生存分析醫(yī)學(xué)生課件

2022/12/191引例現(xiàn)用新舊兩種方法治療某癌病患者各100人，結(jié)果如下表，試評(píng)價(jià)其療效

表3

新舊兩種方法治療某癌病

死亡人數(shù)新法組舊法組RR一年16151.01二年2535

0.70五年40800.50*2022/12/141引例現(xiàn)用新舊兩種方法治療某癌病患2022/12/192生存分析2022/12/142生存分析2022/12/193一、基本概念生存時(shí)間（survivaltime)：疾病治療的預(yù)后情況，一方面看結(jié)局好壞，另一方面還要看出現(xiàn)這種結(jié)局所經(jīng)歷的時(shí)間長短。所經(jīng)歷的時(shí)間稱為生存時(shí)間。完全與不完全數(shù)據(jù)一部分研究對(duì)象可觀察到死亡，從而得到準(zhǔn)確的生存時(shí)間，所提供的信息是完全的，稱為完全數(shù)據(jù)；另一部分病人由于失訪、意外事故、或到觀察結(jié)束時(shí)仍存活等原因，無法知道確切的生存時(shí)間，它提供了不完全的信息，稱為不完全數(shù)據(jù)（截尾數(shù)據(jù)、刪失數(shù)據(jù):censordata）。2022/12/143一、基本概念生存時(shí)間（surviv2022/12/194始點(diǎn)終點(diǎn)2022/12/144始點(diǎn)終點(diǎn)2022/12/195始點(diǎn)終點(diǎn)2022/12/145始點(diǎn)終點(diǎn)2022/12/196生存分析(survivalanalysis)：生存時(shí)間一般是通過隨訪收集。不完全數(shù)據(jù)提供了部分信息。須要用專門的方法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)處理，這類統(tǒng)計(jì)方法起源于對(duì)壽命資料的統(tǒng)計(jì)分析，故稱為生存分析。2022/12/146生存分析(survivalanal2022/12/197

“生存”的概念

生物生存與死亡

儀器始使正常與出現(xiàn)故障疾病產(chǎn)生與治愈疾病治愈與復(fù)發(fā)

陰性與陽性 2022/12/147儀器始使正常與出現(xiàn)故障疾2022/12/198

截尾數(shù)據(jù)的處理

因?yàn)椴惶锰幚斫匚矓?shù)據(jù)，很多臨床研究工作者常常將失訪或中止等原因造成的截尾數(shù)據(jù)在分析時(shí)拋棄。截尾數(shù)據(jù)提供的信息雖然是不完全的，但也很有價(jià)值，不應(yīng)隨便刪掉它。2022/12/148截尾數(shù)據(jù)的處理因?yàn)椴惶锰幚?022/12/199

生存分析的主要內(nèi)容第一，描述生存過程

研究生存時(shí)間的分布特點(diǎn)，估計(jì)生存率，生存曲線；第二，比較生存過程（假設(shè)檢驗(yàn)）對(duì)兩組或多組生存率進(jìn)行比較；第三，影響生存時(shí)間的因素分析了解影響生存過程的主要因素為改善預(yù)后提供指導(dǎo)。2022/12/149生存分析的主要內(nèi)容第一，描2022/12/1910例在對(duì)資料進(jìn)行描述時(shí)：

5名癌癥患者存活時(shí)間（月）

610142020n=5平均生存時(shí)間,mean=18，median=１４78+2535

+50

當(dāng)有截尾數(shù)據(jù)時(shí)，?2022/12/1410例在對(duì)資料進(jìn)行描述時(shí)：72022/12/1911

死亡概率

(mortalityprobability)是指死于某時(shí)段內(nèi)的可能性大小.記為q，年死亡概率計(jì)算公式為：某年內(nèi)死亡數(shù)

q＝───────某年年初人口數(shù)

若年內(nèi)有刪失，則分母用校正人口數(shù)：校正人口數(shù)＝年初人口數(shù)－1/2刪失數(shù)

