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SUMMARYEvolutiontheoryEvolutionisthefundamentalorganizingprincipleofbiologyandthemaintheme.Dawin'stheoryofnaturalselectionisjusttheorybutnotfact,thefactissomethingthathaveevidencetobeproved,wecansaythatorganismsevolvedfrompreviouslylivingformsbecausescientistshavefoundlotsoforganismfossils.注:理論是由一些現(xiàn)象推到而出的,并非有人親眼所見,是看不見摸不著的,由此而稱為理論,而事實(shí)是真實(shí)存在的,或者曾經(jīng)真實(shí)存在并且留下證據(jù)而可以供人考究的現(xiàn)象。我的理解是人們通過對(duì)于一些事實(shí)的總結(jié)和歸納,而得出一些可以解釋這些現(xiàn)象或者事實(shí)的原因性說明,是為理論。事實(shí)是理論的基礎(chǔ),理論是事實(shí)的推論。Thereare4argumentstosupportevolution.Micro-evolution:smallchangesinspecies.(eg.所有的狗都有相同的祖先,也可以歸結(jié)為同類,但是只見也有區(qū)分,哈士奇,牧羊犬,藏獒等等。此外,就算是同樣是哈士奇,也有毛色等一些差異所區(qū)分不同的亞種,這些都是種內(nèi)分化,也是進(jìn)化論的依據(jù)之一。)Macro-evolution:largechangesoverlongperiodoftime.(eg.哺乳動(dòng)物的前肢骨骼形態(tài)差異很大,雖然歸根結(jié)底是同一先祖,但也許是生活習(xí)性或者所處不同環(huán)境而導(dǎo)致的差異擴(kuò)大化,比如說人和海豚的前肢,其實(shí)都有著幾乎相同的骨骼結(jié)構(gòu),只是各種相同的骨骼演化出了不同的形態(tài)。同樣由humerus,ulna,radius,carpals,metacarpals,phalanges等骨構(gòu)成,形態(tài)不同。另外一個(gè)例子就是脊椎動(dòng)物的胚胎開始形成時(shí)其實(shí)非常類似,只是后來慢慢的成長(zhǎng)起來才變得各有不同,這也許也可以作為一個(gè)依據(jù)說明脊椎動(dòng)物是由相同的原始型演變而來的。)imperfections:recordahistoryofpastancestry.(這個(gè)很有意思,拿鯨魚做例子。鯨魚這種海洋生物,其主要活動(dòng)是用前肢劃水,尾部掌握平衡,因此,可以說他的后肢是根本沒有任何用途的,但是有趣的是,鯨魚仍然保留了后肢的骨骼結(jié)構(gòu),雖然已經(jīng)嚴(yán)重退化小到容易被忽略掉,但是這種”不完美”甚至是”累贅”的結(jié)構(gòu)為什么會(huì)出現(xiàn)在鯨魚的身上,科學(xué)界的解釋是鯨魚的祖先其實(shí)是陸生生物,由于某些原因又回到了海洋環(huán)境中生活,而陸生動(dòng)物明顯是需要后肢進(jìn)行行走等活動(dòng)的,于是乎,鯨魚就保留了后肢這種沒有意義的結(jié)構(gòu),稱之為"imperfections"。)Molecularevidence(這個(gè)沒什么意思,就是科學(xué)發(fā)展起來之后,人們研究中發(fā)現(xiàn)的基因相似度問題,基因越類似,很可能親戚關(guān)系就比較近,反之則比較遠(yuǎn)。)Evolutionrepresents:Accumulationofsmallmodificationoverlongtime.說白了就是積少成多,量變引起質(zhì)變(originofearthwas4.5billionyearsago,lifefirstoccurredontheearthwas3.5billionyrsago.)Adaptationsderivedfrompre-existingstructures.chancemutations,butpositivemutationsare'selected'』演化只是一個(gè)選擇的過程,但是不是一個(gè)制造的過程,所以它并不能夠造出新的物種形態(tài),只能選擇那些更容易存活的形態(tài)。就算是基因變異所產(chǎn)生的新形態(tài)也不是演化的結(jié)果,只能給演化提供多一些的素材,這不算是演化新形態(tài)。)