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文檔簡(jiǎn)介
Imagination
at
work.離子交換層析進(jìn)階與優(yōu)化層析技術(shù)的分類凝膠過(guò)濾離子交換疏水層析親和層析反相層析2離子交換和疏水層析2015/7/13離子交換層析原理如何做離子交換層析離子交換層析的應(yīng)用離子交換填料的選擇總結(jié)內(nèi)容離子交換層析?4離子交換和疏水層析2015/7/133離子交換層析是通過(guò)生物分子所帶的電荷與填料上所帶的相反電荷的可逆相互作用來(lái)分離物質(zhì)的一種層析方式。COOHR
NH+R
NH3+COO
-RNH2COO
-low
pH正電荷high
pH負(fù)電荷獲得氫失去氫acid
isoelectric
point
alkalineexcess
positive
charge
balanced
positive
and
negative
charge
excessnegative
chargeCOOHR
NH+pH
3
3
pH
10RNH+3COO-RCOO-NH2overall
charge
on
protein-+蛋白質(zhì)所帶有的電荷取決于pH蛋白質(zhì)的滴定曲線不同宿主中蛋白質(zhì)pI的分布Archaeoglobus
fulgidus
(2420
proteins)
E.
coli
(4279
proteins)H.
Sapiens
(27
941
proteins)絕大部分的pI在5.8或9附近pI分布直方圖SOURCE:
Multi-modality
of
pI
distribution
in
whole
proteome
Songfeng
et
al,
Proteomics,
2006蛋白質(zhì)在生理環(huán)境下通常是帶電荷的!6離子交換和疏水層析2015/7/13為什么選擇離子交換?離子交換是一種可以在層析的各個(gè)階段以及各種規(guī)模下廣泛使用的層析技術(shù)良好的可操控性
Controllable高選擇性
High
selectivity高載量
High
capacity可以將樣品濃縮
Concentrating高回收率
High
recovery離子交換層析原理如何做離子交換層析離子交換層析的應(yīng)用離子交換填料的選擇總結(jié)內(nèi)容怎樣做離子交換層析步驟如何做①
選擇合適的層析設(shè)備②
配制合適的緩沖液③
選擇合適的層析填料④
樣品準(zhǔn)備⑤
洗脫方式⑥
填料的
和再生9離子交換和疏水層析2015/7/13上樣洗脫平衡再生-----
-
--
-
-
---
------
-
--
--
--
-
-
--------
-
----++++
++
++++++-+
+
-+
++
-+-
+-
+
-
+-
+
--
++
-++
-
+-----
+-
+
--
-
+---陰離子交換介質(zhì)怎樣做離子交換-層析步驟10離子交換和疏水層析2015/7/13pH
cond
UVfraction
collection
Frac-901AW1W2B
MIXERsample11離子交換和疏水層析2015/7/13pump
P-920valve
FV-903monitor
UPC-900differentbuffersinjectionvalve
V1large
and
small
fractionscolumns
for
AIX,
CIXand
buffer
exchangemonitor
for
UV,conductivity
and
pH怎樣做離子交換-①層析設(shè)備選擇pH
3pH
10陰離子交換色譜陽(yáng)離子交換色譜charge
on
protein-+怎樣做離子交換-②選擇緩沖液pH12離子交換和疏水層析2015/7/1310203040500
02040
60
80Elution
volume
(ml)100mAUM
NaCl13離子交換和疏水層析2015/7/1310.50120pH
5pH
6pH
7pH
8pH
9使用scouting功能篩選合適的pH條件分離DACOS怎樣做離子交換-②選擇緩沖液pHColumn:
Q
XL,
6
mlSample:
2
mg
crude
DACOSSystem:
?KTAexplorer?
