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學(xué)習(xí)必備——歡迎干載普通生物化學(xué)名詞解釋第一章糖類構(gòu)型(configuration)一個有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。在立體化學(xué)中,因分子中存在不對稱中心而產(chǎn)生的異構(gòu)體中的原子或取代基團的空間排列關(guān)系。有D型和L型兩種。構(gòu)型的改變要有共價鍵的斷裂和重新組成,從而導(dǎo)致光學(xué)活性的變化。構(gòu)象(conformation)分子中由于共價單鍵的旋轉(zhuǎn)所表現(xiàn)出的原子或基團的不同空間排列。指一組結(jié)構(gòu)而不是指單個可分離的立體化學(xué)形式。構(gòu)象的改變不涉及共價鍵的斷裂和重新組成,也無光學(xué)活性的變化。對映體(enantiomer)互為實物與鏡像而不可重疊的一對異構(gòu)體。如左旋乳酸與右旋乳酸是一對對映體。差向異構(gòu)體(epimer)同一不對稱碳原子,各取代基取向不同,而產(chǎn)生兩種差向同分異構(gòu)體。如a-D-吡喃葡萄糖與B-D-吡喃葡萄糖;與葡萄糖互為差向異構(gòu)體的有:甘露糖(C2),阿洛糖(C3),半乳糖(C4)。變旋(mutarotation)吡喃糖,呋喃糖或糖昔伴隨它們的a-和0-異構(gòu)形式的平衡而發(fā)生的比旋度變化。異頭物(anomer):僅在氧化數(shù)最高的C原子(異頭碳)上具有不同構(gòu)形的糖分子的兩種異構(gòu)體。異頭碳(anomercarbon):環(huán)化單糖的氧化數(shù)最高的C原子,異頭碳具有羰基的化學(xué)反應(yīng)性。醛糖(aldose):一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-1)是一個醛基。酮糖(ketose):一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-2)是一個酮基。單糖(monosaccharide):由3個或更多碳原子組成的具有經(jīng)驗公式(CH2O)n的簡糖。寡糖(oligoccharide):由2?20個單糖殘基通過糖昔鍵連接形成的聚合物。多糖(polysaccharide):20個以上的單糖通過糖昔鍵連接形成的聚合物。多糖鏈可以是線形的或帶有分支的。糖昔(dlycoside)單糖半縮醛羥基與別一個分子的羥基,胺基或巰基縮合形成的含糖衍生物。糖昔鍵(glycosidicbond)一個糖半縮醛羥基與另一個分子(例如醇、糖、嘌吟或嘧啶)的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛或縮酮鍵,常見的糖醛鍵有O—糖苷鍵和N一糖昔鍵。還原糖(reducingsugar)羰基碳(異頭碳)沒有參與形成糖昔鍵,因此可被氧化充當(dāng)還原劑的糖。淀粉(starch)一類多糖,是葡萄糖殘基的同聚物。有兩種形式的淀粉:一種是直鏈淀粉,是沒有分支的,只是通過a-(1-4)糖昔鍵的葡萄糖殘基的聚合物;另一類是支鏈淀粉,是含有分支的,a-(1-4)糖昔鍵連接的葡萄糖殘基的聚合物,支鏈在分支處通過a-(1-6)糖昔鍵與主鏈相連。糖原(glycogen)是含有分支的a-(1-4)糖昔鍵的葡萄糖殘基的同聚物,支鏈在分支點處通過a-(1-6)糖昔鍵與主鏈相連。纖維素(cellulose)葡萄糖分子通過0-1,4-糖苷鍵連接而形成的葡聚糖。通常含數(shù)千個葡萄糖單位,是植物細胞壁的主要成分。極限糊精(limitdexitrin)是指支鏈淀粉中帶有支鏈的核心部位,該部分經(jīng)支鏈淀粉酶水解作用,糖原磷酸化酶或淀粉磷酸化酶作用后仍然存在。糊精的進一步降解需要a-(1-6)糖昔鍵的水解。學(xué)習(xí)必備——歡迎干載肽聚糖(peptidoglycan)N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰唾液酸交替連接的雜多糖與不同的肽交叉連接形成的大分子。肽聚糖是許多細菌細胞壁的主要成分。糖蛋白(glycoprotein)含有共價連接的葡萄糖殘基的蛋白質(zhì)。蛋白聚糖(proteoglycan)由雜多糖與一個多肽連組成的雜化的在分子,多糖是分子的主要成分。糖胺聚糖(glycosaminoglycan)蛋白聚糖大分子中聚糖部分的總稱。由糖胺的二糖重復(fù)單位組成,二糖單位中通常有一個是含氨基的糖,另一個常常是糖醛酸,并且糖基的羥基常常被硫酸酯化。曾稱為黏多糖,為雜多糖的一種,主要存在于高等動物結(jié)締組織中,植物中也有發(fā)現(xiàn)。糖胺聚糖可分為硫酸軟骨素、硫酸皮膚素、硫酸角質(zhì)素、透明質(zhì)酸、肝素及硫酸乙酰肝素等類別。凝集素(Lectin)是指一種從各種植物,無脊椎動物和高等動物中提純的糖蛋白或結(jié)合糖的蛋白,因其能凝集紅血球(含血型物質(zhì)),故名凝集素。常用的為植物凝集素(Phytoagglutin,PNA),通常以其被提取的植物命名,如刀豆素A(Conconvalina,ConA)、麥胚素(Wheatgermagglutinin,WGA)、花生凝集素(Peanutagglutinin,PNA)和大豆凝集素(Soybeanagglutinin,SBA)等,凝集素是它們的總稱。第二章脂類脂肪酸(fattyacid)是指一端含有一個竣基的長的脂肪族碳氫鏈。脂肪酸是最簡單的一種脂,它是許多更復(fù)雜的脂的成分。飽和脂肪酸(saturatedfattyacid)不含有一CmC一雙鍵的脂肪酸。不飽和脂肪酸(unsaturatedfattyacid)至少含有一C二C一雙鍵的脂肪酸。必需脂肪酸(occentialfattyacid)維持哺乳動物正常生長所必需的,而動物又不能合成的脂肪酸,如亞油酸,亞麻酸,花生四烯酸。注:必須氨基酸(essentialaminoacid)人體不能合成或合成的量不能滿足機體需要,必須從食物中攝取的氨基酸。半必需氨基酸人體內(nèi)合成量不能滿足需求,必須從外界獲取的氨基酸。包括精氨酸、組氨酸。三脂酰苷油(triacylglycerol)那稱為甘油三酯。一種含有與甘油脂化的三個脂?;孽?。脂肪和油是三脂酰甘油的混合物。磷脂(phospholipid)含有磷酸成分的脂。分為甘油磷脂、鞘磷脂。鞘脂(sphingolipid)一類含有鞘氨醇骨架的兩性脂,一端連接著一個長連的脂肪酸,另一端為一個極性和醇。鞘脂包括鞘磷脂,腦磷脂以及神經(jīng)節(jié)甘脂,一般存在于植物和動物細胞膜內(nèi),尤其是在中樞神經(jīng)系統(tǒng)的組織內(nèi)含量豐富。鞘磷脂(sphingomyelin)一種由神經(jīng)酰胺的C-1羥基上連接了磷酸毛里求膽堿(或磷酸乙酰胺)構(gòu)成的鞘脂。鞘磷脂存在于在多數(shù)哺乳動物動物細胞的質(zhì)膜內(nèi),是髓鞘的主要成分。卵磷脂(lecithin)即磷脂酰膽堿(PC),是磷脂酰與膽堿形成的復(fù)合物。腦磷脂(cephalin)即磷脂酰乙醇胺(PE),是磷脂酰與乙醇胺形成的復(fù)合物。脂質(zhì)體(liposome)是由包圍水相空間的磷脂雙層形成的囊泡(小泡)。生物膜(bioligicalmembrane)圍繞細胞或細胞器的脂雙層膜,由磷脂雙層結(jié)合有蛋白質(zhì)和膽固醇、糖脂構(gòu)成,起滲透屏障、物質(zhì)轉(zhuǎn)運和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的作用。