二、生存資料常計(jì)算的幾種率2022/12/1411死亡概率

(mortalityp2022/12/1912死亡概率（2）死亡概率是指已活滿t時(shí)刻的個(gè)體，在此后一段時(shí)期內(nèi)（t至）死亡的可能性。死亡概率的計(jì)算公式為2022/12/1412死亡概率（2）死亡概率是指已活滿t時(shí)2022/12/1913若t至內(nèi)有截尾值，上式的死亡概率也偏低，可對(duì)分母加以調(diào)整，為：如果很短，即時(shí)，死亡概率為t時(shí)刻的瞬時(shí)死亡概率，或稱為危險(xiǎn)函數(shù)（hazardfunction,h(t)），其意義為剛剛活過t時(shí)刻的個(gè)體在t時(shí)刻死亡的概率。2022/12/1413若t至內(nèi)有截尾值，上2022/12/1914

生存概率

(survivalprobability)表示在某單位時(shí)段開始時(shí)存活的個(gè)體到該時(shí)段結(jié)束時(shí)仍存活的可能性大小,記為p。年生存概率計(jì)算公式為：活滿某一年人數(shù)

p＝1－q＝────────某年年初人口數(shù)若年內(nèi)有刪失，則分母用校正人口數(shù)。2022/12/1414生存概率

(survivalpr2022/12/1915若在t至?xí)r段內(nèi)有截尾值，也應(yīng)計(jì)算調(diào)整生存概率生存概率與死亡概率之間有以下關(guān)系:p=1-q2022/12/1415若在t至?xí)r段內(nèi)有截尾值2022/12/1916生存率與生存函數(shù)累積生存概率，簡稱生存率，是指病人經(jīng)過t個(gè)時(shí)間單位之后仍存活的概率。若令s(t)為任意時(shí)刻t的生存率，T為生存期，得s(t)=p(T≥t)0≤t<∞，稱s(t)為生存率函數(shù)，簡稱生存函數(shù)2022/12/1416生存率與生存函數(shù)累積生存概率，簡稱生2022/12/1917三、生存率估計(jì)（描述）

醫(yī)學(xué)研究中的生存資料分布常常不規(guī)則、不確定或未知分布，因而常用非參數(shù)法估計(jì)生存率。根據(jù)樣本含量的大小可分別選擇乘積極限估計(jì)法（小樣本時(shí)）壽命表法（大樣本時(shí)）2022/12/1417三、生存率估計(jì)（描述）醫(yī)學(xué)研究中的2022/12/19181.乘積限估計(jì)法

Product-limitmethod簡稱積限法或PL法,直接用概率乘法原理估計(jì)生存率，它是由統(tǒng)計(jì)學(xué)家Kaplan和Meier于1958年首先提出的,因此又稱為Kaplan-Meier法.基本思想：將生存時(shí)間（包括截尾數(shù)據(jù)）逐個(gè)由小到大依次排列，并對(duì)其中的每個(gè)死亡點(diǎn)進(jìn)行死亡概率、生存概率和生存率估計(jì)。應(yīng)用條件：數(shù)據(jù)個(gè)數(shù)較少時(shí)。2022/12/14181.乘積限估計(jì)法

Produ2022/12/19192.壽命表法

（Lifetablemethod）

簡稱LT法。基本思想：隨訪時(shí)間劃分成若干個(gè)時(shí)間區(qū)間，t時(shí)刻的生存率為t時(shí)刻前各時(shí)間區(qū)間生存概率的乘積。應(yīng)用條件：數(shù)據(jù)個(gè)數(shù)多，經(jīng)分組時(shí)應(yīng)用。2022/12/14192.壽命表法

