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分子生物學(xué)一、名詞解釋1.ORF答:ORFopenreadingframeDNA列,叫做一個(gè)開放閱讀框架。結(jié)構(gòu)基因答:結(jié)構(gòu)基因(structuralmRNA肽鏈,構(gòu)成各種結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)或催化各種生化反應(yīng)的酶和激素等。斷裂基因RNA的核酸序列,還包括保證轉(zhuǎn)錄所必需的調(diào)控序53splitgen。選擇性剪接答:選擇性剪接(也叫可變剪接)mRNAmRNA表型。5.CDNA倍體基因組DNA的總量成為C值Cvalu。生物大分子糖類。酚抽提法1976年由Stafford以含EDTASDS及無(wú)DNA酶的RNAKpH8.0的Tris飽和酚抽提DNA根據(jù)不同需要進(jìn)行透析或沉淀處理獲得所需的DNA凝膠過濾層析混合物最有效的方法之一。多重PCRPCR泳或毛細(xì)管電泳等技術(shù)加以鑒別。熒光域值答:熒光閾值是在熒光擴(kuò)增曲線上人為設(shè)定的一個(gè)值,它可以設(shè)定在10退火37-58℃時(shí),變性的DNA重新形成氫鍵開始復(fù)性?;蛟\斷康狀態(tài)和疾病做出診斷的方法。PCRPCRPCRPCR板進(jìn)行定量分析的方法。二、問答題什么是SNP?試述研究SNPDNADNADNAsinglenucleotidepolymorphism,SNP)和串聯(lián)重復(fù)序列多態(tài)性(tandemrepeatspolymorphism)兩類。研究SNPDNADNA1kp就存在一個(gè)SNP300萬(wàn)個(gè)之多,遠(yuǎn)多于其它類型的DNA多態(tài)性,是人群中個(gè)體差異最具代表性的DNA多態(tài)性,相當(dāng)一部分還直接或間接與個(gè)體的表型SNP被認(rèn)為是一種能穩(wěn)定遺傳的早期突變。簡(jiǎn)要介紹質(zhì)粒并舉例說明其在分子生物學(xué)中的用途。答:質(zhì)粒(plasmid)是一類染色體外具有自主復(fù)制能力的環(huán)狀雙鏈DNA分子,屬染色體外基因組。質(zhì)粒與致病菌的毒力及耐藥性有關(guān),又是基因工程的常用載體,因而具有重要的研究和應(yīng)用價(jià)值。其在分子生物學(xué)中的用途有:1.質(zhì)粒DNA編碼多種蛋白質(zhì),有的與質(zhì)粒自身的復(fù)制和穩(wěn)定性有關(guān),有的控制宿主細(xì)胞的各種性狀,如各種抗性、代謝能力、致病性、接合轉(zhuǎn)移等。根據(jù)宿主的表型可識(shí)別質(zhì)粒的存在,這一性質(zhì)廣泛應(yīng)用于重組菌的篩選和鑒定。2.質(zhì)粒的不相容性常用于質(zhì)粒的分類?;蚬こ讨幸再|(zhì)粒為載體進(jìn)行基因克隆也是利用了質(zhì)粒的不相容性原理。理。工作流程(Gel-basedworkflow)和基于液相色譜的工作流程LC-basedworkflo。在這兩種流程中,基于凝膠的工作流程是目和MALDI—TOFMDLC。簡(jiǎn)述酵母雙雜交技術(shù)的原理及其用途。功能上相互獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域(domain)構(gòu)成,其中有DNA結(jié)合功能域(DNAbindingdomain,DNA-BD)和轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域(activationdomai,DNA-AD。這兩個(gè)結(jié)合域?qū)⑺鼈兎珠_時(shí)仍分別具有功能,但GAL4activatingsequence,UAS)的下游啟動(dòng)子,使啟動(dòng)子下游基因得到轉(zhuǎn)錄。