100BufferPrep怎樣做離子交換-②選擇緩沖系統(tǒng)陰離子交換陽(yáng)離子型緩沖體系,pH
略高于目標(biāo)蛋白pI(0.5-1
PH)增加pH
可以提高結(jié)合的強(qiáng)度陽(yáng)離子交換陰離子型緩沖體系,pH略低于目標(biāo)蛋白pI(0.5-1
PH)降低pH可以提高結(jié)合的強(qiáng)度14離子交換和疏水層析2015/7/13A.Citrate
20
mM,
pH
4.9B.Citrate
20
mM,
NaCl
1
M,
pH
4.915離子交換和疏水層析2015/7/13A.Citrate
20
mM,
pH
4.9B.A
+
NaCl
1
M怎樣做離子交換-②緩沖液配制方式“相同”的方式配制緩沖液?怎樣做離子交換-②緩沖液中的添加劑不帶電荷的中性添加劑通常是OK的!注意蛋白的溶解性和穩(wěn)定性會(huì)增加靜電作用添加甘油和醇類后粘度和背壓增加陰離子去垢劑如
SDS 會(huì)結(jié)合在陰離子交換劑上陽(yáng)離子去垢劑如
CPC 會(huì)結(jié)合在陽(yáng)離子交換劑上采用去污劑后,先運(yùn)行空白對(duì)照16離子交換和疏水層析2015/7/13500%
B1008time
minRNA/DNA0246RNADNAEDTA在陰離子交換層析中的累積和洗脫EDTA
absorbs
at
254
nm怎樣做離子交換-②緩沖液中的添加劑去垢劑在鹽梯度中達(dá)到臨界膠束濃度CMC超過(guò)臨界膠束濃度CMC,去垢劑形成膠束導(dǎo)致紫外檢測(cè)出問(wèn)題。怎樣做離子交換-②緩沖液中的添加劑19
/GE
/怎樣做離子交換-③選擇填料基架OS
OO配基Sepharose基架Source基架Capto基架Sephadex基架纖維素基架陰離子交換劑DiethylaminoethylDiethylaminopropyl(DEAE)(ANX)-CH2CHOHCHH2N+H(CH2CH3)2
弱Quaternary
ammonium
(Q)
-CH2N+(CH3)3陽(yáng)離子交換劑-OCH2CH2N+H(CH2CH3)2
弱強(qiáng)Carboxymethyl
(CM)Sulphopropyl
(SP)Methylsulphonate
(S)弱強(qiáng)強(qiáng)3-OCH2COO–-CH2CH2CH2SO
–3-CH2SO
–怎樣做離子交換-③選擇填料配基種類蛋白質(zhì)分子的凈電荷和pH有關(guān),所以要根據(jù)蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)和穩(wěn)定性來(lái)選擇離子交換填料的類型如何選擇合適的離子交換填料?從強(qiáng)離子交換劑開(kāi)始(Q,S,SP)可以在寬pH范圍開(kāi)展工作如果目標(biāo)蛋白的等電點(diǎn)低于pH7.0
或未知,用強(qiáng)陰離子交換劑如果強(qiáng)離子交換劑不滿意,可以考慮弱離子交換劑20離子交換和疏水層析2015/7/13強(qiáng)離子交換劑:載量在很寬的pH
范圍內(nèi)保持恒定怎樣做離子交換-③選擇填料配基強(qiáng)弱弱離子交換劑:載量隨pH
而變化原則:首選強(qiáng)離子交換劑,若選擇性不夠好時(shí),嘗試弱離子交換劑21離子交換和疏水層析2015/7/13高載量通量:–高流速粗純
中度純化
精純高分辨率載量合適的流速最高的分辨率要求90
μm
40,
30,
34
μm
15
μm
10
μm粒徑填料Sepharose
HPSOURCE
15MonoBeads?分辨率Rs通量Capto?Sepharose?
FFSOURCE?
