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文檔簡介
1、飛蝗細胞色素P450基因的分子(fnz)特性及功能研究【摘要】:細胞色素P450基因是最龐大的超基因家族之一,存在于幾乎所有的生物體內(nèi)。在昆蟲體內(nèi),細胞色素P450作為一種重要的代謝酶系,可以代謝多種殺蟲劑及植物次生代謝物質(zhì)。細胞色素P450功能的多樣性是由其基因的多樣性決定的。目前已有超過1000個昆蟲細胞色素P450基因被識別和鑒定,數(shù)目還在不斷增加。飛蝗是我國重要的農(nóng)業(yè)害蟲,對其生理生化、發(fā)育生物學、免疫學及有效控制等方面的研究具有重要意義。本文對飛蝗細胞色素P450基因進行了系統(tǒng)研究,從分子水平揭示飛蝗不同家族細胞色素P450基因的組織、發(fā)育階段及殺蟲劑誘導表達特性,通過RNA干擾技術
2、研究飛蝗細胞色素P450基因?qū)⑾x劑的代謝解毒機制,主要研究結(jié)果如下:1、飛蝗細胞色素P450基因的搜索及其分子特性研究采用生物信息學方法(fngf),根據(jù)昆蟲細胞色素P450的保守區(qū)(motif),對飛蝗EST數(shù)據(jù)庫進行了全面搜索,并對獲得的細胞色素P450的ESTs進行了拼接和注釋。獲得15個細胞色素P450基因片段,分別命名為LmP450-1-15。采用RT-PCR檢測了15個細胞色素P450基因在五齡飛蝗不同組織部位和發(fā)育階段的表達,結(jié)果發(fā)現(xiàn)大多數(shù)細胞色素P450基因主要在中腸、胃盲囊和脂肪體表達,少部分主要在馬氏管和后腸表達,極少數(shù)在前腸有明顯表達;飛蝗細胞色素P450基因在三、四齡
3、表達較高,而在卵這一階段相對表達較少。采用三種殺蟲劑(溴氰菊酯、馬拉硫磷和西維因)對三齡飛蝗進行了劑量和時間依賴效應實驗,結(jié)果表明:三種殺蟲劑在不同濃度處理條件下,只有(zhyu)在溴氰菊酯濃度為LD10和LD30分別引起細胞色素P450酶活性升高1.33倍和1.70倍,而用馬拉硫磷和西維因處理蟲體后,細胞色素P450酶活性沒有明顯的變化。溴氰菊酯處理三齡飛蝗12h,酶活性最高。進一步研究點滴溴氰菊酯不同時間,細胞色素P450基因表達量的變化,結(jié)果表明:大多數(shù)基因在溴氰菊酯處理12h表達量最高,表明細胞色素P450酶活性的增高是由于基因表達量增加的結(jié)果。2、飛蝗細胞色素P450基因全長序列克隆
4、通過RACE-PCR方法,對15個飛蝗細胞色素P450基因片段進行5和3-RACE擴增,獲得2個細胞色素P450基因全長序列,由細胞色素P450國際命名委員會分別命名為CYP409A1和CYP408B1,并確定為兩個新家族基因。采用生物信息學方法對飛蝗的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫進行了全面搜索,并對獲得的細胞色素P450基因序列進行克隆,共獲得6個細胞色素P450基因全長序列,由細胞色素P450國際命名委員會分別命名為CYP6FD1、CYP6FD2、CYP6FE1、CYP6FF1、CYP6FG1和CYP9AQ2.將8個飛蝗細胞色素P450氨基酸序列與果蠅的細胞色素P450s進行聚類,結(jié)果顯示,除CYP409
