
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
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DNA是生物遺傳的主要物質(zhì)基礎(chǔ),生物機(jī)體的遺傳信息以密碼的形式編碼在DNA分子上,表現(xiàn)為特定的核苷酸排列順序,并通過(guò)DNA的復(fù)制由親代傳遞給子代。在后代的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中,遺傳信息自DNA轉(zhuǎn)錄給RNA,然后翻譯成特異的蛋白質(zhì),以執(zhí)行各種生命功能,使后代表現(xiàn)出與親代相似的遺傳性狀。中心法則1964-1970勞氏肉瘤病毒的遺傳方式致癌RNA病毒病毒(復(fù)制)復(fù)制轉(zhuǎn)錄DNARNA蛋白質(zhì)翻譯逆轉(zhuǎn)錄1958年,遺傳信息的單向二、DNA的合成(一)依賴于DNA的DNA合成(DNA的復(fù)制)1、DNA的半保留復(fù)制:在1953年,Watson和Crick在建立雙螺旋DNA結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上就提出了DNA復(fù)制的半保留復(fù)制假說(shuō)。他們推測(cè)DNA復(fù)制時(shí),兩鏈先分開(kāi),然后用堿基配對(duì)的方式,按照單鏈DNA的核苷酸順序合成新鏈,以組成新DNA分子。這樣形成的兩個(gè)DNA分子與原來(lái)的DNA分子的堿基順序完全一樣,每個(gè)子代分子的一條鏈來(lái)自親代DNA、另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻?,這種方式稱為半保留復(fù)制(如右圖)。
DNA的半保留復(fù)制定義:由親代DNA生成子代DNA時(shí),每個(gè)新形成的子代DNA中,一條鏈來(lái)自親代DNA,而另一條鏈則是新合成的,這種復(fù)制方式叫半保留復(fù)制半保留復(fù)制的實(shí)驗(yàn)證據(jù):1958年Meselson和Stahl用同位素15N標(biāo)記大腸桿菌DNA,首先證明了DNA的半保留復(fù)制。15N-DNA的密度大于14N-DNA的密度DNA的半保留復(fù)制的生物學(xué)意義:DNA的半保留復(fù)制表明DNA在代謝上的穩(wěn)定性,保證親代的遺傳信息穩(wěn)定地傳遞給后代。
DNA在代謝上的穩(wěn)定性并非指DNA是一種惰性物質(zhì)。2、DNA復(fù)制的起始點(diǎn)和方向:DNA復(fù)制開(kāi)始于染色體上固定的起始點(diǎn)。起始點(diǎn)是含有100-200個(gè)堿基對(duì)的一段DNA。DNA的兩條鏈在起始點(diǎn)分開(kāi)形成叉子樣的“復(fù)制叉”,隨著復(fù)制叉的移動(dòng)完成DNA的復(fù)制過(guò)程。細(xì)胞內(nèi)存在能識(shí)別起始點(diǎn)的特種蛋白質(zhì)。
DNA復(fù)制可以朝一個(gè)方向進(jìn)行,也可以朝兩個(gè)相反的方向進(jìn)行(如有圖)。其證據(jù)來(lái)自放射自顯影實(shí)驗(yàn)或電子顯微鏡觀察。大多數(shù)生物染色體DNA的復(fù)制是雙向進(jìn)行的。大腸桿菌染色體DNA的復(fù)制經(jīng)證明是雙向進(jìn)行的(如右圖)。在迅速生長(zhǎng)的原核生物中,第一個(gè)染色體DNA復(fù)制尚未完成,第二個(gè)DNA分子就在同一個(gè)起始點(diǎn)上開(kāi)始復(fù)制,其復(fù)制叉移動(dòng)的速度約為105堿基對(duì)/分。