Howdoesevolutionadaptspeciestotheirenvironment?Definitionofevolution1)Technicaldefinition:Changeingeneticcompositionofpopulationfromgenerationtogeneration.Darwin'sdefinition:Descentwithmodification.Dawin'stheoryofNaturalselection:Individualsvarygreatlyintheirtraits.Traitsareinheritedfromparentstooffspring.Speciescapableofproducingmoreoffspringthanenvironmentcansupport.Lackoffoodandcompetition,manyoffspringdonotsurvive.(Notincludehuman.)Individualswithinheritedtraitsthatleadtohighersurvival/reproductiontendtoleavemoreoffspring.Unequalabilitytosurvive/reproduceleadstoaccumulationoffavourabletraitsinpopulationovergenerations.NaturalselectiontheorysummaryAprocesswherebyindividualswithcertainheritabletraitssurviveandreproduceathigherratethanothers.(一群里面相比之下總有相對(duì)活的滋潤(rùn)的家族)Overtime,canincreasematchbetweenorganismsandtheirenvironment,whichmeansadaptation.(歲月流逝,活得滋潤(rùn)的家族當(dāng)然會(huì)想方設(shè)法把家族產(chǎn)業(yè)做強(qiáng)做大,活的越來越滋潤(rùn)。)Ifenvironmentchanges,orindividualmovestonewenvironment,naturalselectionmayresultsinadaptationtonewconditions,andgiverisetonewspeciesinprocess.(感覺就好像是一場(chǎng)災(zāi)難把大家的家底全部端了去,所有的人們又要白手起家了,也許又要有另外一個(gè)家族要崛起了)Naturalselectionisnottheprocessthatresultsinchangesingenefrequencies,butistheprocessthatleadstoadaptation.(巧婦難為無米之炊,只有給她的材料多了,才能做出更美味的飯菜)Selectionforphenotypesandgenotypes.(這個(gè)理解有點(diǎn)暈,自然選擇應(yīng)該是選擇那些生存能力更強(qiáng)的品種,而有些基因型是這些個(gè)體比較強(qiáng)悍的根本原因,從而導(dǎo)致了間接的選擇了那些適于生存的基因,進(jìn)而遺傳給后代。我感覺是自然選擇了某種特性,而賦予這種特性的是基因。就好像基因孩子的父母,而自然選擇是來這里挑選繼承人的億萬富翁,父母只能決定孩子的樣貌,而富翁只能從中挑選自己看的最順眼的,并不是說長(zhǎng)的最帥的一定會(huì)被挑中,只有富翁覺得最順眼的才會(huì)成為繼承人,這也是為什么自然選擇并不是選擇最完美的,而是挑選最適應(yīng)的。Twotypesandthreemodesofselection.Twotypes:NaturalselectionandSexualselection.(自然選擇和性選擇,自然選擇一般就是看生存幾率和繁殖幾率,也就是環(huán)境適應(yīng)能力大小。至于性選擇,只說明交配幾率。一般是指女性選擇男性,就好像一般女生都比較喜歡帥哥。所以被女性選中的男性更容易留下后代來繼承自己的基因。)*Sexualselectionhastwotypes:intra-sexualandinter-sexual.(同性選擇和異性選擇,當(dāng)然這個(gè)跟同性戀?zèng)]關(guān)系。同性選擇是指相同性別的物種爭(zhēng)奪交配幾率,不只有男人會(huì)為了女人決斗,在動(dòng)物界也是很常見的。至于異性選擇就看雌性動(dòng)物的喜好了,就好像雄孔雀會(huì)在交配期去雌孔雀那里展示自己漂亮的羽毛,雌孔雀就會(huì)挑選自己認(rèn)為最炫的進(jìn)行交配,跟選美差不多。)Threemodes:Stabilisingselection,DirectionalselectionandDisruptiveselection.(平衡模式,也就是選擇趨近于品均值也就是中間的類型。方向選擇就是選擇一個(gè)極端,好比說長(zhǎng)頸鹿就是脖子越長(zhǎng)的越容易存活,長(zhǎng)就是這個(gè)directiono兩端選擇比較耐人尋味,是選擇兩種極端,就是說除了大眾化的人家都選,有一種魚類就是這樣,同一地方生存的雄性的魚分為兩種不同形態(tài),一種體積很大,另一只體積很小,而這樣兩極分化的原因是因?yàn)轶w型大的魚在為雌性決斗的時(shí)候更容易勝出而取得交配權(quán),不過由于這種魚類是體外受精,也就是說雌性魚把卵排出體外,然后雄性再在有卵的范圍內(nèi)排出精子。