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本章主要內(nèi)容基本概念與原理原核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控真核生物基因表達(dá)調(diào)控本章主要內(nèi)容第一節(jié)基因表達(dá)調(diào)控基本概念與原理
一、基因表達(dá)的概念二、基因表達(dá)的特異性三、基因表達(dá)的方式四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義五、基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)的基本要素
第一節(jié)基因表達(dá)調(diào)控基本概念與原理一、基因表達(dá)的概念
基因表達(dá)
是指生物體基因組種結(jié)構(gòu)基因所攜帶的遺傳信息經(jīng)過轉(zhuǎn)錄及翻譯等一系列過程,合成特定的蛋白質(zhì),進(jìn)而發(fā)揮其特定生物學(xué)功能的全過程。
基因表達(dá)產(chǎn)物各種RNA(tRNA、mRNA和rRNA)以及蛋白質(zhì)、多肽。一、基因表達(dá)的概念二、基因表達(dá)的特異性
(一)時(shí)間特異性往往與細(xì)胞或個(gè)體的特定分化、發(fā)育階段相適應(yīng),又稱階段特異性。(二)空間特異性由細(xì)胞在各組織器官的分布差異所決定的,故又稱為細(xì)胞特異性或組織特異性。二、基因表達(dá)的特異性5時(shí)間特異性(temporalspecificity)
某一基因的表達(dá)嚴(yán)格按特定的時(shí)間順序發(fā)生。
Hb(hemoglobin)α珠蛋白基因簇:ζ(胚胎型)、αβ珠蛋白基因簇:ε(胚胎型)、γ(胎兒型)、β、δζ2ε2→α2γ2→α2β25時(shí)間特異性(temporalspecificity)三、基因表達(dá)的方式
(一)組成性表達(dá)管家基因
在生命全過程都是必需的、且在一個(gè)生物個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)的基因。組成性基因表達(dá)
管家基因較少受環(huán)境因素的影響,在個(gè)體發(fā)育的任一階段都能在大多數(shù)細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)。三、基因表達(dá)的方式(一)組成性表達(dá)(二)誘導(dǎo)和阻遏表達(dá)誘導(dǎo)表達(dá)
在特定環(huán)境信號(hào)刺激下,基因表現(xiàn)為開放或增強(qiáng),表達(dá)產(chǎn)物增加。阻遏表達(dá)在特定環(huán)境信號(hào)刺激下,基因被抑制,從而使表達(dá)產(chǎn)物減少。(二)誘導(dǎo)和阻遏表達(dá)(三)協(xié)調(diào)表達(dá)協(xié)調(diào)表達(dá)
在一定機(jī)制控制下,功能相關(guān)的一組基因,協(xié)調(diào)一致,共同表達(dá)。(三)協(xié)調(diào)表達(dá)四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義(一)適應(yīng)環(huán)境變化、維持細(xì)胞增殖、分化(二)維持個(gè)體生長(zhǎng)、發(fā)育
四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義(一)適應(yīng)環(huán)境變化、維持細(xì)胞增殖五、基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)基本要素
(一)特異DNA序列(二)調(diào)節(jié)蛋白(三)RNA聚合酶五、基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)基本要素
原核生物的特異DNA序列
原核生物的基因表達(dá)與調(diào)控是通過操縱子機(jī)制實(shí)現(xiàn)的。
操縱子
是由功能上相關(guān)聯(lián)的多個(gè)編碼序列(2個(gè)以上)及其上游的調(diào)控序列(包括操縱序列、啟動(dòng)序列和調(diào)節(jié)序列)等成簇串聯(lián)在一起,構(gòu)成的一個(gè)轉(zhuǎn)錄協(xié)調(diào)單位。
(一)特異DNA序列原核生物的特異DNA序列(一)特異DNA序列
操縱子調(diào)節(jié)序列啟動(dòng)序列操縱序列編碼序列表達(dá)轉(zhuǎn)錄ICAPPOZYA阻遏蛋白結(jié)合部位RNA聚合酶結(jié)合部位
編碼序列
規(guī)定蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),又稱結(jié)構(gòu)基因;多順反子mRNA
由多個(gè)結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起,受同一個(gè)啟動(dòng)序列調(diào)控,轉(zhuǎn)錄生成一個(gè)mRNA,翻譯生成多個(gè)蛋白質(zhì),稱此為多順反子mRNA.多順反子mRNA阻遏蛋白
