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關(guān)于人類基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄和調(diào)控1第一頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日2人類基因表達(dá)調(diào)控發(fā)生在:(1)轉(zhuǎn)錄水平(2)轉(zhuǎn)錄后水平(3)翻譯水平(4)epigenetic機(jī)制
第二頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日3一、基因調(diào)控序列----
順式作用元件
人類基因具有一套復(fù)雜順式作用轉(zhuǎn)錄控制DNA或RNA序列,并與特異蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)錄因子——反式作用元件識(shí)別和特異地結(jié)合。
順式作用元件:是指與靶基因處在同一條染色體(DNA)上,起調(diào)控作用的DNA序列。通常不編碼蛋白質(zhì),位于基因的旁側(cè)或內(nèi)含子中。
人類基因有三類以上的cis作用調(diào)節(jié)元件,由幾百bp的短序列元件構(gòu)成,包括啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、反應(yīng)元件和沉默子。第三頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日4Cis作用元件(1)啟動(dòng)子(promoter)通常位于基因上游區(qū),轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的200bp內(nèi),具有啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄作用。組成:CAATbox、TATAbox、GCbox等第四頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日5Cis作用元件
(2)反應(yīng)元件(responseelement,RE)
位于啟動(dòng)子上游短距離只見于選擇性基因(受內(nèi)外因子控制,使有關(guān)基因高水平表達(dá))第五頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日6Cis作用元件(3)增強(qiáng)子(enhancer)
正調(diào)節(jié)元件,位于轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)上游或下游一定范圍起作用??杀蝗我廪D(zhuǎn)錄因子和組織特異轉(zhuǎn)錄因子所識(shí)別,提高轉(zhuǎn)錄水平。(4)沉默子(silencer)
負(fù)調(diào)節(jié)元件在基因中緊靠啟動(dòng)子,在內(nèi)含子上游或其內(nèi)。第六頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日7
二、基因調(diào)控序列------
反式作用元件/因子一個(gè)基因編碼的產(chǎn)物----蛋白質(zhì)或RNA(tRNA、rRNA等)調(diào)控另一個(gè)基因表達(dá),稱為反式作用。這些轉(zhuǎn)錄因子為反式作用元件,能特異地結(jié)合靶基因的順式調(diào)控元件,如啟動(dòng)子等。編碼反式作用因子的基因與受調(diào)控的基因多半不在同一條染色體上,轉(zhuǎn)錄因子含有與DNA結(jié)合的保守結(jié)構(gòu)基序。轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別并結(jié)合于蛋白質(zhì)表面和雙螺旋表面結(jié)合區(qū)之間,用-螺旋(偶有-片層)結(jié)合到DNA的大溝。第七頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日8RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ是轉(zhuǎn)錄需要的通常轉(zhuǎn)錄因子。RNA聚合酶Ⅰ:編碼18S、5.8S和28SrRNA基因RNA聚合酶Ⅱ:編碼小RNA如5SrRNA。RNA聚合酶Ⅲ:編碼tRNA、snRNA的看家基因轉(zhuǎn)錄因子第八頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日9順式和反式作用元件第九頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日10第十頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日11(1)亮氨酸拉鏈基序(Leucinezipper)
為一富含亮氨酸的氨基酸拉鏈。典型的為每七個(gè)氨基酸組成一個(gè)單體,兩個(gè)單體形成雙聚體呈Y形結(jié)構(gòu)。轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別并結(jié)合順式作用元件第十一頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日12(2)螺旋-環(huán)-螺旋基序(Helix-Loop-Helix,HLH)
HLH:兩個(gè)-Helix(一長(zhǎng)一短)由可塑性的環(huán)結(jié)合,環(huán)可使兩個(gè)螺旋折疊而相反結(jié)合,亦可形成異源的二聚體。這一結(jié)構(gòu)可與特異基因調(diào)節(jié)蛋白相互作用。第十二頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日13(3)螺旋-轉(zhuǎn)-螺旋(Helix-Turn-Helix,HTH)基序HTH基序見于同源盒和另外一些轉(zhuǎn)錄因子的共同基序。由一短氨基酸分開的兩個(gè)-Helix組成。兩個(gè)-Helix朝不同方向轉(zhuǎn),故與HLH不同,在不同平面,主要由其C-末端helix特異識(shí)別并結(jié)合于DNA大溝,控制所識(shí)別的DNA序列。第十三頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日14(4)鋅指(ZincFinger)基序