內(nèi)在膜蛋白(integralmembraneprotein)插入脂雙層的疏水核和完全跨越脂雙層的膜蛋白。外周膜蛋白(peripheralmembraneprotein)通過與膜脂的極性頭部或內(nèi)在的膜蛋白的離子相互作用和形成氫鍵與膜的內(nèi)或外表面弱結(jié)合的膜蛋白。學(xué)習(xí)必備——歡迎干載流體鑲嵌模型55~mosaicmodel)針對生物膜的結(jié)構(gòu)提出的一種模型。在這個模型中,生物膜被描述成鑲嵌有蛋白質(zhì)的流體脂雙層,脂雙層在結(jié)構(gòu)和功能上都表現(xiàn)出不對稱性。有的蛋白質(zhì)''鑲''在脂雙層表面,有的則部分或全部嵌入其內(nèi)部,有的則橫跨整個膜。另外脂和膜蛋白可以進行橫向擴散。乳化(emulsification)一種液體以極微小液滴均勻地分散在互不相溶的另一種液體中的作用。皂化值(saponificationnumber)完全皂化1g油脂所需氫氧化鉀的毫克數(shù)。是三酰甘油中脂肪酸平均鏈長的量度,即三酰甘油平均分子量的量度。碘值(iodinenumber;iodinevalue;IV)脂肪不飽和程度的一種度量,等于100g脂肪所攝取碘的克數(shù)。檢測時,以淀粉液作指示劑,用標(biāo)準(zhǔn)硫代硫酸鈉液進行滴定。碘值大說明油脂中不飽和脂肪酸含量高或其不飽和程度高。酸值(acidnumber;acidvalue)中和1g油脂中的游離脂肪酸所需氫氧化鉀的毫克數(shù)。常用以表示其緩慢氧化后的酸敗程度。一般酸值大于6的油脂不宜食用。酸敗(rancidity)天然油脂長時間暴露在空氣中會引起變質(zhì)的現(xiàn)象。這是由于油脂的不飽和成分受空氣中氧、水分或霉菌的作用發(fā)生自動氧化,生成過氧化物進而降解為揮發(fā)性醛、酮、竣酸的復(fù)雜混合物,并產(chǎn)生難聞的氣味??寡趸瘎?oxidationinhibitor;antioxidant)延緩或防止脂肪氧化的添加劑。乙酰值(acetylationvalue)又稱乙?;?。對脂肪中羥基數(shù)目的定量。油脂中含羥基的脂肪酸可與乙酸酐或其他?;瘎┳饔蒙上鄳?yīng)的酯。乙?;抵?g乙?;挠椭纸獬龅囊阴S脷溲趸浿泻蜁r所需的氫氧化鉀mg數(shù)。萜(terpene)由兩個或多個異戊二烯單位連接而成的菇烯及其衍生物。根據(jù)異戊二烯的數(shù)目分單菇、倍半菇、雙萜、三菇、四菇和多菇。通透系數(shù)(permeabilitycoefficient)是離子或小分子擴散過脂雙層膜能力的一種量度。通透系數(shù)大小與這些離子或分子在非極性溶液中的溶解度成比例。通道蛋白(channelprotein)是帶有中央水相通道的內(nèi)在膜蛋白,它可以使大小適合的離子或分子從膜的任一方向穿過膜。(膜)孔蛋白(poreprotein)其含意與膜通道蛋白類似,只是該術(shù)語常用于細菌。被動運輸(passivetransport)離子或小分子在濃度差或電位差的驅(qū)動下順電化學(xué)梯度穿膜的運輸方式。包括簡單擴散和協(xié)助擴散。簡單擴散:也叫自由擴散(freedffusing),特點是:①沿濃度梯度(或電化學(xué)梯度)擴散;②不需要提供能量;③沒有膜蛋白的協(xié)助。協(xié)助擴散:也稱促進擴散(faciliatieddiffusion)、易化擴散(facilitateddeffusion),^運輸特點是:①比自由擴散轉(zhuǎn)運速率高;②存在最大轉(zhuǎn)運速率;在一定限度內(nèi)運輸速率同物質(zhì)濃度成正比。如超過一定限度,濃度再增加,運輸也不再增加。因膜上載體蛋白的結(jié)合位點已達飽和;③有特異性,即與特定溶質(zhì)結(jié)合。主動轉(zhuǎn)運(activetransport)特異性運輸?shù)鞍紫哪芰渴闺x子或小分子逆濃度梯度穿膜的運輸方式。【主動轉(zhuǎn)運(activetransport):一種轉(zhuǎn)運方式,通過該方式溶質(zhì)特異的結(jié)合于一個轉(zhuǎn)運蛋白上然后被轉(zhuǎn)運過膜,與被動轉(zhuǎn)運運輸方式相反,主動轉(zhuǎn)運是逆著濃度梯度下降方向進行的,所以主動轉(zhuǎn)運需要能量的驅(qū)動。在原發(fā)主動轉(zhuǎn)運過程中能源可以是光,ATP或電子傳遞;而第二級主動轉(zhuǎn)運是在離子濃度梯度下進行的?!客ㄍ赶禂?shù)(permeabilitycoefficient):是離子或小分子擴散過脂雙層膜能力的一種量度。通透系數(shù)大小與這些離子或分子在非極性溶液中的溶解度成比例。被動轉(zhuǎn)運(passivetransport):那稱為易化擴散。是一種轉(zhuǎn)運方式,通過該方式溶質(zhì)特異的結(jié)合于一個轉(zhuǎn)運蛋白上,然后被轉(zhuǎn)運過膜,但轉(zhuǎn)運是沿著濃度梯度下降方向進行的,所學(xué)習(xí)必備——歡迎干載以被動轉(zhuǎn)達不需要能量的支持。協(xié)同運輸(contransport)是一類靠間接提供能量完成的主動運輸方式。物質(zhì)跨膜運動所需要的能量來自膜兩側(cè)離子的電化學(xué)濃度梯度,而維持這種電化學(xué)勢的是鈉鉀泵或質(zhì)子泵。包括同向協(xié)同、反向協(xié)同?;鶊F運輸一般來說,物質(zhì)通過膜運輸是不需要進行化學(xué)修飾,但有些糖在通過細菌膜時需要進行磷酸化反應(yīng)加入一個磷酸基團,以糖-磷酸的形式才能通過膜,稱為基團運輸。一個最明顯的例子是1964年由RosmanS等在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)的磷酸烯醇式丙酮酸轉(zhuǎn)磷酸化酶系統(tǒng)即PTS(phosphoenolpyruvate(PEP)-linkedphosphotransferasesystem)系統(tǒng)胞吞(信用)(endocytosis):物質(zhì)被質(zhì)膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形成(物質(zhì)在囊泡內(nèi))被帶入到細胞內(nèi)的過程。胞吞作用(endocytosis)物質(zhì)被質(zhì)膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形成(物質(zhì)在囊泡內(nèi))被帶入到細胞內(nèi)的過程。包括吞噬作用和胞飲作用。吞噬作用(phagocytosis)吞噬細胞攝取顆粒物質(zhì)的過程。胞飲作用(pinocytosis)細胞從外界中攝取可溶性物質(zhì)的過程。第三章氨基酸和蛋白質(zhì)氨基酸(aminoacid);是含有一個堿性氨基和一個酸性竣基的有機化合物,氨基一般連在*碳上。必需氨基酸(essentialaminoacid):指人(或其它脊椎動物)(賴氨酸,蘇氨酸等)自己不能合成,需要從食物中獲得的氨基酸。非必需氨基酸(nonessentialaminoacid):指人(或其它脊椎動物)自己能由簡單的前體合成不需要從食物中獲得的氨基酸。等電點(pI,isoelectricpoint):使分子處于兼性分子狀態(tài),在電場中不遷移(分子的靜電荷為零)的pH值。