原核生物的共有序列
原核生物的啟動(dòng)序列,在距離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)-10區(qū)和-35區(qū)往往含有一些重要的保守序列(共有序列)。
-10區(qū):含TATAAT序列,又稱Pribnow盒。
-35區(qū):含TTGACA序列。RNA聚合酶結(jié)合部位決定轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)
真核生物的特異DNA序列
真核生物基因組中含有可以調(diào)控自身基因表達(dá)活性的特異DNA序列,稱為順式作用元件。
順式作用元件能夠被轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白特異識(shí)別和結(jié)合,從而影響基因表達(dá)活性。
啟動(dòng)子
順式作用元件又分增強(qiáng)子
沉默子真核生物的特異DNA序列
(1)啟動(dòng)子是RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)及其周圍的一組轉(zhuǎn)錄調(diào)控組件(包括轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)以及典型的TATA盒)。
(2)增強(qiáng)子是增強(qiáng)啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性的DNA序列,并決定組織特異性表達(dá)。
(3)沉默子能夠?qū)蜣D(zhuǎn)錄起阻遏作用的DNA片段,屬于負(fù)性調(diào)控元件。
(1)啟動(dòng)子第六章-基因表達(dá)調(diào)控課件(二)調(diào)節(jié)蛋白原核生物的調(diào)節(jié)蛋白(3類)特異因子
決定RNA聚合酶對(duì)啟動(dòng)序列的特異識(shí)別和結(jié)合能力;
(RNA聚合酶的-因子)阻遏蛋白
通過與操縱序列結(jié)合,阻遏基因轉(zhuǎn)錄;(由調(diào)節(jié)基因表達(dá)的阻遏蛋白)激活蛋白
與啟動(dòng)子上游DNA序列結(jié)合,促進(jìn)RNA聚合酶與啟動(dòng)序列結(jié)合,促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄。(CAP—分解代謝物基因活化蛋白)(二)調(diào)節(jié)蛋白原核生物的調(diào)節(jié)蛋白(3類)
2.真核生物的調(diào)節(jié)蛋白
反式作用因子
能直接或間接與順式作用元件相互作用,進(jìn)而調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的一類調(diào)節(jié)蛋白,統(tǒng)稱為反式作用因子。
按其功能不同,常有以下三類:
(基本)轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子:DNA-蛋白質(zhì)共調(diào)節(jié)因子:蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)2.真核生物的調(diào)節(jié)蛋白第六章-基因表達(dá)調(diào)控課件(1)基本轉(zhuǎn)錄因子
是指能夠直接或間接與啟動(dòng)子核心序列TATA盒特異結(jié)合、并啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的一類調(diào)節(jié)蛋白。(參與構(gòu)成基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄裝置所需的一類通用轉(zhuǎn)錄因子)
真核生物RNA聚合酶Ⅱ(RNApolⅡ)識(shí)別啟動(dòng)子所需的轉(zhuǎn)錄因子(TFⅡ)有多種亞類:
TFⅡA,TFⅡB,TFⅡD,TFⅡE,TFⅡF,TFⅡ-I等。
其中TFⅡD最先、最直接與啟動(dòng)子TATA盒結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子,然后按一定時(shí)空順序依次結(jié)合RNApolⅡ和其他轉(zhuǎn)錄因子,形成一個(gè)轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合物(PIC)。(1)基本轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合體的組裝(PIC)轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合物(PIC)轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合體的組裝(PIC)轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合物(PIC)(2)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子