（Lifetable2022/12/19203.Kaplan-meier法計(jì)算生存率此法計(jì)算生存率時(shí)，先將每個(gè)個(gè)體的生存時(shí)間按照由小到大的順序排列，排序時(shí)若截尾值與非截尾值的觀察時(shí)間相同，則規(guī)定非截尾值小于截尾值，排在截尾值之前。然后依次計(jì)算出各時(shí)段的死亡概率、生存概率，進(jìn)而計(jì)算出從觀察開始至各時(shí)刻的生存率及其標(biāo)準(zhǔn)誤。2022/12/14203.Kaplan-meier法計(jì)算2022/12/1921小樣本生存分析Kaplan-Meier方法在SPSS中的實(shí)現(xiàn)生存狀態(tài)：1死亡，0截尾2022/12/1421小樣本生存分析Kaplan-Mei2022/12/1922SPSS軟件實(shí)現(xiàn)方法

File→Open→相應(yīng)數(shù)據(jù)文件→Analyze→Survival→Kaplan-Meier→Time(時(shí)間)→Status→Defineevent→singlevalue(1)→Continue→OK2022/12/1422SPSS軟件實(shí)現(xiàn)方法File→2022/12/19232022/12/14232022/12/1924選擇選項(xiàng)2022/12/1424選擇選項(xiàng)2022/12/19252022/12/14252022/12/1926例1：某臨床試驗(yàn)對(duì)20名第III或第IV期黑色素瘤的患者進(jìn)行隨訪研究，截至研究期結(jié)束，記錄的生存資料見下表，試計(jì)算100周的生存率。4.大樣本壽命表法2022/12/1426例1：某臨床試驗(yàn)對(duì)20名第III或第2022/12/1927表120名第III或第IV期黑色素瘤的患者的治療后的生存時(shí)間（周）12.8077.2015.6082.4024.00+87.20+26.4094.40+29.2097.20+30.80+106.00+39.20114.80+42.00117.20+58.40+140.00+72.00+168.00+2022/12/1427表120名第III或第IV期黑2022/12/1928建立數(shù)據(jù)文件“生存分析.sav”定義兩個(gè)變量：反應(yīng)變量，即生存時(shí)間變量，“time”分類變量，即生存狀態(tài)變量，“status”2022/12/1428建立數(shù)據(jù)文件“生存分析.sav”2022/12/1929Analyze—Survival—LifeTables….2022/12/1429Analyze—Survival—L2022/12/19302022/12/14302022/12/1931本例100周生存率為53%。2022/12/1431本例100周生存率為53%。2022/12/19322022/12/14322022/12/1933

三、生存過程的比較（假設(shè)檢驗(yàn)）非參數(shù)方法:

對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn)(log-ranktest)

廣義Wilcoxon檢驗(yàn)似然比（Likelihoodratio)檢驗(yàn)