兩性電解質(zhì)(ampholyte)同時帶有可解離為負電荷和正電荷基團的電解質(zhì)。等電點(pI,isoelectricpoint)使分子處于兼性分子狀態(tài),在電場中不遷移(分子的靜電荷為零)的pH值。茚三酮反應(yīng)(ninhydrinreaction)在加熱條件下,氨基酸或肽與荀三酮反應(yīng)生成紫色(與脯氨酸反應(yīng)生成黃色)化合物的反應(yīng)。肽鍵(peptidebond)一個氨基酸的竣基與另一個的氨基的氨基縮合,除去一分子水形成的酰氨鍵。范德華力(vanderWaalsforce)分子間作用力又被稱為范德華力,按其實質(zhì)來說是一種電性的吸引力??煞譃槿∠蛄?、誘導(dǎo)力、色散力三種,廣義的范德華力包括氫鍵。氫鍵(hydrogenbond)氫原子與電負性的原子X共價結(jié)合時,共用的電子對強烈地偏向X的一邊,使氫原子帶有部分正電荷,能再與另一個電負性高而半徑較小的原子丫結(jié)合,形成的X—H…Y型的鍵。疏水作用(hydrophobicinteraction)疏水作用是指水介質(zhì)中球狀蛋白質(zhì)的折疊總是傾向于把疏水殘基埋藏在分子內(nèi)部的現(xiàn)象。二硫鍵(disulfidebond):通過兩個(半胱氨酸)巰基的氧化形成的共價鍵。二硫鍵在穩(wěn)定某些蛋白的三維結(jié)構(gòu)上起著重要的作用。肽(peptide):兩個或兩個以上氨基通過肽鍵共價連接形成的聚合物。肽鍵(peptidebond):一個氨基酸的竣基與另一個的氨基的氨基縮合,除去一分子水形成學(xué)習(xí)必備——歡迎干載的酰氨鍵。肽單位(peptideunit):又稱為肽基(peptidegroup),是肽鍵主鏈上的重復(fù)結(jié)構(gòu)。是由參于肽鏈形成的氮原子,碳原子和它們的4個取代成分:羰基氧原子,酰氨氫原子和兩個相鄰a-碳原子組成的一個平面單位。肽平面(peptideplane)也叫酰胺平面,指肽鏈主鏈上的肽鍵因具有部分雙鍵性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn),使連接在肽鍵上的6個原子共處的同一平面。谷胱甘肽(glutathione,GSH)由谷氨酸、半胱氨酸、甘氨酸組成的短肽,主要生理作用是做為體內(nèi)一種重要的抗氧化劑,它能夠清除掉人體內(nèi)的自由基,清潔和凈化人體內(nèi)環(huán)境污染,從而增進了人的身心健康。谷胱甘肽有還原型(G-SH)和氧化型(666-6)兩種形式,在生理條件下以還原型谷胱甘肽占絕大多數(shù)。谷胱甘肽還原酶催化兩型間的互變。該酶的輔酶為磷酸糖旁路代謝提供的NADPH。Edman降解位~巾@門degradation以多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經(jīng)層析鑒定,余下的多肽鏈(少了一個殘基)被回收再進行下一輪降解循環(huán)。雙縮脲反應(yīng)(biuretreaction)蛋白質(zhì)在堿性溶液中與硫酸銅作用形成紫藍色絡(luò)合物的呈色反應(yīng)。在540nm波長處有最大吸收??捎糜诘鞍踪|(zhì)的定性和定量檢測。茚三酮反應(yīng)(ninhydrinreaction)在加熱條件下,氨基酸或肽與荀三酮反應(yīng)生成紫色(與脯氨酸或羥脯氨酸反應(yīng)生成(亮)黃色)化合物的反應(yīng)。此反應(yīng)十分靈敏,根據(jù)反應(yīng)所生成的藍紫色的深淺,在570nm波長下進行比色就可測定樣品中氨基酸的含量,也可以在分離氨基酸時作為顯色劑對氨基酸進行定性或定量分析。件碳原子的二面角兩個肽鍵平面之間的a-碳原子,可以作為一個旋轉(zhuǎn)點形成二面角(dihedralangle)。繞Ca-N鍵軸旋轉(zhuǎn)的二面角(C-N-Ca-C)稱為中,繞Ca-C鍵軸旋轉(zhuǎn)的二面角(N-Ca-C-N)稱為5原則上中和中可以取-180°~+180°之間的任一值,這樣多肽鏈主鏈的各種可能構(gòu)象都可用中和中這兩個二面角或扭角來描述。構(gòu)形(configuration):有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。這種排列不經(jīng)過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。構(gòu)形的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化。構(gòu)象(conformation):指一個分子中,不改變共價鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周圍的原子放置所產(chǎn)生的空間排布。一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時,不要求共價鍵的斷裂和重新形成。構(gòu)象改變不會改變分子的光學(xué)活性。疏水相互作用(hydrophobicinteraction):非極性分子之間的一種弱的非共價的相互作用。這些非極性的分子在嗷肪持芯哂斜蕓嗷^奐那閬頡?lt;br>17,伴娘蛋白(chaperone):與一種新合成的多肽鏈形成復(fù)合物并協(xié)助它正確折疊成具有生物功能構(gòu)向的蛋白質(zhì)。伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒有組裝的蛋白亞基的不正確聚集,協(xié)助多肽鏈跨膜轉(zhuǎn)運以及大的多亞基蛋白質(zhì)的組裝和解體。別構(gòu)效應(yīng)(allostericeffect):又稱為變構(gòu)效應(yīng),是寡聚蛋白與配基結(jié)合改變蛋白質(zhì)的構(gòu)象,導(dǎo)致蛋白質(zhì)生物活性喪失的現(xiàn)象。變性(denaturation;degeneration)蛋白質(zhì)或核酸分子中除了連接氨基酸或核甘酸鏈的一級化學(xué)鍵以外的任何天然構(gòu)象的改變。可涉及非共價鍵如氫鍵的斷裂和共價鍵如二硫鍵的斷裂,可導(dǎo)致蛋白質(zhì)或核酸的一種或多種化學(xué)、生物學(xué)或物理學(xué)特性的改變。蛋白質(zhì)變性(denaturation):生物大分子的天然構(gòu)象遭到破壞導(dǎo)致其生物活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在受到光照,熱,有機溶濟以及一些變性濟的作用時,次級鍵受到破壞,導(dǎo)致天然構(gòu)象的破壞,使蛋白質(zhì)的生物活性喪失。復(fù)性(renaturation;annealing)變性的逆轉(zhuǎn)。蛋白質(zhì)或核酸分子變性后,又全部或部分恢復(fù)其天然構(gòu)象的過程。學(xué)習(xí)必備——歡迎干載蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)(primarystructure)指蛋白質(zhì)中共價連接的氨基酸殘基的排列順序。維持一級結(jié)構(gòu)的主要作用力是肽鍵。蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)(secondarystructure)多肽鏈沿分子的一條軸所形成的旋轉(zhuǎn)和折疊,主要是由分子內(nèi)的氫鍵維系的局部空間排列。