這類調(diào)經(jīng)蛋白能識(shí)別并結(jié)合轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游激活序列和遠(yuǎn)端的增強(qiáng)子元件,通過DNA-蛋白質(zhì)相互作用而調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄活性。
起激活轉(zhuǎn)錄作用——轉(zhuǎn)錄激活因子;阻遏轉(zhuǎn)錄作用——轉(zhuǎn)錄阻遏因子。(3)共調(diào)節(jié)因子
首先與轉(zhuǎn)錄因子或轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子發(fā)生蛋白-蛋白相互作用,進(jìn)而影響它們的分子構(gòu)象,以調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄活性。
如果與轉(zhuǎn)錄激活因子有協(xié)同作用——共激活因子;與轉(zhuǎn)錄阻遏因子有協(xié)同作用——共阻遏因子。(2)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子
反式作用因子的特殊功能域
DNA結(jié)合域;轉(zhuǎn)錄激活域;結(jié)合其他蛋白質(zhì)的功能域。
鋅指結(jié)構(gòu)
亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)反式作用因子的特殊功能域鋅
(三)RNA聚合酶
1.啟動(dòng)子與RNA聚合酶活性啟動(dòng)子核苷酸序列影響與RNA聚合酶的親和力。
2.調(diào)節(jié)蛋白與RNA聚合酶的活性調(diào)節(jié)蛋白通過DNA-蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用影響RNA酶活性。(三)RNA聚合酶六、基因表達(dá)的多級(jí)調(diào)控
基因結(jié)構(gòu)活化轉(zhuǎn)錄水平
轉(zhuǎn)錄起始
轉(zhuǎn)錄后加工轉(zhuǎn)錄后水平
轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的轉(zhuǎn)運(yùn)
翻譯調(diào)控翻譯水平
翻譯后加工六、基因表達(dá)的多級(jí)調(diào)控基因結(jié)構(gòu)活化
第二節(jié)原核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控一、乳糖操縱子調(diào)節(jié)機(jī)制控制區(qū)信息區(qū)結(jié)構(gòu)基因(S)操縱序列(O)啟動(dòng)序列(P)調(diào)節(jié)基因(I)CPA第二節(jié)原核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控控制區(qū)信息區(qū)結(jié)構(gòu)基因(
乳糖操縱子結(jié)構(gòu)基因表達(dá)產(chǎn)物乳糖操縱子結(jié)構(gòu)基因表達(dá)產(chǎn)物(一)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)作用I阻遏蛋白
無乳糖存在時(shí),結(jié)構(gòu)基因受阻遏(一)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)作用I阻遏蛋白無乳糖存在
有乳糖存在時(shí),結(jié)構(gòu)基因表達(dá)有乳糖存在時(shí),結(jié)構(gòu)基因表達(dá)2CAPCAP位點(diǎn)-G,-Lac
阻遏蛋白
操縱序列-G,+LacRNA聚合酶無葡萄糖,無乳糖②無葡萄糖,有乳糖③有葡萄糖,無乳糖④有葡萄糖,有乳糖
啟動(dòng)序列cAMPmRNA5'(二)CAP的正性調(diào)節(jié)作用③①
+G,-Lac+G,+Lac②④2CAPCAP位點(diǎn)-G,-Lac阻遏蛋白操縱當(dāng)培養(yǎng)基中乳糖濃度降低而葡萄糖濃度升高時(shí)
細(xì)胞中cAMP濃度降低
缺乏乳糖與阻遏蛋白結(jié)合
CAP失活
阻抑蛋白與操縱基因結(jié)合
CAP及RNA聚合酶不能與啟動(dòng)基因結(jié)合
基因轉(zhuǎn)錄被阻遏
阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)當(dāng)培養(yǎng)基中乳糖濃度降低而葡萄糖濃度升高時(shí)
當(dāng)培養(yǎng)基中乳糖濃度升高而葡萄糖濃度降低時(shí)
細(xì)胞中cAMP濃度升高
乳糖作為誘導(dǎo)劑與阻抑蛋白結(jié)合
cAMP與CRP結(jié)合并使之激合
促使阻抑蛋白與操縱基因分離
CRP與啟動(dòng)基因結(jié)合并促使RNA聚合酶與啟動(dòng)基因結(jié)合
基因轉(zhuǎn)錄激活