生存率組間比較實(shí)際上是對(duì)兩條或多條生存曲線的分布情況比較（齊性檢驗(yàn)）

特點(diǎn)：檢驗(yàn)過程一般不顧及生存率，而是利用死亡數(shù)和死亡率函數(shù)作統(tǒng)計(jì)推斷2022/12/1433三、生存過程的比較（假設(shè)檢驗(yàn)）非參2022/12/1934應(yīng)用范圍均為兩組或多組生存率比較的方法：對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn)Log－ranktest：且近似服從Weibull分布，數(shù)值較小的失效時(shí)間所起的作用較大，（是SAS默認(rèn)的選項(xiàng)檢驗(yàn)方法）；廣義Wilcoxon檢驗(yàn)：最適合數(shù)值較大的失效時(shí)間所起的作用較大。似然比（Likelihoodratio)檢驗(yàn)：最適合生存資料近似服從指數(shù)分布。2022/12/1434應(yīng)用范圍均為兩組或多組生存率比較的方2022/12/1935例題：22例非小細(xì)胞肺癌患者在不同日期經(jīng)隨機(jī)化分配到放療組和放化療聯(lián)合組，從緩解出院日開始隨訪，隨訪時(shí)間（月）見下表，試比較放療和放化療聯(lián)合兩種治療方案的生存率曲線有無差別。甲（放療組）：1，2，3，5，6，9+，11，13，16，26，37+乙（放化療聯(lián)合組）：10，11+，14，18，22，22，26，32，38，40+，42+2022/12/1435例題：22例非小細(xì)胞肺癌患者在不同日2022/12/1936選擇檢驗(yàn)方法LogrankBreslowTarone-Ware假設(shè)檢驗(yàn)2022/12/1436選擇檢驗(yàn)方法Logrank假設(shè)檢2022/12/19372022/12/14372022/12/19382022/12/14382022/12/1939謝謝大家!2022/12/1439謝謝大家!后面內(nèi)容直接刪除就行資料可以編輯修改使用資料可以編輯修改使用后面內(nèi)容直接刪除就行主要經(jīng)營：網(wǎng)絡(luò)軟件設(shè)計(jì)、圖文設(shè)計(jì)制作、發(fā)布廣告等公司秉著以優(yōu)質(zhì)的服務(wù)對(duì)待每一位客戶，做到讓客戶滿意！主要經(jīng)營：網(wǎng)絡(luò)軟件設(shè)計(jì)、圖文設(shè)計(jì)制作、發(fā)布廣告等致力于數(shù)據(jù)挖掘，合同簡歷、論文寫作、PPT設(shè)計(jì)、計(jì)劃書、策劃案、學(xué)習(xí)課件、各類模板等方方面面，打造全網(wǎng)一站式需求致力于數(shù)據(jù)挖掘，合同簡歷、論文寫作、PPT設(shè)計(jì)、計(jì)劃書、策劃感謝您的觀看和下載Theusercandemonstrateonaprojectororcomputer,orprintthepresentationandmakeitintoafilmtobeusedinawiderfield感謝您的觀看和下載Theusercandemonstr2022/12/1944引例現(xiàn)用新舊兩種方法治療某癌病患者各100人，結(jié)果如下表，試評(píng)價(jià)其療效

表3

新舊兩種方法治療某癌病

死亡人數(shù)新法組舊法組RR一年16151.01二年2535

0.70五年40800.50*2022/12/141引例現(xiàn)用新舊兩種方法治療某癌病患2022/12/1945生存分析2022/12/142生存分析2022/12/1946一、基本概念生存時(shí)間（survivaltime)：疾病治療的預(yù)后情況，一方面看結(jié)局好壞，另一方面還要看出現(xiàn)這種結(jié)局所經(jīng)歷的時(shí)間長短。所經(jīng)歷的時(shí)間稱為生存時(shí)間。完全與不完全數(shù)據(jù)一部分研究對(duì)象可觀察到死亡，從而得到準(zhǔn)確的生存時(shí)間，所提供的信息是完全的，稱為完全數(shù)據(jù)；另一部分病人由于失訪、意外事故、或到觀察結(jié)束時(shí)仍存活等原因，無法知道確切的生存時(shí)間，它提供了不完全的信息，稱為不完全數(shù)據(jù)（截尾數(shù)據(jù)、刪失數(shù)據(jù):censordata）。2022/12/143一、基本概念生存時(shí)間（surviv2022/12/1947始點(diǎn)終點(diǎn)2022/12/144始點(diǎn)終點(diǎn)2022/12/1948始點(diǎn)終點(diǎn)2022/12/145始點(diǎn)終點(diǎn)2022/12/1949生存分析(survivalanalysis)：生存時(shí)間一般是通過隨訪收集。不完全數(shù)據(jù)提供了部分信息。須要用專門的方法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)處理，這類統(tǒng)計(jì)方法起源于對(duì)壽命資料的統(tǒng)計(jì)分析，故稱為生存分析。2022/12/146生存分析(survivalanal2022/12/1950

“生存”的概念

生物生存與死亡

儀器始使正常與出現(xiàn)故障疾病產(chǎn)生與治愈疾病治愈與復(fù)發(fā)

陰性與陽性 2022/12/147儀器始使正常與出現(xiàn)故障疾2022/12/1951

截尾數(shù)據(jù)的處理

因?yàn)椴惶锰幚斫匚矓?shù)據(jù)，很多臨床研究工作者常常將失訪或中止等原因造成的截尾數(shù)據(jù)在分析時(shí)拋棄。截尾數(shù)據(jù)提供的信息雖然是不完全的，但也很有價(jià)值，不應(yīng)隨便刪掉它。2022/12/148截尾數(shù)據(jù)的處理因?yàn)椴惶锰幚?022/12/1952