2.利用酵3.利用酵母雙雜交4.利用酵母雙雜交建立基因組蛋白連鎖圖GenomeProteinLinkageMa4/8分子克隆技術(shù)包括哪些基本步驟?答:分子克隆技術(shù)的基本步驟大致包括:①目的基因的獲??;②載體的選擇;③目的基因與載體連接;④重組DNA導(dǎo)入受體細(xì)胞;⑤重組體的篩選等;即分、切、接、轉(zhuǎn)、篩等過程。目的基因和載體連接主要有哪些方法?答:目的基因與載體構(gòu)建成重組體的方法主要有:1).粘性末端DNA分子的連接2).平末端連接法3).通過同聚尾連接。簡(jiǎn)述分子克隆中常用的工具酶及其作用。它是一類能識(shí)別和切割雙鏈DNA特定核苷酸序列的核酸水解酶;2.DNA35反轉(zhuǎn)錄酶,其功能主要有:1)2)H3)DNADNADNADNA5'DNA片段連接起DNADNARNA或dNTP5'1)在載體或目的基因3'末端加上互補(bǔ)的同質(zhì)多聚尾,形DNA2)DNA3'末端的同位素探針標(biāo)記;7.S1,DNAcDNARNA和DNA-RNA舉例說明載體應(yīng)具備的基本要素。適宜的分子量,一般應(yīng)<10kb;2)帶有遺傳篩選標(biāo)記;3)有適當(dāng)?shù)南拗泼盖形稽c(diǎn),便于外源基因的插入和篩選。簡(jiǎn)述雙抗生素篩選和藍(lán)白斑篩選的原理。AmprTetr等,當(dāng)帶有完整抗性基因的載體轉(zhuǎn)化無(wú)斑,未轉(zhuǎn)化菌不能存活,但應(yīng)排除未重組的空載體。2lacZ基因,該基因含一段編碼β-半乳糖苷酶氨基末端145個(gè)氨基酸α-肽的DNAIPTG碼的缺陷型β-半乳糖苷酶實(shí)現(xiàn)基因內(nèi)α-互補(bǔ),形成完整的β-半乳糖苷酶。該酶能催化指示劑底物X-gal形成藍(lán)色菌落。當(dāng)外源基因lacZMCS,lacα-肽基因閱讀框架被破壞,細(xì)菌內(nèi)將無(wú)β-半乳糖苷酶活性,結(jié)果重組克隆呈白色菌落。有哪些常用的探針標(biāo)記物?答:常用的探針標(biāo)記物有:1.放射性同位素標(biāo)記,常用標(biāo)記探針的同位素有32P、3H、35S、131I、125I等。2.非放射性標(biāo)記,常用的非放射標(biāo)記物有辣根過氧化物酶(HRP)、熒光素、生物素、光敏生物素、地高辛(DIG)等。如何進(jìn)行探針的標(biāo)記?末端標(biāo)記法和反轉(zhuǎn)錄標(biāo)記法等。2.非放射性標(biāo)記核酸探針的方法分影響核酸分子雜交的因素有那些?如何進(jìn)行雜交條件的優(yōu)化?針的濃度、溫度、雜交液的成分、反應(yīng)時(shí)間等。DNAcDNA酸探針,在檢測(cè)單鏈靶序列時(shí)應(yīng)選用與其互補(bǔ)的DNA單鏈探針或RNA234520h6Tm值5~127DNA雜交的標(biāo)準(zhǔn)雜交液為5SSC,1.0%casein0.1%十二烷基肌氨酸,0.02%DNA1、根據(jù)作用原理生物分子的分離純化有那幾類?答:根據(jù)作用原理生物分子的分離純化可分為1)根據(jù)分子極性大小和溶解度的不同,如溶劑提取技術(shù)、鹽析法、分配層析法、分級(jí)沉()根據(jù)分子形狀和大小不同,如凝膠過濾層析等3)根據(jù)物質(zhì)吸附性質(zhì)不同,如選擇性吸附與吸附層析法等4)根據(jù)分子(電離性質(zhì)(5)根據(jù)配體特異性,如親和層析。2、什么原因易引起DNA降解,該如何解決?DNA2)3)4)5)反復(fù)凍融。