項目名稱小菜蛾基因組的研究

項目名：菜蛾基因組的研究提名推獎種：建省自然科學(xué)獎提名推單位：家提名項目簡：小菜蛾是為害十字花科蔬菜的一種重要的世界性害蟲，由于其分布范圍廣、繁殖速度快、抗性水平高，已經(jīng)成為最難防治的害蟲之一世界每年因小菜蛾造成的損失和防治費用達億美在我國高達億美元由于缺乏基因組信息，制約了小菜蛾猖獗危害和災(zāi)變過程分子遺傳機理的系統(tǒng)研究項目組克服了小菜蛾基因組高度雜合的特點成功破譯小菜蛾基因組示了其廣泛適應(yīng)性的遺傳學(xué)基礎(chǔ)以及解毒寄主植物化學(xué)防御物質(zhì)和化學(xué)農(nóng)藥的分子機理，為小菜蛾的有效防治和可持續(xù)控制奠定了重要理論基礎(chǔ)。（）自主研發(fā)拼接件Rabbit率先破小菜蛾基因，為研復(fù)雜基因組提供范例針對小菜蛾基因組高度雜合的特點采用結(jié)WGS的測序和組裝技術(shù)，自主研發(fā)配套的基因組組裝軟件Rabbit，解決了大片段重疊序列組裝和雜合區(qū)域排除的技術(shù)難題成功破譯小菜蛾基因343Mb；N50=737kb面臨國際上多個單位幾乎同時啟動小菜蛾基因組研究項目的激烈競爭中率先完成并在Nature發(fā)表了小菜蛾基因組的研究成果在國際上得到廣泛的應(yīng)用。（）發(fā)現(xiàn)并解析基組的結(jié)變異，闡明小菜蛾適應(yīng)性并成一種世界性害的遺傳學(xué)基。在轉(zhuǎn)錄組測序和表達譜分析的基礎(chǔ)上項目組開展了小菜蛾基因組的注釋和比較基因組的研究，鑒定了個蛋白質(zhì)編碼基因，新增小菜蛾基因16,619（92%建了小菜蛾基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫，奠定了我國在小菜蛾基因組研究領(lǐng)域的國際領(lǐng)先地位用已有的基因組信息構(gòu)建了昆蟲系統(tǒng)發(fā)育進化樹發(fā)現(xiàn)小菜蛾是鱗翅目昆蟲中一個基礎(chǔ)物種通過個體間基因組的比較研究發(fā)現(xiàn)小菜蛾種群內(nèi)部存在著大量的基因組變異闡明了小菜蛾廣適應(yīng)性并成為一種世界性害蟲的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。（）挖掘小菜蛾基組中與毒相關(guān)的基，揭示小菜蛾與寄植物協(xié)同進化抗藥性的分機理篩選和解析了小菜蛾幼蟲階段偏好表達的基因發(fā)

現(xiàn)硫代葡萄糖苷硫酸酯酶基因（）與硫酸酯酶修飾因子1（在幼蟲期的協(xié)同表達對小菜蛾取食十字花科蔬菜起了決定性的關(guān)鍵作用定并研究了細胞色素谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶、羧酸酯酶A轉(zhuǎn)運蛋白4基因家族，發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)運蛋白家族的顯著擴張，多數(shù)成員在抗性品系中上調(diào)表達，揭示了小菜蛾抗藥性快速發(fā)展和適應(yīng)進化的分子機理。該項目的系列成果受到國內(nèi)外同行和媒體的高度關(guān)注產(chǎn)生較好的影響成果涉及的18研究論文累計他引次中小菜蛾基因組論文年發(fā)表至今他引190括NatureBiotechnologyNatureCommunicationsAnnualReviewofEntomology和AnnualEvolutionandSystematics等有重要影響力的學(xué)術(shù)期刊。項目組舉辦昆蟲基因組國際學(xué)術(shù)會議1，3次受邀國際學(xué)術(shù)會議報告。主要完單位：1.福建農(nóng)林大學(xué)2.深圳華大基因科技服務(wù)有限公司主要完人及其貢獻1.尤民生（福建農(nóng)林大學(xué)作為項目主持人，負責項目的規(guī)劃、實施和總結(jié)；在小菜蛾基因組解析、食性和抗藥性的功能基因組研究等方面做出貢獻。2.楊福建農(nóng)林大學(xué)項目的規(guī)劃施和總結(jié)小菜蛾基因組解析、食性和抗藥性的功能基因組研究等方面做出貢獻。3.何瑋（福建農(nóng)林大學(xué)責項目的實施和總結(jié)在小菜蛾基因組解析和食性的功能基因組研究等方面做出貢獻。4.謝（福建農(nóng)林大學(xué)責項目的實施和總結(jié)在小菜蛾基因組解析和抗藥性的功能基因組研究等方面做出貢獻。5.岳（深圳華大基因科技服務(wù)有限公司責項目的實施在小菜蛾基因組測序、組裝和注釋等方面做出貢獻。代表性文目錄：1.MinshengYue,WeiyiHe,XinhuaGuangYang,Xie,

Zhan,W.Baxter,Vasseur,GeoffGurr,CarlJ.JianlinBai,PingKaiShiguoLi,QingZhangyanWu,QilinChunhuiLiu,BoWang,Li,XiufengXu,ChangxinLu,MinJohnDavey,M.MingshunChen,XiaofengWeiqiTang,Zheng,YulanHu,FengqinYanchunMa,LuYunkaiYongLiang,YaqiongYu,Zhang,YuanyuanGuoqingLi,LinLi,Xinzhou,YadanLuo,Wang,JianJunWang.AheterozygousmothgenomeprovidesintoGenetics220-225.2.He,Min-ShengYou,LietteGuangXie,KaiChun-HuiLi,Xiu-FengXu,Shi-GuoDevelopmentalfromthedenovoassembledtranscriptomeofdiamondbackmoth,PlutellaGenomics2012,99(3):3.WeiqiYu,WeiyiYang,FushiW.Baxter,ShijunYou,CarlJ.MinshengDBM-DB:thediamondbackdatabase.,2014,4.YanchunYou,NanaRen,Li,Ma,MinmingZou,MGurr,expressionprofilingofindiamondbackxylostella(L.).Genomics152.5.Yu,WeiqiWeiyiHe,Ma,Liette