CAP的正性調(diào)節(jié)當(dāng)培養(yǎng)基中乳糖濃度升高而葡萄糖濃度降低時(shí)二、色氨酸操縱子的調(diào)節(jié)機(jī)制
色氨酸操縱子(trpoperon):阻遏型操縱子;主要參與調(diào)控一系列用于色氨酸合成代謝的酶蛋白的轉(zhuǎn)錄合成。當(dāng)細(xì)胞內(nèi)缺乏色氨酸時(shí),此操縱子開放;而當(dāng)細(xì)胞內(nèi)合成的色氨酸過多時(shí),此操縱子被關(guān)閉。
二、色氨酸操縱子的調(diào)節(jié)機(jī)制色氨酸操縱子(trpoperoO阻遏蛋白(無活性)mRNAtrpRPtrpEtrpDtrpCtrpBtrpA前導(dǎo)trpL衰減子
結(jié)構(gòu)基因
調(diào)控區(qū)二、色氨酸操縱子的調(diào)節(jié)機(jī)制
色氨酸合成的酶蛋白O阻遏蛋白mRNAtrpRPtrpEtrpDtrpCtO阻遏蛋白mRNATrp
trpRPtrpEtrpDtrpCtrpBtrpA前導(dǎo)序列(L)衰減子(結(jié)構(gòu)基因關(guān)閉)調(diào)節(jié)區(qū)
在高濃度色氨酸存在下,通過形成特殊的“衰減子”結(jié)構(gòu),對(duì)轉(zhuǎn)錄進(jìn)行更精細(xì)的調(diào)控。
色氨酸的負(fù)性調(diào)控作用
有活性O(shè)阻遏蛋白mRNATrptrpRPtrpEtrpDtTrp操縱子的trpE基因5′-端“前導(dǎo)序列”
衰減子結(jié)構(gòu)10、11Trp操縱子的trpE基因5′-端“前導(dǎo)序列”衰減子1前導(dǎo)肽核蛋白體衰減子結(jié)構(gòu)RNA聚合酶5'mRNATrp密碼子1234UUUU3'DNADNA前導(dǎo)肽5'1234Trp結(jié)構(gòu)基因MKAIFVLKGMKAIFVLKGWWRTSRNA聚合酶Trp操縱子的轉(zhuǎn)錄衰減機(jī)制前導(dǎo)肽核蛋白體衰減子結(jié)構(gòu)RNA聚合酶5'mRNATrp密碼子三、原核生物基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn)
主要在轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行調(diào)節(jié)1)σ因子的特異啟動(dòng)作用
2)操縱子調(diào)控機(jī)制具有普遍性3)結(jié)構(gòu)基因進(jìn)行多順反子轉(zhuǎn)錄4)阻遏蛋白阻遏轉(zhuǎn)錄具有普遍性三、原核生物基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn)第三節(jié)真核生物基因表達(dá)調(diào)控
一、真核生物基因組特點(diǎn)
(一)基因組結(jié)構(gòu)龐大
人類的單倍體基因組由3X109的核苷酸組成,含有大約2.63.9萬個(gè)基因。(二)形成染色體結(jié)構(gòu)真核生物的基因組是以DNA和蛋白質(zhì)結(jié)合形成染色體結(jié)構(gòu)形式而存在于細(xì)胞核。第三節(jié)真核生物基因表達(dá)調(diào)控
一、真核生物基因組特點(diǎn)((三)單順反子真核基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物一般是單順反子。單順反子
一個(gè)編碼基因轉(zhuǎn)錄生成一個(gè)mRNA分子,并指導(dǎo)翻譯一條多肽鏈。(四)重復(fù)序列
真核生物基因普遍存在重復(fù)序列。根據(jù)重復(fù)頻率不同,分為以下3類:
高度重復(fù)序列中度重復(fù)序列單拷貝重復(fù)序列反向重復(fù)序列(回文序列)(三)單順反子1.高度重復(fù)序列
重復(fù)數(shù)百萬次,序列簡(jiǎn)單序列,不到10bp;稱為衛(wèi)星DNA;2.中度重復(fù)序列重復(fù)上千次,序列由幾百個(gè)bp構(gòu)成;3.單拷貝序列只出現(xiàn)1次或幾次。真核生物極大多數(shù)為單一基因;反向重復(fù)序列是指在DNA鏈某些區(qū)域,出現(xiàn)反向排列的堿基序列。如:
“---CGTACC---/---CCATGC---”,又稱“回文結(jié)構(gòu)”。1.高度重復(fù)序列(五)斷裂基因
外顯子具有實(shí)際編碼意義的結(jié)構(gòu)基因序列;內(nèi)含子不具有編碼意義的堿基序列,又稱插入序列。(六)大多數(shù)為非編碼區(qū)(95%左右)(五)斷裂基因外顯子(一)DNA、染色體水平的變化特點(diǎn)二、真核基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn)
1.對(duì)核酸酶極度敏感(一)DNA、染色體水平的變化特點(diǎn)二、真核基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn)2.DNA拓樸結(jié)構(gòu)變化
天然雙鏈DNA幾乎均以負(fù)性超螺旋構(gòu)象存在。當(dāng)基因激活后,則轉(zhuǎn)錄區(qū)前方的DNA拓樸結(jié)構(gòu)變?yōu)檎猿菪?,有利于RNA聚合酶向前移動(dòng),進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。3.DNA甲基化