至于那種體型小的魚,是由于小魚靈活,容易隱藏并且在被大魚發(fā)現(xiàn)之前把精子排放到有卵的范圍內(nèi),所以才被幸運(yùn)的選擇了出來,那些大眾化的魚就不走運(yùn)了,打吧又打不過大魚,藏吧又比小魚大容易被大魚發(fā)現(xiàn),所以只能杯具了可憐的魚們)*Sexualselectiondonotincreasesurvivalratebutincreasematingopportunity.Theoriginofspeciesa)Biologicalspeciesconcept(BSC):Commongenepool,(potentially)interbreed,producefertileoffspring,anddon't(normally)matewithotherspeciesinwild.Groupofdistinctorganismscapableofinterbreedingbutreproductivelyisolatedfromotherspecies.(eg.驢和馬鼻騾子,由于染色體不能配對(duì)所以不能生育)Phylogeneticspeciesconcept(PSC):Smallestgroupofindividualsthatshareacommonancestor,hencehaveauniquegenetichistory.(notonlysimilarinmorphology,butalsosimilaringenes.)"Crypticspecies"meansmorphologicallysimilarbutgeneticallydistinct.(長(zhǎng)得像但是基因不同)b)Interbreedingprevent1)Pre-zygoticisolatingmechanism:Mechanical(eg.anatomyofgenitalorgansPrimatepenises)2)Post-zygoticisolatingmechanism:Ensuresreproductivefailure.(hybridnon-viability:Prohibitnormalembryonicdevelopment.Orhybridsterility:hybridsgeneticallyincompatible胚胎無法正常發(fā)育或者中間雜交品種基因不調(diào)和。)*雜交的困難:Habitatisolation(不同種群生存地區(qū)不同)^Temporalisolation(交配期不同)tBehavioralisolation(不同物種的雌雄生物不能相互吸引而產(chǎn)生交配活動(dòng))鼻mating鼻Mechanicalisolation(生殖器官形態(tài)不匹配而無法正常交配)tGameticisolation(精子和卵子不能相互識(shí)別而無法受精)tFertilizationtReducedhybridviability(雜合受精卵無法發(fā)育成胚胎或者無法達(dá)到性成熟階段)tReducedhybridfertility(長(zhǎng)大的混血種無法產(chǎn)生功能性成熟配子)tHybridbreakdown(混血種的后代有交配問題無法正常延續(xù)).c)NewspeciesariseAllopatricspeciationandSympatricspeciation(由于生長(zhǎng)地區(qū)不同而分化和在沒有地區(qū)障礙間隔的相同區(qū)域分化。至于如何區(qū)分,則要看是有有地形上的障礙阻擋兩個(gè)種群的基因交流,如果沒有障礙可以進(jìn)行基因交流則是Sympatric分化,反之則是Allopatric分化)Mostlarge-scalechangesaremodifiedversionsofolderstructures.Genesthatcontroldevelopmentplaymajorrole:rateofdevelopment(改變的速度),timingofdevelopment(改變的時(shí)期,比如I胚胎期還是變態(tài)期等)andsatialpatternofdevelopment(改變的部位).Allometricgrowth:Differencesinrelativegrowthratesofbodyparts.Homeosis(同源轉(zhuǎn)化):Alterationinspatialarrangementofbodyparts.*變化無處不在,相同的基因也可能演化出不同形態(tài),可以理解為內(nèi)外兼修,內(nèi)在的基因影響和外界環(huán)境影響共同鑄造了不同生物的基因型和表現(xiàn)型。