如蛋白質(zhì)的a螺旋、B折疊、B轉(zhuǎn)角、無規(guī)卷曲。a螺旋(a-helix)最先由LinusPauling好RobertCorey于1951年提出,是蛋白質(zhì)中常見的二級結(jié)構(gòu),肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu),螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。每個氨基酸殘基(第n個)的羰基與多肽鏈C端方向的第4個殘基(第4+n個)的酰胺氮形成氫鍵。在典型的右手a-螺旋結(jié)構(gòu)中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個氨基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的長軸上升0.15nm。P折疊(B-strand)是蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu),肽鍵平面折疊成鋸齒狀,相鄰肽鏈主鏈的N-H和c=o之間形成有規(guī)則的氫鍵,在B-折疊中,所有的肽鍵都參與鏈間氫鍵的形成,氫鍵與B-折疊的長軸呈垂直關(guān)系.P轉(zhuǎn)角(B-turnB-bend;reverseturn)由4個氨基酸殘基組成,其中第一個殘基的CO基團和第四個殘基的NH基團之間形成氫鍵,使多肽鏈的方向發(fā)生“U”形改變。無規(guī)卷曲(randomcoil)直鏈多聚體的一種比較不規(guī)則的構(gòu)象,其側(cè)鏈間的相互作用比較小。無規(guī)卷曲對圍繞單鍵轉(zhuǎn)動阻力極小,并且由于溶劑分子的碰撞而不斷扭曲,因此不具獨特的三維結(jié)構(gòu)和最適構(gòu)象。無規(guī)卷曲可因環(huán)境而改變,有其生物學(xué)意義,這類有序的非重復(fù)性結(jié)構(gòu)經(jīng)常構(gòu)成酶活性部位和其他蛋白質(zhì)特異的功能部位。超二級結(jié)構(gòu)(super-secondarystructure)蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)之間的一個過渡性結(jié)構(gòu)層次,在肽鏈折疊過程中,因一些二級結(jié)構(gòu)的構(gòu)象單元彼此相互作用組合而成。典型的超二級結(jié)構(gòu)有BaB、BBB、aa等。結(jié)構(gòu)域(StructuralDomain)是指蛋白質(zhì)亞基結(jié)構(gòu)中明顯分開的緊密球狀結(jié)構(gòu)區(qū)域,可被特定分子識別和具有特定功能。蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)(tertiarystructure)蛋白質(zhì)分子在二級、超二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進一步盤繞形成的高級結(jié)構(gòu)。亞基(subunit)又稱亞單位,組成蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)最小的共價單位,是指四級結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)中具有三級結(jié)構(gòu)的球蛋白。分子病(moleculardisease)由于基因或DNA分子的缺陷,致使細胞內(nèi)RNA及蛋白質(zhì)合成出現(xiàn)異常、人體結(jié)構(gòu)與功能隨之發(fā)生變異的疾病。DNA分子的此種異常,有些可隨個體繁殖而傳給后代。如鐮狀細胞性貧血,是合成血紅蛋白的基因異常所致的貧血疾患。蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)(quaternarystructure)蛋白質(zhì)的層次結(jié)構(gòu)中的第四個層次,特指組成蛋白質(zhì)的各個亞基通過非共價鍵相互作用(包括疏水相互作用、氫鍵和鹽鍵等排列組裝而成的立體結(jié)構(gòu)。大分子蛋白質(zhì)常由多條多肽鏈所組成,每條多肽鏈各具獨立的三級結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu)是指幾個各具獨立三級結(jié)構(gòu)之多肽鏈的相互結(jié)集、以特定的方式接觸、排列形成更高層次的大分子蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象。模序(Motif)也稱模體,在許多蛋白質(zhì)分子中,可以發(fā)現(xiàn)2到3個具有二級結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上互相接近,形成一個具有特殊功能的空間結(jié)構(gòu),稱為蛋白質(zhì)的'模序”。一個模序總有其特異的氨基酸序列,發(fā)揮特殊的功能,例如“鋅指結(jié)構(gòu)"(zincfinger),此模體由一個a-螺旋和兩個反平行的B-折疊三個肽段組成,形似手指,具有結(jié)合鋅離子的功能。模體的特征性空間結(jié)構(gòu)使其特殊功能的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)??乖瓫Q定簇(antigenicdeterminant)又稱表位,是決定抗原性的特殊化學(xué)基團,大多存在于抗原物質(zhì)的表面,有些存在于抗原物質(zhì)的內(nèi)部,須經(jīng)酶或其他方式處理后才暴露出來??贵w(antibody;Ab)機體的免疫系統(tǒng)在抗原刺激下,由B淋巴細胞或記憶細胞增殖分化成的漿細胞所產(chǎn)生的、可與相應(yīng)抗原發(fā)生特異性結(jié)合的免疫球蛋白。主要分布在血清中,也學(xué)習(xí)必備——歡迎干載分布于組織液及外分泌液中??乖?antigen;Ag)是指能夠刺激機體產(chǎn)生(特異性)免疫應(yīng)答,并能與免疫應(yīng)答產(chǎn)物抗體和致敏淋巴細胞在體外結(jié)合,發(fā)生免疫效應(yīng)(特異性反應(yīng))的物質(zhì)??乖幕咎匦杂袃煞N:一是誘導(dǎo)免疫應(yīng)答的能力,也就是免疫原性;二是與免疫應(yīng)答的產(chǎn)物發(fā)生反應(yīng),也就是抗原性。半抗原(hapten)能與對應(yīng)抗體結(jié)合出現(xiàn)抗原-抗體反應(yīng)、又不能單獨激發(fā)人或動物體產(chǎn)生抗體的抗原。它只有反應(yīng)原性,不具免疫原性,又稱不完全抗原。大多數(shù)多糖和所有的類脂都屬于半抗原。如果用化學(xué)方法把半抗原與某種純蛋白的分子(載體)結(jié)合,純蛋白會獲得新的免疫原性,并能刺激動物產(chǎn)生相應(yīng)的抗體。半抗原一旦與純蛋白結(jié)合,就構(gòu)成該蛋白質(zhì)的一個抗原簇。一些比一般半抗原分子量小,但有特異結(jié)構(gòu)的化學(xué)活性基團物質(zhì)(如青霉素、磺胺劑等),稱為簡單半抗原。