DNA甲基化程度與基因表達(dá)呈反比。4.染色體結(jié)構(gòu)的變化組蛋白發(fā)生修飾,堿基暴露等原因而引起核小體結(jié)構(gòu)改變,使核小體不穩(wěn)定性增加。2.DNA拓樸結(jié)構(gòu)變化(二)RNA聚合酶、mRNA的轉(zhuǎn)錄激活及調(diào)節(jié)
真核生物有3種RNA聚合酶:RNApolⅠ、Ⅱ、Ⅲ。每種RNA聚合酶有約10個(gè)亞基組成,其中TATA盒結(jié)合蛋白(TBP)為3種酶共有。
RNApolⅡ?qū)Υ呋痬RNA的生成起主要作用。轉(zhuǎn)錄前RNApolⅡ必須與TBP、TFⅡD等各種通用轉(zhuǎn)錄因子形成轉(zhuǎn)錄前復(fù)合體(PIC),從而激活或抑制RNA的轉(zhuǎn)錄。(二)RNA聚合酶、mRNA的轉(zhuǎn)錄激活及調(diào)節(jié)聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合體的組裝聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合體的組裝聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體的組裝聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體的組裝(三)正性調(diào)節(jié)占主導(dǎo)
真核基因一般都處于阻遏狀態(tài),RNA聚合酶對(duì)啟動(dòng)子的親和力很低。通過利用各種轉(zhuǎn)錄因子正性激活RNA聚合酶是真核基因調(diào)控的主要機(jī)制。采用正性調(diào)節(jié)機(jī)制更有效、經(jīng)濟(jì)、特異;采用負(fù)性調(diào)節(jié)不經(jīng)濟(jì)(四)轉(zhuǎn)錄和翻譯過程分開進(jìn)行轉(zhuǎn)錄與翻譯過程分別存在于不同的亞細(xì)胞部位(胞核與胞漿),可分別進(jìn)行調(diào)控。(三)正性調(diào)節(jié)占主導(dǎo)(五)轉(zhuǎn)錄后加工真核基因大多為斷裂基因,內(nèi)含子和外顯子一起被轉(zhuǎn)錄。轉(zhuǎn)錄后產(chǎn)物(hnRNA)經(jīng)剪接、加帽、加尾等加工修飾,才能轉(zhuǎn)變?yōu)槌墒斓膍RNA.(五)轉(zhuǎn)錄后加工
本章主要內(nèi)容基本概念與原理原核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控真核生物基因表達(dá)調(diào)控本章主要內(nèi)容第一節(jié)基因表達(dá)調(diào)控基本概念與原理
一、基因表達(dá)的概念二、基因表達(dá)的特異性三、基因表達(dá)的方式四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義五、基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)的基本要素
第一節(jié)基因表達(dá)調(diào)控基本概念與原理一、基因表達(dá)的概念
基因表達(dá)
是指生物體基因組種結(jié)構(gòu)基因所攜帶的遺傳信息經(jīng)過轉(zhuǎn)錄及翻譯等一系列過程,合成特定的蛋白質(zhì),進(jìn)而發(fā)揮其特定生物學(xué)功能的全過程。
基因表達(dá)產(chǎn)物各種RNA(tRNA、mRNA和rRNA)以及蛋白質(zhì)、多肽。一、基因表達(dá)的概念二、基因表達(dá)的特異性
(一)時(shí)間特異性往往與細(xì)胞或個(gè)體的特定分化、發(fā)育階段相適應(yīng),又稱階段特異性。(二)空間特異性由細(xì)胞在各組織器官的分布差異所決定的,故又稱為細(xì)胞特異性或組織特異性。二、基因表達(dá)的特異性54時(shí)間特異性(temporalspecificity)
某一基因的表達(dá)嚴(yán)格按特定的時(shí)間順序發(fā)生。
Hb(hemoglobin)α珠蛋白基因簇:ζ(胚胎型)、αβ珠蛋白基因簇:ε(胚胎型)、γ(胎兒型)、β、δζ2ε2→α2γ2→α2β25時(shí)間特異性(temporalspecificity)三、基因表達(dá)的方式
(一)組成性表達(dá)管家基因
在生命全過程都是必需的、且在一個(gè)生物個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)的基因。組成性基因表達(dá)
管家基因較少受環(huán)境因素的影響,在個(gè)體發(fā)育的任一階段都能在大多數(shù)細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)。三、基因表達(dá)的方式(一)組成性表達(dá)(二)誘導(dǎo)和阻遏表達(dá)誘導(dǎo)表達(dá)