30填料的選擇可以登錄
:
om/protein-purification怎樣做離子交換-③選擇填料顆粒大小22離子H交o換w和疏to水d層o析it2015/7/13怎樣做離子交換-③選擇填料顆粒大小平均粒徑40μm23離子交換和疏水層析2015/7/13平均粒徑90μmSample:0.4
mgconalbumin
pI=6.3,
0.8
mg
a-lactoglobulin
pI=5.8,1.2
mg
soyabean
trypsin
inhibitor
pI=4.5start
buffer.HiTrap?DEAE
FF
1
mlHiTrap
Q
FF
1
mlHiTrap
Q
XL
1
mlHiTrap
ANX
FF
high
sub
1
ml20
mM
Tris-HCl
pH
7.420
mM
Tris-HCl,
0.5
M
NaCl
pH
7.41
ml/min
150
cm/hdissolved
in
2mlColumns:Start
buffer:Elution
buffer:Flow
rate:Running
parameters
Equilibration:
20
ml
start
bufferSample
application:
2
mlwash:5
ml
start
buffer
elution
40
ml,
linear
gradient,0–80
%
elution
buffer?KTAexplorer?
100
controlled
by
UNICORN?
3.0Instrumentation:怎樣做離子交換-③實(shí)驗(yàn)篩選填料24離子交換和疏水層析HiTrap
IEX
/
HiTrap
Capto
IEX
select2i0o1n5/7K/i1t325離子交換和疏水層析2015/7/13怎樣做離子交換-④樣品準(zhǔn)備在脫鹽柱上進(jìn)行緩沖液置換用于調(diào)整緩沖液的pH和鹽濃度過(guò)濾和離心來(lái)去除不溶物,防止堵塞層析柱如果緩沖液的pH和鹽濃度調(diào)整好了,大體積的樣品可以直接上樣樣品應(yīng)該溶解到起始緩沖液中,尤其是對(duì)于大體積的樣品更加關(guān)鍵緩沖液的離子濃度應(yīng)該在20-50mMAUvolumepH
valuegradientvolumeAUpH
valuegradient怎樣做離子交換-④樣品準(zhǔn)備怎樣做離子交換-⑤洗脫方式初次試驗(yàn)的標(biāo)準(zhǔn)條件:注意:不同鹽具有不同的洗脫能力Sulphate
(SO4-2)Chloride
(Cl-1)Acetate
(CH3COO-1)150
mM350
mM700
mMStart
buffer
A:Elution
buffer
B:0–50
%
B51–100%
B100-0%
B20-50
mM20-50
mM
+
1
MNaClin
20
col
volin
3–5
col
volin
3–5
col
volseparationwashre-equilibrate27離子交換和疏水層析2015/7/13怎樣做離子交換-⑤洗脫方式Manual
un
7
0_CondManual
un
7
0_pHManual
un
7
0_
act
onsManual
un
7
0_In
ectManual
un
7
0_UV
_280nm
Manual
un
7
0_
ogbook050000050020002500mAU
300020
030
040
050
060
070
080
0mlWas
eM
a
n
u
a
l
u
n
7
0
_
C
o
n
d
M
a
n
u
a
l
u
n
7
0
_
p
H
M
a
n
u
a
l
u
n
7
0
_
F
a
c
t
o
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s
M
an
ua
lun
7
0
_
In
j
e
c
tM
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n
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a
l
u
n
7
0
_
U
_
2
8
0
n
m
M
a
n
u
a
l
u
n
7
0
_
L
o
g
b
o
o
k
50
0
00
0
50
0
2
0
0
0
2
5
0
0
m
A
U
3
0
0
0
24
0
26
0
28
0
34
0
ml
0W
a
s
t
eA
A
2
A3
A
5
W
a
s
t