當(dāng)簡單半抗原進入過敏體質(zhì)的機體時,能與體內(nèi)組織蛋白結(jié)合,成為完全抗原,這種完全抗原可引起超敏反應(yīng)。一般來說,B淋巴細胞識別半抗原決定簇,T淋巴細胞識別載體抗原決定簇。單克隆抗體(monoclonalantibody;McAb;mAb)高度均質(zhì)性的特異性抗體,由一個識別單一抗原表位的B細胞克隆所分泌。一般來自雜交瘤細胞。多克隆抗體(polyclonalantibody)由多個B細胞克隆所產(chǎn)生的抗體,可與不同抗原表位結(jié)合且免疫球蛋白類別各異?;钚噪?ActivePeptide)肽是兩個或兩個以上的氨基酸以肽鍵相連的化合物,在人體內(nèi)起重要生理作用,發(fā)揮生理功能。具有活性的多肽稱為活性肽,又稱生物活性肽或生物活性多肽。同源蛋白(homologousprotein)結(jié)構(gòu)和功能類似的蛋白質(zhì)。這些蛋白質(zhì)可以是在進化過程中,來自共同的祖先蛋白質(zhì),但以后發(fā)散進化成為結(jié)構(gòu)類似,而功能差異較大的蛋白質(zhì)。另一種可能是在一定條件的作用下,由不同的祖先收斂進化為結(jié)構(gòu)和功能類似的蛋白質(zhì)。同源蛋白質(zhì)(homologousprotein)來自不同種類生物的序列和功能類似的蛋白質(zhì),例如血紅蛋白。血紅蛋白(haemoglobin;hemoglobin;ferrohemoglobin;Hb;HHb)存在于脊椎動物、某些無脊椎動物血液和豆科植物根瘤中。血紅蛋白是使血液呈紅色的蛋白,它由四條鏈組成,兩條a鏈和兩條B鏈,每一條鏈有一個包含一個鐵原子的環(huán)狀血紅素。氧氣結(jié)合在鐵原子上,被血液運輸。血紅蛋白的氧解離曲線呈S形,提示亞基之間存在正協(xié)同作用。肌紅蛋白(myoglobin,MYO,Mb)由153個氨基酸殘基組成,是由一條肽鏈和一個血紅素輔基組成的結(jié)合蛋白,和血紅蛋白同源,與氧的結(jié)合能力介于血紅蛋白和細胞色素氧化酶之間,可幫助肌細胞將氧轉(zhuǎn)運到線粒體。它的氧飽和曲線為雙曲線型。肌紅蛋白(myoglobin):是由一條肽鏈和一個血紅素輔基組成的結(jié)合蛋白,是肌肉內(nèi)儲存氧的蛋白質(zhì),它的氧飽和曲線為雙曲線型。血紅蛋白(hemoglobin):是由含有血紅素輔基的4個亞基組成的結(jié)合蛋白。血紅蛋白負責(zé)將氧由肺運輸?shù)酵庵芙M織,它的氧飽和曲線為S型。纖維蛋白(fibrousprotein)一類主要的不溶于水的蛋白質(zhì),通常都含有呈現(xiàn)相同二級結(jié)構(gòu)的多肽鏈許多纖維蛋白結(jié)合緊密,并為單個細胞或整個生物體提供機械強度,起著保護或結(jié)構(gòu)上的作用。球蛋白(globularprotein)緊湊的,近似球形的,含有折疊緊密的多肽鏈的一類蛋白質(zhì),許多都溶于水。典形的球蛋白含有能特異的識別其它化合物的凹陷或裂隙部位。角蛋白(keratin):由處于a-螺旋或0-折疊構(gòu)象的平行的多肽鏈組成不溶于水的起著保護或結(jié)構(gòu)作用蛋白質(zhì)。學(xué)習(xí)必備——歡迎干載膠原(蛋白)(collagen)是動物結(jié)締組織最豐富的一種蛋白質(zhì),它是由原膠原蛋白分子組成。原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結(jié)構(gòu)的蛋白。每個原膠原分子都是由3條特殊的左手螺旋(螺距0.95nm,每一圈含有3.3個殘基)的多肽鏈右手旋轉(zhuǎn)形成的。分子伴侶(chaperone;molecularchaperone)一組從細菌到人廣泛存在的蛋白質(zhì),非共價地與新生肽鏈和解折疊的蛋白質(zhì)肽鏈結(jié)合,并幫助它們折疊和轉(zhuǎn)運,通常不參與靶蛋白的生理功能。主要有三大類:伴侶蛋白、熱激蛋白70家族和熱激蛋白90家族。鐮刀型細胞貧血?。╯ickle-cellanemia)血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大部分紅細胞呈鐮刀狀。其特點是病人的血紅蛋白6TZ基N端的第六個氨基酸殘缺是纈氨酸(vol),而不是下正常的谷氨酸殘基(Ghe)?;疾≌叩难杭t細胞表現(xiàn)為鐮刀狀,其攜帶氧的功能只有正常紅細胞的一半。層析(chromatography)按照在移動相和固定相(可以是氣體或液體)之間的分配比例將混合成分分開的技術(shù)。Edman降解(Edmandegradation):從多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經(jīng)層析鑒定,余下的多肽鏈(少了一個殘基)被回收再進行下一輪降解循環(huán)。離子交換層析(ion-exchangecolumn)使用帶有固定的帶電基團的聚合樹脂或凝膠層析柱透析(dialysis):通過小分子經(jīng)過半透膜擴散到水(或緩沖液)的原理,將小分子與生物大分子分開的一種分離純化技術(shù)。凝膠過濾層析(gelfiltrationchromatography)也叫做分子排阻層析。一種利用帶孔凝膠珠作基質(zhì),按照分子大小分離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。親合層析(affinitychromatograph)利用共價連接有特異配體的層析介質(zhì),分離蛋白質(zhì)混合物中能特異結(jié)合配體的目的蛋白質(zhì)或其它分子的層析技術(shù)。高壓液相層析(HPLC):使用顆粒極細的介質(zhì),在高壓下分離蛋白質(zhì)或其他分子混合物的層析技術(shù)。透析(dialysis)通過小分子經(jīng)過半透膜擴散到水(或緩沖液)的原理,將小分子與生物大分子分開的一種分離純化技術(shù)。鹽溶(salting-in)在蛋白質(zhì)水溶液中,加入少量的中性鹽,如硫酸銨、硫酸鈉、氯化鈉等,會增加蛋白質(zhì)分子表面的電荷,增強蛋白質(zhì)分子與水分子的作用,從而使蛋白質(zhì)在水溶液中的溶解度增大,這種現(xiàn)象稱為鹽溶。鹽析(salting-out)增加中性鹽濃度使蛋白質(zhì)、氣體、未帶電分子溶解度降低的現(xiàn)象。是蛋白質(zhì)分離純化中經(jīng)常使用的方法,最常用的中性鹽有硫酸銨、硫酸鈉和氯化鈉等。凝膠電泳(gelelectrophoresis)以凝膠為介質(zhì),在電場作用下分離蛋白質(zhì)或核酸的分離純化技術(shù)。SDS-聚丙烯酰氨凝膠電泳(SDS)在去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰氨凝膠電泳。SDS只是按照分子的大小,而不是根據(jù)分子所帶的電荷大小分離的。等電聚膠電泳(isoelectricfocusingelectrophoresis,IFE)利用一種特殊的緩沖液(兩性電解質(zhì))在聚丙烯酰氨凝膠制造一個pH梯度,電泳時,每種蛋白質(zhì)遷移到它的等電點(pI)處,即梯度足的某一pH時,就不再帶有凈的正或負電荷了。雙向電泳(two-dimensionalelectrophorese)等電聚膠電泳和SDS的組合,即先進行等電聚膠電泳(按照pI)分離,然后再進行SDS(按照分子大小分離)。經(jīng)染色得到的電泳圖是二維分布的蛋白質(zhì)圖。