在特定環(huán)境信號(hào)刺激下,基因表現(xiàn)為開放或增強(qiáng),表達(dá)產(chǎn)物增加。阻遏表達(dá)在特定環(huán)境信號(hào)刺激下,基因被抑制,從而使表達(dá)產(chǎn)物減少。(二)誘導(dǎo)和阻遏表達(dá)(三)協(xié)調(diào)表達(dá)協(xié)調(diào)表達(dá)
在一定機(jī)制控制下,功能相關(guān)的一組基因,協(xié)調(diào)一致,共同表達(dá)。(三)協(xié)調(diào)表達(dá)四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義(一)適應(yīng)環(huán)境變化、維持細(xì)胞增殖、分化(二)維持個(gè)體生長(zhǎng)、發(fā)育
四、基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義(一)適應(yīng)環(huán)境變化、維持細(xì)胞增殖五、基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)基本要素
(一)特異DNA序列(二)調(diào)節(jié)蛋白(三)RNA聚合酶五、基因轉(zhuǎn)錄激活調(diào)節(jié)基本要素
原核生物的特異DNA序列
原核生物的基因表達(dá)與調(diào)控是通過操縱子機(jī)制實(shí)現(xiàn)的。
操縱子
是由功能上相關(guān)聯(lián)的多個(gè)編碼序列(2個(gè)以上)及其上游的調(diào)控序列(包括操縱序列、啟動(dòng)序列和調(diào)節(jié)序列)等成簇串聯(lián)在一起,構(gòu)成的一個(gè)轉(zhuǎn)錄協(xié)調(diào)單位。
(一)特異DNA序列原核生物的特異DNA序列(一)特異DNA序列
操縱子調(diào)節(jié)序列啟動(dòng)序列操縱序列編碼序列表達(dá)轉(zhuǎn)錄ICAPPOZYA阻遏蛋白結(jié)合部位RNA聚合酶結(jié)合部位
編碼序列
規(guī)定蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),又稱結(jié)構(gòu)基因;多順反子mRNA
由多個(gè)結(jié)構(gòu)基因串聯(lián)在一起,受同一個(gè)啟動(dòng)序列調(diào)控,轉(zhuǎn)錄生成一個(gè)mRNA,翻譯生成多個(gè)蛋白質(zhì),稱此為多順反子mRNA.多順反子mRNA阻遏蛋白
原核生物的共有序列
原核生物的啟動(dòng)序列,在距離轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)-10區(qū)和-35區(qū)往往含有一些重要的保守序列(共有序列)。
-10區(qū):含TATAAT序列,又稱Pribnow盒。
-35區(qū):含TTGACA序列。RNA聚合酶結(jié)合部位決定轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)
真核生物的特異DNA序列
真核生物基因組中含有可以調(diào)控自身基因表達(dá)活性的特異DNA序列,稱為順式作用元件。
順式作用元件能夠被轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白特異識(shí)別和結(jié)合,從而影響基因表達(dá)活性。
啟動(dòng)子
順式作用元件又分增強(qiáng)子
沉默子真核生物的特異DNA序列
(1)啟動(dòng)子是RNA聚合酶結(jié)合位點(diǎn)及其周圍的一組轉(zhuǎn)錄調(diào)控組件(包括轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)以及典型的TATA盒)。
(2)增強(qiáng)子是增強(qiáng)啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性的DNA序列,并決定組織特異性表達(dá)。
(3)沉默子能夠?qū)蜣D(zhuǎn)錄起阻遏作用的DNA片段,屬于負(fù)性調(diào)控元件。
(1)啟動(dòng)子第六章-基因表達(dá)調(diào)控課件(二)調(diào)節(jié)蛋白原核生物的調(diào)節(jié)蛋白(3類)特異因子
決定RNA聚合酶對(duì)啟動(dòng)序列的特異識(shí)別和結(jié)合能力;
(RNA聚合酶的-因子)阻遏蛋白
通過與操縱序列結(jié)合,阻遏基因轉(zhuǎn)錄;(由調(diào)節(jié)基因表達(dá)的阻遏蛋白)激活蛋白
與啟動(dòng)子上游DNA序列結(jié)合,促進(jìn)RNA聚合酶與啟動(dòng)序列結(jié)合,促進(jìn)基因轉(zhuǎn)錄。(CAP—分解代謝物基因活化蛋白)(二)調(diào)節(jié)蛋白原核生物的調(diào)節(jié)蛋白(3類)
2.真核生物的調(diào)節(jié)蛋白
反式作用因子
能直接或間接與順式作用元件相互作用,進(jìn)而調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的一類調(diào)節(jié)蛋白,統(tǒng)稱為反式作用因子。