eA6
A7
A8
A
9
A
0
A
A
2
B
2
B
B
0
B9
B8
B7
B6
W
a
s
t
e
B4
00 20
W
a
s
t
eHiscreen
CaptoDEAE(4.7ml)BufferA:pH8.2
50mM
Tris
0.075MNaClB
uffer
B:A+1MNaCl20min
0~100%BHiscreen
CaptoDEAE(4.7ml)BufferA:pH8.2
50mM
Tris0.075M
NaClB
uffer
B:A+1MNaCl20min
0~50%BManual
un
7
0_pHManual
un
7
0_
act
onsManual
un
7
0_In
ectManual
un
7
0_UV
_280nm
Manual
un
7
0_Cond
Manual
un
7
0_
ogbook05000005002000mAU500600620
mlC2
C3
C4
C6
C7
C8
Waste520
540C9
C
0
C C
2
D
2
D
D
0560
580Was
eHiscreen
CaptoDEAE(4.7ml)BufferA:pH8.2
50mM
Tris0.075M
NaClB
uffer
B:A+1MNaCl20min
0~30%B28離子交換和疏水層析2015/7/13洗脫梯度越長(zhǎng),分辨率越高線性洗脫優(yōu)化后的分步洗脫怎樣做離子交換-⑤洗脫方式選擇29離子交換和疏水層析2015/7/13
分辨率高峰窄、濃度高
峰寬硬件要求低、工藝穩(wěn)定選擇性好需要預(yù)實(shí)驗(yàn)摸索怎樣做離子交換-⑥填料的
和再生?用
1 Msalt去除結(jié)合比較緊的物質(zhì)。然后用5個(gè)柱體積的緩沖液進(jìn)行再平衡每次實(shí)驗(yàn)后都需要再生–
大多數(shù)的離子交換填料可以用
1 M
NaOH以徹底去除雜質(zhì)!–
中性去污劑和酶可以用來(lái)進(jìn)行
雜質(zhì)脂質(zhì)–
30%異丙醇保存–
使用過(guò)的離子交換填料保存在20%乙醇中30離子交換和疏水層析2015/7/13離子交換層析原理如何做離子交換層析離子交換層析的應(yīng)用離子交換填料的選擇總結(jié)內(nèi)容技術(shù)陰離子交換親和層析凝膠過(guò)濾陽(yáng)離子交換備注快速去除蛋白酶常規(guī)親和層析步驟用于DNA
結(jié)合蛋白緩沖液置換最后精細(xì)純化>90%純度Mono
S?
5/50
GLdisrupted
and
clarifiedE.
coli
expressing
TniA17.5
mlSOURCE?
15Q
4.6/100
PEHiTrap?
Heparin
HPHiPrep?
26/10
DesaltingSephadex?
G-25
Fine規(guī)模純化堿性DNA-結(jié)合蛋白32離子交換和疏水層析2015/7/13技術(shù)陰離子交換疏水層析凝膠過(guò)濾陰離子交換備注快速捕獲中度純化緩沖液置換精細(xì)純化>90%純度>60%收率SOURCE?
30
Q
packedin
FineLINE?
70homogenized
E.
coliexpressing
Tyrosinephosphatase
1B
7.6
LQ
Sepharose?
XL
packedin
INdEX?
100/500Phenyl
SepharoseHigh
Performancepacked
in
BPG?
100/500Sephadex?
G-25
Finepacked
in
BPG
200/50033離子交換和疏水層析2015/7/13在中試規(guī)模純化重組蛋白離子交換層析原理如何做離子交換層析離子交換層析的應(yīng)用離子交換填料的選擇總結(jié)內(nèi)容選擇重點(diǎn):合適的基架純度RESOURCE
Q?
1ml15
μm30
μmQ
Sepharose?
FF16
x50
mmSOURCE?
Q
XK16
x
50
mm34
μmQ
Sepharose?
HP16
x
50
mm90
μm反壓Capture
?Intermediate
purificationPolishing10
μm3
μmMono
Q?
5/50
GL?Mini
Q?(4.6x50mm)通量?高Sepharose基架High
Performance
(34um)Fast
Flow
(90
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