Wenternblot蛋白質(zhì)印跡,它是分子生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫遺傳學(xué)中常用的一種實驗學(xué)習(xí)必備——歡迎干載方法。其基本原理是通過特異性抗體對凝膠電泳處理過的細胞或生物組織樣品進行著色,通過分析著色的位置和著色深度獲得特定蛋白質(zhì)在所分析的細胞或組織中的表達情況的信息。波爾效應(yīng)(Bohreffect)CO2濃度的增加降低細胞內(nèi)的pH,引起紅細胞內(nèi)血紅蛋白氧親和力下降的現(xiàn)象。協(xié)同效應(yīng)(synergisticeffect)是指兩種或兩種以上的組分相加或調(diào)配在一起,所產(chǎn)生的作用大于各種組分單獨應(yīng)用時作用的總和。而其中對混合物產(chǎn)生這種效果的物質(zhì)稱為增效劑(synergist)。分為正協(xié)同效應(yīng)、負協(xié)同效應(yīng)。第四章酶酶(enzyme)生物催化劑,除少數(shù)RNA外幾乎都是蛋白質(zhì)。酶不改變反應(yīng)的平衡,只是通過降低活化能加快反應(yīng)的速度。脫脯基酶蛋白(apoenzyme):酶中除去催化活性可能需要的有機或無機輔助因子或輔基后的蛋白質(zhì)部分。全酶(holoenzyme):具有催化活性的酶,包括所有必需的亞基,輔基和其它輔助因子。酶活力單位(U,activeunit):酶活力單位的量度。1961年國際酶學(xué)會議規(guī)定:1個酶活力單位是指在特定條件(25°C,其它為最適條件)下,在1min內(nèi)能轉(zhuǎn)化l^mol底物的酶量,或是轉(zhuǎn)化底物中Ipmol的有關(guān)基團的酶量。單體酶僅有一個活性中心的多肽鏈構(gòu)成的酶,一般是由一條多肽鏈組成。寡聚酶由2個或多個相同或不相同亞基組成的酶,稱為寡聚酶。多酶體系(multienzymesystem)在完整細胞內(nèi)的某一代謝過程中,由幾種不同的酶聯(lián)合組成的一個結(jié)構(gòu)和功能的整體,催化一組連續(xù)的密切相關(guān)的反應(yīng)。輔酶(coenzyme)是一類可以將化學(xué)基團從一個酶轉(zhuǎn)移到另一個酶上的有機小分子,與酶較為松散地結(jié)合,對于特定酶的活性發(fā)揮是必要的。有許多維他命及其衍生物,如核黃素、硫胺素和葉酸,都屬于輔酶。這些化合物無法由人體合成,必須通過飲食補充。不同的輔酶能夠攜帶的化學(xué)基團也不同:NAD或NADP+攜帶氫離子,輔酶A攜帶乙?;~酸攜帶甲?;琒-腺甘基蛋氨酸也可攜帶甲?;]o基(prostheticgroup)酶的輔因子或結(jié)合蛋白質(zhì)的非蛋白部分(其中較小的非蛋白質(zhì)部分稱輔基),與酶或蛋白質(zhì)結(jié)合的非常緊密,用透析法不能除去。輔基在整個酶促反應(yīng)過程中始終與酶的特定部位結(jié)合,例如細胞色素氧化酶的鐵卟啉。輔因子(cofactor)是指與酶結(jié)合且在催化反應(yīng)中必要的具有輔助功能的非蛋白質(zhì)化合物。脫脯基酶蛋白(apoenzyme)酶中除去催化活性可能需要的有機或無機輔助因子或輔基后的蛋白質(zhì)部分。全酶(holoenzyme)具有催化活性的酶,包括所有必需的亞基,輔基和其它輔助因子。核酶(ribozyme)是具有催化功能的RNA分子,是生物催化劑。核酶又稱核酸類酶、酶RNA、核酶類酶RNA。注:端粒酶(telomerase)一種自身攜帶模板的逆轉(zhuǎn)錄酶,由RNA和蛋白質(zhì)組成,RNA組分中含有一段短的模板序列與端粒DNA的重復(fù)序列互補,而其蛋白質(zhì)組分具有逆轉(zhuǎn)錄酶活性,以RNA為模板催化端粒DNA的合成,將其加到端粒的3'端,以維持端粒長度及功能。端粒(telomere)線狀染色體末端的DNA重復(fù)序列,是真核染色體兩臂末端由特定的DNA重復(fù)序列構(gòu)成的結(jié)構(gòu),使正常染色體端部間不發(fā)生融合,保證每條染色體的完整性。端粒是短的多重復(fù)的非轉(zhuǎn)錄序列(TTAGGG)及一些結(jié)合蛋白組成特殊結(jié)構(gòu),除了提供非學(xué)習(xí)必備——歡迎干載轉(zhuǎn)錄DNA的緩沖物外,它還能保護染色體未端免于融合和退化,在染色體定位、復(fù)制、保護和控制細胞生長及壽命方面具有重要作用,并與細胞凋亡、細胞轉(zhuǎn)化和永生化密切相關(guān)??贵w酶(abzyme)通過改變抗體中與抗原結(jié)合的微環(huán)境,并在適當(dāng)?shù)牟课灰胂鄳?yīng)的催化基團,所產(chǎn)生的具有催化活性的抗體??捎蓛煞N途徑獲得抗體酶:①采用過渡態(tài)的底物類似物誘導(dǎo);②在現(xiàn)有的抗體基礎(chǔ)上,通過化學(xué)修飾或通過蛋白質(zhì)工程向其配體結(jié)合部位導(dǎo)入催化基團。固定化酶(immobilizedenzyme)是用物理的或化學(xué)的方法使酶與水不溶性大分子載體結(jié)合或把酶包埋在水不溶性凝膠或半透膜的微囊體中制成的。酶固定化后一般穩(wěn)定性增加,易從反應(yīng)系統(tǒng)中分離,且易于控制,能反復(fù)多次使用。便于運輸和貯存,有利于自動化生產(chǎn)。酶活力單位(U,activeunit)酶活力單位的量度。1961年國際酶學(xué)會議規(guī)定:1個酶活力單位是指在特定條件(25℃,其它為最適條件)下,在1min內(nèi)能轉(zhuǎn)化lpmol底物的酶量,或是轉(zhuǎn)化底物中l(wèi)pmol的有關(guān)基團的酶量。催化常數(shù)(catalyticnumber)(Kcat)也稱為轉(zhuǎn)換數(shù)。是一個動力學(xué)常數(shù),是在底物處于飽和狀態(tài)下一個酶(或一個酶活性部位)催化一個反應(yīng)有多快的測量。催化常數(shù)等于最大反應(yīng)速度除以總的酶濃度(umax/[E]total)?;蚴敲磕γ富钚圆课幻棵腌娹D(zhuǎn)化為產(chǎn)物的底物的量(摩[爾])。米氏方程(Michaelis-Mententequation)表示一個酶促反應(yīng)的起始速度(v)與底物濃度([s])關(guān)系的速度方程:u=umax[s]/(Km+[s])米氏常數(shù)(Michaelisconstant)酶促反應(yīng)的反應(yīng)速度達到最大反應(yīng)速度(vmax)一半時的底物濃度。初速度(initialvelocity)酶促反應(yīng)最初階段底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的速度,這一階段產(chǎn)物的濃度非常低,其逆反應(yīng)可以忽略不計。雙倒數(shù)作圖(double-reciprocalplot)那稱為Lineweaver_Burk作圖。一個酶促反應(yīng)的速度的倒數(shù)(1/V)對底物度的倒數(shù)(1/LSF)的作圖。x和y軸上的截距分別代表米氏常數(shù)和最大反應(yīng)速度的倒數(shù)。激活劑(activator)凡是能提高酶活性的物質(zhì)都稱為激活劑。抑制劑(depressant;depressor)競爭性抑制作用(competitiveinhibition)通過增加底物濃度可以逆轉(zhuǎn)的一種酶抑制類型。