按其功能不同,常有以下三類:
(基本)轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子:DNA-蛋白質(zhì)共調(diào)節(jié)因子:蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)2.真核生物的調(diào)節(jié)蛋白第六章-基因表達(dá)調(diào)控課件(1)基本轉(zhuǎn)錄因子
是指能夠直接或間接與啟動(dòng)子核心序列TATA盒特異結(jié)合、并啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄的一類調(diào)節(jié)蛋白。(參與構(gòu)成基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄裝置所需的一類通用轉(zhuǎn)錄因子)
真核生物RNA聚合酶Ⅱ(RNApolⅡ)識(shí)別啟動(dòng)子所需的轉(zhuǎn)錄因子(TFⅡ)有多種亞類:
TFⅡA,TFⅡB,TFⅡD,TFⅡE,TFⅡF,TFⅡ-I等。
其中TFⅡD最先、最直接與啟動(dòng)子TATA盒結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子,然后按一定時(shí)空順序依次結(jié)合RNApolⅡ和其他轉(zhuǎn)錄因子,形成一個(gè)轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合物(PIC)。(1)基本轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合體的組裝(PIC)轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合物(PIC)轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合體的組裝(PIC)轉(zhuǎn)錄前起始復(fù)合物(PIC)(2)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子
這類調(diào)經(jīng)蛋白能識(shí)別并結(jié)合轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的上游激活序列和遠(yuǎn)端的增強(qiáng)子元件,通過DNA-蛋白質(zhì)相互作用而調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄活性。
起激活轉(zhuǎn)錄作用——轉(zhuǎn)錄激活因子;阻遏轉(zhuǎn)錄作用——轉(zhuǎn)錄阻遏因子。(3)共調(diào)節(jié)因子
首先與轉(zhuǎn)錄因子或轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子發(fā)生蛋白-蛋白相互作用,進(jìn)而影響它們的分子構(gòu)象,以調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄活性。
如果與轉(zhuǎn)錄激活因子有協(xié)同作用——共激活因子;與轉(zhuǎn)錄阻遏因子有協(xié)同作用——共阻遏因子。(2)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子
反式作用因子的特殊功能域
DNA結(jié)合域;轉(zhuǎn)錄激活域;結(jié)合其他蛋白質(zhì)的功能域。
鋅指結(jié)構(gòu)
亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)反式作用因子的特殊功能域鋅
(三)RNA聚合酶
1.啟動(dòng)子與RNA聚合酶活性啟動(dòng)子核苷酸序列影響與RNA聚合酶的親和力。
2.調(diào)節(jié)蛋白與RNA聚合酶的活性調(diào)節(jié)蛋白通過DNA-蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用影響RNA酶活性。(三)RNA聚合酶六、基因表達(dá)的多級(jí)調(diào)控
基因結(jié)構(gòu)活化轉(zhuǎn)錄水平
轉(zhuǎn)錄起始
轉(zhuǎn)錄后加工轉(zhuǎn)錄后水平
轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的轉(zhuǎn)運(yùn)
翻譯調(diào)控翻譯水平
翻譯后加工六、基因表達(dá)的多級(jí)調(diào)控基因結(jié)構(gòu)活化
第二節(jié)原核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控一、乳糖操縱子調(diào)節(jié)機(jī)制控制區(qū)信息區(qū)結(jié)構(gòu)基因(S)操縱序列(O)啟動(dòng)序列(P)調(diào)節(jié)基因(I)CPA第二節(jié)原核生物基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控控制區(qū)信息區(qū)結(jié)構(gòu)基因(