Phylogeneticsandsystematicsa)definitionofphylogenyandsystematicsPhylogeny:Evolutionaryhistoryofaspeciesorgroupofspecies(發(fā)展史).Basedoncommonancestryinferredfromfossils,morphologyandMolecular/DNAevidence.Systematics:Analyticalapproachtounderstandingthediversityandrelationshipoforganisms.(分類學(xué),包括現(xiàn)存的和已經(jīng)滅絕的)b)PhylogeniesarebasedoncommonancestryiferredfromFossils,MorphologyandMoleculer/DNAevidence.Butsimilarmorphologycan'tindicatesharedancestry.ConvergentorDivergentevolutionoccurallovertheworld.Analogoustraits:Morphologysimilarbutnotcommonancestor.Homologoustraits:sharecommonancestor.(similarordifferentstructures.)Ahomologoustraitmaybehomoplasious-thatis,ithasevolvedindependently,butfromthesameancestralstructure-plesiomorphic-thatis,presentinacommonancestorbutsecondarilylostinsomeofitsdescendants-or(syn)apomorphic-presentinanancestorandallofitsdescendants.c)Phylogeneticsystematics:connectsclassificationswithevolutionaryhistoryinHierarchialclassification.Domain(域)^Archaea(古菌),Bacteria(細(xì)菌)andEukarya(真核生物)Kindom(界)^Animalia(動(dòng)物界),Plantae(植物界),Fungi(真菌界),Protista(原生生物界)andProkaryota(原核生物界).Phylum(門)teg.Chordata(脊索動(dòng)物門).注:動(dòng)物界一共有36門【不包括亞門】。植物界有11門,真菌界有6門Class綱)teg.Mammalia(哺乳綱)Order(目)teg.Carnivora(肉食目)Family(科)teg.Felidea(貓科)Genus(屬)teg.Panthera(豹屬)Species種)teg.Panterapardus(美洲豹*【非學(xué)名】)Cladistics(遺傳分類學(xué)):sharedprimitiveandsharedderivedcharacters.Sharedprimitive:can'tdivideitoutbutthefundamentalcharacters.Sharedderived:informativeindistiguishingwithothers.Bothofthetwoarehomologous.Monophyletic:differentgroupssharethecommonancestorimmediate.Paraphyletic:onegrouponlyshareanancestorwithothergourps.Phlyphyletic:donotsharetheimediateancestor.Outgroupspeciesarelessrelatedtotheingroupspecies,sharedprimitivebutnotderivedcharacters,whereingroupspeciesarethegroupweintendtostudy.Fromoriginsoflifetospeciesextinction.a)Firstformsoflifewereprokaryotes(3.8BYA,Cyanobacteria).Eukaryotesaroseviaserialendosymbiosis(內(nèi)共生理論).注:最原始的原核細(xì)胞為光和細(xì)菌,出現(xiàn)在38億年前,這種光和細(xì)菌為地球的生命體造就了有氧的環(huán)境基礎(chǔ),再后來一些細(xì)胞通過包裹光和細(xì)菌和一些其他的呼吸作用的細(xì)菌進(jìn)而產(chǎn)生了真核細(xì)胞,而在這些真核細(xì)胞中,光合細(xì)菌演變成了進(jìn)行光合作用的細(xì)胞器,也就是我們熟悉的葉綠體,而那些有呼吸作用的細(xì)菌則演化成了線粒體,這也是為什么這兩種細(xì)胞器是雙膜結(jié)構(gòu)。b)Archaean(太古:大約4
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