真核生物染色體的不同位置上有多個(gè)起試點(diǎn),如在30000個(gè)堿基對(duì)長(zhǎng)的果蠅染色體DNA上有2000-3000個(gè)起試點(diǎn),如下圖:真核生物的復(fù)制叉移動(dòng)較慢(5x102-5x103堿基對(duì)/分。但由于同時(shí)起作用的復(fù)制叉數(shù)目很大,所以復(fù)制的總速度比原核生物要快。3.與與DNA復(fù)制有有關(guān)的的酶和和蛋白白質(zhì)原料:四種脫脫氧核核苷三三磷酸酸(dATP、、dGTP、dCTP、、dTTP)模板:以DNA的兩條條鏈為為模板板鏈,,合成成子代代DNA。引物:一小小段RNA(或DNA)為引物物,在在大腸腸桿菌菌中,DNA的合成成需要要一段段RNA鏈作為為引物。。(1)DNA聚合酶酶:DNA復(fù)制過(guò)過(guò)程中中最基基本的的酶促促反應(yīng)應(yīng)始四四種脫脫氧核核苷酸酸的聚聚合反反應(yīng)。。1956年Kornberg等首先先從大大腸桿桿菌中中分離離出催催化此此反應(yīng)應(yīng)的DNA聚合酶酶。在在大腸腸桿菌菌中現(xiàn)現(xiàn)已發(fā)發(fā)現(xiàn)三三種DNA聚合酶酶,分分別稱稱為聚聚合酶酶Ⅰ、聚合合酶Ⅱ和聚合合酶Ⅲ。三種種酶的的作用用和活活力大大小見(jiàn)見(jiàn)下表表。聚合酶Ⅰ聚合酶Ⅱ聚合酶Ⅲ功能5‘→3’的聚合酶作用5‘→3’的外切酶作用3‘→5’的外切酶作用相對(duì)分子量每個(gè)細(xì)胞的分子數(shù)活性(37℃時(shí)每個(gè)酶分子酶分鐘聚合的核苷酸數(shù)主要作用
+++109000400600主要對(duì)DNA損傷修復(fù),切除引物
+-+12000030紫外線損傷的修復(fù)
+++14000010-209000DNA復(fù)制的主要聚合酶表1.大腸桿桿菌DNA聚合酶酶在大腸腸桿菌菌中發(fā)發(fā)現(xiàn)有有三種種DNA聚合酶酶(用突變變株研研究其其功能能):⑴DNA聚合酶酶Ⅰ:單體酶酶,多多肽鏈鏈內(nèi)含含一個(gè)個(gè)鋅原原子((其鰲鰲合劑劑是O-二氮氮雜雜菲菲)),,多多功功能能酶酶。。它具具有有53聚合合酶酶功功能能(對(duì)對(duì)脫脫氧氧核核苷苷酸酸的的選選擇擇));;3’’5’’外外切切酶酶活活性性(對(duì)對(duì)雙雙鏈鏈無(wú)無(wú)作作用用,,校對(duì)對(duì)功功能能。。但在在正正常常聚聚合合條條件件下下,,此此活活性性不不能能作作用用于于生生長(zhǎng)長(zhǎng)鏈鏈))及及5’’3’’外外切切酶酶活活性性(雙雙鏈鏈有有效效,,主主要要是是對(duì)對(duì)DNA損傷傷的的修修復(fù)復(fù),,以以及及在在DNA復(fù)制制時(shí)時(shí)RNA引物物切切除除及及其其空空隙隙的的填填補(bǔ)補(bǔ)));;在在DNA鏈的的3形成成焦焦磷磷酸酸解解((生生理理意意義義不不大大));;無(wú)無(wú)機(jī)機(jī)焦焦磷磷酸酸鹽鹽與與dNTP之間間的的焦焦磷磷酸酸基基交交換換。。⑵DNA聚合合酶酶ⅡⅡ::多亞亞基基酶酶,,聚合合作作用用,,但但聚聚合合活活力力很很低低;;具具有有3’’5’’外外切切酶酶活活性性。。其其它它生生理理功功能能尚尚不不清清楚楚,,可可能能在在修修復(fù)復(fù)紫紫外外光光引引起起的的DNA損傷傷中中起起作作用用。。⑶DNA聚合合酶酶ⅢⅢ::是原原核核生生物物DNA復(fù)制制的的主主要要聚聚合合酶酶,該該酶酶由由10種亞亞基基組組成成,,其其中中、、、、形形成成全全酶酶的的核核心心酶酶。具具有有5’’3’’DNA聚合合酶酶活活性性((亞亞基基,,速率率高高));;具具有有3’’5’外外切酶酶(亞基基)的校對(duì)對(duì)功能能,提提高DNA復(fù)制的的保真真性;;還具具有5’3’外外切酶酶活性性(單單鏈有有效,,其意意義未未知))。