生存分析的主要內(nèi)容第一，描述生存過程

研究生存時(shí)間的分布特點(diǎn)，估計(jì)生存率，生存曲線；第二，比較生存過程（假設(shè)檢驗(yàn)）對(duì)兩組或多組生存率進(jìn)行比較；第三，影響生存時(shí)間的因素分析了解影響生存過程的主要因素為改善預(yù)后提供指導(dǎo)。2022/12/149生存分析的主要內(nèi)容第一，描2022/12/1953例在對(duì)資料進(jìn)行描述時(shí)：

5名癌癥患者存活時(shí)間（月）

610142020n=5平均生存時(shí)間,mean=18，median=１４78+2535

+50

當(dāng)有截尾數(shù)據(jù)時(shí)，?2022/12/1410例在對(duì)資料進(jìn)行描述時(shí)：72022/12/1954

死亡概率

(mortalityprobability)是指死于某時(shí)段內(nèi)的可能性大小.記為q，年死亡概率計(jì)算公式為：某年內(nèi)死亡數(shù)

q＝───────某年年初人口數(shù)

若年內(nèi)有刪失，則分母用校正人口數(shù)：校正人口數(shù)＝年初人口數(shù)－1/2刪失數(shù)

二、生存資料常計(jì)算的幾種率2022/12/1411死亡概率

(mortalityp2022/12/1955死亡概率（2）死亡概率是指已活滿t時(shí)刻的個(gè)體，在此后一段時(shí)期內(nèi)（t至）死亡的可能性。死亡概率的計(jì)算公式為2022/12/1412死亡概率（2）死亡概率是指已活滿t時(shí)2022/12/1956若t至內(nèi)有截尾值，上式的死亡概率也偏低，可對(duì)分母加以調(diào)整，為：如果很短，即時(shí)，死亡概率為t時(shí)刻的瞬時(shí)死亡概率，或稱為危險(xiǎn)函數(shù)（hazardfunction,h(t)），其意義為剛剛活過t時(shí)刻的個(gè)體在t時(shí)刻死亡的概率。2022/12/1413若t至內(nèi)有截尾值，上2022/12/1957

生存概率

(survivalprobability)表示在某單位時(shí)段開始時(shí)存活的個(gè)體到該時(shí)段結(jié)束時(shí)仍存活的可能性大小,記為p。年生存概率計(jì)算公式為：活滿某一年人數(shù)

p＝1－q＝────────某年年初人口數(shù)若年內(nèi)有刪失，則分母用校正人口數(shù)。2022/12/1414生存概率

(survivalpr2022/12/1958若在t至?xí)r段內(nèi)有截尾值，也應(yīng)計(jì)算調(diào)整生存概率生存概率與死亡概率之間有以下關(guān)系:p=1-q2022/12/1415若在t至?xí)r段內(nèi)有截尾值2022/12/1959生存率與生存函數(shù)累積生存概率，簡稱生存率，是指病人經(jīng)過t個(gè)時(shí)間單位之后仍存活的概率。若令s(t)為任意時(shí)刻t的生存率，T為生存期，得s(t)=p(T≥t)0≤t<∞，稱s(t)為生存率函數(shù)，簡稱生存函數(shù)2022/12/1416生存率與生存函數(shù)累積生存概率，簡稱生2022/12/1960三、生存率估計(jì)（描述）

醫(yī)學(xué)研究中的生存資料分布常常不規(guī)則、不確定或未知分布，因而常用非參數(shù)法估計(jì)生存率。根據(jù)樣本含量的大小可分別選擇乘積極限估計(jì)法（小樣本時(shí)）壽命表法（大樣本時(shí)）2022/12/1417三、生存率估計(jì)（描述）醫(yī)學(xué)研究中的2022/12/19611.乘積限估計(jì)法