競爭性抑制劑通常與正常的底物或配體競爭同一個蛋白質(zhì)的結(jié)合部位。這種抑制劑使Km增大而umax不變。非競爭性抑制作用(noncompetitiveinhibition)抑制劑不僅與游離酶結(jié)合,也可以與酶-底物復(fù)合物結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制使Km不變而umax變小。反競爭性抑制作用(uncompetitiveinhibition)抑制劑只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合而不與游離的酶結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制使Km和umax都變小但umax/Km不變。酶原(zymogen)通過有限蛋白水解,能夠由無活性變成具有催化活性的酶前體。另U構(gòu)酶(allostericenzyme)具有變構(gòu)效應(yīng)的酶。有些酶除了活性中心外,還有一個或幾個部位,當(dāng)特異性分子非共價地結(jié)合到這些部位時,可改變酶的構(gòu)象,進而改變酶的活性,酶的這種調(diào)節(jié)作用稱為變構(gòu)調(diào)節(jié)(allostericregulation),受變構(gòu)調(diào)節(jié)的酶稱變構(gòu)酶。別構(gòu)效應(yīng)(allostericeffect)一個蛋白質(zhì)與其配體(或其他蛋白質(zhì))結(jié)合后,蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,使它適用于功能的需要,這一類變化稱為別構(gòu)效應(yīng)或變構(gòu)效應(yīng)??拷?yīng)(proximityeffect):非酶促催化反應(yīng)或酶促反應(yīng)速度的增加是由于底物靠近活性部位,使得活性部位處反應(yīng)劑有效濃度增大的結(jié)果,這將導(dǎo)致更頻繁地形成過度態(tài)。別構(gòu)酶(allostericenzyme):活性受結(jié)合在活性部位以外的部位的其它分子調(diào)節(jié)的酶。學(xué)習(xí)必備——歡迎干載別構(gòu)調(diào)節(jié)酶(allostericmodulator):那稱為別構(gòu)效應(yīng)物。結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位,調(diào)節(jié)酶催化活性的別構(gòu)調(diào)節(jié)劑(allostericmodulator):結(jié)合在別構(gòu)調(diào)節(jié)酶的調(diào)節(jié)部位調(diào)節(jié)該酶催化活性的生物分子,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑可以是激活劑,也可以是抑制劑。同功酶(isoenzymeisozyme):催化同一化學(xué)反應(yīng)而化學(xué)組成不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列,底物的親和性等方面都存在著差異。同促效應(yīng)(homotropiceffect)當(dāng)一個效應(yīng)物分子與酶結(jié)合之后,影響另一相同的效應(yīng)物分子與酶的另一部位結(jié)合稱為同促效應(yīng)。異促效應(yīng)(heterotropiceffect)當(dāng)一分子效應(yīng)物和酶結(jié)合之后,影響到另一不同的效應(yīng)物分子與酶的另一部位結(jié)合則稱為異促效應(yīng)。齊變模式(concertedmodel)相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的一種模式,按照最簡單的齊變模式,由于一個底物或別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的結(jié)合,蛋白質(zhì)的構(gòu)相在T(對底物親和性低的構(gòu)象)和R(對底物親和性高的構(gòu)象)之間變換。這一模式提出所有蛋白質(zhì)的亞基都具有相同的構(gòu)象,或是T構(gòu)象,或是R構(gòu)象。序變模式(sequentialmodel)相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的另外一種模式。按照最簡單的序變模式,一個配體的結(jié)合會誘導(dǎo)它結(jié)合的亞基的三級結(jié)構(gòu)的變化,并使相鄰亞基的構(gòu)象發(fā)生很大的變化。按照序變模式,只有一個亞基對配體具有高的親和力。比活(specificactivity)每分鐘每毫克酶蛋白在25℃下轉(zhuǎn)化的底物的微摩爾數(shù)。比活是酶純度的測量?;罨?activationenergy)1mol反應(yīng)底物中所有分子由其態(tài)轉(zhuǎn)化為過渡態(tài)所需要的能量。活性部位(activeenergy)酶中含有底物結(jié)合部位和參與催化底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的氨基酸殘基部分?;钚圆课煌ǔN挥诘鞍踪|(zhì)的結(jié)構(gòu)域或亞基之間的裂隙或是蛋白質(zhì)表面的凹陷部位,通常都是由在三維空間上靠得很進的一些氨基酸殘基組成。調(diào)節(jié)部位(regulatorysite)在酶分子催化部位外,能結(jié)合調(diào)節(jié)物而影響酶活性的部位。同工酶(isoenzymeisozyme)催化同一化學(xué)反應(yīng)而化學(xué)組成不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列,底物的親和性等方面都存在著差異。組成酶(constitutiveenzyme)細胞內(nèi)以相對恒定量存在的酶,其含量不受組織、介質(zhì)的組成和生長條件的影響。誘導(dǎo)酶(inducibleenzyme)在正常細胞中沒有或只有很少量存在,但在酶誘導(dǎo)的過程中,由于誘導(dǎo)物的作用而被大量合成的酶。調(diào)節(jié)酶(regulatoryenzyme)在多酶體系中對代謝過程起調(diào)節(jié)作用的酶,一般是反應(yīng)序列中的第一種酶,或是代謝途徑分支點的酶。其催化活性受到嚴(yán)格的調(diào)節(jié)控制。絲氨酸蛋白酶(serineprotease)活性部位含有在催化期間起親核作用的絲氨殘基的蛋白質(zhì)。絲氨酸蛋白酶是一個蛋白酶家族,它們的作用是斷裂大分子蛋白質(zhì)中的肽鍵,使之成為小分子蛋白質(zhì)。其激活是通過活性中心一組氨基酸殘基變化實現(xiàn)的,它們之中一定有一個是絲氨酸(其名字的由來)。酶工程(enzymeengineering)將酶或者微生物細胞,動植物細胞,細胞器等在一定的生物反應(yīng)裝置中,利用酶所具有的生物催化功能,借助工程手段將相應(yīng)的原料轉(zhuǎn)化成有用物質(zhì)并應(yīng)用于社會生活的一門科學(xué)技術(shù)。