法上,t檢驗(yàn)相對簡單,也沒有什么爭議。但如果數(shù)據(jù)差值不呈正態(tài)分布,理論上應(yīng)用秩和檢驗(yàn)。4、定量數(shù)據(jù)的描述:拿到一組數(shù)據(jù)后,應(yīng)對基本的情況進(jìn)行描述,描述的量比較多,不過個(gè)人覺得太多也沒有必要,在IVDstatistics中,提供均值、標(biāo)準(zhǔn)差、最大值、最小值、偏度、峰度,我想應(yīng)該足夠了,另外一個(gè)較為形象的描述是作直方圖。有些指導(dǎo)原則里寫了說樣本應(yīng)盡量均勻分布,我想這一點(diǎn)是很難做到的,非生理的疾病值不會(huì)按統(tǒng)計(jì)學(xué)上理想的狀態(tài)分布,以偏態(tài)分布居多。如果做不到均勻分布,但我想要考察試劑的性能,高、中、低值的相對連續(xù)的分布不能有所缺失,用直方圖可以直觀的表示出來。5、正態(tài)分布:這是進(jìn)行以上一些檢驗(yàn)在統(tǒng)計(jì)學(xué)上的基本要求。正態(tài)分布算法很多,目前認(rèn)為較好的算法是W檢驗(yàn)和D'Agostino檢驗(yàn)。在計(jì)算方面,正態(tài)分布的計(jì)算很復(fù)雜,只有用程序進(jìn)

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