另外:(4))DNA聚合酶酶IV和V:1999年發(fā)現(xiàn)現(xiàn),當(dāng)當(dāng)DNA嚴(yán)重?fù)p損傷時(shí)時(shí),誘誘導(dǎo)產(chǎn)產(chǎn)生。。許多研研究證證明::DNA聚合酶酶Ⅲ是完整整大腸腸桿菌菌細(xì)胞胞中主主要負(fù)負(fù)責(zé)DNA鏈延長(zhǎng)長(zhǎng)的酶酶。它它以一一個(gè)相相對(duì)分分子量量約為為450000,稱為為“DNA聚合酶酶Ⅲ全酶””的大大復(fù)合合物的的形式式起作作用,,全酶酶有好好幾個(gè)個(gè)亞基基(如如下左左圖))。用用聚丙丙烯酰酰胺凝凝膠電電泳分分離純純化一一萬(wàn)倍倍的DNA聚合酶酶Ⅲ,得到到的主主要成成分為為相對(duì)對(duì)分子子量140000的多肽肽(α亞基))。在在復(fù)合合物中中的β亞基((也稱稱為DNA聚合酶酶Ⅲ輔酶))的功功能是是識(shí)別別引物物并使使DNA母鏈與與引物物鏈結(jié)結(jié)合。。一旦旦全酶酶結(jié)合合在正正確的的起始始位置置上,,DNA聚合酶酶Ⅲ輔酶就就以游游離的的形式式釋放放,隨隨后DNA聚合酶酶Ⅲ復(fù)合物物催化化子代代DNA鏈的延延長(zhǎng)((右圖圖)。。DNA聚合酶酶催化化的反反應(yīng)可可以利利用雙雙鏈作作為模模板和和引物物,也也可以以利用用單鏈鏈作為為模板板和引引物。。如下下圖中中,A為單鏈鏈自身身回折折作為為模板板,形形成發(fā)發(fā)夾環(huán)環(huán)結(jié)構(gòu)構(gòu)。B、C為雙鏈鏈作為為模板板,其其中C是由于于酶離離開(kāi)原原先的的模板板,開(kāi)開(kāi)始復(fù)復(fù)制互互補(bǔ)鏈鏈而形形成分分枝結(jié)結(jié)構(gòu)。。D為環(huán)狀狀DNA進(jìn)行的的反應(yīng)應(yīng)。A、C只存在在于體體外酶酶促合合成的的DNA分子中中,它它使DNA的變性性行為為異常常,并并且失失去遺遺傳活活性。。DNA聚合酶酶具有有”校校對(duì)““作用用:DNA聚合酶酶的3‘→→5’’的外切切酶活活力是是校對(duì)對(duì)新生生DNA鏈和改改正聚聚合酶酶活性性所造造成””錯(cuò)配配“的的一種種手段段。當(dāng)當(dāng)因聚聚合酶酶活性性的作作用插插入一一個(gè)錯(cuò)錯(cuò)配的的核苷苷酸時(shí)時(shí),酶酶能識(shí)識(shí)別這這種””失誤誤“并并立即即從新新DNA鏈的3’端除掉掉所錯(cuò)錯(cuò)配的的核苷苷酸。。所以以當(dāng)復(fù)復(fù)制叉叉沿模模板鏈鏈移動(dòng)動(dòng)時(shí),,所加加入的的每個(gè)個(gè)脫氧氧核苷苷酸單單位都都將受受到檢檢查((如右右圖))。DNA聚合酶酶的校校正功功能十十分有有效,,其準(zhǔn)準(zhǔn)確率率達(dá)到到每聚聚合104個(gè)核苷苷酸單單位至至多出出現(xiàn)一一個(gè)錯(cuò)錯(cuò)配的的核苷苷酸。。復(fù)制的的準(zhǔn)確確性高高于轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)錄和和轉(zhuǎn)譯譯過(guò)程程。這這點(diǎn)非非常重重要,,因?yàn)闉閺?fù)制制的錯(cuò)錯(cuò)誤可可引起起突變變或致致死。。由上可可以歸歸納出出DNA聚合酶酶的反反應(yīng)特特點(diǎn)::①以四種種脫氧氧核糖糖核苷苷三磷磷酸作作為底底物;;②反應(yīng)需需要接接受模模板的的指導(dǎo)導(dǎo);③反應(yīng)需要要引物3’-羥基存存在;④DNA鏈的延長(zhǎng)長(zhǎng)方向?yàn)闉?‘→3’;⑤產(chǎn)物DNA的性質(zhì)于于模板相相同;⑥合成過(guò)程程種有校校正作用用。