由四個(gè)保守的氨基酸結(jié)合一個(gè)鋅離子形成一個(gè)環(huán),通常是串聯(lián)重復(fù)。一般由2個(gè)絲氨酸和2個(gè)組氨酸或4個(gè)絲氨酸結(jié)合一個(gè)Zn2+。組成一-Helix和一-片層或2個(gè)螺旋,由Zn2+協(xié)調(diào),結(jié)合于DNA大溝。第十四頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日15第十五頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日16三、外界刺激與基因表達(dá)的調(diào)控(1)配體可誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄因子
類固醇激素、甲狀腺素和視黃酸等受體的反應(yīng)元件,均含有六核苷酸——AGNNCA(NN:GT、AA或AC)(2)由信號(hào)傳導(dǎo)激活轉(zhuǎn)錄因子
信號(hào)由細(xì)胞表面受體傳遞到細(xì)胞核,蛋白質(zhì)磷酸化(3)通過cAMP途徑的信號(hào)激活:G蛋白(4)由蛋白激酶C信號(hào)激活NF-B(轉(zhuǎn)錄因子)第十六頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日17糖皮質(zhì)激素介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控第十七頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日18通過cAMP途徑的激素信號(hào)CREB(cAMPresponseelementbinding)CREB:cAMPresponseelementbinding第十八頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日19由蛋白激酶C信號(hào)激活NF-B磷脂酰肌醇4,5二磷酸
三磷酸肌醇
甘油二酯鈣離子釋放第十九頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日20四、轉(zhuǎn)錄與選擇加工單個(gè)基因或轉(zhuǎn)錄單位,在轉(zhuǎn)錄中特異活動(dòng)將產(chǎn)生不同的基因產(chǎn)物。一般認(rèn)為一個(gè)基因編碼單一RNA或單一多肽,人類基因組中大的基因是單個(gè)被轉(zhuǎn)錄。此外,在轉(zhuǎn)錄中有各種選擇加工事件,產(chǎn)生不同的基因產(chǎn)物第二十頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日21選擇啟動(dòng)子人的某些基因含2個(gè)或更多的選擇啟動(dòng)子,具有細(xì)胞的特異表達(dá)模式。如人的抗肌營(yíng)養(yǎng)不良蛋白基因有不同的基因產(chǎn)物,就是不同的選擇啟動(dòng)子的作用結(jié)果。第二十一頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日22五、后轉(zhuǎn)錄加工形式(1)選擇剪接和多聚腺苷化人的許多單個(gè)基因進(jìn)行選擇剪接產(chǎn)生不同的mRNA序列,編碼組織特異性的蛋白,并與多聚腺苷化結(jié)合產(chǎn)生不同的蛋白。如:降鈣素基因在甲狀腺合成降鈣素在下丘腦合成降鈣素基因相關(guān)肽——CGRP第二十二頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日23選擇剪接和多聚腺苷化
甲狀腺降鈣素下丘腦降鈣素基因相關(guān)肽第二十三頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日24(2)RNA剪輯(RNAediting)是一種在mRNA前體的堿基序列的改變,由酶中介核苷酸的插入、缺失或單核苷酸替換。五、轉(zhuǎn)錄后加工形式多見于線粒體和葉綠體系統(tǒng)。亦見于Wilm’s瘤的易感基因WT1和apoB。第二十四頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日25RNA剪輯----堿基插入或缺失賴蘇絲KTS:賴蘇絲第二十五頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日26RNA剪輯----堿基替換第二十六頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日27
六、某些人類基因表達(dá)主要在轉(zhuǎn)譯水平調(diào)控如:鐵蛋白增加鐵水平時(shí)刺激鐵蛋白合成而無相應(yīng)鐵蛋白mRNA增加;減少鐵水平刺激運(yùn)鐵蛋白受體合成而無相應(yīng)mRNA增加。
原因:在鐵蛋白mRNA的5’非翻譯序列和運(yùn)鐵蛋白受體3’非翻譯序列均含有一個(gè)或某些鐵反應(yīng)元件,以進(jìn)行特異組織表達(dá)。
第二十七頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日28鐵反應(yīng)元件(IRE)具有高度保守的RNA頸環(huán)結(jié)構(gòu),是細(xì)胞質(zhì)中IRE結(jié)合鐵蛋白(IRE-BP)的結(jié)合位點(diǎn)。IRE與IRE-BP結(jié)合受細(xì)胞內(nèi)鐵含量的調(diào)控,與鐵代謝有關(guān)。第二十八頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日29
在鐵蛋白5’UTR和運(yùn)鐵蛋白3’UTR都存在IRE。IRE在
5’UTR調(diào)節(jié)著翻譯的起始。IRE與IRE-BP結(jié)合可穩(wěn)定
mRNA并預(yù)防其降解。當(dāng)鐵離子濃度高時(shí),IRE-BP就釋放IRE,促進(jìn)翻譯,當(dāng)鐵離子濃度缺乏時(shí),IRE與IRE-BP結(jié)合,使核糖體的翻譯進(jìn)程受阻,抑制mRNA的翻譯。第二十九頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日30七.Epigenetic——DNA甲基化(1)人類基因表達(dá)的組織特異性(2)細(xì)胞發(fā)育分化基因表達(dá)的遺傳機(jī)制
——epigenetic機(jī)制,哺乳動(dòng)物和人胚胎早期發(fā)育在遺傳上的不對(duì)稱性
(3)DNA甲基化模式在細(xì)胞分裂時(shí)傳遞DNA甲基化僅限于CpG雙核苷酸(人DNA約3%胞嘧啶甲基化),CpG在胞嘧啶甲基轉(zhuǎn)移酶作用下,加-CH3到胞嘧啶5C原子上,形成5-甲基胞嘧啶,其化學(xué)上不穩(wěn)定并易于脫氨基形成胸腺嘧啶。第三十頁(yè),共三十二頁(yè),2022年,8月28日31七.Epigenetic——DNA甲基化(4)
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