乒乓反應(yīng)(ping-pongreaction)在該反應(yīng)中,酶結(jié)合一個底物并釋放一個產(chǎn)物,留下一個取代酶,然后該取代酶再結(jié)合第二個底物和釋放出第二個產(chǎn)物,最后酶恢復(fù)到它的起始狀態(tài)。學(xué)習(xí)必備——歡迎干載酸-堿催化(acid-basecatalysis)質(zhì)子轉(zhuǎn)移加速反應(yīng)的催化作用。共價催化(covalentcatalysis)一個底物或底物的一部分與催化劑形成共價鍵,然后被轉(zhuǎn)移給第二個底物。許多酶催化的基團轉(zhuǎn)移反應(yīng)都是通過共價方式進行的。第五章維生素與激素維生素(vitamin)是一類動物本身不能合成,但對動物生長和健康又是必需的有機物,所以必需從食物中獲得。許多輔酶都是由維生素衍生的。水溶性維生素(water-solublevitamin)一類能溶于水的有機營養(yǎng)分子。其中包括在酶的催化中起著重要作用的B族維生素以及抗壞血酸(維生素C)等。脂溶性維生素(lipidvitamin)由長的碳氫鏈或稠環(huán)組成的聚戊二烯化合物。脂溶性維生素包括A,D,E,和K,這類維生素能被動物貯存。尼克酰胺腺嘌吟二核苷酸(NAD+)和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+)含有尼克酰胺的輔酶,在某些氧化還原中起著氫原子和電子載體的作用,常常作為脫氫酶的輔。黃素腺嘌吟二核苷酸(FAD):是某些氧化還原反應(yīng)的輔酶,含有核黃素。黃素單核苷酸(FMN)一種核黃素磷酸,是某些氧化還原反應(yīng)的輔酶。硫胺素焦磷酸(thiaminephosphate,TPP)是維生素B1的輔形式,參與轉(zhuǎn)醛基反應(yīng)。輔酶(conzyme):某些酶在發(fā)揮催化作用時所需的一類輔助因子,其成分中往往含有維生素。輔酶與酶結(jié)合松散,可以通過透析除去。輔基(prostheticgroup):是與酶蛋白質(zhì)共價結(jié)合的金屬離子或一類有機化合物,用透析法不能除去。輔基在整個酶促反應(yīng)過程中始終與酶的特定部位結(jié)合。輔酶A(coenzymeA)一種含有泛酸的輔酶,在某些酶促反應(yīng)中作為?;妮d體。磷酸吡哆醛(pyidoxalphosphate)是維生素B6(叱哆醇)的衍生物,是轉(zhuǎn)氨酶,脫羧酶和消旋酶的酶。轉(zhuǎn)氨酶(transaminase)那稱為氨基轉(zhuǎn)移酶,在該酶的催化下,一個a-氨基酸的氨基可轉(zhuǎn)移給別一個a-酮酸。類胡蘿卜素(carotenoid)由異戊二烯組成的脂溶性光合色素。生物素(biotin)參與脫羧反應(yīng)的一種酶的輔助因子。抗維生素(antivitamin)某些化合物的結(jié)構(gòu)類似于維生素的結(jié)構(gòu),他們在體內(nèi)與維生素競爭,而使維生素不能發(fā)揮作用,這些化合物被稱為抗維生素。經(jīng)常是用某些抗維生素來治療維生素缺乏癥。內(nèi)源因子(intrinsicfactor)胃幽門黏膜分泌的一種糖蛋白,維生素B12只有與他結(jié)合才可能通過腸壁被吸收,且不被腸細菌破壞。缺乏內(nèi)源因子可導(dǎo)致維生素B12缺乏癥。E-F手結(jié)構(gòu)細胞內(nèi)存在有多種鈣結(jié)合蛋白,這些蛋白的鈣結(jié)合部位都有一個共同的結(jié)構(gòu)特征,即在鈣結(jié)合位點有兩個螺旋區(qū)(E區(qū)和F區(qū)),他們的相對位置就像右手的大拇指和食指,該就像結(jié)合在兩個螺旋連接處的凹陷中,這種結(jié)構(gòu)稱為E-F手結(jié)構(gòu)。激素(hormone)由特定細胞分泌的對靶細胞的物質(zhì)代謝或生理功能起調(diào)控作用的一類微量有機分子。激素受體(hormonereceptor)細胞膜上或細胞內(nèi)激素作用的靶分子,能特異地識別激素分子并與之結(jié)合,進而引起生物效應(yīng)的特殊蛋白質(zhì)。級聯(lián)放大(cascadeamplification)在體內(nèi)的不同部位,通過一系列酶的酶促反應(yīng)來傳遞一個信息,并且初始信息在傳遞到系列反應(yīng)的最后時,信號得到放大,這樣的一個系列叫作級聯(lián)系統(tǒng)。共價修飾酶是具有此效果的典型代表。激素效應(yīng)元件(HER)指內(nèi)固醇甲狀腺素等激素受體結(jié)合的一段短的DNA序列(12~20bp),學(xué)習(xí)必備——歡迎干載這類受體結(jié)合DNA后可改變相鄰基因的表達。自磷酸化(autophosphorylation)蛋白激酶催化其自身磷酸化的現(xiàn)象。在配體與具有內(nèi)在蛋白激酶活性的受體結(jié)合時發(fā)生的這種作用能使受體二聚化。自磷酸化在細胞因子介導(dǎo)胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)及其發(fā)揮生物活性中起重要作用。維生素中毒癥所謂維生素中毒癥,就是服用過量的維生素后所發(fā)生的中毒性病癥。癩皮病本病的發(fā)生與尼克酸的攝入、吸收減少及代謝障礙有關(guān),尤其在以玉米等谷類為主食,又缺乏適當(dāng)付食品地區(qū),有時可以地方性疾病表現(xiàn)。佝僂病(rickets)俗稱缺鈣,在嬰兒期較為常見,是由于維生素D缺乏引起體內(nèi)鈣、磷代謝紊亂,而使骨骼鈣化不良的一種疾病。腳氣病(weakfoot)即維生素B1或硫胺素缺乏病(thiaminedeficiency)。硫胺素是參與體內(nèi)糖及能量代謝的重要維生素,其缺乏可導(dǎo)致消化、神經(jīng)和心血管諸系統(tǒng)的功能紊亂。腳氣病臨床有三種類型即“干型”神經(jīng)腳氣。后者多發(fā)生成年長者,伴有消耗癥狀,以神經(jīng)系統(tǒng)異常為主。“嬰兒型”嚴(yán)重,表現(xiàn)為急性心血管癥狀,不及時救治可引起死亡。第六章核酸基因(gene):也稱為順反子(cistron).泛指被轉(zhuǎn)錄的一個DNA片段。在某些情況下,基因常用來指編碼一個功能蛋白或DNA分子的DNA片段。核酸(nucleicacid)由核甘酸或脫氧核甘酸通過3',5'-磷酸二酯鍵連接而成的一類生物大分子。具有非常重要的生物功能,主要是貯存遺傳信息和傳遞遺傳信息。包括核糖核酸(RNA)和脫氧核糖核酸(DNA)兩類。核昔(nucleoside)由堿基和五碳糖(核糖或脫氧核糖)連接而成,即嘌吟的N-9或嘧啶的N-1與核糖或脫氧核糖的C-1通過B糖昔鍵連接而成的化合物,包括核糖核甘和脫氧核糖核昔兩類。構(gòu)成RNA的核昔是核糖核甘,主要有腺昔、鳥甘、胞昔和尿昔。構(gòu)成DNA的核昔是脫氧核糖核甘,主要有脫氧腺甘、脫氧鳥甘、脫氧胞昔和脫氧胸腺昔。核昔酸(nucleotide)核苷的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。視連接部位不同,有2'-核甘酸(核甘2'-磷酸)、3'-核甘酸(核甘3'-磷酸)和5'-核甘酸(核甘5'-磷酸酸)三種,體內(nèi)通常是5'-磷酸酯。cAMP(cycleAMP)3',5'-環(huán)腺甘酸,是細胞內(nèi)的第二信使,由于某部些激素或其它分
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