5、A1和CYP408B1兩個新家族成員外,其它各家族基因均與果蠅的同一家族成員聚為一簇。8個飛蝗細胞色素P450基因均屬于CYP3族(Clan)的成員,該族成員與藥物及外源物質(zhì)的代謝相關。3、飛蝗細胞色素P450基因的發(fā)育階段及組織特異表達采用Real-timePCR技術檢測了8個飛蝗細胞色素P450基因在不同發(fā)育階段的表達,發(fā)現(xiàn)CYP409A1、CYP6FG1和CYP9AQ2三個基因在卵階段mRNA的表達與其它發(fā)育階段相比表達量較低。而CYP6FD1、CYP6FD2和CYP6FE1在卵階段幾乎沒有表達,CYP6FD1在四齡表達最高,一齡到三齡次之;CYP6FD2表達較為特殊,僅在成蟲期高表達;
6、CYP6FE1在四齡表達量最高,五齡和成蟲次之。CYP408B1和CYP6FF1在飛蝗各個發(fā)育階段均有表達。采用Real-timePCR技術檢測了8個飛蝗細胞色素P450基因在飛蝗五齡若蟲不同組織部位的表達,結(jié)果顯示:CYP409A1在所有組織中都有表達,但表達強弱有所不同,馬氏管表達量最高,胃盲囊和脂肪體表達量次之,血淋巴和肌肉中表達量最低。CYP408B1在前腸高表達,后腸、脂肪體、肌肉和腦中也有一定的表達。除血淋巴外,CYP9AQ2在其余組織部位均有較高的表達,前腸表達量最高。CYP6家族的5個基因在脂肪體或馬氏管表達量最高。4、溴氰菊酯對飛蝗細胞色素P450基因的誘導表達采用Real-
7、timePCR對不同濃度溴氰菊酯處理飛蝗后細胞色素P450基因的表達進行了分析。結(jié)果表明:CYP409ALCYP6FD2,CYP6FF1和CYP6FG1均表現(xiàn)為低劑量誘導的趨勢,與對照相比,在溴氰菊酯LD10劑量下,其mRNA表達量提高了1.7-2.0倍。CYP9AQ2在溴氰菊酯三個劑量作用下都有高表達,為對照的2.26-2.55倍。CYP408B1和CYP6FE1的表達情況在溴氰菊酯處理前后沒有顯著的變化。只有CYP6FD1基因mRNA的表達受到抑制,且呈現(xiàn)劑量依賴趨勢,隨著濃度的增加mRNA表達量逐漸下降。采用溴氰菊酯處理飛蝗4、8、12、24和48h,除CYP408B1和CYP6FD1外
8、,大多數(shù)細胞色素P450基因在溴氰菊酯處理后表現(xiàn)出不同程度的誘導作用,在溴氰菊酯處理飛蝗12h其誘導表達量與同一時間點對照相比可達1.2-6.7倍。CYP408B1和CYP6FD1經(jīng)溴氰菊酯處理不同時間后其mRNA表達呈現(xiàn)被抑制的現(xiàn)象,前者在48h表達量最低,后者在8h表現(xiàn)出最低的表達量。5、基于RNAi的飛蝗細胞色素P450基因功能研究本研究發(fā)現(xiàn)在分別注射CYP409A1、CYP408B1、CYP6FF1和CYP9AQ2等4個細胞色素P450基因dsRNA后點滴溴氰菊酯,與注射dsGFP后點滴溴氰菊酯相比,飛蝗的死亡率明顯提高,表明這4個基因在飛蝗對溴氰菊酯的代謝中起著關鍵作用。分別注射CY
9、P6FD2和CYP6FE1基因dsRNA后點滴西維因,與注射dsGFP的對照相比,飛蝗的死亡率明顯提高,表明CYP6FD2和CYP6FE1基因可能參與飛蝗對西維因的代謝。分別注射8個細胞色素P450基因特異dsRNA后點滴馬拉硫磷或DDT,與注射dsGFP的對照相比,飛蝗的死亡率均未見顯著性差異,表明本研究中獲得的8個細胞色素P450全長基因可能并不涉及馬拉硫磷或DDT的代謝。6、飛蝗細胞色素P450基因的原核表達本研究試圖以CYP409A1和CYP408B1為例,建立飛蝗細胞色素P450基因大腸桿菌表達系統(tǒng)。結(jié)果表明:我們成功構(gòu)建了pET28a-CYP409A1和pET28a-CYP408B