這就表明明了DNA聚合酶合合成的產(chǎn)產(chǎn)物是模模板的復(fù)復(fù)制物。。真核生物物DNA聚合酶::主要作作用類似似于大腸腸桿菌聚聚合酶,,但有不不同?,F(xiàn)現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)現(xiàn)四種,,分別以以α、β、γ、δ來(lái)命名((有資料料介紹有有5種,即多多一種ε,它在結(jié)結(jié)構(gòu)和性性質(zhì)上類類似于δ,其主要要功能時(shí)時(shí)參與DNA的修復(fù))),其各各種酶的的特性歸歸納為下下表:表2.真核生物物DNA聚合酶聚合酶α聚合酶β聚合酶γ聚合酶δ分子量亞基數(shù)細(xì)胞內(nèi)分布酶活力占總量的百分比核酸外切酶活力5‘→3’聚合作用110-220000
多個(gè)細(xì)胞核
-80%
無(wú)有
450001個(gè)細(xì)胞核
10-15%
無(wú)有600001個(gè)線粒體
2-15%
無(wú)有1220001個(gè)細(xì)胞核
10-25%3‘→5’外切酶活力有在真核細(xì)細(xì)胞內(nèi)有有五種DNA聚合酶(與細(xì)菌菌DNA聚合酶的的性質(zhì)基基本相同同:底物物、模板板、引物物、方向向)αβγδε定位細(xì)細(xì)胞核細(xì)細(xì)胞胞核線線粒粒體細(xì)細(xì)胞核細(xì)細(xì)胞核3‘-5’外切--+++酶活性功能引物合成修復(fù)作用線粒體DNA的復(fù)制核DNA的復(fù)制修復(fù)作用在復(fù)制過(guò)過(guò)程中,,真核細(xì)細(xì)胞有兩兩個(gè)相互互協(xié)作的的酶,即即α負(fù)責(zé)后隨隨鏈,δ負(fù)責(zé)前導(dǎo)導(dǎo)鏈的合合成,如如下圖::3.DNA連接酶((1967年發(fā)發(fā)現(xiàn))::若雙鏈DNA中一條鏈鏈有切口口,一端端是3’’-OH,另一端是是5‘-磷酸基基,連接接酶可催催化這兩兩端形成成磷酸二二酯鍵,,而使切切口連接接。但是它不不能將兩兩條游離離的DNA單鏈連接接起來(lái)。。大腸桿菌菌和其它它細(xì)菌的的DNA連接酶要要求NAD+提供能量量,在高高等生物物和噬菌菌體中,,則要求求ATP提供能量量。T4噬菌體的的DNA連接酶不僅能在在模板鏈鏈上連接接DNA和DNA鏈之間的的切口,,而且能能連接無(wú)無(wú)單鏈粘粘性末端端的平頭頭雙鏈DNA。。3‘5‘3‘5‘OHP連接酶的的反應(yīng)機(jī)機(jī)制:酶+NAD+(ATP)酶-AMP+煙酰胺單單核苷酸酸(PPi))酶-AMP+P-5‘‘-DNA酶+AMP-P-5’-DNADNA-3’-OH+AMP-P-5’-DNADNA-3’-O-P-5’’-DNA+AMPDNA連接酶在DNA復(fù)制、損損傷修復(fù)復(fù)、重組組等過(guò)程程中起重重要作用用作用4.拓?fù)洚悩?gòu)構(gòu)酶:催化DNA的拓?fù)溥B連環(huán)數(shù)發(fā)發(fā)生變化化的酶,,在DNA重組修復(fù)復(fù)和其他他轉(zhuǎn)變方方面起重重要作用用。5、解螺螺旋酶((解鏈鏈酶):通過(guò)水水解ATP將DNA兩條鏈打打開(kāi)。E.coli中的rep蛋白就是是解螺旋旋酶,還還有解螺螺旋酶I、II、III。每解開(kāi)一一對(duì)堿基基需要水水解2個(gè)個(gè)ATP分子。這類酶能能通過(guò)水水解ATP獲得能量量來(lái)解開(kāi)開(kāi)雙鏈,,每解開(kāi)開(kāi)一對(duì)堿堿基,需需要水解解2分子ATP成ADP和磷酸鹽鹽。分解解ATP的活力要要有單鏈鏈DNA的存在在。如如雙鏈鏈DNA中有
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