乳糖操縱子結(jié)構(gòu)基因表達(dá)產(chǎn)物乳糖操縱子結(jié)構(gòu)基因表達(dá)產(chǎn)物(一)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)作用I阻遏蛋白
無乳糖存在時(shí),結(jié)構(gòu)基因受阻遏(一)阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)作用I阻遏蛋白無乳糖存在
有乳糖存在時(shí),結(jié)構(gòu)基因表達(dá)有乳糖存在時(shí),結(jié)構(gòu)基因表達(dá)2CAPCAP位點(diǎn)-G,-Lac
阻遏蛋白
操縱序列-G,+LacRNA聚合酶無葡萄糖,無乳糖②無葡萄糖,有乳糖③有葡萄糖,無乳糖④有葡萄糖,有乳糖
啟動(dòng)序列cAMPmRNA5'(二)CAP的正性調(diào)節(jié)作用③①
+G,-Lac+G,+Lac②④2CAPCAP位點(diǎn)-G,-Lac阻遏蛋白操縱當(dāng)培養(yǎng)基中乳糖濃度降低而葡萄糖濃度升高時(shí)
細(xì)胞中cAMP濃度降低
缺乏乳糖與阻遏蛋白結(jié)合
CAP失活
阻抑蛋白與操縱基因結(jié)合
CAP及RNA聚合酶不能與啟動(dòng)基因結(jié)合
基因轉(zhuǎn)錄被阻遏
阻遏蛋白的負(fù)性調(diào)節(jié)當(dāng)培養(yǎng)基中乳糖濃度降低而葡萄糖濃度升高時(shí)
當(dāng)培養(yǎng)基中乳糖濃度升高而葡萄糖濃度降低時(shí)
細(xì)胞中cAMP濃度升高
乳糖作為誘導(dǎo)劑與阻抑蛋白結(jié)合
cAMP與CRP結(jié)合并使之激合
促使阻抑蛋白與操縱基因分離
CRP與啟動(dòng)基因結(jié)合并促使RNA聚合酶與啟動(dòng)基因結(jié)合
基因轉(zhuǎn)錄激活
CAP的正性調(diào)節(jié)當(dāng)培養(yǎng)基中乳糖濃度升高而葡萄糖濃度降低時(shí)二、色氨酸操縱子的調(diào)節(jié)機(jī)制
色氨酸操縱子(trpoperon):阻遏型操縱子;主要參與調(diào)控一系列用于色氨酸合成代謝的酶蛋白的轉(zhuǎn)錄合成。當(dāng)細(xì)胞內(nèi)缺乏色氨酸時(shí),此操縱子開放;而當(dāng)細(xì)胞內(nèi)合成的色氨酸過多時(shí),此操縱子被關(guān)閉。
二、色氨酸操縱子的調(diào)節(jié)機(jī)制色氨酸操縱子(trpoperoO阻遏蛋白(無活性)mRNAtrpRPtrpEtrpDtrpCtrpBtrpA前導(dǎo)trpL衰減子
結(jié)構(gòu)基因
調(diào)控區(qū)二、色氨酸操縱子的調(diào)節(jié)機(jī)制
色氨酸合成的酶蛋白O阻遏蛋白mRNAtrpRPtrpEtrpDtrpCtO阻遏蛋白mRNATrp
trpRPtrpEtrpDtrpCtrpBtrpA前導(dǎo)序列(L)衰減子(結(jié)構(gòu)基因關(guān)閉)調(diào)節(jié)區(qū)
在高濃度色氨酸存在下,通過形成特殊的“衰減子”結(jié)構(gòu),對(duì)轉(zhuǎn)錄進(jìn)行更精細(xì)的調(diào)控。
色氨酸的負(fù)性調(diào)控作用
有活性O(shè)阻遏蛋白mRNATrptrpRPtrpEtrpDtTrp操縱子的trpE基因5′-端“前導(dǎo)序列”
衰減子結(jié)構(gòu)10、11Trp操縱子的trpE基因5′-端“前導(dǎo)序列”衰減子1前導(dǎo)肽核蛋白體衰減子結(jié)構(gòu)RNA聚合酶5'mRNATrp密碼子1234UUUU3'DNADNA前導(dǎo)肽5'1234Trp結(jié)構(gòu)基因MKAIFVLKGMKAIFVLKGWWRTSRNA聚合酶Trp操縱子的轉(zhuǎn)錄衰減機(jī)制前導(dǎo)肽核蛋白體衰減子結(jié)構(gòu)RNA聚合酶5'mRNATrp密碼子三、原核生物基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn)
主要在轉(zhuǎn)錄水平進(jìn)行調(diào)節(jié)1)σ因子的特異啟動(dòng)作用
2)操縱子調(diào)控機(jī)制具有普遍性3)結(jié)構(gòu)基因進(jìn)行多順反子轉(zhuǎn)錄4)阻遏蛋白阻遏轉(zhuǎn)錄具有普遍性三、原核生物基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn)第三節(jié)真核生物基因表達(dá)調(diào)控
一、真核生物基因組特點(diǎn)
(一)基因組結(jié)構(gòu)龐大
人類的單倍體基因組由3X109的核苷酸組成,含有大約2.63.9萬個(gè)基因。(二)形成染色體結(jié)構(gòu)真核生物的基因組是以DNA和蛋白質(zhì)結(jié)合形成染色體結(jié)構(gòu)形式而存在于細(xì)胞核
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