10、1兩種重組蛋白。但遺憾的是對兩種重組蛋白在大腸桿菌宿主細胞中未獲表達。綜上所述,本研究基于飛蝗EST數(shù)據(jù)庫平臺獲得15個細胞色素P450基因片段,并進行了初步的分子特性研究,為進一步研究飛蝗細胞色素P450提供了新的資料;通過克隆獲得8個飛蝗細胞色素P450基因全長序列,為深入研究飛蝗細胞色素P450基因結(jié)構(gòu)與功能奠定了基礎;采用Real-timePCR技術系統(tǒng)分析了8個細胞色素P450基因在飛蝗不同發(fā)育階段、不同組織部位及溴氰菊酯誘導下的表達特性,并基于RNAi探討了飛蝗細胞色素P450基因與殺蟲劑代謝的關系;另外,還初步進行了飛蝗細胞色素P450基因的大腸桿菌表達研究。研究結(jié)果將為進一步開
11、展飛蝗細胞色素P450的生物學功能和生理生化特性提供了資料,對于探討飛蝗體內(nèi)細胞色素P450對殺蟲劑的代謝解毒機理具有重要的意義,為基于細胞色素P450基因研究的蝗蟲有效控制提供科學依據(jù),同時也為豐富細胞色素P450的整體研究體系作出一定貢獻?!娟P鍵詞】:飛蝗細胞色素P450表達序列標簽殺蟲劑RNA干擾【學位授予單位】:山西大學【學位級別】:博士【學位授予年份】:2012【分類號】:Q963【目錄】:中文摘要13-16ABSTRACT16-21第一章前言21-431.1細胞色素P450與細胞色素P450酶系21-241.1.1細胞色素P450211.1.2細胞色素P450酶系21-221.1.
12、3細胞色素P450的命名22-231.1.4細胞色素P450的結(jié)構(gòu)特征23-241.2昆蟲細胞色素P450的多樣性及其進化24-271.2.1種類的多樣性24-261.2.2分布的多樣性261.2.3催化反應的多樣性261.2.4細胞色素P450的進化26-271.3昆蟲細胞色素P450基因的功能27-341.3.1內(nèi)源物質(zhì)的代謝28-301.3.2外源物質(zhì)的代謝30-341.4昆蟲細胞色素P450基因的表達與誘導34-351.4.1昆蟲細胞色素P450基因的表達特性341.4.2昆蟲細胞色素P450的誘導34-351.5昆蟲細胞色素P450的研究方法35-401.5.1昆蟲細胞色素P450基
13、因的克隆策略35-381.5.2昆蟲細胞色素P450的異源表達系統(tǒng)38-401.6飛蝗概述40-421.6.1飛蝗的分布與為害401.6.2飛蝗的研究進展40-421.7本研究的立題依據(jù)及主要研究內(nèi)容42-43第二章飛蝗細胞色素P450基因EST序列的獲得及其特性分析43-592.1研究材料43-452.1.1供試昆蟲43-442.1.2主要試劑442.1.3主要儀器44-452.2研究方法45-502.2.1飛蝗EST數(shù)據(jù)庫中細胞色素P450基因的搜索452.2.2飛蝗細胞色素P450基因PCR引物設計452.2.3RT-PCR分析細胞色素P450基因的表達特性45-482.2.4殺蟲劑對飛
14、蝗細胞色素P450的影響48-502.3結(jié)果與分析50-562.3.1飛蝗細胞色素P450基因片段的獲得50-522.3.2基于RT-PCR的細胞色素P450基因的表達特性分析52-532.3.3殺蟲劑對飛蝗細胞色素P450的影響53-562.4討論56-59第三章飛蝗細胞色素P450基因克隆59-823.1研究材料59-603.1.1供試昆蟲593.1.2主要試劑59-603.1.3主要儀器603.2研究方法60-673.2.1飛蝗細胞色素P450基因cDNA全長的獲得60-653.2.2飛蝗細胞色素P450基因全長cDNA的驗證65-673.2.3飛蝗細胞色素P450基因序列分析673.2