相應(yīng)的解決方法有:1)盡量取新鮮材料,低溫保存材料避免反復(fù)凍融;液氮研磨或勻漿組織后,應(yīng)在解凍前加入裂解緩沖液2)內(nèi)源核酸酶含量豐富的材料的DNA3)細(xì)胞裂解后的后續(xù)操作應(yīng)盡量輕柔4)所有試劑用無(wú)菌水配制,5)將DNA3、簡(jiǎn)述PCR技術(shù)的基本原理答:PCRDNADNA、引物dNTPDNADNAdNTP(dATP、dTTP、dGTP、dCTP、引物1、引物2、TaqDNA聚合酶、緩沖液及Mg2+(MgCl2,DNA三步完成。4、簡(jiǎn)述PCR實(shí)驗(yàn)中常見的問題及其對(duì)策。答:1)(1)PCR前后工序分(2)Eppendorf(4)操作人員必須戴手套進(jìn)行操作(5)體濺出。2)PCRPCR()引物特異性不高,引物用量過多,應(yīng)調(diào)換引物或降低引(2)TaqDNA聚合酶質(zhì)量不好或用量偏高,應(yīng)降低酶量或使(3)Mg2+濃度過高,可適當(dāng)調(diào)節(jié)Mg2(4)延伸時(shí)間,或者采用二溫循環(huán)PCR(5)熱循環(huán)次數(shù)過多,適當(dāng)增加模板用量,減少循環(huán)次數(shù)。3)假陰性,可考慮以下原因并(1)引物設(shè)計(jì)是否合理,有無(wú)二級(jí)結(jié)構(gòu)形成,尤其是引3’端應(yīng)無(wú)發(fā)夾結(jié)構(gòu)(2)標(biāo)本中是否有Taq(3)反應(yīng)體系中有無(wú)蛋白酶或DNADNA95℃10(4)反應(yīng)體系中是否有較難去除的蛋白質(zhì)抑制PCR白酶K(5)循環(huán)溫度,特別是解鏈溫度是否準(zhǔn)確,退火溫度是否過高。有些PCR(6)檢測(cè)PCR靶序列發(fā)生突變、缺失等。4)(1)兩個(gè)相同的或不同的引物分子之3’端(2)(3)退火溫度(4)熱循環(huán)次數(shù)過多。5、簡(jiǎn)述實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)的基本原理?答:在實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)中,引入了一種熒光化學(xué)物質(zhì),隨著PCR反應(yīng)的進(jìn)行,PCR反應(yīng)產(chǎn)物不斷累計(jì),熒光信號(hào)強(qiáng)度也等比例增加。每經(jīng)過一個(gè)循環(huán),收集一個(gè)熒光強(qiáng)度信號(hào),這樣我們就可以通過熒光強(qiáng)度變化監(jiān)測(cè)產(chǎn)物量的變化,從而得到一條熒光擴(kuò)增曲線。基因診斷基因診斷常用到的方法有哪些?2)4)bDNA5)NASBA、6)測(cè)序。TaqMan答:1).TaqMan技術(shù)引物的設(shè)計(jì)原則:序列選取應(yīng)在基因的保守區(qū)441824(引物需Tm值在5-65℃GC含量在4060TM相2℃;引物的3’端避免使用堿基A,引物的333Taqman探針技術(shù)要求片段長(zhǎng)度在50bp-150bp;引物末端(5)2G和C。2).TaqMan技術(shù)探針的設(shè)計(jì)原則:先選擇好探針,然后設(shè)計(jì)引物使其盡可能的靠近探針;探針長(zhǎng)度應(yīng)在20-30bp),以保證結(jié)合特異性;探針的DNATm值在65-7℃,通常比引物TM值高5-10℃(至少要5℃,以確保40%-70%;5’端應(yīng)避免使用G5'GC明顯高于G列在blast如何對(duì)鐮刀形細(xì)胞貧血和地中海貧血進(jìn)行基因診斷?β珠蛋白基因發(fā)生了突變,導(dǎo)致β6(密碼子GAG)酸(密碼子GT。因此,對(duì)鐮刀形細(xì)胞貧血的基因診斷方法可有:1>PCR-RFLPA→TDNA和患者DNASouthernDNAM
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