Product-limitmethod簡稱積限法或PL法,直接用概率乘法原理估計(jì)生存率，它是由統(tǒng)計(jì)學(xué)家Kaplan和Meier于1958年首先提出的,因此又稱為Kaplan-Meier法.基本思想：將生存時(shí)間（包括截尾數(shù)據(jù)）逐個(gè)由小到大依次排列，并對(duì)其中的每個(gè)死亡點(diǎn)進(jìn)行死亡概率、生存概率和生存率估計(jì)。應(yīng)用條件：數(shù)據(jù)個(gè)數(shù)較少時(shí)。2022/12/14181.乘積限估計(jì)法

Produ2022/12/19622.壽命表法

（Lifetablemethod）

簡稱LT法?；舅枷耄弘S訪時(shí)間劃分成若干個(gè)時(shí)間區(qū)間，t時(shí)刻的生存率為t時(shí)刻前各時(shí)間區(qū)間生存概率的乘積。應(yīng)用條件：數(shù)據(jù)個(gè)數(shù)多，經(jīng)分組時(shí)應(yīng)用。2022/12/14192.壽命表法

（Lifetable2022/12/19633.Kaplan-meier法計(jì)算生存率此法計(jì)算生存率時(shí)，先將每個(gè)個(gè)體的生存時(shí)間按照由小到大的順序排列，排序時(shí)若截尾值與非截尾值的觀察時(shí)間相同，則規(guī)定非截尾值小于截尾值，排在截尾值之前。然后依次計(jì)算出各時(shí)段的死亡概率、生存概率，進(jìn)而計(jì)算出從觀察開始至各時(shí)刻的生存率及其標(biāo)準(zhǔn)誤。2022/12/14203.Kaplan-meier法計(jì)算2022/12/1964小樣本生存分析Kaplan-Meier方法在SPSS中的實(shí)現(xiàn)生存狀態(tài)：1死亡，0截尾2022/12/1421小樣本生存分析Kaplan-Mei2022/12/1965SPSS軟件實(shí)現(xiàn)方法

File→Open→相應(yīng)數(shù)據(jù)文件→Analyze→Survival→Kaplan-Meier→Time(時(shí)間)→Status→Defineevent→singlevalue(1)→Continue→OK2022/12/1422SPSS軟件實(shí)現(xiàn)方法File→2022/12/19662022/12/14232022/12/1967選擇選項(xiàng)2022/12/1424選擇選項(xiàng)2022/12/19682022/12/14252022/12/1969例1：某臨床試驗(yàn)對(duì)20名第III或第IV期黑色素瘤的患者進(jìn)行隨訪研究，截至研究期結(jié)束，記錄的生存資料見下表，試計(jì)算100周的生存率。4.大樣本壽命表法2022/12/1426例1：某臨床試驗(yàn)對(duì)20名第III或第2022/12/1970表120名第III或第IV期黑色素瘤的患者的治療后的生存時(shí)間（周）12.8077.2015.6082.4024.00+87.20+26.4094.40+29.2097.20+30.80+106.00+39.20114.80+42.00117.20+58.40+140.00+72.00+168.00+2022/12/1427表120名第III或第IV期黑2022/12/1971建立數(shù)據(jù)文件“生存分析.sav”定義兩個(gè)變量：反應(yīng)變量，即生存時(shí)間變量，“time”分類變量，即生存狀態(tài)變量，“status”2022/12/1428建立數(shù)據(jù)文件“生存分析.sav”2022/12/1972Analyze—Survival—LifeTables….2022/12/1429Analyze—Survival—L2022/12/19732022/12/14302022/12/1974本例100周生存率為53%。2022/12/1431本例100周生存率為53%。2022/12/19752022/12/14322022/12/1976

三、生存過程的比較（假設(shè)檢驗(yàn)）非參數(shù)方法:

對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn)(log-ranktest)

廣義Wilcoxon檢驗(yàn)似然比（Likelihoodratio)檢驗(yàn)

生存率組間比較實(shí)際上是對(duì)兩條或多條生存曲線的分布情況比較（齊性檢驗(yàn)