15、.4飛蝗細胞色素P450的聚類分析673.3結(jié)果與分析67-803.3.1飛蝗細胞色素P450基因全長cDNA的獲得及命名67-683.3.2飛蝗細胞色素P450基因cDNA序列的生物信息學分析68-793.3.3飛蝗細胞色素P450的聚類分析79-803.4討論80-82第四章飛蝗細胞色素P450基因的發(fā)育和組織表達特異性82-904.1研究材料82-834.1.1供試昆蟲824.1.2主要試劑824.1.3主要儀器82-834.2研究方法83-854.2.1飛蝗細胞色素P450基因Real-timePCR引物設計834.2.2飛蝗細胞色素P450基因在不同發(fā)育階段的表達83-844.2.3
16、飛蝗細胞色素P450基因在不同組織部位的表達84-854.3結(jié)果與分析85-884.3.1飛蝗細胞色素P450基因不同發(fā)育階段的表達分析854.3.2飛蝗細胞色素P450基因不同組織部位的表達分析85-884.4討論88-90第五章溴氰菊酯對飛蝗細胞色素P450基因的誘導表達90-975.1研究材料905.1.1供試昆蟲905.1.2主要試劑905.1.3主要儀器905.2研究方法90-925.2.1實驗材料的準備90-915.2.2總RNA的提取、純化及cDNA第一鏈的合成915.2.3Real-timePCR分析溴氰菊酯對飛蝗細胞色素P450基因表達的影響915.2.4數(shù)據(jù)分析91-925
17、.3結(jié)果與分析92-955.3.1不同濃度溴氰菊酯對飛蝗細胞色素P450基因的誘導表達925.3.2溴氰菊酯處理飛蝗不同時間后細胞色素P450基因的誘導表達92-955.4討論95-97第六章飛蝗細胞色素P450基因的解毒功能分析97-1066.1研究材料97-986.1.1供試昆蟲976.1.2主要試劑97-986.1.3主要儀器986.2研究方法98-1016.2.1飛蝗細胞色素P450基因dsRNA引物設計及體外合成98-1006.2.2飛蝗細胞色素P450基因沉默效率及交叉干擾檢測1006.2.3細胞色素P450基因沉默后飛蝗對殺蟲劑的敏感性分析100-1016.3結(jié)果與分析101-1
18、046.3.1飛蝗細胞色素P450基因沉默效率及交叉干擾分析101-1026.3.2細胞色素P450基因沉默后飛蝗對殺蟲劑的敏感性分析102-1046.4討論104-106第七章飛蝗細胞色素P450基因的原核表達106-1147.1研究材料106-1077.1.1供試昆蟲1067.1.2主要試劑106-1077.1.3主要儀器1077.2研究方法107-1107.2.1飛蝗CYP409A1和CYP408B1蛋白表達引物設計1077.2.2PCR擴增及產(chǎn)物檢測107-1087.2.3PCR擴增產(chǎn)物的回收純化1087.2.4雙酶切及連接反應108-1097.2.5轉(zhuǎn)化109-1107.2.6重組質(zhì)粒的表達1107.2.7重組蛋白的誘導表達1107.2.8表達產(chǎn)物的SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS)檢測1107.3結(jié)果與分析110-1127.3.1飛蝗CYP409A1和CYP408B1蛋白全長表達驗證110-1117.3.2飛蝗CYP409A1和CYP408B1基因重組表達載體的檢測1117.3.3SDS分析CYP409A1和CYP408B1在大腸
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